يصف هذا البروتوكول تطوير نظام مراسل أدينوفيروسي يعتمد على الخلايا الليفية، يتم تحفيزه بواسطة محفز الكولاجين من النوع I للفئران، وذلك لتمكين المراقبة الطولية لتنشيط الخلايا الليفية وتسهيل الفحص عالي الإنتاجية للمركبات المضادة للتليف.
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
يصف هذا البروتوكول تطوير نظام مراسل أدينوفيروسي يعتمد على الخلايا الليفية، يتم تحفيزه بواسطة محفز الكولاجين من النوع I للفئران، وذلك لتمكين المراقبة الطولية لتنشيط الخلايا الليفية وتسهيل الفحص عالي الإنتاجية للمركبات المضادة للتليف.
يفتقر التليف القلبي، الذي يتميز بتنشيط غير طبيعي للخلايا الليفية وترسيب مفرط للمادة الخلالية خارج الخلية، إلى علاجات محددة الهدف، ويرجع ذلك إلى حد كبير إلى غياب منصات فحص in vitro طولية وقابلة للتوسع وغير مدمرة. إن المقاييس النهائية التقليدية ونماذج الخلايا الجذعية كثيفة الموارد تمنع بطبيعتها المراقبة في الوقت الفعلي لتطور التليف. وللتغلب على هذه القيود، يصف هذا البروتوكول إنشاء وتحسين والتحقق من صحة نظام مراسل فلوري غدي mCherry مدفوع بمحفز الكولاجين من النوع الأول ألفا 1 (Col1a1) للفئران (Ad-mCol1a1p-mCherry) في الخلايا الليفية NIH/3T3. وتفصل هذه الطريقة الخطوات الحرجة لتعبئة الفيروس الغدي المؤتلف، وتحسين عملية التنقل (تعدد العدوى) لتقليل السمية الخلوية، وتأسيس نموذج تليف قوي محفز بعامل النمو التحويلي بيتا (TGF-β). ومن خلال تجنب الحاجة إلى تثبيت الخلايا، يتيح هذا النظام مراقبة مباشرة وطولية لنسخ الكولاجين في الخلايا الحية. وقد تم التحقق من خصوصية النموذج وموثوقيته دوائياً باستخدام مثبط مستقبل TGF-β من النوع الأول (ALK5) وهو SB431542، حيث ارتبطت القراءات الفلورية بعلامات التليف الداخلية التي تم قياسها كمياً عبر تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي بالنسخ العكسي ومقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم. وفي النهاية، توفر هذه المنصة ذات التكلفة المنخفضة أداة سهلة الوصول للفحص عالي الإنتاجية لعوامل جديدة مضادة للتليف، مما يسرع من الأبحاث القلبية الوعائية الانتقالية.
تمثل إدارة التليف القلبي تحديات سريرية كبيرة. ويتميز التليف بالتنشيط غير الطبيعي للخلايا الليفية الساكنة وتحولها إلى خلايا ليفية عضلية، وترسيب مفرط للمادة الخلالية خارج الخلوية (ECM)، وهو ما يمثل مساراً نهائياً غير قابل للانعكاس تشترك فيه حالات فشل القلب، واحتشاء عضلة القلب، وغيرها من أمراض القلب والأوعية الدموية1,2,3. ومع ذلك، تواجه استراتيجيات العلاج الحالية قيوداً كبيرة؛ إذ تعمل التدخلات التقليدية - مثل مدرات البول، وحاصرات β، ومثبطات نظام الرينين-أنجيوتنسين-ألدوستيرون - بشكل أساسي على تخفيف الإجهاد الهيموديناميكي الجهازي وتقليل التنشيط العصبي الهرموني4,5,6,7. وتفشل هذه العلاجات في استهداف تنشيط الخلايا الليفية بشكل مباشر أو وقف ترسيب الكولاجين المستمر. علاوة على ذلك، ورغم أن شلالات الإشارات مثل مسار عامل النمو التحويلي بيتا (TGF-β)/Smad، والإجهاد التأكسدي، وإعادة البرمجة الأيضية تقود هذه الحالة المرضية، فإن ترجمة هذه الرؤى إلى علاجات مباشرة مضادة للتليف تظل صعبة بسبب السميات الجهازية وآليات التوصيل غير المتخصصة8,9,10. وبناءً على ذلك، تبرز حاجة ملحة لعلاجات جديدة مضادة للتليف ومحددة الهدف. وتتمثل إحدى العقبات الرئيسية في الترجمة السريرية في غياب أنظمة تقييم وظيفية قادرة على رصد تنشيط الخلايا الليفية بدقة وديناميكية. وتظهر النماذج التجريبية التقليدية قيوداً كبيرة تحول دون إجراء فحص دوائي فعال11,12. وبينما تعيد نماذج الحيوانات in vivo محاكاة إعادة تشكيل القلب بشكل شامل، إلا أنها تعاني من الاختلافات بين الأنواع، والجداول الزمنية التجريبية الطويلة، والتكاليف العالية، وانخفاض معدل الإنتاجية11.
للتغلب على هذه العقبات، ظهرت منصات فحص متنوعة in vitro؛ ومع ذلك، لا تزال هناك عيوب منهجية حرجة. تتطلب مقايسات التألق المناعي عالية المحتوى تثبيتاً تدميرياً للخلايا ومعالجة شاقة، مما يوفر لقطة ثابتة فقط بدلاً من رصد حركية تنشيط الخلايا الليفية في الوقت الفعلي. وبالمثل، تعاني المنصات التي تدمج مراقبة المعاوقة الخالية من الوسوم مع مطيافية الكتلة (MS/MS) من عدم الخصوصية وانخفاض القابلية للتوسع، حيث يمكن الخلط بسهولة بين انخفاض المعاوقة الناتج عن السمية الخلوية العامة وبين الفعالية الحقيقية المضادة للتليف. علاوة على ذلك، تفرض أنظمة المراسل المهندسة بتقنية التكرارات العنقودية المتناظرة القصيرة منتظمة التباعد (CRISPR) التي تستخدم الخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات (iPSCs) لتتبع علامات الهيكل الخلوي (على سبيل المثال، alpha-smooth muscle actin [α-SMA]/ACTA2) حواجز ترجمية كبيرة13. فهذه النماذج القائمة على iPSCs باهظة التكلفة بشكل مفرط، ومتطلبة تقنياً، وغير متاحة إلى حد كبير للفحص الروتيني عالي الإنتاجية. فضلاً عن ذلك، فإن الاعتماد على علامات الهيكل الخلوي مثل α-SMA قد لا يعكس بدقة نقطة النهاية المرضية، حيث أن تعبيرها لا يرتبط ارتباطاً وثيقاً بالإفراز الوظيفي والترسيب المفرط لـ ECM14. ومن ثم، فإن هذه الأنظمة غير كافية لرسم خريطة طولية للاستجابات الخلوية في المراحل المبكرة للتدخلات الدوائية.
في المقابل، يصف هذا البروتوكول نظام تقرير وظيفي طولي يتم تحفيزه بواسطة محفز الكولاجين من النوع الأول ألفا 1 (Col1a1)، وذلك بهدف إنشاء منصة قوية وغير مدمرة لمراقبة تنشيط الخلايا الليفية. وبما أن الكولاجين من النوع الأول هو المكون السائد في المصفوفة خارج الخلوية (ECM) الذي يتم ترسيبه أثناء إعادة تشكيل القلب، فإن رصد التنشيط النسخي للجين المشفر له، Col1a1، يعمل كقراءة مباشرة وذات صلة مرضية لتنشيط الخلايا الليفية. يتيح هذا النموذج القائم على محفز Col1a1 مراقبة مستمرة على المستوى الجزيئي للعمليات التليفية، مما يوفر منصة حساسة وطولية وقابلة للقياس ومُحسَّنة لفحص الأدوية القائم على الآلية.
نؤكد أن جميع التجارب قد أُجريت وفقاً للإرشادات المؤسسية والوطنية. ونظراً لأن هذه الدراسة اعتمدت حصرياً على خط خلايا ليفية جنينية لفئران سويسرا المعتمد من NIH (NIH/3T3) ونظام المراسل mCol1a1p-mCherry، ولم تتضمن أي حيوانات فقارية أو أجنة أو مشاركين بشريين، فإن الإجراءات الموضحة في هذه المخطوطة لم تكن تتطلب موافقة أخلاقية من مجلس مراجعة مؤسسي.
أُجريت جميع الإجراءات التي تضمنت ناقلات فيروسية غدانية مؤتلفة وفقًا للوائح السلامة البيولوجية المؤسسية وممارسات المستوى الثاني من السلامة البيولوجية (BSL-2) القياسية. وقد تم تنفيذ عمليات التعامل مع الفيروسات، والنقل الجيني، والتخزين، والتخلص من النفايات باستخدام كبائن السلامة البيولوجية المعتمدة ومعدات الوقاية الشخصية المناسبة. كما عُقمت النفايات السائلة التي تحتوي على مواد فيروسية غدانية باستخدام محلول مبيض مُعد حديثًا قبل التخلص منها، وعُقمت المستهلكات الملوثة بجهاز التعقيم البخاري (autoclave) وفقًا لبروتوكولات السلامة البيولوجية المؤسسية. أما الانسكابات العرضية، فقد تم تطهيرها فورًا باستخدام عوامل مضادة للفيروسات معتمدة باتباع إجراءات الاستجابة للانسكابات المؤسسية.
1. نظرة عامة على سير العمل التجريبي

الشكل 1. سير عمل إنشاء والتحقق من صحة نظام المراسل الغدوي mCol1a1p-mCherry في الخلايا الليفية. (أ) نظرة عامة تخطيطية على بناء نظام المراسل الغدوي (AdV) mCol1a1p-mCherry وسير العمل التجريبي للتحقق من النموذج في الخلايا الليفية NIH/3T3. يتضمن سير العمل استنساخ المحفز، وتجميع الفيروس الغدوي المؤتلف، وتغليف الفيروس في خلايا HEK293، وتحسين تعدد العدوى (MOI)، وفحص الفلورة عالي المحتوى اللاحق. (ب) صور فلورية ممثلة للخلايا الليفية NIH/3T3 المصابة بالفيروس الغدوي Ad-mCol1a1p-mCherry عند قيم MOI تبلغ 0، 1، 10، 100، و1000. صُبغت النوى بصبغة Hoechst 33342 (باللون الأزرق)، وتشير فلورة mCherry (باللون الأحمر) إلى نشاط محفز Col1a1. تم قياس شدة الفلورة باستخدام التصوير عالي المحتوى ومعايرتها وفقاً لأعداد النوى. تم اختيار MOI بقيمة 100 للتجارب اللاحقة بناءً على تعبير قوي ومتجانس للمراسل مع حد أدنى من التغيرات المورفولوجية. أشرطة القياس = 200 µm. تم إنشاء هذا الشكل باستخدام BioRender.com بتراخيص معتمدة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
2. بناء وتعبئة وتضخيم الفيروس الغدي الحامل للمروج mCol1a1
3. زراعة الخلايا وتحسين ظروف العدوى الفيروسية

4. تقييم استقرار النموذج باستخدام تحفيز TGF-β
5. التحقق من موثوقية النموذج باستخدام مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (Quantitative Real-Time Polymerase Chain Reaction)
يظهر في الشكل 1A مخطط عام لعمليتي بناء وتعبئة الفيروس الغدي المؤتلف mCol1a1p-mCherry. حيث تم استنساخ محفز Col1a1 الخاص بالفئران في المنطقة العلوية (upstream) من الجين المراسل mCherry ودمجه في ناقل فيروسي غدي، تلا ذلك تعبئة الفيروس وتضخيمه في خلايا HEK293. يوضح سير العمل الخطوات التجريبية الرئيسية، بما في ذلك العدوى الفيروسية، والتحفيز التليفي، والتدخل الدوائي، وقراءة الإشارة القائمة على الفلورة. يوفر هذا المخطط إطاراً مرئياً لتنفيذ النظام المراسل ويدعم تفسير تجارب التحقق الوظيفي اللاحقة.
لتحديد الظروف المثلى للعدوى الفيروسية، تم إصابة الخلايا الليفية NIH/3T3 بفيروس غدي mCol1a1p-mCherry عبر مجموعة من تعدديات العدوى (MOIs). وكما هو موضح في الشكل 1B، زادت شدة فلورية mCherry مع زيادة الـ MOI. في مستويات الـ MOI المنخفضة، كان تعبير المراسل ضعيفاً وغير متجانس، مما يمثل حالة غير مثالية للتحليل الكمي. أما في مستويات الـ MOI العالية، أظهرت الخلايا تغيراً في المورفولوجيا، بما في ذلك التكور والانفصال، مما يشير إلى آثار سمية خلوية. وقد أنتجت قيمة MOI تبلغ 100 فلورية قوية ومتجانسة مع الحفاظ على مورفولوجيا الخلايا، وبناءً على ذلك تم اختيارها كظرف مثالي للتجارب اللاحقة.
عند تعددية العدوى (MOI) المثلى، تم تحفيز الخلايا الليفية NIH/3T3 بتركيزات متزايدة من TGF-β. وقِيست فلورة المراسل عند 24 و48 و72 ساعة بعد التحفيز. وكما هو موضح في الشكل 2A–C، زادت كثافة فلورة mCherry بطريقة تعتمد على التركيز في جميع النقاط الزمنية. كما ازدادت كثافة الإشارة تدريجياً من 24 إلى 72 ساعة، مما يدل على استجابة تعتمد على الوقت. تمثل هذه النتائج نتيجة إيجابية، مما يشير إلى أن نظام المراسل يستجيب طولياً وبشكل قابل للتكرار للتحفيز التليفي.

الشكل 2. تفعيل المراسل mCol1a1p-mCherry المعتمد على الوقت والجرعة بواسطة تحفيز عامل النمو التحويلي بيتا (TGF-β). تم تحفيز الخلايا الليفية NIH/3T3 المصابة بالفيروس الغدي Ad-mCol1a1p-mCherry عند MOI المحسن بتركيزات متزايدة من TGF-β. تظهر الصور الفلورية التمثيلية والتحليلات الكمية المقابلة لنشاط المراسل mCherry بعد 24 ساعة (A)، و48 ساعة (B)، و72 ساعة (C) من التحفيز. يعكس فلورسنت mCherry (الأحمر) نشاط محفز Col1a1، وتم صبغ النوى باستخدام Hoechst 33342 (الأزرق). تم قياس كثافة الفلورسنت كمياً باستخدام التصوير عالي المحتوى وتم تطبيعها بالنسبة لأعداد النوى. تم عرض البيانات كمتوسط ± الخطأ المعياري للمتوسط (SEM) من ست مكررات بيولوجية مستقلة لكل حالة. أُجريت المقارنات الإحصائية بالنسبة لمجموعة التحكم غير المعالجة باستخدام تحليل التباين أحادي الاتجاه (ANOVA) متبوعاً باختبار Tukey للمقارنات المتعددة. تم الحفاظ على ثبات معاملات التصوير عبر جميع الظروف التجريبية. أشرطة المقياس = 200 µm. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
لتقييم خصوصية المسار، تمت معالجة الخلايا الليفية NIH/3T3 بمثبط مستقبل TGF-β من النوع الأول (ALK5) وهو SB431542 تحت تحفيز TGF-β. وكما هو موضح في الشكل 3A–C، قلل SB431542 من شدة فلورة mCherry بطريقة تعتمد على الجرعة. وقد لوحظ تثبيط لنشاط المراسل عبر جميع النقاط الزمنية المفحوصة، مع تثبيط أكبر عند تركيزات أعلى من المثبط. وتمثل هذه النتائج نتيجة إيجابية، مما يشير إلى أن تنشيط المراسل يعتمد على إشارات TGF-β ويمكن تعديله دوائياً.

الشكل 3. يعمل SB431542 على تثبيط تنشيط مراسل mCol1a1p-mCherry المستحث بواسطة TGF-β بطريقة تعتمد على الوقت والجرعة. تم تحفيز الخلايا الليفية NIH/3T3 المصابة بالفيروس الغدي Ad-mCol1a1p-mCherry بواسطة TGF-β (10 ng/mL) بوجود تركيزات متزايدة من مثبط مستقبل عامل النمو التحويلي بيتا من النوع الأول (ALK5) وهو SB431542 (0، 1، 5، 10، و15 µM؛ ويرمز له اختصاراً بـ SB43 في لوحات الشكل). تظهر صور الفلورة التمثيلية والتحليلات الكمية المقابلة لها عند 24 ساعة (A)، و48 ساعة (B)، و72 ساعة (C) بعد المعالجة. تعكس فلورة mCherry (باللون الأحمر) نشاط محفز Col1a1، وتم صبغ النوى بصبغة Hoechst 33342 (باللون الأزرق). تم قياس كثافة الفلورة باستخدام التصوير عالي المحتوى ومعايرتها بالنسبة لأعداد النوى. يتم عرض البيانات كمتوسط ± SEM من ست مكررات بيولوجية مستقلة لكل حالة. أجريت المقارنات الإحصائية بالنسبة للمجموعة المعالجة بـ TGF-β باستخدام اختبار ANOVA أحادي الاتجاه متبوعاً باختبار Tukey للمقارنات المتعددة. تم الحفاظ على ثبات معاملات التصوير عبر جميع الظروف التجريبية. أشرطة المقياس = 200 µm. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
لتقييم ما إذا كان نشاط المراسل يعكس الاستجابات التليفية الداخلية، تم تحليل الخلايا الليفية NIH/3T3 تحت ظروف محسنة من العدوى والتحفيز والتثبيط. تم تلخيص سير العمل التجريبي المستخدم للتحقق من صحة نظام المراسل في الشكل 4A. قيست المؤشرات المرتبطة بالتليف على مستويي البروتين وmRNA. وكما هو موضح في الشكل 4B–C، أظهر اختبار ELISA زيادة في إفراز البروتينات المرتبطة بالتليف بعد التحفيز بـ TGF-β، والتي انخفضت عند المعالجة بـ SB431542. وبشكل متسق، أظهر اختبار RT-qPCR تغيرات مقابلة في تعبير الجينات المرتبطة بالتليف، بما في ذلك Col1a1. ويمثل التوافق بين قراءة الفلورية وإفراز البروتين والتعبير الجيني نتيجة تحقق إيجابية، مما يشير إلى أن نظام المراسل يعكس التنشيط التليفي تحت هذه الظروف.

الشكل 4. التحقق من صحة نظام المراسل mCol1a1p-mCherry عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي بالنسخ العكسي (RT-qPCR) والمقايسة المناعية المرتبطة بالإنزيم (ELISA). (A) نظرة عامة تخطيطية لسير العمل التجريبي للتحقق من صحة نظام المراسل. تم تحفيز الخلايا الليفية NIH/3T3 باستخدام TGF-β (10 ng/mL) ومعالجتها بتركيزات متزايدة من مثبط مستقبل TGF-β وهو SB431542 (SB43). جُمعت نواتج تحلل الخلايا وسوائل المزرعة العلوية لإجراء التحليلات اللاحقة. (B) التحليل الكمي للتعبير عن الحمض الريبي النووي المرسال (mRNA) لـ Col1a1 الذي تم تحديده بواسطة RT-qPCR تحت تحفيز TGF-β عبر تدرج تركيز من SB431542. تم تطبيع مستويات التعبير النسبي لـ Col1a1 mRNA بالنسبة إلى الحمض الريبي النووي الريبوسومي 18S (18S rRNA) وتم التعبير عنها كـ fold change بالنسبة لمجموعة التحكم غير المعالجة. (C) تقدير كمية مستويات الكولاجين من النوع الأول المفرز في سوائل المزرعة العلوية باستخدام ELISA تحت نفس الظروف التجريبية المذكورة في اللوحة B. يتم التعبير عن تركيزات الكولاجين من النوع الأول بوحدة ng/mL. تُمثل البيانات كـ mean ± SEM من ست مكررات بيولوجية مستقلة لكل حالة. أجريت المقارنات الإحصائية بالنسبة للمجموعة المعالجة بـ TGF-β باستخدام one-way ANOVA متبوعاً باختبار Tukey للمقارنات المتعددة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الملف التكميلي 1. التسلسل النيوكليوتيدي الكامل لقطعة محفز Col1a1 للفأر المستخدمة في بناء ناقل المراسل الغدي. تتوافق منطقة المحفز البالغ طولها 2354 bp مع الإحداثيات الجينية chr11:94824779–94827132 (NC_000077.7) وتمتد من −2271 إلى +83 bp بالنسبة لموقع بدء النسخ (TSS). تم استنساخ قطعة المحفز في المنبع من جين المراسل mCherry في الناقل المكوك pDC315 لإنشاء نظام مراسل غدي مأشوب.يرجى النقر هنا لتحميل هذا الملف.
الجدول التكميلي S1. تواليات البادئات المستخدمة في تحليل RT-qPCR. تم إدراج تواليات البادئات الأمامية والعكسية لـ Col1a1 والجين المرجعي الداخلي 18S rRNA باتجاه 5′–3′.يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
الشكل التكميلي S1. خريطة البلازميد لناقل المكوك الغدي pDC315-mCol1a1p-mCherry. تم إدراج قطعة محفز Col1a1 للفئران بطول 2354 bp في المنبع من الجين المراسل mCherry باستخدام استراتيجية استنساخ سلسة تعتمد على إعادة التركيب المتماثل لإنتاج بنية المراسل الغدي المؤشابة.يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
يساهم التليف القلبي في تطور فشل القلب، ويحد نقص منصات الفحص الطولي من تطوير علاجات فعالة مضادة للتليف2,13. وتعتمد الطرق التقليدية لتقييم الفعالية المضادة للتليف، بما في ذلك لطخة ويسترن (Western blotting)، وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (RT-qPCR)، والتلوين المناعي الفلوري، على قياسات نقطة النهاية التي تتطلب تحلل الخلايا أو تثبيتها. وتمنع هذه المنهجيات المراقبة في الوقت الحقيقي لتطور التليف في الخلايا الحية، وتحد من قابليتها للتطبيق في التحليلات الطولية وعالية الإنتاجية. بالإضافة إلى ذلك، غالباً ما يكون إنشاء خطوط خلايا مراسلة مستقرة من خلال ترانسفكشن البلازميد أو التكامل الفيروسي البطيء مقيداً بانخفاض كفاءة الترانسفكشن في الخلايا الليفية، والتباين المرتبط بالتكامل الجينومي العشوائي، والإسكات التدريجي للتعبير عن المراسِل عبر الممرات الخلوية المتتالية15.
بينما تُستخدم النواقل اللنتيفيروسية بشكل متكرر لإيصال الجينات في الخلايا الليفية NIH/3T3، فقد استخدمت دراستنا تحديداً نظام تقرير أدينوفيروسي للحفاظ على الدقة الفسيولوجية للخلايا الليفية. تندمج الفيروسات اللنتيفيروسية بشكل دائم في جينوم المضيف، مما يحمل خطراً متأصلاً بحدوث طفرات إدراجية قد تؤدي دون قصد إلى تعطيل شبكات الإشارات الداخلية، وهو أمر بالغ الأهمية عند تقييم الشلالات المعقدة مثل التليف الناتج عن TGF-β. وفي المقابل، تظل النواقل الأدينوفيروسية خارج الجينوم (episomal)، مما يضمن السلامة الجينومية. علاوة على ذلك، فإن تجاوز عملية الانتقاء بالمضادات الحيوية الطويلة المطلوبة لسلالات الخلايا اللنتيفيروسية المستقرة يمنع التحولات المظهرية الناجمة عن العلاج، مما يسمح بتعبير عابر سريع وقوي وعالي الكفاءة يتناسب مع الفحص عالي الإنتاجية.
لمعالجة هذه القيود التقنية، يوفر نظام التقرير الفيروسي الغدي mCherry المدفوع بمحفز mCol1a1 طريقة لمراقبة تنشيط الخلايا الليفية in vitro. يجمع هذا النظام بين التوصيل الفيروسي الغدي ومحفز Col1a1 الفأري، وهو علامة نسخية مرتبطة بتنشيط الخلايا الليفية وترسيب المادة الخلالية خارج الخلوية (ECM)16. إن ربط نشاط محفز Col1a1 بمراسل فلوري يتيح تصور وقياس الاستجابات النسخية التليفية في الخلايا الحية. تزداد فلورة المراسل بعد التحفيز بـ TGF-β في نقاط زمنية متعددة، مما يعكس التقدم الطولي لتنشيط الخلايا الليفية. ويشير تثبيط نشاط المراسل بواسطة مثبط ALK5 المسمى SB431542 إلى تنظيم يعتمد على المسار. إن التطابق بين فلورة المراسل وتعبير الجينات والبروتينات الداخلية المرتبطة بالتليف، كما تم قياسه بواسطة RT-qPCR وELISA، يدعم استخدام هذه الطريقة لمراقبة الاستجابات التليفية في ظل هذه الظروف.
استخدمت الدراسات الحديثة الخلايا القلبية المشتقة من الخلايا الجذعية المحفزة متعددة القدرات (iPSC) مقترنة بالاضطراب الجيني القائم على نظام CRISPR-Cas9 لفحص الأدوية واكتشاف الأهداف العلاجية11,13. على سبيل المثال، تم تطبيق الخلايا الليفية القلبية المشتقة من iPSC والتي تم هندستها بواسطة CRISPR لتكون مراسلات فلورية في منهجيات فحص المركبات واسعة النطاق11,17. وعلى الرغم من أن هذه الطرق توفر دقة جينية عالية، إلا أنها ترتبط بجداول زمنية طويلة للتمايز، وتعقيد تقني، وتفاوت بين الدفعات، وزيادة في التكلفة التجريبية13,18. وفي المقابل، تتيح منصة المراسلة الفيروسية الغدانية الموصوفة هنا تنفيذًا أكثر سرعة دون الحاجة إلى تحرير الجينوم أو تمايز خلوي ممتد. ويمكن استخدام هذه المنهجيات بطريقة تكاملية، حيث يعمل نظام المراسلة mCol1a1p-mCherry كأداة فحص أولية، بينما تُطبق النماذج القائمة على iPSC للتحقق اللاحق11.
يوفر نظام المراسل mCol1a1p-mCherry الموصوف هنا طريقة لفحص المركبات المرشحة، بما في ذلك المعدلات الأيضية والمنتجات الطبيعية، في نموذج يعتمد على الخلايا الليفية. ولضمان تكرارية هذا البروتوكول، تتطلب عدة خطوات حرجة واعتبارات لاستكشاف الأخطاء وإصلاحها الاهتمام. أولاً، تعد نقاوة التحضير الفيروسي الغدي أمراً ضرورياً؛ حيث إن استخدام المستخلصات الفيروسية غير المنقاة قد يؤدي إلى إدخال حطام الخلايا المضيفة ومكونات سامة للخلايا، مما يؤدي إلى تأثيرات غير محددة في الخلايا الليفية NIH/3T3 وإرباك قراءات المراسل. علاوة على ذلك، ولضمان التكرارية الصارمة والاتساق بين الدفعات في تطبيقات الفحص اللاحقة، خضع كل تحضير فيروسي لتنقية قياسية وتم تقديره كمياً بدقة عبر مقايسة التخفيف النهائي. ومن خلال تطبيق تعدد عدوى (MOI) محدد بدقة بناءً على العيارات الفيروسية الوظيفية (PFU/mL) بدلاً من الكميات الحجمية، نجحنا في تحييد الاختلافات بين الدفعات، وبالتالي توحيد استجابة المراسل عبر جميع التشغيلات التجريبية المستقلة. ثانياً، أثناء تحسين هذا الـ MOI، من المهم التأكد من أن حجم اللقاح الفيروسي لا يتجاوز 10% من إجمالي حجم المزرعة؛ إذ يمكن للمنظم الفيروسي المفرط أن يغير من الـ pH والأسمولية في وسط المزرعة، مما قد يؤدي إلى تحفيز استجابات الإجهاد الخلوي بشكل مستقل عن تحفيز TGF-β.
علاوة على ذلك، يفرض التعامل مع الأطباق ذات 384 بئراً في التصوير عالي المحتوى تحديات تقنية؛ إذ تكون الخلايا الليفية من نوع NIH/3T3 عرضة للانفصال أثناء خطوات استبدال الوسط والغسيل. ويمكن تقليل فقدان الخلايا من خلال التعامل اللطيف مع السوائل، مثل استخدام أجهزة مناولة السوائل الآلية بسرعات توزيع منخفضة أو إمالة رؤوس الماصات مقابل الجدران الجانبية للآبار. ولتقليل التنشيط الأساسي للمروج Col1a1 وتحسين نسبة الإشارة إلى الضوضاء، يمكن استخدام التجويع من المصل لمدة 12–24 h قبل التحفيز بـ TGF-β. وخلال التصوير المتسلسل للخلايا الحية عبر نقاط زمنية متعددة (على سبيل المثال 24 و48 و72 h)، يجب تقليل السمية الضوئية التراكمية وتأثيرات ارتباط DNA الناتجة عن صبغ Hoechst المتكرر عن طريق تحسين ظروف التعريض أو استخدام أطباق تجريبية متوازية لكل نقطة زمنية19.
ينبغي مراعاة العديد من القيود المتعلقة بهذه الطريقة. أولاً، يعتمد النظام على خط خلوي من الخلايا الليفية المخلدة ولا يمثل بشكل كامل التباين الخلوي للخلايا الليفية القلبية in vivo. ثانياً، يعكس المراسل التنشيط النسخي لـ Col1a1 ولا يرصد التنظيم ما بعد النسخي أو نضج المصفوفة خارج الخلوية. قد تشمل التعديلات المستقبلية استخدام الخلايا الليفية القلبية الأولية، أو أنظمة الزراعة المشتركة، أو النماذج ثلاثية الأبعاد لتحسين الصلة الفسيولوجية. وباختصار، يصف هذا البروتوكول نظام مراسل غدوي مدفوع بمحفز Col1a1 لمراقبة تنشيط الخلايا الليفية. وتدمج هذه الطريقة بين التوصيل الفيروسي، والتعديل الدوائي، والمقاييس الجزيئية التكميلية لتمكين التحليل الطولي وغير المدمر في الخلايا الحية. ويمكن تطبيق هذا النهج في فحص المركبات ودراسة عمليات إشارات التليف تحت ظروف in vitro مضبوطة.
ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإفصاح عنه.
تم دعم هذا العمل من خلال منح مقدمة من المؤسسة الوطنية للعلوم الطبيعية في الصين (رقم 32371158 لـ H.X.)، والبحث الوطني الرئيسي ر&برنامج D (من 2023YFA1800902 إلى H.X.)، "تيانشي تالنت (Tianchi Talent)" برنامج، المشروع المفتوح للمختبر الوطني الرئيسي للتوازن الوعائي وإعادة التشكيل (جامعة بكين) (202404 إلى R.Z؛ 202403 إلى Y.M.W.)، المشروع المفتوح للمختبر الرئيسي للأمراض المتوطنة والعرقية في شينجيانغ، وزارة التربية والتعليم (جامعة بكين) (KF202404 إلى H.X.).
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| صفيحة مجهرية ذات قاع زجاجي بـ 384 بئرًا | Cellvis، الولايات المتحدة الأمريكية | P384-1.5H-N | لوحة زجاجية القاع تحتوي على 384 بئراً تُستخدم لزراعة الخلايا، والعدوى الفيروسية، والتصبيغ، والتصوير الفلوري. |
| بلازميد الهيكل الأساسي للفيروس الغدي | Microbix، كندا | pBHGloxΔE1,3Cre | البلازميد المستخدم لإنتاج الجينوم الفيروسي الغدي المؤتلف كامل الطول. |
| ناقل مكوك أدينوفيروسي: pDC315-mCol1a1p-mCherry | جيني كيم (GeneChem)، الصين | خدمة مخصصة | ناقل مكوك غدي فيروسي معاد التركيب يحتوي على محفز Col1a1 للفأر بطول 2354 زوجًا قاعديًا والذي يحفز تعبير mCherry. |
| إنزيم بنزوناز النووي (Benzonase Nuclease) | Merck Millipore، الولايات المتحدة الأمريكية | 70664-3 | إنزيم نوكلياز داخلي يُستخدم أثناء تنقية الفيروسات الغدانية لإزالة الأحماض النووية الملوثة. |
| كابينة السلامة البيولوجية (الفئة الثانية) | مجموعة إيسكو لعلوم الحياة (Esco Lifesciences Group)، سنغافورة | AC2-4S1 | كابينة سلامة حيوية معتمدة تُستخدم للتعامل مع الفيروسات الغدية المؤشابة وإجراءات الزرع الخلوي المعقمة. |
| وسط زراعة الخلايا (DMEM/F12 كامل) | HyClone, الولايات المتحدة الأمريكية | 12800-017 | وسط زرع كامل مستخدم لصيانة خلايا NIH/3T3 وHEK293. |
| برنامج CellPathfinder لتحليل الصور | شركة Yokogawa Electric، اليابان | الإصدار 3.08.01 | برنامج لتحليل الصور يُستخدم للتقدير الكمي التلقائي للفلورة وتجزئة الخلايا. |
| نظام الفحص عالي المحتوى CellVoyager CV8000 | شركة يوكوجاوا إلكتريك (Yokogawa Electric Corporation)، اليابان | CV8000 | نظام تصوير عالي المحتوى مستخدم للحصول على صور الفلورة الخاصة بـ mCherry وHoechst. |
| أول أكسيد الكربون2 حضّانة زراعة الخلايا | Thermo Fisher Scientific، الولايات المتحدة الأمريكية | 3111 | حاضنة مرطبة يتم الحفاظ عليها عند 37 درجة مئوية °C مع 5% CO2 لزارعة الخلايا الثديية. |
| ثنائي ميثيل سلفوكسيد (DMSO) | Sigma-Aldrich، الولايات المتحدة الأمريكية | D2650 | المذيب المستخدم لتحضير SB431542. |
| دولبيكو’وسط إيجل المعدل/خليط المغذيات F-12 (DMEM/F-12) | Servicebio، الصين | G4610 | وسط استزراع أساسي مستخدم للخلايا الليفية من سلالة NIH/3T3. |
| مصل جنين البقر (FBS) | أوزبيان، أستراليا | VS500T | مكمل مصل يُستخدم بتركيز 10% (حجم/حجم) لتحضير وسط زراعي كامل. |
| صبغة Hoechst 33342 الفلورية | Invitrogen، الولايات المتحدة الأمريكية | H3570 | صبغة نووية تستخدم للتصوير الفلوري ومعايرة عدد النوى. |
| خلايا HEK293 | ATCC، الولايات المتحدة الأمريكية | CRL-1573 | خط خلوي للتعبئة يُستخدم لإنتاج الفيروسات الغدانية وتضخيمها. |
| عامل النمو التحويلي بيتا البشري المؤتلف (Human Recombinant TGF-β)β1 | MedChemExpress، الصين | HY-P78214 | السيتوكين المستخدم لتحفيز التنشيط التليفي في الخلايا الليفية من سلالة NIH/3T3. |
| برمجيات الحصول على الصور | شركة Yokogawa Electric Corporation، اليابان | الإصدار 3.08.01.03 | البرنامج المستخدم للاستحواذ الآلي على صور الفلورسنت والتحكم في المجهر. |
| كاشف ترانسفكشن قائم على الدهون | Invitrogen، الولايات المتحدة الأمريكية | 11668-019 | كاشف ترانسفكشن (Transfection reagent) مستخدم لنقل بلازميد الفيروس الغدي إلى خلايا HEK293. |
| أنابيب الطرد المركزي الدقيقة | Axygen، الولايات المتحدة الأمريكية | MCT-150-C | الأنابيب المستخدمة لتخزين نواتج تحلل الحمض النووي الريبوزي (RNA lysate) ومعالجة العينات. |
| قارئ الأطباق الدقيقة | Tecan، سويسرا | شرارة | قارئ أطباق ميكروي متعدد الأنماط يُستخدم لقياسات الامتصاصية في مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA). |
| طقم مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم لكولاجين النوع الأول في الفئران | شركة Meike Biotechnology، الصين | MK6778A | طقم مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) المستخدم لتقدير كمية الكولاجين من النوع الأول المفرز في طافي المزارع الخلوية. |
| خلايا ليفية من فئران NIH/3T3 | Procell Life Science، الصين | CL-0171 | خط خلوي من الخلايا الليفية للفأر استُخدم لإنشاء نموذج مراسل والتحقق من صحته. |
| إنزيم القطع PacI | New England Biolabs، الولايات المتحدة الأمريكية | R0547S | إنزيم التقييد المستخدم لخطية البلازميد الغدي. |
| البنسلين–محلول الستريبتومايسين | Gibco، الولايات المتحدة الأمريكية | 15140-122 | محلول مضاد حيوي مضاف بنسبة 1% (حجم/حجم) لمنع التلوث البكتيري. |
| المزيج الفائق PerfectStart Green qPCR SuperMix | ترانس جين بيوتك (TransGen Biotech)، الصين | AQ602 | مزيج رئيسي لـ qPCR يعتمد على SYBR Green يستخدم لتحليل تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي. |
| المحلول الملحي الموقوف بالفوسفات (PBS) | Servicebio، الصين | G4202 | المحلول المنظم المستخدم لغسل الخلايا وتحضير الكواشف. |
| ناقل مكوك pDC315-EGFP | GeneChem، الصين | نظرًا لعدم توفر نص مصدر للترجمة، يرجى تزويدنا بالمحتوى العلمي المطلوب ترجمته من اللغة الإنجليزية إلى اللغة العربية، وسنقوم بمعالجته وفقًا للمعايير الأكاديمية والتقنية المحددة. | ناقل مكوك أدينوفيروسي أب مستخدم في بناء بلازميد مراسل. |
| نظام تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR) | Applied Biosystems، الولايات المتحدة الأمريكية | QuantStudio 5 | نظام تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي المستخدم لتحليل التعبير الجيني الكمي. |
| إنزيمات القطع (BamHI وKpnI) | Abclonal، الصين | RK21101, RK21104 | إنزيمات القطع المستخدمة لخطية ناقل المكوك. |
| طقم النسخ العكسي | ترانس جين بيوتك، الصين | AT311 | طقم النسخ العكسي المستخدم لتخليق الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين المتمم (cDNA) قبل إجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (RT-qPCR). |
| كاشف تحلل الرنا | Invitrogen، الولايات المتحدة الأمريكية | 15596026 | الكاشف المستخدم لاستخلاص الحمض النووي الريبوزي (RNA) الكلي من الخلايا المستنبتة. |
| SB431542 | MedChemExpress، الصين | 301836-41-9 | عامل النمو المحول بيتا (TGF-β)β مثبط مستقبل من النوع الأول يستخدم في تجارب التثبيط الفارماكولوجي. |
| خدمة تسلسل سانجر/الكواشف | شركة شنغهاي بوشانغ للتكنولوجيا الحيوية المحدودة، الصين | خدمة مخصصة | خدمة التسلسل/الكواشف المستخدمة للتحقق من تسلسل البلازميد. |
| المصّاصات المصلية | Corning، الولايات المتحدة الأمريكية | 4488 | ماصات معقمة تُستخدم لنقل السوائل أثناء إجراءات زراعة الخلايا. |
| جهاز التدوير الحراري T30 | لونجين للأجهزة العلمية (LongGene Scientific Instruments)، الصين | T30 | جهاز الدورات الحرارية المستخدم في النسخ العكسي وتضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR). |
| محلول التريبسين-إيديتات ثنائي الصوديوم (Trypsin-EDTA) | Gibco، الولايات المتحدة الأمريكية | 25200-056 | كاشف تفكيك الخلايا المستخدم في عملية تمرير الخلايا الروتينية. |
| طقم تنقية الفيروسات | Takara Bio USA | 631533 | طقم مستخدم لتنقية الفيروسات الغدانية المؤشبة. |
| حمام مائي | شركة شانغهاي ييهينغ للأجهزة العلمية (Shanghai Yiheng Scientific Instruments)، الصين | HWS-12 | حمام مائي مضبوط درجة الحرارة مُستخدم أثناء تجميد الفيروسات الغدانية–دورات الإذابة. |