$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
يعد قياس معدل نمو البكتيريا تقنية ميكروبيولوجية أساسية ، ولها استخدام واسع النطاق في البحوث الأساسية وكذلك في التطبيقات الزراعية والصناعية.
تعد البكتيريا من بين أكثر أشكال الحياة وفرة على وجه الأرض ، حيث توجد في كل نظام بيئي ، بما في ذلك جسم الإنسان. بعض الأنواع البكتيرية قابلة للتتبع وراثيا أيضا ، وقد تم تسخيرها كنماذج بحثية أو لإنتاج منتجات طبيعية أو اصطناعية على نطاق صناعي. ومع ذلك ، لا يمكن استزراع جميع الأنواع البكتيرية في المختبر. بالنسبة لأولئك الذين يستطيعون ذلك ، فإن السمة المهمة هي معدل الضرب ، أو "حركية النمو".
يمكن أن يؤدي قياس معدل نمو المزرعة البكتيرية إلى إبلاغ العلماء بوظائفها الفسيولوجية والتمثيل الغذائي ، كما أنه مفيد في الحصول على عدد دقيق للخلايا من البكتيريا للتطبيقات النهائية.
سيقدم هذا الفيديو المبادئ الكامنة وراء تحليل معدل نمو البكتيريا ، ويوضح بروتوكولا لتوصيف معدل النمو باستخدام "منحنى النمو" ، وأخيرا ، يستكشف العديد من تطبيقات العلوم البيئية لقياس حركية نمو البكتيريا.
تتكاثر البكتيريا بشكل عام لاجنسيا ، وتتكاثر في الانشطار الثنائي البسيط حيث تنقسم خلية أبوية واحدة إلى خليتين ابنتيتين متطابقتين. في ظل ظروف النمو المواتية حيث تتوفر العناصر الغذائية بكثرة وتكون المعلمات البيئية مثل درجة الحرارة كلها مواتية للنمو ، فإن معدل الضرب يتجاوز معدل الوفيات بكثير. هذا يؤدي إلى نمو أسي.
من خلال قياس كمية البكتيريا في الثقافة كدالة للوقت ، يمكن الحصول على منحنى النمو. ينتج عن نمو البكتيريا في مزرعة سائلة في ظل الظروف المثلى منحنى نمو ذو شكل مميز يمكن تقسيمه إلى مراحل مختلفة. يبدأ المنحنى ب "مرحلة التأخر" ، عندما يكون النمو بطيئا بينما تتأقلم البكتيريا مع ظروف الاستزراع. التالي هو "السجل" أو "المرحلة الأسية" ، عندما تشهد البكتيريا نموا أسيا. يتوقف النمو في النهاية بمجرد استنفاد العناصر الغذائية وتراكم النفايات ، مما يؤدي إلى "مرحلة ثابتة". أخيرا ، بمجرد تجاوز معدل الضرب بمعدل موت الخلايا ، تدخل الثقافة "مرحلة الموت".
لبناء منحنى النمو ، يتم حساب الأعداد البكتيرية في قارورة من الثقافة السائلة في نقاط زمنية مختلفة خلال فترة معينة من الزراعة. يمكن الحصول على أعداد البكتيريا بعدد من الطرق المختلفة. أحد الطرق الشائعة هو قياس الكثافة الضوئية - أو "OD" - 600 ، وهو امتصاص المحلول البكتيري للضوء بطول موجي يبلغ 600 نانومتر.
طريقة أخرى هي تحديد "CFU" ، أو وحدات تشكيل المستعمرة ، لكل مليلتر من الثقافة. نظرا للطبيعة النسيلة لنمو البكتيريا ، يمكن لبكتيريا واحدة في الثقافة أن تتوسع نظريا إلى مستعمرة واحدة يمكن ملاحظتها على صفيحة أجار. من خلال طلاء سلسلة من التخفيفات للثقافة البكتيرية للوصول إلى تركيز بكتيري حيث يمكن ملاحظة مستعمرات فردية منفصلة ، وهي طريقة تسمى "طلاء التخفيف التسلسلي" ، يمكن استخدام عدد المستعمرات لحساب تركيز البكتيريا مرة أخرى من حيث CFU لكل مل.
الآن بعد أن فهمت كيف يمكن تحليل نمو البكتيريا ، دعنا ننتقل إلى بروتوكول لإجراء تحليل منحنى النمو على الثقافات النقية لنموذج بكتيري راسخ ، الإشريكية القولونية ، باستخدام طريقة طلاء التخفيف التسلسلي.
قبل يوم واحد من جمع النقطة الزمنية ، قم بتلقيح 20 مل من مرق الصويا التربتيكاز المعقم مسبقا ، أو TSB ، المتوسط في قارورة سعة 50 مل بمستعمرة واحدة من الإشريكية القولونية.
احتضان الثقافة بين عشية وضحاها في سن 37؟ ج مع الاهتزاز. بالنسبة للإشريكية القولونية ، سيؤدي ذلك إلى طور ثابت يبلغ حوالي 109 CFU / mL.
في اليوم التالي ، قم بتلقيح 100 ؟ L من المزرعة الليلية إلى 250 مل من TSB في قارورة سعة 500 مل. تخلط جيدا. ينتج عن هذا ثقافة مخففة تبلغ حوالي 4 × 105 CFU/mL. قم بتخزين 5 مل من هذه المزرعة المخففة في أنبوب الاستزراع. هذا هو الحصة من النقطة الزمنية 0 ، أو T0. ضعه في الثلاجة على الفور في 4 درجة مئوية
احتضان الحجم المتبقي من الثقافة عند 37؟ ج مع الاهتزاز. في كل ساعة بعد ذلك لمدة تصل إلى 8 ساعات ، اجمع 5 مل من الثقافة. قم بتعيين هذه العينات من T1 إلى T8 ، وقم بتخزينها جميعا في 4؟ ج حتى الاستخدام.
في يوم التجربة ، قم بإزالة الإشريكية القولونية من الثلاجة واحتفظ بها على الجليد. استخدم أنابيب ميكروفوج معقمة ، كل منها يحتوي على 900؟ L من محلول ملحي معقم ، لإعداد سلسلة تخفيف لكل حصة وفقا للجدول التالي.
امزج ثقافة T0 جيدا عن طريق الدوامة برفق ، ثم أضف 100؟ L إلى الأنبوب A من سلسلة التخفيف الخاصة به ، مما يجعل التخفيف 1 في 10 ، أو 10-1. أنبوب دوامة A للخلط ، وباستخدام طرف ماصة جديد ، أضف 100؟ L من الأنبوب A إلى الأنبوب B ، مما يجعل التخفيف 1 في 100 ، أو 10-2.
كرر العملية لكل حصة ثقافة وقم بعمل سلسلة التخفيف المناسبة وفقا للجدول 2. بمجرد إجراء سلسلة التخفيف لجميع عينات النقطة الزمنية ، احصل على العدد المناسب من ألواح أجار الصويا المعقمة المعدة للطلاء البكتيري.
3 تخفيفات لكل ثقافة نقطة زمنية سيتم طلاؤها بثلاث نسخ وفقا للجدول التالي. قم بتسمية اللوحات وفقا لذلك. ثم ، ماصة 100؟ L من كل ثقافة مخففة بشكل مناسب في مركز لوحة الأجار المعنية. قم بتعقيم قضيب زجاجي على شكل حرف "L" باللهب ، وقم بتبريده عن طريق لمس القضيب إلى الأجار بعيدا عن اللقاح ، ثم انشر السائل على الفور على سطح الأجار. يرجى ملاحظة أن التأخير في الانتشار قد يؤدي إلى فرط نمو البكتيريا في مكان التلقيح.
استمر في طلاء كل سلسلة من التخفيف لجميع ثقافات النقاط الزمنية 9 ، وتعقيم قضيب نشر الزجاج باللهب بين كل سلسلة تخفيف.
بمجرد السماح للألواح بالجفاف لبضع دقائق ، اقلبها وضعها في 37؟ حاضنة C بين عشية وضحاها. بعد هذه الفترة من النمو ، يمكن تخزين الصفائح في درجة حرارة 4 درجة مئوية
بعد حضانة ألواح التخفيف طوال الليل ، قم بفحصها بحثا عن تلوث وتوحيد المستعمرات. لكل ثقافة نقطة زمنية ، اختر مخففا يوجد فيه ما بين 30-300 مستعمرة لكل طبق. احسب عدد المستعمرات على كل لوحة من الألواح الثلاثية لهذا التخفيف.
باستخدام متوسط عدد المستعمرات لكل تخفيف وعامل التخفيف ، احسب تركيز البكتيريا في المزرعة الأصلية في كل نقطة زمنية في CFU / mL. على سبيل المثال ، إذا كان هناك في المتوسط 30 مستعمرة من مجموعة الألواح الثلاثية التي تم الحصول عليها من 0.1 مل من التخفيف 10-4 ، أو 1 في 10,000 ، فسيكون هناك 30 مقسوما على 0.1 مل مضروبا في 10,000 ، أو 3 ملايين CFU / مل.
باستخدام التركيز البكتيري المحسوب لكل نقطة زمنية ، ارسم رسما بيانيا لسجل القاعدة 10 للتركيزات البكتيرية ، في CFU / مل ، مقابل الوقت بالساعات. من الرسم البياني ، حدد مرحلة السجل لنمو الثقافة البكتيرية الأصلية واختر نقطتين من النقاط الزمنية داخل مرحلة السجل ، وقم بتعيين أول هذه النقاط الزمنية على أنها t = 0. احسب متوسط وقت التوليد باستخدام المعادلة X يساوي 2 أس n مضروبا في X0 حيث X هو تركيز البكتيريا في الوقت t ، و X0 هو التركيز الأولي عند t = 0 ، و n هو عدد الأجيال المنقضية بين النقطتين الزمنيتين.
على سبيل المثال ، لنفترض أن X0 هو 1,000 CFU / مل ، وعند t = 6 h ، يكون التركيز 16,000 CFU / mL. باستخدام المعادلة ، نحصل على أن 4 أجيال حدثت في غضون 6 ساعات ، وهو ما يعطي وقت التوليد 6 مقسوما على 4 أو 1.5 ساعة لكل جيل.
يعد قياس حركية نمو البكتيريا أمرا أساسيا للعديد من التطبيقات لأغراض البحث أو الزراعة أو الهندسة الحيوية.
أحد الاستخدامات لمعرفة معدل نمو البكتيريا هو السماح بالحصول على كمية دقيقة من الثقافة البكتيرية لتلقيح مزرعة أو وسيط آخر. على سبيل المثال ، تحتاج بعض المحاصيل ، مثل البقوليات ، إلى زراعتها مع البكتيريا التكافلية المعروفة باسم الجذور التي تستعمر جذور النباتات لتكوين عقيدات و "إصلاح" النيتروجين - وتحويل النيتروجين في الغلاف الجوي إلى أمونيا يمكن أن يستخدمها النبات. بالنسبة للتطبيقات الزراعية ، تتم إضافة كمية معروفة من الجذور إلى وسط كربوني قائم على الخث ، والذي يستخدم بعد ذلك لتلقيح بذور البقوليات لتأسيس التعايش النباتي والبكتيري.
يمكن أيضا استخدام تحليل النمو لتحديد الأنواع البكتيرية التي يمكن أن تتحلل النفايات الصناعية وربما تولد منتجات ثانوية قيمة. في هذا المثال ، حقق الباحثون في كيفية تأثير وسائط النمو المكملة بالخمور السوداء ، وهو منتج نفايات من لب الخشب وإنتاج الورق ، على نمو عزلة ميكروبية بيئية.
لم تظهر البكتيريا نموا معززا مع الخمور السوداء فحسب ، بل أظهرت أيضا نمط نمو "ثنائي الأطوار" ، مما يشير إلى وجود أكثر من مصدر كربون في الخمور السوداء التي يمكن للبكتيريا استقلابها. يمكن بعد ذلك استخراج المكونات الفردية للخمور السوداء لتحليل نمو أكثر تفصيلا.
أخيرا ، تعد قياسات معدل النمو مفيدة أيضا لتوصيف البكتيريا التي تم تصميمها لأغراض صناعية معينة ، على سبيل المثال ، لمعالجة التلوث النفطي. هنا ، ابتكر العلماء سلالات بكتيرية معدلة وراثيا تحتوي على إنزيمات لتحلل المكونات الهيدروكربونية للنفط. تم إجراء تحليل النمو ، على سبيل المثال ، للتحقق من أن البكتيريا المهندسة قد زادت من معدل النمو من البكتيريا العادية في وجود الهيدروكربونات السامة ، مما يشير إلى تحسن التحمل الذي سيسمح للبكتيريا المهندسة بأداء وظيفة تنظيف التلوث.
لقد شاهدت للتو فيديو JoVE حول تحليل معدلات نمو البكتيريا مع منحنيات النمو. يجب أن تفهم الآن مراحل النمو المختلفة للثقافات البكتيرية ، وكيفية إجراء تجربة للحصول على منحنى نمو باستخدام مجموعة النقاط الزمنية والطلاء التسلسلي للتخفيف ، وكيف يمكن تطبيق تحليل النمو على الأغراض البحثية والصناعية. كما هو الحال دائما ، شكرا على المشاهدة!