توضح هذه المقالة استخدام الفحص المجهري متحد البؤر و ImageJ لتقييم ديناميكيات الانشطار / الاندماج في الميتوكوندريا عبر مضان تبديل الصور Dendra2.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
توضح هذه المقالة استخدام الفحص المجهري متحد البؤر و ImageJ لتقييم ديناميكيات الانشطار / الاندماج في الميتوكوندريا عبر مضان تبديل الصور Dendra2.
الميتوكوندريا هي أفضل ما يميز لدورها في تخليق ATP وتعمل كمنظمين رئيسيين لعملية التمثيل الغذائي الخلوي. تفهم ديناميكيات الميتوكوندريا الحركة داخل الخلايا وبين الخلايا للميتوكوندريا ، بالإضافة إلى عمليات الانشطار / الاندماج. هذه الأحداث أساسية للحفاظ على وظيفة الميتوكوندريا من خلال الحفاظ على التوازن الخلوي ، والتشكل ، والطاقة الحيوية ، ومراقبة الجودة ، واستجابات الإجهاد. من ناحية أخرى ، يؤثر اختلال تنظيم ديناميكيات الميتوكوندريا على التشكل الخلوي ووظيفته. يمكن أن يكون القياس الدقيق لأحداث انشطار / اندماج الميتوكوندريا مؤشرا على صحة الخلية. تستخدم المنهجيات الحالية لقياس ديناميكيات الميتوكوندريا تصويرا متقدما مثل الفحص المجهري فائق الدقة ، وتقنيات التألق (استعادة التألق بعد التبييض الضوئي (FRAP)) للاتصال ، وأدوات البصريات الوراثية للتحكم الزماني المكاني. يستخدم التحليل الكمي أدوات حسابية لقياس معلمات مثل الطول والعدد والتفرع ، والتي تشير إلى توازن الانشطار / الاندماج. ومع ذلك ، تتطلب هذه الأساليب مهارات وأدوات متطورة. في هذه المقالة ، نصف استخدام الفحص المجهري متحد البؤر جنبا إلى جنب مع الأدوات المجانية للاستخدام في ImageJ (فيجي) لدراسة أحداث الانشطار / الاندماج باستخدام خاصية تبديل الصور لبروتين dendra2 ، الموسومة بالسيتوكروم الميتوكوندريا c.
الميتوكوندريا هي عضية ديناميكية تلعب دورا حيويا في إنتاج الطاقة وموت الخلايا ونقل الإشارات1. يشير مورفولوجيا الميتوكوندريا إلى حجم وشكل مقصورات الميتوكوندريا ، والتي تستجيب بشكل كبير للظروف داخل الخلايا وخارج الخلية وهي ضرورية للحفاظ على صحة الخلايا2. يمكن أن يوفر مورفولوجيا الميتوكوندريا رؤى رئيسية حول وظيفتها ، ومع ذلك ، يمكن أن تؤثر التغييرات في شكل الميتوكوندريا على التمثيل الغذائي الخلوي والصحة العامة3. ترتبط اضطرابات مورفولوجيا الميتوكوندريا بالعديد من الأمراض ، بما في ذلك الاضطرابات التنكسية العصبية والسرطان وأمراض التمثيل الغذائي4. يتم تنظيم مورفولوجيا الميتوكوندريا ديناميكيا عن طريق أحداث الاندماج والانشطار / الاندماج ، والتي تعتبر ضرورية للحفاظ على التوازن الخلوي والاستجابة لمتطلبات التمثيل الغذائي المختلفة5،6.
تساعد ديناميكيات الميتوكوندريا العضية على الاستجابة لمختلف الضغوطات ومتطلبات التمثيل الغذائي7. إنه ينطوي على انشطار / اندماج مستمر وحركة الميتوكوندريا داخل الخلايا أو بين الخلايا. تتكيف الميتوكوندريا مع متطلبات الطاقة الخلوية من خلال التغيرات في التشكل عبر أحداث الانشطار / الاندماج8. تحدد هذه العمليات شكل الميتوكوندريا وتؤثر على وظائف الميتوكوندريا مثل إنتاج الطاقة وإنتاج أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS) ومراقبة جودة الميتوكوندريا7،9،10. علاوة على ذلك ، فإن انشطار / اندماج الميتوكوندريا هي آليات موازنة تحافظ على شبكة ميتوكوندريا وظيفية11. يسمح الاندماج بتبادل محتويات الميتوكوندريا ، مما يعزز التكميل والتخزين المؤقت ضد التلف المحلي ، بينما يتيح الانشطار فصل وإزالة الميتوكوندريا التالفة عبر الميتوكوندريا7،12. علاوة على ذلك ، يساعد الانشطار على فصل المكونات التالفة للميتوكوندريا ، والتي يتم إزالتها بعد ذلك عن طريق الانقسام ، وهي عملية الالتهام الذاتي الانتقائية13. من ناحية أخرى ، يسمح الانصهار بتكملة محتويات الميتوكوندريا ، وتخفيف أي مكونات تالفة14. اللاعبون الرئيسيون في انشطار / اندماج الميتوكوندريا هم الميتوكوندريا (MFN1 / 2) ، وهو ضروري لاندماج غشاء الميتوكوندرياالخارجي 15،16 ، (OPA1): هذا GTPase الشبيه بالدينامين مسؤول عن اندماج غشاء الميتوكوندرياالداخلي 16. تتضمن بروتينات الانشطار البروتين المرتبط بالدينامين 1 (Drp1) ، البروتين المؤيد للانشطار13،17. بروتين انشطار الميتوكوندريا 1 (Fis1) ، عامل انشطار الميتوكوندريا (Mff) ، ومنظم انشطار الميتوكوندريا 1 مثل (MTFR1L). تم استخدام العديد من التقنيات ، مثل EM فائقة الدقة ، لدراسة البنية الفائقة للميتوكوندريا18. تم استخدام التهجين الفلوري أحادي الجزيء في الموقع (smFISH) جنبا إلى جنب مع الفحص المجهري فائق الدقة STED و MINFLUX (الفحص النانوي) لتصور mRNA الفردي للميتوكوندريا والبروتينات المرتبطةبه 18. تتعقب تقنيات الفحص المجهري لتوطين الجزيء الفردي (SMLM) التغيرات في تباعد الأغشية19. يسمح الفحص المجهري فائق الدقة لإعادة البناء البصري العشوائي (STORM) بدراسة مجمعات الغشاء الداخلي للميتوكوندريا20. ومع ذلك ، لا يمكن الوصول بسهولة إلى استخدام هذه المعدات المتقدمة. يمكن الوصول إلى الفحص المجهري متحد البؤر ويتطلب خبرة أقل. علاوة على ذلك ، أدى تطوير بروتينات الفلورسنت المستهدفة للميتوكوندريا إلى تطوير دراسة ديناميكيات الميتوكوندريا في الخلاياالحية 21 بشكل كبير ، حيث نستخدم بروتين الفلورسنت الأخضر القابل للتنشيط الضوئي (GFP) لتصور وقياس اندماج الميتوكوندريا22.
لدراسة انشطار الميتوكوندريا والاندماج ، يتم إجهاد الخلايا أو تعرضها لأدوية مثل السيسبلاتين ، الذي يرتبط بالحمض النووي ويحفز تلف الحمض النووي ، ويبلغ ذروته في موت الخلايا المبرمج بوساطة الميتوكوندريا23. في هذه الدراسة ، استخدمنا ميتوكوندريا Dendra2 القابلة للتبديل بالصور من فئران الميتوكوندريا القابلة للتنشيط الضوئي لدراسة أحداث الانشطار والاندماج في خلايا الكلى الأنبوبية المعالجة بالسيسبلاتين ، لأنها غنية بالميتوكوندريا ولديها قدرة عالية على التجديد. ومع ذلك ، يمكن استخدام هذا البروتوكول في أي نوع من الخلايا يحتوي على ميتوكوندريا Dendra2 قابلة للتحويل بالصور (الشكل 1A-C).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم تنفيذ جميع أعمال وفقا للبروتوكولات المعتمدة من قبل لجنة رعاية واستخدام المؤسسية بجامعة تمبل ، جامعة تمبل (بروتوكول -5183). تم شراء فئران فام ، التي تحتوي على ميتوكوندريا تعبر عن بروتين Dendra2.
1. تحضير وسط زراعة الخلايا
2. تحريض الإجهاد باستخدام سيسبلاتين
3. التصوير
4. تحليل الصور
ملاحظة: نظرا لأن الميتوكوندريا يتم تمييزها ببروتين Dendra2 ، عند الخضوع للتبييض الضوئي ، يؤدي التغيير التوافقي الذي لا رجعة فيه في بروتين dendra2 إلى زيادة في التألق الأحمر المكتشف من خلال ليزر 561 نانومتر. عندما تندمج الميتوكوندريا الحمراء مع الميتوكوندريا الخضراء غير المبيضة ، يعطي المزيج لونا أصفر. والاستفادة من هذه الظاهرة، يمكن قياس أحداث الانشطار/الاندماج الديناميكي.
5. تحليل أحداث الاندماج
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم عزل الخلايا الظهارية الأنبوبية الأولية من كلية الفأر عن طريق الهضم الأنزيمي وزراعتها في DMF-12 المكملة ب 5٪ FBS و 1٪ بنسلين ستربتومايسين عند 37 درجة مئوية تحت 5٪ ثاني أكسيد الكربون2. عند الوصول إلى 80٪ من التقاء الخلايا ، تم تربسين الخلايا (0.25٪ التربسين-EDTA) وبذرها بكثافة 5 × 104 خلايا لكل بئر في ألواح زراعة قاع زجاجي ، مغلفة مسبقا بالكولاجين.
احتوى وسط الاستزراع على سيسبلاتين بتركيز نهائي من ميكرومتر في DMF-12 مكملا بنسبة 0.004٪ DM...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعد انشطار / اندماج الميتوكوندريا عمليات ديناميكية حاسمة تحافظ على توازن الميتوكوندريا والبقاء الخلوي26. يتطلب التقييم الصحيح لهذه العمليات تقنيات تصوير متقدمة لتصور وقياس مورفولوجيا الميتوكوندريا وديناميكياتها ووظيفتها27،28. تم استخدام تقنيات مختلفة لقياس انشطار / اندماج الميتوكوندريا. تتضمن بعض الأدوات المتطورة الفحص النانوي لاستنفاد الانبعاث المحفز (STED) ، والذي يتيح تصور ديناميكيات كريستا الميتوكوندري...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعلن المؤلفون أنه ليس لديهم ما يكشفون عنه.
تم دعم هذا العمل من خلال المنح البحثية من منحة المعهد الوطني للصحة رقم 5R01DK135470-03 ، ومنحة ISAC-NIH 5U24DK128851-03 ، وزمالة ما بعد الدكتوراه لجمعية القلب الأمريكية.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <قوي>زراعة خلايا | |||
| DMEM/F12 | الوسط الأساسي | (جيبكو/كات. رقم 11320033 ) | زراعة الخلايا الأنبوبية القريبة |
| مصل البقر الجنيني (FBS) | 5-10٪ مكملات إضافية | (بيويست/كات. رقم S181B) | إثراء وسيط الثقافة |
| البنسلين-ستريبتومايسين | 100X | (جيبكو/كات. رقم 15140122) | الحماية بالمضادات الحيوية |
| الكولاجين IV | الطلاء | (سيغما-C5533-5M) | طلاء الألواح إيبيدي |
| تريبسين-إيدتا | 0.25٪ حل | (جيبكو/كات. رقم 25200056) | انفصال الخلية |
| محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS) | (جيبكو/كات. رقم 10010023 ) | غسل الخلايا | |
| <قوي>علاجات | |||
| سيسبلاتين | 2 & تركيز M في العمل | (سيليك كيميكاويز/كات. رقم S1166) | تحفيز الإجهاد |
| ثنائي ميثيل كسلفوكسيد (DMSO) | التحكم في المركبات | (فيشر ساينتيفيك/كات. رقم D1391) | Cisplatin solvent control |
| Imaging | |||
| الفينول الخالي من الأحمر المتوسط | تصوير مباشر | (جيبكو/كات. رقم 21041025) | انخفاض التألق الخلفي |
| علم الأحياء الجزيئي | |||
| تريزول وريج؛ | استخراج الحمض النووي الريبي | (جيبكو/كات. رقم 15596018) | عزل RNA كلي |
| SYBR Green Master Mix | كيمياء qPCR | (ثيرمو ساينتيفيك/كات. No.K0221) | تعبير جينات ديناميكا الميتوكوندريا (DNM1L، FIS1، MFN1، MFN2، OPA1) |
| أدوات فلورية | |||
| Dendra2 | علامة مصفوفة الميتوكوندرية | مختبر جاكسون (PhAMexcised) | مراسل قابل للتبديل بالصور (تحويل 405 نانومتر، تصوير 488/561 نانومتر) |
| <المجاهر>القوية | |||
| المجهر الكونفوكالي | لايكا DMi8 | تصوير الخلايا الحية وFRAP | 405 نانومتر/488 نانومتر/561 نانومتر ليزر |
| صورة J | https://imagej.net/software/fiji/downloads ؛ | ||
| إضافة ملفات تعريف RGB | https://imagej.net/ij/plugins/rgb-profiler.html. ؛ | تحليل حدث الاندماج (تداخل الإشارة الحمراء/الخضراء) |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.