$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تم التعبير عن سيتوكروم بو3 أكسيداز الإشريكية القولونية من بلازميد pETcyo في سلالة الإشريكية القولونية C43 (DE3) ΔcyoABCDE وتم تنقيه كما تم وصفه سابقا29. تم استخدام أوكسيداز بو3 المنقى مباشرة لإعادة التكوين وقياسات النشاط، أو وسم بأصباغ فلورية مثل ATTO 643 (هذه الدراسة) أو أصباغ ATTOالأخرى 1,15. بالنسبة للأصباغ شديدة المحبة للماء مثل ATTO 643، تم استخدام عمود بطول 30 سم لتحقيق فصل فعال للصبغة غير المرتبطة عن البروتين الموسوم (الشكل 3A). درجة الوسم (DOL)، التي تحسب من أطياف الامتصاص، تراوحت عادة بين 1.1–1.3 جزيء صبغة لكل إنزيم، اعتمادا على صبغة ATTO المستخدمة. بالنسبة لإكسيداز بو3 الموسوم ب ATTO 643، كان DOL 1.16 (الشكل 3B).
لإعادة تكوين البروتينات، تم تحضير LUVs أولا عبر إعادة ترطيب الأغشية الرقيقة، تلتها دورات تجميد وإذابة وبثق للحصول على أحجام حويصلات منتظمة. بالنسبة للبوليمرسومات، تم إضافة مسحوق تنظيف لمحلول إعادة الترطيب. تم تحليل توزيعات حجم الحويصلات بواسطة تشتت الضوء الديناميكي قبل إعادة التكوين (الشكل 4، الجدول 2). عادة ما أظهرت كل من LUVs الهجينة والبوليمرية أقطارا متوسطة تتراوح بين 85–95 نانومتر مع توزيعات ضيقة الحجم (PDI < 0.2). من المتوقع أن تكون الحويصلات القائمة على PDMS-g-PEO أصغر قليلا من حجم المسام الاسمي لغشاء البثق. أظهرت البوليمرسومات النموذجية أحجاما متجانسة للغاية، حيث كانت قيم PDI أقل من 0.1، في حين شكلت الحويصلات الهجينة مجموعات متجانسة نسبيا مع قيم PDI أحيانا أعلى من 0.1 ولكن باستمرار أقل من 0.2.
ثم تم إدخال بروتين الغشاء bo3 oxidase في LUVs بوجود منظف (صوديوم كولات في هذه الدراسة). تمت إزالة المنظف لاحقا باستخدام بيو-بيدز. بعد إعادة التكوين، زاد حجم البوليمرسوم بشكل طفيف فقط (الشكل 4A)، بينما بقي حجم الحويصلات الهجينة دون تغيير (الشكل 4B). في كلا النظامين، لوحظت زيادة طفيفة في مؤشر التناسل الشخصي (الجدول 2). من المتوقع أن تتغير مثل هذه التغيرات الطفيفة في الحجم، حيث يمكن أن تعيد الذوبان والإزالة بواسطة المنظفات تنظيم سلاسل البوليمر في الغشاء. تم تقييم نشاط البروتين بقياس استهلاك الأكسجين، والذي يشير إلى ما إذا كان البروتين يحتفظ بالنشاط الوظيفي (الشكل 5A). غياب استهلاك الأكسجين في جهاز التحكم السلبي LUV الخالي من البروتين يؤكد أن الإشارة المرصودة تنشأ تحديدا من نشاط أوكسيداز بو3. مع إعادة التكوين التي تعبر عن طريق كولات الصوديوم عند التركيزات المستخدمة هنا، كان نشاط البروتين عادة أعلى قليلا في الحويصلات الهجينة مقارنة بالبوليمرسومات (الشكل 5B). لوحظ بعض التباين في نشاط البروتين بين دفعات التنقية وحتى بين الأجزاء داخل نفس الدفعة. لذلك، في الدراسات المقارنة—مثل مقارنة نشاط البروتين عبر أنظمة الأغشية المختلفة—يجب استخدام نفس نسبة البروتين المنقى لضمان الاتساق.
لتوليد PDMS-g-PEO وPDMS-g-PEO وPDMS-g-PEO/صويا GUVs PC، تم استخدام نهج الاندماج والتشكيل الكهربائي. في هذه الطريقة، تم خلط بروتيو-LUVs مع LUVs خالية من البروتين ووضعها على شرائح زجاجية مغطاة ب ITO، تليها جفاف جزئي لتعزيز اندماج الحويصلات وتكوين طبقة بوليمر/بروتين أو بوليمر/دهون/بروتين. أدى نقص الجفاف إلى انخفاض إنتاج بروتيو-GUV، وحجم أصغر من GUV، ووجود LUVs غير مدمجة (بروتيو).
تم تأكيد دمج البروتين الموسوم، بو3 أوكسيداز–ATTO 643، في الغشاء بنجاح بواسطة المجهر الكونفوكالي بعد ترسيب GUVs في تدرج كثافة السكروز/الجلوكوز (الشكل 6A، B). يمكن تحييز كمية الفلورة المرتبطة بالغشاء باستخدام ملف خط بسيط، حيث تعتمد شدة القياس على الزاوية التي يرسم بها الخط. لتقليل هذا التأثير، تم تقييم شدة الفلورة باستخدام خط متعدد مرسوم على طول كامل محيط الغشاء لكل GUV.
لتقييم الارتباطات المحتملة بين حجم الحويصلات ودمج البروتين، تم تحليل قطر GUV بالتوازي (الشكل 6C، D). عادة ما أظهرت الحويصلات الأكبر حجما (فوق 20 ميكرومتر) تألق أقل في البروتين المرتبط بالغشاء مقارنة بالحويصلات الأصغر. قد يعزى هذا الملاحظة إلى آلية الاندماج–التشكيل الكهربائي: تتكون الحويصلات الأصغر مبكرا وقد تدمج البروتينات بكفاءة أكبر، بينما تنشأ الحويصلات الأكبر من أحداث اندماج لاحقة ونمو الغشاء، مما قد يؤدي إلى تخفيف المواد الفقيرة بالبروتين.
يتم تحديد دمج البروتين بشكل عام بشكل أساسي في المرحلة المبكرة من إعادة التكوين إلى LUVs، خاصة من خلال نوع المغسلة وتركيزه والخطوة التي يضيف. بالنسبة لحويصلات LUV البوليمرية، لوحظ دمج أقل قليلا عند إضافة المغسلة إلى الحويصلات المكونة مسبقا مقارنة بالإضافة أثناء تكوين الحويصلات (خطوة إعادة الترطيب)، مما أدى إلى شدة فلورية تبلغ 18.9 ± 3.9 وحدة وحدة و20.6 ± 3.7 وحدة إلبورية على التوالي (الشكل 6C، D، على اليسار). بالنسبة للأنظمة الهجينة، حيث يضاف المنظف بعد تكوين الحويصلات، يلعب تركيز المنظف دورا ملحوظا: زيادة كولات الصوديوم من 0.015٪ إلى 0.1٪ أدت إلى زيادة ملحوظة في دمج البروتين (22.1 ± 5.2 وحدة وحدة مقابل 26.2 ± 5.0 وحدة إفريقية، الشكل 6C، D، يمين). عند مقارنة أنظمة البوليمر والأنظمة الهجينة، لوحظ عادة دمج أغشائي أعلى قليلا ل bo3 oxidase في GUVs الهجينة. ويرجع ذلك على الأرجح إلى وجود عيوب تعبئة عند واجهات البوليمر-الدهون، والتي، بالإضافة إلى العيوب الناتجة عن المغسلات، توفر مواقع إدخال مناسبة لبروتينات الغشاء.
باستخدام خطوة التشكيل الكهربائي الثانية لمدة ساعتين، كان متوسط قطر bo3 GUVs الوظيفية الأوكسيداز حوالي 14–15 ميكرومتر (13.5 ± 3.7 ميكرومتر للميكروبات البوليمرية GUVs و15.4 ± 6.3 ميكرومتر للحويصلات الهجينة)، رغم وجود حويصلات أكبر بشكل ملحوظ (الشكل 6C، D). زيادة مدة الخطوة الثانية للتشكيل الكهربائي إلى 12 ساعة أدى إلى زيادة إجمالية في حجم GUVبمقدار 1,27.
كما يتيح بروتوكول الاندماج والتشكيل الكهربائي تغليف الأنواع القابلة للذوبان في الماء، مثل الأصباغ الحساسة للرقم الهيدروجيني (مثل البرانين)، عن طريق إضافة الصبغة إلى مخزن إعادة الترطيب أثناء التكوين الكهربائي (الشكل 7A). عادة ما ينخفض حجم GUV عندما تتكون الحويصلات في وجود أصباغ قابلة للذوبان في الماء. لتعويض هذا التأثير، يجب زيادة التردد خلال خطوات التشكيل الكهربائي الأولية من 50–500 هرتز.
يمكن تغليف صبغة حساسة للرقم الهيدروجيني بنسبة مئوية، مثل البرانين، من مراقبة ضخ البروتونات بمفردها الحويصلة ويوفر نظرة على اتجاه مضخات البروتون. عند تحمض تجويف الحويصلة، تنخفض نسبة الفلورة للبرانين المثار عند 448 نانومتر و405 نانومتر. تعكس هذه النسبة حالة البروتونة للبرانين وبالتالي ترتبط بدرجة حموضة. القياسات النسبية مفيدة، لأنها غير حساسة إلى حد كبير لتغيرات كفاءة تغليف الصبغة والتبييض الضوئي. يظهر مثال على نشاط ضخ البروتونات في الشكل 7B، حيث لوحظ انخفاض في نسبة فلورة البرانين داخل الحويصية (I₄₄₈/I₄₀₅) في GUVs هجينة تحتوي على أوكسيداز bo3 المعاد تشكيله بعد إضافة DTT المانح للإلكترونات والوسيط الإلكتروني Q₁. تبدأ نسبة الفلورة في الانخفاض بشكل حاد بعد حوالي دقيقة واحدة من التفعيل وتستمر في الانخفاض السريع لمدة دقيقة تقريبا، ثم تتباطأ خلال ~18 دقيقة التالية. يشير هذا السلوك إلى أن غالبية جزيئات أوكسيداز bo3 موجهة بحيث يحدث ضخ البروتونات نحو داخل GUVs. أظهرت الفروع الخالية من البروتين التي تعرضت لظروف متطابقة انخفاضا أصغر في نسبة التألق، مما عمل كعامل تحكم سلبي وأكد أن الانخفاض الأكبر الذي لوحظ في بروتيناتbo-GUVs ينشأ تحديدا من نشاط ضخ بروتونات أوكسيداز bo3 وليس من التأثيرات غير المحددة ل DTT وQ1 على نسبة التألق في البرانين.

الشكل 1. تمثيل تخطيطي لتحضير الحويصلة أحادية الطبقات الكبيرة (LUV)، وإعادة تشكيل بروتين الغشاء من السيتوكروم بو3 أكسيداز إلى LUVs، وتكوين حويصلات عملاقة أحادية السطح ذات وظائف أكسيدازBO3 (GUVs) عبر نهج الاندماج-التشكيل الكهربائي. يتم تحضير LUVs عن طريق إعادة ترطيب الأغشية الرقيقة، ودورات التجميد والذوبان، والبثق عبر غشاء بحجم مسام بحجم 100 نانومتر. يتم إعادة تشكيل السيتوكروم بو3 أوكسيداز بوجود المنظف، الذي يزال لاحقا باستخدام بيو-بيدز. تتكون بbo-GUVs عن طريق ترسيب bo-LUVs على شرائح زجاجية مطلية بأكسيد القصدير الإنديوم (ITO)، تليها جفاف جزئي وإعادة ترطيب في وجود تيار كهربائي. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 2. تكوين طبقة حويصلية كبيرة وحيدة السطح (LUV) ملتحمة عن طريق الجفاف. تم ترسيب سبع قطرات بحجم 2 ميكرولتر من بروتيو-LUVs وLUVs مختلطة على شرائح زجاجية مغطاة بأكسيد القصدير الإنديوم (ITO): (أ) مباشرة بعد الترسيب و(ب) بعد الجفاف الجزئي. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3. وسم فلوري لسيتوكروم بو3 أوكسيداز. (أ) كروماتوجرام (ملف إزراز) لبوكرو3 أوكسيداز-ATTO 643 تم تنقيه على عمود سوبرديكس 200 10/300 جيلومتر. تم جمع الكسور المميزة بالرمادي وتركيزها لاحقا. (ب) أطياف الامتصاص لأوكسيداز بو3 المركز ATTO 643، ويظهر ذروتا عند 280 نانومتر (بروتين)، 400 نانومتر (نطاق سوريت من عوامل الهيم في أوكسيداز بو3 )، و643 نانومتر (صبغة). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 4. توزيعات حجم الحويصلات أحادية السطح الكبيرة (LUVs) قبل وبعد إعادة تكوين البروتين: (أ) بوليمر بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-بولي (أكسيد الإيثيلين) (PDMS-g-PEO) و(ب) الحويصلات الهجينة PDMS-g-PEO/فوسفاتيديل كولين الصويا (PC). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 5. استهلاك الأكسجين بواسطة أوكسيداز bo3 المعاد تشكيله في الحويصلات أحادية السطح الكبيرة (LUVs). (أ) أثر تمثيلي لتركيز الأكسجين مع مرور الوقت بعد تنشيط سيتوكروم بو3 أكسيداز المعاد تشكيله بإضافة ديثيوثرايتول (DTT) ويوبيكينون-1 (Q1). الأثر الأخضر يتوافق مع LUVs المعاد تشكيلها بواسطة البروتين، والأثر الرمادي يعادل الضابط السلبي (LUVs الخالية من البروتين). (ب) معدلات استهلاك الأكسجين (OCR) لأوكسيداز بو3 المعاد تشكيله في بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-بولي الطعم (أكسيد الإيثيلين) (PDMS-g-PEO) وPDMS-g-PEO/فوسفاتيديل كولين الصويا (PC). تمثل الأشرطة متوسط ± الانحراف المعياري (SD) لثلاثة قياسات مستقلة (n = 3). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 6. إدخال أوكسيداز بو3 الموسوم بالفلورية في حويصلات أحادية الطبقات العملاقة (GUVs). صور مجهرية تمثيلية ل (A) بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-بولي الرقعة (أكسيد الإيثيلين) (PDMS-g-PEO) و(B) PDMS-g-PEO/فوسفاتيديل كولين الصويا (PC) GUVs (أغشية موسومة بفوسفاتيديل إيثانولامين-رودامين (PE-Rho)، باللون الأحمر) تحتوي على السيتوكروم المعاد تشكيله bo3 أوكسيداز-ATTO 643 (الأرجواني). قياس كثافة الفلورة bo3 أوكسيداز-ATTO 643 كدالة لحجم GUV (N = 100) لظروف إعادة التكوين المختلفة: (C) إضافة 0.2٪ كولات الصوديوم (SC) إلى الحويصلات البوليمرية الكبيرة أحادية السطح (LUVs) المكونة مسبقا و0.015٪ SC إلى LUVs الهجينة المكونة مسبقا؛ (D) تكونت LUVs بوليمرية في وجود LUVs بنسبة 0.1٪ SC وLUVs هجينة معالجة ب 0.1٪ SC بعد التكوين. تمثل القيم شدة الفلورة لوحدات GUV الفردية (N = 100 لكل حالة). يتم الإبلاغ عن قيم متوسط ± الانحراف المعياري (SD) في النص. المقارنات وصفية؛ لم يتم إجراء أي اختبارات إحصائية رسمية. A.U. (وحدات عشوائية). شريط المقياس = 20 ميكرومتر. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 7. ضخ البروتون بواسطة أوكسيداز بو3 معاد تكوينه في حويصلات أحادية السطح العملاقة (GUVs). (أ) تصوير فلوري تمثيلي لميكروگراف بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-الطعم البولي (أكسيد الإيثيلين) (PDMS-g-PEO)/فوسفاتيديل كولين الصويا (PC)، مع أغشية موسومة ب 0.05 mol٪ فوسفاتيديل إيثانولامين-رودامين (PE-Rho، أحمر)، تحتوي على سيتوكروم معاد تشكيله ب Bo3 أوكسيداز وصبغة بيرانين حساس لدرجة الحموضة مغلف (الإثارة عند 405 و448 نانومتر؛ قنوات زرقاء وخضراء)، ترسيب في شريحة زجاجية مغرفة. (ب) تغير نسبة فلورة البرانين داخل الحويصة عند التنشيط باستخدام ديثيوثرايتول (DTT) ويوبيكينون-1 (Q1) في PDMS-g-PEO/فول الصويا التي تحتوي على أوكسيداز bo3 المعاد تشكيله. الأثر الأخضر يتوافق مع GUVs المعاد تكوينها بواسطة البروتين، والأثر الرمادي يعادل الضابط السلبي (GUVs الخالية من البروتين). يمثل الأثر متوسط ± الانحراف المعياري (SD) (n = 3 حويصلات). شريط المقياس = 20 ميكرومتر. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
| المكون | المخزون | المبلغ | التركيب النهائي للغشاء |
| البوليمرسومات | PDMS-g-PEO في الكلوروفورم:الميثانول (2:1، v/v) | 10 ملغ/مل | 499.9 ميكرولتر | 99.95 مول٪ |
| PE-رودامين في الكلوروفورم | 1 ملغ/مل | 1.1 ميكرولتر | 0.05 مول٪ |
| الحويصلات الهجينة | PDMS-g-PEO في الكلوروفورم:الميثانول (2:1، v/v) | 10 ملغ/مل | 450.1 ميكرولتر | 70 مول٪ |
| فول الصويا PC (95٪) في الكلوروفورم | 10 ملغ/مل | 49.8 ميكرولتر | 29.95 مول٪ |
| PE-رودامين في الكلوروفورم | 1 ملغ/مل | 1.4 ميكرولتر | 0.05 مول٪ |
الجدول 1: المحاليل والأحجامات المستخدمة في تحضير الأغشية الرقيقة لتكوين الحويصلات أحادية السطح الكبيرة (LUV). تعطى تركيزات المخزون بالملليغرام/مل. يتم حساب الأحجام لتركيز إجمالي الفيلم 5 ملغ/مل من الأمفيفيل. يتم التعبير عن التركيب النهائي للغشاء بوحدة mol٪. PDMS-g-PEO: بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-زراعة (أكسيد الإيثيلين)؛ PE-رودامين: فوسفاتيديل إيثانولامين-رودامين؛ صويا PC: صويا فوسفاتيديل كولين; V/V: الصوت/الصوت.
| شرط إعادة التشكيل | القطر (نانومتر) | PDI |
| البوليمرسومات | ما قبل إعادة التشكيل | 84.34 ± 0.22 | 0.084 |
| ما بعد إعادة التشكيل | 100.73 ± 0.81 | 0.109 |
| الهجائن | ما قبل إعادة التشكيل | 89.21 ± 0.77 | 0.129 |
| ما بعد إعادة التشكيل | 85.01 ± 0.42 | 0.17 |
الجدول 2: متوسط حجم الحويصلات ومؤشر التشتت المتعدد (PDI) للبوليمرسومات (بولي (ثنائي ميثيل سيلوكسان)-الطعم - بولي (أكسيد الإيثيلين)، PDMS-g-PEO) والحويصلات الهجينة (PDMS-g-PEO/فوسفاتيديل كولين الصويا (PC)) قبل وبعد إعادة التكوين. تمثل البيانات متوسط ثلاثة قياسات مستقلة.