Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Sandra Deliard; Jianhua Zhao; Qianghua Xia; Struan F.A. Grant

doi:10.3791/50286

جيل من جودة عالية لونين القالب الحمض النووي مناعي لتسلسل عالية الإنتاجية (رقاقة وما يليها)

JoVE Journal
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

جيل من جودة عالية لونين القالب الحمض النووي مناعي لتسلسل عالية الإنتاجية (رقاقة وما يليها)

Full Text

24,933 Views

09:52 min

April 19, 2013

DOI: 10.3791/50286-v

Sandra Deliard¹, Jianhua Zhao¹, Qianghua Xia¹, Struan F.A. Grant^1,2

¹Division of Human Genetics,Children's Hospital of Philadelphia Research Institute, ²Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

ويمكن الجمع بين لونين مناعي والتسلسل فائقة الإنتاجية (رقاقة وما يليها) تحديد ورسم خريطة التفاعلات البروتين DNA في نسيج أو خلية خط معين. المبين هو كيفية إنشاء قالب الشذرة ذات جودة عالية للتسلسل لاحقة، وذلك باستخدام الخبرة مع عامل TCF7L2 النسخ كمثال على ذلك.

الهدف العام من هذا الإجراء هو تحديد مناطق ربط البروتين عبر الكروماتين. يتم تحقيق ذلك عن طريق الربط المتبادل الأول للبروتين بالحمض النووي. الخطوة الثانية هي قص الحمض النووي.

بعد ذلك ، يتم ترسيب البروتين المستهدف المرتبط بالحمض النووي مناعيا ثم التلميح إليه. الخطوة الأخيرة هي عكس الرابط المتقاطع وعزل الحمض النووي. في النهاية ، يتم استخدام الترسيب المناعي للكروماتين لإظهار توطين ارتباط البروتين عبر الجينوم.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos