تقدم هذه المقالة إعادة تشكيل بسيطة من وعاء واحد لشبكات الهيكل الخلوي داخل حويصلات عملاقة مفصولة عن الطور. يمكن تعميم الطريقة وتطبيقها على تغليف أو حبس مجموعة واسعة من الجزيئات الحيوية.
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
تقدم هذه المقالة إعادة تشكيل بسيطة من وعاء واحد لشبكات الهيكل الخلوي داخل حويصلات عملاقة مفصولة عن الطور. يمكن تعميم الطريقة وتطبيقها على تغليف أو حبس مجموعة واسعة من الجزيئات الحيوية.
تستخدم الأغشية الدهنية المقلدة الحيوية على شكل حويصلات أحادية الصفيحة العملاقة (GUVs) بشكل شائع لتقليد سلوك الغشاء الخلوي بسبب سهولة إعادة تكوين البروتين داخل GUVs ، والتصور ، بالإضافة إلى فهم ديناميكيات بروتين الغشاء الخلوي. ومع ذلك ، فإن أغشية الخلايا تتكون من طوافات دهنية (أو مجالات) تنشأ عن وجود دهون مختلفة في الغشاء الخلوي. يمكن دمج هذا التعقيد المتزايد في أنظمة النماذج لينتج عنه GUVs منفصلة عن الطور ، حيث يمكن ضبط تكوين الدهون بدقة. في حين أن طرق التغليف لتوليد GUVs المتجانسة معروفة على نطاق واسع ، فإن طرق تغليف البروتينات داخل GUVs المنفصلة عن الطور محدودة. هنا ، يقدم هذا البروتوكول إنتاجا مبسطا من وعاء واحد من GUVs المنفصلة عن الطور ، والتي تتألف من مجالات سائلة مضطربة (Ld) وسوائل مرتبة (Lo) ، وتغليف بروتينات الهيكل الخلوي المختلفة بكفاءة ، مثل FtsZ والأكتين ، مما يجعل الطريقة أداة متعددة الاستخدامات للحد الأدنى من إنتاج الخلايا. على وجه التحديد ، يستخدم هذا النهج بروتوكول نقل المستحلب لإنتاج GUVs ذات كفاءة تغليف عالية. في هذه الطريقة ، يتم إنشاء طبقة أحادية الدهون أولا عن طريق استحلاب محلول بروتيني في خليط دهني / زيت ، حيث يتم اختيار الدهون ذات درجات حرارة انتقال الطور المتغيرة لإنتاج فصل الطور في GUVs الناتجة. يتم نقل هذا المستحلب برفق فوق محلول دهني في الزيت في أنبوب آخر ، مما يؤدي إلى تكوين واجهة ماء وزيت. ثم يتم طرد المحلول في درجات حرارة مرتفعة (من الناحية المثالية عند 37 درجة مئوية للاحتفاظ بنشاط البروتين) ، وبعد ذلك يتم جمع GUVs للتصوير. تعمل هذه الطريقة على تبسيط إعادة التكوين في المختبر لبروتينات الهيكل الخلوي داخل GUVs المنفصلة عن الطور دون استخدام إعداد مختبر مرهق ، وبالتالي فهي بمثابة طريقة ملائمة لدراسة آليات تفاعلات الهيكل الخلوي والغشاء في الحبس.
تعمل الحويصلات العملاقة كأنظمة نموذجية لفهم الوظائف الخلوية1،2. إن سهولة إنتاجها ، وتصورها ، وقابليتها للضبط ، وإعادة تشكيل الجزيئات الحيوية في المختبر تجعل هذه النماذج الحيوية هي النظام المفضل للعديد من الدراسات البحثية3،4،5. هناك العديد من الطرق المعروفة لصنع GUVs ، مثل التشكيل الكهربائي6 ، cDICE7،8 ، نقل المستحلب ، وغيرها من الطرق القائمة على الموائعالدقيقة 9،10. تم الإبلاغ عن إنتاج GUV بهذه الأساليب في الأدبيات3،11. علاوة على ذلك ، في المختبر ، تم وصف إعادة تكوين شبكات الهيكل الخلوي داخل GUVs سابقا باستخدام طريقة نقل المستحلب نظرا لسهولة طريقة تكوين الوعاء الواحد هذه ، والتي لا تتطلب أي إعداد معقد12. ومع ذلك ، يتم الإبلاغ عن إعادة التكوين هذه بشكل شائع جدا في GUVs المتجانسة ، وهو نظام لا يحاكي تماما تعقيد الأغشية الخلوية.
يصف هذا البروتوكول إعادة التكوين في المختبر لشبكات الهيكل الخلوي داخل GUVs المنفصلة عن الطور ، مما يدل على تعقيد الغشاء الدهني. بينما تم الإبلاغ سابقا عن ارتباط هذه الشبكات على سطح الغشاء (خارج) ولكنها غير محصورة داخل الحويصلات العملاقة13،14 ، تركز تقنية نقل المستحلب الحالية على البروتوكول لإنتاج فصل الطور ، بالإضافة إلى الاحتفاظ بنشاط تكوين الشبكة للهيكل الخلوي. أحد التحديات الرئيسية في هذه التقنية هو درجة الحرارة. تتطلب طرق الإنتاج القياسية لتوليد GUVs منفصلة عن الطور استخدام درجات حرارة مرتفعة ، والتي تختلف اعتمادا على درجة حرارة انتقال الطور للدهون المكونة. ومع ذلك ، فإن بروتينات الهيكل الخلوي غير قادرة على البلمرة في هياكل ذات ترتيب أعلى عند درجات حرارة عالية15،16،17. وبالتالي ، لا يستخدم هذا البروتوكول تركيبة دهنية فقط لإنتاج فصل الطور في GUVs في درجة حرارة الغرفة ، ولكنه أيضا يحسن الظروف لإنتاج عائد جيد من GUVs في درجات حرارة فسيولوجية.
جانب آخر يجب مراعاته أثناء إنتاج أنظمة GUV المعاد تشكيلها هو حجم الجزيئات الحيوية المغلفة المطلوبة. بالنسبة لمعظم البروتينات ، يمكن أن يكون إنتاج كميات أكبر مكلفا ويستغرق وقتا طويلا ، ويتضمن عدة جولات تنقية. علاوة على ذلك ، تتطلب تجارب إعادة التكوين في المختبر عموما مرحلة استكشافية أولية حيث يتم اختبار تركيزات الجزيئات الحيوية ، وتركيبات العازلة ، وما إلى ذلك ، لأول مرة لتحقيق محتوى محلول داخلي محسن. وبالتالي ، يعمل هذا البروتوكول على تحسين بروتوكول إنتاج GUV لمقياسين مختلفين ، يتكيفان مع المباني المذكورة أعلاه. من ناحية أخرى ، يصف هذا البروتوكول فحصا واحدا يعمل على تحسين بروتوكول المستحلب المقلوب القياسي ، والذي يتضمن كميات أكبر نسبيا من البروتينات ويولد إنتاجا عالي الإنتاجية من GUV في أنابيب ، والتي يتم نقلها لاحقا إلى لوحات تصوير 96 بئرا. من ناحية أخرى ، فإن النهج الموصوف هنا يعمل أيضا على تحسين بروتوكول إنتاج GUV مفصولة الطور مباشرة في ألواح آبار التصوير ، والتي تستخدم كميات أقل من الجزيئات الحيوية (~ 1/4 من الكميات المطلوبة للإنتاج في الأنابيب) وتمكن من توليد GUV في سلسلة ، مما يحقق العديد من الظروف المغلفة في خطوة طرد مركزي واحدة. وبالتالي ، يعرض البروتوكول المقدم هنا طريقة تغليف واحدة ولكنه يسمح للمستخدم باختيار أي من الإعدادين بناء على متطلباته.
علاوة على ذلك ، يصف هذا البروتوكول طريقة محسنة للتغليف لشبكتين مختلفتين للهيكل الخلوي: FtsZ و actin. نظرا لأن هذين البروتينين يتطلبان ظروفا مختلفة للمخزن المؤقت والازدحام ، فإن البروتوكول يعالج التغييرات الضرورية اللاحقة لتحقيق إعادة تشكيل الشبكة المثلى. لذلك ، يمكن استخدام النهج المقدم هنا وتعميمها لتغليف أي جزيئات حيوية مطلوبة داخل GUVs منفصلة عن الطور.
الكواشف والمعدات المستخدمة في هذه الدراسة مدرجة في جدول المواد.
1. تحضير خليط الدهون
2. تحضير الحلول الداخلية للتغليف
3. إنتاج GUV والتغليف في المختبر
4. التصوير وإعادة بناء الصور ثلاثية الأبعاد
5. التحليل الإحصائي لتردد GUV على أساس الحجم
كخطوة أولى ، تم إنتاج GUVs مع فصل طور الغشاء باتباع نهج مستحلب مقلوب معدل (الشكل 1 أ). ينتج عن هذا إنتاجية عالية من GUVs ، والتي تظهر غشاء مختلط إلى مجالات Ld و Lo ، كما يمثله ملصق Atto 655-DOPE على مجال Ld والمناطق المظلمة المقابلة لمجالات Lo غير المسماة (الشكل 1 ب). تنتج هذه الطريقة GUVs مفصولة عن الطور بأحجام تتراوح من 5-30 ميكرومتر (الشكل 1C) في درجات حرارة مرتفعة (جميع الخطوات التي يتم إجراؤها عند 37 درجة مئوية وتم تصويرها عند RT). علاوة على ذلك ، تم تعديل سرعات الطرد المركزي لضمان دمج الدهون المكونة الأصلية في GUVs وكذلك لتجنب الاكتظاظ السكاني المفرط.
علاوة على ذلك ، لإثبات التغليف الناجح للجزيئات الحيوية باستخدام طريقة المستحلب الموضحة في البروتوكول الحالي ، تم إعادة تشكيل كل من شبكات FtsZ والأكتين في تجارب فردية. يتم تلخيص شبكات FtsZ داخل GUVs ، والتي تظهر على شكل خيوط مرتبطة بشكل تفضيلي بمجالات L d عبر تسلسل استهداف الغشاء (MTS) في وجود 2.5 ملي مولار GTP و 50 جم / لتر Ficoll70 (كما هو موضح في الشكل 2). لوحظت الشبكات بعد حوالي ساعة واحدة من خطوة التغليف. ومع ذلك ، تظهر شبكات actomyosin كحزم رفيعة (على عكس الشبكات السميكة ل FtsZ) بعد إعادة التكوين داخل GUVs (الشكل 3). وتجدر الإشارة إلى أن الدهون الحيوية تلعب دورا مهما في ربط شبكات الأكتوميوسين بغشاء GUVs. بدون دهون بيوتينيل ، لا يمكن لحزم أكتوميوسين أن تتبنى تكوينا منحنيا وتبقى كحزم مستقيمة وقصيرة وقاسية عند التجويف بدلا من الالتصاق بالغشاء كشبكة متشابكة من الحزم الطويلة (الشكل 4).
في بروتوكول المستحلب المعدل ، يتم ضبط سرعة الطرد المركزي للحصول على GUVs منفصلة عن الطور ، كما ذكرنا سابقا. في الواقع ، تؤدي سرعات الطرد المركزي الأعلى مع العينات التي تحتوي على شبكات actomyosin (600 × g لمدة 15 دقيقة) إلى تجميع الحويصلات في تكوين يشبه الأنسجة داخل بئر الإنتاج. وهكذا ، في جميع تجارب إعادة التكوين القياسية لشبكات actomyosin ، تم ضبط سرعة الطرد المركزي المثلى على 200 × g للحصول على GUVs غير مجمعة (الشكل 5).

الشكل 1: توليد وعاء واحد من المركبات الكهروضوئية المفصولة عن الطور باستخدام طريقة نقل المستحلب المزدوج. (أ) مخطط تجريبي للخطوات الرئيسية في إنتاج وعاء واحد للحويصلات المنفصلة عن طريق نقل المستحلب المزدوج. (ب) صورة الإسقاط Z متحد البؤر ل GUVs الناتجة التي تم إنشاؤها باتباع الطريقة الموضحة في A. شريط المقياس هو 50 ميكرومتر. (ج) الرسم البياني الشريطي مع جزء من GUVs المنفصلة عن الطور المتولد وفقا لقطرها. التجارب التي أجريت ن = 3 ، العدد الإجمالي ل GUVs التي تم تحليلها لكل تجربة = 100. البيانات المعروضة كقيم متوسطة ، نقاط البيانات الفردية هي التجارب الثلاث المستقلة. تمثل أشرطة الخطأ الانحراف المعياري للتجارب الثلاث. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: حويصلات مفصولة عن الطور مع شبكات FtsZ مغلفة. (أ) صور إسقاط ثلاثية الأبعاد متحدة البؤر يتم إجراؤها على مكدس z مكتسبة بالكامل من GUV منفصل عن الطور يحتوي على شبكة FtsZ. (ب) صور الإسقاط Z متحد البؤر التي يتم إجراؤها على النصف العلوي فقط من الحويصلة. نظرا للتكوين غير المتجانس للمجالات على سطح GUV ، فإن إعادة البناء ثلاثية الأبعاد للشرائح متحد البؤر المكتسبة تظهر تداخل المجالات الدهنية من المناطق العلوية والسفلية من الحويصلة. لمنع التداخل وتسهيل الفحص البصري للمجالات ، تتم إزالة النصف السفلي من مكدسات z التي تم الحصول عليها من الملف. ثم يتم استخدام النصف العلوي الناتج لإسقاطه ثلاثي الأبعاد عبر الانحراف المعياري. أشرطة المقياس كلاهما 20 ميكرومتر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3: حويصلات مفصولة عن الطور مع شبكات أكتوميوسين مغلفة. (أ) صور إسقاط Z متحدة البؤر لكومة كاملة مكتسبة مع عرض تصغير للبئر بعد إنتاج الحويصلة. يسمح العائد المرتفع للحويصلات التي تم الحصول عليها بدراسة هياكل actomyosin المختلفة داخل الحويصلات. شريط المقياس هو 50 ميكرومتر. (ب) صور إسقاط Z متحدة البؤر يتم إجراؤها على النصف العلوي من الحويصلة. لتسهيل التحليل البصري لمجالات الدهون ، يتم استخدام النصف العلوي فقط من شرائح الصورة لإجراء عرض ثلاثي الأبعاد. شريط المقياس هو 10 ميكرومتر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 4: أهمية الدهون الحيوية لتوليد شبكات أكتوميوسين مرتبطة بالغشاء داخل حويصلات مفصولة الطور. إسقاطات ثلاثية الأبعاد متحدة البؤر تصور حويصلات منفصلة عن الطور مع شبكات أكتوميوسين غير متصلة. إذا لم يتم دمج الدهون الحيوية في المزيج ، تتشكل هياكل أكتوميوسين عند التجويف ولا تكتسب تكوينا منحنيا على النشرة الداخلية للحويصلات (اللوحة اليمنى ، الأكتين المسمى ب Atto488). شريط المقياس هو 50 ميكرومتر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 5: تأثير سرعة الطرد المركزي على إنتاج حويصلات مفصولة عن طريق نقل المستحلب. صور ثنائية الأبعاد متحدة البؤر تظهر عينة GUV تم إنشاؤها عن طريق استخدام قوة طرد مركزي تبلغ 600 × جم لمدة 15 دقيقة. تؤدي سرعة الطرد المركزي المستخدمة ، أعلى من 200 × جم المحسنة ، إلى تجميع الحويصلات في تكوين يشبه الأنسجة داخل البئر. شريط المقياس هو 100 ميكرومتر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
يتمثل أحد التحديات الرئيسية لإعادة التشكيل في المختبر لأنظمة النماذج القائمة على الغشاء في تغليف البروتينات داخل GUVs مفصولة بشكل طور بسبب تحضيرها في درجات حرارة عالية. في الواقع ، يمكن أن يؤدي توليد هذا النوع من الحويصلات المنفصلة عن طريق التخليق في وعاء واحد إلى صعوبات تنشأ عن تدهور البروتينات في درجات حرارة مرتفعة. وبالتالي ، يصف هذا البروتوكول الظروف المثلى لمراقبة فصل طور الغشاء باتباع طريقة المستحلب المزدوج لإنتاج GUV في درجات حرارة فسيولوجية ، مع الحفاظ في نفس الوقت على نشاط البروتينات المغلفة. يقدم هذا النهج شحنة سالبة لكلا المجالين لتسهيل ارتباط أي بروتينات مرغوبة عندما تكون التفاعلات الكهروستاتيكية شرطا أساسيا. في حالة تغليف FtsZ ، على الرغم من وجود شحنة سالبة في كلا المجالين ، فإن شبكات الهيكل الخلوي تتطور وترتبط بشكل تفضيلي بمجالات Ld ، مما يشير إلى أنه إلى جانب الشحنة السالبة ، تعد سيولة الغشاء مطلبا أساسيا لربط البروتين18. علاوة على ذلك ، في حالة تغليف الأكتين ، تتطور الشبكات عبر مناطق الغشاء حيث يتم دمج الدهون البيوتينيل19.
على الرغم من أن مقايسة نقل المستحلب تستخدم على نطاق واسع في الأدبيات ، إلا أنها لم يتم تطبيقها إلا على إنتاج GUVs متجانسة. لذلك ، يتكون هذا البروتوكول من عدة جوانب معدلة من الفحص ، والتي تسمح بمراقبة تكوين المجال في الغشاء. أحد الجوانب الرئيسية في هذا الصدد هو درجة الحرارة. لمراقبة المجالات ، وكذلك للحفاظ على وظائف البروتينات (على وجه التحديد تكوين شبكة الهيكل الخلوي) ، يستخدم هذا البروتوكول 37 درجة مئوية لإنتاج GUVs. من ناحية أخرى ، عندما يتم إنتاج GUVs عند درجة حرارة أعلى ، تفقد البروتينات المغلفة وظائفها ، وتقيم في التجويف ولا تتبلمر في هياكل عالية المستوى. من ناحية أخرى ، إذا تم إنتاج GUVs عند درجة حرارة منخفضة ، فلن يلاحظ فصل الطور في الغشاء. وبالتالي ، تصبح 37 درجة مئوية درجة الحرارة المثلى لإنتاج GUV في التجارب.
من المهم ملاحظة أن هذا البروتوكول يوفر نظامين محتملين للفحص لإنتاج GUVs باتباع نفس مبدأ نقل المستحلب: داخل الأنابيب وألواح الآبار. كلاهما يقدم مزايا وعيوبا ، والتي قد يحتاج المستخدم إلى أخذها في الاعتبار أثناء مرحلة التخطيط التجريبي لتحديد النظام الذي يناسب احتياجاته. في الواقع ، لا تتطلب الأنابيب البلاستيكية جهاز طرد مركزي مزود بدوار لألواح الآبار ، فهي أسهل في التعامل معها ، وتسمح بالتحكم في عامل تخفيف الحويصلات بعد الإنتاج وقبل التصوير. ومع ذلك ، فإنها تتطلب كميات أكبر (لكل من المراحل الزيتية والمائية) وإزالة طبقة الزيت بعد الإنتاج لاستخراج GUV ، مما قد يترك بقايا الزيت في بئر التصوير إذا لم يتم تنفيذ هذه الخطوة بعناية. بدلا من ذلك ، تتطلب ألواح الآبار استخدام حجم عينة أقل ، وتسمح بتغليف الظروف الداخلية المختلفة في سلسلة وفي وقت واحد ، ولا تتطلب استخراج GUV ، حيث يمكن تصوير الحويصلات مباشرة بعد الإنتاج في نفس بئر الإنتاج. العيب الرئيسي لألواح الآبار هو تجميع الحويصلات والحاجة إلى ضبط معلمات الطرد المركزي للوصول إلى عائد إنتاج حويصلة مماثل لتلك التي لوحظت في الأنابيب.
بغض النظر عن نظام التغليف المستخدم (الأنابيب أو ألواح الآبار) ، يوضح هذا النهج أن ظروف الازدحام المثلى مطلوبة لإنتاج GUVs ، وكذلك لتسهيل بلمرة البروتينات المغلفة. على وجه الخصوص ، باتباع هذا البروتوكول ، لوحظ أفضل حالة ل GUVs مع FtsZ مغلف مع 30 جم / لتر BSA و 50 جم / لتر Ficoll7018. بينما بالنسبة للأكتين ، كان هناك حاجة إلى خليط من 10 جم / لتر BSA و 7٪ يوديكسانول و 20 جم / لتر Ficoll7019.
جانب آخر مهم لإنتاج GUV هو سرعة الطرد المركزي والوقت. لتشكيل شبكات FtsZ تحت تركيزات الازدحام المذكورة أعلاه ، فإن الطرد المركزي عند 6000 × غرام لمدة 30 دقيقة يجعل مجموعة من GUVs موزعة بشكل جيد ومفصولة فوق لوحة بئر التصوير. على العكس من ذلك ، بالنسبة للأكتين ، يتيح 200 × جم لمدة 20 دقيقة توليد إنتاجية عالية من GUV. إذا انخفضت سرعة الطرد المركزي أو الوقت ، فإن عائد GUVs يتأثر ، بينما تؤدي زيادته فوق القيم المذكورة إلى تجميع GUVs. في ظل الظروف المذكورة ، يولد هذا البروتوكول GUVs بأقصى قدر من كفاءة التغليف بالإضافة إلى GUVs الفردية التي لا تلتصق ببعضها البعض.
في حين يمكن تعميم هذا البروتوكول على أي دهون وجزيئات حيوية مغلفة ، فإن تكوين الغشاء المطلوب ومحتويات الحويصلات تملي معلمات الطرد المركزي ، والتي تسمح بتوليد حويصلات مفصولة عن الطور. لذلك ، يعمل هذا البروتوكول كمبدأ توجيهي لتمكين إنتاج حويصلات متنوعة مع مجالات الغشاء.
تعد منهجيات إعادة التكوين في المختبر داخل GUVs المنفصلة عن الطور ضرورية لفهم ديناميكيات غشاء البروتين المعقدة بوساطة مجالات الدهون ، مع مراعاة تعقيد أغشية الخلايا14. إن الحجم الصغير والطبيعة الديناميكية للغاية لهذه المجالات الدهنية تجعل توصيف التفاعلات البينية أمرا صعبا في الجسم الحي. ومن ثم ، تعمل GUVs كأداة حيوية نظرا لسهولة تحضيرها النسبية وتعديلها الفيزيائي الكيميائي ، فضلا عن ملاءمتها للتحليل بواسطة المجهرالضوئي 20.
بالإضافة إلى ذلك ، فإن تغليف الجزيئات الوظيفية داخل الواجهات الحيوية غير المتجانسة يقدم تطبيقات واعدة في مجال الطب النانوي. على وجه الخصوص ، تطوير أنظمة توصيل الأدوية الوظيفية ذات الخصائص المختلفة الناشئة عن التوزيع غير المتماثل وتقسيم الجزيئات الحيوية إلى مناطق محصورة على سطحها21. تلعب تفاعلات الأدوية والدهون دورا مهما في خصائص الحرائك الدوائية للأدوية ، مثل نقلها وتوزيعها وتراكمها ، مما يؤثر في النهاية على فعالية الأدوية المستخدمة22. لذلك ، فإن فهم دور هذه التفاعلات على خصائص الحركية الدوائية للأدوية أمر بالغ الأهمية في تطوير أدوية فعالة. يمكن استكشاف الأغشية الدهنية النموذجية لفهم آليات تفاعلها مع الببتيدات والبوليمرات والناقلات النانوية23. وبالتالي ، فإن التغييرات في التركيب الدهني للخلايا والأنسجة في بعض الحالات المرضية قد تغير التفاعلات الفيزيائية الحيوية ، والتي يمكن استكشافها لتطوير أدوية محددة الهدف وأنظمة توصيل الأدوية24.
في الختام ، يوفر البروتوكول الموصوف هنا استراتيجية سهلة لتوليد GUVs منفصلة عن الطور مع بروتينات مغلفة مثبتة على نشرة الدهون الداخلية. إن توليد هذه الأنظمة الحويصلية له استخدام واعد في مجالات مثل التكنولوجيا الحيوية والبيولوجيا التركيبية ، حيث قد تجلب التجميعات متعددة المكونات ذات الوظائف المعقدة لتقليد الوظائف الشبيهة بالخلايا حلولا مبتكرة وتطبيقات جديدة.
ويعلن أصحاب البلاغ عدم وجود مصالح متضاربة.
يود المؤلفون أن يشكروا مرفق MPIB الأساسي للمساعدة في تنقية البروتين ، وميكايلا شابر لاستنساخ البلازميد ، وكيرستين رورل لتنقية البروتين ، وساندرا أورتماير لمستحضرات الدهون. يود المؤلفون أيضا أن يشكروا Adrián Merino-Salomón و Shunshi Kohyama على المناقشات المفيدة حول ظروف الزحام وتغليف البروتين. م. ر. ل. هو جزء من IMPRS-ML ومشروع ONE MUNICH الذي تدعمه الوزارة الفيدرالية للتعليم والبحث (BMBF) بالإضافة إلى ولاية بافاريا الحرة في إطار استراتيجية التميز للحكومة الفيدرالية والولايات. يود المؤلفون أيضا أن يقدروا دعم مركز علوم النانو (CeNS) في ميونيخ.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 1،2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-rac-glycerol) (ملح الصوديوم) (DOPG) | دهون Avanti Polar | 840475 | في الكلوروفورم |
| 1،2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC)Avanti | Polar Lipids | 850375 | في الكلوروفورم |
| 1،2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N- (غطاء البيوتينيل) (ملح الصوديوم) (18: 1 غطاء البيوتينيل PE)دهون | أفانتي القطبية | 870273 | في الكلوروفورم |
| 1،2-ديبالميتويل-SN-glycero-3-phospho-(1'-rac-glycerol) (ملح الصوديوم) (DPPG) | دهون أفانتي القطبية | 840455 | في الكلوروفورم |
| 1،2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DPPC) | Avanti Polar Lipids | 850355 | في الكلوروفورم |
| 96-بئر صفيحة مسطحة القاع (SensoPlate) أكتين | |||
| (عضلة هيكلية ألفا أكتين ، أرنب) | HYPERMOL | 8101-01 | |
| Atto488-Actin (عضلة هيكلية ألفا أكتين ، أرنب) | HYPERMOL | 8153-01 | |
| Atto655-DOPE | ATTO-TEC | AD 655-16 | مسحوق |
| حمام سونيكاتور | برانسون & nbsp ؛ | 1510R-MTH | منظف بالموجات فوق الصوتية برانسونيك |
| بيوتين أكتين (عضلة هيكلية ألفا أكتين ، أرنب) | HYPERMOL | 8109-01 | |
| BSA | Sigma Aldrich | A6003 | |
| جهاز طرد مركزي | Eppendorf | 5424R | |
| طرد مركزي | Eppendorf | 5804 R | |
| كلوروفورم | سيجما ألدريتش | 67-66-3 | |
| الكوليسترول (الأغنام) | Avanti Polar Lipids | 700000 | في الكلوروفورم |
| Decane | TCI Deutschland GmbH | D0011 | |
| Fascin (إنسان ، مؤتلف) | Cytoskeleton Inc (Tebubio GmbH) | CS-FSC01-A | |
| Ficoll70 | Sigma Aldrich | F2878 | |
| Iodixanol (OptiPrep) | سيجما ألدريتش | D1556 | |
| LSM800 ليزر متحد البؤر مجهر المسح | كارل زايس | C-Apochromat 40 & thinsp ؛ & مرات; &thinsp ؛ / 1.2 هدف الغمر في الماء. ليزر الحالة الصلبة الذي يتم ضخه بصمام ثنائي: 488 & thinsp ؛ نانومتر و 640 & thinsp; نانومتر. | |
| الزيوت المعدنية | سيجما ألدريتش | 8042-47-5 | |
| الميوسين الثاني (عضلة الهيكل العظمي للأرانب) شركة | الهيكل الخلوي (Tebubio GmbH) | MY02-A | |
| Neutravidin | Thermo Fisher Scientific Inc. | 31000 | |
| مقياس التناضح | Fiske Associates | Fiske Micro-Osmometer نموذج 120 | |
| Greiner Bio-One | جي إم | إتش 07-000-109 |
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن