رواية النظرية الافتراضية تغيير نقطة حسابي لتحليل الجينوم-اسعة من أنواع البيانات المتنوعة ChIPseq

10.8K مشاهدة

استشهد بها 6

12:39 دقيقة

ديسمبر 10, 2012

10.3791/4273-v

ديسمبر 10, 2012

10.8K مشاهدة

تغيير وجهة نظرنا النظرية الافتراضية (BCP) خوارزمية يستند دولة من بين الفن النمذجة التقدم في التغيير عبر نقاط نماذج ماركوف المخفية ويطبقها على لونين مناعي التسلسل (ChIPseq) تحليل البيانات. BCP يؤدي جيدا في كل أنواع البيانات واسعة النطاق والمنقط، ولكن تتفوق في تحديد بدقة قوية والجزر استنساخه من تخصيب هيستون منتشر.

استكشف المزيد من الفيديوهات

تحليل بيانات ChIPseq

Chapters in this video

0:05

العنوان

2:43

المعالجة المسبقة: إعداد ملفات الإدخال لتحليل نقاط التغيير البايزي (BCP) وكثافات قراءات ChIP للكشف عن الجزر المثرية في البيانات المنتشرة

4:48

تقدير المتوسط البعدي لكثافة القراءات لكل كتلة باستخدام تقريب BCMIX

6:24

المعالجة اللاحقة للمتوسطات البعدية لملفات القراءات المنتشرة

7:06

النتائج: مقارنة بين BCP وSICER في تحليل بيانات تعديل الهيستون

11:47

الخاتمة

Related Videos