يجب تنفيذ هذا البروتوكول من قبل باحثين معتمدين في التجارب على (وظائف الاتحاد الأوروبي A و B). يجب أن تتوافق جميع الإجراءات المتعلقة بالتعامل مع وجمع العينات مع إرشادات ARRIVE (أبحاث: الإبلاغ عن التجارب في الجسم الحي ) والالتزام بالمعايير الأخلاقية لرعاية واستخدامها وفقا لتوصيات الاتحاد الأوروبي لجمعيات علوم المختبرات (FELASA). اتبعت هذه الدراسة كل هذه المعايير بالإضافة إلى التشريعات البرتغالية لعلوم المختبر (توجيه الاتحاد الأوروبي 2010/63; المرسوم بقانون رقم 113/2013). تمت الموافقة على البحث من قبل هيئة رعاية وأخلاقياته (ORBEA ، LABVIVOS-002-AquaClimAdapt) ، تحت إشراف الهيئة الوطنية لاستخدام الحية ، والمعروفة باسم المديرية العامة للأغذية والبيطرية (DGAV) ، بموجب رقم التصريح الأخلاقي 20596 / 25-S.
1. دراسة النموذج وصيانة الكائنات الحية
ملاحظة: صممت هذه الدراسة خصيصا لصالح الدنيس الذهبي اليافع (Sparus aurata) ، بمتوسط وزن 30.0 ± 5.0 جم وطول إجمالي 12.0 ± 2.0 سم. قد لا تنطبق هذه الطريقة بشكل مباشر على أنواع الأسماك الأخرى ، حيث أن الأنواع المختلفة لها خصائص فسيولوجية ومناعية فريدة قد تؤثر على عزل الكريات البيض وتثبيت الخلايا وتقييم البقاء. قد تكون هناك حاجة إلى تعديلات على البروتوكول لأنواع أخرى ، ويوصى بإجراء دراسات أولية لتحسين الظروف لكل نوع مستهدف.
- التأقلم مع الأسماك (فترة الحجر الصحي)
- وزع الأسماك بالتساوي في أحواض ذات سعة كبيرة (على سبيل المثال، خزانان بسعة إجمالية قدرها 660 لترا لكل منهما - انظر الشكل التكميلي 1).
ملاحظة: قد تكون الخزانات التي سيتم استخدامها جزءا من نظام إعادة تدوير الاستزراع المائي (RAS) ، والذي يسمح باستخدام المياه بكفاءة وتحسين التحكم في جودة المياه. في RAS ، يتم إعادة تدوير المياه ومعالجتها بشكل مستمر داخل النظام ، مما يوفر بيئة مستقرة وخاضعة للرقابة للأسماك. يساعد هذا الإعداد في الحفاظ على الظروف المثلى لصحة الأسماك ونموها ، مما يضمن توزيعا موحدا وتقليل التوتر أثناء الدراسة.
- الحفاظ على الظروف اللاأحيائية المثلى.
- احتفظ بالأسماك في الحجر الصحي لمدة 3 أسابيع في ظل ظروف تحاكي بيئتها الطبيعية:
درجة الحرارة: 20.0 ± 0.5 درجة مئوية ؛
الأكسجين المذاب: 7.2 ± 0.2 مجم / لتر ؛
الملوحة: 35.0 ± 0.5 ‰ ؛
الرقم الهيدروجيني: 8.0 ± 0.1 وحدة ؛
فترة التصوير: 14 ساعة ضوء / 10 ساعات مظلمة.
ملاحظة: قد تختلف ظروف الصيانة المثالية بين أنواع الأسماك المختلفة. قد يكون للأنواع الأخرى متطلبات مختلفة ، لذلك من المهم تكييف هذه الظروف مع الاحتياجات المحددة للأنواع المستهدفة لضمان صحة ورفاهية الكائنات الحية. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن أن تتغير درجة حرارة مياه البحر والفترة الضوئية مع الفصول ، لذلك يجب مراعاة الاختلافات الموسمية عند تكرار الظروف الطبيعية في المختبر.
- بدء الدراسة التجريبية.
- تحديد عدد الخزانات والأسماك المطلوبة بناء على تصميم الإعداد التجريبي لكل دراسة حالة.
- بعد فترة الحجر الصحي ، انقل الأسماك إلى RAS مستقل (انظر الشكل التكميلي 2).
- تجهيز كل نظام بكاشطات البروتين لإزالة المركبات العضوية الزائدة من الماء ؛ الترشيح الفيزيائي (كيس الفلتر [400 ميكرومتر] ، إسفنجة المرشح ، والصوف الزجاجي) ؛ الترشيح البيولوجي (الكرات الحيوية [1.5 بوصة] ، معقم الماء بالأشعة فوق البنفسجية ، وأحجار الهواء المغمورة) ؛ أنظمة تبريد مياه البحر الأوتوماتيكية والسخانات الرقمية المغمورة ، وكلاهما متصل بنظام تحكم محوسب (ProfiLux) مع مستشعرات درجة الحرارة لضبط درجة الحرارة في كل خزان ؛ أحجار الهواء المغمورة في كل خزان للتحكم في الأكسجين المذاب.
- تأقلم الأسماك لمدة أسبوعين في الأنظمة الجديدة قبل الشروع في التجربة.
- إجراء الصيانة اليومية
- قم بإزالة براز الأسماك من كل حوض حضانة وقم بتجديد مياه البحر بنسبة 25٪.
- قم بقياس درجة الحرارة باستخدام مقياس حرارة دقيق محمول.
- راقب المعلمات اللاأحيائية الأخرى لمياه البحر (الملوحة والأكسجين المذاب ودرجة الحموضة) باستخدام أداة قياس متعددة المعلمات.
- اضبط المعلمات اللاأحيائية لمياه البحر حسب الضرورة لضمان الاستقرار طوال التجربة.
ملاحظة: يمكن أن تختلف الظروف اللاأحيائية في الأنظمة التجريبية اعتمادا على المتطلبات المحددة لكل دراسة حالة. على سبيل المثال ، إذا كانت الدراسة تهدف إلى محاكاة التغيرات الموسمية أو موجات الحر البحرية ، فيجب تعديل درجة الحرارة والفترة الضوئية وفقا لذلك لتقليد التغيرات الموسمية الطبيعية. وبالمثل ، إذا ركزت الدراسة على محاكاة ظروف نقص الأكسجين أو تحمض المحيطات ، فيجب إجراء تعديلات على مستويات الأكسجين ودرجة الحموضة في مياه البحر. هذا يضمن أن تكون الظروف التجريبية واقعية وذات صلة قدر الإمكان ، مما يعزز صحة نتائج الدراسة وقابليتها للتطبيق.
- تقييم صحة الأسماك ورفاهيتها ، وتحديد وإدارة علامات الإجهاد أو المرض كما هو موضح في الخطوات 1.2.4.6-1.2.4.8.
- ابحث عن سلوكيات غير طبيعية مثل السباحة غير المنتظمة أو فقدان الشهية أو الخمول أو العدوان أو العزلة.
- تحقق من علامات المرض ، بما في ذلك الآفات أو القرحة أو تغير اللون أو الزعانف المثبتة أو المخاط المفرط أو حركة الخياشيم السريعة.
- سجل جميع الملاحظات مع ملاحظة التاريخ والإجراءات المتخذة.
- إجراء اختبارات جودة المياه الأسبوعية.
- قم بقياس مستويات الأمونيا (NH3 / NH4) والنتريت (NO2-) والنترات (NO3-) باستخدام اختبارات قياس الألوان.
ملاحظة: تأكد من أن جميع هذه المعلمات أقل من المستويات التي يمكن اكتشافها. إذا تجاوزت المستويات الحدود ، فقم بإجراء تغيير إضافي للمياه أو زيادة التهوية أو ضبط الترشيح.
- إطعام ومراقبة تغذية الأسماك.
- توفير نظام غذائي عالي الجودة يلبي المتطلبات الغذائية المحددة للأسماك الصغيرة (انظر الجدول التكميلي 1 للحصول على مثال على التركيب التفصيلي للنظام الغذائي).
ملاحظة: تأكد من أن حجم كريات العلف المائي (2-3 مم) مناسب للأحداث ، مما يسهل الابتلاع والهضم.
- اضبط كمية العلف لتتوافق مع 2٪ من متوسط وزن جسم السمكة يوميا.
- قم بإطعام الأسماك يدويا مرتين يوميا - مرة في الصباح ومرة في فترة ما بعد الظهر (حدد وقتا محددا للحفاظ على روتين تغذية مستقر).
2. أخذ عينات الأسماك ، والقتل الرحيم ، والتشريح ، وجمع كلى الرأس
- تذوق الأسماك من الخزانات.
- اختر الأسماك بشكل عشوائي من الخزانات لتجنب تحيز أخذ العينات.
- استخدم شبكة لنقل الأسماك برفق إلى وعاء تخزين مؤقت مملوء بمياه الخزان.
ملاحظة: قلل من وقت المناولة لتقليل التوتر.
- تحضير محلول القتل الرحيم.
- استخدم حاوية مناسبة (على سبيل المثال ، دلو سعة 3 لتر) مناسبة لحمل الأسماك.
- قم بإذابة الكمية المناسبة من التريكايين (MS-222) في مياه البحر لتحقيق تركيز نهائي يتراوح بين 200 و300 ملغم/لتر18 (تنبيه انظر الجدول التكميلي 2 والملف التكميلي 1).
- قم بتخزين المحلول ببيكربونات الصوديوم إلى درجة حموضة 7.2-7.5.
- إدارة حل القتل الرحيم.
- ضع السمكة في محلول القتل الرحيم لمدة 10 دقائق على الأقل أو حتى يتم ملاحظة توقف الحركة الجراحية وفقدان ردود الفعل (تأكد من القتل الرحيم عن طريق التحقق من عدم الاستجابة للمنبهات الخارجية).
- سجل وزن جسم السمكة (جم) والطول الكلي (سم).
- إجراء تشريح الأسماك.
ملاحظة: لضمان جودة العينة المثلى وقابلية الخلية للحياة ، يجب إكمال عملية التشريح في أسرع وقت ممكن ، ويفضل في غضون 5 دقائق بعد القتل الرحيم.- تأكد من الحفاظ على درجة حرارة المختبر عند 19 درجة مئوية باستخدام تكييف الهواء لتقليل التقلبات أثناء أخذ العينات والمعالجة.
- قم بتعقيم أدوات التشريح (يفضل أدوات الأوتوكلاف المعدنية كلما أمكن ذلك) وقم بإعداد مساحة عمل نظيفة تحتوي على 70٪ من الإيثانول (تنبيه ، انظر الجدول التكميلي 2).
- ضع السمكة القتل الرحيم على جانبها على صينية تشريح معقمة مع توجيه الرأس نحو اليد غير المهيمنة.
- باستخدام مشرط ، قم بعمل شق دقيق على طول خط الوسط البطني للأسماك من فتحة التهوية (فتحة الشرج) باتجاه الخياشيم.
ملاحظة: كن حذرا من عدم القطع بعمق شديد لتجنب إتلاف الأعضاء الداخلية.
- استخدم مقص التشريح بعناية لتمديد الشق وفضح الأعضاء الداخلية. ارفع اللوحات الجانبية لجدار الجسم برفق لتوفير رؤية واضحة للتشريح الداخلي.
- تحديد موقع كلية الرأس: يتم وضع كلية الرأس خلف الخياشيم مباشرة ، بالقرب من المنطقة الظهرية الأمامية من تجويف الجسم ، وتمتد على طول الجانب العلوي من تجويف الجسم ، أسفل العمود الفقري.
ملاحظة: عادة ما تكون كلية الرأس أغمق في اللون مقارنة بالأنسجة المحيطة (الشكل 1).
- قم بإزالة أي أنسجة محيطة بعناية ، مثل الدهون والأنسجة الضامة ، لتصور كلية الرأس بشكل أفضل.
ملاحظة: تتطلب هذه الخطوة معالجة دقيقة لتجنب إتلاف كلية الرأس.
- باستخدام ملقط ومقص رفيع الرؤوس ، ارفع كلية الرأس بعناية وقم بعمل جروح دقيقة حولها لتحريرها من الأنسجة المحيطة.
ملاحظة: تعامل مع الأنسجة برفق لمنع التلف. في سمكة تزن حوالي 30 جراما ، من المتوقع أن تزن كلية الرأس حوالي 20-30 مجم.
- ضع العضو المستأصل على الفور في مصفاة خلية (شبكة نايلون 100 ميكرومتر) داخل طبق بتري معقم لضمان العقم ولتسهيل خطوات المعالجة اللاحقة.
ملاحظة: من هذه النقطة فصاعدا ، يجب تنفيذ جميع الخطوات في أسرع وقت ممكن (في غضون 5 دقائق) للحفاظ على بقاء الخلية. للحفاظ على برودة العينة ، قم بتنفيذ الخطوات التالية مع وضع طبق بتري على وعاء مملوء بالثلج ومغطى بورق الألمنيوم.

الشكل 1: موضع كلية الرأس: (أ) رسم توضيحي يصور الموقع النموذجي لكلية الرأس خلف الخياشيم وعلى طول المنطقة الظهرية الأمامية لتجويف الجسم ؛ (ب) صورة تمثيلية لكلية الرأس في الدنيس ، مع التأكيد على لونها الأغمق مقارنة بالأنسجة المحيطة. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
3. عزل كريات البيض في الكلى في الرأس (الشكل 2)

الشكل 2: وصف توضيحي لعزل الكريات البيض من كلية الرأس. يتضمن البروتوكول عدة خطوات: بدءا من تجانس الأنسجة ، متبوعا بالطرد المركزي المتدرج للكثافة ، وجمع حلقة الكريات البيض ، وغسل حلقة الكريات البيض ، والانتهاء بإعادة تعليق وتعديل تركيز الخلية. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- تجانس الأنسجة.
- ضع 2 مل من محلول الملح المتوازن من هانكس (HBSS) في طبق بتري معقم.
- تأكد من أن شبكة مصفاة الخلية (شبكة نايلون 100 ميكرومتر) على اتصال مع HBSS ولكنها غير مغمورة بالكامل.
- نقع كلية الرأس على مصفاة الخلية باستخدام مكبس المحقنة. استخدم ضغطا برفق لإجبار شظايا العضو على المرور عبر شبكة النايلون ، مما يؤدي إلى تعليق الخلية.
ملاحظة: في حالة معالجة عينات متعددة ، يمكن تخزين طبق بتري الذي يحتوي على تعليق الخلية في الثلاجة عند 4 درجات مئوية لبضع دقائق حتى الخطوة التالية. سيتم استخدام تعليق الخلية هذا لعزل الكريات البيض.
- إجراء الطرد المركزي المتدرج الكثافة.
- قم بإعداد محلول متوسط تدرج الكثافة بكثافة 1.077 جم / مل ، والأسمولية 353 mOsm / kg ، ودرجة الحموضة 7.4 (انظر الملف التكميلي 1).
ملاحظة: قد تختلف الأسمولية بين أنواع الأسماك المختلفة ، لذلك من الضروري ضبط الأسمولية لمحلول متوسط تدرج الكثافة لتلبية المتطلبات المحددة لكل نوع.
- في أنابيب البوليسترين المستديرة القاع سعة 5 مل ، أضف بعناية 600 ميكرولتر من محلول متوسط تدرج الكثافة.
- خذ معلق الخلية (2 مل) وأضفه ببطء إلى الأنبوب الذي يحتوي على وسط تدرج الكثافة. القطرة الأولى حاسمة - أضفها برفق شديد لتجنب زعزعة استقرار الطور المتوسط لتدرج الكثافة.
ملاحظة: يجب أن يتم ذلك بنسبة 3:10 (وسط تدرج الكثافة: تعليق الخلية). استخدم ماصة باستور معقمة سعة 1 مل لإضافة دقيقة ولطيفة. تأكد من أن طرف الماصة يلامس جانب الأنبوب لمنع إزعاج الطبقة المتوسطة المتدرجة للكثافة. تجنب خلط العينة مع وسط تدرج الكثافة.
- قم بالطرد المركزي للأنابيب عند 400 × جم لمدة 45 دقيقة عند 4 درجات مئوية مع إيقاف تشغيل الفرامل. هذا يضمن بقاء الطبقات سليمة أثناء العملية.
ملاحظة: بعد الطرد المركزي ، يجب أن تكون الطبقات المميزة مرئية. ستشكل الكريات البيض حلقة عند الواجهة بين وسط تدرج الكثافة وحبيبات الحطام الخلوي (الشكل 3).

الشكل 3: حلقة الكريات البيض عند الواجهة بين وسط تدرج الكثافة وحبيبات الحطام الخلوي. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- اجمع حلقة الكريات البيض.
- باستخدام ماصة باستور معقمة، قم بشفط حلقة الكريات البيض برفق (~ 100 ميكرولتر) ونقلها إلى أنبوب طرد مركزي دقيق سعة 2 مل.
ملاحظة: احرص على عدم إزعاج الطبقات بشكل كبير لتجنب التلوث. إذا بدا أن حلقة الكريات البيض تحتوي على حطام أو معلقات داكنة ، فمن المستحسن تمرير معلق الكريات البيض الذي تم جمعه عبر مصفاة خلية صغيرة جديدة (100 ميكرومتر) لضمان النقاء. ضع مصفاة الخلية الصغيرة فوق أنبوب الطرد المركزي الدقيق سعة 2 مل وانقل تعليق الكريات البيض برفق عبر المصفاة.
- اغسل حلقة الكريات البيض.
- أضف HBSS إلى أنابيب الطرد المركزي الدقيقة التي تحتوي على حلقة الكريات البيض حتى يصل الحجم إلى 2 مل وأعد تعليق الخلايا برفق.
ملاحظة: احتفظ بالأنابيب في وعاء مملوء بالثلج ومغطى بورق الألمنيوم للحفاظ على العينة عند درجة حرارة منخفضة. تأكد من أن الأنابيب لا تتلامس بشكل مباشر مع الجليد. حافظ على إعداد التبريد هذا طوال عملية الغسيل.
- الطرد المركزي للعينات عند 400 × جم لمدة 10 دقائق عند 4 درجات مئوية (يمكن تشغيل الفرامل).
- بعد الطرد المركزي ، تخلص من المادة الطافية بعناية ، واترك الحبيبات في الأسفل (والتي قد تكون غير مرئية تقريبا).
- كرر خطوات الغسيل (إضافة HBSS ، وإعادة التعليق ، والطرد المركزي ، والتخلص من المادة الطافية) حتى تصبح الحبيبات خالية من الشوائب.
- إعادة تعليق وضبط تركيز الخلية.
- أعد تعليق الخلايا في 1 مل من HBSS داخل نفس أنابيب الطرد المركزي الدقيقة سعة 2 مل المستخدمة في الغسيل.
- حقق تركيزا للخلية بين 1 × 104 و 1 × 106 خلايا لكل مل. إذا كانت الحبيبات الأولية كبيرة ، فقد تكون هناك حاجة إلى HBSS إضافي لتخفيف تركيز الخلية إلى النطاق المطلوب. انقل معلق الخلية إلى أنبوب سعة 15 مل وأضف المزيد من HBSS حسب الحاجة بناء على عدد الخلايا التي تم الحصول عليها.
ملاحظة: يوصى باستخدام عداد خلوي آلي لتسهيل العملية.
4. تلطيخ وتثبيت الكريات البيض (الشكل 4)
ملاحظة: توفر مجموعات بقع الخلايا الميتة القابلة للإصلاح LIVE / DEAD طريقة محسنة لتقييم صلاحية الخلية في الخلايا الثابتة باستخدام قياس التدفق الخلوي. تستخدم هذه المقايسات صبغة تفاعلية فلورية تتفاعل مع الأمينات الخلوية. إذا تعرضت أغشية الخلايا للخطر ، يمكن للصبغة أن تخترق الخلايا ، وتتفاعل مع الأمينات الحرة داخل الخلية وعلى سطح الخلية ، مما يؤدي إلى تلطيخ الفلورسنت الشديد. على العكس من ذلك ، في الخلايا القابلة للحياة ، تتوفر فقط الأمينات على سطح الخلية للتفاعل مع الصبغة ، مما يؤدي إلى تلطيخ خافت نسبيا. يتم الحفاظ على شدة التلوين بعد التثبيت بالفورمالديهايد ، والذي يحافظ أيضا على العينة عن طريق منع نمو الكائنات الحية الدقيقة. مجموعات بقع الخلايا الميتة القابلة للإصلاح LIVE / DEAD متطابقة باستثناء صبغة الفلورسنت - متوفرة باللون الأزرق أو البنفسجي أو المائي أو الأصفر أو الأخضر أو الأحمر أو الأحمر البعيد أو الأشعة تحت الحمراء القريبة (الأشعة تحت الحمراء). في هذه الدراسة ، استخدمنا صبغة الفلورسنت التفاعلية Near-IR. بالإضافة إلى ذلك ، يسمح هذا الاختبار أحادي اللون باختبار المعلمات الأخرى بالتوازي في تجربة متعددة الألوان.
- تحضير الصبغة.
- أحضر الكواشف إلى درجة حرارة الغرفة (RT): اسمح لقارورة واحدة من الصبغة التفاعلية الفلورية وقارورة ثنائي ميثيل سلفوكسيد اللامائية (DMSO) للوصول إلى RT قبل إزالة الأغطية.
- أعد تكوين الصبغة: أضف 50 ميكرولتر من DMSO إلى القارورة التي تحتوي على الصبغة التفاعلية. تخلط جيدا وتأكدي من ذوبان الصبغة تماما.
- استخدم محلول الصبغة المعاد تكوينه في أسرع وقت ممكن ، ويفضل أن يكون ذلك في غضون ساعات قليلة.
ملاحظة: تشتمل كل مجموعة على خمس قوارير فردية من الصبغة التفاعلية ، مما يوفر مادة كافية لتلطيخ ما لا يقل عن 40 عينة من الخلية. ومع ذلك ، بعد إعادة التكوين ، يكون محلول DMSO للصبغة غير مستقر نسبيا ، خاصة عند تعرضه للرطوبة. يمكن تخزين أي أجزاء غير مستخدمة لمدة تصل إلى أسبوعين عند ≤-20 درجة مئوية ، محمية من الضوء والرطوبة.
- وصمة عار وإصلاح الخلايا.
ملاحظة: تشمل المخازن المؤقتة المناسبة لتلوين الخلايا محلول الملح المتوازن هانكس (HBSS) ، والمحلول الملحي المخزن بالفوسفات (PBS) ، و D-PBS (D-PBS) من Dulbecco ، طالما أنها لا تحتوي على بروتينات غريبة مثل ألبومين مصل الأبقار أو المصل. عند استخدام صبغة متفاعلة أمينية، تجنب مخازن ومحاليل تريس التي تحتوي على أزيد الصوديوم أو البروتين الدخيل لإعادة تعليق الخلايا وغسلها. في هذه الدراسة ، استخدمنا HBSS نظرا لتركيبته الأيونية المتوازنة ، مما يساعد على الحفاظ على التوازن التناضحي ويوفر الأيونات الأساسية والجلوكوز لدعم عملية التمثيل الغذائي للخلايا وقابليتها للحياة أثناء عملية التلوين. HBSS أيضا خالي من البروتينات الدخيلة ، مما يمنع التداخل مع الصبغة التفاعلية ويضمن تقييما دقيقا للبقاء.- بعد عد الخلايا وضبط الكثافة إلى 1 × 106 خلايا لكل مل باستخدام HBSS ، قم بنقل 1 مل من تعليق الخلية هذا إلى أنابيب طرد مركزي دقيقة سعة 2 مل.
- لكل يوم ، قم بتحفيز موت الخلايا في عينة واحدة على الأقل لاستخدامها كعنصر تحكم لتحديد عتبة شدة التألق بين الخلايا الحية والميتة. تحضير العينات في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة على النحو التالي:
الأنبوب 1: الخلايا الحية - غير ملوثة
الأنبوب 2: الخلايا الحية - ملطخة
الأنبوب 3: الخلايا الميتة - غير ملوثة
الأنبوب 4: الخلايا الميتة - ملطخة
ملاحظة: تحتاج هذه الأنابيب الأربعة فقط إلى التحضير لعينة واحدة في كل تجربة كعناصر تحكم. بالنسبة للعينات المتبقية ، هناك أنبوبان فقط ضروريان (الأنبوب 1: عينة - غير ملوثة والأنبوب 2: عينة - ملطخة) ، حيث سيوفر معلومات حول الخلايا التي كانت حية وتلك التي كانت ميتة.
- التحكم الإيجابي في موت الخلايا: ضع الأنبوب المسمى ميت غير ملطخ (الأنبوب 3) والملطخ الميت (الأنبوب 4) في حمام مائي عند 50 درجة مئوية لمدة 7 دقائق للحث على موت الخلايا عن طريق المعالجة الحرارية.
- تلطيخ الخلايا: أضف 1 ميكرولتر من الصبغة التفاعلية الفلورية المعاد تكوينها (من الخطوة 4.1.2) إلى 1 مل من تعليق الخلية في الأنبوبين 2 و 4 (الأنابيب التي سيتم تلطيخها) واخلطها جيدا.
- احتضن في RT لمدة 30 دقيقة ، محمية من الضوء.
ملاحظة: إذا لم يكن التثبيت مطلوبا، فيمكنك تخطي الخطوات 4.2.5-4.2.7 أدناه. بدلا من ذلك ، اغسل الخلايا مرتين ب 1 مل من HBSS مع 1٪ ألبومين مصل بقري (انظر الملف التكميلي 1) وأعد تعليقه في 1 مل من HBSS مع 1٪ زلال مصل البقري. إجراء التحليل على مقياس التدفق الخلوي في أسرع وقت ممكن ؛ خلاف ذلك ، قد تتعرض صلاحية الخلية للخطر لأن الخلايا غير ثابتة.
- اغسل الخلايا مرتين ب 1 مل من HBSS وأعد تعليق الخلايا في 900 ميكرولتر من HBSS.
- أضف 100 ميكرولتر من 37٪ فورمالديهايد (تنبيه ، انظر الجدول التكميلي 2).
- احتضن لمدة 15 دقيقة في RT.
- يغسل مرتين ب 1 مل من HBSS مع 1٪ ألبومين مصل بقري (BSA) ، ثم يعلق الخلايا في 1 مل من HBSS مع 1٪ BSA.
- قم بتخزين العينات في الثلاجة عند 4 درجات مئوية. تحليل الخلايا في غضون 1 شهر بعد التثبيت.
- قم بتحليل تعليق الخلية الثابتة عن طريق قياس التدفق الخلوي باستخدام قناة الإثارة والكشف المناسبة.
ملاحظة: قد تختلف قنوات الإثارة والكشف الصحيحة بناء على الأداة المستخدمة (انظر الجدول التكميلي 3).

الشكل 4: وصف توضيحي لتلوين وتثبيت الكريات البيض. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
5. قياس التدفق الخلوي
- الحصول على البيانات.
ملاحظة: قد تختلف الإجراءات التي يجب اتباعها على مقياس التدفق الخلوي اعتمادا على مقياس الخلوي المحدد المستخدم. في هذه الدراسة ، تم الحصول على البيانات باستخدام مقياس التدفق الخلوي Attune NTx.- تشغيل العينات.
- ضع أنبوب العينة في منفذ العينة.
- ابدأ الاستحواذ بالضغط على ابدأ ثم انقر فوق تسجيل بمجرد استقرار معدل الحدث (الأحداث / الثانية).
- سجل ما لا يقل عن 10,000 حدث لكل عينة في بوابة المفردات لتحليل موثوق.
- احفظ جميع البيانات لكل عينة وقم بنسخها احتياطيا على محركات أقراص خارجية أو تخزين سحابي.
- تحليل البيانات.
ملاحظة: لتحليل قياس التدفق الخلوي ، تتوفر العديد من خيارات البرامج. في هذه الدراسة ، تم إجراء تحليل البيانات باستخدام FlowJo v10.8.119.- تحميل ملفات البيانات: قم بتشغيل برنامج تحليل قياس التدفق الخلوي وقم بتحميل ملفات .fcs المكتسبة من التجربة.
- تصور البيانات (الشكل 5 أ): رسم التشتت الأمامي (FSC-A) (XX) مقابل الانتثار الجانبي (SSC-A) (YY) لتقييم حجم الخلية وحدبتها.
ملاحظة: تستخدم هذه المؤامرة بشكل شائع لتحديد مجموعات الخلايا واستبعاد الحطام بناء على خصائص التشتت.
- استبعاد بوابات الخلية المفردة والمضاعفات (الشكل 5 ب): استخدم مخطط منطقة التشتت الأمامي (FSC-A) مقابل ارتفاع التشتت الأمامي (FSC-H) لاستبعاد المضاعفات. ارسم بوابة لتضمين جميع الأحداث المحاذاة في الرسم البياني (الخلايا المفردة) واستبعاد الأحداث غير المحاذاة (المتعددات). إذا كانت العينة تحتوي على أحداث ذات FSC منخفض جدا ، فاستبعدها بعدم تضمينها في بوابة الخلية الفردية ، مع الإبقاء على الخلايا المفردة فقط.
- تحديد مجموعات الكريات البيض (الشكل 5 ج): قم بتمييز 3 مجموعات من الكريات البيض بناء على ملف تعريف FSC-A / SSC-A: FSC-AHIGH / SSC-Aهي الخلايا الحبيبية ،ومتوسط FSC-A / SSC-A هو الخلايا الوحيدة و FSC-Aمنخفضة / SSC-Aمنخفضة هي الخلايا الليمفاوية.
- بوابة الجدوى (الشكل 5 د): قم بإعداد عتبة تلطيخ صبغة الجدوى على قناة التألق المقابلة (NIR ، RL3-A). يتم تعريف الخلايا الحية مقابل الخلايا الميتة بناء على شدة التلوين باستخدام صبغة الخلايا الميتة القابلة للإصلاح الحية / الميتة: يتم تعريف الخلايا الملطخة الخافتة على أنها الخلايا الحية ، ويتم تعريف الخلايا الملطخة بشدة على أنها خلايا ميتة.
- الإحصاءات السكانية: انظر إلى الإحصائيات التي يوفرها البرنامج ، بما في ذلك إجمالي الأحداث (الخلايا) في كل بوابة والنسب المئوية للخلايا الإجمالية والمسورة.
- تصدير البيانات: قم بتصدير البيانات إلى جدول بيانات واستخدم البرامج الإحصائية المناسبة (GraphPad Prism أو R) لمزيد من التحليل الإحصائي.
ملاحظة: يعتمد اختيار طرق التحليل على أهداف البحث.

الشكل 5: استراتيجية بوابات قياس التدفق الخلوي لتقييم الجدوى في خلايا الكلى الرئيسية: (أ) يمثل ملف تعريف FSC-A / SSC-A لجميع الأحداث التي تم جمعها. (ب) يمثل استبعاد المضاعفات بناء على تعريف منطقة المفردات على أساس الخطية على الرسم البياني للتبعثر الأمامي (FSC-A)/الانتثار الأمامي (FSC-H). (ج) يمثل المجموعات السكانية الرئيسية الثلاثة التي تم تعريفها على أساس FSC-A/SSC-A، بعد استبعاد المضاعفات. (د) يمثل رسما بيانيا يوضح تلطيخ صبغة البقاء الحية / الميتة. لإعداد العتبة التي تسمح بالتمييز بين الخلايا الحية والميتة ، تم إخضاع الكريات البيض لصدمة حرارية خفيفة (50 درجة مئوية ، 7 دقائق) ثم تلطيخها بصبغة البقاء. الخلايا عالية الشدة الموجبة (++) هي الخلايا الميتة ، والخلايا الموجبة منخفضة التلوين (+-) هي الخلايا الحية. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.