$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
في المقايسات والمقارنات الموثقة أدناه ، استخدمنا خطين hESC (H9 و HS429 ، من WiCell ومعهد Karolinska ، على التوالي) وخطين hiPSC (NCS001 و NCS002 ، وكلاهما تم إنشاؤه بواسطة المرفق الأساسي النرويجي للخلايا الجذعية البشرية متعددة القدرات). البيانات الواردة في الأشكال والجداول مأخوذة من خطوط hESC ، ولكن تم الحصول على نتائج مماثلة تماما من خطوط hiPSC.
في أيدينا ، أدى الحصاد الميكانيكي إلى تقسيم المستعمرات إلى ما يقرب من خمس إلى ست كتل قطرها ~ 200-250 ميكرومتر ، بينما مع عدم الالتصاق الناجم عن EDTA متبوعا بالتثليج ، تم تقسيم كل مستعمرة إلى ~ 10-20 كتل قطرها ~ 60 ميكرومتر. نقدر أن عدد الخلايا في كل كتلة تم حصادها بواسطة EDTA هو ~ 20. نظرا لأنه من غير العملي تقسيم مستعمرة إلى كتل بهذا الحجم باستخدام مشرط ، في هذا الصدد ، يكون عدم الالتصاق الناجم عن EDTA متفوقا ، لأنه يولد كتلا بحجم أكثر ملاءمة لبقاء خلايا المستعمرة10,11.
كانت مستعمرات hESC / hiPSC التي تم حصادها باستخدام EDTA أكثر تجانسا في الحجم والشكل مقارنة بالمستعمرات التي تم حصادها ميكانيكيا (الشكل 1A-F). وذلك لأن القطع المطلوب للحصاد الميكانيكي يولد حواف غير متساوية وأحجام تكتل متفاوتة. لتقييم هذا كميا ، قمنا بتقييم دائرية المستعمرة (كمقياس لمدى تقريب حواف المستعمرة ؛ تشير القيمة 1 إلى دائرة مثالية) بعد 5 أيام من المرور باستخدام بروتوكول ImageJ-win6412. كانت دائرية المستعمرة أقل بكثير في المستعمرات التي تم حصادها ميكانيكيا (الحصاد الميكانيكي: 0.61 ± 0.10 ؛ الحصاد القائم على EDTA: 0.84 ± 0.01 ؛ ن = 10 ، ع < 0.001 ، مان ويتني U-test ، U = 10).
كانت كثافة الخلايا في المستعمرات المحصودة والمعاد طلاؤها ، وهو مقياس لتفاعلات الخلايا الخلوية بعد الحصاد أثناء تكوين المستعمرة ، مماثلة للحصاد القائم على EDTA والحصاد الميكانيكي (الجدول 1 والشكل 1G ، H). كان لدى المستعمرات التي تم حصادها ميكانيكيا ميل أكبر لتطوير النخر في مناطقها الوسطى (الشكل 1J). كان هذا على الأرجح بسبب التباين في الشكل ، وخاصة حجم كتل الخلايا المعزولة ميكانيكيا ، كما هو الحال عندما تكون هذه الكتل كبيرة جدا ، يمكن أن تطوى بسهولة على نفسها عند نقلها إلى أطباق استزراع جديدة. لم يكن هذا هو الحال مع المستعمرات التي تم حصادها باستخدام EDTA ، والتي أظهرت بشكل موحد مظهرا شفافا بحواف مميزة (الشكل 1I).
باستخدام الحصاد القائم على EDTA ، تمكنا من جمع جميع المستعمرات التي تم إنشاؤها في بئر في غضون 2-3 دقائق. باستخدام الحصاد الميكانيكي ، سيكون جمع كل المستعمرات في البئر مملا ويستغرق وقتا طويلا. تمكنا عادة من جمع ~ 30٪ فقط ، أو ~ 20-25 مستعمرة ، باستخدام الحصاد الميكانيكي ، واستغرق ذلك ~ 20 دقيقة. وبالمثل ، باستخدام هضم الكولاجيناز متبوعا بالكشط اللطيف ، كان من الصعب عادة حصاد جميع المستعمرات ، على الرغم من أن الإجراء الإجمالي استغرق بضع دقائق فقط. وبالتالي ، فإن الحصاد القائم على EDTA سريع أو أسرع من الحصاد الأنزيمي وأكثر كفاءة من الحصاد الميكانيكي أو الأنزيمي.
لتقييم تأثير طرق الحصاد المختلفة على الجذع وتعدد القدرات ، قمنا أولا بإخضاع المستعمرات التي تم الحصول عليها بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد القائم على EDTA أو الحصاد الميكانيكي لتحليل qPCR (الشكل 2) والتلوين الكيميائي المناعي (الشكل 3 والشكل 4) لعلامات الجذعية. أظهرت المستعمرات التي تم الحصول عليها باستخدام أي من الطريقتين تعبيرا مستقرا عن علامات الجذعية على مستوى mRNA والبروتين. ثم قمنا بتقييم تعدد القدرات عن طريق التمايز إلى الطبقات الجرثومية الثلاث في الأجسام الجنينية (الشكل 5 والشكل 6). احتوت الأجسام الجنينية المتولدة من hESCs أو hiPSCs التي تم الحصول عليها بعد 20 ممرا باستخدام أي من الطريقتين على خليط من الخلايا التي تعبر عن علامات تم تقييمها بشكل شائع للأديم الظاهر والأديم المتوسط والأديم الباطن.
أخيرا ، قمنا بتقييم حدوث الانحرافات الجينومية في hESCs و hiPSCs التي تم تمريرها بواسطة كل طريقة باستخدام التحليل الجيني القائم على qPCR (انظر جدول المواد). أظهرت المستعمرات التي تم الحصول عليها بعد 20 ممرا باستخدام أي من طريقتي الحصاد بعض الأمثلة على الانحراف المتواضع عن نمط كروموسومي مرجعي ثنائي الصيغة الصبغية (كانت التشوهات التي تم تقييمها هي تلك المرتبطة عادة بإعادة برمجة hiPSCs ولكن يمكن الحصول عليها أيضا في hESCs) (الشكل 7). ومع ذلك ، كان نمط هذه الانحرافات هو نفسه بشكل أساسي في المستعمرات التي تم الحصول عليها بعد أي من طريقتي الحصاد ، مما يشير إلى أنها لم تكن مرتبطة بطريقة الحصاد.

الشكل 1: مورفولوجيا المستعمرة وكثافة الخلايا بعد الحصاد الميكانيكي أو القائم على EDTA. (A-F) صور برايت فيلد تمثيلية لمستعمرات H9 hESC التي تم إنشاؤها في ثقافة خالية من التغذية لمدة 5 أيام بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي القائم على (A-C) أو (D-F). (ز ، ح) صور مضان تمثيلية لكثافة الخلية في مستعمرات H9 hESC التي تم إنشاؤها بعد 20 ممرا باستخدام (G) القائم على EDTA أو (H) الحصاد الميكانيكي. نواة الخلية ملطخة ب DAPI. (ط، ي) صور برايت فيلد تمثيلية لمستعمرات H9 hESC التي تم إنشاؤها بعد 20 ممرا باستخدام (I) الحصاد الميكانيكي القائم على EDTA أو (J). لاحظ المنطقة الوسطى الميتة في المستعمرة التي يتم حصادها ميكانيكيا (السهم في J). تم الحصول على جميع الصور بعد 5 أيام من مرور 20. قضبان المقياس = 100 ميكرومتر. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ DAPI = 4 '، 6-دياميدينو -2-فينيليندول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: التعبير عن علامة الجذعية mRNA في خطين hESC (H9 و HS429) المتولدة بعد الحصاد القائم على EDTA أو الميكانيكي. تفاعل البلمرة الكمي المتسلسل في الوقت الحقيقي للعلامات المشار إليها في H9 (اللوحة العلوية) و HS429 (اللوحة السفلية) hESCs بعد مرور واحد باستخدام الحصاد الميكانيكي ، وبعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي ، وبعد 20 ممرا باستخدام الحصاد القائم على EDTA (تخفيف 1: 5). مستوى التعبير متعلق بمستوى جين التدبير المنزلي ACTB (بيتا أكتين). تشير أشرطة الخطأ إلى الانحراف المعياري. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: التعبير عن بروتينات علامة الجذعية في خط H9 hESC بعد ظروف الحصاد المختلفة. تلطيخ المناعة التمثيلي لمستعمرات H9 hESC التي تم حصادها ميكانيكيا (A-E) قبل المرور الإضافي ، (F-J) بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي ، و (K-O) بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد القائم على EDTA. قضبان المقياس = 100 ميكرومتر. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ DAPI = 4 '، 6-دياميدينو -2-فينيليندول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: التعبير عن بروتينات علامة الساق في خط HS429 hESC بعد ظروف الحصاد المختلفة. تلطيخ المناعة التمثيلي لمستعمرات HS429 hESC التي تم حصادها ميكانيكيا (A-E) قبل المرور الإضافي ، (F-J) بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي ، و (K-O) بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد القائم على EDTA. قضبان المقياس = 100 ميكرومتر. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ DAPI = 4 '، 6-دياميدينو -2-فينيليندول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5: التعبير عن علامات الطبقات الجرثومية الثلاث في الأجسام الجنينية المتولدة من خط H9 hESC بعد الحصاد الميكانيكي أو القائم على EDTA. تلطيخ التألق المناعي التمثيلي لعلامات (الصفوف A و D) الأديم الظاهر (ECTO ، TUJI) ، (الصفوف B و E) الأديم الباطن (ENDO ، AFP) ، و (الصفوف C و F) الأديم المتوسط (MESO ، SMA). تم إنشاء EBs (A-C) بعد 20 ممرا من الحصاد الميكانيكي أو (D-F) بعد 20 ممرا من الحصاد القائم على EDTA. قضبان المقياس = 40 ميكرومتر. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ EBs = الأجسام الجنينية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 6: التعبير عن علامات الطبقات الجرثومية الثلاث في الأجسام الجنينية المتولدة من خط HS429 hESC بعد الحصاد الميكانيكي أو القائم على EDTA. تلطيخ التألق المناعي التمثيلي لعلامات (الصفوف A و D) الأديم الظاهر (ECTO ، TUJI) ، (الصفوف B و E) الأديم الباطن (ENDO ، AFP) ، و (الصفوف C و F) الأديم المتوسط (MESO ، SMA). تم إنشاء EBs (A-C) بعد 20 ممرا من الحصاد الميكانيكي (A-C) أو (D-F) بعد 20 ممرا من الحصاد القائم على EDTA. قضبان المقياس = 40 ميكرومتر. الاختصارات: hESC = الخلايا الجذعية الجنينية البشرية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ EBs = الأجسام الجنينية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 7: التحليل الجيني القائم على qPCR للانحرافات الجينومية الشائعة في خطوط HS9 و HS429 ESC وخط NCS002 iPSC بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي أو القائم على EDTA. يمثل خط الأساس عند القيمة 2 ثنائية الصيغة الصبغية الطبيعية في جميع علامات الكروموسومات. تمثل القيمة 1 أو 3 خسارة أو ربحا ، على التوالي ، لعلامة الكروموسومات المشار إليها في جميع الخلايا. تشير القيم الوسيطة بين 1 و 2 أو بين 2 و 3 إلى وجود خسارة أو كسب للعلامة المشار إليها في جزء من الخلايا. لاحظ أن نمط الانحرافات متشابه في شرطي الحصاد. الاختصارات: ESC = الخلايا الجذعية الجنينية. EDTA = حمض الإيثيلين ديامينيترايتيك ؛ iPSC = الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
| كثافة الخلية (الخلايا / مم2) | | |
| إتش9 | دني | stdev |
| الحصاد الميكانيكي قبل مرور المزيد | 3918 | 263.3 |
| الحصاد الميكانيكي 20 مرة | 3868 | 197.7 |
| حصاد EDTA 20 مرة | 4080 | 127.8 |
| HS429 | دني | stdev |
| الحصاد الميكانيكي قبل مرور المزيد | 5249 | 565.4 |
| الحصاد الميكانيكي 20 مرة | 5247 | 726.3 |
| حصاد EDTA 20 مرة | 4963 | 448.8 |
الجدول 1: مقارنة كثافات الخلايا في المستعمرات من خطي hESC (H9 و HS429) المتولدة بعد الحصاد القائم على EDTA أو الميكانيكي. تم تقييم كثافة الخلايا إما بعد مرور واحد باستخدام الحصاد الميكانيكي ، أو بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد الميكانيكي ، أو بعد 20 ممرا باستخدام الحصاد القائم على EDTA (عند تخفيف 1: 5). في جميع الحالات ، n = 5 مستعمرات.