مقالة منهجية

تعزيز موثوقية البنوك الحيوية لأورام البروستاتا من خلال تحسين تقنية أخذ العينات والتوصيف النسيجي

DOI:

10.3791/65635

⸱

نوفمبر 17, 2023

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 
1Department of Pathology, Hospital Universitario y Politécnico La Fe, 2Department of Urology, Hospital Universitario y Politécnico La Fe, 3Biobanco La Fe, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, 4Department of Medicine, Jaume I University of Castellon, 5Department of Surgery, University of Valencia, 6Department of Pathology, University of Valencia

* These authors contributed equally

في هذه المقالة

ملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يصف هذا البروتوكول طريقة لتسهيل جمع العينات من عينات استئصال البروستاتا الجذري. الهدف هو رسم خرائط وتوصيف وتشريح عينات الأنسجة الدقيقة من العينات بناء على معايير التشريح المرضي قبل تخزينها في البنك الحيوي.

الملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يعد الحصول على عينات جديدة ومميزة جيدا من أنسجة الورم أمرا بالغ الأهمية لإجراء دراسات "أوميكس" عالية الجودة. ومع ذلك ، يمكن أن يكون تحديا خاصا في سياق سرطان البروستاتا (PC) بسبب الطبيعة الفريدة لهذا العضو وعدم التجانس العالي المرتبط بهذا الورم. من ناحية أخرى ، فإن توصيف العينات نسيجيا قبل تخزينها دون التسبب في تغييرات كبيرة في الأنسجة يمثل أيضا تحديا مثيرا للاهتمام. في هذا السياق ، نقدم طريقة جديدة لاكتساب أنسجة البروستاتا المقطوعة ورسم خرائطها وتوصيفها وتشريحها الدقيق بناء على معايير التشريح المرضي.

على عكس البروتوكولات المنشورة سابقا ، تقلل هذه الطريقة من الوقت اللازم للتحليل النسيجي المرضي لعينة البروستاتا دون المساس بهيكلها ، وهو أمر بالغ الأهمية لتقييم الهوامش الجراحية. علاوة على ذلك ، فإنه يتيح تحديد وتشريح الماكرو الجزئي لعينات أنسجة البروستاتا الطازجة ، مع التركيز على مناطق الورم النسيجية المحددة بمعايير مرضية مثل درجة غليسون ، وآفات السلائف (أورام البروستاتا داخل الظهارة عالية الدرجة - PIN) ، والآفات الالتهابية (التهاب البروستاتا). ثم يتم تخزين هذه العينات في بنك حيوي لتحليلات البحوث اللاحقة.

المقدمة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

سرطان البروستاتا (PC) هو2 الثانية الأكثر شيوعا في الرجال و 5السبب الرئيسي للوفاة في جميع أنحاء العالم1. يعتمد علاج المريض والتشخيص على التدريج والتصنيف (درجة جليسون) للورم ، كما يتضح من ارتفاع معدلات البقاء على قيد الحياة لمدة 5 سنوات للأورام الموضعية والمنخفضة الدرجة (درجة جليسون 6) (99٪) مقارنة بدرجات جليسون العالية والأورام النقيلية (31٪) 2.

تم ربط الانتكاس الموضعي للكمبيوتر الشخصي وفشل العلاج بعدم التجانس الوراثي المميز داخل الورم لهذا النوع من الورم3. بالإضافة إلى ذلك ، يعتبر PC مرضا متعدد البؤر مع العديد من بؤر الورم التي تظهر خصائص مورفولوجية ونسيجية وجزيئية مختلفة4 ، والتي قد تنشأ بشكل مستقل أو مشتقة من سلف خلية سرطانية شائع5. أظهرت الدراسات السابقة أن تطور الورم يختلف بين المرضى بناء على دوافع وراثية محددة يمكن أن تعزز ورم خبيث أو تحصر سلالة الخلية في البروستاتا5. لذلك ، يعد التوصيف الجزيئي لبؤر الورم المختلفة أمرا بالغ الأهمية ليس فقط لتوفير تشخيص وتشخيص أكثر دقة ولكن أيضا لتصميم علاج فعال وشخصي للمريض.

في هذا السياق ، توفر البحوث الطبية الحيوية والنهج التكاملية متعددة الأوميكس فرصا غير مسبوقة لتصنيف السرطانات إلى أنواع فرعية مختلفة ، وتحديد المؤشرات الحيوية التشخيصية والتنبؤية ، واكتشاف العلامات المتعلقة بالاستجابة للعلاج. علاوة على ذلك ، تساهم هذه الأساليب في فهم أفضل لبيولوجيا هذا المرض 6,7. يمكن تحليل العينات البيولوجية ، سواء كانت أنسجة أو سوائل حيوية ، باستخدام منصات متعددة الأوميكس (علم الجينوم ، وعلم النسخ ، والبروتينات ، والأيض ، وما إلى ذلك) للكشف عن السمات البيولوجية الكامنة وراء الفيزيولوجيا المرضية للسرطان ، وبالتالي معالجة القيود الحالية المتعلقة بعدم التجانس الجيني والظاهري6. ومع ذلك ، من المهم مراعاة أن جودة البيانات المستمدة من دراسات omics تعتمد على جودة العينات التي تم جمعها من الأورام ، وتوصيفها الدقيق ، والمعالجة والتخزيناللاحقين 8.

في هذا السياق ، يمثل الحصول على أنسجة PC جديدة للبحث تحديا منهجيا بسبب صعوبة أخذ عينات الورم بنجاح9. تضمنت الطرق السابقة أخذ عينات عشوائية بعد استئصال البروستاتا الجذري ، مما أسفر عن نتائج سيئة10. ومع ذلك ، تتضمن الأساليب الحديثة بروتوكولات مستهدفة تستند إلى كل من التصوير بالرنين المغناطيسي (MRI) وبيانات الخزعة ، مما يؤدي إلى تحسين الفعالية في جمع عينات الورم11.

من ناحية أخرى ، فإن التوصيف النسيجي المرضي للعينات قبل تخزينها دون تغيير كبير في الأنسجة يشكل أيضا تحديا مثيرا للاهتمام. وبالتالي ، في كثير من الحالات ، يتم إجراء التحديد النسيجي المرضي للعينات بعد تحليلها (على سبيل المثال ، تحليل التمثيل الغذائي HR 1H NMR)12. تستلزم هذه الممارسة نفقات غير ضرورية ، واستهلاك الوقت ، وفقدان عدد كبير من العينات التي يتم استبعادها في النهاية من التحليل (على سبيل المثال ، العينات التي ، بعد التحليل النسيجي المرضي ، تبين أنها ليست عينات ورم). في حالات أخرى ، يتم إجراء التوصيف النسيجي المرضي للعينات قبل تحليلها. في الواقع ، حاولت بعض الدراسات السابقة توحيد طرق توفير عينات بحثية تمثيلية عالية الجودة من عينات استئصال البروستاتا الجذري لعلم الجينوم والأيض13،14. ومع ذلك ، فإن كفاءة أخذ العينات أعلى بكثير عند إجراؤها من أقسام مؤكدة نسيجيا بالفعل (88٪) تعطل الأنسجة ، مقارنة بعند إجراؤها من أقسام غير مؤكدة (45٪) 1.

هنا ، يتم تقديم منهجية جديدة للتغلب على هذه القيود ، بهدف الحصول على عينات جديدة ومميزة جيدا من أجهزة الكمبيوتر قبل التخزين في البنك الحيوي. تم تطوير هذه الطريقة من خلال الجهود التعاونية بين الخدمات السريرية المختلفة (جراحة المسالك البولية وعلم الأمراض والبنك الحيوي لمستشفى La Fe). من المهم تسليط الضوء على أن البنوك الحيوية تلعب دورا أساسيا في جمع العينات البيولوجية ومعالجتها وحفظها وتخزينها مع ضمان الجودة العالية للعينات والبيانات ، فضلا عن الامتثال للمتطلبات الأخلاقية والقانونية8،15،16.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تم تطوير هذه الطريقة من خلال الجهود التعاونية التي تشمل خدمات سريرية مختلفة (جراحة المسالك البولية ، وعلم الأمراض ، والبنك الحيوي لمستشفى La Fe). أجريت الدراسة وفقا للمبادئ التوجيهية المؤسسية والوطنية والدولية لرفاهية الإنسان ، وحصلت على موافقة من لجنة أخلاقيات البحوث الطبية الحيوية في معهد البحوث الصحية في مستشفى Universitario y Politécnico La Fe (فالنسيا ، إسبانيا). تم تخزين جميع العينات في البنك الحيوي لمستشفى La Fe (PT13 / 0010 / 0026). الإجراء العام مفصل في الشكل 1.

figure-protocol-1
الشكل 1: مخطط الإجراءات العام. تمثيل تخطيطي للإجراء التدريجي الموضح في قسم البروتوكول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

1. استهداف الورم

  1. قبل الجراحة ، استخدم التصوير بالرنين المغناطيسي متعدد المعلمات أو ثنائي المعلمات (mpMRI أو bpMRI)17,18 لتحديد موقع الورم وتعيين موقعه داخل غدة البروستاتا. الجمع بين المعلومات التي تم الحصول عليها من التصوير بالرنين المغناطيسي مع نتائج الموجات فوق الصوتية عبر المستقيم أو فحص المستقيم إذا كان الأخير يعطي نتائج متنافرة.
  2. لتعزيز توطين الورم، راجع نتائج خزعات البروستاتا عبر المستقيم الموجهة بالموجات فوق الصوتية والتصوير بالرنين المغناطيسي قبل الجراحة.
    ملاحظة: في الإجراء التشخيصي لسرطان البروستاتا ، يتم أخذ الخزعات مباشرة من البروستاتا عبر الوصول عبر المستقيم. تتضمن هذه الخزعات أخذ عينات منهجية من البروستاتا (تتضمن أسطوانات موزعة في جميع أنحاء الغدة) وأسطوانات تستهدف مباشرة النتائج المشبوهة في التصوير بالرنين المغناطيسي. لاستهداف استرجاع هذه العينات ، يتم استخدام الموجات فوق الصوتية عبر المستقيم ، والتي يتم دمجها مع نتائج التصوير بالرنين المغناطيسي بطريقة معرفية ("الانصهار المعرفي") أو مع "برنامج اندماج حقيقي بالموجات فوق الصوتية بالرنين المغناطيسي" عند توفره.

2. استئصال البروستاتا الجذري وجمع البروستاتا

  1. قم بإجراء استئصال البروستاتا الجذري بمساعدة الروبوت من خلال نهج عبر الصفاق ، باتباع الخطوات التي حددها Huynh et al.19.
    1. ابدأ بالوصول إلى البطن والنفخ ووضع منفذ الكاميرا (انظر جدول المواد). ضع المنافذ الخمسة المتبقية تحت الرؤية المباشرة. ضبط استرواح الصفاق إلى 12 ملم.
    2. حرر المثانة عن طريق شق الصفاق وتشريح الفضاء حول المستقيم.
    3. افتح لفافة الحوض على كل جانب.
    4. إجراء تشريح كامل للجوانب الأمامية والجانبية للبروستاتا والمثانة.
    5. تنفيذ فتح عنق المثانة ، وتحديد وتقسيم مجرى البول القريب للوصول إلى الجوانب الخلفية للبروستاتا والمثانة.
    6. تشريح الحويصلات المنوية ومساحة المستقيم19.
    7. تشريح الجوانب الجانبية للبروستاتا ، مع تجنيب الحزم الوعائية العصبية.
    8. ضمان الارقاء من الأوعية في الفضاء خلف العانة.
    9. تشريح القمة وقسم مجرى البول البعيد.
    10. أكمل مفاغرة المفاغرة المثاني الإحليلي.
    11. استخراج البروستاتا وإجراء إغلاق شق19.
  2. جمع البروستاتا الطازجة في وعاء جاف. من الأهمية بمكان عدم إصلاح عينة العينة أو تضمينها بالبارافين.
  3. نقل العينة الجراحية الطازجة ، والتي تشمل البروستاتا بأكملها ، إلى البنك الحيوي لمعالجة العينات.

3. معالجة البروستاتا وجمع العينات

  1. حدد مناطق البروستاتا المستهدفة لأخذ العينات بناء على معلومات موقع الورم التي تم استردادها من التصوير بالرنين المغناطيسي قبل الجراحة ، ونتائج الخزعة قبل الجراحة ، وجس عينة استئصال البروستاتا المباشر. سجل هذه المعلومات في نموذج يتضمن بيانات تعريف المريض ومناطق البروستاتا التي تم أخذ عينات منها أخيرا وعدد العينات التي تم جمعها.
    ملاحظة: عندما تكون نتائج التصوير بالرنين المغناطيسي ونتائج الخزعة قبل الجراحة وملامسة عينة استئصال البروستاتا المباشر متوافقة ، استهدف جميع العينات إلى ذلك أو تلك المواقع (بين 4 و 6 أسطوانات). إذا كان هناك أي اختلاف ، فقم بزيادة عدد الأسطوانات واستهدف بشكل منفصل جميع المناطق التي يشتبه في تأثرها بأي من هذه الطرق.
  2. استخدم إبرة أوتوماتيكية يمكن التخلص منها (جراح) لاسترداد العينات الأسطوانية من المناطق المحددة (الخطوة 1.1). بعد ذلك ، حدد (أخصائي علم الأمراض) المنطقة الخارجية للأسطوانة ، وقم بتثبيت الأسطوانة بملقط الأنسجة ، وضعها على شريحة ، وقم بتمييز المنطقة الخارجية بحبر الأنسجة. كرر هذه العملية مع أخذ جميع الأسطوانات.
  3. ضع الأسطوانات المجمعة أفقيا على قرص حامل عينة (انظر جدول المواد) مملوء بوسط تضمين cryostat وانقلها إلى السطح الزجاجي لتبريد microtome للقطع.
  4. بمجرد وضعه على السطح الزجاجي ، قم بتوصيل قرص حامل العينة بظرف العينة ، وقم بقصه بحركات دقيقة للعجلة باتباع الخطوات التالية:
    1. استخدم مركب درجة حرارة القطع الأمثل (مركب OCT ، انظر جدول المواد) لتضمين عينة الأنسجة قبل التقسيم المجمد على ميكروتوم كريوستات.
    2. بعد ذلك ، اقطع العينة باستخدام ميكروتوم كريوستات عند -25 درجة مئوية. اجمع مقاطع رقيقة على شكل أسطوانة من الأنسجة (10 ميكرومتر) على شرائح مجهرية معالجة. تأكد من جمع بضعة ميكرونات فقط من الأنسجة لضمان كمية كافية من أنسجة الورم السليمة للتخزين في البنك الحيوي.
    3. اجمع قسمين أو ثلاثة أقسام رفيعة لكل شريحة وقم بتلطيخها يدويا للتحكم في التلوين النهائي. تضمن عين الفني تلطيخا مثاليا ، ويمكن إجراء أي إعادة تلطيخ ضرورية. اتبع هذه الخطوات
      1. إصلاح الشرائح في 96 ٪ من الإيثانول ، هيدرات في الماء المقطر ، وصمة عار مع هاريس الهيماتوكسيلين (انظر جدول المواد) لمدة 1 دقيقة لتلطيخ النوى. إزالة الهيماتوكسيلين الزائدة عن طريق شطف الشرائح بالماء المقطر.
      2. عالج الشرائح التي تحتوي على هيدروكسيد الأمونيوم بنسبة 30٪ لتحويل الهيماتوكسيلين إلى اللون الأزرق. إزالة الحل الزائد مع شطف الماء المقطر.
      3. شرائح وصمة عار مع eosin (انظر جدول المواد) لمدة 30 ثانية.
      4. بعد ذلك ، قم بتجفيف الشرائح بمعايرة متزايدة من الكحول ، ونظفها بالزيلين (100٪) ، وقم بتركيبها باستخدام DPX (خليط من الديستيرين والملدنات والزيلين ، يستخدم كوسائط تثبيت راتينج اصطناعي يحل محل زيلين بلسم ، انظر جدول المواد). خلال هذه الخطوات ، اغمس الشرائح وأخرجها من جرة محلول كوبلن.
      5. أخيرا ، ضع غطاء فوق الأنسجة الملطخة واستخدم وسيطا بمعامل انكسار مناسب (انظر جدول المواد) للعرض تحت المجهر.

4. توصيف العينة

  1. تحليل العينة تحت المجهر الضوئي (أخصائي علم الأمراض) ، والتمييز بين مناطق السرطان وتحديد درجة غليسون للورم. قم بتوثيق كل هذه البيانات ووضع علامة على مناطق الورم الدقيقة على الشرائح.
  2. خلال هذه الخطوة ، قم بتسمية الشريحة بالموقع الدقيق للورم ونقاط Gleason20 الخاصة به. أيضا ، حدد موقع PIN (الأورام داخل البروستاتا) بناء على التحديد المورفولوجي.

5. عينة تشريح الجزئي الكلي والتخزين

  1. ضع علامة واضحة على المكونات النسيجية المختلفة بعلامات مميزة على الشريحة (أخصائي علم الأمراض) واربطها مباشرة بالأنسجة المجمدة على القرص.
  2. بعد ذلك ، باستخدام شفرة جراحية ، يقوم الماكرو الجزئي بتشريح مناطق العينة المحددة على الشريحة داخل قرص OCT ، وتقسيمها إلى أنسجة سرطانية وشبه أورام و PIN وأنسجة البروستاتا الطبيعية.
  3. عندما يبدأ وسيط التضمين في التذويب ، تعامل مع الأنسجة بالملقط وضعها في أنابيب التبريد ذات العلامات الصحيحة.
    ملاحظة: قم بتخزين كل جزء تشريح بعناية داخل الأنبوب المقابل ، بعد التشخيص النسيجي لشرائح التبريد.
  4. قم بتخزين أنابيب التبريد الموسومة بعينات نسيجية كاملة المواصفات في البنك الحيوي عند -80 درجة مئوية لاستخدامها لاحقا في الدراسات البحثية.
    ملاحظة: يمكن تنفيذ الخطوات الموضحة في هذا القسم بواسطة فني مدرب تحت إشراف أخصائي علم الأمراض. يجب نقل العينة الجراحية إلى البنك الحيوي في أقرب وقت ممكن لمنع تدهور الأنسجة والحمض النووي. وفقا للأدلة المرجعية ، يجب بذل الجهود لتجنب وقت نقص التروية المطول (>30 دقيقة)21. يمكن الاحتفاظ بالعينات في البنك الحيوي إلى أجل غير مسمى طالما يتم الحفاظ على مبادئ جودة العينة.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تكشف النتائج أن هذه التقنية جعلت من الممكن الحصول على مادة الورم في 61٪ من الحالات التي تمت دراستها (25 من أصل 41 حالة) (الجدول 1).

الجدول 1: البيانات النسيجية المرضية لعينات الدراسة. ملخص البيانات النسيجية المرضية للعينات المستخدمة في الدراسة. تشير أسطوانة التشخيص إلى عينة خزعة البروستاتا التي تم الحصول عليها لأغراض التشخيص ، بينما تتوافق الأسطوانة المعالجة مع الأسطوانة التي تم الحصول عليها من عينة استئصال البروستاتا لأغراض البحث. ND: لا توجد بيانات. LL: الفص...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

في أي دراسة بحثية ، يعد الحصول على عينات عالية الجودة مطلبا أساسيا لتقليل التحيزات المنهجية والحصول على نتائج موثوقة22. لذلك ، يجب مراعاة التحكم في المتغيرات قبل التحليل مثل درجة الحرارة التي تتم فيها معالجة العينات وتخزينها ، والوقت المنقضي من جمع العينات إلى التخزين ، واستخدام المواد المعقمة ، أو الآثار التي يمكن أن تحدثها إضافة المواد الحافظة أو المواد المضافة الأخرى على العينات في أي بروتوكول يتضمن عينات بيولوجية. ليس هذا المفتاح فحسب ، بل يعد أيضا التحديد الصحيح للعينات وتدويناها ، بالإضافة إ...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يعلن أصحاب البلاغ عدم وجود تضارب في المصالح.

شكر وتقدير

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تعترف AL بعقد ما بعد الدكتوراه "Margarita Salas" (رقم 21-076) ، و MAM-T عقد بحث "ماريا زامبرانو" (رقم MAZ / 2021/03 UP2021-021). تم تمويل كلا العقدين من قبل الاتحاد الأوروبي - الجيل القادم من الاتحاد الأوروبي.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
ملقط كاديربديهيPN1052082-US 10/2021رقم القطعة: 471049. 18 استخداما.
الشرائح التقليديةKnittel Glass2021أرضي / بلوري
نهاية Cryostat microtomeThermo Fisher Scientific---Criostato CryoStar NX50
CryotubesGreiner Bio-One GmbHالمرجع: 122280.CRYO S. PP ، مع غطاء لولبي ، معقم.
نظام دافنشي الجراحيبديهيPN1052082-US 10/2021XI نموذج
أدوات التشريحBayer---ملاقطان وشفرة جراحية 
DPX Eukitt Medizin- und Labortechnik GmbH6.00.01.0001.06.01.01
EosinAgilent157252
ملقط ثنائي القطب FenestratedIntuitivePN1052082-US 10/2021رقم الجزء: 471205. 14 حياة.
القوة ثنائية القطببديهيةPN1052082-US 10/2021رقم القطعة: 471405. 12 استخداما.
مجمداتحراري علميموديل 907. -80 & ordm; C
HematoxylinAgilent157251
Inmunohistochemistry SlidesAgilent-DakoK802021-2
سائق إبرة كبيربديهيPN1052082-US 10/2021رقم القطعة: 471006. 15 استخداما.
ملقط ماريلاند ثنائي القطببديهيةPN1052082-US 10/2021رقم الجزء: 471172. 14 استخداما.
مجهرأوليمبوس---أوليمبوس cx40
شفرات ميكروتومPFM Medicala35
مقص منحني أحادي القطببديهيPN1052082-US 10/2021رقم القطعة: 470179. 10 استخدامات.
OCT مركبNEG-50LOT.117340
PlusSpeed S جهاز خزعة للاستخدام مرة واحدة مع طرف مشطوفبيتر Pflugbeil GmbH ملقط PSS-1825-S
ProGaspبديهيةPN1052082-US 10/2021رقم القطعة: 471093. 18 استخداما.
حامل العينة قرصديفيدسون كرايو تشاك. برادلي منتجات30 مم  
حبر مناديلPelikan2021Ink 4001 أسود لامع (301168)
XylolQuimipurالمرجع 169

المراجع

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Rawla, P. Epidemiology of prostate cancer. World Journal of Oncology. 10 (2), 63-89 (2019).
  2. Epstein, J. I. The 2019 Genitourinary Pathology Society (GUPS) white paper on contemporary grading of prostate cancer. Archives of Pathology & Laboratory Medicine. 145 (4), 461-493 (2021).
  3. Zhang, W. Intratumor heterogeneity and clonal evolution revealed in castration-resistant prostate cancer by longitudinal genomic analysis. Translational Oncology. 16, 101311(2022).
  4. Haffner, M. C., et al. Genomic and phenotypic heterogeneity in prostate cancer. Nature Reviews Urology. 18 (2), 79-92 (2021).
  5. Woodcock, D. J. Prostate cancer evolution from multilineage primary to single lineage metastases with implications for liquid biopsy. Nature Communications. 11 (1), 5070(2020).
  6. Heo, Y. J., Hwa, C., Lee, G. H., Park, J. M., An, J. Y. Integrative multi-omics approaches in cancer research: from biological networks to clinical subtypes. Molecules and Cells. 44 (7), 433-443 (2021).
  7. Menyhárt, O., Győrffy, B. Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis. Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, 949-960 (2021).
  8. Annaratone, L. Basic principles of biobanking: from biological samples to precision medicine for patients. Virchows Archiv. 479 (2), 233-246 (2021).
  9. King, C. R., Long, J. P. Prostate biopsy grading errors: A sampling problem. International Journal of Cancer. 90 (6), 326-330 (2000).
  10. Jayadevan, R., Zhou, S., Priester, A. M., Delfin, M., Marks, L. S. Use of MRI-ultrasound fusion to achieve targeted prostate biopsy. Journal of Visualized Experiments. 146, e59231(2019).
  11. Heavey, S., et al. Use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking. Journal of Visualized Experiments. 152, 60216(2019).
  12. Panach Navarrete, J. Estudio metabolómico en tejido prostático y orina para el diagnóstico y pronóstico del cáncer de próstata. , https://roderic.uv.es/handle/10550/81853 (2022).
  13. Bertilsson, H., et al. A new method to provide a fresh frozen prostate slice suitable for gene expression study and MR spectroscopy. The Prostate. 71 (5), 461-469 (2011).
  14. Show SOP - Biospecimen Research Database. , https://brd.nci.nih.gov/brd/sop/show/522 (2022).
  15. Dagher, G. Quality matters: International standards for biobanking. Cell Proliferation. 55 (8), e13282(2022).
  16. Yüzbaşıoğlu, A., Özgüç, M. Biobanking: sample acquisition and quality assurance for "omics" research. New Biotechnology. 30 (3), 339-342 (2013).
  17. Carpagnano, F. A. Multiparametric MRI: local staging of prostate cancer. Current Radiology Reports. 8 (12), 27(2020).
  18. Christophe, C. Prostate cancer local staging using biparametric MRI: assessment and comparison with multiparametric MRI. European Journal of Radiology. 132, 109350(2020).
  19. Huynh, L. M., Ahlering, T. E. Robot-assisted radical prostatectomy: a step-by-step guide. Journal of Endourology. 32 (S1), S28-S32 (2018).
  20. van Leenders, G. J. L. H., et al. The 2019 International Society of Urological Pathology (ISUP) consensus conference on grading of prostatic carcinoma. The American Journal of Surgical Pathology. 44 (8), e87-e99 (2020).
  21. Liu, A., Collins, C. C., Diemer, S. M. Biobanking metastases and biopsy specimens for personalized medicine. Journal of Biorepository Science for Applied Medicine. 3, 57-67 (2015).
  22. Ellervik, C., Vaught, J. Preanalytical variables affecting the integrity of human biospecimens in biobanking. Clinical Chemistry. 61 (7), 914-934 (2015).
  23. Arellano, H. L., Castillo, C. O., Metrebián, B. E. Diagnostic agreement of the Gleason score in needle biopsy and radical prostatectomy and its clinical consequences. Rev Méd Chile. 132 (8), 971-978 (2004).
  24. Torres Caparó, D. A. Concordancia en los valores de gleason en biopsia prostática transrectal y en prostatectomia radical en pacientes con cáncer de próstata del Hospital Cirujano Mayor Santiago Távara entre enero 2010 - junio del 2018. , Universidad Ricardo Palma. https://repositorio.urp.edu.pe/handle/20.500.14138/1886 (2019).
  25. Chavolla-Canal, A. J., et al. Concordancia del puntaje de Gleason en biopsia transrectal de próstata vs prostatectomía radical. Revista Mexicana de Urología. 81 (2), 1-10 (2021).
  26. Fan, X. J., et al. Impact of cold ischemic time and freeze-thaw cycles on RNA, DNA and protein quality in colorectal cancer tissues biobanking. Journal of Cancer. 10 (20), 4978-4988 (2019).
  27. Vaswani, A., et al. Comparative liquid chromatography/tandem mass spectrometry lipidomics analysis of macaque heart tissue flash-frozen or embedded in optimal cutting temperature polymer (OCT): Practical considerations. Rapid communications in Mass Spectrometry: RCM. 35 (18), e9155(2021).
  28. Zhang, W., Sakashita, S., Taylor, P., Tsao, M. S., Moran, M. F. Comprehensive proteome analysis of fresh frozen and optimal cutting temperature (OCT) embedded primary non-small cell lung carcinoma by LC-MS/MS. Methods (San Diego, Calif). 81, 50-55 (2015).
  29. Boyd, A. E., Allegood, J., Lima, S. Preparation of human tissues embedded in optimal cutting temperature compound for mass spectrometry analysis. Journal of Visualized Experiments. 170, e62552(2021).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

مقالات ذات صلة