أجريت جميع التجارب على وفقا للمبادئ التوجيهية الأخلاقية وتمت الموافقة عليها من قبل لجنة الأخلاقيات حول استخدام التابعة لمعهد العلوم الطبية الحيوية بجامعة ساو باولو (CEUA-ICB / USP). تم إيواء وصيانتها وفقا للمعايير التي وضعتها هذه اللجنة. أجريت التجارب التي شملت طفيليات المتصورة المعدلة وراثيا ، بالإضافة إلى تخزينها بالتبريد عند -80 درجة مئوية ، وفقا للوائح التي وضعتها لجنة السلامة البيولوجية المؤسسية التابعة لمعهد العلوم الطبية الحيوية بجامعة ساو باولو (CIBio-ICB / USP). تم استخدام ما مجموعه ثلاث أنثى فئران BALB / c ، تتراوح أعمارهن بين 3-5 أسابيع ، في هذه الدراسة - اثنتان مصابان وواحدة غير مصابة.
1. المواد والكواشف
- تحضير وسط أوكينيت عن طريق استكمال RPMI 1640 ب 0.025 M HEPES ، وبنسلين - ستربتومايسين - نيومايسين (PSN) ، و 50 مجم / لتر هيبوكسانثين ، و 100 ميكرومتر من حمض الزانثورينيك. اضبط الرقم الهيدروجيني إلى 8.3 8,16.
- قم بإعداد حل العمل لمقايسة التلألؤ عن طريق خلط حجم 1 من الركيزة مع 50 مجلدا من المخزن المؤقت للتحلل المقدم في نظام فحص لوسيفيراز.
- اضبط الحاضنة على 21 درجة مئوية.
2. العدوى وجمع الدم المتطفل
- إصابة اثنين من أنثى الفئران BALB / c (4-6 أسابيع) ب 150 ميكرولتر من سلالة Ookluc المحفوظة بالتبريد عن طريق الحقن داخل الصفاق (IP) (اليوم 0).
ملاحظة: في هذا البروتوكول ، نوصي باستخدام فئران BALB / c نظرا لتوفرها الجاهز واستخدامها على نطاق واسع في مرافق. ومع ذلك ، فإن أي سلالة فأر من النوع البري معرضة للإصابة بعدوى P. berghei وتدعم تكوين الخلايا المشيجية يجب أن تكون مناسبة للاستخدام.
- بدءا من اليوم 3 ، قم بتقييم طفيليات الدم وخلايا الدم المشيجية عن طريق الفحص المجهري لمسحات الدم الملطخة بالجيمسا.
- عندما تصل الطفيليات والخلايا المشيجية إلى حوالي 5٪ و 0.5٪ على التوالي (عادة في اليوم 4) ، قم بجمع الدم عن طريق ثقب القلب باستخدام محاقن هيبارين وتجمع الدم من كل من الفئران المصابة.
ملاحظة: على الرغم من أن هذا خط معدل وراثيا من P. berghei ، إلا أن نموه وملف تعريف المشيجات يشبه تلك التي لوحظت في سلالة ANKA. في هذا السياق ، تكون نسبة الخلايا المشيجية بالنسبة إلى الطفيليات الكلية أقل بحوالي 10 مرات.
ملاحظة: من الناحية المثالية ، يتم تحضير الصفيحة المركبة (انظر أدناه) قبل جمع الدم المتطفل ، لذلك يتم سحب الدم إلى اللوحة مباشرة بعد جمعها. إذا كان يجب جمع دم الفأر في غرفة مختلفة ، أو لا يمكن نقله على الفور إلى اللوحة المركبة لأي سبب آخر ، فيجب الاحتفاظ بالدم الذي تم جمعه عند 37 درجة مئوية لمدة لا تزيد عن 30 دقيقة.
3. فحص التحويل - الفحص في لوحات 96 بئرا
ملاحظة: لضمان نتائج متسقة ، يجب تكرار التجربة بأكملها ثلاث مرات في أيام مختلفة لتأكيد النتائج.
- تحضير العينات المركبة باستخدام وسط أوكينيت كمخفف (تركيز نهائي 10 ميكرومتر). قم بتخفيف المخزون المركب إلى 1 ملي مولار وقم بإعداد عينات العمل عن طريق تخفيف مخزون 1 ملي مولار 1: 100 فولت: v في Ookinete Medium. لاختبار واحد في نسختين ، قم بإعداد حجم نهائي قدره 200 ميكرولتر من عينة العمل.
- إذا تم تخفيف المركب في مذيب آخر غير الماء ، فقم بتضمين عينة تحكم تحتوي على المذيب المخفف في وسط أوكينيت بنفس النسبة كما في عينة الاختبار للتأكد من أن أي تثبيط ملحوظ يعزى إلى المركب وليس المذيب.
ملاحظة: على سبيل المثال ، سنقوم بفحص 90 مركبا.
- باستخدام لوحين من 96 بئرا ، ضع 80 ميكرولتر من العينات في كل بئر ، على النحو التالي والموضح في الشكل 1 ، في نسختين (لوحتين): التحكم الإيجابي: 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت. التحكم السلبي: 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت. التحكم في المذيبات: 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت مع 1٪ DMSO ؛ العينات: 80 ميكرولتر من 10 ميكرومتر من كل مركب في وسط أوكينيت.

الشكل 1: تمثيل تخطيطي لتخطيط لوحة 96 بئرا مصمم للفحص المركب. يتضمن تخطيط اللوحة التحكم الإيجابي (C +) ، والتحكم السلبي (C-) ، ومذيب التحكم بالإضافة إلى التخفيف (C + S) ، و 90 مركبا اختباريا (S1-S90). الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- أضف 4 ميكرولتر من دم الفأر المتطفل إلى كل بئر من اللوحة المكونة من 96 بئرا بنسبة 1:20 v: v ، باستثناء عنصر التحكم السلبي (C-). تجانس بلطف عن طريق سحب العينات.
ملاحظة: بالنظر إلى الخسائر ، نحسب الحاجة إلى ~ 400 ميكرولتر من الدم المتطفل لكل لوحة.
- بالنسبة للتحكم السلبي ، أضف دم الفأر غير المصاب بنسبة 1:20 (v: v ، الدم: العينة). تجانس بلطف.
- احتضان عند 21 درجة مئوية لمدة 6 ساعات أو 24 ساعة.
ملاحظة: يمكن اكتشاف نشاط nLuc مع 6 ساعات من الحضانة ويبلغ ذروته عند 24 ساعة من الفحص8. الفحص غير قادر على تحديد المركبات ذات النشاط بعد تكوين البيضة الملقحة ، مثل المركبات التي تمنع تكوين أوكينيت ، لأن البيضة الملقحة المتكونة ستتراكم nLuc بغض النظر عن استكمال التشكل. لذلك ، فإن الحضانة لمدة 6 ساعات كافية للكشف عن جميع المركبات التي ستمنع نشاط nLuc عن طريق تثبيط تكوين الأمشاج أو إعادة التركيب الجنسي أو السمية الخلوية المبكرة. ومع ذلك ، فإننا نفضل عادة الحضانات لمدة 24 ساعة للحصول على إشارات أقوى ونسبة إشارة إلى ضوضاء أفضل.
4. فحص التلألؤ
- بعد فترة الحضانة ، قم بتجانس العينات عن طريق سحب العينة لأعلى ولأسفل لضمان خلط الدم المتوسط بشكل شامل.
- قم بإعداد خليط الركيزة للتحلل / لوسيفيراز مباشرة قبل الاستخدام بنسبة 1:50 (v: v ، الركيزة: مخزن التحلل).
- امزج خليط الركيزة مع العينات بنسبة 1: 1 (v: v) ، مع ضمان الخلط اللطيف لتجنب الفقاعات. احتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 3-5 دقائق.
ملاحظة: في هذا المثال ، أضفنا 84 ميكرولتر من الركيزة: مخزن التحلل إلى كل بئر.
- انقل العينات إلى طبق أبيض مسطح القاع مكون من 96 جيدا. قم بقياس اللمعان باستخدام قارئ اللوحة. استخدم تكوين المعلمة التالية: مرشح الانبعاث: العدسة؛ وقت الفاصل الزمني للقياس: 1 ثانية لكل بئر.
5. تحليل البيانات - الفحص
- بعد مقايسة التلألؤ ، قم بتدوين البيانات الأولية التي تظهر (الشكل 2).
ملاحظة: تعتمد وحدات الضوء النسبي (RLU) التي تم الحصول عليها على مقياس الإضاءة المستخدم. في حالتنا ، تراوحت قيم RLU للتحكم الإيجابي من 10,000 إلى 500,000 في اختبار حضانة لمدة 24 ساعة. ستؤدي أوقات الحضانة الأقصر (6 ساعات) إلى انخفاض قيم RLU.

الشكل 2: النتائج التي تم الحصول عليها من قراءة محاكاة لمقايسة التحويل للفحص المركب. تعرض الصورة قراءات تلألؤ محاكاة من اختبار تم إجراؤه بعد تحويل البوكينيت في وجود لوحة من 90 مركبا. تشير قيم وحدة الضوء النسبي المنخفضة إلى انخفاض تكوين أوكينيت. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- باستخدام جدول بيانات، احسب متوسط كل قياس باستخدام الصيغة أدناه. يستعاض عن XX بعنوان خلية القياس الأولى و YY بعنوان خلية القياس الثانية. كرر الصيغة لجميع العينات.
=(المتوسط (XX: YY)
- قم بتحويل البيانات إلى تثبيط٪ لتحليل أفضل للنتائج. في جدول البيانات، استخدم الصيغة أدناه. استبدل A بقيمة RLU النموذجية و B بقيمة RLU للتحكم. كرر الصيغة لجميع المركبات التي تم اختبارها:
= 1 - (أ / ب) × 100
ملاحظة: ستظهر البيانات كما هو موضح في الشكل 3.

الشكل 3: النتائج التي تم الحصول عليها من قراءة محاكاة لمقايسة التحويل للفحص المركب ممثلة كنسبة مئوية من التثبيط لكل مركب. النسبة المئوية لتثبيط التحويل لكل مركب تم اختباره ، محسوبة كما هو موضح أعلاه. تشير المربعات المميزة إلى المركبات التي تعزز تثبيط التحويل بنسبة تزيد عن 95٪. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- تحديد المركبات التي تظهر تثبيط أكثر من 95٪.
ملاحظة: تظهر هذه المركبات نشاطا عاليا ضد المراحل الجنسية بتركيز 10 ميكرومتر. في مثالنا ، وجدنا خمسة مركبات ذات نشاط عال ضد المراحل الجنسية.
- بالنسبة للمركبات المحددة ، قم بإجراء تحديد IC50 كما هو موضح أدناه.
6. اختبار التحويل - تحديد IC 50
- إصابة الفئران ب Ookluc وجمع الدم المتطفل ، كما هو موضح في القسم 2.
- تحضير العينات باستخدام وسط أوكينيت كمخفف. استخدام تركيز أولي في أي 100٪ لوحظ تثبيط التحويل بواسطة المركب.
ملاحظة: نظرا لأنه تم تحديد المركبات النشطة في شاشة بتركيز 10 ميكرومتر ، فإننا نستخدم 20 ميكرومتر كتركيز أولي لمنحنى استجابة الجرعة الأول. للحصول على منحنى دقيق للجرعة والاستجابة ، من المهم أن يتضمن الفحص تركيزات أولية تؤدي إلى تثبيط التحويل والتركيزات النهائية بنسبة 100٪ التي تؤدي إلى تثبيط 0٪. يضمن هذا النهج حسابا دقيقا ل IC50 . سيبلغ منحنى الاستجابة الجرعة الأول أدنى تركيزات المركب مع تثبيط ~ 100٪. في هذا البروتوكول ، سنستخدم PyAz90 ، الذي تم تحديده مؤخرا باستخدام Ookluc13 ، كمثال.
- في طبق مكون من 96 بئرا ، أضف ثلاث نسخ (انظر الشكل 4): التحكم الإيجابي (C +): 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت. التحكم السلبي (C-): 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت. تخفيف العينة الأولى (Cpd D1): 160 ميكرولتر من المركب بتركيز أولي في وسط أوكينيت ينتج عنه تثبيط التحويل بنسبة 100٪. آبار D2 إلى D12: 80 ميكرولتر من وسط أوكينيت.
- قم بعمل تخفيفات تسلسلية ذات شقين عن طريق سحب 80 ميكرولتر من البئر D1 إلى D2 ، والتجانس ، والماصة 80 ميكرولتر من البئر D2 إلى D3 وما إلى ذلك. تأكد من أن جميع الآبار تحتوي على 80 ميكرولتر من الحجم الكلي ، لذا تخلص من آخر 80 ميكرولتر تمت إزالتها من البئر D12.
ملاحظة: قم بإجراء التجربة بثلاث نسخ مكررة على الأقل لجميع العينات، كما هو موضح في الشكل 4. لضمان موثوقية نتائجك وقابليتها للتكرار ، يجب تكرار التجربة بأكملها في ثلاثة أيام منفصلة باستخدام المصابة حديثا في كل مرة.
ملاحظة: إذا أظهرت النتائج في الشاشة الأولى عدم وجود تأثير للمذيب في التحويل ، فليس من الضروري تضمين عناصر التحكم هذه في التخفيفات التسلسلية. خلاف ذلك ، يجب أيضا تضمين التخفيفات التسلسلية للمذيب.

الشكل 4: تخطيط لوحة 96 بئرا مصمم لتحديد مركب IC50 . يتضمن تخطيط اللوحة تحفيفا إيجابيا (C +) وتحكم سلبي (C-) وتخفيفات مركبة (Cpd) (D1 إلى D12). الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
- أضف دم الفأر المتطفل إلى اللوحة المكونة من 96 بئرا عند 1:20 فولت: حجم. تجانس بلطف عن طريق سحب العينات.
ملاحظة: سيتم إضافة ما مجموعه 4 ميكرولتر من الدم المتطفل إلى كل بئر ، باستثناء التحكم السلبي (C-). بالنظر إلى الخسائر ، نحسب الحاجة إلى ~ 200 ميكرولتر من الدم المتطفل لكل مركب يتم اختباره.
- في آبار التحكم السلبي ، أضف دم الفأر غير المصاب بنسبة 1:20 (v: v ، الدم: العينة). تجانس بلطف.
- احتضان عند 21 درجة مئوية لمدة 6 ساعات أو 24 ساعة.
- قم بإجراء مقايسة اللمعان ، كما هو موضح في القسم 4.
7. تحليل البيانات - تحديد IC 50
ملاحظة: يعرف IC50 بأنه تركيز مركب مطلوب لتثبيط 50٪ من النشاط البيولوجي / التثبيط. في هذا الاختبار ، يشير التثبيط إلى انخفاض تحويل أوكينيت. يتم تمثيل البيانات كمنحنى استجابة للجرعة السيني ، حيث يمثل المحور X تركيزا مركبا (محول لوغاريتم) ويمثل المحور Y نسبة تثبيط.
- احسب النسبة المئوية للتثبيط كما هو موضح في القسم 5، الخطوة 5.3.
- افتح البرنامج وأنشئ جدول XY.
- قم بتعيين خيارات المحور Y لإدخال 3 قيم نسخ متماثل في أعمدة فرعية جنبا إلى جنب.
- لصق البيانات ، حيث يمثل X تركيزا مركبا و Y يمثل النسبة المئوية للتثبيط (الشكل 5 أ).
- في شريط القائمة ، انقر فوق تحليل وحدد الانحدار غير الخطي (ملاءمة المنحنى) ثم منحنيات استجابة الجرعة - التثبيط و [المثبط] مقابل الاستجابة الطبيعية - المنحدر المتغير ؛ انقر فوق موافق.
- في اللوحة اليسرى ، راقب منحنى استجابة الجرعة للبيانات. قم بتطبيق التخصيص المطلوب، مثل تغييرات الألوان وتنسيقات النقاط.
- حدد موقع جدول ملاءمة Nonlin للعثور على فاصل الثقة IC50 و 95٪ المحسوب (95٪ CI) (الشكل 5 ب).

الشكل 5: منحنى استجابة الجرعة ل PyAz90. تم قياس النسبة المئوية للتثبيط كدالة لتركيز PyAz90 (ميكرومتر) على مقياس لوغاريتمي. يمثل المنحنى السيني البيانات الملائمة المستخدمة لتحديد IC50 ، والتي كانت 0.013 ميكرومتر (فاصل ثقة 95٪: 0.012-0.014 ميكرومتر). تمثل نقاط البيانات متوسط ± الخطأ المعياري للمتوسط من التكرارات التجريبية. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.