نمذجة البنية الرباعية من خلال قياس الطيف الكتلي المتقاطع الكيميائي: توسيع تقارير TX-MS Jupyter

2.5K مشاهدة

استشهد بها 2

05:18 دقيقة

أكتوبر 20, 2021

10.3791/60311-v

أكتوبر 20, 2021

2.5K مشاهدة

Hamed Khakzad¹^,² , Swen Vermeul³ , Lars Malmström⁴^,⁵^,⁶

¹Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes, Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, ²Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, ³Scientific IT Services, ETH Zurich, ⁴Institute for Computational Science, University of Zurich, ⁵S3IT, University of Zurich, ⁶Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine, Lund University

ينشئ قياس الطيف الكتلي المستهدف المتقاطع نماذج بنية البروتين الرباعية باستخدام بيانات قياس الطيف الكتلي التي تم الحصول عليها باستخدام ما يصل إلى ثلاثة بروتوكولات اكتساب مختلفة. عند التنفيذ كسير عمل مبسط على خادم الويب Cheetah-MS ، يتم الإبلاغ عن النتائج في دفتر ملاحظات Jupyter. هنا ، نوضح الجوانب الفنية لكيفية توسيع Jupyter Notebook لإجراء تحليل أكثر تعمقا.