التحليل الهيستوكيميائي للأنماط الجينية للقطن المقاومة والحساسة
كشف الفحص الكيميائي النسيجي لمقاطع عرضية من الجذر والساق في مرحلة الورقة الحقيقية عن وجود اختلافات مرئية بين الأنماط الوراثية المقاومة والحساسة، كما هو موضح في الشكل 4، والشكل 5، والشكل التكميلي 1 (مقاطع عرضية للساق). وفرت التكبيرات الأعلى (100x–300x) رؤى مفصلة لهذه الاختلافات (الشكل 4A–C والشكل 5A–C للأنماط الوراثية المقاومة، والشكل 4D–F والشكل 5D–F للأنماط الوراثية الحساسة). اختلفت أنماط صبغ اللجنين حسب أنواع الأنسجة: أظهرت الأنماط الوراثية المقاومة أنماط صبغ لجنين أقل أو مماثلة في السيقان، بينما أظهرت الأنماط الوراثية الحساسة زيادة نسبية في تغلظ السيقان باللجنين بصرياً (الشكل التكميلي 1A–D).
التحليل الكمي للصور الخاصة بتصبيغ اللجنين
أظهر الصنف Deltapine 16، وهو صنف حساس شمله البحث، صبغاً أقل لللجنين (Figure 6A–C) بقيم للنسبة المئوية للمنطقة المصبوغة بلغت 12 و17.8 و16.3 (Figure 6D). وسجل النمط الجيني الحساس A2-40 قيم نسبة مئوية للمنطقة المصبوغة بلغت 25.2 و19.9 و28.75، بينما أظهر النمط الجيني المقاوم A2-995 قيم نسبة مئوية للمنطقة المصبوغة بلغت 54.95 و58.71 و69.85 (Figure 7). ومع ذلك، سجل A2-20 قيم نسبة مئوية للمنطقة المصبوغة بلغت 16.6 و21.3 و20.4، بينما أظهر A2-514 قيم نسبة مئوية للمنطقة المصبوغة بلغت 49.8 و34.1 و43.38 (Figure 8). وقد أسفرت المقارنة عن قيمة p-value بلغت 0.06. ونظراً لأن هذه القيم استُخرجت باستخدام عتبات مختلفة، فقد أُجري تحليل ImageJ بعتبة موحدة باستخدام عتبات متطابقة للتدرج اللوني والتشبع والسطوع لضمان إمكانية تكرار النتائج عبر العينات المكررة. وأظهر النمط الجيني المقاوم (A2-514) صبغاً أكبر نسبياً مقارنة بالنمط الجيني الحساس (A2-20). وقد حُسبت النسبة المئوية للمنطقة المصبوغة كنسبة عدد البكسلات الموجبة للجنين إلى إجمالي بكسلات الأنسجة داخل المقطع. وتظهر المقارنة الكمية ذات العتبة الموحدة للنمط الجيني الحساس A2-20 والنمط الجيني المقاوم A2-514 في Figure 9. وبشكل عام، يوضح تحليل العتبة الموحدة وجود اختلافات في عملية اللجنين خاصة بكل نمط جيني بين هذه الأنماط الجينية.
توافر البيانات:
تمت إضافة البيانات الخام كـ ملف تكميلي.

الشكل 1: منظر مجهري لنيماتودا كلوية الشكل تتغذى على جذور القطن. تظهر النيماتودا كلوية الشكل وهي تتغذى على جذور القطن بتكبير 50x بعد الصبغ بملون طعام أحمر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 2: تحضير المادة النباتية للتحليل الهستوكيميائي للـ lignin. يتكون سير العمل من الخطوات التالية: (1) نقع بذور القطن في الماء؛ (2) وضع البذور على مناشف ورقية مبللة في طبق بتري معقم ومصنف؛ (3) ترك البذور لتنبت لمدة يومين ثم نقل الشتلات إلى أصص مصنفة تحتوي على التربة؛ (4) تنمية الشتلات حتى مرحلة الفلقات؛ (5) الاستمرار في تنمية النباتات حتى مرحلة الأوراق الحقيقية وتحضير مقاطع عرضية من السيقان والجذور؛ و(6) صبغ مقاطع الأنسجة المجمعة وفحصها تحت المجهر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3: جمع وصبغ مقاطع من جذور وسيقان القطن باستخدام phloroglucinol-HCl. يتكون سير العمل من الخطوات التالية: (1) تنمية ثلاث مكررات بيولوجية حتى مرحلة الورقة الحقيقية؛ (2) إزالة النباتات برفق من التربة، وغسلها بالماء، وتجهيزها لعملية التقطيع؛ (3) استخدام شفرة معقمة لتحضير مقاطع عرضية للساق؛ (4) استخدام شفرة معقمة لتحضير مقاطع عرضية للجذر؛ (5) صبغ مقاطع الساق بـ 3% phloroglucinol-HCl، وشطفها بالماء، وفحصها تحت المجهر؛ (6) صبغ مقاطع الجذر بـ 3% phloroglucinol-HCl، وشطفها بالماء، وفحصها تحت المجهر؛ و(7) فحص المقاطع المصبوغة تحت المجهر لتصور الاختلافات في صبغ phloroglucinol وتسجيل الصور. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 4: صبغ اللجنين في المقاطع العرضية لجذور التراكيب الوراثية للقطن A2-514 و A2-20. مقاطع عرضية لجذور التركيب الوراثي المقاوم A2-514 مصبوغة باللجنين عند تكبير (A) 100x، و(B) 200x، و(C) 300x. مقاطع عرضية لجذور التركيب الوراثي القابل للإصابة A2–20 مصبوغة باللجنين عند تكبير (D) 100x، و(E) 200x، و(F) 300x. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 5: صبغ اللجنين في المقاطع العرضية للجذور في التركيبات الجينية للقطن A2-995 و A2-40. مقاطع عرضية للجذور مصبوغة باللجنين للتركيبة الجينية المقاومة A2-995 بتكبير (A) 100x، و(B) 200x، و(C) 300x. مقاطع عرضية للجذور مصبوغة باللجنين للتركيبة الجينية القابلة للإصابة A2-40 بتكبير (D) 100x، و(E) 200x، و(F) 300x. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 6: صبغ اللجنين والتحليل الكمي للمقاطع العرضية لجذور Deltapine 16. مقاطع عرضية لجذور مصبوغة باللجنين لثلاث مكررات بيولوجية من الصنف الحساس Deltapine 16 بتكبير 100x: (A) المكرر البيولوجي 1، و(B) المكرر البيولوجي 2، و(C) المكرر البيولوجي 3. (D) النسبة المئوية للمساحة المصبوغة للمكررات البيولوجية الثلاثة والتي تم تحديدها بواسطة تحليل ImageJ الكمي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 7: التحليل الكمي لصبغ اللجنين في التركيبات الوراثية للقطن A2-40 و A2-995. النسبة المئوية للمنطقة المصبوغة التي تم تحديدها بواسطة تحليل ImageJ لثلاث مكررات بيولوجية من التركيبة الوراثية القابلة للإصابة A2-40 والتركيبة الوراثية المقاومة A2-995. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 8: التحليل الكمي لتصبغ اللجنين في التركيبات الوراثية للقطن A2-20 وA2-514. النسبة المئوية للمنطقة المصبوغة التي تم تحديدها بواسطة تحليل ImageJ لثلاث مكررات بيولوجية من التركيب الوراثي القابل للإصابة A2-20 والتركيب الوراثي المقاوم A2-514. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 9: التكميم ذو العتبة الموحدة لصبغ اللجنين في التركيبات الوراثية للقطن A2-20 وA2-514. النسبة المئوية للمساحة المصبوغة في التركيبة الوراثية القابلة للإصابة A2-20 والتركيبة الوراثية المقاومة A2-514 بعد تحليل الصور بالعتبة الموحدة. أُجريت المقارنة الإحصائية باستخدام اختبار Welch's t-test (t = −1.52, p = 0.267). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 10: تصوير صبغة اللجنين عبر مناطق الجذور المختلفة. صور تمثيلية توضح صبغ اللجنين في مناطق نضج الجذور، واستطالة الجذور، وقمة الجذر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل التكميلي 1: صبغة اللجنين في المقاطع العرضية لسوق تراكيب وراثية من القطن المقاومة والحساسة. مقاطع عرضية للساق مصبوغة باللجنين بتكبير 100x لكل من (A) الصنف الحساس A2-20، و(B) الصنف المقاوم A2-514، و(C) الصنف الحساس A2-40، و(D) الصنف المقاوم A2-995. يرجى النقر هنا لتحميل هذا الملف.