Name: تحليل إكلينيكية من ميرنا التعبير في سرطان الثدي الأنسجة باستخدام ميرنا في الموقع التهجين (فيديو) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-06-07T15:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 1 s
Description: اكتشف تقنية التهجين الموضعي للميكرو رنا لتحليل التعبير في أنسجة سرطان الثدي. تتيح هذه الطريقة تحديد موقع الميكرو رنا بدقة خلوية لفهم دورها في قمع الأورام.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

تم دعم هذا العمل من خلال منحة المعاهد الوطنية للصحة (5R01 CA178386-03) ومنحة USC ASPIRE-1 إلى HC. نود أن نشكر Vrushab Gowda على مساعدته في المخطوطة.

وافقت هذه الدراسة من قبل مجلس المراجعة المؤسسية للمستشفى شونام الجامعة الوطنية هواسون وجامعة ولاية كارولينا الجنوبية. وقدمت عينات TMA تتألف من سرطان الثدي ومطابقة الأنسجة الطبيعية للثدي المجاورة من قبل البنك الحيوي من مستشفى شونام الجامعة الوطنية هواسون، وهو عضو في شبكة البنك الحيوي كوريا. 1. الحل تحضير <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إعداد 1 لتر من الدناز وريبونوكلياز المياه مجانا. جعل جميع الحلول الكيماوية التي تستخدم diethylpyrocarbonate (DEPC) المياه المعالجة. علاج 1 لتر من الماء مع 500 ميكرولتر من DEPC واحتضان لمدة 3 ساعات في درجة حرارة الغرفة. تعقيم المياه إلى تعطيل DEPC. تحذير: لا يستنشق DEPC لأنه من المعروف مسرطنة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إعداد برنامج تلفزيوني 1X من 10X PBS باستخدام المياه DEPC المعالجة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إعداد 20x ومحكمة أمن الدولة (حل 175.3 غرام من كلوريد الصوديوم و 88.2 غرام من سترات الصوديوم في 800 مل من الماء، وضبط درجة الحموضة إلى 7.0 مع انخفاض قليل في 14 N حل حمض الهيدروكلوريك وضبط مستوى الصوت إلى 1 لتر مع واتإيه)، و 4٪ لامتصاص العرق، و 95٪ من الإيثانول و 80٪ من الإيثانول باستخدام المياه DEPC المعالجة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إضافة 8 مل من ثلاثي إيثانول أمين و 1.05 مل من حمض الهيدروكلوريك في 590 مل من المياه المعالجة DEPC وإضافة 1.5 مل من أنهيدريد الخل لأستلة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تجهيز 50 ميكروغرام / ميكرولتر بروتين كاف في المخزن (50 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، ودرجة الحموضة 8.0 في DEPC المياه المعالجة). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إعداد العازلة التهجين يتألف من 500 ميكرولتر من الفورماميد، 250 ميكرولتر من 20X SSC، 100 ميكرولتر من 50X حل دينهارت لو 12.5 ميكرولتر من تي RNA، 2.5 ميكرولتر من الحمض النووي الرنجة الحيوانات المنوية، 30 ميكرولتر من RVC، 0.02 غرام من عرقلة كاشف و 50 ميكرولتر من الماء DEPC. إعداد الطازجة. </li></ol> 2. أقسام نسيج الثدي <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> قطع 5 ميكرون أقسام جزءا لا يتجزأ من البارافين الثابتة الفورمالين مع مشراح وتطبيق قسم لشحن شريحة 14. ملاحظة: وقد أعد أنسجة الثدي المستخدمة هنا في وقت سابق من شبكة البنك الحيوي كوريا. </li></ol> 3. الأنسجة التحضير <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إزالة البارافين جيئة وذهابام الأنسجة عن طريق غمر الشرائح في 2X جرة Coplin في زيلين الطازجة لمدة 10 دقيقة لكل منهما وترطيب قسم الأنسجة بنسبة 5 حضانات دقيقة في خفض تركيزات الإيثانول (100٪، 95٪ و 80٪) في [ده 2 O. تنفيذ هذه الخطوة في غطاء الدخان. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تزج الأنسجة في DEPC المياه المعالجة لمدة 5 دقائق. في هذه المرحلة جعل الحدود حول قسم الأنسجة مع قلم حاجز مسعور. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إصلاح الأنسجة مع PFA 4٪ لمدة 15 دقيقة تليها يغسل مع برنامج تلفزيوني. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تزج الأنسجة في 0.3٪ تريتون X-100 / برنامج تلفزيوني لمدة 10 دقيقة تليها يغسل مع برنامج تلفزيوني. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> احتضان العينة مع 50 ميكروغرام حل / ميكرولتر بروتين كاف لمدة 15 دقيقة عند 37 درجة مئوية. ثم احتضان أقسام الأنسجة مع ثلاثي إيثانول أمين وأنهيدريد الخل لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة، تليها يغسل مع برنامج تلفزيوني. لا يلزم غسل برنامج تلفزيوني بين العلاج بروتين كاف وثلاثي إيثانول أمين / العلاج أنهيدريد الخليك. </li></ol> 4. التهجين <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل الأنسجة بدقة وincuباتي قسم الأنسجة مع العازلة التهجين لمدة 2 إلى 3 ساعات في درجة حرارة الغرفة. عادة 120 العازلة التهجين ميكرولتر ما يكفي لتغطية قسم الأنسجة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تمييع 5&#39;-DIG المسمى LNA التحقيق لتركيز النهائي من 3:00 في 120 حل التهجين ميكرولتر. كما أن تركيز الأسهم عادة ما يكون 40 نانوغرام / ميكرولتر، إضافة 3 ميكرولتر من الأسهم لعازلة تهجين 120 ميكرولتر واحتضان الخليط في درجة حرارة 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> احتضان قسم الأنسجة مع التحقيق بين عشية وضحاها في 54 درجة مئوية (تيم) في غرفة رطبة. عادة 120 ميكرولتر كافية لتغطية مقطع واحد. إنشاء الرطوبة باستخدام اثنين من مناشف ورقية مبللة. الحجم المثالي للغرفة هو 10 بوصة 8 بوصة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ملاحظة: تيم قد تكون مختلفة لمختلف ميرنا. 54 درجة مئوية هو ذكر لمير 489. </li></ol> 5. صرامة غسل <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل الأنسجة مع 5X SSC لمدة 7 دقائق (بعد خطوة التهجين، ريبونوكلياز ظروف خالية لم تعد المطلوبة). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل قسم الأنسجة خفة دمح 1X SSC لمدة 7 دقائق مرتين في 57 درجة مئوية. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل قسم الأنسجة مع SSC 0.2x لمدة 7 دقائق عند 57 درجة مئوية. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل قسم الأنسجة مع SSC 0.2x لمدة 7 دقائق في درجة حرارة الغرفة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> احتضان قسم الأنسجة في برنامج تلفزيوني لمدة 10 دقيقة. </li></ol> 6. حجب <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> احتضان قسم الأنسجة مع عازلة تمنع في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة في غرفة رطبة (لجعل عازلة تمنع إضافة 2 مل FBS، 10 ميكرولتر من توين-20 و 3 ميكرولتر من جيش صرب البوسنة في 18 م من برنامج تلفزيوني تخزين عازلة تمنع في 4 ° C). </li></ol> 7. الابتدائية الأجسام المضادة الحضانة والتنمية <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تمييع 1: 300 المضادة للDIG-AP الأجسام المضادة في عرقلة العازلة واحتضان قسم الأنسجة مع الأجسام المضادة عند 4 درجات مئوية خلال الليل. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غسل المقاطع مع غسل العازلة 3 مرات، لمدة 5 دقائق لكل منهما (العازلة التي تقدمها مجموعة تطوير). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تطوير قسم الأنسجة مع مجموعة تجارية لالفوسفاتيز القلوية التي تنتج CY-3 ضوء الفلورسنت. </li> &lt;لى&gt; غسل القسم مع غسل العازلة لمدة 5 دقائق. قسم صمة عار مع 100 ميكرولتر من 2.5 نانوغرام / ميكرولتر صبغة هويشت لمدة 5 دقائق تليها غسل 5 دقائق مع غسل العازلة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> جبل القسم مع تصاعد عازلة وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة. استخدام 15 ميكرولتر في قسم الأنسجة والقضاء حل تصاعد المفرط مع أنسجة مسح. ختم الشريحة مع طلاء الأظافر واضحة لمنع تسرب. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> مراقبة المجهر قسم الفلورسنت باستخدام مع 10X عدسة الكلي حتى التكبير هو 100X. </li></ol>

<ol><li>Shah, N. R., Chen, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNAs+in+pathogenesis+of+breast+cancer%3A+Implications+in+diagnosis+and+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">MicroRNAs in pathogenesis of breast cancer: Implications in diagnosis and treatment.</a> World J Clin Oncol. 5, 48-60 (2014).</li>
<li>Tang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((miR-185+suppresses+tumor+proliferation+by+directly+targeting+E2F6+and+DNMT1+and+indirectly+upregulating+BRCA1+in+triple-negative+breast+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cancer+Ther%22%5BJournal%5D)">miR-185 suppresses tumor proliferation by directly targeting E2F6 and DNMT1 and indirectly upregulating BRCA1 in triple-negative breast cancer.</a> Mol Cancer Ther. 13, 3185-3197 (2014).</li>
<li>Ye, X. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epigenetic+silencing+of+miR-375+induces+trastuzumab+resistance+in+HER2-positive+breast+cancer+by+targeting+IGF1R%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Cancer%22%5BJournal%5D)">Epigenetic silencing of miR-375 induces trastuzumab resistance in HER2-positive breast cancer by targeting IGF1R.</a> BMC Cancer. 14, 134(2014).</li>
<li>Oneyama, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNA-mediated+downregulation+of+mTOR%2FFGFR3+controls+tumor+growth+induced+by+Src-related+oncogenic+pathways%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">MicroRNA-mediated downregulation of mTOR/FGFR3 controls tumor growth induced by Src-related oncogenic pathways.</a> Oncogene. 30, 3489-3501 (2011).</li>
<li>McGuire, A., Brown, J. A., Kerin, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metastatic+breast+cancer%3A+the+potential+of+miRNA+for+diagnosis+and+treatment+monitoring%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Metastasis+Rev%22%5BJournal%5D)">Metastatic breast cancer: the potential of miRNA for diagnosis and treatment monitoring.</a> Cancer Metastasis Rev. 34, 145-155 (2015).</li>
<li>Quesne, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+and+prognostic+associations+of+miR-205+and+let-7b+in+breast+cancer+revealed+by+in+situ+hybridization+analysis+of+micro-RNA+expression+in+arrays+of+archival+tumour+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Biological and prognostic associations of miR-205 and let-7b in breast cancer revealed by in situ hybridization analysis of micro-RNA expression in arrays of archival tumour tissue.</a> J Pathol. 227, 306-314 (2012).</li>
<li>Fernandez, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((miR-340+inhibits+tumor+cell+proliferation+and+induces+apoptosis+by+targeting+multiple+negative+regulators+of+p27+in+non-small+cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">miR-340 inhibits tumor cell proliferation and induces apoptosis by targeting multiple negative regulators of p27 in non-small cell lung cancer.</a> Oncogene. 34, 3240-3250 (2015).</li>
<li>Yu, L., Zhang, J., Guo, X., Li, Z., Zhang, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNA-224+upregulation+and+AKT+activation+synergistically+predict+poor+prognosis+in+patients+with+hepatocellular+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Epidemiol%22%5BJournal%5D)">MicroRNA-224 upregulation and AKT activation synergistically predict poor prognosis in patients with hepatocellular carcinoma.</a> Cancer Epidemiol. 38, 408-413 (2014).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((microRNA-146+up-regulation+predicts+the+prognosis+of+non-small+cell+lung+cancer+by+miRNA+in+situ+hybridization%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Mol+Pathol%22%5BJournal%5D)">microRNA-146 up-regulation predicts the prognosis of non-small cell lung cancer by miRNA in situ hybridization.</a> Exp Mol Pathol. 96, 195-199 (2014).</li>
<li>Kriegel, A. J., Liang, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNA+in+situ+hybridization+for+formalin+fixed+kidney+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">MicroRNA in situ hybridization for formalin fixed kidney tissues.</a> J Vis Exp. , e50785(2013).</li>
<li>Ucar, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((miR-212+and+miR-132+are+required+for+epithelial+stromal+interactions+necessary+for+mouse+mammary+gland+development%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">miR-212 and miR-132 are required for epithelial stromal interactions necessary for mouse mammary gland development.</a> Nat Genet. 42, 1101-1108 (2010).</li>
<li>Nuovo, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+detection+of+microRNAs+in+paraffin+embedded%2C+formalin+fixed+tissues+and+the+co-localization+of+their+putative+targets%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">In situ detection of microRNAs in paraffin embedded, formalin fixed tissues and the co-localization of their putative targets.</a> Methods. 52, 307-315 (2010).</li>
<li>Kierzek, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+locked+nucleic+acid+residues+on+the+thermodynamic+properties+of+2%27-O-methyl+RNA%2FRNA+heteroduplexes%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">The influence of locked nucleic acid residues on the thermodynamic properties of 2'-O-methyl RNA/RNA heteroduplexes.</a> Nucleic Acids Res. 33, 5082-5093 (2005).</li>
<li>Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Paraffin+embedding+tissue+samples+for+sectioning%5BTitle%5D)+AND+%22CSH+Protoc%22%5BJournal%5D)">Paraffin embedding tissue samples for sectioning.</a> CSH Protoc. 2008, (2008).</li>
<li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequential+expression+of+miR-182+and+miR-503+cooperatively+targets+FBXW7%2C+contributing+to+the+malignant+transformation+of+colon+adenoma+to+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Sequential expression of miR-182 and miR-503 cooperatively targets FBXW7, contributing to the malignant transformation of colon adenoma to adenocarcinoma.</a> J Pathol. 234, 488-501 (2014).</li>
</ol>

لا يوجد شيء للكشف عنه.

وكان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد مستوى التعبير ميرنا في أنسجة سرطان الثدي باستخدام ميرنا في الموقع التهجين. وتجدر الإشارة إلى أنه في هذه التجربة، وتحسين كل الظروف لأنسجة سرطان الثدي. قد تكون هناك حاجة مزيد من التحسين لأنواع الأنسجة الأخرى. ويجب بذل كل الحلول مع الماء DEPC ويجب أن تشطف بالماء DEPC المعالجة وتعقيمها بعد كل حاويات لاستخدامها. تلوث ريبونوكلياز طفيف حتى يمكن أن تتداخل مع النتيجة النهائية للتجربة. كما ميرنا هي سلسلة قصيرة جدا، فمن الضروري استخدام مسبار LNA لت...

سرطان الثدي هو من بين الأورام الخبيثة الأكثر شيوعا التي تؤثر على السكان الإناث في جميع أنحاء العالم. وذكرت أكثر من 1.3 مليون حالة إصابة بسرطان الثدي كل عام في جميع أنحاء العالم 1،2. على الرغم من أن الخلايا السرطانية قد تعتبر تقليديا متجانسة من الناحية البيولوجية والتكاثري للغاية، أصبح من الواضح أن سرطان الثدي هو جينيا وغير متجانسة سريريا. مقاومة للعقاقير المضادة للسرطان انتشارا هي السمة المميزة لسرطان الثدي المتقدمة، مما أدى إلى وفيات في الغالبية العظمى من المرضى من خلال تسهيله من تطور السرطان وبعد ورم خبيث 3. الرنا الميكروية (miRNAs) هي فئة من جزيئات الحمض النووي الريبي الصغيرة حوالي 22 النيوكليوتيدات طويلة أن تنظيم التعبير الجيني عن طريق تثبيط عملية الترجمة مرنا أو التوسط مرنا تدهور 4. وقد تم تحديد أكثر من 2000 miRNAs مختلفة حتى الآن في البشر، التي ترتبط الأمراض التي تصيب الإنسان 5. مجموعة متزايدة من الدراسات هفأظهرت الإلكترونية التي miRNAs يمكن أن تعمل كما المسرطنة والمكثفات الورم وغالبا ما dysregulated في الأورام 6. miRNAs تؤثر بشدة كل من تكون الأورام الأولية عن طريق التحكم في الهيئات التنظيمية الرئيسية للتقدم دورة الخلية، الشيخوخة، موت الخلايا المبرمج والالتهام الذاتي، جنبا إلى جنب مع تلك الحركة الخلايا السرطانية، والغزو والانبثاث 7. ارتبط التعبير شاذ ميرنا أيضا مع الآثار السريرية مثل المرحلة، والتمايز، والتشخيص والاستجابة إلى العلاج المساعد 8. على وجه الخصوص، وزيادة يرتبط ارتباطا مير 146 التعبير مع سوء أحوال الطقس في مرضى سرطان الرئة 9. وقد أثبتت دراسة أخرى أن فقدت التعبير عن ميرنا let7b مرتبط الظواهر الخبيثة، وبالتالي، وضعف البقاء على قيد الحياة 6. فهم أنواع من الخلايا والهياكل التي تعبر عن miRNAs هو جزء مهم من فهم آليات يمكن من خلالها إحداث تغييرات في ميرنا خلية تأثير التعبير والأنسجة الظواهر 10. يتم أخذ بعض miRNAs وجدت أن يفرز في الخلايا اللحمية في الخلايا الظهارية وتعمل خصيصا على أهدافها. في السياق نفسه، تفرز مير 212 و مير-132 التي سدى وتنظيم التفاعلات الظهارية انسجة اللازمة لنمو الأقنية خلال تطوير الغدة الثديية 11. الهدف العام من هذه الورقة هو شرح بروتوكول مفصلة للكشف عن التعبير ميرنا في أنسجة سرطان الثدي من خلال ميرنا في الموقع التهجين. لقد الأمثل جميع الظروف لفحص مستويات التعبير ميرنا-489 في سرطان الثدي عينات المرضى. تحقيقا لهذه الغاية، استخدمنا DIG المسمى مقفل النووي حمض (LNA) التحقيق في تجربتنا. وكان بعض من النيوكليوتيدات لها لتعديل حالات الغدد، وهذا هو، والجسر الذي يربط بين الميثيلين 2 &quot;ذرة أكسجين و 4&quot; ذرة الكربون في العمود الفقري ريبوز الذي يحدد النوكليوتيدات بحيث يبقى &quot;في مكان مغلق&quot; بعد التهجين. ونتيجة لذلك، هو أكثر صعوبةللمجمع المهجنة لتفسد 12،13.

<table><tbody><tr><td>ELF-97</td><td>تكنولوجيا الحياة&nbsp;</td><td>E6604</td><td></td></tr><tr><td>50x Denhard't&nbsp;</td><td>تكنولوجيا الحياة&nbsp;</td><td>750018</td><td></td></tr><tr><td>t-RNA</td><td>Roche</td><td>109541</td><td>إعادة التكوين في مياه</td></tr><tr><td>DEPC الرنجة المنوية الحمض النووي</td><td>Promega & nbsp ؛</td><td>D1815</td><td></td></tr><tr><td>Roche Blocking&nbsp;</td><td>روش</td><td>11096176001</td><td></td></tr><tr><td>RVC</td><td>Fisher</td><td>50-812-650</td><td>قبل الاستخدام قم بتدويرها عند 16.1 RCF وخذ طافي &nbsp ؛</td></tr><tr><td>مسبار miR-489&nbsp;</td><td>Exiqon</td><td>38599-01</td><td></td></tr><tr><td>Nuclease free BSA</td><td>Roche&nbsp;</td><td>711454</td><td></td></tr><tr><td>الأجسام المضادة الأولية المضادة DIG</td><td>Roche&nbsp;</td><td>11093274910</td><td></td></tr><tr><td>ثنائي إيثيل بيروكربونات&nbsp;</td><td>سيجما</td><td>1609478</td><td></td></tr></tbody></table>

تحليل إكلينيكية من ميرنا التعبير في سرطان الثدي الأنسجة باستخدام ميرنا<em&gt; في الموقع</em&gt; التهجين

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

في هذه المقالة ، نصف بروتوكولا مفصلا للكشف عن miRNA في أنسجة سرطان الثدي باستخدام التهجين في الموقع باستخدام مسبار LNA (الحمض النووي المغلق) المسمى digoxigenin. تم التعرف على المسبار بواسطة الأجسام المضادة للفوسفاتيز القلوية المضادة ل DIG وتم تطويره لاحقا باستخدام ركيزة الفوسفاتيز القلوية التي تنتج إشارات مضانة. استخدمنا هنا تقنية التهجين الموضعي (MISH) miRNA لتحليل التعبير عن miR-489 في أنسجة مرضى سرطان الثدي. يمكن لهذه التقنية اكتشاف توطين miRNA ذات الأهمية في عينات الأنسجة الفردية. يمكن استخدام هذه التقنية لمقارنة التعبير عن miRNA المطلوب في أنسجة الورم مع ذلك الموجود في الأنسجة الطبيعية المجاورة ولتحديد الهياكل المحددة المسؤولة عن التعبير عن هذا miRNA. يمكن أن تكون هذه التقنية مفيدة جدا في الإجابة على بعض الأسئلة السريرية ، مثل دور miRNA المحدد في تطور السرطان. تشير نتائجنا إلى أن الخلايا الظهارية الثديية تعبر عن مستويات أعلى بكثير من miR-489 من الخلايا السرطانية المجاورة.

تم استخدام أنسجة الأورام السرطانية الثديية البشرية لتحديد التعبير ميرنا-489. تم العثور على الثديية قناة الغدة والخلايا الظهارية للتعبير عن أعلى بكثير ميرنا-489 مستويات من الأنسجة المجاورة ورم في اثنين من المرضى (الشكل 1A و 1B). يدل هذا بوضوح أن ميرنا-489 التعبير قد ضاع في أنسجة الورم، مما يشير إلى ورم النشاط القمعية من ميرنا-489. لمزيد من تأكيد هذه النتائج، نسيج الورم والأنسجة الطبيعية المجاورة من نفس المريض وتمت م...

نقدم هنا بروتوكولا للكشف عن تعبير miRNA في عينات مرضى سرطان الثدي باستخدام miRNA في التهجين الموضعي

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...

الهدف العام من عملية التهجين الموضعي للحمض النووي الريبي الميكروي (Micro RNA In Situ Hybridization) هو الكشف عن تموضع الحمض النووي الريبي الميكروي المستهدف في أنسجة سرطان الثدي. وبذلك يمكن للمعلومات الناتجة أن تجيب على الأسئلة الجوهرية في مجال سرطان الثدي، مثل ما إذا كان الحمض النووي الريبي الميكروي المستهدف غير واضح الدور أو يعمل ككابت للأورام.تتمثل الميزة الرئيسية لهذه التقنية في قدرتها على الكشف عن النواتج الخلوية ذات الأهمية في أنسجة سرطان الثدي. ابدأ بتحضير الأنسجة عن طريق إزالة البارافين من مقاطع أنسجة الثدي التي تم تحضيرها مسبقاً. اغمر الشرائح في وعاء كوبلن يحتوي على Xyline حديث مرتين لمدة عشر دقائق في كل مرة.أعد ترطيب قطاع النسيج من خلال الحضن في تركيزات تنازلية من الإيثانول في ماء مقطر مرتين لمدة خمس دقائق لكل تركيز. بعد ذلك، اغمر النسيج في ماء معالج بـ diethylpyrocarbonate أو DEPC لمدة خمس دقائق. وأثناء غمر النسيج، حدد حدودًا حول قطاع النسيج باستخدام قلم حاجز كاره للماء.بعد الغمر في DEPC، يتم تثبيت النسيج باستخدام 4%PFA لمدة 15 دقيقة. يتبع عملية التثبيت غسل بمحلول PBS. بعد ذلك، يُغمر النسيج في 0.3%Triton X-100 في PBS لمدة عشر دقائق.يتم تحضين العينة مع 50 µg/µL من محلول Proteinase K لمدة 15 دقيقة عند 37 °C. بعد ذلك، يتم تحضين مقاطع النسيج مع triethanolamine وacetic anhydride لمدة خمس دقائق في درجة حرارة الغرفة، ثم تُغسل المقاطع باستخدام PBS.اغسل النسيج جيداً. ثم قم بتحضين مقطع النسيج مع 120 µL من محلول التهجين لمدة ساعتين في درجة حرارة الغرفة. بعد ذلك، خفف مسبار NLA المسمى بـ 5' DIG إلى تركيز نهائي قدره 3 pM في 120 µL من محلول التهجين.ثم أضف 3 µL من المخزون بتركيز 40 ng/µL إلى 120 µL من منظم التهجين. ثم حضّن المزيج عند 95 °C لمدة خمس دقائق. ضع مقطع النسيج في حاوية مقاس 10 × 8 بوصة وقم بتغطية النسيج بـ 120 µL من المسبار بحيث يتم تغطيته بالكامل.بلل منشفتين ورقيتين وغطِّ الحاوية لإنشاء غرفة رطوبة. يتم تحضين مقطع النسيج طوال الليل عند 54 درجة مئوية. بعد التهجين، اغسل النسيج باستخدام محلول منظم سترات الصوديوم الملحية بتركيز 5X أو SSC لمدة سبع دقائق عند 57 درجة مئوية.بعد ذلك، اغسل مقطع النسيج بمحلول one X SSC مرتين. واغسل مقطع النسيج بمحلول 0.2 X SSC. ثم اغسل مقطع النسيج بمحلول 0.2 X SSC لمدة سبع دقائق في درجة حرارة الغرفة.يُحضن مقطع النسيج في PBS لمدة عشر دقائق. ثم يُحضن مقطع النسيج مع محلول الحجب (blocking buffer) في درجة حرارة الغرفة لمدة ساعة واحدة داخل غرفة رطبة. يُخفف الجسم المضاد anti DIG AP بنسبة 1 إلى 300 في محلول الحجب.ثم يتم تحضين مقطع النسيج مع الجسم المضاد عند درجة حرارة 4 درجة مئوية طوال الليل. وفي اليوم التالي، تُغسل المقاطع باستخدام محلول الغسيل ثلاث مرات لمدة خمس دقائق في كل مرة. اتبع تعليمات طقم ELF 97 التجاري لتحميض مقطع النسيج باستخدام الفوسفاتاز القلوي الذي ينتج ضوءاً فلورياً من الحجم الثالث.بعد ذلك، اغسل المقطع باستخدام محلول الغسيل لمدة خمس دقائق. صبغ المقطع باستخدام 100 µL من صبغة Hoeshct بتركيز 2.5 ng/µL لمدة خمس دقائق. ثم اتبع عملية الصبغ بالغسل باستخدام محلول الغسيل لمدة خمس دقائق.استخدم 15 µL من محلول التثبيت لكل مقطع نسيجي. وامسح محلول التثبيت الزائد باستخدام منديل ورقي خاص بالأنسجة. بعد ذلك، قم بإحكام غلق الشريحة باستخدام طلاء أظافر شفاف لمنع التسرب.أخيراً، افحص المقطع باستخدام مجهر فلوري بقوة تكبير إجمالية تبلغ 100 X. استُخدمت أنسجة سرطان الثدي البشرية من مريضتين لتحديد تعبير Micro RNA 489. وُجد أن خلايا القنوات الغدية والخلايا الظهارية في الثدي تعبر عن مستويات من Micro RNA 489 أعلى بكثير من أنسجة الورم المجاورة. بعد مشاهدة هذا الفيديو، يجب أن يكون لديك فهم جيد لكيفية إجراء التهجين الموضعي لـ Micro RNA باستخدام عينات من مرضى سرطان الثدي.

clinicopathological-analysis-mirna-expression-breast-cancer-tissues

Research

JoVE Journal

Medicine

الطب

الكمية بوليميريز سلسلة من ردود الفعل في الوقت الحقيقي (qPCR) هو وسيلة سريعة وحساسة للتحقيق في مستويات التعبير عن مختلف microRNA (ميرنا) الجزيئات في عينات الورم. ويمكن استخدام هذا التعبير أسلوب مئات من جزيئات ميرنا مختلفة يتم تضخيمها، كميا، وتحليلها من القالب نفسه [كدنا].

الكشف microRNA في أورام البروستات بواسطة PCR الوقت الحقيقي الكمية (qPCR)

توضح هذه المقالة في البروتوكول الموقع التهجين الأمثل للكشف colormetric التعبير الرنا الميكروي في الفورمالين أقسام الكلى ثابتة.

الرنا الميكروي<em&gt; في الوضع الطبيعي</em&gt; التهجين للأنسجة الكلى الفورمالين الثابتة

الجزيئي يشير من خلال كل من الاستروجين وmicroRNAs حاسمة في تطوير سرطان الثدي والنمو. الاستروجين ينشط مستقبلات هرمون الاستروجين، والتي هي عوامل النسخ. يمكن أن العديد من عوامل النسخ تنظيم التعبير عن microRNAs، وmicroRNAs التنظيم الاستروجين يمكن لمحة باستخدام تقنيات مختلفة واسعة النطاق.

التنميط من MicroRNAs الاستروجين التنظيم في خلايا سرطان الثدي

نصف هنا بروتوكولا مبسطا لتحليلات تعبير microRNA (miRNA) في الأنسجة السريرية المؤرشفة الثابتة بالفورمالين ، المضمنة في البارافين (FFPE) أو سرطان البروستاتا المجمد الطازج (PCa) التي تستخدم PCR الكمي في الوقت الفعلي (RT-PCR) والتهجين في الموقع (ISH).

ميرنا تحليلات التعبير في سرطان البروستاتا الأنسجة السريرية

تدهور الحمض في الأنسجة المحفوظات والتغاير الورم وعدم وجود عينات الأنسجة المجمدة الطازجة يمكن أن يؤثر سلبا على خدمات تشخيص السرطان في مختبرات علم الأمراض في جميع أنحاء العالم. ويصف هذه المخطوطة الاستفادة المثلى من لوحة المؤشرات الحيوية باستخدام مقايسة حبة مغناطيسية متعدد لتصنيف سرطان الثدي.

الأمثل للتحليل متعدد التعبير المستندة إلى الجيش الملكي النيبالي استخدام المواد الأرشيفية سرطان الثدي

الفورمالين--الثابتة العينات جزءا لا يتجزأ من البارافين تمثل مصدرا قيماً للمؤشرات الحيوية الجزيئية للأمراض التي تصيب الإنسان. نقدم هنا كدنا المستندة إلى مختبر مكتبة إعداد بروتوكول، في البداية مصممة مع الحمض النووي الريبي مجمدة طازجة، والأمثل لتحليل microRNAs المؤرشفة من أنسجة تخزين تصل إلى 35 عاماً.

تسلسل ميكرورنا أثر رجعي: الحمض النووي التكميلية المكتبة إعداد بروتوكول باستخدام عينات الفورمالين--الثابتة جزءا لا يتجزأ من البارافين الحمض النووي الريبي

الصغير-الكشف (ميرناس) تسلسل الحمض النووي الريبي قصيرة وعالية مثلى، بوصفه بوستترانسكريبشونال المنظمين للكشف رسول (مرناس). وتختلف طرق الكشف عن ميرنا الحالية في حساسية وخصوصية. ونحن تصف بروتوكول الذي يجمع بين التهجين في الموقع وإيمونوستينينج للكشف عن جزيئات البروتين وميرنا على أبواب أنسجة القلب الماوس المتزامنة.

ميرنا الأنسجة على حدة "التعبير التنميط" في "أقسام القلب الماوس باستخدام" التهجين في الموقع

نقدم بروتوكولا لتقييم مستويات التعبير المتداولة ميكرورنا (ميرناس) في عينات البلازما من مرضى السرطان. على وجه الخصوص، قمنا باستخدام مجموعة أدوات متوفرة تجارياً لتعميم استخراج ميرنا والنسخ العكسي. وأخيراً، قمنا بتحليل فريق من 24 ميرناس المحدد باستخدام مسبار مسبقاً رصدت في الوقت الحقيقي لوحات مخصصة.

الكشف عن لوحة مخصصة MicroRNA المتداولة في المرضى الذين يعانون من سرطان القولون والمستقيم المنتشر

يصف البروتوكول مقايسة تهجين التألق المناعي الترادفي مع الأنسجة المضمنة بالبارافين المثبت بالفورمالين لاكتشاف وقياس الحمض النووي الريبي الصغير والبروتينات متعددة الإرسال في وقت واحد.

تضخيم الحمض النووي الريبي الصغير والتعرف عليه من خلال التهجين الموضعي الموضعي كطريقة جديدة للكشف والقياس الكمي

نقدم بروتوكولا للتحليل الهيكلية والتركيبية للبيوفيلم الفم الطبيعية من الأجهزة التقويمية...

عن طريق الفم من تحليل بيوفيلم المتوسعون حلقي بواسطة التهجين في الموضع الإسفار ومتحد البؤر المسح الضوئي ليزر مجهرية

اكتشف تقنية التهجين الموضعي للميكرو رنا لتحليل التعبير في أنسجة سرطان الثدي. تتيح هذه الطريقة تحديد موقع الميكرو رنا بدقة خلوية لفهم دورها في قمع الأورام.

تحليل إكلينيكية من ميرنا التعبير في سرطان الثدي الأنسجة باستخدام ميرنا

استكشف المزيد من الفيديوهات