تمت الموافقة على جميع البروتوكولات والإجراءات من قبل السلطات المختصة في ولاية سكسونيا السفلى ، ألمانيا ، مع أرقام التصاريح AZ 33.19-42502-04-15/1828 و 33.19-42502-04-15/1990. هذا البروتوكول مخصص للجربيلات المنغولية (M. unguiculatus) من كلا الجنسين. يشير الشباب البالغين إلى عمر 3-12 شهرا ، في حين يعتبر الجربوع في سن 36 شهرا فما فوق. عندما لا يذكر خلاف ذلك ، يمكن تحضير المخازن المؤقتة والمحاليل وتخزينها في الثلاجة لمدة تصل إلى عدة أشهر (4-8 درجات مئوية). قبل الاستخدام ، تأكد من أن المخازن المؤقتة والحلول لم تترسب.
1. التثبيت وجمع الأعضاء
ملاحظة: إذا كانت هناك حاجة فقط إلى القوقعة ، فمن المستحسن تنفيذ إجراء أبسط إلى حد ما للتثبيت عن طريق الغمر. ومع ذلك ، إذا كانت هناك حاجة أيضا إلى دماغ محفوظ جيدا ، فإن التروية عبر القلب هي الخيار الوحيد. المثبت في كلتا الحالتين هو 4٪ بارافورمالديهايد (PFA) في محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS). يجب أن يكون هذا طازجا ولكن يمكن تخزينه مجمدا حتى الاستخدام. استخدم الأليكوتات ~ 300 مل لتروية عبر القلب أو ~ 50-100 مل لكل قوقعة للتثبيت عن طريق الغمر.
تحذير: PFA مادة خطرة. التعامل معها وفقا لإجراءات السلامة المخبرية العامة.
- التثبيت عن طريق التروية عبر القلب
- اغسل إعداد التروية حتى تصبح الأنابيب خالية من أي فقاعات هواء. املأ أنابيب التروية ب PBS التي تحتوي على الهيبارين (0.2 مل في 100 مل من PBS) لمنع تخثر الدم. أوقف التدفق بمجرد ملء الأنابيب ب PBS وإفراغ زجاجة تخزين السوائل للتو ؛ صب 200 مل من PFA المذاب فيه.
ملاحظة: الإعداد جاهز الآن للحيوان. PBS المتبقية في الأنابيب كافية لطرد الدم وسوف يتبعها تلقائيا المثبت بمجرد استئناف التدفق.
- تأكد من وجود نظام لجمع النفايات لتدفق PFA إلى الخارج. استخدم قنية طازجة (19 جم) واحصل على مقص كبير ، ملقط (مع طرف مسطح) ، مرقئ ، مشرط أو قنية حادة ، وحصيرة مطاطية مع دبابيس في متناول اليد.
- القتل الرحيم للجربيل بجرعة زائدة داخل الصفاق من البنتوباربيتال (160 ملغ / مل ، 0.3 مل لكل ، نطاق وزن الجسم: 50-120 جم). ضع الحيوان مرة أخرى في قفصه. عندما يبدأ توقف التنفس بحيث يصبح التنفس غير منتظم مع فترات من 30 ثانية أو أكثر ، ضع الجربيل على ظهره على الحصيرة المطاطية وقم بإصلاح كل من الكفوف الأمامية والمخلب الخلفي مع دبابيس (اترك مخلبا خلفيا واحدا حرا للتحرك للحصول على حكم أفضل على نجاح التروية ؛ انظر الملاحظة بعد الخطوة 1.1.7).
- لفتح التجويف الصدري ، ارفع الجلد فوق القص بالملقط واقطع الجلد حوالي 0.5 سم أسفل القص بالمقص حتى تصبح العملية البيضاء اللون xiphoideus مرئية. امسك القص في العملية xiphoideus مع ملقط وقطع على طول الحجاب الحاجز للحصول على رؤية جيدة في التجويف الصدري. قطع الأضلاع أفقيا على كلا الجانبين حتى يكون هناك وصول جيد إلى القلب. تأكد من أن زاوية المقص متوازية ومسطحة بالنسبة لجسم الجربيل لتجنب تلف الأعضاء ، وبالتالي ضمان نظام الدورة الدموية المغلق.
- قم بتثبيت مرقأ على القص ، وارفع القفص الصدري ، وضع المرقأة على كتف الجربيل دون وضع المرقأة على أي أجزاء من الجسم لتجنب منع تدفق الدم.
- افتح تدفق السائل قليلا حتى تتدفق قطرة واحدة من PBS من القنية (19 جم) كل 2 ثانية تقريبا. امسك القلب بالملقط وحوله قليلا إلى اليسار بحيث يمكن رؤية البطين الأيسر بوضوح. أدخل القنية في البطين الأيسر بزاوية تتجنب اختراق الحاجز. امسك الإبرة في مكانها إما باليد أو بمرقئ آخر.
ملاحظة: يمكن تمييز البطينين الأيسر والأيمن من خلال درجات ألوانهما المختلفة. يبدو البطين الأيسر أخف لونا من بقية أنسجة القلب.
- قم بزيادة ضغط تدفق السوائل ببطء وافتح الأذين الأيمن إما بمقص ناعم أو مشرط أو قنية أخرى. افتح تدفق السائل أكثر حتى يتم ملاحظة ما يقرب من 2-3 قطرات / ثانية في غرفة التنقيط ، أو قم بتعيين تدفق قدره 4 مل / دقيقة للمضخة. بمجرد تثبيت القلب ، تأكد من بقاء قنية التروية في مكانها دون أن يتم تثبيتها أكثر من ذلك.
ملاحظة: علامات التروية الناجحة هي تقلصات العضلات البطيئة ، وتصلب الرقبة والأطراف ، والكبد يصبح شاحبا ، والرئتين الوردية. علامة التروية غير الناجحة هي تبييض الرئتين ، مما يشير إلى أن الدورة الدموية الرئوية منتشرة بسبب ثقب الحاجز.
- في حالة التروية غير الناجحة ، حاول تحريك القنية إلى أعلى ، إلى الشريان الأورطي ، وتثبيتها في مكانها باستخدام مرقئ.
- قطع رأس الجربيل. قم بإزالة الفقاعات وقطع عظامها وكسرها كما هو موضح في الخطوة 1.2.2.
ملاحظة: إذا لم يكن النسيج ثابتا بما فيه الكفاية ، فسوف تزيح الظهارة الحسية من عضو Corti أثناء التشريح.
- إذا لم تظهر التروية أي علامات على التثبيت في غضون 5-10 دقائق ، فقم بإجهاضها واتبع الإجراء أدناه على الفور للتثبيت عن طريق الغمر. لذلك ، عالج القوقعة كما في الخطوة 1.2.2 وقم بتثبيت الأنسجة في حوالي 50-80 مل من PFA بنسبة 4٪ في حاويات غطاء لولبي لمدة 1-2 أيام على شاكر ثنائي الأبعاد عند 8 درجات مئوية.
ملاحظة: نظرا لأنه قد يكون من الصعب في نهاية المطاف تقييم جودة التثبيت أثناء التروية، فمن المستحسن نشر القوقعة بشكل روتيني كما هو موضح.
- التثبيت عن طريق غمر الأنسجة
- القتل الرحيم للجربلات بجرعة زائدة داخل الصفاق من البنتوباربيتال (160 ملغ / مل ، 0.3 مل لكل ، نطاق وزن الجسم: 50-120 جم). عندما يتوقف الجربيل عن التنفس ، اقطع رأس الحيوان.
- قم بإزالة الفقاعات وقطع وكسر عظامها بالمقص والملقط ، على التوالي ، للوصول إلى القوقعة. قم بإزالة قنوات maellus و incus والقنوات نصف الدائرية. قم بعمل ثقوب صغيرة في القمة وفي المنعطف القاعدي عن طريق خدش عظم القوقعة بعناية باستخدام ملقط. انقل الفقاعات على الفور إلى فائض من المثبت البارد (50 مل على الأقل) وقم بإصلاح الأنسجة في البرد (4-8 درجة مئوية) تحت إثارة لطيفة (2D-shaker [100 دورة في الدقيقة]) لمدة يومين.
ملاحظة: بعد إصلاح الأنسجة ، يمكن معالجة القوقعة على الفور أو تخزينها في PBS مع 0.05٪ من أزيد الصوديوم. تحذير: أزيد الصوديوم سام. لاحظ أن طول التخزين قد يؤثر سلبا على جودة التلطيخ. وقد أشارت تجارب محدودة إلى أن تلطيخ المناعة بدا أضعف بعد 2 سنوات من تخزين الأنسجة في أزيد الصوديوم.
2. إعداد الأنسجة ووضع العلامات المناعية
- قم بإذابة مسحوق حمض الإيثيلين ديامين رباعي أسيتيك (EDTA) في PBS لإنتاج محلول 0.5 M عند درجة الحموضة 8. لهذا ، ضع دورقا على مقلب مغناطيسي ، واملأه بما يقرب من نصف الكمية الإجمالية ل PBS ، وأضف الكمية المناسبة من مسحوق EDTA ، مما يؤدي إلى تعليق حمضي. أضف بعناية محلول هيدروكسيد الصوديوم المركز (NaOH) أثناء مراقبة الرقم الهيدروجيني باستخدام مقياس الأس الهيدروجيني. املأ PBS إلى الحجم النهائي المطلوب وقم بتصفية المحلول لمنع التلوث الميكروبي.
ملاحظة: لن يذوب مسحوق EDTA تماما إلا بعد وصول التعليق إلى قيمة حموضة محايدة.
- لإزالة الكلس ، انقل القوقعة إلى 80 مل من 0.5 M EDTA في PBS. احتضان الأنسجة في البرد (4-8 درجة مئوية) تحت إثارة لطيفة على 2D-shaker (100 دورة في الدقيقة) لمدة يومين.
ملاحظة: بعد خطوة إزالة الكلس ، يمكن تخزين الأنسجة في PBS لعدة أيام تصل إلى 3 أسابيع قبل المتابعة مع خطوات المعالجة المتبقية. بالنسبة للأجسام المضادة التي تضع علامة على الأوعية الدموية stria ، ينصح بقطع القوقعة إلى النصف على طول محور modiolar في هذه المرحلة (أي قبل التلطيخ المناعي) لضمان الوصول الموحد للأجسام المضادة إلى أهدافها. هذا يعتمد على الأجسام المضادة ولا ينطبق على الأجسام المضادة المستخدمة هنا لتسمية الهياكل المتشابكة و IHCs. استخدم قطعة من شفرة الحلاقة القابلة للكسر وحامل شفرة (كما هو موضح في الخطوة 4.2) للقطع.
- نفذ الخطوات التالية (حتى الخطوة 3.2) في أنبوبي تفاعل آمنين الختم مل (2 مل). إذا كانت قطعة الأنسجة كبيرة جدا بحيث لا يمكن وضعها داخل الأنبوب ، فقم بقص الأنسجة الزائدة بالمقص. لتحسين اختراق الأجسام المضادة ، قم أولا باختراق الأنسجة في 1 مل من 1٪ triton (Triton X-100) في PBS على 2D-shaker (100 دورة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة. اغسل المنديل 3x بسعة 1 مل من 0.2٪ triton (Triton X-100) في PBS على شاكر 2D (100 دورة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق لكل منهما.
- لمنع المستضدات غير المحددة ، احتضن القوقعة في 1 مل من محلول الحجب (3٪ ألبومين مصل البقر [BSA] ، 0.2٪ تريتون ، في PBS) على 2D-shaker (100 دورة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة.
ملاحظة: يمكن إعداد حل الحظر مقدما ولكن يجب ألا يزيد عمره عن 10 أيام تقريبا.
- تمييع الأجسام المضادة الأولية التالية طازجة في نفس أليكوت محلول الحظر: anti-myoVIIa (myosin VIIa) لتسمية IHCs (أرنب IgG متعدد النسيلة) ، مخفف 1:400 ؛ مضاد ل CtBP2 (بروتين ربط C-terminal 2) لتسمية شرائط ما قبل المشبكي (ماوس IgG1 أحادي النسيلة) ، مخفف 1:400 ؛ ومضاد GluA2 لتسمية بقع مستقبلات ما بعد المشبكي (IgG2a ماوس أحادي النسيلة) ، مخفف 1:200. تأكد من تغطية القوقعة بالكامل بمحلول الأجسام المضادة (عادة 0.4 مل) واحتضنها عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة.
- بعد ذلك ، اغسل المنديل 5x باستخدام 0.2٪ triton في PBS على شاكر 2D (100 دورة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق لكل منهما. اختر الأجسام المضادة الثانوية لتتناسب مع الأنواع المضيفة لنظيراتها الأولية ومرة أخرى تخفيفها طازجا في 3٪ BSA ، 0.2٪ triton ، في PBS: الماعز المضاد للفأر (IgG1) - Alexa fluorophore (AF) 488 ، المخفف 1: 1000 ؛ الماعز المضادة للفأر (IgG2a)-AF568 ، المخفف 1:500 ؛ والحمار المضادة للأرانب-AF647 (IgG)، المخفف 1:1000. لف الأنبوب بورق الألومنيوم لمنع تبييض التألق. احتضان القوقعة في 0.4 مل من محلول الأجسام المضادة الثانوية عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة.
ملاحظة: أشارت تجارب محدودة إلى أن حضانة أنسجة القوقعة الصناعية عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة باستخدام الأجسام المضادة الأولية والثانوية أدت إلى تلطيخ مناعي أكثر إشراقا من اتباع إجراء الحضانة الأكثر شيوعا مع درجات حرارة أقل وفترات أقصر.
- اغسل القوقعة 2x مع 1 مل من 0.2٪ تريتون في PBS لمدة 5 دقائق لكل منها و 3x مع PBS لمدة 5 دقائق لكل منها على 2D-shaker (100 دورة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة.
ملاحظة: بعد خطوات الغسيل هذه ، يمكن أن تبقى القوقعة في PBS في الثلاجة عند ~ 4 درجة مئوية لعدة أيام.
3. العلاج مع التبريد التألق الذاتي (اختياري)
ملاحظة: تظهر القوقعة من الجربوع في منتصف العمر والشيخوخة تألقا ذاتيا في الخلفية. في أنسجة البالغين الشباب ، ليس من الضروري العلاج باستخدام مبرد التألق الذاتي. من الممكن ، من حيث المبدأ ، تطبيق مبرد التألق الذاتي قبل إجراء التلطيخ المناعي ، والذي يتجنب بعد ذلك أي انخفاض غير مقصود في تألق الأجسام المضادة المطلوب. ومع ذلك ، وفقا لورقة بيانات الشركة المصنعة ، فإن استخدام المنظفات (مثل Triton X-100 في البروتوكول الحالي) لم يعد ممكنا لأنها تزيل المبرد من الأنسجة.
- قطع القوقعة إلى نصفين تحت المجهر المجسم، كما هو موضح في الخطوة 4.2.
- امزج مبرد التألق الذاتي مع الإيثانول بنسبة 70٪ للحصول على محلول 5٪ واحتضن القوقعة في هذا المحلول على شاكر 2D في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة. اغسل القوقعة 3x مع 1 مل من PBS على شاكر 2D في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق لكل منهما.
تنبيه: إن مبرد التألق الذاتي خطير وضار. ارتداء قفازات عند التعامل مع هذه المادة.
4. تشريح الغرامة النهائية
- تشريح القوقعة تحت المجهر المجسم. املأ طبق بتري متعدد الستايور وغطائه ب PBS واحتفظ بملقطين ناعمين ومقص زنبركي من فاناس وحامل شفرة حلاقة وشفرة حلاقة قابلة للكسر في متناول يديك. كسر القطع من شفرة الحلاقة للحصول على سطح قطع من ~ 2-4 مم اعتمادا على خطوة التشريح. قم بإعداد شريحة مجهرية عن طريق وضع ثلاث قطرات من وسط التركيب على التوالي.
ملاحظة: سطح القطع لشفرة الحلاقة يتلاشى بسرعة. يجب استبدال الشفرة بعد تشريح وتركيب كل قطعة ثانية تقريبا من القوقعة.
- إذا لم يتم ذلك بالفعل في الخطوة 3.1 ، فقم أولا بقطع القوقعة إلى نصفين على طول modiolus تحت المجهر المجسم. لهذا ، ضع قطعة من شفرة الحلاقة أطول من الطول الملفوف للقوقعة في حامل شفرة. ضع القوقعة في طبق بتري واقطع الأنسجة الزائدة بقطعة شفرة الحلاقة. امسك القوقعة في مكانها باستخدام ملقط ناعم وقطعها إلى نصفين على طول الموديولوس.
- ابدأ بنصف واحد ، ولكن اترك النصف الآخر في طبق بتري أيضا. ثبت بعناية نصف قوقعة الأذن باستخدام ملقط بحيث تكون حافة القطع متجهة لأعلى. استخدم مقص زنبركي ناعم لقطع عظم القوقعة فوق الهليكوتريما ، وتغطية القمة.
- لبدء فصل قطع القوقعة الصناعية ، اعزل المنعطف الأوسط عن طريق القطع بالمقص من خلال modiolus والعصب السمعي ، أعلى (scala vestibuli) وأسفل (scala tympani).
- قطع من خلال عظم القوقعة الصناعية الذي يغطي الأوعية الدموية داخل القناة القوقعية. قم بإجراء قطعتين على جانبي عظم القوقعة الصناعية فوق عضو كورتي وعلى طول الأوعية الدموية المخططة واستخدم شفرة الحلاقة لفصل قطع القوقعة الصناعية في النهاية.
ملاحظة: يمكن رؤية الأوعية الدموية ستريا بسهولة كشريط داكن. قطع على طول الأوعية الدموية ستريا يترك عضو كورتي سليمة.
- اختياري: لجمع الأوعية الدموية stria ، قطع بعناية بين عضو Corti و stria vascularis لفصل الاثنين. اترك المخطط الوعائي متصلا بالرباط الحلزوني (المتصل بالعظم الذي يغطي السطح الخارجي للقوقعة) وقم بإزالة العظم غير المكلس باستخدام الملقط. ضع القطعة مع جانب ستريا لأعلى على شريحة المجهر في قطرة من وسط التركيب.
ملاحظة: إذا كانت القطعة المجمعة منحنية بقوة كبيرة، فقد يكون من الضروري تقسيمها إلى قطع أصغر حتى تكون مسطحة بما يكفي للتركيب على الشريحة.
- انقل قطع القوقعة الصناعية إلى الغطاء المملوء ب PBS لطبق بتري متعدد الستايورول، مما يضمن أن حوامل القوقعة الصناعية بأكملها مسطحة قدر الإمكان على الشريحة. قم بإزالة الأنسجة الزائدة، مثل أجزاء من الرباط الحلزوني على الجانب الأبنوي وأجزاء من الطرف الحلزوني على الجانب العصبي. قم بإزالة الغشاء التكتوري بعناية باستخدام ملقط فائق الدقة.
- ضع قطع القوقعة الصناعية على الشريحة في قطرة من وسط التركيب. ضع حوامل القوقعة الصناعية بالكامل مع توجيه عضو Corti لأعلى على الشريحة لتجنب حجب IHCs في المسار البصري للتصوير. ابحث عن غزو الطرف الحلزوني على مقربة من IHCs ، والذي يمكن رؤيته عن طريق تحويل قطعة القوقعة الصناعية إلى المستوى السهمي لتحديد الجانب إلى الوجه لأعلى.
ملاحظة: لإعادة بناء القوقعة الكاملة رقميا من قطعها الفردية أثناء المعالجة الإضافية، يوصى بشدة بتوثيق الرسومات التخطيطية للقطع وتدوين المعالم. علاوة على ذلك ، يجب ترتيب القطع بشكل مثالي بالترتيب الصحيح على الشريحة.
- كرر الخطوات من 4.3 إلى 4.8 حتى يتم نقل القوقعة بأكملها إلى شريحة المجهر. إذا لزم الأمر ، أضف المزيد من وسط التركيب ، وقم بتغطية الشريحة ، وأغلق الغطاء في مكانه باستخدام طلاء أظافر أسود مطلي حول الحواف. اتركه يجف في الظلام في درجة حرارة الغرفة ثم قم بتخزين الشريحة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
ملاحظة: حتى لو فقدت أجزاء من الظهارة الحسية نفسها عن طريق الخطأ، فمن المهم مع ذلك تركيب ما تبقى من قطعة القوقعة الصناعية لتقدير الطول الصحيح.
5. قياس طول القوقعة الصناعية
- قم بقياس طول القوقعة من الصور الساطعة لقطعها باستخدام نظام المجهر فوق الفلوري والبرامج المرتبطة به. احفظ الصور منخفضة التكبير (عدسة 4x) من كل قطعة قوقعة صناعية واستخدم أداة قياس lasso الخاصة ببرنامج المجهر لرسم خط على طول صف IHCs في كل صورة من الصور. احسب الطول الإجمالي بإضافة أطوال جميع القطع.
ملاحظة: عندما تكون أجزاء من الظهارة الحسية مفقودة داخل قطعة قوقعة صناعية، قم باستجواب الخط.
- لتحديد مواقع القوقعة الصناعية التي يجب تحليلها في قوقعة واحدة، احسب المسافات المقابلة لها من القمة باستخدام المعادلة التي قدمها مولر25. ضع علامة على هذه المواقع ، على سبيل المثال ، على نسخة مطبوعة من قطع القوقعة الصناعية.
6. الحصول على الصورة باستخدام المجهر البؤري
- استخدم مجهرا متحد البؤرة مع هدف غمر الزيت 40x (الفتحة العددية 1.3) والزيت المناسب للتصوير عالي الدقة.
ملاحظة: إذا كان المجهر البؤري يحتوي على مسار ضوء مقلوب، فيجب وضع الشريحة رأسا على عقب. في هذه الحالة ، امنح العينة حوالي 30 دقيقة لتغرق وتستقر بثبات على الغطاء قبل البدء في الفحص النهائي. بدلا من ذلك ، استخدم وسيطا متصاعدا سائلا طوال مدة التشريح ولكنه يتصلب لاحقا وفي نفس الوقت يحافظ على التألق.
- تنشيط الليزر المناسب: يتم استخدام اثنين من ليزر أشباه الموصلات التي يتم ضخها بصريا بأطوال موجية λ = 488 نانومتر و λ = 522 نانومتر ، وليزر الصمام الثنائي بطول موجي λ = 638 نانومتر في هذا البروتوكول. اختر نطاق انبعاث علامات التألق (AF488: 499-542 نانومتر، AF568: 582-621 نانومتر، AF647: 666-776 نانومتر). عندما يقوم الكاشف الهجين بحساب الفوتونات الصادرة ، ضع خط الليزر على بعد 10 نانومتر على الأقل من منحنى الانبعاثات.
ملاحظة: من المهم إجراء فحوصات أولية باستخدام أنسجة ذات تسمية واحدة للتأكد من أن عرض النطاق الترددي للكاشف المختار يفصل قنوات الألوان بشكل نظيف (أي لا يؤدي إلى تداخل القنوات). تتداخل موجات الراديو مع الكاشف الهجين ، مما يؤدي إلى الحد الأقصى لعدد الفوتونات ، وبالتالي تسبب خطوط اصطناعية في المكدس. لذلك ، تجنب استخدام الهاتف المحمول بالقرب من المجهر.
- قم بتكبير الأنسجة حتى تمتد الصورة إلى 10 IHCs. اختر دقة الصورة وفقا لأخذ عينات Nyquist ، والتي عادة ما تكون ~ 40-60 نانومتر / بكسل. اضبط حجم الخطوة في اتجاه z على 0.3 ميكرومتر وسرعة التصوير على 400-700 هرتز.
ملاحظة: يعد كل من هذين الإعدادين (حجم الخطوة وسرعة التصوير) تنازلات بين استخدام معلمات التصوير المثلى وتوفير وقت المسح الضوئي.
- قم بإجراء أخذ عينات ثنائية الاتجاه لتقصير وقت التصوير. تجميع الإطار لقناة 488 نانومتر و 638 نانومتر 3x وقناة 522 نانومتر 6x ؛ بالإضافة إلى ذلك ، متوسط الخطوط 3x لكل قناة. اختر بداية المكدس ونهايته في البعد z.
- اضبط الكسب على 100 عند استخدام الكاشف الهجين (وضع العد) لتجنب انخفاض نسبة الإشارة إلى الضوضاء. اضبط طاقة الليزر بحيث لا يتم تشبع أي بكسل في المنطقة ذات الأهمية ولكن الهياكل تغطي في الغالب نطاق 8 بت كامل. ابدأ بقوة ليزر منخفضة تبلغ 0.5٪ وقم بزيادتها حتى تصبح الهياكل مرئية.
ملاحظة: عادة ما يحتاج التلطيخ الجيد إلى طاقة ليزر تتراوح بين 0.1٪ و 5٪.
- استخدم برنامج فك الالتفاف للمعالجة اللاحقة لمكدسات الصور لإزالة الهالة الضبابية حول هياكل الفلورسنت الصغيرة باستخدام دالة انتشار النقاط النظرية. استخدم الإعدادات نفسها لكل مكدس داخل تجربة. احفظ الصور غير المعقدة .tif أو .ics.
ملاحظة: لا تستفيد تسمية myoVIIa (IHCs) من إزالة الالتفاف وقد يتم حذفها لتوفير الوقت. يستخدم البرنامج البيانات الوصفية لملفات الصور. ومع ذلك ، يجب تحديد العديد من المعلمات مثل مسار الضوء أو وسط التضمين أو وسط الغمر.
7. القياس الكمي للمشابك
- افتح نسخة من المكدسات غير المعقدة في برنامج ImageJ الذي يمكن الوصول إليه بحرية باستخدام المكون الإضافي Biovoxxel الإضافي ، والذي يتوفر أيضا على موقعه على الويب.
- اضبط ألوان القنوات الفردية عن طريق تقسيم القنوات (الصورة | | الألوان تقسيم القنوات) والدمج (| الصورة | الألوان دمج القنوات) مرة أخرى ، مع تعيين ألوان مختلفة. تحويل الصورة إلى مكدس RGB (| الصورة | الألوان قم بالتكديس إلى RGB) واضبط السطوع والتباين (الصورة | ضبط | | السطوع/التباين إما تلقائي أو شريط تمرير فيما يتعلق بالحد الأقصى) ، إذا لزم الأمر ، بحيث تكون الهياكل قبل وبعد المشبكي وتسمية المدينة العالمية للخدمات الإنسانية متميزة بشكل ممتع عن الخلفية.
- اختر خمس شهادات IHC وقم بتصنيفها باستخدام أداة النص (IHC1-IHC5) بالنقر فوق الموقع المطلوب داخل المكدس. افتح مدير عائد الاستثمار (تحليل | أدوات | مدير عائد الاستثمار)؛ قم بتنشيط خانة الاختيار تسميات لتسمية النقاط برقم. قم بتكبير المدينة العالمية للخدمات الإنسانية التي تهمك.
- استخدم أداة النقطة/النقاط المتعددة في وضع النقاط المتعددة (انقر بزر الماوس الأيمن على الأداة للاختيار بين وضع النقطة أو النقطة المتعددة). انقر فوق مشبك شريطي وظيفي (أي شريط ما قبل المشبكي في تجاور وثيق مع رقعة الغلوتامات ما بعد المشبكي) أثناء التمرير عبر البعد z.
ملاحظة: استنادا إلى مقدار التداخل واللون المختار لكل قناة، تظهر البيكسلات المشتركة بلون مختلط. عادة ما يكون التمييز بين نقاط الاشتباك العصبي الوظيفية الفردية بسيطا لأنها بعيدة بما فيه الكفاية عن بعضها البعض.
- عند تحديد جميع هياكل الاهتمام، انقر فوق إضافة على واجهة المستخدم الرسومية لمدير عائد الاستثمار. انقر على الاسم التعسفي واختر إعادة تسمية.
ملاحظة: تظل تسميات النقاط باقية خلال كافة مستويات المكدس عند تحديد خانة الاختيار إظهار الكل في قائمة خيارات أداة النقطة (انقر نقرا مزدوجا فوق أيقونة أداة النقطة )، مما يساعد على تجنب حساب نفس المشبك الشريطي عدة مرات.
- عند اختيار المدينة العالمية للخدمات الإنسانية التالية للعد، تجنب إضافة الأعداد عن غير قصد عن طريق ضبط الصورة لعرض المدينة العالمية للخدمات الإنسانية التالية بالكامل باستخدام الأداة اليدوية. قم بالتغيير من أداة متعددة النقاط إلى أداة نقطة لتجنب إضافة المزيد من النقاط إلى البيانات المخزنة مسبقا. انقر على هيكل الاهتمام داخل المدينة العالمية للخدمات الإنسانية التالية وقم بالتغيير مرة أخرى إلى أداة متعددة النقاط. كرر الخطوات من 7.4 إلى 7.5 حتى يتم تقييم جميع المدن العالمية للخدمات الإنسانية ذات الاهتمام.
- لحفظ البيانات ، انقر فوق مجموعة بيانات في مدير عائد الاستثمار ثم عند القياس. انتظر حتى تظهر نافذة جديدة تسرد نقاط البيانات المقاسة. احفظ هذه القائمة كملف جدول بيانات (ملف | حفظ باسم). احفظ الصورة عن طريق تنشيط إظهار الكل في مدير عائد الاستثمار. انقر فوق Flatten لإضافة تسميات النقاط بشكل دائم إلى المكدس. عند إغلاق مكدس الصور، وافق على حفظ التغييرات.
8. تحليل حجم المشبك وموقعه على خلية الشعر
ملاحظة: استخدم المؤلفون إجراء مبرمجا خصيصا يعتمد على Matlab. وبما أنه غير متاح للجمهور، فإنه يرد هنا بعبارات عامة فقط (انظر أيضا7). يرجى الاتصال بالمؤلف المقابل إذا كنت مهتما باستخدامه. يتوقع الإجراء مكدس صور ثلاثي العلامات (IHCs ، ما قبل وبعد المشبكي) بتنسيق TIFF كمدخلات ، ويوجه المستخدم خلال خطوات التحليل المختلفة عبر واجهة رسومية ، ويوفر مخرجات واسعة النطاق للنتائج بتنسيق جدول بيانات.
- تطبيع موضع الهياكل المتشابكة إلى نظام إحداثي 3D محدد بمدى المدينة العالمية للخدمات الإنسانية الفردية على محور العمود المتوسط والمحور القوقعي القاعدي ومحور المدينة العالمية للخدمات الإنسانية من الأعلى (الصفيحة الجلدية) إلى الأسفل (القطب المشبكي).
ملاحظة: يتم توفير أحجام العناصر المشبكية (قبل وبعد المشبك العصبي، والحجم المشترك للمشابك الوظيفية) في μm 3 وتطبيعها إلى القيمة الوسيطة3 المعنية.