$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
الأساس المنطقي لتصميم جهاز الموائع الدقيقة
استرشد تصميم جهاز الموائع الدقيقة في هذه الدراسة بالعديد من الميزات الرئيسية (الشكل 2) ، والتي تبني وتحسن التصميم التقليدي لخلية التدفق البسيطة. وتجدر الإشارة إلى أن جهاز الموائع الدقيقة له حجم داخلي يبلغ ~ 160 نانولتر ، وهو أصغر بكثير من حجم ~ 10 ميكرولتر لخلايا التدفق التقليدية47 ، مما يسمح باستخدام أكثر تحكما للكواشف التي يحتمل أن تكون ثمينة ، مثل مكونات البروتين المنقى. نظرا لأن وحدة التحكم في تدفق الموائع الدقيقة تحتوي على قناتين تنظيميتين ، فقد تم تطوير الجهاز على افتراض أن منفذي مدخل / مخرج فقط سيكون لهما التحكم في الضغط في أي وقت. يمكن تنفيذ المزيد من القنوات التي يتم التحكم فيها بالضغط ، إذا رغبت في ذلك.

الشكل 2: تخطيطي لتصميم جهاز الموائع الدقيقة. العلامات المستطيلة على المحيط هي للمساعدة البصرية في رؤية محيط القنوات. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
تعمل غرفة الجهاز المركزية المستطيلة كمنطقة تصوير رئيسية حيث يتم توصيل بذور الأنابيب الدقيقة ، ويتم بلمرة امتدادات الأنابيب الدقيقة من هذه البذور. تتقاطع الغرفة بواسطة قناة تدفق على كل جانب ، مع قنوات مستقيمة على طول المحور x تعمل كمدخل ومخرج لتسهيل التبادل السريع لمحلول التفاعل. تستخدم قناة مدخل الأنابيب الدقيقة أيضا لإدخال بذور الأنابيب الدقيقة في الغرفة ، مع التدفق الرقائقي مما يؤدي إلى ارتباط البذور بالسطح الزجاجي على طول اتجاه التدفق. في الاتجاه العمودي (المحور y) ، تتفرع قنوات التدفق إلى قنوات أصغر باتجاه الغرفة ، على غرار بعض التصميمات السابقة25،28،36،39. الهندسة المتفرعة مناسبة بشكل خاص لدراسة الخواص الميكانيكية للأنابيب الدقيقة. يسمح تدفق المحلول إلى الغرفة المركزية من اتجاه عمودي على اتجاه بذور الأنابيب الدقيقة بقوى الانحناء الناجمة عن التدفق بزوايا شبه طبيعية. علاوة على ذلك ، فإن إدراج هندسة متفرعة مع العديد من قنوات التدفق الأصغر يسهل تطبيق قوة أكثر تجانسا على مساحة واسعة من الغرفة المركزية ، وهو ما لا يتحقق من خلال هندسة تدفق بسيطة أحادية القناة. بهذه الطريقة ، يمكن للفكرة المتفرعة ، على الرغم من أنها تبدو أكثر تعقيدا ، أن تقلل من التعقيد الكلي في تحديد القوة المنقولة إلى الأنابيب الدقيقة (الشكل 3). يتميز هذا التصميم أيضا بخطوط متعددة من التماثل ، مما يسمح بسهولة الاستخدام وفرصة تقييم الانحناء من عدة اتجاهات (على سبيل المثال ، أعلى مقابل أسفل).

الشكل 3: ينتج عن إدراج شكل متفرع مساحة كبيرة من التدفق المماثل. محاكاة لتصميمين للجهاز في ظل تدفق الحالة المستقرة: أحدهما بدون قنوات متفرعة (A) والآخر بقنوات متفرعة (B). تشير الأسهم إلى اتجاه التدفق المحلي وتتناسب مع حجم التدفق. يشير تلوين السطح إلى سرعة خط الوسط. تظهر الصور الموجودة على اليمين قسما مكبرا من الجهاز حيث تخضع الأنابيب الدقيقة (غير المعروضة) الموجهة على طول المحور x لقوى الانحناء من سائل يتدفق في المنفذ العلوي وخارج المنفذ السفلي. يؤدي دمج القنوات المتفرعة إلى زيادة المساحة النسبية الخاضعة لحقول السرعة المماثلة مع عدم زيادة حجم الكاشف المطلوب. تم تعديل هذا الرقم بإذن من روجرز (2022)14. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
والجدير بالذكر أن الجهاز ينفذ أيضا سلسلة من مصائد الفقاعات في قنوات تدفق المدخل والمخرج لمنع فقاعات الهواء من دخول غرفة التصوير المركزية. على وجه التحديد ، اخترنا تضمين مصفوفات من الركائز الدقيقة داخل مسار التدفق من أجل منع فقاعات الهواء من السفر إلى الماضي بسبب التوتر السطحي (الشكل 2) 46. علاوة على ذلك ، لمنع احتباس الهواء ، قمنا بتصميم الحواف داخل الجهاز كمنحنيات ناعمة ، بدلا من وجود زوايا مائلة. مجتمعة ، تقلل ميزات التصميم هذه من احتمالية حدوث فقاعات هواء وتزيد من متانة الجهاز.
تصنيع جهاز الموائع الدقيقة
يتطلب تحديد المعلمات المناسبة لإنشاء الجهاز الرئيسي بعض التحسين. كما لوحظ سابقا ، فإن مقاومة الضوء هذه حساسة للغاية لمعلمات التشغيل الرئيسية مثل الإضاءة المحيطة ومعدلات التسخين والتبريد أثناء خطوات الطباعة الحجريةالضوئية 50. على سبيل المثال ، إذا تم تبريد السيد بسرعة كبيرة بعد التسخين ، فقد تتطور الشقوق الحرارية في مقاومة الضوء. هذا أمر غير مرغوب فيه ، لأن الشقوق يمكن أن تضر بسلامة القناة. بينما يمكن حل الشقوق عن طريق إعادة تسخين المقاومة إلى درجة حرارة قريبة من درجة الحرارة الانتقالية (~ 115 درجة مئوية) ، وجدنا أن السماح للسيد بالتبريد بشكل محيط على اللوح الساخن كان أقوى طريقة لمنع التشقق. علاوة على ذلك ، يمكن أن يؤدي الضوء المحيط الزائد إلى التعرض غير المقصود لمقاومة الضوء ، مما يضعف المقاومة ويؤدي إلى تعرض ميزات الجهاز نفسها (التي يجب أن تظل على الرقاقة بعد التطوير) لتجريد جزئي أثناء خطوة التطوير. لهذا السبب ، نشجع خطوة التطوير التي يجب تنفيذها في اليوم التالي لخطوات الخبز بعد التعرض والتبريد المحيط طوال الليل. علاوة على ذلك ، عندما لا يكون الجهاز الرئيسي قيد الاستخدام ، نوصي بتخزينه في مكان مظلم أو ملفوف بورق الألمنيوم لمنع التدهور بمرور الوقت. بمجرد تحديد هذه المعلمات ، كانت عملية الطباعة الحجرية الضوئية قابلة للتكرار بدرجة كبيرة (الشكل 4).
بعد إنشاء السيد، تم صب نظام إدارة البرمجيات السائلة فوق السيد، مما سمح ل PDMS بمعالجة وإنشاء بصمة سلبية لميزات السيد. وجدنا أن صب PDMS بسمك 2-3 مم سمح بسهولة التلاعب بالأجهزة ؛ في المقابل ، إذا كان الطلاء بالدوران لتحقيق سمك في نطاق ميكرومتر ، فإن PDMS كان عرضة للتمزق أو الالتصاق بنفسه ، مما يجعل التلاعب صعبا. علاوة على ذلك ، تسمح طبقة PDMS السميكة بتوصيل أسهل للأنبوب ، حيث سيبقى الأنبوب في منافذ المدخل / المخرج دون الحاجة إلى مادة مانعة للتسرب أو مشبك.
أخيرا ، في حين أن فحوصات خلايا التدفق التقليدية لهذه التطبيقات البيولوجية غالبا ما تستخدم أغطية زجاجية تم تنظيفها مسبقا باستخدام محلول سمكة الضاري المفترسة (بيروكسيد الهيدروجين وحمض الكبريتيك) ثم السيلان ، وجدنا أن الأغطية المعالجة بتنظيف البلازما الممتدة وغسل IPA كانت مناسبة لأغراضنا47. قد تتطلب التطبيقات الأخرى ، مثل التصوير أحادي الجزيء ، معالجة زجاجية أكثر شمولا.

الشكل 4: عملية الطباعة الحجرية الضوئية. (أ) القناع بالتصميم المطلوب (قناع مصنوع من الكروم محفور على الزجاج). (ب) تكسير طفيف في مقاومة الضوء على رقاقة السيليكون بسبب الإجهاد الحراري (تسلط الأسهم الضوء على بعض الشقوق). غالبا ما تمتد هذه الشقوق عبر الرقاقة بأكملها. (ج) السيد المتطور. (د) إعداد الموائع الدقيقة على المجهر. يتم تصنيف المكونات الفردية باللون الأخضر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
نمو الأنابيب الدقيقة والاستقرار والانحناء
تعمل بذور الأنابيب الدقيقة المزروعة في GMPCPP كمواقع تنوي لملحقات الأنابيب الدقيقة للبلمرة وهي نفسها مستقرة ضد إزالة البلمرة لعدة ساعات في درجة حرارة الغرفة. تم ربط البذور بالغطاء الزجاجي في قناة الموائع الدقيقة باستخدام جسم مضاد مضاد للرودامين47. ثم نمت امتدادات الأنابيب الدقيقة الديناميكية في وجود التوبولين القابل للذوبان (المسمى بالفلورسنت ولكن ليس مترافقا بالرودامين) و GTP. وبهذه الطريقة ، تم إرفاق مواقع تنوي البذور بالغطاء الزجاجي ، لكن الامتدادات لم تكن كذلك. خلال فترة نمو التمديد التي استمرت 15 دقيقة ، تم بلمرة امتدادات الأنابيب الدقيقة وإزالة البلمرة بشكل عشوائي ، كما هو متوقع بسبب عدم استقرارها الديناميكي الجوهري49. بعد فترة النمو هذه ، تم إجراء غسل 10 ميكرومتر من Taxol للتخلص من أي توبولين متبقي من المحلول وتثبيت امتدادات الأنابيب الدقيقة التي تشكلت. التثبيت هو المفتاح ، حيث أن امتدادات الأنابيب الدقيقة ستتفكك عند استنفاد الأنبوبولين. بالإضافة إلى ربط وتثبيت بوليمر الأنابيب الدقيقة ، ثبت أيضا أن Taxol يؤثر على ميكانيكا بوليمر الأنابيب الدقيقة وقد يؤدي إلى انحناء في امتدادات الأنابيب الدقيقة الخطية51،52،53،54. عكست النتائج المعروضة هنا هذه الملاحظات. ومع ذلك ، فإن تجعيد امتدادات الأنابيب الدقيقة أمر غير مرغوب فيه ، حيث ينتج عن ذلك قوى غير متساوية يتم نقلها على طول الشبكة أثناء الانحناء. لذلك ، تم استخدام الأنابيب الدقيقة فقط التي بقيت مستقيمة نسبيا بعد التثبيت لتحليل الانحناء. بدلا من ذلك ، بعد فترة النمو الأولية ، يمكن استخدام فترة نمو ثانوية بمحلول من التوبولين و GMPCPP (على عكس GTP الأولي) لإنشاء "أغطية" مستقرة على الأطراف المتنامية لشبكة الأنابيب الدقيقة ومنع إزالة البلمرة55.
ثم تم ثني الأنابيب الدقيقة عن طريق التدفق في المحلول العازل باستخدام نظام التحكم في الضغط للحفاظ على ضغط ثابت في المنبع (الشكل 5 ، الفيديو التكميلي 1). بهذه الطريقة ، يمكننا تقريب التدفق المحلي الذي تشهده الأنابيب الدقيقة. من خلال تدفق السائل من أعلى وخارج منفذ الجهاز السفلي ، كان من المفترض أن يكون اتجاه التدفق عموديا على اتجاه البذر.

الشكل 5: يمكن استخدام إعداد الموائع الدقيقة لثني الأنابيب الدقيقة المستقرة. يتم ثني الأنابيب الدقيقة في حالة الراحة بعد الاستقرار باستخدام باكليتاكسيل أثناء التدفق النابض. يؤدي الضغط الثابت في المنبع البالغ 30 ملي بار إلى التدفق (يشير السهم إلى اتجاه التدفق). الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
تحديد ملف تعريف التدفق في جهاز الموائع الدقيقة
يمكن محاكاة سرعة الخط المركزي في الموائع الدقيقة حسابيا باستخدام برنامج COMSOL (برنامج المحاكاة ، الشكل 6 أ). ومع ذلك ، يتم توصيل الأنابيب الدقيقة بالغطاء الزجاجي للفحص المجهري TIRF في حدود ~ 100 نانومتر من السطح. لذلك ، فإن السرعة التي تتعرض لها الأنابيب الدقيقة ليست هي نفسها التي تم التنبؤ بها في المحاكاة ثنائية الأبعاد. لتقريب التدفق المحلي الذي تشهده الأنابيب الدقيقة ، استخدمنا معادلة Navier-Stokes العامة لتدفق السوائل غير القابل للانضغاط في بعد واحد:

هنا ، z هو ارتفاع الأنابيب الدقيقة في الجهاز ، h هو الارتفاع الكلي للجهاز ، و vc هي سرعة خط الوسط في الجهاز. بحكم تعريف النظام ، فإن z-origin هو مركز الجهاز (الشكل 6 ب). باستخدام هذا التعريف وارتفاع القناة البالغ 13 ميكرومتر ، يتم تقريب ارتفاع الأنابيب الدقيقة على أنه z = -6.4 ميكرومتر. ينتج عن حل هذه المعادلة تقدير لسرعة السائل المحلية التي تتعرض لها الأنابيب الدقيقة:


الشكل 6: تحديد نظام تحليل تدفق السوائل للسائل الذي يدخل الجهاز في المنفذ العلوي ويخرج من المنفذ السفلي (المنافذ غير معروضة). (أ) محاكاة مجال سرعة خط الوسط المتدرج كما في الشكل 3 ب. تشير النجمة إلى مجال اهتمام اللوحة B. (B) التمثيل المقطعي للجهاز. يوجد ملف تعريف تدفق السوائل المطور بالكامل في الاتجاه y مع سرعة خط الوسط vc عند z = 0 وحالة حدود عدم الانزلاق عند الجدران. لاحظ أن الأسهم الموجودة في هذه اللوحة لا يجب قياسها فيما يتعلق بمجال السرعة الفعلي الموضح في اللوحة A. تم تعديل هذا الرقم بإذن من روجرز (2022)14. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
بالإضافة إلى عمليات المحاكاة ، يمكن التحكم في سرعة السوائل باستخدام وحدة تحكم في التدفق تعتمد على معدل التدفق الحجمي بدلا من الحفاظ على الضغط. علاوة على ذلك ، يمكن تحديد معدل التدفق المحلي في كل جهاز بشكل مباشر من خلال تضمين حبات الفلورسنت ومراقبة سرعتها ، وبالتالي التخفيف من أي تباين من عينة إلى عينة.
النمذجة الحسابية والعروض التوضيحية المتدرجة
أخيرا ، أجرينا عمليات محاكاة حسابية مع التجارب لإثبات جدوى استخدام هذا الجهاز للتجارب عالية الإنتاجية. إلى جانب القدرة على ثني الأنابيب الدقيقة في اتجاهات متعددة بفضل تناظر الجهاز ، أظهرت عمليات المحاكاة أن الجهاز يمكنه الحفاظ على تدرجات دقيقة ، مما يتيح التحقيق المتزامن للظروف التجريبية المتعددة (الشكل 7 أ). أظهرت التجارب الأولية (الطرق التي لم يتم ذكرها صراحة كجزء من هذا المنشور) باستخدام صبغة الفلورسنت في المحلول الاتساق مع التنبؤات الحسابية (الشكل 7 ب). علاوة على ذلك ، أظهرنا بنجاح تقسيم البروتينات المختلفة في مناطق مختلفة من الجهاز عن طريق زيادة امتدادات الأنابيب الدقيقة في وقت واحد مع ملصقات فلورية مختلفة (الشكل 8). على حد علمنا ، هذا هو أول تطبيق للموائع الدقيقة عالية الإنتاجية على تحقيقات الأنابيب الدقيقة. يمكن استخدام هذه الميزة لهذا الجهاز لتقليل وقت وكميات الكواشف المطلوبة مع تحسين المتانة التجريبية أيضا. على سبيل المثال ، يمكن التحقيق في تأثيرات البروتينات المختلفة أو التركيزات المميزة للبروتينات الفردية على ميكانيكا وديناميكيات الأنابيب الدقيقة في وقت واحد في جهاز واحد.

الشكل 7: تكوين التدرج. (أ) محاكاة تدرج من محلولين يدخلان الجهاز بنفس ضغط المدخل (50 ملي بار) والتركيز (15 ميكرومتر). يشار إلى منافذ المدخل لكل حل بأسهم ملونة (حل واحد في المنفذ العلوي وحل آخر في المنفذ الأيمن) ، ويعمل المنفذان المتبقيان كمنافذ. تظهر خريطة التمثيل اللوني ملف تعريف تركيز المحلول العلوي. تم تحقيق الحالة المستقرة عند t = 5 s. (ب) توليد تجريبي لتدرج مماثل باستخدام صبغة الفلورسنت في المحلول في المنفذ العلوي والمخزن المؤقت في المنفذ الأيمن. الصورة عبارة عن طبقة نقطية تم إنشاؤها عن طريق خياطة كل مجال رؤية (80 ميكرومتر × 80 ميكرومتر) لحل منطقة الجهاز بأكملها. تم تعديل هذا الرقم بإذن من روجرز (2022)14. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 8: إظهار تدرج البروتين في جهاز الموائع الدقيقة. تم نقل التوبولين المسمى AlexaFluor647 (أرجواني) في المدخل 1 ، وتم نقل التوبولين المسمى AlexaFluor488 (الأخضر) في المدخل 2 من الجهاز بتركيزات ومعدلات تدفق متساوية. تم تأرجح التدفق على / إيقاف تشغيله بزيادات 90 ثانية للسماح ببلمرة التوبولين من بذور GMPCPP المستقرة (الحمراء) مع تثبيط الخلط. (أ) طبقة نقطية واسعة النطاق مصنوعة من خياطة مجالات الرؤية (80 × 80 ميكرومتر) لحل طول الجهاز بالكامل. تحدد الرسائل الموقع النسبي لمجالات الرؤية الفردية في اللوحات اللاحقة. شريط المقياس هو 50 ميكرومتر في الموضع X و Y. (ب) مجال الرؤية بالقرب من المدخل 1 للجهاز ، حيث تتكون الامتدادات في الغالب من الأنابيب المسماة A647. (ج) مجال الرؤية بالقرب من منتصف الجهاز ، حيث تتكون الامتدادات من خليط من الأنابيب المصنفة ، كما هو متوقع. (د) مجال الرؤية بالقرب من الجزء السفلي من الجهاز ، حيث تتكون الامتدادات في الغالب من الأنابيب المسماة A488. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
يظهر مخطط تدفق العملية (PFD) للإعداد التجريبي للموائع الدقيقة على المجهر في الشكل التكميلي 1.
الشكل التكميلي 1: مخطط تدفق العملية (PFD) للإعداد التجريبي للموائع الدقيقة على المجهر. الرجاء النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
فيديو تكميلي 1. يمكن استخدام إعداد الموائع الدقيقة لثني الأنابيب الدقيقة المستقرة. يتم ثني الأنابيب الدقيقة في حالة الراحة بعد الاستقرار باستخدام باكليتاكسيل أثناء التدفق النابض. ضغط ثابت في المنبع يبلغ 30 ملي بار يقود التدفق. معدل تشغيل الفيديو 10 إطارات في الثانية. الرجاء النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
الملف التكميلي 1: ملف CAD لتصميم قناع الموائع الدقيقة. الرجاء النقر هنا لتنزيل هذا الملف.