يحدد هذا البروتوكول الإجراء الخاص بالفصل السريع لعينات ورم الإنسان والفأر لتسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية.
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
يحدد هذا البروتوكول الإجراء الخاص بالفصل السريع لعينات ورم الإنسان والفأر لتسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية.
تحتوي عينات الأورام البشرية على عدد كبير من المعلومات حول بيئتها المكروية وذخيرتها المناعية. يعد التفكك الفعال لعينات الأنسجة البشرية إلى معلقات خلوية قابلة للحياة مدخلا مطلوبا لخط أنابيب تسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية (scRNAseq). على عكس أساليب تسلسل الحمض النووي الريبي السائب ، يمكننا scRNAseq من استنتاج عدم تجانس النسخ في عينات الورم على مستوى الخلية الواحدة. أدى دمج هذا النهج في السنوات الأخيرة إلى العديد من الاكتشافات ، مثل تحديد الحالات الخلوية المناعية والأورام والبرامج المرتبطة بالاستجابات السريرية للعلاجات المناعية وأنواع أخرى من العلاجات. علاوة على ذلك ، يمكن استخدام تقنيات الخلية الواحدة المطبقة على الأنسجة المنفصلة لتحديد مناطق الكروماتين التي يمكن الوصول إليها ذخيرة مستقبلات الخلايا T و B ، والتعبير عن البروتينات ، باستخدام الأجسام المضادة المشفرة بالحمض النووي (CITEseq).
تعد صلاحية وجودة العينة المنفصلة متغيرات حرجة عند استخدام هذه التقنيات ، حيث يمكن أن تؤثر بشكل كبير على التلوث المتبادل للخلايا المفردة بالحمض النووي الريبي المحيط ، وجودة البيانات ، والتفسير. علاوة على ذلك ، يمكن أن تؤدي بروتوكولات التفكك الطويلة إلى القضاء على مجموعات الخلايا الحساسة وتنظيم التوقيع الجيني للاستجابة للإجهاد. للتغلب على هذه القيود ، ابتكرنا بروتوكول تفكك عالمي سريع ، والذي تم التحقق من صحته على أنواع متعددة من أورام الإنسان والفئران. تبدأ العملية بالتفكك الميكانيكي والأنزيمي ، يليه الترشيح ، وتحلل الدم الأحمر ، والتخصيب الحي الميت ، وهو مناسب للعينات ذات المدخلات المنخفضة من الخلايا (على سبيل المثال ، خزعات لب الإبرة). يضمن هذا البروتوكول تعليقا نظيفا وقابلا للحياة أحادي الخلية له أهمية قصوى للجيل الناجح من مستحلبات حبيبات الجل (GEMs) ، والترميز الشريطي ، والتسلسل.
على الرغم من أن العديد من التطورات في أبحاث السرطان قد أدت إلى تطوير وموافقة إدارة الغذاء والدواء الأمريكية على العوامل التي تستهدف المستقبلات المثبطة المعبر عنها على الخلايا المناعية والسرطانية ، والمعروفة باسم مثبطات حصار نقاط التفتيش ، إلا أن مقاومة العلاج وتحديد الآليات التي تدفع استجابة المريض لا تزال صعبة1. إن التحدي المعقد المتمثل في توصيف عدم تجانس الورم على تنوعه الجزيئي والتفاعل المعقد بين الخلايا السرطانية والبيئة المكروية المناعية يتطلب أساليب جديدة لتشريح هذا النظام البيئي المعقد بدقة الخلية الواحدة. يعد فهم التعقيدات الجزيئية داخل الأورام وبيئاتها الدقيقة أمرا محوريا لتطوير الاستراتيجيات العلاجية وفك رموز البيولوجيا المعقدة الكامنة وراء تطور السرطان2. أصبح تسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية (scRNA-seq) شائعا بشكل متزايد لأنه يوفر تحليلا عالي الدقة للخلايا الفردية داخل عينات الورم المعقدة 3,4.
يشكل عدم تجانس الورم ، الذي يشمل التنوع الجيني والجيني والظاهري ، تحديا في الكشف عن تعقيدات بيولوجيا السرطان5. تميل الطرق التقليدية لتسلسل الحمض النووي الريبي المجمع إلى إخفاء ملامح التعبير الفريدة والأنماط الظاهرية لمجموعات الخلايا غير المتجانسة الموجودة داخل الأورام ، حيث تقوم هذه الطرق بمتوسط الإشارات عبر مجموعات الخلايا بأكملها4. في المقابل ، يسمح scRNA-seq بتشريح أنواع الخلايا الفردية ، والكشف عن التعبير الجيني المتنوع ، وأنماط القمع ، والحالات الخلوية التي يتم تجاهلهابخلاف ذلك 4,6. تكمن فرضية scRNA-seq في قدرته على فك تشفير التوقيعات الجينية والجزيئية للخلايا الفردية ، مما يحمل وعدا هائلا في اكتشاف علاجات جديدة للسرطان7.
من خلال فك رموز ملامح التعبير الجيني للخلايا السرطانية والخلايا اللحمية والمناعية المحيطة ، يمكن للباحثين تحديد أهداف علاجية جديدة وتطوير استراتيجيات الطب الوراثي الدقيقة المصممة خصيصا للمرضىالفرديين 6. علاوة على ذلك ، فإن تشريح الذخيرة المناعية داخل البيئة المكروية للورم يوفر رؤى حاسمة في التفاعل بين الخلايا السرطانية والمستجيبات المناعية ، مما يمهد الطريق للتدخلات العلاجية المناعية3. على الرغم من التقدم في استخدام scRNAseq على العينات السريرية ، فإن العديد من التحديات أثناء خطوات المعالجة يمكن أن تضر بسلامة الحمض النووي الريبي للخلية وصلاحيتها وجودة البيانات التي تم إنشاؤها. علاوة على ذلك ، يمكن أن تؤدي معالجة الأنسجة ذات الصلاحية المنخفضة للخلية إلى زيادة مستويات الحمض النووي الريبي المحيط في القطرات المتولدة أثناء تغليف الخلايا الفردية ، مما يؤدي إلى التلوث المتبادل والتعليق غير الصحيح لأنواع الخلايا ، في حين أن بروتوكولات التفكك الطويلة التي يتم إجراؤها عند 37 درجة مئوية يمكن أن تؤدي إلى زيادة تنظيم التوقيع الجيني للاستجابة للإجهاد في أنواع متعددة من الخلايا 8,9 ، 10.
يبدأ الإجراء التدريجي (الشكل 1 أ) الموضح في هذا البروتوكول بالتفكك الميكانيكي والأنزيمي السريع للأورام ، يليه الترشيح وإزالة الخلايا الميتة ، اعتمادا على صلاحية كل عينة ورم. في الوقت الحاضر ، تم التحقق من هذا الإجراء في سرطان الجلد11 ، القولون والمستقيم12 ، سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة13 ، عينات ورم البنكرياس والرئة (بيانات غير منشورة). تضمن هذه التقنيات توليد معلقات خلوية قابلة للحياة عالية الجودة ضرورية للتحليلات النهائية14. والجدير بالذكر أن إزالة خلايا الدم الحمراء ، الخالية من الحمض النووي الريبي المركب ، تصبح ضرورية لتنقية العينة15. يعمل التقييم اللاحق لعدد الخلايا والقضاء على الخلايا الميتة كشرط أساسي لنجاح توليد مستحلب حبة الجل 10x Genomics (GEM) ، والترميز الشريطي ، وزيادة استعادة النصوص والخلايا المتسلسلة دون تعريض استبعاد المجموعات السكانية الحساسة للخطر (على سبيل المثال ، العدلات والخلايا الظهارية)16. هذه الخطوات أساسية في إطلاق العنان لإمكانات تحليل دقة الخلية الواحدة داخل عينات الورم 9,10 ، والكشف عن ملفات تعريف التعبير الجيني الجديدة والتوقيعات المناعية اللازمة لدفع التدخلات العلاجية المبتكرة ، وتحديد نقاط الضعف الجديدة للورم.
امتثلت هذه الدراسة لجميع المبادئ التوجيهية المؤسسية المتعلقة بأخذ عينات الأنسجة البشرية. تم تلقي الموافقة المستنيرة من المرضى ، وتم إخفاء هوية بيانات العينة التي يمكن التعرف عليها. يتم جمع العينات في غرفة العمليات ، ووضعها في محلول RPMI أو محلول ملحي أو PBS ، وتأكيد إصابتها بالسرطان عبر قسم علم الأمراض قبل استخدامها في البحث. يجب تنفيذ جميع الخطوات ، باستثناء ما يشير إليه ، عند 4 درجات مئوية أو على الجليد. العمل داخل غطاء السلامة الحيوية عند معالجة الأنسجة البشرية. انظر جدول المواد للحصول على تفاصيل حول جميع المواد والكواشف والأدوات المستخدمة في هذا البروتوكول.
1. الحصول على العينة
2. الهضم الميكانيكي والأنزيمي
3. تصفية العينة
4. تحلل خلايا الدم الحمراء
5. عد الخلايا
6. إزالة الخلايا الميتة - كيت 1
ملاحظة: اعمل داخل غطاء السلامة الحيوية عند استخدام كواشف إزالة الخلايا الميتة ، حيث يمكن أن تتلوث بسهولة.
7. إزالة الخلايا الميتة - كيت 2
ملاحظة: اعمل داخل غطاء للسلامة البيولوجية عند استخدام كواشف المجموعة.
تم الحصول على خزعة سرطان الجلد المعلقة في RPMI ووضعها على الفور على الجليد. تم نقل العينة إلى أنبوب طرد مركزي دقيق سعة 1.5 مل يحتوي على 420 ميكرولتر من RPMI وإنزيمات الهضم ، وتم فرمها إلى قطع صغيرة باستخدام مقص ، وخضعت للهضم الأنزيمي اللاحق لمدة 15 دقيقة في خلاط حراري رأسيا 37 درجة مئوية (الشكل 1). بعد الهضم ، تم ترشيح العينة من خلال مرشح معقم يمكن التخلص منه 50 ميكرومتر ، وتم غسل المرشح باستخدام RPMI جديد لزيادة إنتاجية الخلية (الشكل 1). تم التخلص من الأجزاء المتبقية من الأنسجة المتبقية بعد الغسيل ، لأنها مواد بيولوجية غير مرغوب فيها (على سبيل المثال ، الأنسجة الدهنية).
بناء على لون حبيبات الخلية الناتجة ، كانت هناك حاجة إلى 15 مل من محلول تحلل ACK لإزالة خلايا الدم الحمراء (الشكل 2). بعد إعادة التعليق في 3 مل من وسائط RPMI ، كان إجمالي عدد الخلايا 1 × 106 / مل ، مع صلاحية كانت <80٪ (الشكل 3 أ). يشير هذا إلى أن هناك حاجة إلى دورة واحدة من إثراء الخلايا الحية باستخدام المجموعة 1 (قسم البروتوكول 6) قبل الانتقال إلى تحميل الجينوم 10x (الشكل 4). إذا كانت هذه العينة تحتوي على أكثر من مليون خلية وكانت صلاحيتها أقل من 10٪ ، لكانت إزالة الخلايا الميتة - المجموعة 2 قد استخدمت بدلا من ذلك (الشكل 5). تم غسل العينة بوسائط العزل ، وأضيف 10 ميكرولتر من الملحق الخامس وكوكتيل اختيار البيوتين ، تليها 20 ميكرولتر من الخرز المغناطيسي و 60 ميكرولتر من وسائط العزل ، كما هو موضح في قسم البروتوكول 6 (الشكل 4). بعد هذا الإجراء ، تم إعادة تعليق العينة في 500 ميكرولتر من الوسائط وإعادة فرزها. كان عدد الخلايا الحية 4.9 × 105 / مل مع صلاحية أعلى من 90٪ (الشكل 3 ب) ، وانتقلت العينة على الفور إلى توليد GEM وفقا لتعليمات الشركة المصنعة.

الشكل 1: نظرة عامة على معالجة عينة الورم. (أ) توضيح العملية خطوة بخطوة لبروتوكول تفكك الأنسجة. ب: هضم عينة باستخدام خلاط حراري رأسي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: علاج ما قبل ACK وبعده لعينة سرطان الجلد المصطبغة بشكل معتدل. (أ) توضح الصورة عينة سرطان الجلد التي تم ترشيحها وتكويرها بعد خطوة الهضم قبل تحلل خلايا الدم الحمراء (RBC) باستخدام ACK. (B) تظهر الصورة نفس عينة سرطان الجلد بعد إزالة كرات الدم الحمراء باستخدام المخزن المؤقت ACK. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: منظر للخلايا على مقياس الدم تحت التريبان الأزرق مكبرا بتكبير 200x. (أ) صورة توضح ظهور الخلايا الزرقاء قبل إثراء الخلايا الحية ، والتي تمثل الخلايا الميتة ، مع صلاحية أقل من 80٪. (ب) صورة تظهر العينة بعد إثراء الخلايا الحية باستخدام بروتوكول Kit 1 (الخطوة 6 من البروتوكول) ، تظهر زيادة في الصلاحية تزيد عن 90٪. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: نظرة عامة على عزل خلية العينة الحية والميتة باستخدام المجموعة 1. يتم تنفيذ هذه الخطوة عند اكتشاف أقل من مليون خلية أو أكثر من مليون خلية ذات صلاحية >10٪ بعد عدد الخلايا (خطوة البروتوكول 5). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5: نظرة عامة على عزل الخلايا الحية والميتة باستخدام ميكروبيدات إزالة الخلايا الميتة في المجموعة 2. يتم تنفيذ هذه الخطوة عندما يكون هناك أكثر من مليون خلية وصلاحية <10٪. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 6: التحقق من صحة تحليل الخلية الواحدة لعينة غير معالجة بعد دورة واحدة من إثراء الخلايا الحية باستخدام بروتوكول Kit 1 المعدل. يظهر الجزء العلوي تحليل UMAP يوضح الاتساق في مجموعات الخلايا وأنواعها قبل وبعد إثراء الخلايا الحية. يلخص الجزء السفلي مخرجات التسلسل الناتجة عن Cell Ranger. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
يصف هذا البروتوكول تفكك عينات ورم الإنسان أو الفئران إلى تعليق خلية واحدة لتسلسل scRNA باستخدام نظام الموائع الدقيقة 10x Genomics. عند معالجة الأنسجة التي غالبا ما تأتي من سرطانات نادرة أو تشكل جزءا من التجارب السريرية الجارية أو التجارب الطويلة لأورام الفئران ، يجب الحفاظ على العينة على النحو الأمثل وبعناية بين جميع الخطوات. يجب تنفيذ جميع الخطوات بسرعة على الجليد أو عند 4 درجات مئوية للحفاظ على ملامح الحمض النووي الريبي الخلوي الأصلي ومنع التدهور ، لأن العمل في درجة حرارة الغرفة لفترات طويلة سيؤثر على جودة النسخ17,18.
يجب اتخاذ عدة خطوات لضمان الحد الأدنى من فقدان الخلايا طوال العملية ، خاصة عند معالجة الخزعات الأساسية الصغيرةبالإبرة 17. سيؤدي التأكد من تضمين جميع أجزاء عينة الورم في عملية الهضم إلى النتيجة الأكثر نجاحا ، حيث أن المزيد من الخلايا المستخرجة من العينة ستحسن تغليف وتسلسل الجينوم 10x في المستقبل والعدد الإجمالي للخلايا والنصوص المستردة للتحليل. إذا استقرت العينة في الأنبوب الذي وصلت إليه ، فيمكن إضافة الوسائط ، وقلب الأنبوب ، ونقله إلى الطبق للمعالجة. إذا كانت العينة الأولية مجزأة أو كان المحلول غائما ، مما يشير إلى وجود خلايا معلقة ، فتأكد من جمع كل العينة للهضم الأنزيمي عن طريق الطرد المركزي للعينة بالمحلول الذي وصلت إليه وتعليقها في حجم الوسائط للهضم (قسم البروتوكول 1).
عند الشفط ، تأكد من عدم إزعاج الحبيبات طوال العملية. اترك حجما إضافيا عند الشفط ، والذي يمكن إزالته باستخدام ماصة P200. في حالة اضطراب الحبيبات ، يمكن توزيع الحجم مرة أخرى في الأنبوب وإعادة الطرد المركزي. بعد تحلل ACK أو بعد إزالة الميت الحي ، قد تكون العينة بأحجام منخفضة تصل إلى 25 ميكرولتر. وبالتالي ، من الأهمية بمكان عدم فقدان أي طاف يحتوي على الخلايا. الهضم الميكانيكي السليم ضروري لضمان تعرض الخلايا ذات الاهتمام للهضم الأنزيمي. قد تكون هناك حاجة إلى هضم إنزيمي أطول باستخدام الإنزيمات المناسبة والخلاط الحراري لأحجام العينات الأكبر9،19،20. في حين أن أسماء الإنزيمات المحددة مملوكة ، فإن الشركة المصنعة تلاحظ الإنزيم A باعتباره نيوكلياز والإنزيمات H و D و R كبروتياز غير متخصص. يعد تمرير أكبر قدر ممكن من عينة الورم عبر المرشح أمرا حيويا لضمان أعلى إنتاجية ممكنة للخلايا. ستؤدي التصفية الناجحة إلى عدم وجود أي عينة مرئية صغيرة فقط في المرشح أو عدم وجود عينة مرئية صغيرة فيه. قد لا يمكن ترشيح بعض أجزاء العينة إذا كانت تحتوي على كميات عالية من الأنسجة الدهنية أو الضامة. إذا كانت هناك قطع مرئية من العينة أعلى المرشح ، فاستمر في استخدام الجزء الخلفي من مكبس المحقنة لطحن ودفع كل العينة من خلال استخدام حركة الالتواء مع غسل الجزء العلوي من المرشح بمزيد من الوسائط.
يتم تحديد نجاح خطوة تحلل خلايا الدم الحمراء من خلال عرض العينة أسفل المجهر بمجرد تحميل العينة على مقياس الدم للعد والبقاء15,21. إذا تمت إضافة ما يكفي من ACK إلى العينة لإزالة خلايا الدم الحمراء ، فلن تكون هناك خلايا دم حمراء أو احمرار مرئي في الحبيبات. إذا كانت خلايا الدم الحمراء مرئية في العينة ، فيجب إضافة ACK إضافي ، ويجب إعادة طرد العينة عند 450 × جم ، 4 درجات مئوية لمدة 5 دقائق. بمجرد الانتهاء من ذلك ، يجب استنشاق المادة الطافية ، ويمكن إعادة تعليق حبيبات الخلايا في وسائط RPMI للتصور والعد.
لضمان التشغيل الأمثل لعلم الجينوم 10x ، يجب أن يتراوح عدد الخلايا بين 700 و 1200 خلية / ميكرولتر (7 × 105- 1.2 × 106 / مل). سيؤدي التركيز العالي إلى زيادة معدل المضاعفة (خليتان في قطرة واحدة) أثناء تكوين القطيرات. إذا كان العدد مرتفعا جدا ، فيمكن إضافة كمية مناسبة من الوسائط إلى العينة وإعادة تحميلها على مقياس الدم لإعادة الفرز. إذا كان التركيز منخفضا جدا ، يمكن إعادة طرد العينة عند 450 × جم ، 4 درجات مئوية لمدة 5 دقائق ، واستنشاق المادة الطافية وإعادة تعليقها في حجم أقل من الوسائط قبل إعادة الفرز. تكون العينة جاهزة للتحميل لعلم الجينوم 10x إذا كانت صلاحية الخلية الحية أعلى من 80٪ (الشكل 3).
إذا كانت صلاحية العينة أقل من 80٪ ، فيجب إجراء ميت حي قبل تحميل 10x Genomics16. إذا لم تحقق جولة واحدة من إزالة الأحياء والموتى نسبة الصلاحية أعلى من 80٪ ، فيجب إجراء جولة أخرى إذا كان هناك أكثر من 1 × 105 خلايا إجمالا. ستمنع الجدوى العالية الانسداد في بروتوكول الجينوم 10x اللاحق ، وتزيد من استعادة الخلايا ، وتقلل من وجود الحمض النووي الريبي المحيط. تم تحسين بروتوكول Kit 1 وتصغيره لفصل عينات الأنسجة الصغيرة بسرعة مع انخفاض عدد الخلايا. يؤدي انخفاض حجم الكواشف وتقصير أوقات الحضانة إلى زيادة إنتاجية الخلايا ومنع التوقيع الجيني للاستجابة للإجهاد (FOS و JUN و JUNB) على خلايا مختلفة 9,22. تشمل الطرق البديلة لإثراء الخلايا الحية تلطيخ وفرز. ومع ذلك ، فإن هذا من شأنه أن يؤدي إلى انخفاض إنتاج الخلايا ، وحضانة التلوين لفترات طويلة ، والتي يمكن أن تؤثر على الحالات الخلوية (على سبيل المثال ، الأجسام المضادة aCD3e ستنشط الخلايا التائية) ، والإجهاد الناجم عن ضغط الجهاز على الخلايا أثناء الفرز 9,22. يوضح المثال الموضح في الشكل 6 UMAP تم إنشاؤه بعد تسلسل التعبير الجيني 10X Genomics (GEX) وتحويل الرموز الشريطية للخلية التي تم إنشاؤها إلى ملفات FASTQ التي تم تسلسلها بعد ذلك ومحاذاتها عبر CellRanger. تم رسم نتائج التسلسل اللاحقة ومقارنات إزالة الأحياء والأموات ، مما يدل على مجموعات الخلايا في عينة قبل وبعد إزالة الأحياء والأموات وتحسين جودة التسلسل. أشارت عينة الرئة الموضحة في الشكل 6 إلى وجود مشكلة في جزء القراءات ، حيث كانت أقل من 70٪. تم إنشاء هذا التحذير بسبب ارتفاع الحمض النووي الريبي المحيط في مجموعة من الخلايا المحللة أو الميتة. ومع ذلك ، بعد إزالة الخلايا الميتة ، لم يعد هذا الخطأ موجودا وأدى إلى نسبة أعلى من قراءات الكسور في الخلايا23.
يعد تسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية عملية مكلفة وغير مستقرة أدت إلى تقدم كبير في مجال مناعة السرطان وأبحاث السرطان. يسمح بمزيد من الاستجواب للجينات والحالات الخلوية والبرامج التي يتم التعبير عنها وقمعها في أنواع معينة من الخلايا ، ويكشف المزيد عن سلوك السرطانات وعدم تجانسها. من المرجح أن تولد الأنسجة دون المستوى الأمثل أو منخفضة الصلاحية بيانات منخفضة الجودة يمكن أن تخلق قطعا أثرية تأخذ بعيدا عن واقع بيولوجيا الورم ، مع التأكيد على الأهمية الحاسمة لتفكك الورم السليم وإعداد العينة.
م.س-ف. تلقى تمويلا من بريستول مايرز سكويب ، Istari Oncology ، وكان مستشارا لعلاجات Galvazine.
تم دعم هذه الدراسة من قبل مؤسسة أديلسون للأبحاث الطبية (AMRF) ، وتحالف أبحاث سرطان الجلد (MRA) ، و U54CA224068. تم إنشاء الشكل 1 والشكل 4 والشكل 5 باستخدام BioRender.com.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 1x PBS | Corning | 21-040-CV | |
| 10 مل ماصة مصلية | Corning | 357551 | |
| 1000 & mu ؛ L أطراف ماصة منخفضة الاحتفاظ | Rainin | 30389213 | |
| 1000 مو ؛ L أطراف ماصة عريضة منخفضة الاحتفاظ | Rainin | 30389218 | |
| 1000 & أطراف ماصة L | Rainin | 30389212 | |
| فاصل مغناطيسي 10x | 10x الجينوم | 120250 | |
| أنابيب مخروطية 15 مل | Corning | 430052 | |
| مل ماصة شفط | Corning | ||
| 20 & mu ؛ L أطراف ماصة منخفضة الاحتفاظ | Rainin | 30389226 | |
| 20 & mu ؛ أطراف ماصة L | Rainin | 30389225 | |
| 200 مو ؛ L أطراف ماصة منخفضة الاحتفاظ | Rainin | 30389240 | |
| 200 مو ؛ أطراف ماصة | L Rainin | 30389239 | |
| 50 مل أنبوب مخروطي من مادة البولي بروبيلين | Falcon | 352098 | |
| 60 × 15 مم طبق زراعة الأنسجة | Falcon | 353004 | |
| ACK Lysing Buffer | Gibco | A10492-1 | |
| BD 1 مل حقنة | Becton و Dickinson and Company | 3090659 | |
| مقياس كثافة الدم الساطع | الخط Hausser Scientific | 551660 | |
| محلول كلوريد الكالسيوم | سيجما ألدريتش | 2115-100 مل | |
| خلية رينجر | 10x الجينوم | N / A | https://www.10xgenomics.com/support/software/cell-ranger/latest |
| شرائح عد الخلايا لعداد الخلايا TC20 | Bio-Rad | 1450015 | |
| CellTrics 30 & mu ؛ م مرشحات معقمة يمكن التخلص | Sysmex | 04-004-2326 | |
| CellTrics 50 & mu ؛ م مرشحات معقمة يمكن التخلص | Sysmex | 04-004-2327 | |
| طقم إزالة الخلايا الميتة ؛ | Miltenyi Biotec | 130-090-101 | مخزن عند -20 درجة ؛ C; المجموعة 2 |
| ملقط تشريح ، طرف ناعم | VWR | 82027-386 | |
| DNA LoBind أنابيب الطرد المركزي الدقيقة ، 1.5 مل | Eppendorf | 22431021 | |
| EasySepTM إزالة الخلايا الميتة (Annexin V) Kit | STEMCELL Technologies | 17899 | Store at 4 & deg ؛ C; المجموعة 1 |
| جهاز الطرد المركزي Eppendorf 5425R | Eppendorf | 5406000640 | |
| أجهزة الطرد المركزي Eppendorf 5910R | Eppendorf | 2231000657 | |
| Eppendorf Easypet 3 وحدة تحكم الماصة | الإلكترونية Eppendorf | EP4430000018 | |
| Eppendorf Thermomixer F1.5 موديل 5384 | Eppendorf | EP5384000012 | |
| FBS | Gibco | 26140-079 | يخزن في درجة حرارة 4 درجات. C ، استخدم في غطاء بيولوجي |
| مقص ألماني غير قابل للصدأ | أدوات العلوم | الدقيقة 14568-12 | |
| Leica Dmi1 مجهر | Leica Microsystems | 454793 | |
| LS Column | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| MACS Multistand | Miltenyi Biotec | 130-042-303 | |
| Pipet-Lite LTS ماصة L-1000XLS + | Rainin | 17014382 | |
| Pipet-Lite LTS ماصة L-200XLS + | Rainin | 17014391 | |
| Pipet-Lite LTS ماصة L-20XLS + | Rainin | 17014392 | |
| Quadro MACS Magnet | Miltenyi Biotec | 130-091-051 | |
| RPMI Medium 1640 (1x) | Gibco | 21870-076 | Store at 4 & deg; C |
| TempAssure 0.2 مل PCR 8-Tube شرائط الولايات | المتحدة الأمريكية العلمية | 1402-4700 | |
| Trypan Blue stain 0.4٪ | Thermo Fisher Scientific | T10282 | |
| طقم تفكك الورم ، Human | Miltenyi Biotec | 130-095-929 | يخزن في -20 درجة ؛ ج ، قم بإعداد الإنزيمات وفقا لتعليمات المجموعة: إعادة تكوين قارورة إنزيم H المجففة بالتجميد في 3 مل من RPMI 1640 إعادة تكوين قارورة الإنزيم R المجففة بالتجميد في 2.7 مل من RPMI 1640 إعادة تكوين قارورة الإنزيم المجفف بالتجميد A في 1 مل من Buffer A المزود بالمجموعة. |
| طقم تفكك الورم ، فأر | Miltenyi Biotec | 130-096-730 | يخزن في -20 درجة ؛ ج ، قم بإعداد الإنزيمات وفقا لتعليمات المجموعة: إعادة تكوين قارورة الإنزيم D المجففة بالتجميد في 3 مل من RPMI 1640 إعادة تكوين قارورة إنزيم R المجففة بالتجميد في 2.7 مل من RPMI 1640 إعادة تكوين قارورة الإنزيم المجفف بالتجميد في 1 مل من العازلة A المزودة بالمجموعة. |
| ماء مقطر فائق النقاء | Invitrogen | 10977-015 | يخزن في 4 درجات ؛ ج |
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن