يصف البروتوكول الحالي طريقة تحليل النباتات المعوية باستخدام تسلسل الجينات 16S rRNA القائم على Illumina ويوفر إطارا لتقييم فعالية decoctions العشبية.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
يصف البروتوكول الحالي طريقة تحليل النباتات المعوية باستخدام تسلسل الجينات 16S rRNA القائم على Illumina ويوفر إطارا لتقييم فعالية decoctions العشبية.
من أجل استكشاف مبدئي لآثار Desmodium caudatum على التهاب المعدة والنباتات المعوية في الفئران ، تم إنشاء نموذج فئران التهاب المعدة المزمن باستخدام طريقة ساليسيلات الصوديوم الكلاسيكية. تم تقسيم ثمانية عشر فأرا SPF إلى ثلاث مجموعات: المجموعة الضابطة (المجموعة C) ، والمجموعة النموذجية (المجموعة M) ، ومجموعة العلاج (المجموعة T). تم أخذ الأقسام المرضية لجدار المعدة من الفئران في كل مجموعة. علاوة على ذلك ، تم تحديد تركيزات الغاسترين والمالوندالديهيد في مصل الفئران في كل مجموعة بواسطة ELISA. بالإضافة إلى ذلك ، تم استكشاف آثار D. caudatum على النباتات المعوية للفئران المصابة بالتهاب المعدة من خلال مقارنة مفصلة للمجتمعات البكتيرية المعوية في المجموعات الثلاث ، باستخدام تسلسل جين 16S rRNA القائم على Illumina. أشارت النتائج إلى أن ديكوتيون D. caudatum يمكن أن يقلل من محتوى malondialdehyde ويزيد من محتوى الغاسترين. علاوة على ذلك ، تم العثور على D. caudatum decoction لتعزيز تنوع ووفرة النباتات المعوية ، مما يمارس تأثيرا إيجابيا على علاج التهاب المعدة من خلال تنظيم واستعادة النباتات المعوية.
يتميز التهاب المعدة المزمن (CG) ، أحد أكثر الأمراض السريرية شيوعا ، بتغيرات التهابية مزمنة ومستمرة في ظهارة الغشاء المخاطي في المعدة ، والتي تتعرض للهجوم بشكل متكرر ومتكرر من قبل عوامل مسببة للأمراضالمختلفة 1. يحتل معدل الإصابة ب CG المرتبة الأولى بين جميع أنواع أمراض المعدة ، وهو ما يمثل 40٪ إلى 60٪ من معدل خدمة العيادات الخارجية في قسم أمراض الجهاز الهضمي2. علاوة على ذلك ، يزداد معدل الإصابة بشكل عام مع تقدم العمر ، خاصة في الأفراد الذين هم في منتصف العمر وكبارالسن 3. مما لا شك فيه أن CG يقلل بشكل كبير من نوعية حياة الناس ، مما يؤكد الحاجة الماسة لاكتشاف عوامل علاجية جديدة.
أفادت العديد من الدراسات أن حدوث وتطور CG مرتبطان بإفراز هرمونات الجهاز الهضمي ، مثل الغاسترين (GAS)4,5. يحفز GAS ، وهو هرمون ببتيد معدي معوي شائع في الجهاز الهضمي ، الخلايا على إفراز حمض المعدة عن طريق تعزيز إطلاق الهيستامين من الحمضات. بالإضافة إلى ذلك ، فإنه يحسن التغذية وإمدادات الدم من الغشاء المخاطي في المعدة ، وتعزيز انتشار الغشاء المخاطي في المعدة والخلايا الجدارية6. لذلك ، يمكن استخدام الغاسترين كمؤشر لتقييم مستوى تطوير CG. علاوة على ذلك ، يمكن لمنتجات بيروكسيد الدهون التي تسببها الأكاسيد التفاعلية تنشيط الخلايا الالتهابية ، مما يؤدي إلى CG. Malondialdehyde (MDA) ، علامة بيروكسيد الدهون ، هو مؤشر شائع الاستخدام لقياس درجة الإجهاد التأكسدي. إنه يعكس مستوى الجذور الحرة في الغشاء المخاطي في المعدة إلى حد ما. يمكن أن يشير مستوى MDA إلى هجوم الأحماض الدهنية غير المشبعة في الغشاء المخاطي في المعدة المحلية التي تسببها الجذور الحرة 7,8.
تتكون البيئة الدقيقة المعوية من ملايين الكائنات الحية الدقيقة الموجودة في الأمعاء المضيفة ، وتلعب دورا حيويا في الحفاظ على صحة المضيف وتنظيم مناعة المضيف. تعمل النباتات المعوية الصحية ، التي تتميز بالثراء العالي والتنوع ووظيفة الجراثيم المستقرة ، كحاجز وقائي ضد غزو الكائنات الحية الدقيقة المسببة للأمراض من خلال المشاركة في عملية التمثيل الغذائي. الاضطرابات في النباتات المعوية تجعل الأفراد أكثر عرضة لأمراض الجهاز الهضمي الحادة والمزمنة 9,10. في السنوات الأخيرة ، تقدم علاج الجراثيم لأمراض الجهاز الهضمي بسرعة وأظهر فعالية كبيرة11. باختصار ، فإن النظر في النباتات المعوية أمر بالغ الأهمية في فهم ومعالجة أمراض الجهاز الهضمي.
كعنصر لا غنى عنه في كنز الطب الصيني التقليدي ، تحمل المواد الطبية الشعبية أهمية كبيرة للممارسة السريرية وتحديث الطب الوطني. جذور وأجزاء كاملة من Desmodium caudatum (Thunb.) DC. على نطاق واسع لتخفيف عدم الراحة في المعدة في منطقة Beichuan Qiang في مدينة Mianyang لفترة طويلة. تشير بعض المقالات إلى الأساس العلمي لعلاج أمراض الجهاز الهضمي باستخدام D. caudatum ، مستشهدة بآثاره مثل الإرقاء ومضادات الأكسدة وحماية الجهاز الهضمي12،13،14. ومع ذلك ، بسبب عدم وجود بحث متعمق ، لم يتم إنشاء آلية الديناميكا الدوائية السريرية. تهدف هذه المقالة إلى دراسة آثار D. caudatum في علاج التهاب المعدة على أساس هرمونات الجهاز الهضمي والنباتات المعوية ، وتوفير أساس لتطبيقه السريري العقلاني.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تمت الموافقة على إجراءات رعاية واستخدام من قبل لجنة الأخلاقيات بجامعة ميانيانغ العادية ، وتم اتباع جميع اللوائح المؤسسية والحكومية ذات الصلة المتعلقة بالاستخدام الأخلاقي للحيوانات بدقة. بالنسبة للدراسة الحالية ، تم استخدام فئران SPF (أنواع كونمينغ ، ذكورا وإناثا ، تزن 180-220 جم). تم الحصول على من مصدر تجاري (انظر جدول المواد). تم إيواء جميع في بيئة خالية من مسببات الأمراض ووفرت الوصول إلى الغذاء.
1. إعداد الكواشف
2. التجميع والإدارة
3. القسم المرضي لجدار المعدة
4. تحديد هرمونات الجهاز الهضمي في الدم
5. استخراج الحمض النووي الكلي للبراز وتضخيم وتنقية PCR
6. التسلسل
ملاحظة: يتم تنفيذ الخطوة 6 والخطوة 7 باتباع الطرقالمنشورة مسبقا 20،21.
7. معالجة بيانات التسلسل
8. التحليل الإحصائي
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يوضح الشكل 1 نتائج القسم المرضي لجدار المعدة. بالمقارنة مع المجموعة C ، أظهرت المجموعة M ضمور جدار المعدة الخفيف والتهاب خفيف. ومع ذلك ، عند مقارنتها بالمجموعة M ، لم تظهر المجموعة T أي التهاب واضح أو حؤول معوي أو ضمور. هذا يشير إلى أن D. caudatum ديكوتيون يمكن أن يحسن بشكل فعال التهاب المعدة.
يتم عرض نتائج فحص هرمون الجهاز الهضمي في الدم في الشكل 2. كان محتوى malondialdehyde (MDA) أعلى بكثير في المجموعة M منه في المجموعة C. ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
D. caudatum ، وهو دواء شعبي شائع الاستخدام من قبل جنسية تشيانغ12 ، أظهر فعالية كبيرة في علاج أمراض الجهاز الهضمي. مع تقدم البحوث الدوائية الحديثة ، يتم تحديد اختلال توازن النباتات الناتج عن اختلال توازن البيئة الدقيقة المعدية المعوية كعامل رئيسي في أمراض الجهاز الهضمي الحادة والمزمنة22,23. تلعب بعض الكائنات الحية الدقيقة في الأمعاء دورا حاسما في الحفاظ على التوازن الديناميكي في الجسم ، وتعكس الهرمونات في المصل الحالة الفسيولوجية و...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس لدى المؤلفين ما يكشفون عنه.
تم تمويل هذا العمل من قبل مشاريع البحث والتطوير الرئيسية لإدارة العلوم والتكنولوجيا في مقاطعة سيتشوان (2020YFS0539).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| تحليل تنوع ألفا | Mothur 1.30.2 | ||
| AxyPrep مجموعة استخراج هلام الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين (DNA) | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
| تحليل التنوع التجريبي | Qiime 1.9.1 | ||
| ثلاجة مبردة | Forma-86C ULT فريزر | ||
| Desmodium caudatum | مستشفى الطب الصيني التقليدي في مقاطعة Beichuan Qiang ذاتية الحكم | ||
| E.Z.N.A. مجموعة التربة | أوميغا بيو تيك | D5625-01 | |
| Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300 / NovaSeq PE250 | ||
| Multiskan | Spectrum Max i3 | ||
| OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
| OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
| PCR أداة | TransGen AP221-02 | ||
| PCR أداة | ABI GeneAmp 9700 | ||
| QuantiFluor-ST مزدوجة تقطعت بهم السبل نظام الحمض النووي (dsDNA) | Promega Corp. | ||
| تصنيف التسلسل التعليق التوضيحي | RDP المصنف 2.11 | ||
| ساليسيلات الصوديوم | Sichuan Xilong الكيميائية المحدودة | 54-21-7 | |
| SPF الفئران | تشنغدو Dashuo التجريبي المحدودة | ||
| SPSS 18.0 | IBM |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.