جميع الإجراءات امتثلت للوائح المؤسسية والوطنية وتمت الموافقة عليها من قبل لجنة الأخلاقيات في مستشفى شعب شينغتاي (رقم 2024-124). تم التنازل عن شرط الموافقة المكتوبة المستنيرة لأن البيانات السريرية التي جمعت بشكل روتيني وتم استخدام عينات متبقية. تم إخفاء هوية جميع البيانات قبل التحليل.
تصميم الدراسة، الإعداد، والمخطط العام
أجريت هذه الدراسة كمجموعة رصدية مركزية واحدة تهدف إلى تقييم الآثار السريرية ل MMP-12 في المصل وورم CDH13، بشكل فردي ومجتمع، في تصنيف جزيئات سرطان الرئة والعلاج الشخصي. أجريت الدراسة في مستشفى شينغتاي الشعبي. تم تحديد المرضى المؤهلين الذين أداروا بين يناير 2021 ويونيو 2022، وتم تسجيل 262 مريضا متتاليا استوفوا معايير الإدراج والاستبعاد المحددة مسبقا.
يتم توضيح سير العمل العام للدراسة في الشكل 1. يعرض المخطط العملية الكاملة من تحديد هوية المريض إلى التحليل، بما في ذلك فحص المرضى وتسجيله، والتوصيف السريري المرضي الأساسي والتحليل الجزيئي المستمد من الاختبارات السريرية الروتينية، وجمع ومعالجة المصل قبل العلاج، وتحضير أنسجة الورم لكيمياء المناعة CDH13، وقياس كمية MMP-12 في المصل، وتقييم CDH13 المناعي، وتصنيف العلاج الخط الأول ومسارات العلاج اللاحقة، والنتيجة الطولية التأكيد، بما في ذلك الاستجابة للعلاج، والبقاء بدون تقدم، والبقاء على قيد الحياة بشكل عام. يميز المخطط بين تحليلات التشخيص والتحليل الجزيئي عن تحليلات العلاج والنتائج، ويشير إلى النقاط الزمنية التي تم فيها جمع العينات الحيوية، وتوليد النتائج الجزيئية، وبدء العلاج، وإجراء تقييمات المتابعة.
فحص المشاركين، معايير الأهلية، وتجريد البيانات السريرية
تم تحديد المرضى المؤهلين المحتملين من نظام معلومات المستشفى وسجل علم الأمراض خلال نافذة التسجيل المحددة مسبقا (يناير 2021 إلى يونيو 2022). تم تأكيد وجود سرطان رئة أولي باستخدام علم الأمراض النسيجي، مع دعم مراجعة سريرية متعددة التخصصات عند الحاجة. تم تسجيل المرضى البالغين المتتاليين الذين استوفوا جميع معايير الأهلية. شملت معايير الإدراجة وجود سرطان رئة أولي مؤكد نسيجيا، وتوفر عينة مصل قبل العلاج تم الحصول عليها قبل بدء أي علاج مضاد للورم (وقبل الجراحة لدى المرضى الذين يخضعون للاستئصال الأولي)، وتوفر نسيج ورمي كاف لكيمياء المناعة النسيجية CDH13، وتوفر معلومات النوع الجزيئي الفرعي التي تم توليدها كجزء من الرعاية السريرية الروتينية. تم استبعاد المرضى الذين لديهم تاريخ موثق لورم خبيث آخر قبل التسجيل، والمرضى الذين لم يكن لديهم حجم مصل كاف أو تدهور سلامة العينة، والمرضى الذين لم يكن لديهم نسيج ورمي مقيم لتقييم CDH13، والمرضى الذين تلقوا علاجا جهازيا مضادا للسرطان قبل جمع الدم في المرحلة الأساسية.
تم استخراج البيانات السريرية المرضية والعلاج من السجلات الطبية الإلكترونية باستخدام نموذج تقرير حالة موحد مع تعريفات متغيرات محددة مسبقا وقواعد ترميز. شملت المتغيرات المسجلة التركيبة السكانية (العمر والجنس)، التعرض للتدخين، حالة أداء مجموعة الأورام التعاونية الشرقية (ECOG)، الأمراض المصاحبة، نتائج التصوير الأساسية، النوع النسيجي، مرحلة الورم والعقدة-النقائل (TNM) (وفقا لنظام المراحل المستخدم في الممارسة السريرية الروتينية خلال فترة الدراسة)، معايير المختبر الأساسية، ومعلومات العلاج التفصيلية (بما في ذلك النظام الأول، وتواريخ البدء، وتعديلات الجرعة، وانتقالات العلاج). تم قياس التعرض للتدخين بسنوات العلبة كما يلي: سنوات العلبة = (سجائر يوميا ÷ 20) × سنوات التدخين. عندما يكون تاريخ التدخين غير مكتمل أو غير متسق عبر السجلات، يتم تصنيف متغير التدخين على أنه غير معروف، وتم توثيق المصدر كاختلاف في سجل التجريد؛ تم التعامل مع الاختفاء وفقا لخطة التحليل الإحصائي المحددة مسبقا.
جمع العينات ومعالجتها وتخزينها
تم جمع دم الأوردة الطرفية في البداية قبل بدء أي علاج مضاد للأورم. تم فصل المصل عن طريق الطرد المركزي بحرارة 1,500 × جرام لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة. تم نقل المادة الفائقة في المصل إلى الكريوفيالات منخفضة الارتباط دون إزعاج الطبقة الخلوية. تم توزيع المصل إلى أجزاء تتراوح بين 200–500 ميكرولتر لتقليل دورات التجمد والذوبان، وتم تخزين الكميات عند −80 درجة مئوية حتى تحليل الدفعات. تم تسجيل الفترة من جمع الدم إلى التجميد لكل عينة، وتم استبعاد العينات التي تجاوز وقت الجمع إلى التجميد ساعتين.
تم تطبيق إجراءات مراقبة جودة محددة مسبقا قبل التحليل من خلال توثيق تحلل الدم والدهون في مرحلة المعالجة. تم استبعاد العينات التي ظهرت بشكل واضح من قياس ELISA. تم إذابة أليكوات المصل على الثلج مباشرة قبل الاختبار، وخلطها بعكس لطيف، وطرد مركزها عند 2000 × جرام لمدة 5 دقائق لإزالة الجسيمات عند الحاجة. تم تجنب التحريك القوي والدوامات لمنع تكون الفقاعات والتشوهات البصرية أثناء قياسات الامتصاص.
اكتساب وتحضير أنسجة الورم
تم الحصول على نسيج ورمي من إجراءات تشخيصية روتينية (الخزعة، تنظير القصبات، خزعة الإبرة الأساسية، أو الاستئصال الجراحي). تم تثبيت الأنسجة في فورمالين محايد ومخزن وفقا لممارسة علم الأمراض القياسي وتم دمجها في البارافين. تم إعداد مقاطع (3–4 ميكرومتر) على شرائح مشحونة للكيمياء المناعية النسيجية. تم تخزين الشرائح غير المصبوغة في بيئة جافة بدرجة حرارة الغرفة وصبغها خلال فترة محددة مسبقا لتقليل تحلل المستضدات. تم الاحتفاظ بسجل سلسلة الحجز يربط معرفات العينات برموز الدراسة التي تم إلغاء التعريف. تم إعماء الطبيب الشرعي الذي أجرى تقييم CDH13 عن قيم MMP-12 في المصل، والنوع الجزيئي، والعلاج، والنتائج.
قياس كمية مصل MMP-12 باستخدام اختبار التوربنت المناعي المرتبط بالإنزيمات (ELISA)
تم جمع دم الأوردة الطرفية قبل أي علاج مضاد للأورم، ويفضل أن يكون ذلك خلال 7 أيام قبل الخزعة أو بدء العلاج. تم قياس مصل MMP-12 باستخدام مجموعة ELISA تجارية بشرية من نوع MMP-12. تم إذابة كل قطعة مصل مرة واحدة على الثلج، وخلطها برفق، واختبارها في نسخة طبق تعليمات المجموعة. تم توليد منحنى قياسي على كل لوحة باستخدام تخفيفات تسلسلية للمعيار المؤتلف المرفق، وتمت قراءة الامتصاص عند 450 نانومتر مع تصحيح مرجعي باستخدام قارئ الميكروبلايت. تم حساب التكثفات عن طريق تركيب منحنى معيار الانحدار اللوجستي المكون من أربعة معاملات. لضمان المتانة التحليلية، تم تضمين مصل مراقبة الجودة الداخلية (QC) على كل لوحة وتمت مراقبته للتأكد من دقة الفحص داخل الاختبار وبين الاختبارات (معاملات التغير المستهدفة المتوافقة مع التحقق من صحة الاختبار). إذا انخفضت النتائج إلى ما دون الحد الأدنى للكمية، يتم تخصيص نصف هذا الحد للتحليل الإحصائي؛ إذا تجاوزت النتائج الحد الأعلى، يعاد القياس بعد التخفيف المناسب. لتقليل تأثيرات الدفعات، تم تخصيص عينات عشوائيا عبر اللوحات، وتم تضمين مجموعة مطابقة من مصل QC على كل لوحة لتتبع التغير بين الصفائح. كان موظفو المختبر الذين أجروا ELISA غير معينين عن التجميع السريري والنتائج.
كيمياء المناعة النسيجية للورم CDH13 والتسجيل المناعي النشط
تم إجراء الكيمياء المناعية النمطية لمادة CDH13 على أقسام أورام مثبتة بالفورمالين ومدمجة بالبارافين باستخدام جسم مضاد أولي مضاد CDH13 موثق. تم اكتشاف مركبات المستضدات-الأجسام المضادة باستخدام نظام كشف قائم على البوليمر، وتم رؤية التلوين باستخدام 3,3′-ديامينوبينزيدين (DAB). تم تطبيق سير عمل مماثل للصبغ على جميع عينات الدراسة؛ تمت معالجة الشرائح على دفعات وتضمنت عناصر التحكم المناسبة.
تم تقسيم كتل البارافين بعمق 3–4 ميكرومتر، وتم إزالة البارافين من الزيلين، وإعادة ترطيبها عبر الإيثانول المصنف إلى ماء مقطر. تم استرجاع الملحمة الناتج عن الحرارة في مخزن سترات (10 مللي مول، درجة حموضة 6.0) باستخدام فرن ميكروويف عند 95–100 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة، تلاها التبريد إلى درجة حرارة الغرفة لمدة 20 دقيقة. تم تبريد نشاط البيروكسيداز الداخلي ب 3٪ بيروكسيد الهيدروجين لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة، وتم إجراء حجب البروتين باستخدام محلول حجب المصل العادي لمدة 20 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. تم حضن الأقسام بالجسم المضاد الأساسي لمادة CDH13 طوال الليل عند درجة حرارة 4 درجات مئوية. بعد الغسيل، تم تطبيق كاشف الكشف الثانوي القائم على البوليمر لمدة 20–30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة، تلاها الرؤية بكروموجين 3,3′ DAB لمدة 3–5 دقائق تحت مراقبة مجهرية. تم طلاء الأقسام بالهيماتوكسيلين، وتجفيفها عبر الإيثانول المتدرج، وتطهيرها بالزيلين، وتركيبها على وسط تثبيت دائم.
تم تضمين ضوابط جودة داخلية في كل عملية تلوين. تمت معالجة قسم نسيج معروف إيجابي ل CDH13 بالتوازي كضابط إيجابي، وتم حذف الجسم المضاد الأساسي في الضابط السلبي. تم قبول السحب فقط عندما أظهر العنصر المثبت نمط التلوين المتوقع بشدة مناسبة، أما الضابط السلبي فلم يظهر أي صبغة محددة. تم تكرار التلوين في الفترات التي تحتوي على خلفية مفرطة، أو فشل في أداء التحكم، أو مع إشارة غير محددة تؤثر على التفسير.
تم قياس تعبير CDH13 باستخدام درجة النشاط المناعي (IRS) المستمدة من شدة التلوين ونسبة الخلايا الورمية الإيجابية. قام اثنان من أخصائيي علم الأمراض المدربين بتقييم جميع الشرائح بشكل مستقل بينما كانوا عميان عن قياسات مؤشرات المصل الحيوية، والنوع الجزيئي، والعلاج، والنتائج. تم حل الدرجات المتباينة من خلال مراجعة مشتركة على مجهر متعدد الرؤوس، وتم تسجيل مصلحة الضرائب الأمريكية التي تم البت عليها. تم تحديد شدة التلوين على أنها 0 (بدون صبغ)، 1 (ضعيف)، 2 (متوسط)، أو 3 (قوي). تم تعيين نسبة الخلايا الورمية الإيجابية إلى 0 (0٪)، 1 (1–10٪)، 2 (11–50٪)، 3 (51–80٪)، أو 4 (81–100٪). تم حساب مصلحة الضرائب كما يلي: IRS = درجة الشدة × درجة النسبة. تراوحت قيم مصلحة الضرائب بين 0 و12. تم تعريف التعبير المنخفض ل CDH13 بأنه IRS ≤ 3، استنادا إلى عتبة شائعة الاستخدام للتقييم المناعي. تم الاحتفاظ بنظام IRS كمتغير مستمر وفئة ثنائية للتحليلات اللاحقة، بما في ذلك المقارنات بين المجموعات الفرعية ونمذجة المؤشرات الحيوية المجمعة. تم تقييم اتفاق المراقبين في عينة عشوائية محددة مسبقا تتكون من 30٪ من الحالات باستخدام إحصائية كابا مرجحة، وتم توثيق إجراءات العينة، وتقدير الاتفاق، وقرارات الفصل في سجل تدقيق.
التصنيف الجزيئي وتصنيف المعالجة
تم الحصول على معلومات عن النوع الجزيئي من خلال اختبارات سريرية روتينية أجريت على نسيج ورمي تشخيصي. تم توليد النتائج من خلال اختبارات تم التحقق منها سريريا وتم تنفيذها في الرعاية القياسية، بما في ذلك اختبارات مستهدفة تعتمد على PCR، ولوحات تسلسل الجيل القادم المستهدفة، والكيمياء المناعية، والتهجين الفلوري في الموقع. لكل مريض، تم تسجيل نوع الاختبار، ومصدر العينة، وبيان كفاية العينة، وتاريخ التقرير. تم تصنيف المرضى بناء على حالة تغيير المحرك القابلة للتنفيذ، بما في ذلك الطفرات التي تنشط EGFR، إعادة ترتيب ALK، إعادة ترتيب ROS1، طفرات KRAS، طفرات BRAF، تغييرات تخطي إكسون 14 في MET، إعادة ترتيب RET، تعديلات ERBB2، واندماجات NTRK. تم تسجيل نسبة الورم في PD-L1 حيث تم إجراءه، وتم تصنيف تعبير PD-L1 حسب الطبقات المستخدمة في الممارسة الروتينية خلال فترة الدراسة. تم تحديد جميع فئات التصنيف الجزيئي مسبقا قبل التحليل. عندما تم الإبلاغ عن أكثر من تغيير قابل للتنفيذ، تم تعيين المرضى وفقا لقاعدة تصنيف هرمية محددة مسبقا تحدد أولويات التعديلات ذات الدلالات العلاجية الموجهة بالنمط الجيني بالترتيب التالي: طفرات EGFR، إعادة ترتيب ALK، إعادة ترتيب ROS1، طفرات BRAF، تغييرات تخطي إكسون 14 في MET، إعادة ترتيب RET، تغييرات ERBB2، اندماجات NTRK، وطفرات KRAS.
تم استخراج معلومات العلاج من السجلات الطبية، بما في ذلك النظام الأول، وتواريخ البدء والانتهاء، وخطوط العلاج اللاحقة. تم تصنيف الإدارة الأولية إلى فئات علاجية متعارضة ومحددة مسبقا: العلاج الموجه بالنمط الجيني، العلاج القائم على مثبطات نقاط التفتيش المناعي، العلاج الكيميائي، وإدارة متعددة الأساليب التي تدمج الجراحة مع العلاج الجهازي المحيط بالجراحة حسب الاقتضاء. تم تعريف تاريخ المؤشر بأنه تاريخ بدء العلاج الجهازي الخط الأول؛ بالنسبة للمرضى الذين أداروا باستئصال أولي، كان تاريخ المؤشر هو تاريخ الجراحة، وتم تصنيف العلاج الجهازي اللاحق كعلاج مساعد وفقا للسجل السريري. لتحليلات تناولت العلاج الشخصي، تم تصنيف المرضى بشكل مشترك حسب النوع الجزيئي وفئة العلاج، وتمت مقارنة تركيزات MMP-12 في المصل وتعبير CDH13 في الأورام بين المرض الإيجابي للسائق والمرض السلبي للسائق، وبين مجموعات العلاج الموجه ومجموعات العلاج المعتمدة على مثبطات نقاط التفتيش المناعية.
تعريفات النتائج والمتابعة
تم تعريف تاريخ المؤشر بأنه تاريخ بدء العلاج المضاد للأورم من الخط الأول. بالنسبة للمرضى الذين تم إدارتهم بعملية استئصال جراحية مقدمة، تم تعريف تاريخ المؤشر بأنه تاريخ الجراحة؛ تم تصنيف العلاج الجهازي اللاحق كمساعد أو تلطيف وفقا للسجل الطبي. تمت متابعة كل مريض من تاريخ المؤشر حتى الوفاة، أو تاريخ آخر اتصال مؤكد، أو تاريخ الرقابة الإدارية، أيهما يحدث أولا. تم تسجيل مدة المتابعة بالشهور، ولكل نقطة نهاية، تم الاحتفاظ بمؤشر الحدث وتاريخ الحدث أو الرقابة المقابل. تم تحديد النتائج من خلال التجريد المنظم للسجل الطبي الإلكتروني، بما في ذلك تقارير الأشعة، وتوثيق عيادة الأورام، وسجلات المرضى الداخليين، والمتابعة الهاتفية عند الحاجة. تم استخدام نموذج تقرير حالة محدد مسبقا، وطبقت قواعد هرمية موحدة للمصدر. عندما اختلفت التواريخ أو التصنيفات بين السجلات، تم حل التناقضات من خلال إعطاء الأولوية لتقارير الأشعة المعاصرة وملاحظات اتخاذ قرارات العلاج؛ تم توثيق القيمة النهائية المقسمة ومصادرها الداعمة. تم الاحتفاظ بسجل متابعة يسجل تواريخ التصوير، وانتقالات العلاج، وحالات الاستشفاء، ومحاولات الاتصال لتقليل فقدان المتابعة وضمان إمكانية التتبع.
تم تقييم استجابة الورم لدى المرضى الذين يعانون من مرض قابل للقياس وفقا لإصدار RECIST 1.1. تم تصنيف أفضل استجابة شاملة على أنها استجابة كاملة، استجابة جزئية، مرض مستقر، أو مرض تقدمي. تم تعريف معدل الاستجابة الموضوعية بأنه استجابة كاملة أو جزئية، ومعدل السيطرة على المرض بأنه استجابة كاملة، استجابة جزئية، أو مرض مستقر. تم تحديد تواريخ الاستجابة والتقدم بناء على أقدم الأدلة الموثقة.
تم تعريف البقاء بدون تقدم (PFS) بأنه الفترة من تاريخ المؤشر إلى أول ظهور لتقدم المرض أو الوفاة من أي سبب، أيهما يحدث أولا. تم تحديد التقدم بشكل أساسي من خلال تقارير الأشعة التي توثق التقدم وفقا ل RECIST 1.1. عندما لا تتوفر الأشعة في وقت التدهور السريري، كان يقبل التقدم الموثق من الأطباء إذا كان مرتبطا صراحة بسوء عبء الورم ويؤدي إلى تغيير في إدارة مكافحة السرطان. تم فرض رقابة على المرضى الذين لم يحدث حدث في تاريخ آخر تقييم موضوعي، مما يؤكد عدم وجود تقدم. إذا تم بدء خط علاج جهازي جديد دون توثيق صريح لتقدم المرضى، يتم مراجعة التصوير وتقديم توثيق سريري متزامن. إذا لم يكن بالإمكان تأكيد تقدم المرضى، يتم فرض رقابة على المرضى في آخر تقييم شعاعي قبل تغيير العلاج، ويتم تسجيل قاعدة القرار المطبقة.
تم تعريف فترة البقاء الكلي (OS) بأنها الفترة من تاريخ المؤشر إلى الوفاة لأي سبب. تم تحديد الحالة الحيوية باستخدام سجلات المستشفى وملاحظات المتابعة الخارجية، مدعومة بتأكيد هاتفي منظم عند الحاجة. كان تاريخ الوفاة يسجل كما هو موثق في السجل الطبي أو، عندما لا يكون متاحا، كتاريخ أكد من قبل العائلة أثناء التواصل المتابع، مع تسجيل الوثائق الداعمة في سجل المتابعة. تم فرض رقابة على المرضى الذين كانوا على قيد الحياة في تاريخ آخر اتصال مؤكد.
تم تنفيذ سير عمل متابعة موحد يتماشى مع مسارات الرعاية الروتينية. خلال العلاج الجهازي النشط، تم توثيق التقييمات السريرية في كل دورة علاج، وتم تسجيل إعادة التقييمات الإشعاعية على فترات منتظمة تحددها البروتوكول السريري، مع تسجيل طريقة التصوير والتاريخ لكل تقييم. بعد الانتهاء من العلاج الأول أو أثناء المراقبة بعد العملية، تم تسجيل زيارات المتابعة وتقييمات التصوير وفقا للجدول المؤسسي. عندما لم يكن بالإمكان إكمال المتابعة الشخصية، تم إجراء متابعة هاتفية منظمة لتأكيد استمرار العلاج، وتوثيق فترات الاستشفاء المتقطعة، وتأكيد حالة المرض كما هو موثق بالتصوير الخارجي، حيثما كان ذلك مناسبا، وتأكيد حالة البقاء. تم توثيق جميع الزيارات الفائتة، والمحاولات غير القابلة للوصول، وأسباب وقف المتابعة. قبل تصنيف المريض على أنه مفقود للمتابعة، كان يتم محاولة الاتصال مرتين إضافيتين على الأقل في أيام مختلفة، ويتم تسجيل كل محاولة.
تم الحفاظ على الفصل الإجرائي بين تقييم المؤشرات الحيوية وتحديد النتائج. كان الأفراد الذين أجروا قياس MMP-12 في المصل وتسجيل CDH13 عميين عن النتائج السريرية. تم إجراء تجريد النتائج دون الوصول إلى نتائج المؤشرات الحيوية كلما أمكن ذلك. تم تطبيق عملية تقييم من مرحلتين لنقاط النهاية للتقدم والاستجابة. قام ملخص مدرب أو بتعيين تصنيف الأحداث والتواريخ باستخدام القواعد المحددة مسبقا، وبعد ذلك قام أخصائي أول بمراجعة التعيينات بشكل مستقل. تم حل التناقضات من خلال مراجعة مشتركة لتقرير الأشعة الأصلي، وملاحظات الأورام، والجدول الزمني للعلاج، وتم الحفاظ على سجل تدقيق لجميع قرارات الفصل.
تم إجراء فحوصات اتساق لتحديد التسلسلات غير المعقولة، بما في ذلك الأحداث المؤرخة قبل تاريخ الفهرس، أو انتقالات العلاج بدون تقييمات متوافقة، أو تواريخ الوفاة بدون وثائق داعمة. تم التوفيق بين الحالات التي تم الإبلاغ عنها بالعودة إلى الوثائق الأصلية وتحديث مجموعة البيانات بملاحظة تصحيحية مؤرخة تحدد سبب التغيير والأدلة الداعمة.
التحليل الإحصائي
تم إجراء تحليلات إحصائية باستخدام SPSS (الإصدار 26.0) وR (الإصدار 4.3.0). تم تقديم المتغيرات المستمرة كمتوسط ± انحراف معياري أو وسيط (نطاق رباعي)، حسب الاقتضاء، وتم تقديم المتغيرات التصنيفية كأعداد ونسب مئوية. استخدمت المقارنات الجماعية اختبارات بارامترية أو غير بارامتري حسب الحاجة، مع اختبارات كاي-تربيع أو اختبارات فيشر الدقيقة للبيانات الفئوية. كانت جميع الاختبارات ذات الجانبين المختلفين، حيث اعتبر P < 0.05 دلالة إحصائية.
تم اختيار المتغيرات المشتركة مسبقا بناء على الصلة السريرية والأدلة السابقة، وتم تطبيق نفس مجموعة المتغيرات عبر النماذج ذات الصلة لدعم المقارنة. شملت المتغيرات الأساسية العمر، الجنس، التعرض للتدخين، مرحلة TNM، حالة أداء ECOG، والنوع الفرعي النسيجي، مع تعديل إضافي لمجموعة العلاج عندما يكون هدف التحليل هو النوع الجزيئي ضمن السكان المعالجين. تم تقييم التعدد التعاوني باستخدام عوامل تضخم التباين، وتم معالجة التوازي الإشكالي باستخدام قواعد تقليل المتغيرات المحددة مسبقا. تم الإبلاغ عن نسب احتمالات معدلة مع فترات ثقة 95٪ وقيم P ثنائية الوجه. تم تحديد عدد المتغيرات المشتركة المدرجة في نماذج الانحدار اللوجستي متعددة المتغيرات ونموذج كوكس المحدد مسبقا وتقييدا بالنسبة لعدد أحداث النتائج لتقليل خطر التوافق الزائد. ظلت نسبة الأحداث لكل متغير مقبولة (≥10) لجميع النماذج. بالنسبة لنتائج الأنواع الجزيئية متعددة الفئات، تم تركيب نماذج الانحدار اللوجستي متعددة الحدود، أو تم إجراء مجموعة من المقارنات اللوجستية الثنائية باستخدام فئة مرجعية محددة مسبقا، وتم توضيح استراتيجية النمذجة بوضوح.
تم تحليل البقاء بدون تقدم والبقاء الكلي باستخدام تقديرات كابلان-ماير، وتمت مقارنة منحنيات البقاء باستخدام اختبار السجل اللوغاريتمي. تم قياس الروابط بين المؤشرات الحيوية والنتائج باستخدام انحدار المخاطر النسبي كوكس، حيث أبلغ عن نسب المخاطر بفواصل ثقة 95٪. تم بناء نماذج كوكس متعددة المتغيرات باستخدام متغيرات سريرية مرضية محددة مسبقا، بما في ذلك النوع الجزيئي وفئة العلاج، لتقييم الآثار على العلاج الشخصي. تم التحقق من افتراض المخاطر النسبية باستخدام تشخيصات شونفيلد المتبقية ومخططات البقاء اللوغاريتمية ناقص اللوغاريتمية. إذا تم انتهاك افتراض المخاطر النسبية للمتغيرات المشتركة، يتم معالجة المشكلة باستخدام نهج محدد مسبقا مثل التدرج على ذلك المتغير أو تضمين مصطلح تفاعل يعتمد على الزمن، ويتم الإبلاغ عن المواصفات النهائية للنموذج.
تم التعامل مع البيانات المفقودة باستخدام استراتيجية محددة مسبقا. عندما كان النقص ضئيلا، أجريت تحليلات حالة كاملة؛ وإلا، تم استخدام الحساب المتعدد بالمعادلات المتسلسلة، بما في ذلك جميع المتغيرات في النماذج التحليلية. تم توليد عشر مجموعات بيانات محسوبة، وتم حساب التقديرات المجمعة باستخدام قواعد روبين. بالنسبة للتحليلات التي تتضمن مقارنات متعددة بين الأنواع الفرعية أو عدة نقاط نهاية، كان معدل الاكتشاف الخاطئ يضبط باستخدام إجراء محدد مسبقا، أو تم تحديد التحليلات بوضوح كاستكشافية لضمان الشفافية فيما يتعلق بالتعددية.
تم قفل مجموعة بيانات التحليل قبل ملاءمة النموذج، وتم الحفاظ على قاموس بيانات شامل يحدد كل متغير ووحدة ونظام ترميز ونطاق مسموح به. تم تضمين عينات مراقبة جودة مكررة عبر ألواح الفحص لقياس التغير بين الألواح ومراقبة الانحراف. بالنسبة لتقييم الكيمياء المناعية، تم توثيق معايير التقييم، وإجراءات التسمية، وتقييم الاتفاق بين المراقبين، وتم الاحتفاظ بسجلات الفصل للحالات المتناقضة. تم تنفيذ فحوصات النطاق المبرمجة وفحوصات الاتساق المنطقي عبر المتغيرات الرئيسية، بما في ذلك تاريخ الفهرس، وتاريخ جمع العينة، وتاريخ بدء العلاج، وتواريخ النتائج. تم الحفاظ على جميع السكريبتات الإحصائية وسجلات الإخراج التي يتم التحكم بها بالإصدارات لتمكين تكرار سير العمل التحليلي بالكامل.