تمت الموافقة على جميع التجارب على الموضحة هنا من قبل اللجنة المؤسسية لرعاية واستخدامه في جامعة أوريغون للصحة والعلوم (OHSU) وتم إجراؤها وفقا للمبادئ التوجيهية لرعاية في OHSU. في هذه الدراسة ، تم استخدام ذكور الفئران C57BL / 6J البالغة من العمر ثمانية أسابيع. الكواشف والمعدات المستخدمة في هذه الدراسة مدرجة في جدول المواد.
1. إنتاج ناقلات AAV عن طريق تعداء البلازميد الخالي من الفيروسات الغدية
- زراعة الكلى الجنينية البشرية (HEK) 293 خلية في وسط النسر المعدل (DMEM) - نسبة عالية من الجلوكوز (4.5 جم / لتر) من Dulbecco مع مصل بقري الجنين 10٪ (FBS) ، و 1٪ بنسلين ومزيج ستربتومايسين ، و 1 ملي مولار ل-جلوتامين ، في حاضنة 37 درجة مئوية مع 5٪ ثاني أكسيد الكربون (CO2).
- في اليوم -2 (48 ساعة قبل التعدي) ، لوحة 4 × 106 HEK 293 خلية لكل قارورة T225 في 40 مل من وسط الاستزراع كما هو موضح في الخطوة 1.1. يصل هذا إلى ~ 95٪ التقاء في اليوم 0.
ملاحظة: يمكن ضبط مقياس الثقافة بناء على التطبيق. بالنسبة للتحضير المصغر AAV (الخطوة 2) ، قم بإعداد عدد مناسب من القوارير بناء على العيار المستهدف وتركيز المتجه ، مع الأخذ في الاعتبار أن عملية التنقية تؤدي عادة إلى فقدان تقريبي بنسبة 50٪ من المواد. لتحقيق >6 × 1012 vg / mL من نواقل AAV9 و AAV-KP3 لحقن RP في الفئران بجرعة 3 × 1011 vg / فأر في محلول ناقل 50 ميكرولتر ، يوصى باستخدام قارورتين على الأقل. لإنتاج ناقلات AAV على نطاق أوسع ، مثل تلك الخاصة بناقلات AAV المنقاة بالتدرج بكثافة CsCl (CsCl AAVs) ، عادة ما يتم استخدام 25 قارورة أو أكثر.
- اليوم 0: تعداء الحمض النووي البلازميد
- التحضير للتعداء
- تأكد من أن الخلايا قد وصلت إلى ~ 95٪ من التقاء.
- قم بتسخين DMEM مكمل بمزيج البنسلين والستربتومايسين 1٪ و 1 ملي مولار L-glutamine ولكن بدون FBS (أي وسط خال من المصل) في حمام مائي 37 درجة مئوية.
- اسمح لمحلول البولي إيثيلينيمين الخطي (PEI) للوصول إلى درجة حرارة الغرفة.
- تحضير خليط الحمض النووي البلازميد
- امزج البلازميدات (15 ميكروغرام لكل من pAAV-CAG-tdTomato, pRepCap, و pHelper) في 1 مل من محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS) بدون CaCl2 أو MgCl2 في أنابيب أجهزة الطرد المركزي الدقيقة المعقمة 1.5 مل. الكمية الإجمالية للحمض النووي هي 45 ميكروغرام / قارورة.
ملاحظة: يمكن تجاهل أحجام محلول الحمض النووي البلازميد إذا كانت ضئيلة. ومع ذلك ، ينصح بضبط الحجم إذا كان الحجم الكلي للمحلول ≥225 ميكرولتر. تسلسلات البلازميدات المستخدمة في هذه الدراسة متوفرة في الملف التكميلي 1.
- تعداء جزيرة الأمير إدوارد
- أضف 90 ميكرولتر من محلول PEI (1 مجم / مل) إلى 1 مل من PBS واخلطه مع مزيج PBS-plasmid DNA (المحضر على النحو الوارد أعلاه) في أنبوب بولي بروبيلين سعة 50 مل. الحجم النهائي حوالي 2 مل (حجم 5٪ من وسط الاستزراع).
- قم بتدوير الأنابيب لمدة 5 ثوان وقم بتدوير الأنابيب لفترة وجيزة باستخدام جهاز طرد مركزي لتجميع السائل إلى قاع الأنابيب.
- يحفظ في درجة حرارة الغرفة لمدة 15 دقيقة لتشكيل مجمعات البلازميد DNA-PEI.
- بمجرد اكتمال الحضانة لمدة 15 دقيقة ، أضف 40 مل من الوسط الخالي من المصل المسخن مسبقا المحضر في الخطوة 1.3.1.2 إلى مجمعات البلازميد DNA-PEI. الحجم حوالي 42 مل.
- استبدل وسط استزراع قارورة T225 بمجمعات DNA-PEI البلازميد التي تحتوي على وسط خال من المصل الموصوف في الخطوة 1.3.4.
- حافظ على الخلايا في وسط التعداء هذا حتى الحصاد في اليوم 5 (لا يلزم تغيير متوسط).
- في اليوم 2 ، راقب الخلايا المنقولة بالبلازميد الذي يعبر عن بروتينات الفلورسنت (على سبيل المثال ، pAAV-CAG-tdTomato) تحت مجهر مضان مقلوب لتقييم كفاءة تعداء البلازميد.
ملاحظة: عادة ما تؤدي الظروف الموضحة أعلاه إلى زيادة كفاءة التعداء 70٪. يمكن ملاحظة بعض التغييرات المورفولوجية (على سبيل المثال ، استطالة الخلية) ، على الأرجح بسبب البيئة الخالية من المصل.
- في الأيام من 3 إلى 5 ، استمر في زراعة الخلايا المنقولة في حاضنة 37 درجة مئوية مع 5٪ ثاني أكسيد الكربون2.
- في اليوم الخامس، اجمع كل من الخلايا والوسط المحتوي على الفيروسات في أنبوب بولي بروبيلين سعة 50 مل.
- قم بتخزين العينات في درجة حرارة -80 درجة مئوية حتى الاستخدام.
2. تنقية الترشيح الفائق بالطرد المركزي (CU) لنواقل AAV (AAV miniprep)
- قم بإذابة العينة المجمدة من الخطوة 1.3.11 في حمام مائي 37 درجة مئوية.
- احتفظ ب 1 مل من المحللة الخام جانبا لفحص لطخة نقطة الحمض النووي (يستخدم ككسر 1).
- أضف 80 ميكرولتر من كلوريد المغنيسيوم 1M (MgCl2 ، التركيز النهائي 2 مل) ، و 160 ميكرولتر من 0.1M هيدروكسيد الصوديوم (هيدروكسيد الصوديوم ، التركيز النهائي 0.4 مل) ، و 16 ميكرولتر من نوكلياز المغنيسيوم Serratia marcescens (التركيز النهائي 100 وحدة / مل) في أنبوب سعة 50 مل. احتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 1 ساعة. دوامة العينة كل 15 دقيقة أثناء الحضانة.
- اجمع عينة Serratia marcescens المعالجة بنوكلياز داخلي في زجاجة طرد مركزي سعة 250 مل وجهاز طرد مركزي عند 10,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 30 دقيقة.
- انقل المادة الطافية إلى أنبوب بولي بروبيلين سعة 50 مل باستخدام ماصة مصلية سعة 50 مل.
- قم بتصفية المادة الطافية لإزالة الحطام باستخدام مرشح حقنة PVDF 0.45 ميكرومتر. احتفظ ب 1 مل من عينة مفلحة بمقدار 0.45 ميكرومتر جانبا لمقايسة لطخة نقطة الحمض النووي (تستخدم ككسر 2).
- أضف 10 مل من الماء من الدرجة الجزيئية إلى أنبوب الترشيح الفائق بالطرد المركزي بسعة 100 كيلو دالتون (MWCO) وجهاز الطرد المركزي عند 2,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 10 دقائق. قم بإزالة التدفق.
- أضف 15 مل من السوربيتول بنسبة 5٪ في PBS إلى أنبوب الترشيح الفائق بالطرد المركزي وجهاز الطرد المركزي عند 2,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 10 دقائق. قم بإزالة التدفق.
- أضف ما يصل إلى 15 مل من عينة مفلحة بمقدار 0.45 ميكرومتر كما هو موضح في الخطوة 2.6 وأجهزة الطرد المركزي عند 2,000 × غرام عند 4 درجات مئوية لمدة 15 دقيقة للتركيز حتى يتحقق الحجم المستهدف البالغ حوالي 500 ميكرولتر. احتفظ ب 1 مل من التدفق جانبا لفحص لطخة نقطة الحمض النووي (يستخدم ككسر 3).
ملاحظة: قبل كل عملية طرد مركزي، أعد تعليق المخزن باستخدام ماصة لتعطيل تدرج التركيز. لا تلمس الغشاء بطرف الماصة. إذا لم يتم الوصول إلى الحجم المستهدف بعد 15 دقيقة من الطرد المركزي ، فقم بتمديد الطرد المركزي حسب الحاجة عن طريق ضبط المدة بناء على الحجم المتبقي في الأنبوب.
- كرر الخطوة 2.9 حتى يتم تصفية العينة بأكملها ، لتصل إلى الحجم المستهدف البالغ حوالي 500 ميكرولتر. احتفظ ب 1 مل من التدفق من التكرارين الأول والثاني للخطوة 2.10 جانبا لمقايسة لطخة نقطة الحمض النووي (تستخدم ككسر 4 وكسر 5).
ملاحظة: يمكن استخدام أنبوب ترشيح فائق طرد مركزي واحد لمعالجة العينات التي تم الحصول عليها من قارورتين أو أكثر.
- أضف 15 مل من السوربيتول بنسبة 5٪ في PBS وأجهزة الطرد المركزي عند 2,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 15 دقيقة حتى يتم تحقيق الحجم المستهدف البالغ حوالي 500 ميكرولتر. احتفظ ب 1 مل من التدفق جانبا لمقايسة لطخة نقطة الحمض النووي (تستخدم ككسر 6).
- كرر الخطوة 2.11 (تستخدم ككسر 7).
ملاحظة: إذا كانت هناك حاجة إلى عيارات AAV أعلى للتجارب النهائية ، فيمكن تقليل الحجم المستهدف النهائي إلى 150 ميكرولتر.
- انقل ناقل AAV فائق الترشيح إلى أنبوب غطاء لولبي سعة 2 مل بحلقة O. احتفظ ب 10 ميكرولتر من متجه AAV فائق الترشيح جانبا لمقايسة لطخة نقطة الحمض النووي (تستخدم ككسر 8).
- تحديد عيار AAV عن طريق مقايسة بقعة نقطة الحمض النووي كما هو موضحسابقا 46.
ملاحظة: تحتوي النواقل المنقاة بالنحاس (CU AAV) على مستويات أعلى من تلوث القفيصة الفارغة والشوائب المشتقة من الخلايا المضيفة مقارنة بالنواقل المنقاة CsCl (CsCl AAV). قد تؤثر هذه العوامل على كفاءة التحويل والاستجابات المناعية ، مما يتطلب دراسة متأنية في تفسير البيانات.
3. تنقية تدرج الكثافة CsCl لنواقل AAV
- قم بإذابة العينة المجمدة من الخطوة 1.3.11 في حمام مائي 37 درجة مئوية.
- جهاز طرد مركزي عند 10,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 30 دقيقة لإزالة بقايا الخلية.
- اجمع المادة الطافية وتترسب نواقل AAV في المادة الطافية عن طريق إضافة البولي إيثيلين جلايكول 8000 (PEG ، التركيز النهائي 8٪) وكلوريد الصوديوم (التركيز النهائي 500 مليمتر).
- احتضن على الجليد لمدة 3 ساعات.
- جهاز طرد مركزي عند 10,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 30 دقيقة للحصول على الكريات المحتوية على AAV.
- قم بإزالة المادة الطافية وإعادة تعليق الكريات ب 10 مل من Sarkosyl الذي يحتوي على عازلة لإعادة التعليق (50 ملي مولار HEPES ، 150 ملي كلوريد الصوديوم ، 1٪ ساركوسيل ، درجة الحموضة 8.0).
- انقل تعليق الحبيبات إلى أنبوب بولي بروبلين سعة 15 مل واحتفظ به عند 4 درجات مئوية طوال الليل.
- في اليوم التالي ، عالج معلق الحبيبات باستخدام نوكلياز داخلي Serratia marcescens (التركيز النهائي 200 وحدة / مل) و MgCl2 (التركيز النهائي 2 مل).
- احتضن عند 37 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
- جهاز طرد مركزي عند 10,000 × جم عند 4 درجات مئوية لمدة 30 دقيقة.
- اجمع المادة الطافية وأضف كلوريد السيزيوم (CsCl ، التركيز النهائي لمعامل الانكسار (RI) = 1.3710 +/- 0.0005) و EDTA (التركيز النهائي 20 مليمتر).
- قم بتحميل العينة في أنبوب طرد مركزي فائق سعة 29.9 مل وأضف محلول الطبقة العلوية (50 ملي مولار HEPES ، 150 ملي كلوريد الصوديوم ، 20 ملي مولار EDTA ، CsCl (RI = 1.3710 +/- 0.0005) ، درجة الحموضة 8.0) حتى تمتلئ.
- جهاز طرد مركزي عند 41,000 × جم عند 12 درجة مئوية لمدة 22 ساعة.
- قم بعمل ثقوب في الجزء السفلي والجانبي من أنبوب الطرد المركزي الفائق لجمع ما مجموعه 15 جزءا من 2 مل لكل منهما.
- استخدم 10 ميكرولتر من كل جزء للتحقق من RI وإجراء مقايسة لطخة نقطة الحمض النووي46.
- بناء على نتائج فحص RI و DNA dot blot ، حدد أفضل 5 كسور تحتوي على نواقل AAV.
- اجمع بين أفضل 5 كسور (إجمالي حوالي 10 مل) واضبط RI على 1.3710 +/- 0.0005.
- قم بتحميل العينة في أنبوب طرد مركزي فائق سعة 11.2 مل وأضف محلول الطبقة العلوية حتى تمتلئ.
- جهاز طرد مركزي عند 65,000 × جم عند 12 درجة مئوية لمدة 12 ساعة.
- قم بعمل ثقوب في الجزء السفلي والجانبي من أنبوب الطرد المركزي الفائق سعة 11.2 مل لجمع ما مجموعه 18 جزءا من 0.5 مل لكل منهما.
- استخدم 10 ميكرولتر من كل جزء للتحقق من RI وإجراء مقايسة لطخة نقطة الحمض النووي46.
- بناء على نتائج فحص RI و DNA dot blot ، حدد أفضل 6 كسور تحتوي على نواقل AAV.
- اجمع بين أفضل 6 أجزاء (إجمالي حوالي 3 مل) وقم بتحميلها في شريط غسيل الكلى.
- قم بتعويم كاسيت غسيل الكلى في 1.3 لتر من المخزن المؤقت لغسيل الكلى (المخزن المؤقت PBS المكمل بنسبة 0.001٪ خافض للتوتر السطحي غير أيوني) مع قضيب تحريك لمدة ساعتين لإزالة CsCl.
- كرر الخطوة 3.24 مرتين (إجمالي 6 ساعات من غسيل الكلى).
- انقل الكاسيت إلى 500 مل من السوربيتول بنسبة 5٪ في المخزن المؤقت PBS المكمل بخافض للتوتر السطحي بنسبة 0.001٪ لمدة ساعتين للتبادل المؤقت
- اجمع العينة من كاسيت غسيل الكلى باستخدام حقنة وقم بتصفية العينة المجمعة باستخدام مرشح حقنة PVDF 0.22 ميكرومتر.
- تم تحديد عيارات AAV بواسطة مقايسة لطخة النقاط الكمية46.
4. تقييم جودة مستحضرات ناقلات AAV بواسطة SDS-PAGE متبوعا بتلطيخ الفضة
- امزج مستحضرات النواقل ، 1 × 1010 vg لنواقل CsCl AAV ، و 1 × 109 و 1 × 1010 vg لنواقل CU AAV ، مع 6x Laemmli buffer في المجموع 18 ميكرولتر (تحضير المتجه: 6x Laemmli = 15: 3) وتسخينها عند 100 درجة مئوية لمدة 5 دقائق.
- قم بتحميل مستحضرات ناقلات AAV المعالجة حراريا على جل SDS-PAGE بنسبة 7.5٪ وقم بتفريغ العينات بالكهرباء عند 20 مللي أمبير باستخدام مخزن مؤقت تشغيل هلام Tris-glycine-SDS.
- قم بإزالة الجل من علبة الجل ، واشطفه بالماء فائق النقاء ، وقم بلطخه باستخدام مجموعة تلطيخ الفضة وفقا لتعليمات الشركة المصنعة.
- احتضان الجل المحمل بنواقل CsCl AAV في حل المطور لمدة 7 دقائق ، بينما احتضان الجل المحمل بنواقل CU AAV لمدة دقيقتين لتجنب تشبع الإشارة.
ملاحظة: تحتوي مستحضرات ناقلات CU AAV على مستويات أعلى من شوائب البروتين مقارنة بناقلات CsCl AAV. لذلك ، تم فصل المواد الهلامية المحملة بنواقل CsCl AAV و CU AAV بعد تشغيل الجل وصبغها بالفضة بشكل منفصل لمنع تشبع الإشارة بسبب الحساسية العالية لطريقة التلوين.
5. تحديد بروتينات AAV VP في مستحضرات ناقلات CU AAV بواسطة اللطخة الغربية
- امزج 1 × 109 vg من مستحضرات ناقلات CU AAV مع 6x Laemmli buffer بإجمالي 18 ميكرولتر (تحضير الناقل: 6x Laemmli = 15: 3) وقم بتسخينها عند 100 درجة مئوية لمدة 5 دقائق.
- قم بتحميل مستحضرات ناقلات AAV المعالجة حراريا على جل SDS-PAGE بنسبة 7.5٪ وقم بتفريغ العينات بالكهرباء عند 20 مللي أمبير باستخدام مخزن مؤقت تشغيل هلام Tris-glycine-SDS.
- بروتينات النقل الكهربائي في الجل على غشاء ثنائي فلوريد البولي فينيلدين (PVDF) ، يتم تنشيطه في الميثانول ، باستخدام نظام نقل شبه جاف.
- سد الغشاء بحليب منزوع الدسم بنسبة 5٪ في محلول ملحي مخزن ب Tris مع Tween 20 (TBST) في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة.
- احتضان الغشاء المسدود بمحلول الأجسام المضادة الأولية (الجسم المضاد متعدد النسيلة للأرانب المضاد ل VP ، مخفف إلى 1: 1000 مع 5٪ حليب منزوع الدسم في 1x TBST) عند 4 درجات مئوية بين عشية وضحاها.
- اغسل الغشاء ب 1x TBST لمدة 10 دقائق ، 3 مرات.
- احتضان الغشاء بمحلول الأجسام المضادة الثانوية (جسم مضاد IgG مضاد للأرانب للماعز مقترن ببيروكسيداز الفجل ، مخفف إلى 1: 5000 مع 5٪ حليب منزوع الدسم في 1x TBST) في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة.
- اغسل الغشاء ب 1x TBST لمدة 10 دقائق ، 3 مرات.
- تصور الإشارات على الغشاء باستخدام نظام تصوير اللطخة الغربية.
6. حقن الحوض الكلوي (RP)
- إعداد ما قبل الجراحة والتخدير
- قم بقياس وزن جسم كل فأر في دورق بلاستيكي على مقياس وزن دقيق يصل إلى 0.1 جرام.
- يتم تطبيق ميلوكسيكام (5 ملغ/كغ) تحت الجلد بناء على وزن الجسم لتوفير تسكين ما قبل الجراحة.
- قم بتخفيف محلول ناقل AAV إلى تركيز 6.0 × 1012 vg / مل مع 5٪ سوربيتول في PBS واحتفظ به على الجليد.
ملاحظة: قم بإعداد محلول AAV بمقدار 40 ميكرولتر أكثر من إجمالي حجم الحقن (50 ميكرولتر × عدد الفئران المراد حقنها) لحساب المساحة الميتة في حقنة زجاجية محكمة الغلق وأنبوب بولي إيثيلين PE-10.
- ثني وقطع طرف الإبرة فقط من إبرة 30 جم باستخدام حامل إبرة.
- تحت المجهر المجسم ، قم بتوصيل طرف الإبرة 30 G ، و 15 سم من أنبوب PE-10 ، وإبرة 30 G ، وحقنة زجاجية محكمة الغلق بالغاز بهذا الترتيب من الطرف (الشكل 1D).
- ضع المحقنة الزجاجية المتصلة محكمة الغلق بالغاز على مضخة حقنة التسريب.
- استنشق 90 ميكرولتر من محلول ناقل AAV المحضر في الخطوة 6.1.3 في المحقنة الزجاجية محكمة الغلق باستخدام مضخة حقنة التسريب.
- اضبط وضع التسريب لمضخة الحقنة على النحو التالي: الحجم المستهدف البالغ 50 ميكرولتر ومعدل تدفق 50 ميكرولتر / دقيقة.
- ضع الفأر في حجرة بلاستيكية مملوءة ب 4٪ من الأيزوفلوران يتم توصيله بمعدل 100٪ أكسجين بمعدل تدفق من 1.5 إلى 3.0 لتر / دقيقة حتى يتم تخديره بالكامل.
- ضع خطم الفأر في مخروط الأنف مع تدفق الأيزوفلوران من 1.5٪ إلى 3.0٪. راقب عمق التخدير عن طريق منعكس إصبع القدم طوال العملية الجراحية.
- غطي العينين بمرهم للعيون باستخدام قضيب قطني لمنع جفاف القرنية.
- قم بإزالة الفراء من الجانب الخلفي الأيسر من الماوس باستخدام مزيل الشعر باستخدام قضيب قطني.
ملاحظة: يجب إزالة كريم إزالة الشعر تماما عن طريق الشطف لمنع تهيج الجلد.
- ضع الماوس في وضع جانبي على وسادة حرارية مغلقة الحلقة متصلة بمضخة العلاج الحراري للحفاظ على درجة حرارة الجسم عند 37 درجة مئوية (لا حاجة لتثبيته بشريط لاصق).
- تطهير المنطقة المحلوقة بثلاثة تطبيقات متناوبة من بوفيدون اليود و 70٪ إيثانول باستخدام قضيب قطني بحركة دائرية تبدأ من موقع الشق.
- قم بتغطية الماوس بستارة جراحية معقمة.
- حقن RP للكلية اليسرى
- اقرص الجلد بالملقط الأنسجي وقم بعمل شق بطول 1 سم تقريبا في طبقة الجلد بمقص جراحي على مستوى زاوية الغطاء في موقع الكلية اليسرى.
- بعد إجراء شق في الجلد ، قم بقطع طبقة العضلات بنفس الطول.
ملاحظة: إذا كان طول الشق قصيرا جدا ، فلا يمكن تعريض الكلية ، وبدلا من ذلك ، قد يتعرض الطحال ، الأصغر حجما ، عن طريق الخطأ. من ناحية أخرى ، إذا كان طول الشق طويلا جدا ، فلن يتم الاحتفاظ بالكلية في مكانها بواسطة الشق نفسه وستنزلق باستمرار إلى البطن من خلال الشق.
- اضغط برفق على البطن بالأصابع ، دون لمس الكلى مباشرة ، بحيث تتعرض الكلية من خلال موقع الشق (الشكل 1 أ).
- قم بإزالة الدهون المحيطة بالحد الأدنى بحيث يظهر الحوض الكلوي كمنطقة بيضاء صغيرة.
- أولا ، قم بتثبيت الحالب بمشبك وعاء دموي صغير من النوع المستقيم ، ثم الشريان الكلوي والوريد الكلوي مع مشبك وعاء دموي صغير من النوع المنحني.
ملاحظة: يتحول لون الكلى إلى اللون الأحمر الداكن ، مما يؤكد الحصار الناجح لتدفق الدم داخل وخارج الكلى (الشكل 1 ب).
- أدخل الإبرة 30 جم المتصلة بمضخة المحقنة حوالي 3 مم في تجويف الحوض باستخدام ملقط منحني وابدأ حقن 50 ميكرولتر من محلول ناقل AAV باستخدام مضخة حقنة التسريب بمعدل تدفق 50 ميكرولتر / دقيقة خلال دقيقة واحدة (الشكل 1C).
- احتفظ بالإبرة والمشبك لمدة 5 دقائق لزيادة تعرض الكلى المحقونة لناقل AAV.
ملاحظة: قد يختلف وقت الإقامة المناسب ويعتمد على قفيصة AAV. وقد ثبت أن وقت الإقامة البالغ 5 دقائق كاف للنقل باستخدام ناقل AAV-KP1 أو AAV-KP3.
- بمجرد اكتمال الحضانة لمدة 5 دقائق ، قم بإزالة المشابك.
ملاحظة: يتغير لون الكلى على الفور من الأحمر الداكن إلى الأحمر الدموي ، مما يؤكد استعادة تدفق الدم في الكلى.
- اسحب إبرة الحقن بعناية وببطء ، مع وضع قضيب قطني على موقع الحقن بالضغط. تأكد من عدم وجود نزيف من موقع الحقن. لا يلزم تطبيق رقعة مرقئ.
- ضع الكلية برفق مرة أخرى في التجويف البريتوني.
- خياطة طبقة العضلات بخياطة قابلة للامتصاص 6-0 والجلد بخياطة أحادية الشعيرات 5-0.
- قم بإعطاء 1 مل من المحلول الملحي تحت الجلد في الجزء الخلفي من الفئران لدعم السوائل.
- استبدل طرف الإبرة المستخدم 30 جم بآخر معد حديثا ، وتخلص من إبرة 30 G المستخدمة وفقا لإرشادات المؤسسة لإدارة النفايات الكيميائية الخطرة ، وقم بتحميل 50 ميكرولتر من محلول ناقل AAV باستخدام مضخة حقنة التسريب لإعطائها إلى الماوس التالي.
- كرر الخطوات 6.2.12-6.2.13 لجميع الفئران في المجموعة ، باستثناء الخطوة الأخيرة ، والتي لا يلزم فيها الخطوة 6.2.13.
- بعد الانتهاء من جميع الحقن المخطط لها ، تخلص من الإبر الملوثة وأنابيب البولي إيثيلين وفقا لإرشادات المؤسسة لإدارة النفايات الكيميائية الخطرة.
- مراقبة ورعاية ما بعد الجراحة
- يتم تطبيق ميلوكسيكام (5 ملغ/كغ) تحت الجلد في الجزء الخلفي من الفئران لعلاج التسكين التالي للجراحة بعد 24 ساعة و48 ساعة من حقن RP.
- يجب تطبيق 1 مل من المحلول الملحي تحت الجلد في الجزء الخلفي من الفئران لدعم السوائل بعد 24 ساعة من حقن RP.
- مراقبة وزن الجسم والمظهر العام للفئران المحقونة يوميا لمدة أسبوع واحد بعد الجراحة. في حالة حدوث فقدان لوزن الجسم بنسبة 10٪ ، قم بإعطاء 1 مل من المحلول الملحي تحت الجلد في الجزء الخلفي من الفئران ثلاث مرات في الأسبوع لمدة أسبوع. إذا لم يلاحظ أي تحسن ، يتم قتل الفئران المصابة.
7. حصاد الأنسجة والتشريح بالتبريد
- تحضير محلول التثبيت والحماية بالتبريد.
- 0.2 م عازلة فوسفات (إجمالي 1 لتر)
- تحضير 800 مل من الماء فائق النقاء في دورق زجاجي سعة 1 لتر.
- أضف 6.4 جم من فوسفات الصوديوم أحادي القاعدة (NaH2PO4) و 21.8 جم من فوسفات الصوديوم ثنائي القاعدة (Na2HPO4) إلى المحلول.
- اضبط الرقم الهيدروجيني على 7.4 باستخدام حمض الهيدروكلوريك.
- املأ بالماء فائق النقاء حتى 1 لتر.
- يحفظ في درجة حرارة 4 درجات مئوية حتى الاستخدام.
- محلول بارافورمالدهيد 4٪ (إجمالي 40 مل)
- امزج 10 مل من 16٪ PFA ، و 20 مل من محلول الفوسفات 0.2M المحضر في الخطوة 7.1.1 ، و 10 مل من الماء عالي النقاء.
- Aliquot 10 مل في أنبوب بولي بروبيلين سعة 15 مل.
ملاحظة: اصنع محلول PFA بنسبة 4٪ قبل الاستخدام مباشرة لتثبيت التروية.
- محلول سكروز 30٪ (إجمالي 40 مل).
- امزج 30 مل من PBS مع 12 جم من السكروز.
- بعد الذوبان تماما ، املأ ب PBS إلى 40 مل.
- تثبيت التروية وحصاد الأنسجة.
تنبيه: يجب إجراء تثبيت التروية في غطاء الدخان لأن محلول PFA بنسبة 4٪ مادة كيميائية ضارة قوية إذا تم استنشاقه.
- قم بتخدير الفأر باستخدام الأيزوفلوران ، وضعه في وضع ضعيف ، وتأكد من الغياب التام للاستجابة عن طريق الضغط برفق على الأطراف.
- بمجرد تخدير الفأر ، قم بعمل شق باستخدام مقص جراحي من البطن الذيلية إلى الخنجري. بعد ذلك ، قم بعمل شقين جانبيين على جانبي القص وسحب جدار الصدر من الأمام لكشف القلب والأوعية الرئيسية.
- افتح الأذين الأيمن عن طريق تشريح حاد لفك ضغط الدورة الدموية. أدخل إبرة فراشة 25 جم في البطين الأيسر وقم بنقع 50 مل من PBS بمعدل 10 مل / دقيقة تقريبا ، مع توجيه التدفق نحو الشريان الأورطي الصاعد.
ملاحظة: يعد التألق المناعي أمرا مهما للحصول على صور التألق المناعي (IF) عالية الجودة لأن الدم يظهر التألق الذاتي. لضمان الإزالة الكاملة للدم ، تم استخدام 50 مل من PBS في هذه الدراسة ، على الرغم من استخدام 20-30 مل بشكل شائع.
- قم ببث 20 مل من محلول PFA بنسبة 4٪ المحضر في الخطوة 7.1.2 بنفس المعدل ، مما يضمن عدم إدخال الهواء أثناء تبديل المحاليل.
- احصد الأنسجة واحتفظ بها عند 4 درجات مئوية طوال الليل في أنبوب بولي بروبيلين سعة 15 مل مملوء بمحلول PFA بنسبة 4٪ للتثبيت اللاحق. عندما يتم التعبير عن البروتين الفلوري في الأنسجة المجمعة ، قم بتغطية الأنبوب بورق الألمنيوم لحمايته من الضوء.
- التثبيت بالتبريد
- انقل الأنسجة إلى أنبوب بولي بروبلين سعة 15 مل مملوء بمحلول سكروز 30٪ تم إعداده في الخطوة 7.1.3 للحماية بالتبريد.
- يحفظ عند 4 درجات مئوية حتى تغرق الأنسجة تماما في قاع الأنابيب.
- انقل الأنسجة إلى برديد بلاستيكي باستخدام ملقط نمط قياسي.
- ضع مركب OCT فوق الأنسجة مع التأكد من أن الأنسجة موجهة بشكل صحيح وتتدفق مع الجزء السفلي من القالب بالتبريد.
- املأ الجزء العلوي بمركب OCT. قم بإزالة أي فقاعات بطرف ماصة.
- ضع المبرد البلاستيكي في حمام مبرد يحتوي على 2-ميثيل بيوتان ، مبرد بالثلج الجاف المسحوق في دلو ثلج ، حتى يتجمد مركب OCT تماما (سيتحول مركب OCT إلى اللون الأبيض).
- قم بتخزين كتل المناديل على حرارة -80 درجة مئوية حتى الاستخدام.
- التقطيع بالتبريد
- انقل كتل الأنسجة المجمدة إلى ميكروتوم ناظم البرد عند -20 درجة مئوية قبل التقسيم واترك درجة حرارة كتل الأنسجة المجمدة بالتوازن.
- قسم كل كتلة من الأنسجة المجمدة إلى السماكة المرغوبة (عادة 5 ميكرومتر) باستخدام ميكروتوم ناظم البرد. ضع أقسام الأنسجة على شريحة زجاجية مجهرية لتلوين التألق المناعي.
- يمكن تخزين الأقسام عند -80 درجة مئوية لاستخدامها لاحقا.
8. تلطيخ التألق المناعي
- تجف الشرائح المجمدة في درجة حرارة الغرفة لمدة 30 دقيقة.
- اعزل القسم بقلم مانع للسائل وجففه في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- أعد ترطيب الأقسام ب 150 ميكرولتر من PBS لمدة 10 دقائق.
- ضع الشرائح على سطح مستو وأضف 150 ميكرولتر من ألبومين مصل الأبقار بنسبة 1٪ (BSA) المخفف ب PBS لكل قسم على الشرائح. احتضن في درجة حرارة الغرفة لمدة 45 دقيقة للحظر.
- أضف 150 ميكرولتر من محلول الأجسام المضادة الأولية (الجسم المضاد المضاد لورم ويلمز 1 (WT1) ، المخفف إلى 1: 100 مع 1٪ BSA ؛ الجسم المضاد المضاد ل Na-K-2Cl cotransporter 2 (NKCC2) ، مخفف إلى 1: 100 مع 1٪ BSA ؛ أو الجسم المضاد المضاد للأكوابورين 2 (AQP2) ، مخفف إلى 1: 100 مع 1٪ BSA) واحتضانه عند 4 درجات مئوية طوال الليل تحت غرفة رطبة.
- اغسل الأقسام باستخدام PBS في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق ، 3 مرات.
- أضف 150 ميكرولتر من الأجسام المضادة الثانوية (الجسم المضاد IgG Alexa Fluor 647 المضاد للأرانب ، المخفف إلى 1: 500 مع 1٪ BSA) و Lotus tetragonolobus lectin (LTL) - فلوريسين (مخفف إلى 1: 200 مع 1٪ BSA) ، واحتضانه في درجة حرارة الغرفة لمدة 60 دقيقة.
- اغسل الأقسام باستخدام PBS في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- ضع الشرائح على سطح مستو وأضف 150 ميكرولتر من Hoechst 33342 (مخفف إلى 1: 10،000 مع PBS) للتلوين النووي. احتضن في درجة حرارة الغرفة لمدة 10 دقائق ، محمية من الضوء.
- اغسل الأقسام باستخدام PBS في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- قم بتركيب الشرائح ب 20 ميكرولتر من وسط التثبيت وغطاء زجاجي. احتفظ بالشرائح في الظلام عند 4 درجات مئوية حتى يتم إجراء التصوير.
9. استخراج الحمض النووي من الأنسجة
- استخراج الحمض النووي من الأنسجة باستخدام مجموعة متوفرة تجاريا (انظر جدول المواد).
- انقل الأنسجة إلى أنبوب حبة خزفي وأضف 400 ميكرولتر من المخزن المؤقت لاستخراج الحمض النووي (100 ملي كلوريد الصوديوم ، 20 ملي مولار EDTA ، 1٪ SDS ، و 50 ملي مولار Tris-HCl ، درجة الحموضة 8.0).
- تجانس الأنسجة بسرعة 5 م / ث لمدة 20 ثانية في 3 دورات باستخدام الخالط.
- جهاز طرد مركزي عند 2,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة دقيقتين.
- اجمع 200 ميكرولتر من المادة الطافية باستخدام ماصة P200 وأضف 10 ميكرولتر من محلول البروتيناز K (التركيز النهائي 1 ملغم/مل).
- امزج عن طريق الدوامة لمدة 15 ثانية واحتضانها عند 55 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
- أضف 200 ميكرولتر من المخزن المؤقت للتحلل من مجموعة استخراج الحمض النووي.
- تخلط عن طريق الدوامة لمدة 15 ثانية وتحتضن عند 55 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة.
- أضف 250 ميكرولتر من الإيثانول بنسبة 100٪.
- تخلط عن طريق الدوامة لمدة 15 ثانية وتحتضن في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- ضع المحللة على عمود دوران استخراج الحمض النووي.
- جهاز طرد مركزي عند 6,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة.
- ضع عمود الدوران في أنبوب تجميع جديد سعة 2 مل. أضف 500 ميكرولتر من أول مخزن مؤقت للغسيل من مجموعة استخراج الحمض النووي.
- جهاز طرد مركزي عند 6,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة.
- ضع عمود الدوران في أنبوب تجميع جديد. أضف 500 ميكرولتر من مخزن الغسيل الثاني من مجموعة استخراج الحمض النووي.
- جهاز طرد مركزي عند 6,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة.
- ضع عمود الدوران في أنبوب تجميع جديد سعة 2 مل. أضف 500 ميكرولتر من الإيثانول بنسبة 100٪.
- جهاز طرد مركزي عند 6,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة.
- ضع عمود الدوران في أنبوب تجميع جديد سعة 2 مل وجهاز طرد مركزي عند 20,000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 3 دقائق.
ملاحظة: تضمن هذه الخطوة التجفيف الكامل لغشاء عمود الدوران ، حيث يمكن أن يتداخل ترحيل الإيثانول إلى المصفاة مع التطبيقات النهائية.
- ضع عمود الدوران في أنبوب طرد مركزي دقيق جديد سعة 1.5 مل. أضف 35 ميكرولتر من المخزن المؤقت للشطف من مجموعة استخراج الحمض النووي إلى عمود الدوران.
ملاحظة: عادة ما يكون حجم الشطف المستعاد أقل بحوالي 5 ميكرولتر من حجم المخزن المؤقت للشطف المطبق في البداية على العمود.
- احتضن في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- جهاز طرد مركزي عند 20،000 × جم في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة.
- قياس تركيز الحمض النووي.
- القياس الكمي لعدد نسخة الجينوم المتجه بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR)
- تمييع الحمض النووي المستخرج المحضر في الخطوة 9.1 بتركيز 25 نانوغرام / ميكرولتر بماء من الدرجة الجزيئية.
- صمم زوجا أوليا qPCR للقياس الكمي لجينوم المتجه (تم استخدام tdTomato في هذه الدراسة) وزوج تمهيدي qPCR للجين المرجعي للفأر الذي سيتم استخدامه لتحديد الجينومات ثنائية الصبغيات في عينات الحمض النووي المستخرجة (تم استخدام جين agouti للفأر في هذه الدراسة).
ملاحظة: التسلسلات التمهيدية المستخدمة في هذه الدراسة هي كما يلي ؛
tdTomato إلى الأمام: 5 '-TATGAACGGAGCGAGGGGAG-3'
tdTomato عكس : 5 '-TTCCACTAGACCCTGAGCCG-3 '
الماوس إلى الأمام: 5'-GGCGTGGTCAGTGGTTGTG-3'
عكس الماوس: 5'-TTTAGCTTCCACTAGGTTTCCTAGAAA-3'
- لتفاعل qPCR سعة 25 ميكرولتر ، امزج 4 ميكرولتر من عينة الحمض النووي المخففة في الخطوة 9.2.1 (ما مجموعه 100 نانوغرام من الحمض النووي في خليط تفاعل 25 ميكرولتر) ، و 12.5 ميكرولتر من المخزن المؤقت لتفاعل qPCR 2x ، و 0.5 ميكرولتر من كل من الأعداد الأولية 20 ميكرومتر للأمام والعكسي المحضرة في الخطوة 9.2.2 (التركيز النهائي 400 نانومتر من كل طبقة أولية) ، و 7.5 ميكرولتر من الماء الجزيئي.
- قم بقياس تركيز الحمض النووي لمعايير البلازميد ل qPCR أربع مرات وحدد متوسط قيمة تركيز الحمض النووي.
ملاحظة: تم استخدام بلازميد pAAV-CAG-tdTomato الدائري فائق الالتفاف وبلازميد دائري فائق الالتف يحتوي على تسلسل هدف PCR المشتق من جين agouti الفأر لقياس جينوم المتجهات والتطبيع ، على التوالي ، في هذه الدراسة.
- قم بإعداد سلسلة من التخفيفات التسلسلية 1:10 لمعايير الحمض النووي البلازميد التي تغطي نطاقا ديناميكيا من 106.
ملاحظة: يجب تحليل كل عينة ومعيار على الأقل في نسختين.
- قم بإجراء qPCR باستخدام ظروف التدوير الحراري التالية: خطوة تنشيط حرارية أولية عند 95 درجة مئوية لمدة 10 دقائق ، تليها 35 دورة من التمسخ عند 95 درجة مئوية لمدة 15 ثانية ، والتلدين / التمديد عند 60 درجة مئوية لمدة 30 ثانية.
- بعد الانتهاء من تفاعل qPCR والحصول على قيم رقم النسخ مزدوجة الشريطة (ds) لجينومات المتجهات والجين المرجعي للفأر في العينات ، حدد أرقام نسخ الجينوم المتجه ds لكل مكافئ جيني ثنائي الصبغيات (ds-vg / dge) عن طريق تطبيع أرقام نسخ الجينوم المتجه ds إلى رقم نسخة الجين المرجعي في كل عينة بناء على المنحنيات القياسية التي تم إنشاؤها من التركيزات المعروفة لكل من الجينوم المتجه والجين المرجعي.
ملاحظة: يمكن تحديد Ds-vg / dge بناء على التقريب التالي بأن 100 نانوغرام من الحمض النووي الجيني للفأر يمثل 16,900 خلية فأر ثنائية الصبغيات (2N) (أي 5.92 بيكوغرام من الحمض النووي لكل خلية فأر ثنائية الصبغيات).