$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
المصفوفة خارج الخلية (ECM) هي هيكل هيكلي وكيميائي حيوي أساسي يحدد الخصائص الميكانيكية للأنسجة ويدعم وظائفها البيولوجية. على سبيل المثال، الأنسجة المرنة مثل الرئتين والشرايين غنية بمادة ECM المعتمدة على الكولاجين والإيلاستين، والتي توفر المرونة الميكانيكية اللازمة لتكرار دورات التمدد والارتداد أثناء التنفس. على النقيض من ذلك، يحتوي الجهاز العصبي المركزي على ECM غني بالجليكوزامينوجليكان، مما يخلق بيئة شديدة التوافق ومحسنة للتمايز العصبي وإرسال الإشارات1. عبر أنسجة مختلفة داخل الجسم، يمتد تيبس الأنسجة إلى عدة مراتب حجم، تتراوح من مئات الباسكال في الأنسجة الرخوة مثل الدماغ والرئتين إلى مستويات ميغاباسكال وجيجاباسكال من الصلابة في الأوتار والعظم، على التوالي 2,3. هذه الاختلافات الميكانيكية ليست مجرد هيكلية بل تلعب أيضا دورا حاسما في تنظيم سلوك الخلية 4,5. على سبيل المثال، تخضع الخلايا الجذعية الميزنشيمية لتحديد سلالة تعتمد على الصلابة، حيث تتبنى مصائر عصبية على الركائز اللينة، ومصائر ميوجينية على الركائز الوسيطة، ومصائر عظمية على الركائز الصلبة6. يمكن للتغيرات المرضية في صلابة ECM أن تدفع أيضا استجابات خلوية شاذة وتساهم في بدء وتقدم المرض 7,8,9. وبالمثل، فإن التغيرات في خصائص ECM حول الخلايا تغير وظيفة العضيات وسلوكيات الخلايا المختلفة10,11. على الرغم من الأهمية المعترف بها لإدارة الإشارات الكيميائية في توجيه الإشارات، ووظيفة العضيات، وتكوين الأمراض، إلا أن الآليات التي تستشعر الخلايا إشارات ECM وتحولها إلى إشارات كيميائية حيوية لا تزال غير مفهومة بشكل كامل.
لقد أعاق التقدم في فهم التفاعل الداخلي بين الخلايا وECM جزئيا بسبب محدودية توفر منصات تجريبية توفر تحكما دقيقا في خصائص ECM مع الحفاظ على التوافق الكامل مع الفحوصات الكيميائية الحيوية القياسية وسير عمل التصوير. بالإضافة إلى ذلك، ينظر إلى دراسة تفاعلات الخلايا والإلكترونيات الإلكترونية غالبا على أنها تحد تقني، لأنها تتطلب خبرة متعددة التخصصات تشمل علوم المواد، وعلم الأحياء الخلوي، والهندسة الحيوية. تهدف هذه الطريقة إلى معالجة هذه التحديات من خلال توفير بروتوكولات خطوة بخطوة لتوليد ركائز ECM تعتمد على ال PA والسيليكون بخصائص ميكانيكية محددة، ويمكن تحضيرها بسهولة في معظم بيئات المختبرات الرطبة.
الهيدروجيلز PA ذات الصلابة القابلة للتعديل هي أساسيات في علم الأحياء الميكانيكي؛ ومع ذلك، غالبا ما تتأثر فائدتها بارتفاع تكلفة الكواشف لاقتران ECM، وعدم اتساق وظائف السطح، وضعف التوافق مع سير العمل الكيميائي الحيوي واسع النطاق. بالإضافة إلى ذلك، لم تكن هناك طرق عملية وموحدة لجمع العينات والتصوير عبر ركائز ذات صلابة متفاوتة غير راسخة. يمكن معالجة هذه الاختناقات باستخدام منصة الجل PA التي وصفناها والتي تتميز بأربعة ابتكارات رئيسية: (1) تقليل كبير في التكاليف، (2) كيمياء الوظيفية القابلة لإعادة الإنتاج، (3) الإنتاج القابل للتوسع عبر الأجهزة القابلة لإعادة الاستخدام، و(4) الدمج السلس مع العديد من اختبارات بيولوجيا الخلايا التقليدية والكيميائية الحيوية. يستخدم هذا النهج نسب مختلفة من الأكريلاميد وبيساكريلاميد لتوليد هيدروجيلز ذات خصائص ميكانيكية مميزة (الجدول 1). جل PA خامد ولا يتوافق مباشرة مع بروتينات ECM. لذلك، يستخدم تفاعل بلمرة الراديكاليات الحرة الذي يبدأ بالأشعة فوق البنفسجية لدمج شبكة رقيقة متشابكة من رباعي أكريلات ثنائي (تريميثيلولبروبان)، وحمض الأكريليك إن-هيدروكسي سكوسينيميد إستر (NHS-أكريلات)، وبيساكريلاميد على سطح جل PA (الشكل 1). تخلق هذه الشبكة سطحا لاصقا ثنائي الفعل لبروتينات ECM: يوفر NHS-الأكريلات تثبيتا تساهميا مستقرا لبروتينات ECM، بينما يسهل رباعي الأكريلات امتصاص بروتين ECM الموحد12. بالإضافة إلى ذلك، نقدم طرقا توضح كيفية استخراج البروتينات والأحماض النووية مثل الحمض النووي الريبي من هذه الركائز بطريقة متوافقة مع تحليلات بيولوجيا الخلايا اللاحقة مثل التحليل الغربي للبالتقويم وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي العكسي (RT-qPCR). علاوة على ذلك، تدعم ركائز PA المتوافقة الناتجة أيضا تكوين الكرويدات ووضعها ضمن مستوى بؤري متسق، مما يمكن من التحليل المنهجي لسلوكيات الخلايا ثلاثية الأبعاد13.
على النقيض من ذلك، تقيد القيود البصرية للهيدروجيلز PA استخدامها في وسائل التصوير المتقدمة، خصوصا المجهر14 للانعكاس الداخلي الكلي (TIRF). لمعالجة هذا القيد، طورنا ركائز ECM قابلة للتعديل ميكانيكيا تعتمد على السيليكون ومحسنة لتصوير TIRF. تظهر هذه المواد معامل انكسار مماثل للزجاج مع الحفاظ على صلابة قابلة للتعديل عبر نطاق واسع (الشكل 2A). طبقة رقيقة من جل السيليكون، بنسب أجزاء مختلفة، تغلى بالدوران على زجاج تغطية قبل اقتران ECM (الشكل 2B والجدول 2). ومع ذلك، فإن الكراهية المائية الجوهرية وخاملة السيليكون الكيميائية تمنع الاقتران المباشر لل ECM. لذلك ننفذ استراتيجية تعديل السطح لتمكين الارتباط التساهمي لروابط ECM. معالجة بلازما الأكسجين تدخل مجموعات الهيدروكسيل على سطح السيليكون (الشكل 2C). لاحقا، يحول (3-أمينوبروبيل) تري إيثوكسيسيلان (APTES) هذه المجموعات الهيدروكسيل إلى أمين تفاعلي. 1-إيثيل-3-(3-ثنائي ميثيل أمينوبروبيل) هيدروكلوريد الكربوديميد (EDC)، وهو رابط متقاطع للكربوديديميد بطول صفري، يسهل تكوين روابط أميدية تساهمية بين مجموعات الأمين على سطح الجل ومجموعات الكربوكسيل على بروتينات ECM.
توفر هذه المنصات مجتمعة أنظمة فعالة من حيث التكلفة، قابلة للتكرار، وقابلة للتوسع لاستكشاف آليات الإشارة المعتمدة على صلابة ECM. تسمح مرونتها بالتكامل بسلاسة مع الاختبارات الكيميائية الحيوية، والتصوير عالي الدقة، وسير العمل عالي الإنتاجية، مما يمكن من دراسة كيفية تأثير صلابة ECM على سلوك الخلايا وتحفيز تقدم الأمراض.