-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Developmental Biology
التنبؤ والتحقق من جين تنظيم عناصر المنشط خلال الريتينويك حمض المستحثة الجنينية الجذعية تمايز الخلايا
التنبؤ والتحقق من جين تنظيم عناصر المنشط خلال الريتينويك حمض المستحثة الجنينية الجذعية تمايز الخلايا
JoVE Journal
Developmental Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Developmental Biology
Prediction and Validation of Gene Regulatory Elements Activated During Retinoic Acid Induced Embryonic Stem Cell Differentiation

التنبؤ والتحقق من جين تنظيم عناصر المنشط خلال الريتينويك حمض المستحثة الجنينية الجذعية تمايز الخلايا

Full Text
8,714 Views
09:07 min
June 21, 2016

DOI: 10.3791/53978-v

Zoltan Simandi*1, Attila Horvath*2, Peter Nagy1, Laszlo Nagy1,2,3

1Sanford-Burnham-Prebys Medical Discovery Institute at Lake Nona, 2Department of Biochemistry and Molecular Biology,Research Center for Molecular Medicine, Medical and Health Science Center, University of Debrecen, 3MTA-DE “Lendulet” Immunogenomics Research Group,University of Debrecen

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This video presents an integrated set of methods for identifying and validating genomic regulatory elements known as enhancers. It highlights the workflow's adaptability for various cellular model systems.

Key Study Components

Area of Science

  • Genomic regulatory elements
  • Enhancer identification
  • Cellular model systems

Background

  • Enhancers play a crucial role in gene regulation.
  • Understanding enhancer selection is vital for studying transcription.
  • Cell differentiation and responses to stimuli can be influenced by enhancers.
  • ChIP-seq analysis aids in identifying candidate enhancers.

Purpose of Study

  • To provide a workflow for enhancer identification and validation.
  • To facilitate research on transcription and gene regulation.
  • To demonstrate the adaptability of the protocol across different cellular models.

Methods Used

  • Selection of candidate enhancers based on ChIP-seq data.
  • Utilization of genome browsers to analyze binding sites.
  • Experimental validation of enhancer activity.
  • Adaptation of methods for various cellular systems.

Main Results

  • Identification of active enhancers in different contexts.
  • Validation of enhancer functionality through experimental approaches.
  • Demonstration of the workflow's versatility.
  • Insights into enhancer usage during cell differentiation.

Conclusions

  • The presented workflow is effective for enhancer research.
  • It can be adapted for various experimental setups.
  • Enhancer identification is crucial for understanding gene regulation.

Frequently Asked Questions

What are enhancers?
Enhancers are regulatory DNA sequences that increase the likelihood of transcription of particular genes.
How can enhancers be identified?
Enhancers can be identified using techniques such as ChIP-seq to analyze protein-DNA interactions.
What is the significance of enhancer validation?
Validating enhancers is essential to confirm their role in gene regulation and their functional impact on biological processes.
Can the methods be used in different cell types?
Yes, the workflow is designed to be adaptable for various cellular model systems.
What role do enhancers play in cell differentiation?
Enhancers influence gene expression patterns that are crucial for cell differentiation and response to stimuli.

في هذا العمل ، نقدم سير عمل تجريبيا لكيفية تحديد المعززات النشطة والتحقق من صحتها تجريبيا.

الهدف العام من هذا الفيديو هو توفير مجموعة متكاملة من الأساليب لتحديد العناصر التنظيمية الجينومية والتحقق من صحتها تجريبيا ، ما يسمى بالمعززات. يمكن أن تساعد هذه الطريقة في الإجابة على الأسئلة الرئيسية في نسخ وتنظيم الأحداث البيولوجية ، بما في ذلك اختيار المحسن واستخدامه ، باستخدام تمايز الخلايا ، أو استجابة للمنبهات الخارجية. الميزة الرئيسية لتدفق العمل المقدم هي أنه يمكن تكييف البروتوكول بسهولة واستخدامه في أي أنظمة نموذجية خلوية.

سأوضح خطوات الإجراء. للبدء ، اختر محسنا مرشحا بناء على تحليل تسلسل الرقائق الموجود مسبقا. استخدم متصفح الجينوم لعرض نتائج تجربة تسلسل الرقاقة المطلوبة ، وتحديد مواقع الربط بالقرب من الجين محل الاهتمام.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

علم الأحياء التنموي العدد 112 نص محسن التعبير الجيني وحمض الريتينويك الريتينويك حمض مستقبلات الخلية الجذعية الجنينية رقاقة وما يليها إرنا فحص وسيفيراز

Related Videos

كفاءة اشتقاق أسلاف الإنسان متعلق بالخلايا العصبية والخلايا العصبية من افرة القوة الخلايا الجذعية الجنينية البشرية التعريفي مع جزيء صغير

10:47

كفاءة اشتقاق أسلاف الإنسان متعلق بالخلايا العصبية والخلايا العصبية من افرة القوة الخلايا الجذعية الجنينية البشرية التعريفي مع جزيء صغير

Related Videos

15.9K Views

Oct4GiP الفحص مراسل لدراسة الجينات التي تنظم الفأر الخلايا الجذعية الجنينية الصيانة والتجديد الذاتي

08:01

Oct4GiP الفحص مراسل لدراسة الجينات التي تنظم الفأر الخلايا الجذعية الجنينية الصيانة والتجديد الذاتي

Related Videos

10.9K Views

تمايز خلايا الجسم الجنينية إلى أسلاف عصبية باستخدام حمض الريتينويك

02:25

تمايز خلايا الجسم الجنينية إلى أسلاف عصبية باستخدام حمض الريتينويك

Related Videos

538 Views

توظيف خلايا المراسل في ثقافة مشتركة لدراسة إنتاج حمض الريتينويك بواسطة الخلايا الجنينية للفأر

02:15

توظيف خلايا المراسل في ثقافة مشتركة لدراسة إنتاج حمض الريتينويك بواسطة الخلايا الجنينية للفأر

Related Videos

496 Views

الزنك الاصبع نوكلياز المحسن استهداف الجينات في الخلايا الجذعية الجنينية البشرية

12:13

الزنك الاصبع نوكلياز المحسن استهداف الجينات في الخلايا الجذعية الجنينية البشرية

Related Videos

11.3K Views

عدوى فيروسات الفئران الجنينية الجذعية المستمدة خلية خلايا الجسم مضغي لتحليل التمايز لدم

11:40

عدوى فيروسات الفئران الجنينية الجذعية المستمدة خلية خلايا الجسم مضغي لتحليل التمايز لدم

Related Videos

8.9K Views

طريقة سريعة وفعالة لتنقية خلايا الأديم المولدة من الخلايا الجذعية الجنينية البشرية

08:34

طريقة سريعة وفعالة لتنقية خلايا الأديم المولدة من الخلايا الجذعية الجنينية البشرية

Related Videos

8.9K Views

القياس الكمي لمستويات حمض الريتينويك النسبية في E8.5 الأجنة وNeurosphere الثقافات باستخدام F9 نادر-Lacz القائم على خلية مراسل الفحص

09:49

القياس الكمي لمستويات حمض الريتينويك النسبية في E8.5 الأجنة وNeurosphere الثقافات باستخدام F9 نادر-Lacz القائم على خلية مراسل الفحص

Related Videos

8.3K Views

تحليل الناجم عن حمض الريتينويك العصبية تمايز الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في الهيئات مضغي اثنين وثلاثة الأبعاد

09:04

تحليل الناجم عن حمض الريتينويك العصبية تمايز الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في الهيئات مضغي اثنين وثلاثة الأبعاد

Related Videos

9.5K Views

التمايز العصبي من الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في المختبر

08:01

التمايز العصبي من الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في المختبر

Related Videos

10.5K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code