نوفمبر 6, 2014
وقد تم تطوير طريقة لقياس حجم فموي وجهي وشكل الضفدع الأجنة المورق. في هذا البروتوكول، ويتم الجمع بين قياسات حجم التقليدية مع morphometrics الهندسية للسماح لتحليلات أكثر تطورا التنمية الوجهية والعيوب.
الهدف العام من الإجراء التالي هو وصف الأنماط الظاهرية للوجه الفموي لأجنة xap Levis بطريقة إحصائية كمية. يتم تحقيق ذلك عن طريق تركيب رؤوس الأجنة xip المنفصلة أولا في قالب من الطين لتوثيق الصور باستخدام الصور. يتم قياس أبعاد الوجه لتوفير معلومات حول حجم منطقة الوجه الفمية.
يتم تطبيق المعالم التالية عبر القياس الخشبي الهندسي لتقييم شكل منطقة الوجه الفموي. تظهر النتائج تغيرات كبيرة في الحجم والشكل في منطقة الوجه الفموي Opus بناء على التحليلات الإحصائية لأبعاد الوجه وموضع المعلم النسبي. على الرغم من أن هذه الطريقة يمكن أن توفر نظرة ثاقبة على تطور التأليف أو الوجه ، إلا أنه يمكن تطبيقها أيضا على دراسات مورفولوجيا الفقاريات الأخرى ، مثل مقارنات الأنواع ذات الصلة الوثيقة لأغراض تطورية أو بيئية.
يوضح هذا القسم كيفية صنع أطباق من الطين لحمل رؤوس الأجنة لتوثيق الصور الخاصة بهم. أولا ، قم بتسطيح بعض طين النمذجة في طبق بأي حجم ، وقم بتنعيمها لتغطية اللوحة بأكملها. ثم اضغط برفق على إبرة إغاظة مستقيمة في الطين بزاوية 45 درجة.
أمسك الإبرة بقوة وحرك الطبق ببطء لإنشاء خط مكتئب. بعد ذلك ، استخدم ماصة زجاجية لعمل منخفضات دائرية ضحلة على طول كل خط. في كل اكتئاب ، يمكن وضع رأس الجنين قبل التحميل.
ملأت الرؤوس الطبق ب PBT. تم توضيح تفاصيل حول زراعة شخ القذاء في بروتوكول النص بالإضافة إلى تفاصيل حول إصلاح الأجنة. بالنسبة لهذا البروتوكول ، قم بإصلاح الأجنة بين المرحلتين 42 و 45 ، وفقا لذلك.
أولا ، ضع الأجنة الثابتة في طبق بتري 150 ملم يحتوي على ما يقرب من 100 مل من PBT. الآن ، اقطعوا رؤوسهم. أولا ، أمسك جنينا بزوج من الملقط واستخدم مشرطا لعمل شق في الجانب الخلفي من القناة الهضمية.
ثانيا ، قم بعمل شق في الجانب الأمامي من الأمعاء بالقرب من القلب لإزالة الرأس تماما. باستخدام ماصة ، انقل الرؤوس إلى طبق خط الطين. من الأهمية بمكان أن يتم وضع رؤوس الأجنة في الطين في نفس الاتجاه بالضبط للتصوير الفوتوغرافي.
لضمان النجاح ، استخدم الصفوف المرسومة في الطين كأدلة. من المفيد أيضا أن يلتقط نفس الشخص جميع الصور في نفس اليوم. للعرض الأمامي ، تضع الصور الفوتوغرافية الجانب الخلفي للرؤوس لأسفل في المنخفضات.
استخدم الملقط لمعالجة الرؤوس والطين المحيط بحيث يتم تثبيت الرؤوس في مواجهة الكاميرا ولا يتم إمالتها للرؤية الجانبية. تضع الصور الفوتوغرافية الرؤوس بحيث تواجه جوانبها نفس الاتجاه. قم بمعالجة الرؤوس والطين المحيط بها ، بحيث تشير جميع الغدد الأسمنتية إلى نفس الزاوية.
الآن باستخدام أي مجهر تشريح مع قدرات التقاط الصور ، اجمع صورا لرؤوس الشرغوف. استخدم عدة مصابيح لمنع التظليل المفرط واستخدم أعلى تكبير ممكن. صور كل رأس بنفس الطريقة.
ثم احفظ الصور غير مضغوطة وبأعلى دقة ممكنة. من الصور ، قم بقياس أبعاد الوجه عن طريق الفم. أولا ، حدد عرض الوجه.
حدد النقاط التي يلتقي عندها الجزء البطني من كل عين بأطراف الوجه ، وقم بقياس المسافة بين هذه النقاط. يمكن العثور على تفاصيل حول قياس ارتفاع الوجه ومنطقة الوجه الفموية في بروتوكول النص. انتبه بشكل خاص لتحديد طول الخطم في الصور الجانبية ، قم بعمل خط عمودي يشير إلى الجزء الأمامي من العين.
ثم قم بقياس المسافة الأفقية من النقطة الأمامية حيث يلتقي الوجه بالحافة الظهرية للغدة الأسمنتية إلى الخط الرأسي الذي يشير إلى الجزء الأمامي من العين. يتم شرح أبعاد أخرى مثل عرض الفم والاستدارة في بروتوكول النص لهذا التحليل ، ويجب توحيد إحداثيات معالم الوجه وحفظها في ملف. يجب أن تلتقط المعالم شكل الصورة وأن تكون قابلة للاستخدام في جميع الصور.
لذلك لا تستخدم الهياكل التي قد لا تكون موجودة في جميع العينات. الآن افتح ملف الصورة الأول. للتقييم ، حدد علامة تبويب المكونات الإضافية في شريط الأدوات الرئيسي واختر منتقي النقاط.
من القائمة المنسدلة، حدد علامة التبويب إضافة نقاط وضع نقاط المعالم على الصورة. تظهر على أنها متعددة الألوان. التبديل بين نقاط النقاط البارزة باستخدام أداة نقل الصليب.
بمجرد وضع كل شيء ، حدد علامة التبويب عرض النتائج على شريط الأدوات الرئيسي واختر خيار العرض. يعرض هذا إحداثيات المعالم التاريخية. بعد ذلك ، انسخ الإحداثيات إلى برنامج جداول بيانات في صف فارغ أعلى نوع البيانات الملصق LM يساوي متبوعا بعدد المعالم في العينة في الصف أدناه.
معرف نوع البيانات الملصق يساوي متبوعا بالاسم الذي يحدد العينة. يجب أن يكون لكل عينة معرف فريد. كرر هذه العملية حتى يتم تعيين جميع الصور النموذجية وإدخالها في جدول البيانات.
بعد ذلك ، انسخ الأعمدة مع عينة من التعريف والإحداثيات لكل معلم واحفظها في مستند نصي. ثم افتح برنامج القياس المورفومتري. في هذا البرنامج ، حدد إنشاء مجموعة بيانات جديدة من القائمة الرئيسية.
قم بتسمية الملف ومجموعة البيانات في الشاشة المنبثقة واستورد الملف كملف TPS. حدد الآن ملفا نصيا للإحداثيات لإنشاء مجموعة البيانات. بعد ذلك ، قم بإجراء ملاءمة ومحاذاة procrustes.
أولا، قم بتمييز مجموعة البيانات في علامة تبويب شجرة المشروع. ثم اختر التمهيدات على شريط الأدوات الرئيسي وتتناسب procrustes الجديدة من القائمة المنسدلة. من التحديدات المتاحة، اختر المحاذاة حسب المحور الأساسي.
ثم حدد خيار إجراء ملاءمة القشرية مرة أخرى في القائمة المنسدلة للتمهيدات ، وحدد إنشاء مصفوفة Covance وحدد تنفيذ. الآن من علامة تبويب النتائج ، اعرض ارتباطات مصفوفة كوفانس. لتمييز عينات المجموعة التجريبية والمجموعة الضابطة، قم بإنشاء ملف مصنف عن طريق تعيين كل عينة في مجموعة البيانات لمتغير المصنف المناسب.
في جدول بيانات، أنشئ عمودا يسمى معرف وأنشئ عمودا بعنوان علاج. ثم قم بإدراج كل عينة في عمود المعرف وقم بتعيينها إلى مجموعة. ضمن عمود المعالجة ، احفظ هذا كملف نصي وفي برنامج القياس المورفولوجي ، قم باستيراده من خلال خيار اختيار المطابقة حسب المعرف.
الآن ضمن علامة تبويب المقارنة ، قم بإنشاء تحويل تحليل دالة تمييزية في القائمة المنبثقة. في إطار هذه الوظيفة ، تأكد من تحديد مجموعة البيانات المناسبة ونوع البيانات هو الإحداثيات الملائمة للبروكريست. قم بتمييز أزواج المجموعات المراد مقارنتها ثم قم بإجراء اختبار 1000 التقليب.
لعرض خريطة المتجهات للإحداثيات ، انتقل إلى قائمة الرسومات وحدد علامة التبويب فرق الشكل. إذا كانت الصورة مقلوبة، فقم بإحضار القائمة المنبثقة في مساحة المؤامرة لقلب الرسم التخطيطي إلى الاتجاه الصحيح. أيضا ، في القائمة المنبثقة ، قم بتغيير الرسم البياني إلى شبكة تحويل لتركيب المتجهات على تفاصيل الشبكة عند إنشاء تحليل مكون أساسي.
تحليل مكون مبدأ المخطط المبعثر. يتم توفير شبكات تحويل CVA والمخطط المبعثر وشبكات تحويل CVA في بروتوكول النص. عولجت الأجنة بمستقبل حمض الريتينويك الميكرومولار أو مثبط RAR من المرحلة التنموية 24 إلى المرحلة 30 ، ثم تم تثبيتها في المرحلة 42 وتم تصوير أجنة التحكم المعالجة ب DMSO.
عادة ، أدى العلاج بمثبطات RAR إلى تضييق تشوهات العين في الوجه وفم مثلث الشكل مشوه. بعد إجراء التحليل المورفومتري الهندسي ، تم تقييم التباين من خلال تحليل المكونات المبدئي. تم تمييز الأجنة المعالجة بوضوح عن الضوابط.
على طول محور الكمبيوتر الشخصي ، تحدد الأسهم القيم المتطرفة الإحصائية من داخل المجموعة. تم تقييم الاختلافات المورفولوجية بعد ذلك من خلال تحليل الوظيفة التمييزية. تشير التحولات الدراماتيكية في موضع المعالم الجانبية إلى تضييق شكل الوجه.
يلاحظ الأسهم تحولا طفيفا للخارج في وضع فتحة الأنف. هناك أيضا تزييف ملحوظ في منطقة منتصف الوجه. بعد مشاهدة هذا الفيديو ، يجب أن يكون لديك فهم جيد لكيفية استخدام مجموعة من قياسات الحجم التقليدية والقياسات المورفومترية الهندسية لتقييم حجم وشكل الوجه الجنيني Theus.
اعرض النص الكامل واحصل على الوصول إلى آلاف الفيديوهات العلمية
تقدم هذه المقالة طريقة لتقدير حجم وشكل المنطقة الفموية الوجهية في أجنة Xenopus laevis كمياً. ومن خلال دمج قياسات الحجم التقليدية مع المورفومترية الهندسية، تتيح هذه الدراسة إجراء تحليلات دقيقة لتطور المنطقة الفموية الوجهية والعيوب المرتبطة بها.
يتيح التحليل الكمي للأنماط الظاهرية الفموية الوجهية في Xenopus استقصاءً دقيقاً لآليات النمو القحفي الوجهي، مما يدعم التحقق من الأهداف في المراحل المبكرة وتقليل المخاطر الميكانيكية في الأنظمة ذات الصلة بالأمراض. ويوفر تكامل القياسات المورفومترية الهندسية والتحليل الإحصائي ثقة تنبؤية للتمييز بين تأثيرات العلاج، ويدعم الاستمرارية الانتقالية من مرحلة الاكتشاف إلى الأبحاث قبل السريرية. يطبق سير العمل هذا بشكل مباشر على فرز المحافظ الدوائية وقرارات التقدم المعدلة حسب المخاطر في مسارات اضطرابات النمو والتشوهات القحفية الوجهية.
تندمج هذه الطريقة في المسار الممتد من مرحلة الاكتشاف إلى المرحلة ما قبل السريرية من خلال تمكين التقييم الكمي للنمط الظاهري، والتمييز الإحصائي بين المجموعات، واستخراج مخرجات بيانات قابلة للتكرار لفرق البحث والتطوير متعددة الوظائف.