استخدام خط أنابيب MALDI TOF-MS IDBac المفتوح المصدر لتحليل البروتين الميكروبي وبيانات المستقلب المتخصصة

21.1K مشاهدة

استشهد بها 20

09:29 دقيقة

مايو 15, 2019

10.3791/59219-v

مايو 15, 2019

21.1K مشاهدة

IDBac هو خط أنابيب المعلوماتية الحيوية القائمة على الطيف الكتلي المفتوح المصدر الذي يدمج البيانات من كل من البروتين السليم وأطياف المستقلب المتخصصة، التي تم جمعها على مواد الخلايا كشط من المستعمرات البكتيرية. يسمح خط الأنابيب للباحثين بتنظيم المئات إلى الآلاف من المستعمرات البكتيرية بسرعة في مجموعات تصنيفية مفترضة، وتمييزها بشكل أكبر على أساس إنتاج المستقلب المتخصص.

استكشف المزيد من الفيديوهات

تحليل أطياف البروتين

Chapters in this video

0:04

Title

1:10

Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition

2:02

Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data

2:47

Work with Previous Experiments

3:22

Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots

4:07

Clustering Samples Using Protein Data

4:49

Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram

5:32

Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)

6:51

Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac

8:28

Conclusion

Related Videos