$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تم التعامل مع جميع المواد الكيميائية الخطرة (مثل الجلوتارالديهايد، ومحلول كاكوديلات الصوديوم، والهيكسام ميثيلديسيلازان [HMDS]، والإيثانول) وفقا لسياسات الصحة والسلامة البيئية (EHS) المؤسسية. تم تحضير واستخدام الكواشف المتطايرة/السامة باستخدام غطاء بخار كيميائي معتمد مع معدات الحماية الشخصية المناسبة (معطف المختبر، واقيات العين، وقفازات مقاومة للمواد الكيميائية)، وتم إبعاد المذيبات القابلة للاشتعال عن مصادر الإشعال. تم فصل النفايات الكيميائية وجمعها في حاويات معلمة بشكل صحيح (بما في ذلك نفايات مخصصة تحتوي على الزرنيخ للكاكوديلات، ونفايات مذيبات لأنظمة HMDS/الإيثانول) للتخلص منها من خلال برنامج النفايات الخطرة المؤسسي. تم تطهير المواد الخطرة البيولوجية (المزارع البكتيرية، الأطباق الملوثة، والمواد القابلة للتخلص مرة واحدة) وفقا لإجراءات السلامة الحيوية (مثل التعقيم أو المطهرات المعتمدة) قبل التخلص منها، وتم إجراء أي تعقيم بأكسيد الإيثيلين وفقا لبروتوكولات المنشأة المعتمدة وممارسات التهوية المطلوبة.
نماذج مطبوعة ثلاثية الأبعاد
تم تصميم النماذج باستخدام برامج تصميم مجانية بمساعدة الحاسوب وطباعتها باستخدام طابعة ثلاثية الأبعاد مزودة بتقنية نمذجة الترسيب المنصهر، مع خيوط بقطر 1.75 مم من حمض البولي لاكتيك (PLA) والبولي إيثيلين تيريفثالات جليكول (PETG) (جدول المواد). كانت معايير الطباعة المستخدمة في تصنيع العينات كما يلي: سرعة حركة الفوهة (0.4 مم) 1800 مم/دقيقة؛ سرعة الطبقة الأولى 300 مم/دقيقة؛ درجة حرارة الفوهة عند البثق 220 درجة مئوية (PLA) و255 درجة مئوية (PETG)؛ درجة حرارة السرير 60 درجة مئوية؛ ارتفاع الطبقة 0.08 مم؛ عرض البثق 0.48 مم و؛ كثافة الحشو 100٪ لجميع العينات. لم تتطلب أي من العينات استخدام هياكل دعم. تكونت النماذج ثلاثية الأبعاد من أقراص، وألواح ذات قاع مسطح، وجهاز كالغاري بيوفيلم (CBD)، وجهاز روبينز المعدل (MRD). تم تصميم الأقراص كأسطوانة بقطر 6 مم × 6 مم (ارتفاع).
بالنسبة لل CBD، تم إنشاء نموذج (جدول المواد). تكون CBD من جزأين: لوحة قاعدة، ولوحة ميكروتيتر قياسية ب 96 بئر (صيغة ANSI/SLAS)، وغطاء (صفيحة دبابية): غطاء بوليمر (PLA أو PETG) يحتوي على 96 وتدا أسطوانيا بقطر 2 مم و5 مم (ارتفاع). تم تطوير MRD بدبابيس بقطر 4 مم (قطر وارتفاع) مثبتة في نموذج لولبي (جدول المواد). بعد الانتهاء من عملية الطباعة، تمت إزالة النماذج بعناية من لوحة البناء، وفحصها بصريا بحثا عن أي تشوهات، ثم تعقيم بأكسيد الإيثيلين.
نموذج القرص للغشاء الحيوي الثابت
تم استخدام هذه الطريقة لتحفيز تكوين الغشاء الحيوي على PLA باستخدام الأقراص الأسطوانية 6 مم ×6 مم 23 الموصوفة سابقا (الشكل 1).

الشكل 1: أقراص PLA وPETG ولوحة ب 24 بئر لتكوين الأغشية الحيوية على نماذج هذه الأقراص. (أ) أقراص PLA وPETG مطبوعة ثلاثية الأبعاد ممثلة قبل التلقيح البكتيريا وتكوين الأغشية الحيوية. (ب) أقراص PLA وPETG موضوعة في صفيحة ب 24 بئرا أثناء تحفيز الأغشية الحيوية تحت ظروف الزراعة المختبرية . الاختصارات؛ PLA = حمض بولي لاكتيك؛ PETG = بولي إيثيلين تيريفثالات غليكول معدل. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
تم تخزين S. aureus عند −80 درجة مئوية في مرق الصويا التريبتي (TSB) مع مكمل 15٪ جلسرول، وقبل كل تجربة، تم زراعته على الأجار الدموي وحضانه لمدة 24 ساعة عند 37 درجة مئوية. تم إعادة تعليق مستعمرة معزولة في 10 مل من TSB مع تغذية 50 مللي مولار جلوكوز، وأضيفت إلى أنبوب مخروطي بسعة 50 مل، وحضنتها لمدة 24 ساعة عند 37 درجة مئوية في هزاز مداري بسرعة 120 دورة في الدقيقة. تم طرد مركزي الزراعة الناتجة لمدة 5 دقائق عند 200 × جم، وتم التخلص من المادة الفائقة. تم غسل الحبيبة ثلاث مرات بكمية 10 مل من المحلول المعقم بنسبة 0.9٪ NaCl. في الخطوة النهائية للغسل، تم إعادة تعليق الحبيبة في 10 مل من TSB طازج للحصول على تعليق بكتيري بعكارة تعادل معيار ماكفارلاند 0.5 (حوالي 1.5 ×10 8 CFU/mL)، كما تم تحديده بواسطة القياس النفيلومتري. ثم تم تخفيف التعليق بنسبة 1:10 في 10 مل من TSB في أنبوب مخروطي بحجم 15 مل لتحقيق تركيز بكتيريا نهائي يبلغ 107 CFU/mL. في التجارب على الأقراص، أضيف 2 مل من التعليق البكتيري السابق إلى كل بئر من صفائح 24 بئر معقمة لتغطية كل مجموعة من الأقراص (PLA وPETG) لمدة ساعتين للسماح بالالتصاق الخلوي. ثم تم نقل الأقراص بشكل معقم باستخدام ملقط معقم إلى صفيحة معقمة جديدة تحتوي على 2 مل من 0.9٪ NaCl لإزالة الخلايا العوالية. تمت إضافة 10 مل من TSB طازجة إلى الآبار، وتم حضن الصفائح عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة. خلال هذه الخطوة، تكون الخلايا الملتصقة بأسطح القرص طبقة حيوية. بعد الحضانة، تم استنشاق وسط الزراعة، وغسلت الأقراص ب 2 مل من 0.9٪ NaCl لإزالة الوسط المتبقي والخلايا غير الالتصقة. تم تجهيز صفيحة ب 24 بئر تحتوي على 1 مل من محلول الفانكومايسين عند تخفيف تسلسلي (2–4,096 ملغ/لتر)، وتم غمس الأقراص لمدة 24 ساعة. تم تضمين مجموعة ضابطة بدون فانكومايسين (NaCl 0.9٪). بعد 24 ساعة، تم غسل الأقراص ب 2 مل NaCl بنسبة 0.9٪.
لقياس البكتيريا الملتصقة على الأقراص، تم نقل كل قرص باستخدام ملقط معقم إلى أنبوب دقيق يحتوي على 1 مل من NaCl معقم بنسبة 0.9٪ وتم سوتيكه في حمام فوق صوتي لمدة 15 دقيقة عند 40 كيلوهرتز و37 درجة مئوية لفصل الخلايا الملتصقة. تم تدوير الأنابيب الدقيقة لمدة 60 ثانية لضمان تفكيك كامل لمجموعات الخلايا. تم طلاء 100 ميكرولتر من العينة غير المخففة (10°) و10⁻2 و10⁻4 في NaCl معقم بنسبة 0.9٪ على TSA وحضانها لمدة 24 ساعة عند درجة حرارة 37 °م. تم قياس نمو البكتيريا عن طريق عد CFU على لوحة ويعبر عنها كCFU/mL.
ألواح ذات 24 بئرا مسطحة القاع لتركيز أقل قدر ممكن من القضاء على الأغشية الحيوية
في التجارب على ألواح 24 بئرا، أضيف 3 مل من التعليق البكتيري (المحضر كما هو موضح أعلاه) إلى كل بئر لمدة ساعتين للسماح بالالتصاق الخلوي بشكل كاف. بعد ذلك، تم استنشاق التعليق البكتيري، وأضيف 3 مل من NaCl المعقم بنسبة 0.9٪ لإزالة الخلايا العوالقة. ثم أضيف 3 مل من TSB طازجة، وتم حضن الصفائح عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة. خلال هذه الخطوة، تشكل الخلايا الملتصقة بأسطح الآبار طبقة حيوية. بعد الحضانة، تم استنشاق TSB، وغسلت الآبار ب 3 مل من NaCl بنسبة 0.9٪ لإزالة الخلايا المتوسطة المتبقية والخلايا غير الملتصقة. تمت إضافة 3 مل من محلول الفانكومايسين عند التخفيف التسلسلي (2–4096 ملغ/لتر) إلى كل بئر. تم تضمين مجموعة ضابطة بدون فانكومايسين (NaCl 0.9٪).
بعد 24 ساعة، تم إزالة المحلول، وغسل كل بئر بلطف مرتين بسعة 3 مل من 0.9٪ NaCl. تمت إضافة ثلاثة ملليلتر من 0.9٪ NaCl إلى كل بئر، وتم تغطية اللوحة وإغلاقها بطبقة بارافيلم، ثم تم تثبيتها في حمام فوق صوتي لمدة 15 دقيقة عند 40 كيلوهرتز و37 درجة مئوية لفصل الفيلم الحيوي الملتصق. تم جمع أليكوت بمقدار 100 ميكرولتر من الآبار، وتم طلاء العينة غير المخففة (10°) وتخفيفات 10⁻2 و10⁻4 المحضرة في NaCl معقم بنسبة 0.9٪ على TSA وحضنتها لمدة 24 ساعة عند 37 درجة مئوية. ثم تم قياس نمو البكتيريا عن طريق عد CFU/mL. تم إجراء جميع التجارب على ثلاث نسخ. تم تعريف الحد الأدنى من تركيز القضاء على الأغشية الحيوية (MBEC) بأنه تقليل لا يقل عن 3 log10 مقارنة بمجموعة الضابطين (الشكل 2).

الشكل 2: ألواح مطبوعة ب 24 بئرا. (أ)ألواح ذات 24 بئر مطبوعة ب PLA. (ب)ألواح ذات 24 بئر مطبوعة ب PETG. الاختصارات؛ PLA = حمض بولي لاكتيك؛ PETG = بولي إيثيلين تيريفثالات غليكول. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
جهاز الأغشية الحيوية في كالغاري
يتكون CBD من صفيحة ميكروتيتر بسعة 96 بئر وغطاء يحتوي على 96 دبابة، كل واحدة مصممة لتناسب بدقة داخل البئر عند وضع الغطاء على اللوحة. لتحفيز تكوين الغشاء الحيوي، تم ملء كل بئر من صفيحة معقمة مكونة من 96 بئر بسعة 200 ميكرولتر من التعليق البكتيري، ثم وضعت أغطية مشابك معقمة على اللوحة. تم حضن الألواح المجمعة عند درجة حرارة 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة تحت ظروف ثابتة للسماح بتطور الأغشية الحيوية على الأوتاد. بعد الحضانة، تم شطف أغطية الأوتاد بلطف في صفيحة تحتوي على 96 بئر تحتوي على 200 ميكرولتر من 0.9٪ NaCl لإزالة الخلايا العوالقية. تم غمس الصفيحة التي تحتوي على الأوتاد في صفيحة أخرى تحتوي على 96 بئر تحتوي على فانكومايسين بتركيزات تدريجية (2–4,096 ملغ/لتر) وحضنتها عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة تحت ظروف ثابتة.
تم شطف اللوح مع الأوتاد في صفيحة بسعة 96 بئر تحتوي على 200 ميكرولتر من 0.9٪ NaCl، وتم ختم الأوتاد بعناية في صفيحة TSA بقطر 15 سم وحضنتها عند 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة. لوحظ نمو بكتيريا، وتم تعريف MBEC بأنه أدنى تركيز لا يحدث فيه نمو. تم إجراء جميع التجارب بثلاث نسخ (الشكل 3).

الشكل 3: جهاز كالغاري وألواح ذات قاع مسطح بسعة 96 بئر مطبوعة ب PLA وPETG. (A) جهاز كالغاري مطبوع ب PLA. (ب)ألواح ذات 96 بئر مسطحة القاع مطبوعة ب PLA. (ج) جهاز كالغاري مطبوع ب PETG. (D) ألواح ذات قاع مسطح ب 96 بئر مطبوعة ب PETG. الاختصارات؛ PLA = حمض بولي لاكتيك؛ PETG = بولي إيثيلين تيريفثالات جليكول. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
نظام ديناميكي تحت ظروف تدفق مستمرة
يحتوي كل MRD على خمسة أوتاد فردية مثبتة في نموذج لولبي ومرتبة خطيا على قناة ذات مقطع عرضي مستطيل. تكون النظام الديناميكي من قارورة تحتوي على 1 لتر من المحلول مع المضاد الحيوي المراد اختباره متصلا بمضخة بيريستالية عبر أنبوب سيليكون مرتبط ب MRD. تم التجميع في خزانة تدفق هواء طبقية لمنع التلوث. تم الحفاظ على معدل التدفق المتوسط عند 1 مل/دقيقة وتم تدويره عبر النظام لمدة 24 ساعة. يتم التخلص من السائل المار عبر جهاز MRD في قارورة زجاجية أخرى (دون إعادة تدوير).
تم تحفيز أغشية S. aureus على أوتاد MRD، حيث أسقطت الأوتاد على صفائح 24 بئر مع TSB بتركيز 3 مل بتركيز 107 CFU/mL. تم شطف الأوتاد بلطف بالغمر في صفيحة تحتوي على 24 بئر مملوءة بمحلول NaCl بسعة 3 مل من 0.9٪. تم تثبيت المسامير بعناية في MRD (n = 5). تم حقن محلول فانكومايسين (40 ملغ/لتر) مخفف بنسبة 0.9٪ NaCl عبر MDR باستخدام المضخة كما هو موضح أعلاه لمدة 24 ساعة. تم تضمين مجموعة ضابطة بدون مضادات حيوية (0.9٪ NaCl). تم اختيار هذا التركيز بناء على تركيز المصل الذي تم الحصول عليه خلال الجرعات العالية من فانكومايسين الوريدي، كما هو موضح سابقا24. تمت إزالة الدبابيس معقمة من جهاز MRD باستخدام ملقط معقم، ووضعت في أنابيب دقيقة تحتوي على 1 مل من NaCl معقم بنسبة 0.9٪ بعد الغسل ب 0.9٪ NaCl، وتم تحويلها إلى صوت في حمام فوق صوتي لمدة 15 دقيقة عند 40 كيلوهرتز و37 درجة مئوية لضمان الانفصال الكامل للغشاء الحيوي. تم تدوير الأنابيب الدقيقة لمدة 60 ثانية، وتم تكرار العملية ثلاث مرات لتعطيل تجمعات الأغشية الحيوية المتبقية. تم طلاء أليكوت بسعة 100 ميكرولتر على TSA، وتم حضن الصفائح لمدة 24 ساعة عند درجة حرارة 37 درجة مئوية. تم قياس نمو البكتيريا والتعبير عنه كوحدة CFU/mL (الشكل 4).

الشكل 4: جهاز روبينز المعدل مع PETG وPLA وصورة للنظام الديناميكي. (أ) جهاز روبينز معدل مطبوع ب PETG أو PLA. (ب) صورة للنظام الديناميكي. الاختصارات؛ PLA = حمض بولي لاكتيك؛ PETG = بولي إيثيلين تيريفثالات جليكول. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
المجهر الإلكتروني الماسح
لتصور شكل وبنية الأغشية الحيوية، تم إجراء المجهر الإلكتروني الماسح (SEM) على الأقراص. تم تحفيز الغشاء الحيوي على الأقراص كما هو موضح في البروتوكولات. تمت إزالة الأقراص بعناية من اللوحة باستخدام ملقط معقم وثبتها بمحلول (0.68 جرام سكاروز، 0.42 جرام من كاكودييلات الصوديوم، 0.6 مل 30٪ جلوتارالدهايد)، مع 19.4 مل من الماء منزوع الأيون، لمدة 45 دقيقة. بعد ذلك، تم نقل العينات إلى محلول عازل (0.68 جرام سكروز و0.42 جرام من كاكوديلات الصوديوم) لمدة 10 دقائق. ثم تم تجفيف العينات في سلسلة إيثانول متدرجة (35٪، 50٪، 70٪، و100٪) لمدة 10 دقائق لكل منها. بعد ذلك، تم نقل العينات إلى طبق بتري آخر وتغطيتها بمادة هيكساميثيل ديزيلازان بنسبة 100٪ لمدة 10 دقائق. وأخيرا، تم طلاء الأقراص بالذهب باستخدام مضخة دوارة وتركيبها على جزء معدني للملاحظة تحت تكبيرات مختلفة على مجهر إلكتروني ماسح (الشكل 5).

الشكل 5: المجهر الإلكتروني الماسح لنماذج PLA وPETG المطبوعة ثلاثية الأبعاد مع وبدون الحث البيوفيلم. (أ) صورة بالمجهر الإلكتروني الماسح لPLA بدون فيلم حيوي. (ب) صورة مجهرية إلكترونية ماسحة ل PETG بدون فيلم حيوي. (ج) صورة مجهرية إلكترونية ماسحة لبكتيريا تشكل الأغشية الحيوية على أقراص PLA. (د) صورة ميكروسكوبية إلكترونية ماسحة لبكتيريا تشكل الأغشية الحيوية على أقراص PETG. تظهر C و D سمات نموذجية للأغشية الحيوية: تنظيم البكتيريا في بنية ثلاثية الأبعاد، التصاق بالأسطح، ووجود مصفوفة خارج الخلية. شريط القياس الأبيض يمثل 10 ميكرومتر. الاختصارات؛ PLA = حمض بولي لاكتيك؛ PETG = بولي إيثيلين تيريفثالات غليكول. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
التحليل الإحصائي
كانت بعض التحليلات وصفية. بالنسبة للبيانات الكمية، برر حجم العينة استخدام الوسيط مع النطاق الرباعي، مع اختبار مان-ويتني للمقارنة الإحصائية. تم اعتبار قيمة p < 0.05 ذات دلالة إحصائية.