نقدم هنا بروتوكولاً للتصوير عالي المحتوى الموحد ومعالجة البيانات للخلايا المصبوغة بـ propidium iodide (PI)/Hoechst 33342 لإجراء تحليل قابل للتكرار لحيوية الخلايا باستخدام سير عمل مؤتمت لالتقاط الصور وتحليلها.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
نقدم هنا بروتوكولاً للتصوير عالي المحتوى الموحد ومعالجة البيانات للخلايا المصبوغة بـ propidium iodide (PI)/Hoechst 33342 لإجراء تحليل قابل للتكرار لحيوية الخلايا باستخدام سير عمل مؤتمت لالتقاط الصور وتحليلها.
لمواجهة تحديات انخفاض قابلية التكرار الناتجة عن التباينات التشغيلية في التصوير الخاص بالبحث العلمي، وتعقيد تحليل عدد كبير من العينات باستخدام الطرق التقليدية، نقدم بروتوكولاً لصبغ خلايا HT22 بصبغتي PI وHoechst 33342، ومن ثم تصوير وتحليل البيانات باستخدام نظام التصوير عالي المحتوى (High-Content Imaging System). يهدف سير العمل هذا إلى وضع معلمات مضبوطة لإعدادات التصوير ومعايير صارمة لمراقبة الجودة. كما يوضح إعدادات التصوير في الجهاز وسير العمل لثلاث طرق مختلفة لمعالجة الصور يوفرها الجهاز، وهي: تسجيل الخلايا متعدد الأطوال الموجية (Multi)، والحي-الميت (Live)، ومحرر الوحدات المخصصة (CME). وقد تمت مقارنة طرق معالجة الصور هذه والتحقق من صحتها مقابل الطريقة التقليدية، ImageJ، لضمان فعاليتها. وتلخص الدراسة في النهاية سير عمل لاستخدام نظام التصوير عالي المحتوى لتحديد حيوية الخلايا باستخدام طريقة الصبغ المزدوج بـ PI وHoechst. ومن خلال توحيد سير عمل التصوير ومعالجة البيانات بالكامل، تعزز الدراسة بشكل كبير من قابلية تكرار وموثوقية التصوير في البحث العلمي، مما يوفر دعماً منهجياً قوياً لمقارنة البيانات بين المختبرات ويدفع عجلة البحث العلمي.
يعد نظام التصوير عالي المحتوى أداة حاسمة في البحوث العلمية الحديثة، حيث يتيح التصوير عالي السرعة والتقييم متعدد المعايير للخلايا المصابة أو غير المصابة1,2,3. وهو يلعب دوراً لا يمكن الاستغناء عنه في تخصصات متنوعة؛ ففي مجال علوم الحياة، يساعد الباحثين في استكشاف العالم المجهري للخلايا والأنسجة4,5. على سبيل المثال، يتيح الكشف الدقيق عن الجزيئات والبنى المحددة بصبغات فلورية داخل الخلايا تصوراً واضحاً للبنى الخلوية الدقيقة والتغيرات الديناميكية6. أما في أبحاث العلوم العصبية، فيمكن للنظام إجراء تصوير ثلاثي الأبعاد للعصبونات، مما يساعد في تحليل الروابط المعقدة وآليات نقل الإشارات في الشبكات العصبونية، ويوفر أدلة حاسمة لفهم وظائف الدماغ والمسببات المرضية للأمراض العصبية7,8,9.
على الرغم من المزايا الكبيرة لتقنية نظام التصوير عالي المحتوى، لا تزال هناك عدة مشكلات في عملية التصوير. ففي مرحلة تحضير العينة، توجد درجة عالية من الذاتية؛ إذ تفتقر عمليات تحضير العينات البيولوجية، مثل التعامل مع الخلايا والصباغة، إلى المعايير ذات الصلة. أما فيما يتعلق بمعلمات التصوير، فهناك اختلافات ملحوظة في أوقات التعريض واختيار أطباق الآبار بين المختبرات وموديلات المجاهر عالية المحتوى. وفي مرحلة معالجة البيانات، هناك نقص في التوحيد القياسي، بدءاً من تقليل الضجيج وضبط التباين للصور الخام، وصولاً إلى تحديد المعلمات وتعيين السمات المستهدفة. وتؤدي هذه المشكلات بشكل مباشر إلى انحيازات في نتائج التصوير بالمجهر، مما يتسبب في أزمة في إمكانية تكرار النتائج.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يستخدم هذا البروتوكول خطاً خلوياً تجارياً (HT22, ATCC) ولا يتضمن مشاركين بشريين أو أنسجة بشرية أولية. كما لم يتم استخدام أي حيوانات في هذه الدراسة.
1. تحضير العينات الموحد
2. مواصفات التصوير وإعدادات المعلمات
3. معالجة الصور وتحليلها
ملاحظة: يوضح هذا المستند ثلاث طرق لمعالجة الصور يوفرها البرنامج المصاحب للجهاز، وجميعها مناسبة لبروتوكول التلوين المستخدم في هذه الدراسة. وبينما تشترك هذه الطرق في نفس المبدأ الأساسي للتعرف، إلا أنها تختلف في تقنيات المعالجة المحددة وأنواع نتائج البيانات. كان سير عمل معالجة الصور ذاته على النحو التالي: فتح الملف → قم بتحميل الصورة الأصلية مع طريقة المعالجة المقابلة لها → ضبط معلمات القناة المناسبة → إنشاء قناع → اضبط نوع بيانات القياس في Measure → إجراء التحليل → لاحظ النتائج → تصدير البيانات.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تأثير التحضير الموحد على جودة التصوير
تم تكوين معاملات الطبق لضمان قدرة الجهاز على تحديد موقع طبقة صورة الخلايا بشكل موثوق. وقد سهّل تحضير العينات كطبقة واحدة من الخلايا ذات تلاقي متوسط عملية تركيز الصورة عند تكبيرات مختلفة للعدسات الشيئية، كما أدى ذلك إلى تحسين التعرف على الصور والتحليل الكمي. وقد ساهم توحيد تحضير العينات وتحسين معاملات الطبق في تقليل تأثيرات الحواف، وتداخل الخلايا، والعوامل الأخرى التي تساهم في رداءة جودة التصوير (الشكل 1).
...الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
باستخدام طريقة الصبغ المزدوج بـ PI وHoechst لتحديد حيوية الخلايا، يمكن لجهاز التصوير عالي المحتوى، على سبيل المثال، حساب حيوية الخلايا ضمن الدفعة نفسها بسرعة وبطريقة عالية الإنتاجية باستخدام وحدات خوارزمية مدمجة. وتتميز هذه الطريقة بعدة مزايا، منها انخفاض حجم العينة، والتكلفة المنخفضة، والحد الأدنى من تلف الخلايا، وضعف بهتان الفلورة، ومقاومة الخمود، والقدرة على التقاط صور متعددة. بالإضافة إلى ذلك، فإن وقت التصوير للوحة ذات 96 بئراً يستغرق عموماً من 30 إلى 45 min20 فقط.
...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يقر جميع المؤلفين بعدم وجود تضارب في المصالح. وخلال عملية ترجمة المخطوطة، تم استخدام Zhipu AI لأغراض الترجمة فقط، وليس لتوليد بيانات بحثية أو نتائج تجريبية أو محتوى أكاديمي أساسي. ويتحمل المؤلفون المسؤولية الكاملة عن محتوى المخطوطة.
يتوجه المؤلفون بالشكر على الدعم المقدم من مؤسسة كلية جامعة تشنغدو للطب الصيني التقليدي. كما يشكر المؤلفون الدعم المقدم من المنحة MPRC2022034. وقد استُخدم هذا التمويل لتطوير طريقة تصوير ديناميكي ثلاثي الأبعاد لبكتيريا الأمعاء في مستخلص Erchen Decoction لعلاج الفئران المصابة بالسمنة البسيطة. كما يقر المؤلفون بالمنصة البحثية التي وفرها معهد الابتكار للطب والصيدلة الصينية ومعهد الدراسات متعددة التخصصات بجامعة تشنغدو للطب الصيني التقليدي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| أنبوب طرد مركزي 1.5 mL | Labigic Technology Co., Ltd. | MCT-001-150 | |
| رؤوس ماصات 1000 µL | Labigic Technology Co., Ltd. | 35423003E | |
| أنبوب طرد مركزي 15 mL | Labigic Technology Co., Ltd. | CT-002-15A | |
| رؤوس ماصات 2.5 µL | Qingdao Haier Biomedical Co., Ltd. | B10T | |
| رؤوس ماصات 200 µL | Labigic Technology Co., Ltd. | T-001-200 | |
| أنبوب طرد مركزي 50 mL | Labigic Technology Co., Ltd. | CT-002-50A | |
| طبق زراعة خلايا بـ 96 بئراً | Corning Incorporated | 3599 | |
| ماصة أحادية القناة قابلة للضبط، 0.1–2.5 μL | Eppendorf SE | 3120000216 | |
| ماصة أحادية القناة قابلة للضبط، 100–1000 μL | Eppendorf SE | 3120000267 | |
| ماصة أحادية القناة قابلة للضبط، 20–200 μL | Eppendorf SE | 3120000259 | |
| ماصة أحادية القناة قابلة للضبط، 2–20 μL | Eppendorf SE | 3120000232 | |
| طبق زراعة خلايا | Corning Incorporated | 430167 | |
| قوارير تجميد | Labigic Technology Co., Ltd. | BS-20-ST | |
| ثنائي ميثيل سلفوكسيد (DMSO) | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | D8371 | |
| وسط دولبيكو المعدل (DMEM) | Life Technologies Limited | 11966-025 | في هذه الدراسة، تم تحضير وسط DMEM الكامل باستخدام 10% FBS، و1% محلول بنسلين-ستريبتومايسين، و89% DMEM. |
| حاضنة ESCO CelCulture CO2 | Esco Micro Pte. Ltd. | CCL-170B-8 | |
| مصل بقري جنيني (FBS, Superfine) | Procell Life Science & Technology Co.,Ltd. | 164210-50 | |
| أصباغ Hoechst 33342 الفلورية | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | B8040 | |
| خلية HT22 | Procell Life Science & Technology Co.,Ltd. | CL-0697 | |
| ImageJ | National Institutes of Health | برنامج ImageJ هو أحد برامج معالجة الصور المستخدمة في المخطوطة. | |
| نظام التصوير عالي المحتوى بؤري ImageXpress Micro Confocal | Molecular Devices, LLC | ImageXpress Micro Confocal | في المخطوطة، استخدم "نظام التصوير عالي المحتوى" كبديل لاسم الجهاز. |
| جهاز طرد مركزي للتجميد منخفض السرعة | Hunan Xiangyi Laboratory Instrument Development Co., Ltd. | L530R | |
| برنامج MetaXpress لتحصيل وتحليل الصور عالية المحتوى | Molecular Devices, LLC | هذا البرنامج مكمل لنظام التصوير عالي المحتوى بؤري ImageXpress® Micro Confocal. في المخطوطة، يشير مصطلح "برنامج التحليل المرفق مع الجهاز" إلى هذا البرنامج. | |
| خزانة تدفق صفائحي عمودي OptiMair | Esco Micro Pte. Ltd. | ACB-4E1 | |
| Parafilm M | Pechiney Plastic Packaging Inc. | PM996 | |
| PBS | Shanghai Yuchun biology science and technology co., ltd | YC-5013 | |
| محلول بنسلين-ستريبتومايسين | Procell Life Science & Technology Co.,Ltd. | PB180120 | |
| محلول يوديد البروبيديوم (PI) | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | C0080 | |
| محلول Trypsin-EDTA | BasalMedia Technology Co.,Ltd. | S310KJ |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم نشر هذه المقالة
الفيديو قريباً