تُعرض هنا النتائج التمثيلية للتحليل غير المستهدف لأجهزة VAMS، وذلك باتباع الإجراء الموضح أعلاه.
تم تقييم البيانات الناتجة عن تحليل ثلاثي لعينة مجمعة تم تحضيرها من دم وريدي لـ 10 أفراد، تم سحبها بواسطة VAMS، وموضحة خصائص البصمات الأيضية الناتجة. كما تم تقييم جودة البيانات والمعلومات التي تم جمعها من أجهزة VAMS بناءً على معيارين أساسيين: العدد الإجمالي للميزات الكيميائية المكتشفة، وقابلية تكرار هذه الميزات (n = 3)، والتي تم التعبير عنها كنسبة مئوية للانحراف المعياري النسبي (%RSD). وقد استُخدم العدد الإجمالي للميزات لتقييم مدى اتساع عملية الاستخلاص والتغطية الكيميائية للمذيب، بينما تمت مراقبة %RSD لضمان الدقة التقنية ومتانة الطريقة؛ حيث يشير انخفاض %RSD إلى عملية استخلاص عالية التكرارية تقلل من الضوضاء التحليلية.
بعد استخراج البيانات الخام ومعالجتها، تم الحصول على مصفوفة من ميزات نسبة الكتلة إلى الشحنة (m/z) وزمن الاستبقاء (RT)، إلى جانب شدتها. وقد أُخذت في الاعتبار فقط الميزات التي أظهرت إشارة يمكن اكتشافها في اثنتين من أصل ثلاث مكررات، وذلك بعد خطوات المعالجة الأولية المناسبة وتصفية العينات الفارغة. يوضح الشكل 2A،B مخططات m/z مقابل RT لنفس العينة التي تم تحليلها وفقاً للبروتوكولات الموصوفة لكل من تقنيتي LC-MS وGC-MS.
يُعزى العدد المرتفع من الميزات التي تخرج مبكرًا في تشغيل الكروماتوغرافيا السائلة ذات الطور المعكوس (RPLC) إلى المستقلبات شديدة الهيدروفيلية التي تم استخلاصها بواسطة البروتوكول المطبق ولكنها لم تُحتجز جيدًا في عمود الطور المعكوس. وعلى الرغم من أن المستقلبات التي تخرج مبكرًا تفرض تحديات في التحديد، إلا أن التوصيف الدقيق لا يزال ممكنًا باستخدام بيانات التجزئة بـ MS/MS جنبًا إلى جنب مع المقارنات مع قواعد البيانات الطيفية والمعايير المرجعية الداخلية. علاوة على ذلك، من المتوقع التقاط جزء كبير من هذا الكسر الهيدروفيلي عبر تحليل GC-MS. وفي النهاية، يمثل هذا قيدًا متأصلاً في هذا المجال، حيث أن التعقيد الشديد للمستقلبوم يتطلب استخدام منصات تحليلية متعددة.
يظهر التقييم متعدد المنصات للمستخلصات الميثانولية بوضوح الطبيعة التكاملية العالية لسير عمل التحليل باستخدام LC وGC، حيث وقعت مقاييس الأداء ضمن النطاق المتوقع للتنميط الشامل للمستقلبات. يوضح الشكل 3A،B العدد الإجمالي للميزات وتوزيع نسبة RSD% لكل منصة. قدمت منصة LC تغطية كيميائية واسعة، حيث تم تحليل 4,169 ميزة، وهو ما يتماشى مع قدرتها الراسخة على التقاط مجموعة واسعة من المركبات القطبية وشبه القطبية وغير المتطايرة. وبالتزامن مع ذلك، أظهرت منصة GC مجموعة فرعية أصغر من الميزات، بواقع 187 ميزة، وكان هذا متوقعاً نظراً لأن GC يمكنها فقط اكتشاف المركبات المتطايرة القابلة لعملية الاشتقاق.
فيما يتعلق بقابلية التكرار، وكما يظهر في مخطط الكمان (violin plot)، فإن التوزيع العام ومدى انتشار قيم RSD% متشابهان بشكل ملحوظ بين تقنيتي LC-MS وGC-MS. كان متوسط %RSD نمطياً لكلا المنصتين، حيث بلغ حوالي 29.7% لتقنية LC (كان %RSD لأقل من 30% في 2,655 من أصل 4,169) و32.3% لتقنية GC (كان %RSD لأقل من 30% في 114 من أصل 187). وعلى الرغم من أن عدداً قليلاً من السمات أظهرت قيم RSD أعلى في كلا الجانبين، إلا أن هذا التباين شائع ومتوقع في الدراسات الأيضية غير المستهدفة (untargeted metabolomics). وتنتمي هذه القيم المرتفعة عادةً إلى المستقلبات ذات الوفرة المنخفضة التي تقترب من حد الكشف للجهاز. وبشكل عام، تؤكد ملفات التوزيع الضيقة وجود قابلية تكرار مرضية لكلا الإعدادين التحليليين.
يمكن دراسة الحيز الكيميائي للمستقلبات التي تم رصدها بواسطة البروتوكول من خلال تعيينات المستقلبات. تم الكشف عن مركبات متنوعة باستخدام LC-MS وGC-MS، وهو أمر متوقع نظراً للتكامل المتأصل بين المنصتين. تتوفر قائمة كاملة بتعيينات المستقلبات لأجهزة VAMS في الجدول التكميلي 1 والجدول التكميلي 2. إجمالاً، تم الكشف عن 97 مستقلاً وتعيينها (المستوى 1 و2، وفقاً لما اقترحه Sumner et al. (2007)22) بواسطة هذا البروتوكول عبر التقنيتين، بالإضافة إلى مركبات أخرى مفترضة التوصيف من المستوى 3. وتم تأكيد تعيينات GC بشكل إضافي من خلال مقارنة مؤشرات الاحتفاظ التجريبية – التي تم الحصول عليها عبر المقارنة مع FAMES – مع المؤشرات المدرجة في الجداول23. يوضح الشكل 4A,B توزيع الفئات الفرعية للمستقلبات المعينة لكلتا الطريقتين، بينما يوضح الشكل 4C التداخل بين التقنيتين، مما يسلط الضوء على تكاملهما. يمكن التحقق المتقاطع من عدد قليل من المستقلبات الوسيطة الرئيسية بواسطة كلتا التقنيتين، بينما يمكن للميزات الفريدة هيكلياً أو الخاصة بمنصة معينة أن تسد الثغرات في مسارات الكربون المركزية والمسارات الأيضية الثانوية. وبالرغم من أن الأحماض الأمينية والببتيدات هي الفئات الكيميائية الرئيسية في كلا التحليلين، إلا أن عدداً قليلاً فقط من المستقلبات يتداخل بين التقنيتين. وتعتبر العديد من فئات المستقلبات خاصة بجهاز معين، مثل أسيل كارنيتين في LC-MS والسكريات السداسية في GC-MS.
لإثبات كفاءة الميثانول كمذيب استخلاص لكلتا التقنيتين، أُجريت تجارب مقارنة على عينات VAMS باستخدام أنظمة مذيبات متنوعة، تلتها تحليلات باستخدام LC-MS وGC-MS. تمت مقارنة ثلاثة أنظمة مذيبات مختلفة مع الميثانول في ثلاث مكررات: الأسيتونيتريل النقي (ACN)، ومزيج ميثانول-ماء (60:40، v/v)، ومزيج أسيتونيتريل-ميثانول (70:30، v/v). استند اختيار هذه المذيبات والمزيجات إلى تجارب أولية أجراها فريقنا، بالإضافة إلى الدراسات المنشورة سابقاً13,14,24,25. تم تقييم كفاءة الاستخلاص لكل نظام باستخدام ثلاثة معايير أساسية: العدد الإجمالي للميزات المكتشفة، والشدة الإجمالية للميزات، وتكرارية الميزات، والتي تم التعبير عنها كالانحراف المعياري النسبي (RSD, %).
بالنسبة لمسار عمل LC-MS، تم رصد أعلى عدد من السمات باستخدام MeOH-H2O (60:40, v/v)، بمتوسط 4,514 سمة عبر ثلاث مكررات، يليه مباشرة MeOH النقي (4,169 سمة). وأعطى خليط ACN–MeOH (70:30, v/v) متوسطاً قدره 3,502 سمة، بينما أعطى ACN النقي أدنى متوسط لعدد السمات، وهو 2,836. ويوضح التمثيل الرسومي لأعداد هذه السمات لكل مكرر في الشكل 5A.
لفحص خصائص الدقة لكل حالة استخلاص، تم تحليل شدة السمات وقيم RSD (%) من ثلاث حقنات مكررة. يظهر مقارنة بين الوفرة الإجمالية للسمات ومتوسط %RSD لكل مذيب استخلاص بالنسبة لـ LC-MS في الشكل 5A. كانت توزيعات إشارة log2 متشابهة لجميع المستخلصات، حيث أعطى كل من MeOH-H2O 60:40 (v/v) وACN وMeOH وفرة أعلى قليلاً من ACN-MeOH 70:30 (v/v). كما أعطى MeOH متوسط %RSD إجمالي أقل، مما يشير إلى أن عملية الاستخلاص كانت أكثر قابلية للتكرار باستخدام هذا المذيب.
تم إجراء تقييم مماثل لكفاءة نظام مذيب الاستخلاص في بيانات GC-MS. ومرة أخرى، لتقييم عدد السمات، تم اعتبار تلك التي تم اكتشاف إشارتها في اثنين على الأقل من أصل ثلاث مكررات فقط. وكان المذيب الذي أعطى أكبر عدد من السمات هو ACN-MeOH 70:30 (v/v) (216 سمة)، يليه MeOH مباشرة (187 سمة). يظهر توضيح بياني لعدد السمات المكتشفة لكل مذيب استخلاص وBµS في الشكل 5B.
فيما يتعلق بالوفرة الإجمالية للميزات المكتشفة، ظهر أن MeOH هو الأكثر كفاءة، حيث أعطى وفرة أعلى، كما هو موضح في الشكل 5B. وكان MeOH-H₂O 60:40 (v/v) هو ثاني أفضل المذيبات، يليه ACN-MeOH 70:30 (v/v)، بينما كان ACN المذيب الأقل فعالية. وبالنسبة لـ %RSD الميزات، فقد وفر MeOH-H₂O 60:40 (v/v) أدنى قيم RSD لـ VAMS (RSD = 38.57%)، يليه عن كثب ACN (42.65%)، ثم MeOH (44.14%)، وأخيرًا ACN-MeOH 70:30 (v/v) (49.14%). وتتمثل هذه القيم في الشكل 5B.
تتماشى النتائج المذكورة أعلاه بشكل جيد مع الدراسات المنشورة مسبقاً. حيث أفاد Couacault et al. (2026)19 عن عدد مماثل من الميزات في تحليل RP-LC-MS لعينات DBS و VAMS باستخدام تركيبة مماثلة لمذيب الاستخلاص (إعادة الترطيب بـ 80 µL من الماء، يليها إضافة 320 µL من MeOH). وبالمثل، اكتشف Cala et al. (2017)11 عدداً مماثلاً من الميزات (153) عبر تحليل GC-MS لرؤوس VAMS. ورغم أن معظم الدراسات الحالية لم تقيم دقة التحليلات التي أجريت بهذه الأجهزة، إلا أن نتائجنا العامة تتوافق مع التوقعات الخاصة بالتحليل غير المستهدف. علاوة على ذلك، تتفق نتائج LC مع تلك التي أبلغ عنها Bossi et al. (2025)26 لتحليل HILIC لعينات DBS و qDBS الدقيقة، حيث كانت قيم RSD لمعظم الميزات المكتشفة < 30%.
بشكل عام، تُظهر هذه النتائج أن الاستخلاص القائم على الميثانول يوفر توازناً قوياً بين عدد الميزات، والشدة، والدقة (متوسط RSD, %) لتحليل عينات VAMS باستخدام كل من LC-MS وGC-MS. وبناءً على ذلك، يمكن لبروتوكول استخلاص واحد بالميثانول أن يبسط عملية التحضير المزدوج للعينات، ويسهل الحصول المتوازي على ملفات تعريف استقلابية متكاملة، ويرفع من مخرجات المعلومات إلى الحد الأقصى.

الشكل 1: مخططات البروتوكول التي توضح (A) بروتوكول استخلاص العينات، و (B) إعادة تشكيل LC-MS، و (C) عملية الاشتقاق لـ GC-MS/MS. تم إنشاؤه بواسطة BioRender. Marques, D. (2026) https://BioRender.com/dprdv18, https://biorender.com/xu2qh34, https://biorender.com/7ztz2qv. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 2: مقارنات m/z و rt لعينة ممثلة لكل من (أ>) تحليل LC-MS و (ب>) تحليل GC-MS. تمثل كل نقطة إشارة واحدة قبل تجميعها في سمات. تمثل الألوان شدة إشارة MS1 لسمة معينة، حيث تزداد الشدة من اللون الأزرق إلى الأحمر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3تغطية السمات وقابلية التكرار عبر المنصات التحليلية. (A) تغطية الميزات: العدد الإجمالي للميزات الفريدة التي تم اكتشافها بواسطة الكروماتوغرافيا السائلة LC (باللون الأزرق المخضر) والكروماتوغرافيا الغازية GC (باللون البرتقالي)، مع تدوين الأعداد الدقيقة فوق كل شريط. (B(ج) تكرارية الميزات: توضح مخططات الكمان كثافة توزيع الانحرافات المعيارية النسبية (RSD%) لجميع الميزات. وتشير مخططات الصندوق المدمجة إلى الوسيط والنطاقات الربيعية؛ وقد حُذفت نقاط البيانات الفردية لضمان الوضوح البصري. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 4: مخططات تكرارية توضح عدد المركبات من الفئات الكيميائية المختلفة التي تم اكتشافها بواسطة (A) LC-MS و (B) GC-MS. (C) تداخل المستقلبات المصنفة بالمستويين 1 و 2 بين المنصات. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 5: نتائج مذيبات الاستخلاص من تحليل LC-MS (A) و GC-MS (B>) لأجهزة VAMS. تمثل المخططات العمودية في الجزء العلوي من الشكل عدد السمات الناتجة عن كل مذيب استخلاص تم تطبيقه على أجهزة VAMS لكل مكررة. وتظهر المخططات في أسفل الشكل مجموع الشدات ومتوسط الانحراف المعياري النسبي (RSD % ) لكل مذيب استخلاص مستخدم مع جهاز VAMS. يمثل حجم الدائرة إجمالي مجموع شدة السمات المكتشفة بمقياس log2، مما يعكس كفاءة الاستخلاص. ويشير تدرج الألوان إلى الدقة التحليلية، المعبر عنها بالانحراف المعياري النسبي (RSD)، حيث يمثل اللون الأصفر دقة أعلى واللون الأحمر يشير إلى تباين أكبر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الجدول 1: جدول استكشاف الأخطاء وإصلاحها. نظرة عامة على مشكلات أخذ العينات الشائعة، وأسبابها، وحلولها عند أخذ العينات باستخدام أجهزة VAMS. يرجى النقر هنا لتحميل هذا الملف.
الجدول 2: محاليل الشطف ومحاليل الاستخلاص في RP. نظرة عامة على تركيبات الأطوار المتحركة، ومحلول غسل السدادة، ومذيب التطهير، ومذيب الشطف المستخدمة في التحليل الكروماتوغرافي. يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
الملف التكميلي 1: تفاصيل تجريبية إضافية. معلمات LC-MS وGC-MS. يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.
الجدول التكميلي 1: تعليقات LC-MS. المركبات التي تم تحديدها باستخدام البروتوكول الحالي على منصة LC-MS. يرجى النقر هنا لتحميل هذا الملف.
الجدول التكميلي 2: تعليقات GC-MS. المركبات التي تم تحديدها باستخدام البروتوكول الحالي على منصة GC-MS. يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.