باستخدام ماسحات ضوئية مسطحة لجمع عالية الدقة، ساقطا التوقيت صور من Gravitropic استجابة نبات الأرابيدوبسيس الجذر

الهدف العام من هذا الفيديو هو توضيح طريقة قائمة على الماسح الضوئي لالتقاط صورة عالية الدقة للاستجابة الاستوائية الجذرية في عملية النبات النموذجية. لبدء هذا البروتوكول ، تزرع البذور من مخزون البذور المعين على أطباق بتري التي تحتوي على وسط شفاف بعد أن تنبت البذور للفترة الزمنية المحددة ، تتم إزالة أطباق بتري من غرفة النمو ، وإعدادها للمسح الضوئي ، ثم توضع في ماسحات ضوئية مسطحة موجهة عموديا. ثم يتم قلب اللوحات بزاوية 90 درجة ومسحها ضوئيا لفترة زمنية محددة.

يتم حفظ الصور إما على الكمبيوتر أو جهاز تخزين البيانات واستخدامها لاحقا لمعالجة الصور. قبل الحصول على الصورة ، قم بإعداد لوحات aga تحتوي على نسيجتين نباتيتين ممسوحة ضوئيا ب. أولا ، امتصاص أي تكاثف مجمعة على غطاء وجوانب لوحة AGA بمنديل كيم.

بعد ذلك ، ضع كمية وفيرة من Triton X 100 لمنع التكثيف في المستقبل. أخيرا ، قم بإنهاء هذه العملية عن طريق لف اللوحة بشريط دقيق المسام لتأمين الغطاء والسماح للتهوية بالبدء في الحصول على الصورة. قم بإعداد مجلدات لحفظ الصور في الموقع المطلوب.

يتكون كل اسم مجلد من مجموعة من بيانات التعريف التي تتعلق بالمعلومات المراد مسحها ضوئيا. في هذا المثال، تم تضمين بيانات عمر المعرف الفريد وحجمه ومخزونه الأولي في أسماء المجلدات. يمكن بعد ذلك نسخ بيانات التعريف هذه ولصقها في اسم مجلد.

يفترض هذا البروتوكول أنه يتم استخدام أكثر من ماسح ضوئي واحد لجمع الصور ويوفر إرشادات لتوصيل ماسحات ضوئية متعددة بجهاز كمبيوتر واحد. لهذا السبب ، تم إعداد ثلاثة مجلدات لحفظ الصور. الخطوة التالية هي ضبط المؤقتات لوقت تجميع محدد.

نظرا لأنه لا يزال هناك قدر كبير من التحضير للقيام به في هذه المرحلة ، تأكد من ضبط المؤقتات لبعض الوقت الإضافي. بعد ذلك ، قم بتشغيل الماسح الضوئي الأول وافتح برنامج فحص العرض. ضمن علامة تبويب الإدخال، قم بتعيين المصدر إلى الماسح الضوئي الصحيح ومربع القائمة المنسدلة للتكرار التلقائي إلى لا شيء ضمن علامة تبويب الاقتصاص.

قم بتعيين منطقة المعاينة إلى الحد الأقصى واضغط على المعاينة. اختر مربع اقتصاص يلتقط منطقة الاهتمام وقم بتعيين منطقة المعاينة إلى مربع الاقتصاص. ثم قم بمعاينة الصورة مرة أخرى.

لحفظ البيانات التي تم جمعها في الموقع المطلوب ، اضغط على علامة تبويب الإخراج وابحث عن أسماء المجلدات التي تم إنشاؤها مسبقا والتي تتوافق مع كل ماسح ضوئي. قم بتشغيل الماسح الضوئي التالي وكرر فحص العرض. قم بإعداد الاتجاهات للماسحين الضوئيين الآخرين ، مع التأكد من اختيار المجلدات الصحيحة لحفظ البيانات فيها.

من المهم أيضا مراجعة كل علامة تبويب والتأكد من أن جميع إعدادات الماسح الضوئي كما تريد. وجد مختبرنا أن الإعدادات التالية تعمل بشكل أفضل لنوع جمع الصور التي يتم إجراؤها. ومع ذلك، قد تتطلب أنواع مختلفة من مجموعة الصور إعدادات أخرى.

بعد التحقق من جميع الإعدادات، اختر علامة تبويب الإدخال واضبط مربع القائمة المنسدلة للتكرار التلقائي على مستمر في جميع الماسحات الضوئية الثلاثة. ضع الألواح المحضرة في الماسحات الضوئية مع توجيه الشتلات أفقيا ووضع الجانب المحسود من الخلفية مؤقتا على الألواح لضمان الاستقرار في الماسح الضوئي. إذا كان تنفيذ هذا البروتوكول مع شريك ، فقم بتشغيل شخص واحد للألواح 90 درجة وعلى الفور شعرت بالخلفية ، فإن الشخص الآخر يضغط بعد ذلك على زر المسح ويقوم كلاهما بتأمين الخلفية إلى الماسح الضوئي باستخدام سلك بنجي.

يكرر هذه العملية للماسحات الضوئية الثانية والثالثة. يجب أن تستغرق كل صورة حوالي دقيقتين إلى ثلاث دقائق لمسح ضوئي بالكامل ستظهر الصور النهائية كما هو موضح. من الجيد التحقق من المجلدات التي يتم حفظ الصور فيها للتأكد من حفظها بشكل صحيح.

من المثالي إبقاء الماسحات الضوئية في منطقة خالية من الاضطرابات لمسح الوقت المحدد. ومن الحكمة أيضا مراعاة الظروف البيئية في منطقة المسح لضمان استجابات نمطية مثالية. الصور التالية هي أمثلة على تلك التي تم جمعها باستخدام الطريقة الموضحة في هذا الفيديو.

اللوحات A و B و C و D هي الصور الأولى والأخيرة من فترة مسح واحدة. يظهر A وB المنطقة الممسوحة ضوئيا بالكامل. في حين أن C و D عبارة عن منطقة مقصوصة في المنطقة الممسوحة ضوئيا تظهر لوحة واحدة ، يمكن ملاحظة العديد من التناقضات.

يوضح الشكل أ التباين في الإنبات ومسار النمو. توضح الصورة B أن الصفائح يمكن أن تتراكم التكثيف بينما تعتبر الصورتان C و D نتائج جيدة بسبب النمو القوي للشتلات وجودة الصورة طوال الجري. يتناسب الإجراء الموضح في هذه الورقة مع مكانته الخاصة في عالم تصوير الجذر من حيث أنه عالي الإنتاجية ودقة عالية بينما لا يزال ميسور التكلفة نسبيا.

تتمثل إحدى المزايا الإضافية لهذا النهج في أنه يمكن تخصيصه بسهولة لتلبية احتياجات التصوير لمجموعة بحثية معينة. يتم تخصيص الطريقة أيضا لتصوير الآخرين.