التحليل الكيميائي النسيجي للأنماط الجينية للقطن المقاومة والحساسة
كشف الفحص النسيجي الكيميائي للمقاطع العرضية للجذر والساق في مرحلة الورقة الحقيقية عن اختلافات بصرية في التراكيب الوراثية المقاومة والقابلة للإصابة كما هو موضح في الشكل 4، والشكل 5، والشكل التكميلي 1 (مقاطع عرضية للساق). وقد وفرت التكبيرات الأعلى (100x–300x) رؤى تفصيلية لهذه الاختلافات (الشكل 4A–C والشكل 5A–C للتراكيب الوراثية المقاومة، والشكل 4D–F والشكل 5D–F للتراكيب الوراثية القابلة للإصابة). وقد اختلفت أنماط صبغ اللجنين باختلاف أنواع الأنسجة: حيث أظهرت التراكيب الوراثية المقاومة أنماط صبغ لجنين أقل أو مماثلة في السيقان، بينما أظهرت التراكيب الوراثية القابلة للإصابة تغلظاً لجنينياً أعلى نسبياً في الساق بصرياً (الشكل التكميلي 1A–D).
التحليل الكمي لصور صبغ اللجنين
أظهر الصنف Deltapine 16، وهو صنف حساس تم إدراجه في هذه الدراسة، تلوناً أقل باللجنين (الشكل 6A–C) بقيم للنسبة المئوية للمساحة الملونة بلغت 12 و17.8 و16.3 (الشكل 6D). وسجل النمط الجيني الحساس A2-40 قيم مساحة ملونة بنسبة 25.2 و19.9 و28.75، بينما أظهر النمط الجيني المقاوم A2-995 قيم مساحة ملونة بنسبة 54.95 و58.71 و69.85 (الشكل 7). وفي المقابل، سجل A2-20 قيم مساحة ملونة بنسبة 16.6 و21.3 و20.4، بينما أظهر A2-514 قيم مساحة ملونة بلغت 49.8 و34.1 و43.38 (الشكل 8). وقد أسفرت المقارنة عن قيمة p بلغت 0.06. ونظراً لأن هذه القيم تم استخراجها باستخدام عتبات مختلفة، فقد تم إجراء تحليل ImageJ بعتبة موحدة باستخدام عتبات متطابقة للتدرج اللوني والتشبع والسطوع لضمان إمكانية تكرار النتائج عبر المكررات. وأظهر النمط الجيني المقاوم (A2-514) تلوناً أكبر نسبياً من النمط الجيني الحساس (A2-20). وقد حُسبت النسبة المئوية للمساحة الملونة باعتبارها نسبة البكسلات الموجبة للجنين إلى إجمالي بكسلات النسيج داخل المقطع. وتظهر المقارنة الكمية ذات العتبة الموحدة بين النمط الجيني الحساس A2-20 والنمط الجيني المقاوم A2-514 في الشكل 9. وبشكل عام، يثبت تحليل العتبة الموحدة وجود اختلافات في التخشب خاصة بكل نمط جيني بين هذه الأنماط الجينية.
توافر البيانات:
تتم إضافة البيانات الخام كـ ملف تكميلي.

الشكل 1: منظر مجهري للنيماتودا الكلوية وهي تتغذى على جذور القطن. تظهر النيماتودا الكلوية التي تتغذى على جذور القطن بتكبير 50x بعد صبغها بملون طعام أحمر. يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 2: تحضير المادة النباتية للتحليل الهيستوكيميائي لللجنين. يتكون سير العمل من الخطوات التالية: (1) نقع بذور القطن في الماء؛ (2) وضع البذور على مناشف ورقية مبللة في طبق بتري معقم ومسمى؛ (3) ترك البذور لتنبت لمدة يومين ونقل الشتلات إلى أصص مسمى تحتوي على التربة؛ (4) تنمية الشتلات حتى مرحلة الفلقات؛ (5) الاستمرار في تنمية النباتات حتى مرحلة الأوراق الحقيقية وتحضير مقاطع عرضية من السيقان والجذور؛ و(6) صبغ مقاطع الأنسجة التي تم جمعها وفحصها تحت المجهر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3: جمع وتلوين مقاطع جذور وسيقان القطن باستخدام phloroglucinol-HCl. يتكون سير العمل من الخطوات التالية: (1) تنمية ثلاث مكررات بيولوجية حتى مرحلة الأوراق الحقيقية؛ (2) إخراج النباتات برفق من التربة، وغسلها بالماء، وتجهيزها للتقطيع؛ (3) استخدام شفرة معقمة لتحضير مقاطع عرضية للساق؛ (4) استخدام شفرة معقمة لتحضير مقاطع عرضية للجذر؛ (5) تلوين مقاطع الساق بـ 3% phloroglucinol-HCl، وشطفها بالماء، وفحصها تحت المجهر؛ (6) تلوين مقاطع الجذر بـ 3% phloroglucinol-HCl، وشطفها بالماء، وفحصها تحت المجهر؛ و(7) فحص المقاطع الملونة تحت المجهر لتصور الاختلافات في تلوين الفلوروغلوسينول وتسجيل الصور. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 4: تلوين اللجنين في المقاطع العرضية لجذور التركيبات الوراثية للقطن A2-514 وA2-20. مقاطع عرضية للجذور ملونة باللجنين للتركيب الوراثي المقاوم A2-514 بتكبير (A) 100x، و(B) 200x، و(C) 300x. مقاطع عرضية للجذور ملونة باللجنين للتركيب الوراثي الحساس A2–20 بتكبير (D) 100x، و(E) 200x، و(F) 300x. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 5: صبغ اللجنين في المقاطع العرضية للجذور في التركيبات الوراثية A2-995 و A2-40 للقطن. مقاطع عرضية من جذور التركيبة الوراثية المقاومة A2-995 مصبوغة باللجنين عند تكبير (A) 100x، و (B) 200x، و (C) 300x. مقاطع عرضية من جذور التركيبة الوراثية القابلة للإصابة A2-40 مصبوغة باللجنين عند تكبير (D) 100x، و (E) 200x، و (F) 300x. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 6: صبغ اللجنين والتحليل الكمي للمقاطع العرضية للجذور في Deltapine 16. مقاطع عرضية للجذور مصبوغة باللجنين لثلاث مكررات بيولوجية من الصنف القابل للإصابة Deltapine 16 بتكبير 100x: (A) المكرر البيولوجي 1، و(B) المكرر البيولوجي 2، و(C) المكرر البيولوجي 3. (D) النسبة المئوية للمساحة المصبوغة للمكررات البيولوجية الثلاثة والتي تم تحديدها عن طريق تحليل ImageJ الكمي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 7: التحليل الكمي لصبغة اللجنين في التركيبات الوراثية للقطن A2-40 وA2-995. النسبة المئوية للمساحة المصبوغة التي تم تحديدها بواسطة تحليل ImageJ لثلاث مكررات بيولوجية من التركيبة الوراثية الحساسة A2-40 والتركيبة الوراثية المقاومة A2-995. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 8: التحليل الكمي لتصبغ اللجنين في التركيبات الوراثية للقطن A2-20 و A2-514. نسبة المساحة المصبوغة التي تم تحديدها بواسطة تحليل ImageJ لثلاث مكررات بيولوجية من التركيب الوراثي القابل للإصابة A2-20 والتركيب الوراثي المقاوم A2-514. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 9: التكميم القائم على عتبة موحدة لتصبغ اللجنين في نمطي القطن الوراثيين A2-20 وA2-514. النسبة المئوية للمساحة المصبوغة في النمط الوراثي القابل للإصابة A2-20 والنمط الوراثي المقاوم A2-514 بعد تحليل الصور باستخدام عتبة موحدة. تم إجراء المقارنة الإحصائية باستخدام اختبار Welch's t-test (t = −1.52, p = 0.267). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 10: تصوير صبغ اللجنين عبر مناطق مختلفة من الجذر. صور ممثلة توضح صبغ اللجنين في مناطق نضج الجذر، واستطالة الجذر، وقمة الجذر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل التكميلي 1: صبغ اللجنين في المقاطع العرضية لساق أنماط جينية من القطن المقاومة والحساسة. مقاطع عرضية للساق مصبوغة باللجنين بتكبير 100x لكل من (A) النمط الحساس A2-20، و(B) النمط المقاوم A2-514، و(C) النمط الحساس A2-40، و(D) النمط المقاوم A2-995. يرجى النقر هنا لتنزيل هذا الملف.