تم إجراء جميع إجراءات الحيوانات وفقا لإرشادات المجلس الكندي لرعاية الحيوانات، وحصلت على موافقة لجنة رعاية الحيوانات في جامعة ميموريال في نيوفاوندلاند بموجب البروتوكول رقم 22-01-DK.
1. التحضيرات قبل بدء التجارب
- جهز محلول التشريح بإضافة 10 مللي مولار HEPES إلى 1x HBSS بدون Ca2+ وMg 2+.
- تحضير محلول هضم (لكل 2–3 أدمغة) بدمج 1 مل من 2.5٪ تريبسين (10 أضعاف المخزون، غير مخفف)، 2 مل من محلول التشريح، و200 ميكرولتر DNase I (1 ملغ/مل).
- حضر وسط دبقية مختلط عن طريق إضافة DMEM ب 10٪ FBS، و1x جلوتامكس، و1x مضاد حيوي/مضاد للفطريات.
- حضر وسط ميكروغليا عن طريق إضافة DMEM ب 10٪ FBS، و1x جلوتامكس، و1x MEM NEAA، و1x بيروفات الصوديوم، و1x بنسلين/ستربتومايسين.
2. الطلاء لثقافات الدبقيات المختلطة (الشكل 2A)
- في اليوم الأول:
- اجمع جراء اليوم التالي (P0)-P2 من فئران C57BL/6C واستخرج القشور باستخدام مجهر ستيريو، وإزالة السحايا. ثم قم بتشريح القشرة إلى قطع صغيرة في محلول تشريح ونقلها إلى أنبوب مخروطي بحجم 15 مل. دع الأنسجة تستقر في أسفل الأنبوب.
- قم بتفريغ محلول التشريح واستبداله ب 3 مل من محلول الهضم لكل 2–3 أدمغة. قم بالتثبيط بلطف باستخدام ماصة مصلية بحجم 2 مل لتفكيك الأنسجة.
- ضع الأنابيب على دوار داخل الحاضنة عند 37 درجة مئوية، وامزج الأنابيب باستخدام ماصة مصلية بسعة 2 مل كل 8 دقائق ليصبح المجموع حوالي 24 دقيقة.
- بعد هضم الأنسجة، قم بطرد مركزي الخلايا بحرارة 300 × جرام لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة (RT). ثم تخلص من المادة الفائقة وأعد تعليق الحبيبات في 5 مل من وسط الدبقية المختلط.
- باستخدام إبرة 18 جيلون في حقنة 5 مل، قم بتثبيث الخلايا ثم مررها عبر مصفاة خلايا نايلون بمقاس 70 ميكرومتر. قم بجهاز الطرد المركزي للخلايا المجمعة مرة أخرى عند 300 x g لمدة 5 دقائق عند RT.
- أعد تعليق الحبيبة في 1 مل من وسط الدبقية المختلط في البداية وقم بالتثبيث عدة مرات لإزالة تكتل الخلايا، ثم أعد تعليقها بحجم أعلى، لتكوين ما يصل إلى 12 مل في كل قارورة T75 (ينصح بوجود 2–3 قشورات دماغية لكل قارورة)
ملاحظة: لا يلزم تغليف القارورة بمادة بولي-دي-لايسين أو أي مادة أخرى من المواد الكيميائية.
- في اليوم الثاني، غير الوسائط بالكامل وأضف الوسائط المختلطة الطازجة للدبقية الإنجليزية.
- في اليوم الثالث، استبدل حوالي ثلثي الوسائط بوسط دبقي مختلط طازج. اترك الخلايا تنمو لمدة سبعة أيام إضافية، أي بإجمالي 10 أيام.
ملاحظة: في هذه المرحلة، يمكن ملاحظة طبقة من الخلايا النجمية.
- في اليوم السادس، استبدل ثلثي الوسائط بوسط دبقي جديد مختلط. أكد وجود طبقة من الخلايا النجمية المتلاطمة.
3. الحصول على الخلايا الدبقية الصغيرة الأولية النقية (الشكل 2A)
ملاحظة: حوالي اليوم العاشر، تظهر خلايا صغيرة مستديرة تطفو فوق طبقة الخلايا النجمية؛ هذه هي في الغالب الخلايا الدبقية الصغيرة (الشكل 2B).
- حرك القارورة بسرعة 250 دورة في الدقيقة لمدة ساعتين عند 37 درجة مئوية. اجمع الوسط الكامل الذي يحتوي على الخلايا العائمة في أنبوب مخروطي بحجم 15 مل وجهاز طرد مركزي بقوة 300 × جرام لمدة 10 دقائق.
- أعد تعليق الحبيبة في وسط الخلايا الدبقية الدقيقة ووضع حوالي 250,000 خلية في كل بئر في صفائح زراعة الخلايا الدقيقة لمحلل التدفق خارج الخلية.
ملاحظة: يتم الحصول على حوالي 3–4 ملايين خلية لكل مل من ثلاث قوارير T75؛ طلاء ألواح زراعة الخلايا بمادة بولي-دي-ليسين أو كواشف أخرى ليس شرطا.
- حضن الصفيحة الصغيرة عند 5٪ ثاني أكسيد الكربونلمدة 30–45 دقيقة. بعد ذلك، غير الوسط مرة أخرى للحصول على مزرعة ميكروبليا نقية وإزالة أي خلايا قليلة التجودد قد لا تزال عائمة. الخلايا جاهزة للعلاج في اليوم التالي مباشرة (الشكل 2C).
- استبعد الآبار الأربعة المخصصة كعناصر تحكم 'خلفية' من بذر الخلايا: واحدة في كل صف (الشكل 3C). تتلقى هذه الآبار وسائط التحليل.
ملاحظة: املأ الآبار غير المستخدمة بماء معقم أو PBS لمنع تبخر الوسط، وقم بتغليف الخلايا بنمط عشوائي بدلا من صفوف أو أعمدة ثابتة لتقليل التغير القائم على الصفائح.
4. علاج الخلايا الدبقية الصغيرة الأولية باستخدام محفزات التهابية
- في اليوم الحادي عشر، عالج الخلايا ب 100 نانوغرام/مل من الدهون البوليسكاريدية (LPS) لمدة 24 ساعة. قم بتوزيع الآبار العشوائية والمخابرة المعالجة ب LPS لاستبعاد أي تأثيرات موضعية.
ملاحظة: قد تختلف مدة العلاج حسب الظروف التجريبية وتحتاج إلى تحسين مسبق.
5. التحضير لاختبار التدفق خارج الخلوي قبل يوم واحد من بدء التجربة
- في اليوم الحادي عشر، أضف 1 مل من المخزن المعاير إلى لوحة المعايرة (بصيغة 24 بئرا؛ مجموعة اختبار التدفق خارج الخلوي) في جميع الآبار. حافظ على الطبق طوال الليل عند 37 درجة مئوية بدون ثاني أكسيد الكربون.
ملاحظة: تتكون لوحة المعايرة من 4 آبار حقن. في اختبار إجهاد التحلل السكري، يضاف الجلوكوز إلى المنفذ A، ويضاف الأوليغوميسين إلى المنفذ B، ويحقن 2DG في المنفذ C (راجع الشكل 4A).
- تحضير محاليل الجلوكوز ومخزون 2DG
- الجلوكوز – إذابة 90 ملغ من الجلوكوز في 2 مل من وسط تحليل التدفق خارج الخلوي (جدول المواد). في البداية، قم بالذوبان في حوالي 1.9 مل بحيث عند تعديل الرقم الهيدروجيني في اليوم التالي ب 1N NaOH، لا يتجاوز الحجم النهائي 2 مل، وهو أمر حاسم للحفاظ على المولارية.
- 2DG – إذابة 328 ملغ في 2 مل من وسط تحليل التدفق خارج الخلية.
ملاحظة: خزن كل من الجلوكوز و2DG عند 4 درجات مئوية طوال الليل
- أليكوت 30-40 مل من وسائط الفحص في أنبوب مخروطي 50 مل وتخزينه عند 4 درجات مئوية لإجراء الفحوصات في اليوم التالي.
6. اختبار التدفق خارج الخلوي (اليوم 12)
- في اليوم الثاني عشر، قم بتسخين الجلوكوز المكون مسبقا، 2DG، ووسائط الاختبار المكونة على درجة حرارة 37 درجة مئوية. اضبط درجة الحموضة للجلوكوز و2DG، وكذلك وسط الاختبار المقتبس، إلى 7.4 بإضافة 1N NaOH بزيادات (مثلا 5 ميكرولتر، ثم 10 ميكرولتر).
- دوامة لفترة وجيزة لخلط منتظم حتى يصل الرقم الهيدروجيني إلى فوق 7.
ملاحظة: ينصح باستخدام شرائط مؤشر الحموضة لمراقبة درجة الحموضة بشكل متسق.
- أضف 2 ميكرولتر من محلول المخزون من أوليغوميسين 10 ملليمولار في 2 مل من وسط الفحص المعدل حسب الرقم الهيدروجيني.
- تحضير محلول المخزون من أوليغوميسين 10 ملليمول: يعيد تشكيل قارورة أوليغوميسين بمقدار 10 ملغ في 1 مل من DMSO المعقم، مع تركيز 10 ملغ/مل، وتخزينه عند -80 درجة مئوية حتى الاستخدام الإضافي.
- أخرج الخلايا من الحاضنة (من الخطوة 4) واجمع الوسائط في أنابيب طرد مركزي دقيقة بسعة 1.5 مل وجهاز طرد مركزي بقوة 300 × جرام لمدة 5 دقائق.
- اجمع المادة الفائقة (تخلص من الحبيبات للتخلص من الخلايا/الحطام) وخزنها في درجة حرارة -80 درجة مئوية لقياس اللاكتات المذكورة في الخطوة 8.
- اغسل الخلايا بلطف شديد بمقدار 1 مل من وسط التحليل المعدل حسب الرقم الهيدروجيني لتجنب الارتفاع عن الخلايا.
- تخلص من وسط الفحص وأضف 500 ميكرولتر من وسط الفحص المعدل حسب الرقم الهيدروجيني واحتضن على حرارة 37 درجة مئوية (بدون ثاني أكسيد الكربون2) لمدة 45 دقيقة إلى ساعة واحدة.
- في هذه الأثناء، أضف جميع المثبطات المطلوبة إلى لوحة معايرة محلل التدفق خارج الخلوي في منافذ كل منها - 55 ميكرولتر من الجلوكوز إلى المنفذ A في أعلى اليسار في جميع الآبار، 60 ميكرولتر من الأوليغوميسين في المنفذ B إلى الآبار العلوية اليمنى و65 ميكرولتر من 2DG في المنفذ C إلى الآبار السفلية اليسرى (بما في ذلك الآبار الخلفية) (راجع الشكل 4A).
ملاحظة: زيادة الحجم في كل خطوة مطلوبة للحفاظ على المولارية، حيث تزداد الأحجام مع إضافة الجلوكوز والأوليغوميسين مسبقا.
- بعد إضافة المثبطات، قم بإعداد اختبار إجهاد التحلل السكري باستخدام برنامج Agilent Seahorse Wave (راجع الشكل 3). ثم، شغل لوحة المعايرة بمجرد أن يطلب منك ذلك.
ملاحظة: قم بإزالة الغطاء العلوي من اللوحة والغطاء الوردي بين الألواح قبل وضع لوحة المعايرة في الجهاز. خلال هذه الخطوة، سيتم اختبار حساسات الرقم الهيدروجيني والأكسجين2 ، وفحص مراقبة الجودة.
- بعد انتهاء المعايرة، سيقوم الجهاز بطلب من تفريغ لوحة المعايرة وتحميل لوحة الزراعة.
- الخطوة الأولى: اختيار قالب الاختبار (الشكل 3A)
- افتح برنامج الموجة ، ومن قسم القوالب ، اختر قالب الاختبار المناسب للتجربة.
- في هذه الحالة، اختر "اختبار إجهاد تحلل السكر XF" في محلل التدفق خارج الخلية.
- الخطوة الثانية: تعريف المجموعات واستراتيجيات الحقن (الشكل 3B)
- اذهب إلى تبويب تعريفات المجموعات وأنشئ مجموعات تجريبية (مثل الخلفية، التحكم، وLPS).
- حدد استراتيجية الحقن باختيار المركبات التي سيتم حقنها في كل منفذ (مثل الجلوكوز، الأوليغوميسين، 2DG لاختبار إجهاد التحلل السكري؛ هذه الإعدادات محددة مسبقا من قبل البرنامج كافتراضية، تحقق بناء على ذلك).
- الخطوة الثالثة: تعيين المجموعات لخريطة الألواح (الشكل 3C)
- افتح عرض خريطة الألواح وخصص الآبار لكل مجموعة عن طريق سحب أسماء المجموعات (مثلا: الخلفية = الأسود، التحكم = الأخضر، LPS = الأحمر) على تخطيط اللوحة.
- تأكد من تخصيص آبار فارغة/خلفية لتطبيع دقيق.
- الخطوة الرابعة: إعداد البروتوكول (الشكل 3D)
- تحت تبويب البروتوكول ، برمج دورات القياس والحقن. يشمل التسلسل النموذجي لاختبار إجهاد التحلل السكري تحمض غير الجليكوليكية، وحقن الجلوكوز (المنفذ A) → قياس تحلل السكر، وحقن الأوليغوميسين (المنفذ B) → قياس السعة القابلة للجليكوليكية، وحقن 2-DG (المنفذ C) → قياس الاحتياطي الجليكوليكي
- حدد عدد دورات القياس بعد كل حقنة وعدل التوقيت (مثلا: 3 دورات من خلط 3 دقائق، انتظار دقيقتين، قياس لمدة 3 دقائق).
ملاحظة: في تجاربنا، نستخدم الإعدادات الافتراضية للبرنامج.
- راجع إجمالي وقت الفحص قبل إجراء الاختبار.
- الخطوة الخامسة: التطبيع (الشكل 3E)
- تطبيع البيانات بقيم تركيز البروتين التي تم الحصول عليها من اختبار حمض البيسينشونيك (BCA) داخل برنامج Wave باستخدام خيار التطبيع المدمج (مثل محتوى البروتين، عدد الخلية، أو طرق أخرى متاحة). تظهر قياسات تركيز البروتين في الجدول 1.
ملاحظة: بروتوكول عزل البروتين لاختبار BCA بعد قياس ECAR موصوف في الخطوة 7 التالية.
7. جمع الخلايا لقياس البيانات وتطبيعه
- بمجرد اكتمال اختبار التدفق خارج الخلية، قم بإزالة لوحة الزراعة وبدء استخراج البروتين فورا أو تخزين الطبق عند -80 درجة مئوية حتى يكون جاهزا لاستخلاص البروتين.
ملاحظة: تسمح اختبارات البروتين لنا بتطبيع القيم عبر ظروف العلاج المختلفة (وهي إحدى الطرق لتطبيع البيانات، وليست الطريقة الوحيدة).
- لعزل البروتين الفوري، قم بإزالة وسط الاختبار من الآبار وغسل مرة واحدة ب 500 ميكرولتر من زيت RT PBS (مرة واحدة) (ينصح بغسل خفيف بغسيل واحد لتقليل تمزيق طبقة الخلية الأحادية).
- لجمع الخلايا التي قد تنفصل خلال هذه العملية، قم بطرد مركزي على اللوحة مرة واحدة على 300 × جرام لمدة 5 دقائق، ثم تخلص من PBS، وأعد تعليق الحبيبات الناتجة في مخزن RIPA لضمان قياسات بروتين كلية دقيقة.
- أضف حوالي 75–100 ميكرولتر من مخزن RIPA إلى كل بئر ووضع اللوحة على هز (دوران منخفض-متوسط) لمدة 30 دقيقة (RT). ثم انقل المحتويات إلى أنبوب طرد مركزي دقيق جديد بسعة 1.5 مل.
ملاحظة: قم بالتثبيث وامزج جيدا داخل الآبار قبل نقل مخزن RIPA إلى أنبوب الطرد المركزي الدقيق بسعة 1.5 مل.
- حضن أنبوب الطرد المركزي الدقيق على جهاز دوار لمدة حوالي 30 دقيقة عند RT لتحلل الخلايا بشكل صحيح. خلال هذا الوقت، قم بتبريد الطرد المركزي إلى 4 درجات مئوية.
- قم بعمل طرد مركزي على محلل الخلية عند 16,000 × جرام لمدة 15 دقيقة عند 4 درجات مئوية. تخلص من الحبيبة لأنها ستحتوي على حطام خلوي.
- اجمع المادة الفائقة لقياس كمية البروتين باستخدام اختبار BCA (أو أي طريقة مفضلة أخرى). إما أن تتابع فورا أو تخزن الليزاتات بعد إزالة جميع وسائط الفحص عند -20 درجة مئوية (للتخزين قصير الأمد)، أو -80 درجة مئوية (للتخزين طويل الأمد).
- عند إعادة التشغيل بعد تخزين العينات على -20 درجة مئوية أو -80 درجة مئوية، قم بإذابتها على الجليد لمدة 20–30 دقيقة تقريبا، مع دوامة/دوران قصيرة، واستمر في بروتوكول BCA القياسي.
- بدلا من ذلك، عد الخلايا في كل بئر باستخدام مقياس الدم أو عبر مقياس تدفق خلوي ودمجها في استراتيجيات التطبيع. في هذه الحالة، أضف حوالي 100–200 ميكرولتر من التريبسين (تم تسخينها مسبقا إلى 37 درجة مئوية) فور انتهاء الاختبار وإزالة وسط الاختبار، وحضن على حرارة 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق. اجمع الخلايا بإضافة 100–200 ميكرولتر من 10٪ FBS لتحييد تأثيرات التربسين.
- قم بالطرد المركزي للخلايا بقوة 300 × جرام لمدة 5 دقائق، ثم أزل السوبرناتان، وأعد تعليق الرصاصة في حوالي 1 مل من 10٪ FBS قبل العد باستخدام جهاز قياس الدم. بدلا من ذلك، يمكن تثبيت الخلايا بنسبة 4٪ من PFA لمدة 15 دقيقة قبل البدء في عد الخلايا المعتمد على قياس تدفق الخلايا (تدفق الخلايا الخلوية).
ملاحظة: إذا بدأت عد الخلايا فورا، فلا حاجة للتثبيت القائم على PFA.
- تطبيع قيم ECAR مع تركيز البروتين من الخطوة 7.8 أو عد الخلايا من الخطوة 7.9.1 في كل بئر باستخدام برنامج Wave كما في الخطوة 6.10.5.1. القيم الناتجة هي القيم المقررة لاختبار إجهاد التحلل الجليكولي.
- توليد النتائج والرسم البياني باستخدام خيار "تصدير" يليه خيار "منشور لوحة الرسم البياني" و"ورقة إكسل" لكل قيمة نقطة بيانات للقياس.
ملاحظة: في لوحة زراعة الخلية، يكون اختيار أربعة آبار فارغة مخصصة مرنا ويمكن للباحث تحديده. الترتيب الافتراضي للفراغات موضح في الشكل 3C.
8. قياسات اللاكتات من الكائنات الزائدة في الزراعة
- قم بإذابة الأليكوات الفائقة على الجليد التي جمعت في اليوم الثاني عشر وتم تخزينها عند −80 درجة مئوية من الخطوة 6.5.
- تحديد تركيزات L-Lactate باستخدام مجموعة اختبار L-Lactate في الوضع الفلورومتري، وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
ملاحظة: الوضع الفلورومتري أكثر حساسية بكثير من اختبار الألوان اللوني.
- إعداد المعايير عن طريق التخفيف التسلسلي لمعيار اللاكتات المقدم لتوليد منحنى معايرة يتراوح من 0 إلى 0.1 نانومول/بئر.
- أضف العينات والمعايير إلى صفيحة دقيقة شفافة مكونة من 96 بئر مكررة، ثم أضف خليط التفاعل الذي يحتوي على خليط إنزيمات اللاكتات ومسبار فلوري إلى كل بئر.
- احتضن في RT لمدة 30 دقيقة محميا من الضوء. قس شدة التألق باستخدام قارئ ميكرولوح فلوري مع أطوال موجية للإثارة/الانبعاث مضبوطة على 535/587 نانومتر.
- احسب تركيزات اللاكتات في العينات من المنحنى القياسي وعبر عنها كpM. مستويات اللاكتات من الكائنات الفائقة للدبقية الدبقية الأولية غير المعالجة (الضابطة) والمعالجة ب LPS معروضة في الجدول 2.