$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تم إجراء جميع رعاية والتجارب وفقا لإرشادات اللجنة المؤسسية لرعاية واستخدامه في جامعة تشنغتشو. تعقيم جميع الأدوات الجراحية قبل الاستخدام. اتبع تقنيات التعقيم للوقاية من العدوى. بعد الحصول على جميع البيانات ، تم القتل الرحيم للحيوانات باستخدام جرعة زائدة من التخدير المستنشق متبوعا بقطع الرأس.
1. التطبيقات في المختبر
- بناء البلازميد
- احصل على المستشعر المتسارع لإمكانات الفعل 1 (ASAP1) و ASAP3 الجينات من Addgene أو التوليف من التسلسل. (ASAP1 ، معرف انضمام NCBI: AHV90412.1 ، معرف Addgene: 52519 ؛ في أسرع وقت ممكن 3 ، معرف Addgene: 132331).
- استخدم الاشعال المدرجة في الجدول 1 لتركيبات البلازميد.
- للتعبير في الخلايا ، استخدم متجه EGFPN1 للبناء.
- في البداية ، قم بتجميع تسلسل جين cox8 (NP_004065 ، الأحماض الأمينية 1-29) مع أربعة تكرارات ترادفية (4cox8) محاطة بمواقع تقييد NheI و XhoI. استيعاب كل من جزء 4cox8 المركب ومتجه EGFPN1 مع NheI و XhoI ، متبوعا بالربط لتوليد متجه 4cox8-EGFP.
- بعد ذلك ، قم بإجراء تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لتسلسل ASAP1 باستخدام التمهيدي 1 والتمهيدي 2. استيعاب جزء ASAP1 ومتجه 4cox8-EGFP مع SalI و NotI ، متبوعا بالربط لتوليد متجه MPI-1 النهائي (MPI تعني مؤشر إمكانات الميتوكوندريا).
ملاحظة: تم تصوير خريطة المتجهات ل CMV-MPI-1 في الشكل 1. يمكن الوصول إلى التسلسل التفصيلي من NCBI (معرف الانضمام: PQ678920).
- للحصول على تعبير محدد في الخلايا العصبية ، قم بتضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لتسلسل محفز hSyn من بلازميد AAV-hSyn-EGFP (معرف انضمام NCBI: MH458079 ، معرف Addgene: 50465) باستخدام التمهيدي 3 والتمهيدي 4.
- استيعاب كل من تسلسل hSyn ومتجه 4cox8-EGFP باستخدام AseI و NheI ، متبوعا بالربط لتوليد متجه hSyn-4cox8-EGFP. بعد ذلك ، قم بإجراء تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لتسلسل ASAP3 باستخدام التمهيدي 1 والتمهيدي 2.
- استيعاب متجه hSyn-4cox8-EGFP وتسلسل ASAP3 مع SalI و NotI ، متبوعا بالربط لتوليد متجه hSyn-MPI-2.
ملاحظة: ستختلف ظروف تفاعل البوليميراز المتسلسل بناء على الإنزيمات المحددة ودرجات حرارة انصهار التمهيدي (Tm). يتضمن تفاعل تفاعل البوليميراز المتسلسل النموذجي خطوة تمسخ أولية عند 95 درجة مئوية لمدة 30 ثانية ، تليها 25-35 دورة من التمسخ (95 درجة مئوية ، 10 ثوان) ، والتلدين (55 درجة مئوية ، 30 ثانية) ، والتمديد (72 درجة مئوية ، 30 ثانية / كيلو بايت). تضمن خطوة التمديد النهائية عند 72 درجة مئوية لمدة 5 دقائق تخليقا كاملا للمنتج ، متبوعا بثبات عند 4 درجات مئوية. يجب أن تكون درجة حرارة التلدين حوالي 5 درجات مئوية أقل من Tm من البادئات. راجع تعليمات الشركة المصنعة للحصول على معلمات PCR المثلى. بادئات ASAP1 و ASAP3 متطابقة.
- التصوير في الخلايا الحية
- تحضير وسط استزراع DMEM بإضافة 10٪ مصل بقري للجنين و 100 مجم / لتر بنسلين / ستربتومايسين إلى الوسط.
- تحضير كواشف تعداء الكالسيوميوم2+ : 2.5 مول / لتر كلوريد الكالسيوم2 ، 2 × سداسبايت (274 مليمول / لتر كلوريد الصوديوم ، 10 مليمول / لتر كلوريد الصوديوم ، 1.4 مليمول / لتر Na2HPO4 ، 15 مليمول / لتر D-glucose ، 42 مليمول / لتر HEPES ، درجة الحموضة 7.07).
- قم بإعداد عازلة Tyrode للحفاظ على الخلايا أثناء التصوير (145 مليمول / لتر كلوريد الصوديوم ، 3 مليمول / لتر كلوريد كلوريد ، 10 مليمول / لتر هيبلز ، 10 مليمول / لتر جلوكوز ، درجة الحموضة 7.4).
- زراعة خلايا هيلا في طبق استزراع 35 مم يتم تغذيته بوسط استزراع DMEM في حاضنة بدرجة حرارة 37 درجة مئوية وجو 5٪ ثاني أكسيد الكربون2/95٪ هواء. أضف 2-3 أغطية لكل طبق للسماح للخلايا بالنمو عليها.
- قم بنقل خلايا Hela عبر طريقة ترسيب فوسفات الكالسيوم.
- لنقل الخلايا ، ابدأ باستبدال وسط المزرعة القديم ب 2 مل من DMEM الخالي من المصل. بعد 35 دقيقة ، قم بإعداد محلول DNA / Ca2+ عن طريق خلط 10 ميكروغرام من الحمض النووي ، و 4 ميكرولتر من CaCl2 ، و ddH2O إلى حجم نهائي قدره 40 ميكرولتر في أنبوب طرد مركزي دقيق.
- أضف 40 ميكرولتر من 2x HEBS إلى محلول DNA / Ca2+ بالتنقيط مع التقليب بقوة. قم بفقاعة الهواء مع ماصة في الخليط لتسهيل ترسيب فوسفات الكالسيوم.
- بعد 25 دقيقة ، أضف 80 ميكرولتر من هذا المحلول المرسب إلى الطبق مع الخلايا وأعده إلى الحاضنة لمدة 1-2 ساعة أخرى. ثم قم بإزالة DMEM غير المصل واشطف الخلايا بنسبة 15٪ من الجلسرين (المذاب في PBS) لمدة دقيقتين.
- بعد شفط الجلسرين ، أضف 2 مل من DMEM الذي يحتوي على 10٪ FBS واستمر في زراعة الخلايا لمدة 16-24 ساعة.
- ضع أغطية مع الخلايا في طبق استزراع 35 مم مع 2 مل من عازلة Tyrode وقم بتلطيخ الخلايا بصبغة الرودامين 800 عن طريق إضافة 20 ميكرولتر / لتر من الرودامين 800 (المذاب في ddH2O) إلى الطبق إلى تركيز نهائي يبلغ 50 نانومول / لتر.
- قم بإعداد مجهر مضان وإعداده بالمرشحات المناسبة ومصدر الضوء لإثارة البروتين بمصدر ضوء 488 نانومتر وجمع الانبعاث بين 490-540 نانومتر. قم بإثارة صبغة الرودامين 800 بمصدر ضوء 633 نانومتر واجمع الانبعاث بين 650-720 نانومتر.
- قم بإعداد محلول الكربونيل سيانيد m-chlorophenyl hydrazone (CCCP) عند 500 ميكرومتر (مخزون) وأضفه إلى الخلايا إلى تركيز نهائي يبلغ 5 ميكرومتر أثناء التصوير.
ملاحظة: يعد الرقم الهيدروجيني لمحلول 2x HEBS أمرا بالغ الأهمية لكفاءة التعداد. يجب ضبط الرقم الهيدروجيني بعناية إلى 7.07 باستخدام هيدروكسيد الصوديوم الصلب. لا يمكن أن يكون الرقم الهيدروجيني أقل من 7.01 أو أعلى من 7.12.

الشكل 1: خريطة متجهة CMV-MPI-1. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
2. تطبيقات في الجسم الحي
- بناء البلازميد
- للتعبير في الجسم الحي ، استخدم فيروس AAV للتحويل. احصل على العمود الفقري للتعبير عن عبوات AAV (معرف Addgene: 46954 أو 26968) ، والذي يحتوي على تسلسلات التكرارات الطرفية المقلوبة (ITR) لتغليف فيروس AAV.
- قم بإجراء تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لمتجه hSyn-MPI-2 (من الخطوة 1.1.4) باستخدام البادئات 5 و 7 في الجدول 1.
- قم بإجراء تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل الثاني باستخدام نفس القالب والبادئات 6 و 8 في الجدول 1.
- قم بإجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل النهائي باستخدام المنتج من تفاعل البوليميراز المتسلسل الأول والثاني (الخطوتان 2.1.2 و 2.1.3) كقالب والبادئات 5 و 8 في الجدول 1 ، مما يؤدي إلى إنشاء تسلسل hSyn-MPI-2 النهائي.
- استيعاب تسلسل hSyn-MPI-2 والعمود الفقري ل pAAV باستخدام MluI و EcoRI ، متبوعا بالربط لإنشاء بناء pAAV-hSyn-MPI-2 النهائي. يتم توضيح خريطة المتجهات ل pAAV-hSyn-MPI-2 في الشكل 2. يمكن الوصول إلى التسلسل التفصيلي من NCBI (معرف الانضمام: PQ678919).
ملاحظة: يحتوي متجه hSyn-MPI-2 على موقع EcoRI داخلي ينشأ من العمود الفقري الأصلي EGFPN1 ، والذي تمت إزالته باستخدام بادئات معدلة في استراتيجية تفاعل البوليميراز المتسلسل المتداخلة (الخطوات 2.1.2-2.1.4).
- تحضير الفيروس ونقله
- استزراع خلايا HEK293t في طبق استزراع 100 مم يتم تغذيته بوسط استزراع FBS DMEM بنسبة 10٪ في حاضنة بدرجة حرارة 37 درجة مئوية وجو من 5٪ ثاني أكسيد الكربون2/95٪ هواء للوصول إلى التقاء 70٪.
- شارك في نقل خلايا HEK293t مع بلازميد جين AAV ، القفيصة (pAAV-DJ أو pAAV9) ، والبلازميدات المساعدة (pHelper) باستخدام طريقة ترسيب فوسفات الكالسيوم. كانت كمية الحمض النووي لكل بلازميد على النحو التالي: الجين: 10 ميكروغرام ، pHelper: 11 ميكروغرام ، القفيصة: 9 ميكروغرام. كمية كاشف التعداد: 12 ميكرولتر من كلوريدالكالسيوم 2 ، 120 ميكرولتر من 2x HEBS.
- احتضان الخلايا المنقولة لمدة 72 ساعة لتمكين إنتاج الفيروس.
- بعد فترة الحضانة ، قم بحصاد الخلايا عن طريق أجهزة الطرد المركزي عند 400 جم. شطف الخلايا مع PBS 2 مرات وإعادة تعليق الخلية في 400 ميكرولتر من PBS.
- حصاد الفيروسات من معلق الخلية بأربع دورات من طرق التجميد والذوبان (37 درجة مئوية و -80 درجة مئوية). جهاز الطرد المركزي للمحللة عند 13,500 × جم عند 4 درجات مئوية وتخلص من الحبيبات. يحتوي المادة الطافية على فيروس AAV.
- قم بإجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي لتحديد معايرة الفيروس المحضر. يمكن العثور على بروتوكول مفصل لتحديد المعايرة بالتحليل الحجمي AAV على https://www.addgene.org/protocols/aav-titration-qpcr-using-sybr-green-technology/.
- Aliquot وتخزين فيروس AAV المحضر عند -80 درجة مئوية.
- حقن الفيروسات التجسيمية
- تخدير فأر ذكر C57 / BL بالغ يزن 24-26 جم مع 3٪ بنتوباربيتال الصوديوم عن طريق الحقن داخل الصفاق بجرعة 30 مجم / كجم. بمجرد التخدير ، قم بتثبيت الفئران على جهاز تجسيمي للحفاظ على وضع مستقر طوال العملية.
- ضع مرهم بيطري للعيون لحماية العينين من التلف الضوئي وللحفاظ على رطوبة العينين.
- استخدم كريم إزالة الشعر لإزالة الشعر من رأس الفأر وفضح فروة الرأس.
- افتح فروة الرأس باستخدام مقص الجراحة وكشف الجمجمة. عالج الجمجمة بنسبة 3٪ بيروكسيد الهيدروجين لتعقيم وتصور المعالم الرئيسية مثل مواقع بريجما ولامدا.
- اضبط موضع رأس الماوس للتأكد من أن الجمجمة أفقية.
- استخدم مجتذب ماصات دقيقة قابلة للبرمجة لسحب الماصات الزجاجية إلى الشكل والحجم المطلوبين لإجراء حقن دقيق. املأ الماصة الدقيقة الزجاجية بزيت البارافين.
- ضع الماصة الدقيقة في الموقع المستهدف. في هذا البروتوكول ، الهدف هو منطقة M2 على الجانب الأيمن ، باستخدام الإحداثيات التالية: AP (الأمامي الخلفي) ، +1.94 مم ؛ مل (متوسط الجانب) ، +0.75 مم ؛ DV (ظهري بطني) ، -1.5 مم.
- استخدم مثقابا كهربائيا لعمل ثقب صغير في الجمجمة في الموقع المستهدف.
- أستفير 500 نانولتر من الفيروس بعيار 1.5 × 1011 نسخة جينوم لكل مليلتر (GC / مل) من خلال طرف الماصة الدقيقة. حقن 500 نانولتر من الفيروس في الموقع المستهدف باستخدام مضخة حقن بمعدل تدفق 100 نانولتر / دقيقة.
- بعد الحقن، اترك الماصة في مكانها لمدة 5 دقائق تقريبا للسماح بالانتشار قبل سحبها بعناية.
- زرع الألياف الضوئية (قطر 200 ميكرومتر ، فتحة عددية 0.37 ، طول 2 مم) في موقع الحقن.
- قم بتثبيت الألياف الضوئية في مكانها باستخدام أسمنت الأسنان.
- خياطة فروة رأس الفأر بخيط نايلون 5-0 (إبرة جمالية Δ1 / 2 4x12) وأعيدها إلى قفص منزلها.
- ضع قفص المنزل على وسادة تدفئة للحفاظ على درجة حرارة جسم الماوس حتى يتعافى تماما من التخدير.
- قم بإيقاف تشغيل وسادة التدفئة بمجرد أن يبدأ في الحركة. اترك ساعتين أخريين من التأقلم مع درجة حرارة الغرفة (RT) قبل نقل الماوس إلى منشأة الإسكان.
- فأر المنزل في دورة إضاءة مدتها 12 ساعة / 12 ساعة في 22 درجة مئوية مع إمكانية الوصول إلى الطعام والماء لمدة 2-3 أسابيع للسماح بالتعبير الفيروسي.
- قياس ضوئي الألياف
- قم بتوصيل الألياف الضوئية المزروعة في الماوس بكابل بصري.
- قم بتوصيل الطرف الآخر من الكبل البصري بكاشف سيتم استخدامه لالتقاط بيانات التصوير.
- للتصوير ، استخدم مصدر ضوء لإثارة البروتينات بطول موجي يبلغ 488 نانومتر. قم بإعداد الكاشف لجمع الضوء المنبعث بأطوال موجية تتراوح من 490 نانومتر إلى 540 نانومتر.
- اضبط شدة ضوء الإثارة لتحسين الإشارة دون التسبب في تلف أنسجة المخ.
- قم بتعديل مكاسب إشارة الفلورسنت لضمان التقاط إشارة واضحة وقوية بواسطة الكاشف.
- لتجنب التبييض السريع للتألق ، مما يقلل من جودة التصوير ، قم بضبط شدة الضوء واكتساب إشارة الفلورسنت حسب الضرورة.
- إجراء اختبار سلوك الماوس.
- راقب عملية التصوير باستمرار أثناء اختبار السلوك.
- تحليل البيانات
- استخدم Python و GNUplot لإنشاء خريطة حرارية للتجارب التجريبية لتمثيل مرئي للبيانات. يتم توفير الرموز المصدرية في الملف التكميلي 1.

الشكل 2: خريطة متجهة ل AAV-hSyn-MPI-2. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.