$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تمت مراجعة الدراسة واعتبارها "معفاة" من قبل مجلس المراجعة المؤسسية بجامعة جورجتاون (IRB # 2002-022). تم جمع أنسجة نخاع العظم التي تم حصادها حديثا من مرشحات جمع نخاع العظم البشرية السليمة المهملة التي تم إلغاء تحديدها.
1. تصميم غرفة جديدة (الشكل 2)
- افتح لوحة جديدة لتحليل الخلايا ثنائية الغرفة. ضع الغرفة العلوية جانبا مع الأقطاب الكهربائية.
- باستخدام آلة طحن ، حلق 2 مم من الآبار السفلية على شكل حرف U للوحة محلل الخلايا.
- قم بتوصيل غشاء بولي إيثرسلفون (PES) مقاس 2 سم × 7 سم بحجم مسام 0.2 ميكرومتر بقاع الآبار المحلوقة باستخدام مادة لاصقة بالأشعة فوق البنفسجية. اسمح بوقت تنظيم لمدة 30 دقيقة لضمان شفاء الغراء تماما وخامله.
- باستخدام آلة طحن ، قم بقطع شقين طوليين (1.5 مم × 5.6 مم) على طول الجانبين للانجذاب إلى تلال الغرفة الثالثة المصنعة حديثا.
- باستخدام آلة طحن ، قم بإنشاء غرفة ثالثة من البولي كربونات تكرر الأبعاد الكلية للوحة محلل الخلية ؛ 72 مم × 18 مم (جدول المواد).
- إنشاء آبار بعمق 4.8 مم وقطر 4.75 مم لتكرار تصميم 16 بئرا للوحة محلل الخلايا. هذا يسمح ب 90 ميكرولتر من الحجم لكل بئر.
- على الجانبين ، قم بإنشاء اثنين من التلال المثلثة بحيث تقفل الغرفة في الشقوق الأصلية التي تم إنشاؤها في الخطوة 1.4. الجزء الأفقي من المثلث هو 1.5 ملم ، والعمودي هو 1.4 ملم ، والوتر هو 2.052 ملم.
- قم بإنشاء مقبض على الجانب القصير يبلغ قطره 50.8 مم وارتفاعه 1.397 مم ليتناسب مع درجة اللوحة الأصلية (الشكل 2 ، الوسط).
- استخدم غسالة مطاطية بسماكة 0.9 مم لكل بئر لتوفير ملاءمة مختومة.
2. زراعة الخلايا (MDA-MB-231 ، DCIS ، DCIS-Δ4 ، J2-الخلايا الليفية)
- اغسل مزارع الخلايا الملتصقة (~ 70٪ التقاء) باستخدام 1x محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS).
- أضف محلول التريبسين-EDTA بنسبة 0.05٪ لرفع الخلايا.
- تحييد محلول التربسين باستخدام وسائط زراعة الخلايا التي تحتوي على مصل وحساب الخلايا باستخدام أليكوت من تعليق الخلية.
ملاحظة: يمكن العثور على وسائط زراعة الخلايا المحددة في الجدول 1.
3. انفصال xenograft المستمدة من المريض
- تقطع قطعة ورم طازجة (1 سم2) إلى هريس ناعم باستخدام مشرط معقم.
- ضع في أنبوب مخروطي 50 مل مع 20 مل من وسائط DMEM F12 المكملة ب 3 ملغ / مل تريبسين و 2 ملغ / مل كولاجيناز.
- احتضان في شاكر حراري (150 دورة في الدقيقة) عند 37 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة.
- قم بتدوير الأنبوب عند 500 × جم لمدة 5 دقائق ؛ إزالة supernatant.
- أضف 20 ميكرولتر من DMEM F12 + 2٪ FBS لغسل الخلايا ؛ تدور في 300 × غرام لمدة 5 دقائق وإزالة supernatant. كرر الغسل مرتين أخريين.
- أعد التعليق في 1 مل من وسائط PDX (الجدول 1) لحساب الخلايا.
4. استخراج خلايا نخاع العظم
- اغسل مرشح جمع نخاع العظم (BM) باستخدام 25 مل من 1x PBS.
ملاحظة: في هذه الدراسة ، تمت إضافة PBS إلى مرشح جمع BM المستخدم من المستشفى لجمع BM المتبقي في الفلتر.
- أضف BM المتدفق ببطء إلى أنبوب مخروطي سعة 50 مل مع 25 مل من وسط تدرج الكثافة ، مع الحرص على إبقاء الطبقات منفصلة قدر الإمكان.
- تدور عند 800 × جم لمدة 20 دقيقة عند 18 درجة مئوية
- اسحب الطبقات العليا بعد الطرد المركزي (الدهون / البلازما) وانقل 5 مل من الطبقة البيضاء فوق وسط تدرج الكثافة الذي يحتوي على خلايا BM إلى أنبوب مخروطي 15 مل.
ملاحظة: بدلا من ذلك، اغمس ماصة سعة 5 مل في الطبقة العليا حتى تلامس الطبقة الوسطى (BM) وقم بإخراج الطبقة الوسطى ببطء شديد دون تحريك الماصة.
- املأ الأنبوب المخروطي سعة 15 مل ب 1x PBS (~ 10 مل) وقم بالدوران عند 300 × g لمدة 15 دقيقة.
- إزالة supernatant. الكريات البيضاء المتبقية هي BM.
- إذا لوحظت خلايا الدم الحمراء في الكريات ، أضف 5 مل من محلول تحلل RBC (جدول المواد) واتركه لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة (RT). تدور في 300 × غرام لمدة 5 دقائق وإزالة supernatant.
- أضف 10 مل من 1x PBS لغسل الخلايا ، وتدور عند 300 × g لمدة 5 دقائق وإزالة supernatant. كرر تحلل RBC (الخطوة 4.7) حتى تصبح الكريات بيضاء.
5. بذر الخلايا وتجميعها
- ضع جميع الغرف المعقمة الثلاث في غطاء محرك السيارة لزراعة الأنسجة.
- حدد موقع المقبض على الجانب القصير من الغرفة السفلية. قم بتوجيه الغرفة السفلية بحيث يواجه المقبض المجرب .
- أضف 30,000-50,000 خلية في 90 ميكرولتر من الوسائط إلى كل بئر من الغرفة السفلية. تجنب تشكيل فقاعات. هذه هي الخلايا اللحمية التي ستوفر عوامل إفرازية ولكن لن يتم اكتشافها بواسطة أقطاب الغرفة العلوية.
- استخدم 5٪ من الوسائط المكملة بمصل البقر الجنيني في بئرين من الغرف السفلية كعنصر تحكم إيجابي في حركة الخلايا. استخدم 0٪ من الوسائط المكملة بالمصل كعنصر تحكم سلبي.
- دع الغرفة السفلية مع الخلايا تجلس لمدة 10-15 دقيقة في الغطاء لتستقر.
ملاحظة: يوصى بهذه الخطوة إذا كانت الخلايا ملتصقة أو تنمو في حالة تعليق.
- قم بتدوير الغرفة السفلية عند 90 درجة وضع الغرفة الوسطى في الأعلى بحيث ينزلق المقبض الموجود في الغرفة السفلية إلى الشق الموجود في الغرفة الوسطى.
ملاحظة: يوجد المقبض الموجود في الغرفة السفلية والنقطة الزرقاء الموجودة في الغرفة الوسطى في طرفي التجميع المتقابلين.
- ادفع عموديا لأسفل حتى يتم سماع صوت نقرة من كل جانب من الجوانب الطويلة للتجميع.
- أضف 160 ميكرولتر من الوسائط الخالية من المصل إلى جميع آبار الغرفة الوسطى.
- تأكد من أن الغضروف المفصلي على شكل قبة مرئي بعد ملء الآبار. خلاف ذلك ، اضبط الحجم النهائي بناء على معايرة الماصة. تجنب تشكيل فقاعات.
- ضع الغرفة العلوية مع أقطاب كهربائية متجهة لأسفل إلى الغرفة الوسطى مع التأكد من محاذاة النقاط الزرقاء على الحجرتين الوسطى والعليا.
- ادفع عموديا لأسفل حتى يتم سماع صوت نقرة من كل جانب من الجوانب الطويلة للتجميع.
- أضف 25-50 ميكرولتر من الوسائط الخالية من المصل إلى الغرفة العلوية.
- قم بتركيب التجميع على محلل الخلايا ثنائي الغرض في حاضنة زراعة الأنسجة وانتظر لمدة 30 دقيقة قبل قياس الخلفية.
ملاحظة: هذه المرة ضرورية لموازنة الصفيف ويمكن استخدامها لإعداد خطوط الخلايا لإضافتها إلى الغرفة العلوية.
- قم بقياس الخلفية (انظر القسم 6) ووضع التجميع مرة أخرى في غطاء محرك الأنسجة.
- أضف 30,000-50,000 خلية في 100 ميكرولتر من الوسائط الخالية من المصل إلى كل بئر من الغرفة العلوية. هذه هي الخلايا التي سيكتشفها القطب الكهربائي بمجرد أن تهاجر بنجاح عبر الغشاء.
ملاحظة: لتحقيق أقصى قدر من الاستجابة، يوصى بزراعة الخلايا في وسائط مصل خالية أو منخفضة من المصل لمدة 6-18 ساعة قبل إجراء الفحص.
- دع التجميع يقف في غطاء المحرك لمدة 30 دقيقة قبل تركيبه على محلل الخلايا ثنائي الغرض لقياس المعاوقة.
6. قياس الخلفية والمعاوقة
- ضع الصفيف في المهد في أداة تحليل الخلايا ثنائية الغرض.
- افتح برنامج محلل الخلايا وحدد المهد المراد استخدامه.
- انقر فوق علامة التبويب رسالة وتأكد من أنها تقول اتصالات موافق لضمان وضع الصفيف بشكل جيد في المهد وأن الأقطاب الكهربائية محاذاة بشكل جيد مع أجهزة الاستشعار.
- انقر على علامة التبويب ملاحظات التجربة واملأ أكبر قدر ممكن من المعلومات حول التجربة .
- انقر فوق علامة التبويب تخطيط واملأ وصف تخطيط الصفيف.
- انقر فوق علامة التبويب جدولة وأضف خطوتين من قائمة الخطوات ؛ خطوة خلفية (عملية مسح واحدة) وخطوة اختبار مع 100 عملية مسح - عملية مسح كل 15 دقيقة ، يبلغ مجموعها 25 ساعة.
- بعد أن تكون المصفوفة في حاضنة تحليل الخلايا ثنائية الغرض لمدة 30 دقيقة ، انقر فوق الزر " تشغيل" لبدء قياس الخلفية. ستظهر نافذة تطلب اختيار المجلد لحفظ البيانات.
- بعد الانتهاء من قياس الخلفية ، قم بإزالة الصفيف من المهد وضعه مرة أخرى في غطاء مزرعة الخلية.
- أضف الخلايا إلى الغرفة العلوية كما هو موضح في الخطوة 5.13 ، واحتفظ بالتجميع في غطاء زراعة الأنسجة لمدة 30 دقيقة حتى تستقر الخلايا.
- ضع الصفيف مرة أخرى في محلل الخلايا ثنائي الغرض وتحقق من علامة التبويب رسالة " موافق على الاتصالات ".
- انقر فوق الزر " تشغيل" لبدء قياس المعاوقة.
- انقر فوق علامة التبويب رسم لمراقبة تقدم الإشارة.
- إذا تم الوصول إلى نقطة النهاية قبل 25 ساعة ، فانقر فوق خطوة إجهاض من القائمة المنسدلة تنفيذ .
- لتصدير البيانات، انقر بزر الماوس الأيمن فوق الرسم البياني، واختر نسخ بتنسيق القائمة، ثم الصق البيانات في جدول بيانات.
ملاحظة: يمكن تصدير البيانات كفهرس خلية أو فهرس خلية دلتا. يمكن أيضا اختيار معلومات الرسم البياني و / أو التخطيط للتصدير.
7. مفرزة وجمع الخلايا
- راقب معدل الترحيل في الوقت الفعلي على محلل الخلايا ثنائي الغرض لتحديد نقطة التوقف المثيرة للاهتمام (6-18 ساعة).
ملاحظة: تعتمد نقطة التوقف على معدل غزو الخلية ومتى يتم تحقيق إشارة غزو مميزة من التحكم السلبي.
- بمجرد تحقيقه ، قم بفك التجميع من محلل الخلايا ثنائي الغرض وضعه في غطاء زراعة الأنسجة.
- قم بإعداد عدد مناسب من أنابيب الطرد المركزي الدقيقة سعة 1.5 مل لجمع الخلايا من الآبار ذات الاهتمام.
- ضع التجميع في طبق 10 سم لاحتواء السوائل عند انفصال الغرف.
- ادفع نهايات الانجذاب المرنة على الجانب الطويل من الغرفة الوسطى إلى الداخل حتى يتم سماع صوت نقرة.
- قم بتفكيك الغرفة العلوية وقلبها إلى طبق جديد بحجم 10 سم.
- استخدم رافع الخلايا بشفرة 13 مم لجمع الخلايا من جميع الآبار التي تؤوي نفس الحالة التجريبية (أي نوع الخلية ، والعلاج الدوائي ، وما إلى ذلك).
ملاحظة: صمم الإعداد بحيث يحتوي على بئرين على الأقل لكل حالة تجريبية لتحقيق تغيير ذي دلالة إحصائية من عناصر التحكم السلبية.
- شطف أو غمس الشفرة في 1x الفوسفات المخزن ملحيا مؤقتا لجمع الخلايا في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة 1.5 مل.
- قم بتدوير الخلايا عند 500 × جم لمدة 5 دقائق.
- نشر الخلايا التي تم جمعها (انظر القسم 8) أو إجراء تحليل نقطة النهاية مثل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية.
ملاحظة: بالنسبة للحمض النووي الريبي السائب، استخدم مجموعة استخراج الحمض النووي الريبي ذات عدد الخلايا المنخفض.
8.3D انتشار الخلايا واسترجاعها
ملاحظة: نظرا لقلة عدد الخلايا التي تم جمعها ، قم بزرع الخلايا في 3D باستخدام مصفوفة خارج الخلية (ECM) لتعزيز قابلية البقاء. ومع ذلك ، فإن ثقافة 2D هي أيضا خيار في هذه المرحلة ، خاصة إذا كانت الخلايا المستخدمة من خطوط الخلايا الثابتة.
- قم بإذابة أليكوت من مصفوفة الغشاء السفلي عند 4 درجات مئوية بين عشية وضحاها. احتفظ بمصفوفة الغشاء السفلي على الجليد حتى تصبح جاهزة للاستخدام.
- أضف 25 ميكرولتر من مصفوفة الغشاء السفلي البارد إلى حبيبات الخلايا الحية التي تم جمعها وماصة بلطف لأعلى ولأسفل للخلط. تجنب تشكيل فقاعات.
- أضف مزيج مصفوفة الغشاء الخلوي السفلي إلى قاع بئر زراعة الأنسجة الصغيرة (أي في صفيحة 96 بئرا) ، مما يشكل قبة. حاول ألا تلمس جدران البئر. احتضن عند 37 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة قبل إضافة 100 ميكرولتر من الوسائط بلطف عن بعد.
- لاسترداد الخلايا ، قم بشفط الوسائط وإضافة 100 ميكرولتر من dispase إلى كل بئر.
- احتضان في RT لمدة 10 دقائق، وسحب لأعلى ولأسفل من حين لآخر.
- انقل الخلايا ومصفوفة الغشاء السفلي المذاب إلى أنبوب طرد مركزي دقيق 1.5 مل. أضف 1 مل من 1x PBS ، وتدور عند 300 × g لمدة 5 دقائق وإزالة supernatant. كرر الغسيل مرة واحدة.
- شفط السوبرناتانت. قم بتقسيم الخلايا في الكريات أو قم بإجراء تحليل نقطة النهاية.