يصف هذا البروتوكول إعادة البرمجة في الجسم الحي لخلايا سرطان الفئران إلى خلايا شبيهة بالتغصنات من النوع 1 داخل البيئة المكروية للورم من خلال التعبير القسري عن عوامل النسخ PU.1 و IRF8 و BATF3.
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
يصف هذا البروتوكول إعادة البرمجة في الجسم الحي لخلايا سرطان الفئران إلى خلايا شبيهة بالتغصنات من النوع 1 داخل البيئة المكروية للورم من خلال التعبير القسري عن عوامل النسخ PU.1 و IRF8 و BATF3.
تعتمد فعالية العلاج المناعي للسرطان على تجنيد وتنشيط استجابات الخلايا التائية السامة للخلايا ضد الأورام الصلبة بواسطة الخلايا المتغصنة التقليدية من النوع 1 (cDC1s). ومع ذلك ، فإن توليد cDC1s للعلاج المناعي للسرطان يواجه قيودا كبيرة ، بما في ذلك ضعف إنتاجية الخلايا ، وعدم التجانس الوظيفي ، والقابلية لكبت المناعة في البيئة المكروية للورم (TME). لقد طورنا مؤخرا طريقة علاج مناعي تعتمد على إعادة برمجة الخلايا السرطانية في الجسم الحي إلى خلايا شبيهة ب cDC1 المناعية ، مما مكن الخلايا السرطانية من تقديم مستضدات الورم على أنها cDC1s وأثارت استجابات الخلايا التائية السامة للخلايا متعددة النسيلة ومناعة جهازية دائمة مضادة للورم. هنا ، نصف بروتوكولا قابلا للتتبع لتوليد خلايا شبيهة ب cDC1 داخل TME عن طريق الإفراط في التعبير عن الحد الأدنى من الشبكة التنظيمية للجينات الخاصة ب cDC1 - PU.1 و IRF8 و BATF3 (يشار إليها مجتمعة باسم PIB) - في الخلايا السرطانية ، متبوعا بزرع تحت الجلد لمزيج من الخلايا المنقولة والأبوية. يقود الإفراط في التعبير PIB إلى الاستحواذ التدريجي على علامة المكونة للدم CD45 ومركب عرض المستضد الاحترافي معقد التوافق النسيجي الكبير من الفئة الثانية على الخلايا السرطانية ، حيث يعمل كقراءات لسطح الخلية لإعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي . عند مقارنتها بعملية إعادة البرمجة في المختبر ، أظهرت إعادة برمجة نموذج الورم الميلانيني للفأر YUMM1.7 في الجسم الحي حركية أسرع وكفاءة أعلى. تسببت الخلايا الشبيهة ب cDC1 في إعادة تشكيل سريعة ل TME عن طريق تجنيد الخلايا المناعية المضيفة خلال الأيام الثلاثة الأولى وتؤدي إلى تكوين بنية ليمفاوية ثلاثية بحلول اليوم 9. استمرت الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها في الأورام لمدة 9 أيام على الأقل ولكن لم يتم اكتشافها في اليوم 15. يوفر بروتوكول إعادة برمجة cDC1 الموصوف هنا في الجسم الحي طريقة قابلة للتتبع وقوية لتحويل الأورام "المناعية الباردة" بشكل فعال إلى "مناعة ساخنة". بشكل عام ، فإنه يوفر منصة قوية لدراسة الآليات الكامنة وراء المناعة المضادة للورم بوساطة cDC1 والكشف عن التركيبات التآزرية مع طرق العلاج المناعي الأخرى للسرطان.
أدت التطورات الحديثة في طرق العلاج المناعي للسرطان ، بما في ذلك حصار نقاط التفتيش المناعية (ICB) ، والعلاج بالخلايا بالتبني (ACT) ، واللقاحات ، إلى تغيير مشهد علاجالسرطان 1. في الورم الميلانيني ، يمكن أن تصل معدلات الاستجابة لبروتين موت الخلايا المبرمج 1 (PD-1) وتثبيط البروتين المرتبط بالخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا 4 (CTLA-4) إلى 60٪ 2. ومع ذلك ، فإن أكثر من 40٪ من مرضى الورم الميلانيني يفشلون في الاستجابة للICB ، وتظل معدلات الاستجابة في السرطانات الأقل مناعة ، مثل سرطان الثدي وسرطان القولون والمستقيم المستقر بالأقمار الصناعية الدقيقة والورم الأرومي الدبقي ، أقل من 5٪ ، مما يسلط الضوء على الفجوات السريرية3،4،5. يتمثل أحد العوائق الرئيسية أمام النجاح السريري الواسع في ضعف تنشيط استجابات الخلايا التائية السامة للخلايا ، والتي تعتمد على العرض الفعال للمستضد داخل البيئة المكروية للورم (TME) 6.
الخلايا المتغصنة التقليدية من النوع 1 (cDC1s) نادرة ، ولكنها لا غنى عنها لبدء المناعة الخاصة بالورم ، حيث تقدم ثلاث إشارات رئيسية لاستجابات الخلايا التائية الأولية: (1) المعالجة الاحترافية وعرض المستضدات على مجمعات التوافق النسيجي الرئيسية (MHC) من الفئة الأولى والثانية ، (2) التحفيز المشترك عبر CD80 و CD86 ، و (3) إشارات السيتوكين المؤيدة للالتهابات بما في ذلك IL-127،8. من بين المجموعات الفرعية للخلايا المتغصنة (DC) ، تتفوق cDC1s في تقديم المستضدات المرتبطة بالخلايا السرطانية لتشغيل خلايا الذاكرة CD8 + T الساذجة أو إعادة تنشيطها أو دفع تمايز الخلايا التائية CD4 + إلى خلايا المساعدة من النوع 1 T (TH1)9. بالإضافة إلى ذلك ، فإن cDC1s هي المنتجين الرئيسيين للكيموكينات ، روابط الكيموكين 9 و 10 (CXCL9 / 10) ، والتي تتوسط تجنيد الخلايا التائية في أنسجة الورم10،11،12،13. على مدى السنوات القليلة الماضية ، سلطت العديد من الدراسات الضوء على أن رفض الورم والاستجابات الفعالة ل ICB أو ACT ترتبط ارتباطا وثيقا بوجود cDC1s داخل الورم12،13. ومن ثم ، فقد تطورت cDC1s كهدف جذاب للعلاج المناعي للسرطان ويمكن أن يكون لتسخير ميزاتها الفريدة بنجاح إمكانات انتقالية كبيرة.
تعتمد الطرق الحالية لتوليد cDC1s على عزل الدم أو تمايزه من أسلاف CD34 + أو الخلايا الجذعية متعددةالقدرات 14،15،16. تعتمد الاستراتيجيات السريرية السائدة على عزل مزيج من مجموعات فرعية من DC الذاتية من الدم وتحفيزها خارج الجسم الحي باستخدام ناهضات مستقبلات شبيهة بالحصيلة أو السيتوكينات المؤيدة للالتهابات للحث على برنامج مناعي ناضج قبل إعادة التسريب16. ومع ذلك ، فإن هذه الاستراتيجيات محدودة بسبب ضعف نضج الخلايا ، والحواجز المثبطة للمناعة في TME ، وعدم تجانس المجموعة الفرعية في خليط DC المنقوع ، حيث توجد نسبة صغيرة فقط من cDC1s7. علاوة على ذلك ، فإن عزل cDC1s فقط للعلاج المناعي للسرطان أو التطعيم يمثل تحديا بسبب وفرة منخفضة للغاية في الدم المحيطي (<0.3٪)16. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن إنتاج cDC1s من الخلايا السلفية CD34 + أو الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات باستخدام السيتوكينات وإشارات NOTCH. ومع ذلك ، تتطلب هذه الأساليب بروتوكولات معقدة وطويلة وتنتج أعدادا منخفضة ومجموعات غير متجانسة من المجموعات الفرعية DC17،18،19.
لمعالجة هذه القيود ، توفر إعادة البرمجة في الجسم الحي استراتيجية مناسبة للعلاج المناعي للسرطان لتوليد خلايا شبيهة ب cDC1 ، والتي تشبه الخصائص المظهرية والنسخية والوظيفية ل cDC1s20. من خلال الإفراط في التعبير عن الحد الأدنى من الشبكة التنظيمية للجينات الخاصة ب cDC1 - PU.1 و IRF8 و BATF3 (يشار إليها مجتمعة باسم PIB) - تمت إعادة برمجة الخلايا الليفية والخلايا اللحمية والخلايا السرطانية تدريجيا إلى خلايا شبيهة ب cDC1 مما يتيح معالجة مستضد الورم وعرضه على معقد التوافق النسيجي الكبير من الفئة الأولى والثانية ، والإشارات التحفيزي المشترك عبر CD80 و CD86 ، وإفراز السيتوكين / الكيموكين ، بما في ذلك CXCL9 / 10 و IL-1220 ، 21،22،23. تقدمت إعادة برمجة cDC1 بشكل أسرع وأكثر كفاءة عبر الطعوم الغريبة البشرية في الجسم الحي وبشكل مستقل عن تثبيط المناعة ، مما أدى إلى توليد خلايا شبيهة ب cDC1 مع توقيع مناعي ناضج20. في أورام الورم الميلانيني الزاوي ، لاحظنا أن الخلايا الشبيهة ب cDC1 أعادت تشكيل TME ، وأثارت تكوين بنية ليمفاوية ثلاثية (TLS) ، وقامت بتجنيد وتوسيع الخلايا التائية متعددة النسيلة TH1 والذاكرة السامة للخلايا ، مما أدى إلى مناعة جهازية طويلةالأمد 20. أخيرا ، قمنا بتطوير طريقة جديدة للعلاج المناعي للسرطان تعتمد على إعادة برمجة الخلايا السرطانية في الموقع إلى خلايا شبيهة ب cDC1 عن طريق الحقن داخل الورم لنواقل الفيروساتالغدية 20. تمهد هذه النتائج الطريق للترجمة السريرية لإعادة برمجة cDC1 كطريقة جديدة للعلاج المناعي للسرطان يمكنها تسخير الخصائص الوظيفية ل cDC1s.
هنا ، نقدم بروتوكولا قابلا للتتبع لإنشاء خلايا شبيهة ب cDC1 داخل TME بناء على إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي. يسمح توصيل الفيروسات العدسية ل PIB إلى الخلايا السرطانية والزرع اللاحق كمزيج محدد من الخلايا السرطانية المنقولة مع الخلايا السرطانية الأبوية غير المنقولة بإعادة البرمجة في الجسم الحي لجزء خاضع للرقابة من الخلايا السرطانية داخل TME. بالإضافة إلى ذلك ، لا تقتصر هذه الطريقة على كفاءة التوصيل في الموقع للنواقل الفيروسية20. نحدد خطوات الإنتاج الفعال لنواقل الفيروسات القشرية ، والمعايرة الوظيفية ، وإعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي باستخدام نموذج الورم الميلانيني المتزاوي ، YUMM1.7 ، كمثال. نقوم بتفصيل الإعداد التجريبي واستراتيجية البوابات لتحليل الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها في الجسم الحي عن طريق قياس التدفق الخلوي بعد تفكك الورم. نقدم أيضا خطوات تقييم التغييرات في TME من خلال إجراء الحفظ بالتبريد والتقسيم وتلوين التألق المناعي لأقسام الورم ، متبوعا بالفحص المجهري متحد البؤر. أخيرا ، نتناول كيفية مراقبة المناعة التي يسببها cDC1 عن طريق قياس نمو الورم والبقاء على قيد الحياة. يوفر هذا النهج القابل للتتبع والقابل للتطوير للباحثين أداة قيمة لتقييم استراتيجيات العلاج الاندماجية من خلال إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي ، لتوصيف التغييرات في تكوين التكوين الجديد TME و TLS عبر نماذج السرطان أو إجراء شاشات كبيرة لتعديل التعبير عن المسارات المناعية المختلفة ، على سبيل المثال ، عرض المستضد أو إفراز السيتوكين / الكيموكين ، وكشف تأثيرها على المناعة المضادة للأورام.
تم تنفيذ إجراءات التجارب على وفقا للوائح السويدية بعد موافقة المجلس السويدي للزراعة.
1. إعداد الكاشف
2. إنتاج فيروس العدسي
3. معايرة الفيروس الوظيفية
ملاحظة: يجب تكرار هذه الخطوة لكل دفعة من الفيروسات العدسية لتحديد الجرعة الفيروسية المثلى المطلوبة لتحقيق نسبة 1: 1 من الخلايا المنقولة (eGFP +) إلى الخلايا غير المنقولة (eGFP-).
4. إنشاء الورم تحت الجلد لإعادة البرمجة في الجسم الحي
5. عزل الورم لتحليل قياس التدفق الخلوي
6. تجميد الورم والتقطيع لتحليل الفحص المجهري متحد البؤر
7. تلطيخ التألق المناعي لأقسام الورم
يتم تقديم نظرة عامة تخطيطية على بروتوكول إعادة البرمجة القابل للتتبع في الجسم الحي في الشكل 1. أولا ، أنتجنا ناقل الفيروسات العدسية متعدد السيسترونيك SFFV-PIB-IRES-eGFP (PIB-eGFP) ، وترميز عوامل إعادة البرمجة الإرشادية ل cDC1 PU.1 و IRF8 و BATF3 ، متبوعا بموقع دخول الريبوسومي الداخلي (IRES) وبروتين الفلورسنت الأخضر المعزز (eGFP) في خط خلايا التعبئة والتغليف HEK 293T. للتحكم في المناعة بوساطة فيروس العدس، أنتجنا متجها فارغا من SFFV-MCS-eGFP (eGFP)، يحتوي على موقع استنساخ متعدد (MCS) و IRES-eGFP، ولكن باستثناء عوامل إعادة البرمجة. بعد الإنتاج الفيروسي ، حصدنا المادة الطافية المحتوية على فيروس العدسات وركزناها عن طريق الطرد المركزي الفائق. قمنا بمعايرة الفيروس وظيفيا لتحديد الكمية المطلوبة لتحقيق نسبة 1: 1 من الخلايا المحولة (eGFP +) إلى الخلايا غير المحولة (eGFP) ، والتي قمنا بتقييمها في اليوم 3 بعد التنبيغ. بعد ذلك ، استخدمنا كمية الفيروس الناتجة لتحويل خط الخلايا السرطانية المحدد في اليوم -1. بعد 24 ساعة ، قمنا بجمع الخلايا وزرعها تحت الجلد لإنشاء الأورام. ضمنت هذه الإستراتيجية إعادة برمجة الخلايا المنقولة إلى خلايا شبيهة ب cDC1 في الجسم الحي ، داخل TME. في النقاط الزمنية المحددة بعد النقش ، قمنا باستئصال الأورام ومعالجتها لتحليلات المصب ، بما في ذلك قياس التدفق الخلوي للخلايا السرطانية المنفصلة ، لتحديد كفاءة إعادة البرمجة في الجسم الحي ، أو تلطيخ التألق المناعي لأقسام الورم المحفوظة بالتبريد لتوصيف التغييرات في TME.
أولا ، لضمان إنتاج عيارات عالية من الفيروسات العدسية ، قمنا بمراقبة خلايا HEK 293T قبل التعدي ، بهدف الوصول إلى 70-80٪ التقاء وبعد 24 ساعة ، قمنا بتقييم كفاءة التعدي من خلال تعبير eGFP عن طريق المجهر الفلوري (الشكل 2 أ). بعد ذلك ، قمنا بجمع متوسط يحتوي على فيروسات بعد 48 ساعة و 60 ساعة من التعدي ، وقمنا بطرده المركزي الفائق ، وتخزينه في حصص عند -80 درجة مئوية (الشكل 2 ب). بعد ذلك ، حددنا الكمية الفيروسية المثلى المطلوبة لتحقيق نسبة 1: 1 من خلايا eGFP + إلى eGFP في خلايا الورم الميلانيني YUMM1.7. قمنا بزرع 105 خلايا YUMM1.7 لكل بئر في صفيحة مكونة من 6 آبار ، وقمنا بتحويل الخلايا بكميات متزايدة من فيروس العدسات ، واستبدلنا المادة الطافية المحتوية على الفيروس بوسائط كاملة جديدة من DMEM / F12 بعد 24 ساعة (الشكل 2 ج). في اليوم 3 ، قمنا بتقييم تعبير eGFP عن طريق الفحص المجهري الفلوري ، قبل الشروع في تحديد النسب المئوية الدقيقة لخلايا eGFP + عن طريق قياس التدفق الخلوي (الشكل 2 ج). لتحديد نسبة eGFP + إلى خلايا eGFP ، قمنا ببوابات في خلايا مفردة حية لاستبعاد الخلايا الميتة والمزدوجات (الشكل 2 د). تم تحديد الحجم الأمثل لدفعة الفيروسات العدسية المنتجة لكل من PIB-eGFP وفيروس التحكم eGFP على أنه 2 ميكرولتر لكل 105 خلايا YUMM1.7 ، مما أدى إلى 50.0 ± 0.3٪ و 63.0 ± 0.9٪ eGFP + ، على التوالي (الشكل 2E).
بعد ذلك ، لتقييم كفاءة إعادة البرمجة في الجسم الحي ، قمنا بإنشاء خط خلايا سرطانية مصنف بالفلورسنت (mCherry +) (YUMM1.7-mCherry). هذا يضمن أنه يمكننا التمييز بين الخلايا السرطانية والخلايا اللحمية أو المناعية عن طريق البوابات في خلايا mCherry + الحية في تحليل قياس التدفق الخلوي (الشكل 3 أ ، ب). ثم قمنا بتحويل خلايا YUMM1.7-mCherry مع 2 ميكرولتر من PIB-eGFP أو التحكم في فيروس eGFP لكل 105 خلايا لتحقيق نسبة 1: 1 eGFP + إلى eGFP. قمنا بزرع 1.6 × 106 خلايا تحت الجلد لكل ورم في الفئران CD45.1 واحتفظنا بكمية من الخلايا للزراعة في المختبر للمقارنة. قمنا بتقييم كفاءة إعادة البرمجة عن طريق قياس التدفق الخلوي ، وبوابة خلايا mCherry + eGFP + و CD45.1- الحية لاستبعاد الخلايا المناعية المضيفة التي ابتلعت eGFP أو mCherry (الشكل 3 ب). من الأيام 1 إلى 9 ، لاحظنا الاستحواذ التدريجي على تعبير CD45.2 و / أو معقد التوافق النسيجي الكبير - II ، مما يشير إلى الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها جزئيا (CD45.2 + MHC-II- أو CD45.2- MHC-II +) والخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها بالكامل (CD45 + MHC-II +) (الشكل 3 ج). لقد تحققنا من أن إعادة برمجة خلايا سرطان الفئران في الجسم الحي أدت إلى نسب أعلى من الخلايا الشبيهة ب cDC1 في اليوم 9 مقارنة بالظروف المختبرية (9.54 ± 1.54٪ CD45 + MHC-II + في الجسم الحي مقابل 4.72 ± 1.1٪ CD45 + MHC-II + في المختبر ، P = 0.018). كما تم تسريع حركية إعادة البرمجة حيث لاحظنا نسبة أعلى من الخلايا الشبيهة ب cDC1 في وقت مبكر من اليوم الرابع (8.7 ± 3.3٪ CD45 + MHC-II + في الجسم الحي مقابل 0.3 ± 0.1٪ CD45 + MHC-II + في المختبر ، P = 0.05) ، مما يشير إلى أن وجود إشارات بيئية يعزز إعادة برمجة أسرع وأكثر كفاءة نحو الخلايا الشبيهة ب cDC119. بينما كانت الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها في المختبر موجودة حتى اليوم 15 ، استمرت الخلايا الشبيهة ب cDC1 في الجسم الحي لمدة 9 أيام ، ولكن لم يتم اكتشافها بحلول اليوم 15 ، مما يشير إلى استنفاد الجهاز المناعي المضيف من TME (الشكل 3C).
أخيرا ، هدفنا إلى توصيف التغييرات المبكرة ل TME نتيجة لإعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي في أول 9 أيام. أجرينا تلطيخا مناعيا بالفلورة المناعية لأنسجة الورم المحفوظة بالتبريد والمقطعة من أورام eGFP و PIB-eGFP بعد 3 و 9 أيام من إعادة البرمجة في الجسم الحي ، مع التركيز على تسلل الخلايا المناعية التي تتميز بعلامة المكونة للدم CD45. والجدير بالذكر أن الخلايا الشبيهة ب cDC1 جندت المزيد من خلايا CD45 إلى TME بسهولة في اليوم 3 ، مقارنة بأورام eGFP (49.6 ± 17.0 مقابل 8.0 ± 5.8 eGFP متوسط شدة التألق لتلوين CD45 لكل منطقة ورم. الشكل 4 أ ، ب). ومن المثير للاهتمام ، أننا اكتشفنا TLS داخل TME للأورام بعد 9 أيام من إعادة البرمجة في الجسم الحي. يشير هذا إلى أن الخلايا الشبيهة ب cDC1 يمكنها إعادة تشكيل TME بسرعة من بيئة "مناعية باردة" إلى بيئة "مناعية ساخنة" في غضون 3 أيام ، مما يؤدي لاحقا إلى تكوين TLS في اليوم 9.

الشكل 1: نظرة عامة على البروتوكول لتوليد خلايا شبيهة ب cDC1 عن طريق إعادة برمجة الخلايا السرطانية في الجسم الحي . يتم إنتاج ناقلات الفيروسات النسية SFFV-PIB-IRES-eGFP-ترميز PU.1 و IRF8 و BATF3 في كاسيت متعدد السترونيك تحت سيطرة محفز الفيروسات المكونة للتركيز على الطحال (SFFV) و eGFP بعد موقع دخول الريبوسوم الداخلي (IRES) لتتبع الخلايا المنقولة عن طريق قياس التدفق الخلوي والفحص المجهري الفلوري - في خط خلايا التعبئة HEK 293T. بعد ذلك ، يتم طرد النواقل الفيروسية العدسية بالطرد المركزي الفائق ومعايرة وظيفيا لتحديد كمية الفيروس المطلوبة لنقل الخلايا السرطانية بنسبة 1: 1 eGFP + المحولة إلى خلايا eGFP غير المحقولة. بالنسبة لتجارب إعادة البرمجة في الجسم الحي ، يتم طلاء الخلايا السرطانية بالكمية المثلى من فيروس العدسات في اليوم -1. في اليوم التالي ، يتم غسل هذا المزيج 1: 1 من GFP + المحولة وخلايا GFP غير المحولة وجمعها لإنشاء الورم تحت الجلد في الفئران. يتم الحفاظ على الثقافات المتوازية في المختبر للتحقق من صحة التنبيغ في اليوم 3 عن طريق قياس التدفق الخلوي. تتم مراقبة كل 2-3 أيام لنمو الورم والبقاء على قيد الحياة. يتم جمع الأورام في نقاط زمنية محددة ، ويتم فصلها وتلطيخها للتعبير عن علامة السطح لتحليل قياس التدفق الخلوي. بدلا من ذلك ، يتم إصلاح الأنسجة بأكملها وحفظها بالتبريد وتقسيمها من أجل تلطيخ التألق المناعي وتحليل المجهر متحد البؤر. يتم تقييم كفاءة إعادة البرمجة في الجسم الحي عن طريق تحليل قياس التدفق الخلوي ، بينما تتميز التغييرات في البيئة المكروية للورم بالتصوير متحد البؤر. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: إنتاج فيروس العدسات ومعايرة حجمه الوظيفية لإعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي.(أ) عندما تصل خلايا HEK 293T إلى ~ 70-80٪ من التقاء ، يتم نقلها بخليط يحتوي على 10 ميكروغرام من بلازميد النقل إما SFFV-PIB-eGFP (PIB-eGFP) أو التحكم في ناقلات الفيروسات العسقرية SFFV-eGFP (eGFP) ، جنبا إلى جنب مع 7.5 ميكروغرام من psPAX2 ، و 2.5 ميكروغرام من mPD2.G و 60 ميكرولتر من 1 مجم / مل PEI. تظهر صور المجهر الساطع والفلوري لخلايا HEK 293T تعبير eGFP بعد 24 ساعة من التعداء ، مما يشير إلى تسليم البلازميد الناجح. أشرطة المقياس = 200 ميكرومتر. (ب) التمثيل التخطيطي لسير عمل الطرد المركزي الفائق لتركيز فيروس العدس. يتم جمع المادة الطافية المحتوية على فيروس العدسي لخلايا HEK 293T بعد 48 ساعة و 60 ساعة من التعدي ، ويتم ترشيحها من خلال مرشح PES المرتبط بالبروتين منخفض البروتين 0.45 ميكرومتر ، ويتم وزن 37 جم في أنابيب البولي بروبيلين ذات الجدران الرقيقة المفتوحة باستخدام مقياس مقاعد البدلاء. يتم طرد الأنابيب بشكل فائق في دوار دلو متأرجح ، ويتم شفط المادة الطافية ، وتجفيف الحبيبات لمدة 5 دقائق. ثم يتم تعليق الكريات في DMEM المثلج البارد الذي يحتوي على HEPES وتحضينها طوال الليل قبل الاقتباس والتخزين عند -80 درجة مئوية. (ج) الإستراتيجية التجريبية للمعايرة بالتحليل الحجمي الوظيفية لتحديد الجرعة الفيروسية المثلى لتحقيق نسبة 1: 1 من خلايا GFP + إلى GFP. تظهر صور المجهر اللامع والفلوري اللامع تعبير eGFP في خلايا الورم الميلانيني YUMM1.7 ، بعد 72 ساعة من التنبيغ ، مما يشير إلى التسليم الناجح لعوامل إعادة البرمجة و eGFP. أشرطة المقياس = 100 ميكرومتر. (د) مخططات قياس التدفق الخلوي التمثيلية التي توضح استراتيجية البوابات لتحديد نسبة خلايا eGFP +. تم تسيير الخلايا الحية للبقاء للسكان السلبيين للصبغة (DAPI) متبوعا بالاستبعاد المزدوج. (ه) قياس التدفق الخلوي لكفاءة التنبيغ مع زيادة الجرعات الفيروسية لتحديد الحجم الأمثل لتحقيق خلايا 1: 1 GFP + / GFP. بالنسبة لكل من PIB-eGFP و eGFP lentivirus ، حقق حجم 2 ميكرولتر لكل 105 خلايا النسبة المطلوبة. الاختصارات: cDC1s = النوع 1 الخلايا المتغصنة التقليدية. DAPI = 4',6-diamidino-2-phenylindole; PIB = PU.1 و IRF8 و BATF3 ؛ جزيرة الأمير إدوارد = بولي إيثيلينيمين. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: تقييم كفاءة إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي. (أ) التمثيل التخطيطي لسير العمل التجريبي لتقييم كفاءة إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي. يتم نقل الخلايا السرطانية في البداية بفيروس عدسي يعبر عن mCherry لتوليد خط خلوي مصنف بالفلورسنت (YUMM1.7-mCherry) ، متبوعا بالنقل بالجرعة المثلى من فيروس العدسات PIB-eGFP في اليوم -1. ثم يتم حقن الخلايا تحت الجلد بنسبة 1: 1 من خلايا eGFP + / eGFP في اليوم 0 لإنشاء أورام في الفئران CD45.1 والسماح للخلايا المنقولة PIB بإعادة البرمجة إلى خلايا شبيهة ب cDC1 داخل TME. ثم يتم عزل الأورام في نقاط زمنية محددة ، وفصلها ، وتلطيخها ل CD45.1 و CD45.2 و MHC-II باستخدام قياس التدفق الخلوي. يسمح ذلك باستبعاد الخلايا المناعية المضيفة CD45.1 لتحديد كفاءة إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي عن طريق التعبير عن CD45.2 و MHC-II. يتم الاحتفاظ بالثقافات المتوازية في المختبر طوال النقاط الزمنية كمقارنة بإعادة البرمجة في الجسم الحي. (ب) مخططات قياس التدفق الخلوي التمثيلية التي توضح استراتيجية البوابات في اليوم 9. تم بوابات الخلايا على mCherry + و GFP + لتحديد الخلايا السرطانية المنقولة بنجاح. تم استبعاد الخلايا المناعية المضيفة عن طريق إخراج خلايا CD45.1 +. (ج) القياس الكمي لكفاءة إعادة البرمجة في الجسم الحي (يسار) لخلايا YUMM1.7-mCherry عن طريق قياس التدفق الخلوي كنسبة مئوية لخلايا CD45 + MHC-II + (معاد برمجتها بالكامل) و CD45.2 + HLA-DR- أو CD45.2- HLA-DR + cDC1 (معاد برمجتها جزئيا) مسورة داخل eGFP + mCherry + خلايا. مخططات قياس التدفق الخلوي التمثيلية (على اليمين) تظهر الاستحواذ التدريجي على تعبير CD45.2 و MHC-II في خلايا YUMM1.7-mCherry المنقولة بواسطة PIB-eGFP خلال النقاط الزمنية المحددة. تم استخدام خلايا YUMM1.7-mCherry المنقولة بواسطة eGFP كعنصر تحكم وتم استخدام خلايا شبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها في المختبر للمقارنة. تشير البيانات الواردة في (C) إلى متوسط ± SD ل 3-5 تجارب تكرار بيولوجية. تم إجراء التحليل الإحصائي في (C) لخلايا CD45 + MHC-II + باستخدام اختبار مان ويتني. * ص < 0.05. الاختصارات: cDC1s = النوع 1 الخلايا المتغصنة التقليدية. PIB = PU.1 و IRF8 و BATF3 ؛ TME = بيئة مكروية للورم. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: تحليل التسلل المناعي في البيئة المكروية للورم بعد إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي . (أ) صور متحدة البؤر تمثيلية تظهر خلايا CD45 + في أورام YUMM1.7 بعد الزرع تحت الجلد ل PIB-eGFP- أو التحكم في الخلايا المنقولة بواسطة eGFP (نسبة 1: 1 من الخلايا المنقولة إلى الخلايا الأبوية) في اليومين 3 و 9. أشرطة المقياس = 500 ميكرومتر. (ب) القياس الكمي ل MFI لتلوين CD45 في أورام YUMM1.7 المعالجة ب PIB والسيطرة عليها في اليومين 3 و 9. تشير البيانات الواردة في (ب) إلى متوسط ± SD ل 3-6 تجارب بيولوجية مكررة. تم إجراء التحليل الإحصائي في (B) باستخدام اختبار مان ويتني. *P < 0.05 و ***P < 0.001. الاختصارات: cDC1s = النوع 1 الخلايا المتغصنة التقليدية. PIB = PU.1 و IRF8 و BATF3 ؛ MFI = متوسط شدة الفلورة. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
في هذا البروتوكول ، نصف طريقة قابلة للتتبع لتوليد خلايا شبيهة ب cDC1 بناء على إعادة برمجة الخلايا السرطانية في الجسم الحي من الأورام الصلبة. توضح نتائجنا أن الإفراط في التعبير عن PU.1 و IRF8 و BATF3 يدفع إلى الاستحواذ التدريجي على النمط الظاهري cDC1 في TME حتى اليوم 9 ، وبعد ذلك يتم استنفاد الخلايا الشبيهة ب cDC1 من الأورام. في النهاية ، يؤدي هذا إلى زيادة تسلل خلايا CD45 إلى TME بحلول اليوم الثالث ، مما يتسبب في إعادة تشكيل TME "المناعي البارد" ليصبح "حارا للمناعة".
تشمل البروتوكولات الحالية لتوليد cDC1 إثراء التيار المستمر الذاتي من الدم المحيطي ، أو التمايز من الخلايا السلفية المكونة للدم CD34 + ، أو التمايز من الخلايا الجذعية متعددة القدرات14،15،16،17،18،19. ومع ذلك ، فإن هذه الطرق تقدم عوامل محدودة: النضج غير الكافي ، وانخفاض عرض المستضد والقدرة الإنتاجية للسيتوكين / الكيموكين في الجسم الحي ، والقابلية لتثبيط المناعة ، وعدم تجانس التيار المستمر العالي ، وانخفاض عدد الخلايا المتولدة7. هنا ، نقدم بروتوكولا يسمح بتوليد خلايا شبيهة ب cDC1 في الجسم الحي للدراسات الوظيفية والميكانيكية.
باستخدام هذه الطريقة ، اختبرنا ما إذا كان التعبير عن تركيبة عامل النسخ PU.1 و IRF8 و BATF3 كافيا لدفع إعادة البرمجة في الجسم الحي . يتيح هذا البروتوكول التحكم الدقيق في كفاءة التوصيل ، حيث يؤثر تغيير جرعة الخلايا المعدلة وراثيا المزروعة بشكل مباشر على فعالية العلاج. لقد أظهرنا سابقا أن 2٪ من الخلايا المنقولة ، والتي تتوافق مع 0.15٪ CD45 + و MHC-II + cDC1 ، كافية لاستنباط مناعة مضادةللورم 20. علاوة على ذلك ، يشير التسلل المناعي السريع الذي لوحظ في اليوم 3 إلى أن الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها جزئيا نشطة وظيفيا في الجسم الحي ، حيث لا توجد زيادة كبيرة في الخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها بالكامل في هذه المرحلة الزمنية. في المستقبل ، سيكون من المثير للاهتمام الكشف عن الدور الوظيفي للخلايا الشبيهة ب cDC1 المعاد برمجتها جزئيا مقابل المعاد برمجتها بالكامل في الفعالية المضادة للورم باستخدام نواقل معدلة تحتوي على جين انتحاري للحث على موت الخلايا في مجموعات خلايا مختارة في نقاط زمنيةمحددة 24. يمكن استخدام هذا البروتوكول أيضا لاستكشاف الجمع مع المواد المساعدة اللاجينية ، والتي يمكن أن تزيد من كفاءة إعادةالبرمجة 25. أخيرا ، يمكن أيضا تكييف هذه الطريقة لتوليد أنواع فرعية أخرى من DC في الجسم الحي ، وإطلاق أنواع مختلفة من الاستجابات المناعية ، على سبيل المثال ، الاستجابات المضادة للفيروسات أو التحمل14. بالإضافة إلى ذلك ، يمكننا تسخير إعادة البرمجة في الجسم الحي كمنصة لأداء شاشات مشفرة لمجموعات عوامل النسخ لتوليد أنواع متنوعة من الخلايا المناعية. يمكن أن يزيد هذا الاحتمال من مرونة العلاجات من خلال الاستفادة من الخصائص الوظيفية المتنوعة لمجموعات فرعية مناعية محددة.
في دراستنا السابقة ، أظهرنا أن البيئة المثبطة للمناعة في الجسم الحي لا تعيق إعادة برمجة الخلايا السرطانية البشرية إلى cDC1s20 المناعي. في هذه المقالة ، نوضح أنه في الفئران ، تكون إعادة البرمجة أكثر سرعة وكفاءة في الجسم الحي منها في المختبر ، مما يشير إلى أن إعادة البرمجة المحسنة التي لوحظت في الجسم الحي هي ظاهرة محفوظة عبر كلا النوعين. ومع ذلك ، فإن أحد قيود هذه الطريقة هو عدم وجود بيئة في الجسم الحي أثناء التسليم الأولي للنواقل. وبالتالي ، لا يمكنها تمييز ما إذا كانت الإشارات البيئية تؤثر على كفاءة التسليم في الجسم الحي . يجب تحديد ذلك في الموقع من خلال مقارنة الشقوق المختلفة. يمكن مقارنة نواقل الفيروسات الغدية ، التي حددناها على أنها أكثر كفاءة من نواقل الفيروسات العسقرية للتوصيل في الموقع 20 بالشقوق غير الفيروسية مثل الحمض النووي الريبي الخطي والدائري وذاتي التضخيم أو كوكتيلات الجزيئاتالصغيرة 26،27.
لقد أظهرنا سابقا أن إعادة برمجة cDC1 تمنح الخلايا السرطانية إفراز السيتوكين المؤيد للالتهابات وإفراز الكيموكينات المجندة للخلايا الليمفاوية ومعالجة المستضد الاحترافي والعرض التقديمي على معقد التوافق النسيجي الكبير الأول و MHC-II في نماذج الورم الميلانيني23،28. ينتج عن هذا إعادة تشكيل TME من حالة "البرد المناعي" إلى الحالة "المناعية الساخنة" عن طريق تحفيز تكوين TLS ، مما يزيد من تسلل الخلايا التائية المستجيبة للخلايا والخلايا القاتلة الطبيعية والخلايا البائية ، ويقلل من المجموعات المثبطة للمناعة مثل الخلايا التائية التنظيمية والمنهكة20. في المرضى ، تم ربط الاستجابات الإيجابية للعلاج المناعي بوجود TLS داخل الأورام ، حيث يولد تحضير الخلايا التائية والبائية المستمرة ضد مستضدات الورم استجابات للأجسام المضادة الخاصةبالورم 29،30. في المستقبل ، نتصور استخدام بروتوكول إعادة برمجة cDC1 القابل للتتبع في الجسم الحي لكشف آليات تكوين TLS المستحث ، وإعادة تشكيل TME والمناعة المضادة للأورام عبر أنواع السرطان المختلفة وتوصيف ما إذا كان إنتاج الأجسام المضادة الخاصة بالورم قد تم تحفيزه.
لقد لاحظنا سابقا التآزر بين إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي و ICB مع مضاد PD-1 أو مضاد CTLA-420. يشير هذا إلى أن TME "المناعي الساخن" الذي تم إنشاؤه بواسطة إعادة برمجة cDC1 يمكن أن يوفر بيئة مواتية للتوليفات المحتملة مع العلاجات المناعية الأخرى مثل ACT بما في ذلك مستقبلات الخلايا التائية (TCR) - الخلايا التائية ، أو الخلايا التائية المستقبلية للمستضد الخيمري (CAR) - الخلايا التائية ، أو الخلايا الليمفاوية المتسللة للورم (TILs). ميزة أخرى لهذه الطريقة هي إمكانية إجراء شاشات اندماجية أو CRISPR كبيرة غير متحيزة ، حيث يمكن الإفراط في التعبير عن المستقبلات المناعية أو السيتوكينات أو الكيموكينات أو السموم اللمفاوية أو استنفادها في الخلايا الشبيهة ب cDC1 في أنواع الأورام المقاومة ، وبالتالي كشف دور المسارات المتميزة في تعزيز المناعة بوساطة cDC1. في الختام ، يوفر البروتوكول الحالي موردا قيما لمجتمع علمي واسع ، نظرا لأن إعادة برمجة cDC1 في الجسم الحي هي منصة مرنة وقوية للدراسات الميكانيكية والابتكار العلاجي في العلاج المناعي للسرطان.
تتمتع C.-F.P. بحصة في الأسهم وتعمل في مناصب إدارية في Asgard Therapeutics AB ، التي تطور العلاجات المناعية للسرطان بناء على تقنيات إعادة البرمجة في الجسم الحي DC. C.-F.P هو مخترع في براءات الاختراع الممنوحة US 11،345،891 و JP 7303743 و CN ZL201880005047.3 وطلبات براءات الاختراع WO 2018/185709 و WO 2022/243448 (جنبا إلى جنب مع EA) التي تحتفظ بها Asgard Therapeutics ، والتي تغطي نهج إعادة برمجة الخلايا الموضح هنا.
نشكر ماريانا لوبيز وكاميل شاتلين ، عضوين في مختبر إعادة برمجة الخلايا في تكون الدم والمناعة ، على تحرير المخطوطة وتدقيقها اللغوي.
تم إنجاز هذه الدراسة في سياق المدرسة الوطنية لأبحاث ATMP بتمويل من مجلس البحوث السويدي. تم تمويل المشاريع التي تمت مناقشتها هنا من قبل مجلس البحوث الأوروبي في إطار برنامج البحث والابتكار Horizon 2020 التابع للاتحاد الأوروبي (866448-TrojanDC and 101189370) ، Novo Nordisk Fonden (NNF22C0079466) ، مجلس الابتكار الأوروبي (101130218-RESYNC) ، Cancerfonden (23 2932 Pj) ، مجلس البحوث السويدي (2020-00615) ، الوكالة السويدية للابتكار (2024-02178) ، ALF (44410) ، FCT (2022.02338.PTDC) ، و Plano de Recuperação e Resiliência de Portugal pelo fundo NextGenerationEU (C644865576-00000005). يتم الاعتراف بمؤسسة Knut and Alice Wallenberg وكلية الطب في جامعة Lund و Region Skåne للدعم المالي السخي.
توافر المواد:
تتوفر التركيبات والنواقل المستخدمة لإعادة البرمجة من Asgard Therapeutics بموجب اتفاقية نقل المواد مع الشركة. جميع البيانات الأخرى اللازمة لتقييم الاستنتاجات الواردة في الورقة موجودة في النص الرئيسي أو المواد التكميلية.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 0.45 μ مرشح ربط منخفض البروتين ، 150 مل مرشح فراغ علوي للزجاجة | فيشر العلمي | 15983297 | |
| 2-ميركابتوإيثانول 50 ملي | ثيرموفيشر العلمية | 31350010 | |
| الجسم المضاد أحادي النسيلة CD45 المضاد للفأر (استنساخ: 30-F11) ، الفئران IgG2b ، &kappa ؛ | ثيرموفيشر العلمية | 14-0451-82 | |
| ب 6. SJL-PtprcaPepcb / BoyCrl (CD45.1) | مختبر جاكسون | 002014 | |
| محاقن الأنسولين BD Micro-Fine U-100 (0.5 مل) | فيشر العلمية | 11395751 | |
| الفئران C57BL / 6J | مختبر جاكسون | 000664 | |
| الكولاجيناز د | سيجما ألدريتش | 11088882001 | |
| مصفاة خلية Corning Falcon للاستخدام مع أنابيب مخروطية 50 مل | سيجما ألدريتش | CLS352340 | |
| نظارات غطاء كورنينج 24 × 50 مم ؛ | سيجما ألدريتش | CLS2975245 | |
| DAPI (4 '، 6-diamidino-2-phenylindole, ثنائي هيدروكلوريد) | ثيرموفيشر العلمية | د 1306 | |
| DNase I | سيجما ألدريتش | 10104159001 | |
| صبغة قابلية للحياة eBioscience قابلة للإصلاح eFluor 450 | إنفيتروجين | 65-0863-14 | |
| محلول استرجاع مستضد eBioscience IHC - درجة حموضة منخفضة (10x) | ثيرموفيشر العلمية | 00-4955-58 | |
| مصل الأبقار الجنينية (FBS) | ثيرموفيشر العلمية | A5256701 | |
| Fluoromount-G تصاعد وسيط | ثيرموفيشر العلمية | 00-4958-02 | |
| الأجسام المضادة GFP [Alexa Fluor 594] | نوفوس بيولوجيڪل | NB600-308AF594 | |
| جيبكو DMEM / خليط المغذيات F-12 (DMEM / F-12) | ثيرموفيشر العلمية | 31331028 | |
| محلول الأحماض الأمينية غير الأساسية Gibco MEM (100x) | ثيرموفيشر العلمية | 11140035 | |
| جيبكو أوبتي MEM I | ثيرموفيشر العلمية | 11058021 | |
| معهد جيبكو روزويل بارك التذكاري (RPMI) 1640 متوسط | ثيرموفيشر العلمية | 52400025 | |
| جيبكو بيروفات الصوديوم (100 ملم) | ثيرموفيشر العلمية | 11360070 | |
| محلول جيبكو تريبان بلو ، 0.4٪ | ثيرموفيشر العلمية | 15250061 | |
| الملحق GlutaMAX | ثيرموفيشر العلمية | 35050061 | |
| الماعز المضادة للفئران IgG (H + L) الأجسام المضادة الثانوية الممتزة ، متعددة النسيلة ، أليكسا فلور 488 | ثيرموفيشر العلمية | أ 11006 | |
| خلايا HEK 293T | ATTC | CRL-11268 | |
| هيكساديميثرين بروميد (بوليبرين) | سيجما ألدريتش | [إتش9268] | |
| HyClone Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) مع نسبة عالية من الجلوكوز | سيتيفا | SH30243.01 | |
| محلول HyClone Penicillin Streptomycin 100x (قلم / Strep) | سيتيفا | SV30010 | |
| محلول ملحي مخزن HyClone Phosphate (PBS) | سيتيفا | SH30028.02 | |
| كيتامينول بيطري. محلول للحقن 100 مجم / مل | MSD صحة السويد | QN01AX03 | |
| شفرة ميكروتوم - C35 | PFM الطبية | 207500005 | |
| ماوس مضاد ل CD45.2 (104) ، سطح ، APC ، أحادي النسيلة | بيوليجند | 109814 | |
| ماوس مضاد MHCII (M5 / 114.15.2) ، سطح ، PE-CY7 ، أحادي النسيلة | بيوليجند | 107630 | |
| مصل الماعز العادي | أبكام | أب7481 | |
| مصل الفئران العادي (معقم) | أبكام | أب7488 | |
| أنابيب البولي بروبيلين ذات الجدران الرقيقة المفتوحة | بيكمان كولتر علوم الحياة | 326823 | |
| بارافورمالديهايد، 16٪ وزن/حجم الخام. سولن، خال من الميثانول | ثيرموفيشر العلمية | 043368.9م | |
| pFUW-tetO-Batf3 ، ماوس تشفير كاسيت أحادي Batf3 | أدجين | 139837 | |
| pFUW-tetO-Irf8 ، ماوس تشفير كاسيت أحادي Irf8 | أدجين | 139838 | |
| pFUW-tetO-Pu.1 ، ماوس تشفير كاسيت أحادي الكاسيت Pu.1 | أدجين | 139839 | |
| البلازميد pMD2.G | أدجين | 12259 | |
| البلازميد psPAX2 | أدجين | 12260 | |
| البلازميد SFFV-eGFP (eGFP) | الاستنساخ في المنزل | - | |
| البلازميد SFFV-mCherry (mCherry) | الاستنساخ في المنزل | - | |
| البلازميد SFFV-PIB-eGFP ، ؛ ماوس تشفير كاسيت متعدد الكيسترونيك PU.1 و IRF8 و BATF3 (PIB) ؛ | الاستنساخ في المنزل | - | تتوفر التركيبات والمتجهات المستخدمة في إعادة البرمجة من Asgard Therapeutics بموجب اتفاقية نقل المواد مع الشركة |
| البولي إيثيلينمين (PEI) ، خطي ، MW 25000 ، درجة تعداء | علوم متعددة | 23966 | |
| ReadyProbes قلم عنق الرحم الحاجز المقاوم للماء | ثيرموفيشر العلمية | 3777 راند | |
| زبدات الصوديوم | سيجما ألدريتش | 303410 | |
| سكروز | سيجما ألدريتش | S7903 | |
| SuperFrost Plus التصاق مجهر الشرائح | إبريديا | J1800AMNZ | |
| مركب Tissue-Tek O.C.T. | ساكورا فينتيك | 4583 | |
| إنزيم TrypLE Express (1x) لا فينول أحمر | ثيرموفيشر العلمية | 12604021 | |
| TT Cryomold متوسط، مربع (15 × 15 × 5 مم) | ساكورا فينتيك | 4566 | |
| UltraPure 0.5 M EDTA ، درجة الحموضة 8.0 | إنفيتروجين | 15575020 | |
| الطبيب البيطري Xysol. محلول للحقن 20 مجم / مل | في إم فارما | QN05CM92 | |
| خلايا YUMM1.7 | أنتينيو |
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن