هنا ، نقدم بروتوكولا يوضح مقايسة التدفق الجانبي لتضخيم الحمض النووي الريبي ونقيم فعاليته للكشف السريع عن النيسرية البنية والكلاميديا الحثرية واليوريابلازما والواقعي.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
هنا ، نقدم بروتوكولا يوضح مقايسة التدفق الجانبي لتضخيم الحمض النووي الريبي ونقيم فعاليته للكشف السريع عن النيسرية البنية والكلاميديا الحثرية واليوريابلازما والواقعي.
النيسرية البنية (NG) والكلاميديا الحثرية (CT) و Ureaplasma urealyticum (UU) هي مسببات الأمراض الشائعة المرتبطة بالأمراض المنقولة جنسيا (STDs). NG هو العامل المسبب للسيلان ، والذي يمكن أن يؤدي إلى اضطرابات مختلفة في الجهاز البولي التناسلي ، بما في ذلك التهاب البربخ والتهاب البروستاتا والتهاب عنق الرحم والعقم. التصوير المقطعي المحوسب هو كائن حي دقيق مسؤول عن التهاب الإحليل غير المكورات البنية ومرض التهاب الحوض. يرتبط UU بالتهاب الإحليل غير المكورات البنية والتهاب عنق الرحم والتهاب البروستاتا والعقم. غالبا ما تكون التقنيات الجزيئية الحالية لتحليل NG و CT و UU معقدة وتستغرق وقتا طويلا. قد يسهل الاختبار الجزيئي السريع لهذه مسببات الأمراض التشخيص المبكر للأمراض المنقولة جنسيا. مقايسة التدفق الجانبي لتضخيم الحمض النووي الريبي (RGT) هي طريقة لا تتطلب استخراج الحمض النووي. في هذه العملية ، يتم تحلل العينات لإطلاق شظايا الحمض النووي ، والتي يتم تضخيمها بعد ذلك من خلال النسخ العكسي والنسخ. يتم التعرف على منتج الحمض النووي الريبي المضخم والتقاطه بواسطة مجسات محددة ، مما يشكل مركبا مسبارا ذهبيا للكشف عن الحمض النووي الريبي يمكن تثبيته على غشاء النيتروسليلوز عبر التدفق الجانبي لإنتاج نطاقات مرئية. يستغرق الإجراء بأكمله أقل من 1 ساعة. كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم فعالية RGT للكشف السريع عن NG و CT و UU. تم تضمين ما مجموعه 1,416 عينة. كان اتساق NG و CT و UU عند تحليله بواسطة RGT مقارنة بطريقة التحقيق الفلوري لتفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) 99.03٪ (307/310) و 99.38٪ (159/160) و 99.02٪ (303/306) ، على التوالي. كان اتساق NG و CT و UU عند تحليلها بواسطة RGT مقارنة بالتسلسل الجيني 99.17٪ (238/240) و 98.95٪ (188/190) و 98.30٪ (173/176) ، على التوالي. بالمقارنة مع طريقة ثقافة عزل مسببات الأمراض ، كانت معدلات الكشف عن فحوصات NG و CT و UU 100.00٪ (9/9 ، 17/17 ، 8/8). تجعل الحساسية العالية والخصوصية وسهولة الاستخدام ومتطلبات الوقت المنخفضة هذا الاختبار مثاليا للكشف السريع والدقيق عن NG و CT و UU.
تمثل الأمراض المنقولة جنسيا تحديات عالمية كبيرة في مجال الصحة العمومية، مما يؤدي إلى اعتلال ووفيات خطيرة في الأعضاء التناسليةوالإنجابية1. النيسرية البنية (NG) هي العامل المسبب لمرض السيلان ، حيث يتم الإبلاغ عن حوالي 87 مليون حالة جديدة سنويا في جميع أنحاءالعالم 2. يؤدي هذا العامل الممرض في المقام الأول إلى حدوث التهاب عن طريق غزو الظهارة العمودية للجهاز البوليالتناسلي 3. الكلاميديا الحثرية (CT) ، وهي كائن حي دقيق آخر ، مسؤولة عن التهاب الإحليل غير المكورات البنية والتهابات الحوض ، حيث تمثل حوالي 130 مليون حالة جديدة كل عام4. يوريابلازما يوريتيكوم ، أبسط وأصغر خلية ذاتية التكاثر، تغزو بسهولة أنسجة عنق الرحم التالفة وترتبط بالتهاب الإحليل غير المكورات البندي والتهاب عنق الرحم والتهاب البروستاتا والعقم5. غالبا ما تكون كل هذه العدوى بدون أعراض في كل من المرضى من الإناث والذكور ، ومع ذلك يمكن أن تؤدي إلى مضاعفات خطيرة إذا لم يتم علاجها على الفور. يمكن أن تؤدي عدوى الأمهات إلى نتائج حمل ضارة خطيرة ، بما في ذلك ولادة جنين ميت والإجهاض والولادة المبتسرة والعدوى المباشرة للجنين6. لذلك ، فإن تطوير طريقة سريعة وحساسة ومحددة وسهلة الاستخدام للكشف عن مسببات الأمراض له أهمية قصوى.
يعد الكشف السريع والدقيق لمسببات الأمراض أمرا بالغ الأهمية لتشخيص الأمراض وإدارتها بشكل فعال. وأساليب الاستزراع التقليدية، التي تتطلب عزل مسببات الأمراض وثقافتها وتحديدها، لها عيوب كبيرة، بما في ذلك كونها تستغرق وقتا طويلا وذات حساسية منخفضة. على الرغم من أن التسلسل الجيني يتميز بمعدل دقة عال ، إلا أنه يتطلب بيئة ومعدات معقدة ، مما يجعله مكلفا ويستغرق وقتا طويلا أيضا. تم قبول التقنيات الجزيئية التقليدية لتحليل NG و CT و UU على نطاق واسع. ومع ذلك ، غالبا ما تكون هذه الأساليب معقدة وتستغرق وقتا طويلا ، وتتطلب أجهزة متطورة وفنيين مدربين وأوقات معالجة ممتدة. لذلك ، هناك حاجة ملحة لطريقة تشخيص جزيئية بسيطة وموثوقة لمعالجة قيود الأساليب التقليدية. يوفر مقايسة التدفق الجانبي لتضخيم الحمض النووي الريبي (RGT) بديلا سريعا وحساسا ومحددا دون الحاجة إلى إجراءات معقدة7،8. في هذه الطريقة ، يتم تحلل العينات مباشرة لإطلاق شظايا الحمض النووي دون استخراج الحمض النووي ، ويتم تضخيم هذه الأجزاء من خلال النسخ العكسي والنسخ. ثم يتم التعرف على منتج الحمض النووي الريبي المضخم والتقاطه بواسطة مجسات محددة ، مما يشكل مركبا مسبارا ذهبيا للكشف عن الحمض النووي الريبي ، والذي يمكن تثبيته على غشاء النيتروسليلوز عبر التدفق الجانبي لإنشاء نطاقاتمرئية 9. تستغرق العملية برمتها أقل من 1 ساعة ، مما يجعلها مناسبة للغاية للاختبارات المعملية في حالات الطوارئ.
في هذه الدراسة ، قمنا بتجنيد 1,416 عينة لتقييم استخدام RGT للكشف عن NG و CT و UU. تم تحليل العينات باستخدام RGT ، وفحص مضان تفاعل البوليميراز المتسلسل ، والتسلسل الجيني ، وطرق زراعة عزل مسببات الأمراض. أشارت النتائج إلى أن طريقة RGT كانت دقيقة ومتسقة مع طرق التشخيص التقليدية. في الختام ، فإن الحساسية العالية والخصوصية وسهولة الاستخدام ومتطلبات الوقت المنخفضة تجعل هذا الاختبار مثاليا للكشف السريع والدقيق عن NG و CT و UU ، مما يشير إلى تطبيقه الواعد في التشخيص الطبي الأولي للأمراض المنقولة جنسيا.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
أجريت هذه الدراسة وفقا للمبادئ التوجيهية الأخلاقية والموافقة الممنوحة من قبل مجلس المراجعة المؤسسية لمستشفى الشعب الأول في فوشان بمقاطعة قوانغدونغ بالصين (وثيقة المراجعة الأخلاقية رقم 10). LR (2025) 136). تم جمع ما مجموعه 1,416 عينة من مسحات الأعضاء التناسلية (716 من المرضى الإناث ، 700 من المرضى الذكور) من الأفراد المشتبه سريريا في إصابتهم بالأمراض المنقولة جنسيا والذين لم يخضعوا للعلاج بالمضادات الحيوية خلال ال 14 يوما السابقة (الجدول التكميلي 1). لكل مشارك ، تم الحصول على مسحات مقترنة في وقت واحد وتحليلها بالتوازي: أحدهما بطريقة الاختبار (RGT) والآخر بالطريقة المرجعية (فحص مضان PCR ، والتسلسل الجيني ، وثقافة عزل مسببات الأمراض ، على التوالي). تم تحديد الاتفاق بين الأساليب باستخدام معامل كابا كوهين (κ) ، مع التفسير الموجه بمعايير لانديس وكوخ.
ملاحظة: يتبع بروتوكول الفحص ل CT و UU خطوات إجرائية مماثلة لتلك الموضحة ل NG ، مع التعديلات التي تقتصر على الكواشف الخاصة بمسببات الأمراض. يتم توفير تركيبات الكاشف التفصيلية في الخطوة 2.1 (الجدول التكميلي 2 ، الجدول التكميلي 3 ، والجدول التكميلي 4).
1. جمع العينات
2. التحضير
3. لبزيل الخلايا لاستخراج الحمض النووي الريبي
4. تضخيم الحمض النووي الريبي متساوي الحرارة
5. فحص التدفق الجانبي
6. تحليل النتائج
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
اتساق طرق الفحص الفلوري RGT و PCR
تم تحليل ما مجموعه 310 عينة من أجل NG ، تتكون من 161 أنثى و 149 ذكرا. وبلغت نسبة المصادفة الإيجابية 98.78٪ (مجال الموثوقية 95٪: 93.39٪-99.97٪)، بينما كانت نسبة المصادفة السلبية 99.12٪ (مجال الموثوقية 95٪: 96.87٪-99.89٪). كان معدل المصادفة الإجمالي 99.03٪ (مجال الموثوقية 95٪: 97.20٪ -99.80٪). كانت قيمة اتساق كابا 0.975 (فاصل الثقة 95٪: 0.947-1.003 ، Z = 17.171 ، ص < 0.05) (الجدول 1). كانت ه...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
في هذه الدراسة ، تم استخدام RGT للكشف عن مسببات الأمراض المنقولة بالاتصال الجنسي ، بما في ذلك NG و CT و UU. عند إجراؤه بموجب بروتوكولات تشغيلية صارمة ، أظهر اختبار RGT توافقا قويا مع طرق التشخيص المعمول بها مثل فحص مضان تفاعل البوليميراز المتسلسل ، والتسلسل الجيني ، وتقنيات ثقافة عزل مسببات الأمراض. كانت حساسية وخصوصية مقايسة RGT قابلة للمقارنة أو تجاوزت تلك الخاصة بالمنهجيات المبلغ عنها سابقا ، كما يتضح من التحليلات المقارنة مع المعايير المرجعيةالمعمول بها 10
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإفصاح عنه.
نشكر شركة Wuhan Zhongzhi Bio-technologies Inc. على الكواشف والإرشادات الفنية المقدمة لهذه الدراسة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 10٪ (وزن / حجم) تحضير هيبوكلوريت الصوديوم | في المختبر. | التحضير في المختبر. | محلول التبييض المخفف لإزالة التلوث وتعطيل مسببات الأمراض على المعدات أو الأسطح. |
| 75٪ (v / v) الإيثانول | Ante Food Co.، Ltd (آنهوي ، الصين) | http://www.antegroup.com/product_detail_cn/id/81.html | محلول الإيثانول المائي المستخدم لتطهير السطح |
| ماصة قابلة للتعديل الحجم (0.5 & ndash ؛ 10 و مو ؛ ل) | DLAB العلمية المحدودة | 7010101004 | ماصة دقيقة أحادية القناة للتعامل الدقيق مع أحجام مقياس الميكرولتر. |
| ماصة الحجم القابل للتعديل (100 – 1000 مو ؛ ل) | DLAB العلمية المحدودة | 7010101014 | ماصة أحادية القناة تمت معايرتها لمعالجة السوائل بكميات كبيرة. |
| ماصة الحجم القابل للتعديل (10 – 100 مو ؛ ل) | DLAB العلمية المحدودة | 7010101008 | ماصة أحادية القناة محسنة للأحجام المتوسطة، وتستخدم بشكل شائع في بروتوكولات البيولوجيا الجزيئية. |
| ماصة قابلة للتعديل الحجم (20 – 200 مو ؛ ل) | DLAB العلمية المحدودة | 7010101009 | ماصة أحادية القناة لعمليات النقل متوسطة الحجم، ومناسبة للتوزيع الدقيق للكواشف. |
| خزانة السلامة الحيوية (HF Safe-1200) | HealForce Bio-Meditech Holdings Limited (هونغ كونغ ، الصين) خزانة | HF Safe-1200 | A من الفئة الثانية تضمن حماية الأفراد والعينة والبيئة أثناء التعامل مع الكائنات الحية الدقيقة المسببة للأمراض أو مزارع الخلايا. |
| أنابيب الطرد المركزي | Haozhi Medical Devices Co.، Ltd. (قوانغتشو ، الصين) | رقم 20210414 ملف الأجهزة الطبية في قوانغتشو Yuexiu | لاستخراج الحمض النووي ، وتكوير الخلايا ، والإجراءات المختبرية الأخرى. |
| مقايسة الحمض النووي Chamydia trachomatis (CT) (مقايسة تضخيم الحمض النووي الريبي - مقايسة التدفق الجانبي) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC. (ووهان ، الصين) | A.10.309-STD-RG-002 | للكشف النوعي عن الحمض النووي الريبي للحمض النووي Chamydia trachomatis في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| CO2< / sub> حاضنة | Thermo Fisher Scientific (آشفيل ، الولايات المتحدة الأمريكية) LLC | SN: | تستخدم لزراعة الخلايا ، وتوفر بيئة مستقرة مع درجة حرارة يتم التحكم فيها (37 درجة ؛ ج) ، والرطوبة ، وتركيز ثاني أكسيد الكربون 2< / sub> (عادة 5٪) لضمان النمو الأمثل للخلايا. |
| لوحة الثقافة | كورنينج إنكوربوريتد (كورنينج ، الولايات المتحدة الأمريكية) | 50 مم & حاد ؛ 9 مم | لزراعة الخلايا الملتصقة وتوسعها. |
| مجموعة الكشف عن الحمض النووي إلى Chamydia trachomatis (CT) (PCR-Fluorescence Probing) Fosun | Diagnostics (شنغهاي ، الصين) المحدودة | شهادة تسجيل الأجهزة الطبية الصينية رقم 20143402234 | للكشف النوعي عن الحمض النووي لداء الحثرة الحثرية في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| مجموعة الكشف عن الحمض النووي إلى النيسرية البنية (NG) (PCR-Fluorescence Probing) Fosun | Diagnostics (شنغهاي ، الصين) المحدودة | شهادة تسجيل الأجهزة الطبية الصينية رقم 20173401080 | للكشف النوعي عن الحمض النووي للنيسرية البنية في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| مجموعة الكشف عن الحمض النووي إلى Ureaplasma Urealyticum (UU) (PCR-Fluorescence Probing) | Fosun Diagnostics (شنغهاي ، الصين) المحدودة | شهادة تسجيل الأجهزة الطبية الصينية رقم 20173400536 | للكشف النوعي عن الحمض النووي ل Ureaplasma Urealyticum في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| DMEM متوسط | Thermo Fisher Scientific Inc. (Waltham ، الولايات المتحدة الأمريكية) | 11965092 | لثقافة الكلاميديا الحثرية. |
| أطراف ماصة المرشح (10 & mu; ل) | قوانغتشو Surbiopure التكنولوجيا الحيوية المحدودة (قوانغتشو ، الصين) | TF-10-BXL | لسحب العينات بدقة في التجارب. |
| أطراف ماصة المرشح (200 مو ؛ ل) | قوانغتشو Surbiopure التكنولوجيا الحيوية المحدودة (قوانغتشو ، الصين) | TF-200-BXL | لسحب العينات بدقة في التجارب. |
| مسحة الأعضاء التناسلية | Haozhi Medical Devices Co.، Ltd. (قوانغتشو ، الصين) | Hz112 | مسحات قطنية معقمة لجمع العينات السريرية من أسطح الغشاء المخاطي للأعضاء التناسلية. |
| مصل الأبقار الجنينية من جيبكو (FBS) | شركة ثيرمو فيشر العلمية (والثام ، الولايات المتحدة الأمريكية) | 10270106 | لثقافة الكلاميديا الحثرية. |
| الشرائح الزجاجية | Haozhi Medical Devices Co.، Ltd. (قوانغتشو ، الصين) | إيداع الأجهزة الطبية في قوانغتشو Yuexiu 20210414 | زجاجية قياسية مع علاج مضاد للبهتان لإعداد مسحات الخلايا أو أقسام الأنسجة ، متوافقة مع بروتوكولات تلطيخ الجرام. |
| Goldenstar RT6 cDNA Synthesis Kit Ver2 | Beijing Tsingke Biotech Co.، Ltd (بكين ، الصين) | TSK302S | لتخليق الخيط الأول من (كدنا) في الخطوة الأولى من RT-PCR المكون من خطوتين. يحتوي على جميع الكواشف المطلوبة لتخليق (كدنا) من الحمض النووي الريبي. |
| Gram Stain Kit | Baso Diagnostics، Inc. (Zhuhai ، الصين) | BA4012 | مجموعة تلطيخ تحتوي على البنفسج الكريستالي واليود ومزيل اللون والسافرانين للتمييز بين Neisseria Gonorrhoea. |
| IBM SPSS Statistics (V25.0) | International Business Machines Corporation (New York, USA) | الإصدار 25.0 | لتحليل البيانات. |
| معقم الأشعة تحت الحمراء | Huaxixinrui (تشينغداو) الأدوات التحليلية المحدودة | MJ-200W | لإزالة التلوث الفوري لحلقات التلقيح أو الملقط ، مما يقلل من التلوث المتبادل في خزانات السلامة الحيوية. |
| حلقة التلقيح | BKMAM Biotechnology Co.، Ltd. (Hunan ، الصين) | 110306002 | لنقل العينات الميكروبية أو الخطوط أو التلقيح. |
| المجهر المقلوب (IX-51) | شركة أوليمبوس (طوكيو ، اليابان) | رمز أصول المختبر: 71807101 | لمراقبة الخلايا الملتصقة أو ديناميكيات الخلايا الحية في أطباق الاستزراع. |
| نظام قياس الطيف الكتلي الميكروبي الآلي MALDI Biotyper | Bruker Daltonics GmbH & Co. KG (بريمن ، ألمانيا) | تسجيل استيراد الأجهزة الطبية الوطنية رقم 20182222017 | نظام قائم على قياس الطيف الكتلي MALDI-TOF لتحديد الميكروبات بسرعة من خلال توصيف البروتين ، مما يتيح تحديد أنواع البكتيريا والفطريات في مختبرات علم الأحياء الدقيقة السريرية. |
| خطوط خلايا مكوي | محفوظة في المختبر. | محفوظة في المختبر. | لثقافة الكلاميديا الحثرية. |
| حاضنة ميكروبليت ترموستاتي Leopard70-4 (سعة 4 ألواح) | Leaptec Scientific Instruments (Beijing) Co.، Ltd. | Leopard70-4 | حاضنة صفيحة دقيقة تستوعب ما يصل إلى 4 ألواح دقيقة قياسية ، مع نطاق درجة حرارة من محيط إلى 70 درجة ؛ ج, تستخدم لخطوات الحضانة. |
| مجهر (أوليمبوس CX43) | شركة أوليمبوس (طوكيو ، اليابان) | https://lifescience.evidentscientific.com.cn/zh/microscopes/upright/cx43-33/ | لمراقبة العينة السريرية (على سبيل المثال ، مورفولوجيا الخلية ، العينات الملطخة). |
| معدني صغير MiniG-R100 | Leaptec Scientific Instruments (بكين) المحدودة | MiniG-R100 | لتنظيم درجة الحرارة بسرعة أثناء التجربة ، مثل التسخين أو الحضانة أو إنهاء التفاعلات في عينات صغيرة الحجم. |
| مقايسة الحمض النووي Neisseria pinorrhoeae (NG) (مقايسة تضخيم الحمض النووي الريبي - مقايسة التدفق الجانبي) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC. (ووهان ، الصين) | A.10.309-STD-RG-001 | للكشف النوعي عن الحمض النووي الريبي للنيسرية البنية في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| كاشف استخراج الحمض النووي | ووهان تشونغتشي للتقنيات الحيوية (ووهان ، الصين) | A.10.105-SC-001 | لاستخراج وتخصيب وتنقية الأحماض النووية. |
| وسيط نقل العينات | QIAGEN N.V. (فينلو ، هولندا) | 5128-1220 | تم تصميم هذه الوسيلة خصيصا لجمع العينات السريرية وحفظها ونقلها ، مما يضمن صلاحية الكلاميديا الحثرية ؛ و النيسرية البنية للاختبارات التشخيصية اللاحقة. |
| جهاز الطرد المركزي الحراري | Beckman Coulter، Inc. (Brea ، الولايات المتحدة الأمريكية) | SN: MRZ21L037 | لتكوير الخلايا أو الميكروبات أو الحمض النووي. |
| TM المتوسطة | شنغهاي Yihua العلوم الطبية & شركة التكنولوجيا المحدودة (شنغهاي ، الصين) | الجهاز الطبي Shanghai Pu رقم 20140081 | TM الوسيط لعزل وزراعة وتحديد النيسرية البنية من العينات السريرية للمساعدة في تشخيص مرض السيلان. |
| Trypsin-EDTA (0.25٪) شركة | Thermo Fisher Scientific Inc. (Waltham ، الولايات المتحدة الأمريكية) | 25200072 | للتفكك اللطيف للخلايا الملتصقة أثناء الزراعة الفرعية أو الإجراءات التجريبية. |
| مقايسة الحمض النووي Ureaplasma urealyticum (UU) (مقايسة تضخيم الحمض النووي الريبي - مقايسة التدفق الجانبي) | Wuhan Zhongzhi Biotechnologies INC. (ووهان ، الصين) | A.10.309-STD-RG-003 | للكشف النوعي عن الحمض النووي الريبي Ureaplasma Urealyticum في عينات مسحة الأعضاء التناسلية والمسالك البولية. |
| Ureaplasma urealyticum و Mycoplasma hominis ثقافة العزل الانتقائي وتحديد الهوية وحساسية الأدوية مجموعة | أدوات Hebei Zhongaisheng Biotechnology Co.، Ltd. (Hebei ، الصين) | تسجيل الجهاز الطبي Hebei 20152400168 | للعزل الانتقائي ، والثقافة ، وتحديد الهوية ، وتحديد حساسية الدواء ل Ureaplasma urealyticum و Mycoplasma hominis. |
| خلاط دوامة | Xinkang Medical Instrument Co. Ltd (جيانغسو ، الصين) | XK80-A | جهاز مختبر لتجانس العينات السائلة عن طريق التحريض السريع. |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
