يوفر الشكل 6 نظرة عامة على سير عمل اختبار DIO1-SK والخطوات الرئيسية المطلوبة لتأسيس الطريقة بنجاح في المختبر. تلخص سير العمل (الشكل 6A) المراحل التتابعية للاختبار، بما في ذلك استخدام ميكروسومات الكبد البشرية، والحضانة مع عناصر الاختبار وأدوات التحكم، واستخراج اليوديد عبر فصل التبادل الأيوني، وقياس اليوديد اللوني باستخدام تفاعل ساندل-كولثوف (SK). يسلط الشكل 6B الضوء على استراتيجية التوحيد التي تدعم الأداء القوي والنتائج الصحيحة، بما في ذلك (1) توحيد تفاعل SK، (2) اختبار نشاط الميكروسوم الخاص بالدفعات، (3) تقييم الذوبانية واختبار التداخل، (4) اختبار تحديد النطاق، و(5) تعديل تركيزات عناصر الاختبار بناء على أول اختبار صالح.
عنصر أساسي في هذه الاستراتيجية هو اختبار النشاط الصغري الخاص بالدفعات، لأن دفعات ميكروسوم الكبد البشرية يمكن أن تختلف بشكل كبير في نشاط إزالة اليود ل rT3، مما يتطلب تحديد تركيز إنزيم مناسب لكل دفعة جديدة قبل الاختبار الروتيني للمواد.
تعد استراتيجية الاختبار المرحلي هذه ضرورية للتنفيذ: فقط بعد التحقق من الأداء الأساسي للاختبار (الضوابط، سلوك تفاعل SK، ونشاط الميكروسوم) وتوحيد شروط الاختبار، يمكن توقع أن ينتج اختبار المواد ملفات تثبيط صحيحة وقابلة للتفسير.

الشكل 6: سير عمل اختبار DIO1 SK وخطوات التوحيد القياسي. (أ) يوضح سير العمل استخدام ميكروسومات الكبد البشرية، وإعداد صفيحة 96 بئرا، والحضانة مع عناصر الاختبار وأدوات التحكم، واستخراج اليوديد، والقياس اللوني عبر تفاعل SK. يتم تصوير كل خطوة بشكل متسلسل لتسليط الضوء على المراحل الرئيسية للاختبار. (ب) تشمل خطوات التوحيد القياسي لتفاعل ساندل-كولثوف، واختبار نشاط الميكروسومات الخاصة بالدفعات، وتقييم الذوبانية واختبار التداخل، واختبار تحديد النطاق، وضبط تركيزات عناصر الاختبار بناء على أول اختبار صالح. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
استنادا إلى سير العمل وإطار التوحيد الموضح في الشكل 6، يوضح الشكل 7 كيف تحدد المختبرات تركيز البروتين الميكروسومي المناسب (وتخفيف ما بعد تبادل الأيونات) لتحقيق نطاق ديناميكي كاف مع الحفاظ على استجابة تثبيط سيجمويدي للمثبط المرجعي. في الشكل 7A، يزداد ΔOD21min-BG مع زيادة البروتين الميكروسومي ويعتمد على التخفيف بعد تبادل الأيونات (غير مخفف، 1:2، 1:4). يتم اختيار التخفيف الذي ينتج أعلى ΔOD21min-BG مع الحفاظ على استجابة سيجموية للتجارب اللاحقة (المثال الموضح هو تخفيف بنسبة 1:2). في الشكل 7B، تتم مقارنة منحنيات تثبيط 6-PTU عبر كميات البروتين الميكروسومي لتحديد أدنى تركيز بروتين لا يزال يعطي منحنى سيجمويدي (المثال الموضح: 5 ميكروغرام من البروتين/البئر)، وبالتالي موازنة الحساسية مع الخلفية.
من المهم أن كل مختبر يجب أن يقوم بهذه الخطوة عند تنفيذ الطريقة، لأن تركيز البروتين المطلوب يعتمد على نشاط دفعة الميكروسوم المستخدمة، مما يستلزم توحيد تركيز الإنزيمات حسب دفعات معينة.

الشكل 7: النشاط الميكروسومي والتثبيط بواسطة 6-PTU. (A) يظهر الرسم البياني زيادة النشاط مع إشارة ساندل-كولثوف المصححة بالخلفية (BG) (ΔOD21 دقيقة n- BG) مع زيادة كميات البروتين الميكروسومي لكل بئر (log10[ميكروغرام بروتين/بئر])، التي تم اختبارها في تخفيفات غير مخففة، 1:2، و1:4. سيتم استخدام أعلى تخفيف مع أعلى قيمة ΔOD21 دقيقة في BG، وكذلك مع شكل سيغمويد، في التجارب المستقبلية. في هذه الحالة، هو التخفيف بنسبة 1:2. (ب) منحنى التركيز-الاستجابة للمثبط المرجعي 6-بروبيل-2-ثيوراسيل (6-PTU) الذي يظهر نشاط إطلاق اليود (IRA في ٪) مرسوم مقابل log10[تركيز (M)] عند أحمال بروتينات ميكروسومية مختلفة (5، 7.5، و10 ميكروغرام بروتين/بئر). يتم تطبيع قيم IRA إلى التحكم في المذيب. تمثل نقاط البيانات في كلا الرسمين البيانيين متوسط SD ± ثلاثة نسخ تقنية (آبار) لكل حالة من اختبار نشاط ميكروسوم ممثل. تم تكييف المنحنيات بواسطة الانحدار غير الخطي باستخدام نموذج لوجستي مكون من أربعة معاملات ("ميل متغير") (مثبط مقابل استجابة). سيتم استخدام أصغر تركيز بروتين ذو منحنى سيجمويدي في التجارب المستقبلية؛ في هذه الحالة، 5 ميكروغرام/بئر. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
بمجرد الانتهاء من سير العمل وخطوات التوحيد القياسي (الشكل 6) وتحديد تركيز مناسب للبروتين الميكروسومي لدفعة الميكروسوم المختارة (الشكل 7)، تكون معايير الاختبار الأساسية جاهزة للمضي قدما في اختبارات المواد الروتينية. في هذه المرحلة، يمكن تقييم عناصر الاختبار جنبا إلى جنب مع مجموعة التحكم في الصفيحة (العنصر المرجعي، التحكم بالمذيب، والتحكم الإيجابي/السلبي) بصيغة الصفيحة الموحدة، مما يتيح تطبيعا قويا وتفسيرا متسقا لملفات التثبيط.
يوضح الشكل 8 التمييز بين الاختبارات بناء على سلوك التركيز والاستجابة في نشاط إفراز اليوديد (IRA). يظهر مثبط المرجع 6-PTU (الشكل 8A) انخفاضا يعتمد على التركيز في IRA، مما يوفر ملف التثبيط السيني المتوقع، كما هو متوقع للتحقق من أداء الاختبار. حمض التانيك (الشكل 8B) يظهر ملف مثبط يقارن بالمثبط المرجعي (أقصى تثبيط > 90٪) تحت الظروف المعروضة. أظهرت أعلى ثلاثة تركيزات من المادة المختبرة قيم IRA سلبية. قيم IRA <0٪ لا تعكس 'إطلاق اليوديد السلبي' ذي معنى بيولوجيا، بل تنشأ من عملية الحساب (طرح الخلفية والتطبيع إلى التحكم بالمذيب)، والتي يمكن أن تنقل تقلبات صغيرة في التحكم بالمذيب إلى قيم سالبة مطبعة. وبناء عليه، تعتبر قيم IRA أقل من 0٪ مكافئة ل 0٪ (خط الأساس) لتفسير النتائج. ديبيوتيل فثالات (الشكل 8C) لا يظهر أي تثبيط (أقصى تثبيط أقل من 25٪) عبر نطاق التركيز المختبر، مما يمثل ملف غير مثبط. توضح هذه الملفات معا أن الاختبار يمكنه التمييز بين السلوك المثبط وغير المثبط في الظروف الموحدة. يمكن لنظام الاختبار أيضا تحديد المثبطات الجزئية، التي تظهر مستويات تثبيط قصوى تتراوح بين 25٪ و90٪ (البيانات غير موضحة). يمكن العثور على مزيد من التفاصيل حول كيفية تصنيفها في الجدول 5.

الشكل 8: سلوك استجابة الجرعة في اختبار DIO1–SK يميز المثبطات عن غير المثبطات. تظهر منحنيات الجرعة-الاستجابة نشاط إطلاق اليود (IRA بالنسبة المئوية) مخططا مقابل تركيز log10 (M) ل (A) المثبط المرجعي 6-PTU، (B) مثبط تمثيلي (حمض التانيك)، و(C) مثبط غير مثبط ممثل (ثنائي بيوتيل فثالات). تم حساب قيم IRA بعد طرح الخلفية وتم تطبيعها إلى التحكم في المذيب. تمثل الرموز متوسط ± SD (n = 3) من تجربة مستقلة واحدة، كل تجربة تجرى بثلاث نسخ تقنية (آبار) لكل تركيز. تم تكييف المنحنيات بواسطة الانحدار غير الخطي باستخدام نموذج لوجستي مكون من أربعة معاملات ("ميل متغير") (مثبط مقابل استجابة). تعتبر قيم IRA أقل من 0٪ مكافئة ل 0٪ (خط الأساس) لتفسير النتائج. تظهر هذه البيانات أن الاختبار يعطي ملف تثبيط سيجمي للمثبط المرجعي ويمكن أن يؤكد ما إذا كان منحنى تركيز الاستجابة مثبطا أم غير مثبط في الظروف الموحدة. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
في إجراء اختبار صالح، تظهر ضوابط المذيب (SC) فصلا واضحا للإشارة لمدة21 دقيقة ΔOD عن الحالة المرجعية المقيدة بالكامل (6-PTU، RI-C8). في مجموعة بيانات نموذجية (10 عمليات مستقلة)، تضمنت كل لوحة n = 9 نسخ تقنية مكررة ل SC والمرجع المثبط بالكامل (6-PTU عند 10−3 M). عبر الألواح، تراوحت قيم متوسط SC ΔODللصفيحة لمدة 21 دقيقة من 1.383 إلى 1.819 (متوسط ± SD: 1.565 ± 0.114)، بينما تراوحت قيم متوسط الصفيحةΔOD 21 دقيقة لحالة 6-PTU المثبطة من 0.258 إلى 0.771 (متوسط ± SD: 0.473 ± 0.087). يعتمد حساب ΔOD في هذا الاختبار على الفرق بين OD0min و OD21min، وعادة ما يدعم صحة الاختبار عتبة عامل z′ >0.5.
عبر 10 عمليات اختبار مستقلة، أنتج 6-PTU منحنى تركيز واستجابة سيغمويدية بقيم IC50 تتراوح بين 1.20E-06 M إلى 5.02E-06 M (متوسط SD ± 2.74E-06 M ± 1.13E-06 M). معايير قبول قيم IC50 في النطاق المرجعي من 1.00E-06 إلى 1.00E-05 تعتمد على بيانات من دراسات التحقق السابقة. ومع ذلك، تتأثر قيم IC50 بشكل كبير بدفعة الميكروسوم المحددة المستخدمة وقد تظهر تباينا كبيرا. ومع ذلك، من المتوقع أن تبقى هذه التغيرات ضمن نفس الرتبة المئوية.
يمكن تلخيص جودة الاختبار باستخدام عامل z′، الذي يعكس كل من نافذة الإشارة وتقلب أدوات التحكم. في مجموعة البيانات الموصوفة، ارتبطت ستة منحنيات مرجعية بعوامل z′ تتراوح بين 0.544 و0.774 (متوسط ± SD: 0.658 ± 0.062)، مما يتوافق مع هدف القبول المستخدم عادة وهو z′ > 0.5.
في الواقع، يمكن تحديد التجارب غير المثالية من خلال الانحرافات في خلفية الاختبار و/أو عدم تحقيق معايير القبول المحددة مسبقا. على سبيل المثال، يشار إلى خلفية عالية في تفاعل ساندل-كولثوف عندما يظهر فراغ diH₂O النقي ΔOD > 0.3، مما يستدعي التحقيق (مثل التلوث الكيميائي أو مشاكل جودة المياه). يمكن أن تقلل هذه الزيادات في الخلفية من النطاق الديناميكي للاختبار وترفع من تباين التحكم، مما يساهم في فشل معايير القبول، بما في ذلك عامل z′ أقل من 0.5. الآبار التي تظهر عيوبا تقنية واضحة (مثل الهطول أو تغير اللون غير الطبيعي) تستبعد كحالات شاذة من التقييم. كما يتم استبعاد القيم الشاذة التي تم تحديدها عبر اختبار الصندوق المخطط (boxplot). إذا لم تستوف معايير القبول بعد إزالة المؤشرات الشاذة، يعتبر اختبار الاختبار غير صالح ويجب تكراره.
| الكاشف/المخزن المؤقت | معلومات عن التحضير |
| محلول السيريوم الحمضي للأمونيوم (40 ملمولار (NH4)4Ce(SO4)4*2H2O، 0.5 M H2SO4) (250 ملم) | أضف 6.32 جرام من (NH4)4Ce(SO4)4*2H2O و125 مل من diH2O إلى قارورة حجمية بحجم 250 مل. أضف 125 مل 1 متر H2SO4 للوصول إلى حجم نهائي يبلغ 250 مل. خزن في درجة حرارة الغرفة حتى 6 أشهر. |
| DTT (أليكوتات 1 M) | أليكوت هو محلول DTT بسعة 1 متر في H2O جاهز أو مورد في أنابيب طرد مركزي دقيق بحجم 1.5 مل ويخزن عند -20°C لمدة تصل إلى 6 أشهر. |
| هيبس (50 ملم م) / إيدتا (2.16 ميليمتر) (الرقم الهيدروجيني 7.0) | باستخدام قارورة حجمية بسعة 250 مل، أضف 12.5 مل محلول HEPES بسعة 1 مل، و201 ملغ من حمض الإيثيلين ديامين تترا أسيتيك (EDTA) واملأ حتى 250 مل بمحلول ثاني H2O. تخزين عند 4°C لمدة تصل إلى 3 أشهر. |
| محلول rT3 ("أنابيب خلط الركيزة") | قم بإذابة rT3 في DMSO إلى تركيز نهائي يبلغ 6 مللي مول، ثم تقسيمها في أجزاء 10 ميكرولتر في أنابيب طرد مركزي بسعة 15 مل، وتخزنها عند -20°م لمدة تصل إلى 6 أشهر. |
| محلول الصوديوم أرسنيت (25 ملليموتر NaAsO2، 0.8 ملليمول NaCl، 0.5 ملويكيمونيوم H2SO4) (250 مل) | أضف 0.81 جرام من NaAsO2، و11.7 جرام من NaCl، و125 مل من diH2O إلى قارورة حجمية بحجم 250 مل. أضف 125 مل 1 متر H2SO4 للوصول إلى حجم نهائي يبلغ 250 مل. خزن في درجة حرارة الغرفة حتى 6 أشهر. |
الجدول 1: تحضير المخازن والكواشف. يوضح هذا الجدول خطوات التحضير وتعليمات التخزين لجميع المخازن والمحاليل المستخدمة في اختبار DIO1 SK، بما في ذلك مخزن HEPES/EDTA، وDTT، ومحلول rT3، ومحلول سيريوم الأمونيوم الحمضي، ومحلول أرسنيت الصوديوم.
| اسم عنصر التخفيف المرجعي | تركيز عنصر المرجع لتخفيف العنصر [M] | 10٪ DMSO [μL] | عنصر مرجعي | التركيز النهائي لعنصر المرجع في الاختبار [M] |
| RI-C8 | 1.00E-02 | 450 | 50 ميكرولتر من محلول العنصر المرجعي 10-1 متر | 1.00E-03 |
| RI-C7 | 1.00E-03 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C8 | 1.00E-04 |
| RI-C6 | 1.00E-04 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C7 | 1.00E-05 |
| RI-C5 | 3.16E-05 | 342 | 158 ميكرولتر من RI-C6 | 3.16E-06 |
| RI-C4 | 1.00E-05 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C6 | 1.00E-06 |
| RI-C3 | 3.16E-06 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C5 | 3.16E-07 |
| RI-C2 | 1.00E-06 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C4 | 1.00E-07 |
| RI-C1 | 1.00E-07 | 450 | 50 ميكرولتر من RI-C2 | 1.00E-08 |
الجدول 2: تحضير تخفيف العناصر المرجعية. يلخص هذا الجدول تحضير التخفيفات التسلسلية للعنصر المرجعي (6-PTU)، بما في ذلك التركيزات، وأحجام DMSO، والتكثفات النهائية المستخدمة في الاختبار.
| ميكروزوم لكل بئر [ميكروغرام] | diH2O [μL] | تخفيف الميكروزومات [μL] | التركيز النهائي للإنزيم في الاختبار [ميكروغرام/مل] |
| 20 | 780 | 20 ميكرولتر من محلول ميكروسوم بسعة 20 ملغ/مل | 200 |
| 10 | 400 | 400 ميكرولتر من 20 ميكروجرام ميكروسوم لكل تخفيف بئر | 100 |
| 5 | 400 | 400 ميكرولتر من 10 ميكروغرام ميكروسوم لكل تخفيف بئر | 50 |
| 2.5 | 400 | 400 ميكرولتر من 5 ميكروجرام ميكروسوم لكل تخفيف بئر | 25 |
| 1.25 | 400 | 400 ميكرولتر من 2.5 ميكروجرام ميكروسوم لكل تخفيف بئر | 12.5 |
| 0.68 | 400 | 400 ميكرولتر من ميكروسوم 1.25 ميكروغرام لكل تخفيف بئر | 6.8 |
الجدول 3: تحضير تخفيفات الميكروسوم. يوفر هذا الجدول نظام التخفيف للبروتين الميكروسومي لكل بئر، بما في ذلك الأحجام المطلوبة من محلول diH₂O ومخزون الميكروسوم لتحقيق التركيزات النهائية للبروتينات الميكروسومية للاختبار.
| معايير القبول | القيمة القطعية المقترحة |
| رقمي | |
| IC50 من البند المرجعي [M] | 1*10-05 - 1*10-06 |
| السيرة الذاتية لتقدير لوغاريتمية IC50 للبند المرجعي [٪] | < 3 |
| السيطرة السلبية على حساب IRA [٪] | 80 - 120 |
| التحكم الإيجابي في IRA [٪] | < 20 |
| عامل z'-Factor | > 0.5 |
| ثنائي | |
| شكل عنصر مرجعي (سيغمويدال؟) | نعم |
| يتكون منحنى التركيز والاستجابة النهائي للعنصر المرجعي من ست تركيزات على الأقل من ثلاث نسخ مكررة | نعم |
| يتكون منحنى التركيز والاستجابة النهائي لعنصر الاختبار من ست تركيزات على الأقل من ثلاث نسخ مكررة | نعم |
الجدول 4: معايير القبول لاختبار DIO1 SK. يسرد هذا الجدول معايير القبول لصلاحية الاختبار مثل نطاق IC₅₀، ومعامل التغير، وقيم IRA للضوابط، وعامل z'، ومتطلبات منحنيات التركيز-الاستجابة. تم اشتقاق نوافذ القبول من دراسات التحقق من DIO1-SK المبلغ عنهاسابقا 6، بما في ذلك تقييم قابلية التكرار بناء على خمس عمليات مستقلة أثرت نافذة IC₅₀ المرجعية. في مجموعة بيانات نموذجية من 10 جولات مستقلة، تراوح أداء عامل z′ من 0.544 إلى 0.774 (متوسط SD ±: 0.658 ± 0.062)، مما يدعم عتبة قبول z′ المستخدمة هنا.
| الفئة (حسب الفعالية) | الفئة الفرعية (حسب القوة) | نشاط التثبيط | العتبة |
| الفئة 1: مثبط كامل | ج: مثبط كامل قوي | يثبط نشاط DIO1 بالكامل بتركيز مماثل للعنصر المرجعي 6-PTU | أقصى تثبيط أعلى بنسبة 90٪ وIC50 عند أو أقل من النطاق الأعلى IC50 من 6-PTU |
| ب: مثبط ضعيف بالكامل | يثبط نشاط DIO1 بالكامل عند تركيزات أعلى من العنصر المرجعي 6-PTU | أقصى تثبيط أعلى بنسبة 90٪ وIC50 فوق النطاق الأعلى IC50 من 6-PTU |
| الفئة 2: مثبط جزئي | - | لا يوجد تثبيط كامل، لكنه أكبر من السلبية والتحكم في المذيبات | أقصى تثبيط بين 25٪ و90٪ |
| الفئة 3: ليس مثبطا | - | لا يثبط DIO1 (نفس التحكم السلبي والمذيب) | أقصى تثبيط أقل من 25٪ |
الجدول 5: تصنيف عناصر الاختبار بناء على فعالية تثبيط DIO1 وفعاليته. تصنف عناصر الاختبار إلى ثلاث مجموعات فعالية (كاملة، جزئية، أو غير مثبطة) بناء على أقصى تثبيط لنشاط DIO1. يتم تصنيف المثبطات الكاملة بشكل فرعي حسب الفعالية، اعتمادا على IC₅₀ بالنسبة للعنصر المرجعي 6-PTU.