لم يتم جمع عينات شفط القصبة الهوائية لحديثي الولادة إلا بعد موافقة مستنيرة من الوالدين ، وتمت الموافقة على البروتوكول المستخدم للجمع والنقل والتخزين من قبل مجلس المراجعة المؤسسية (IRB) التابع لمركز العلوم الصحية بجامعة أوكلاهوما (IRB 14377).
1. التحضير للعزل والمرور وثقافة ALI ل nTAEC
- إعداد وسائل الإعلام
- وسط مجرى الهواء الظهاري القصبي (BLEAM) مع مثبطات (BLEAM-I): تحضير 500 مل (زجاجة واحدة ، مخزنة عند 4 درجات مئوية) من BLEAM عن طريق إضافة 1.25 مل من مكمل HLL (500 ميكروغرام / مل ألبومين مصل بشري ، 0.6 ميكرومتر حمض اللينوليك ، 0.6 ميكروغرام / مل ليسيثين) ، 15 مل من L-Glutamine (6 مل) ، 2 مل من مستخلص P (0.4٪ ، مستخلص الغدة النخامية البقري) ، 5 مل من TM1 (1 ميكرومتر من الأدرينالين ، 5 ميكروغرام / مل ترانسفيرين ، 10 نانومتر ثلاثي يودوثيرونين ، 0.1 ميكروغرام / مل هيدروكورتيزون ، 5 نانوغرام / مل عامل نمو البشرة (EGF) ، 5 نانوغرام / مل أنسولين) ، 1 مل من محلول المضادات الحيوية (نورموسين ، 0.1 مجم / مل). لمنع شيخوخة الخلايا الأولية وتحسين كفاءة التمدد ، أضف مثبطات عامل النمو التالية كما هو موضحسابقا 39: Y-27632 (بروتين كيناز مرتبط ب Rho أو مثبط ROCK) بتركيز نهائي يبلغ 5 ميكرومتر ، A83-01 (يثبط إشارات Smad) بتركيز نهائي يبلغ 1 ميكرومتر ، CHIR 99021 (مثبط سينسيز الجليكوجين -3 أو GSK3) بتركيز نهائي قدره 0.4 ميكرومتر و Rapamycin (مثبط الهدف الجزيئي للرابامايسين أو mTOR) مع نهائي تركيز 5 نانومتر. قم بتصفية الوسائط من خلال مرشح بحجم المسام 0.22 ميكرومتر. راجع الجدول 1 للحصول على قائمة بمكونات الوسائط.
- الخلية الظهارية للقصبات الهوائية / القصبة الهوائية البشرية (HBTEC) ALI متوسط: اصنع 500 مل من وسائط HBTEC عن طريق إذابة الزجاجة عند 37 درجة مئوية وإضافة 1 مل من محلول المضادات الحيوية (نورموسين ، 0.1 مجم / مل). بمجرد إضافتها ، قم بتصفية الوسائط من خلال مرشح بحجم المسام 0.22 ميكرومتر.
- وسائط HBTEC مع مثبطات (HBTEC-I): إعداد وسائط HBTEC على النحو الوارد أعلاه. قبل التصفية ، أضف المثبطات التالية: Y-27632 بتركيز نهائي يبلغ 5 ميكرومتر و A83-01 بتركيز نهائي يبلغ 0.5 ميكرومتر. قم بتصفية الوسائط من خلال مرشح بحجم المسام 0.22 ميكرومتر.
ملاحظة: قم بتخزين وسائط BLEAM-I و HBTEC و HBTEC-I عند 4 درجات مئوية ، مؤرخة ومصنفة ، في الظلام (ملفوفة بورق الألمنيوم) ، وقم فقط بتسخين ما هو مطلوب (مدة الصلاحية 30 يوما).
- HEPES/FBS: أضف 500 مل من محلول ملحي مخزن ب HEPES و 88 مل من FBS (التركيز النهائي هو 15٪). بمجرد إضافته ، قم بتصفية المحلول من خلال مرشح بحجم المسام 0.22 ميكرومتر وقم بتخزينه عند 4 درجات مئوية ، مؤرخا وموسما.
ملاحظة: Aliquot ودافئ BLEAM و HEPES-FBS و Trypsin-EDTA إلى 37 درجة مئوية (30 دقيقة على الأقل) قبل الاستخدام.
- قوارير ثقافة الطلاء وإدخالات زراعة خلايا ALI بوسط مكيف 804G
- قم بإعداد خلية 804G (خط الخلية الظهارية لمثانة الفئران) وسائط مكيفة بالمصفوفة كما هو موضحسابقا 39.
- قم بتغطية قارورة زراعة الخلية وإدخالات زراعة الخلايا بوسائط مكيفة ب 804G لمدة 4 ساعات على الأقل في حاضنة 37 درجة مئوية ، 5٪ ثاني أكسيد الكربون2. راجع الجدول 2 لمعرفة كميات الوسائط اللازمة لتغطية قوارير الاستزراع المختلفة وإدخالات زراعة الخلايا.
2. عزل وتوسيع nTAECs والاستعداد لثقافة ALI اللاحقة
- الحصول على شفط القصبة الهوائية الطازج (حوالي 1 مل) أثناء الشفط الروتيني للأنبوب الرغامي لحديثي الولادة المنببين وتجميع الشفط في مصيدة مخاطية. إذا كان حجم الشفط غير كاف للوصول إلى مصيدة المخاط ، اشطف قسطرة الشفط ب 1-3 مل من المحلول الملحي المعقم.
- قم بتسمية العينة وتخزينها في كيس بيولوجي على الجليد.
ملاحظة: يمكن تخزين العينات على الجليد عند 4 درجات مئوية لمدة أقصاها 24 ساعة. ومع ذلك ، فإن العائد أعلى مع العينات الجديدة.
- نقل العينة من وحدة العناية المركزة لحديثي الولادة إلى المختبر. قم بتغطية قارورة T25 بوسائط مكيفة بتقنية 804G واستعد لتلقيح العينة في وقت نقل شفط القصبة الهوائية إلى المختبر.
- قم بإزالة مصيدة المخاط من كيس الخطر البيولوجي وتنظيف الأسطح الخارجية جيدا باستخدام 70٪ من الإيثانول لتجنب أي تلوث. افتح بعناية الغطاء الموجود على مصيدة المخاط تحت غطاء مزرعة الخلايا المعقم.
- قم بتخفيف عينة القصبة الهوائية باستخدام PBS معقم إلى 5 مل (لتخفيف المخاط) ونقل المحتوى بالكامل إلى أنبوب مخروطي سعة 50 مل.
- جهاز الطرد المركزي للأنبوب عند 250 × جم ، 20 درجة مئوية -23 درجة مئوية لمدة 5 دقائق ، وتخلص من المادة الطافية (بما في ذلك المخاط).
ملاحظة: تتم جميع عمليات الطرد المركزي هنا عند 250 × جم ، 20 درجة مئوية -23 درجة مئوية لمدة 5 دقائق ما لم ينص على خلاف ذلك.
- أعد تعليق الحبيبات في 5 مل من BLEAM-I.
- قم بإزالة قارورة T25 من الحاضنة وتخلص من الوسائط المكيفة 804G قبل طلاء العينة.
- ضع العينة في قارورة T25 وضعها في الحاضنة عند 37 درجة مئوية ، 5٪ ثاني أكسيد الكربون2 (سيطلق على هذا الممر 0 أو P0).
- قم بتغيير الوسائط باستخدام BLEAM-I بعد 24 ساعة من الطلاء لغسل الخلايا غير المتصلة وبعد ذلك كل 48 ساعة.
ملاحظة: بعد معالجة عينة نفطة القصبة الهوائية واحتضانها في وسائط BLEAM-I ، تظهر خلايا متوازية المستطيلات بعد 7-10 أيام من الطلاء. بحلول حوالي 3 أسابيع بعد الطلاء ، تكون الخلايا معبأة بكثافة وتتطلب التربسين للمرور والتوسع والتخزين اللاحق. يتم وضع خلايا المرور المبكر (P1 - P2) في أنابيب التبريد (2.5 × 106 خلايا لكل 500 ميكرولتر من وسائط التجميد لكل أنبوب تبريد) وتخزينها في النيتروجين السائل للتخزين طويل الأجل.
- قم بإذابة الخلايا المجمدة بسرعة من النيتروجين السائل في حمام مائي بدرجة حرارة 37 درجة مئوية ونقل معلق الخلية إلى أنبوب معقم بحجم مناسب يحتوي على BLEAM-I.
- عد الخلايا لتحديد العدد الإجمالي والحي للخلية باستخدام بقعة زرقاء مغرقة وعداد خلوي آلي أو يدوي كما هو موضح سابقا48. قم بتخفيف معلق الخلية بحجم مناسب من BLEAM-I ، بحيث يكون التركيز النهائي 2.1 × 106 خلايا في 15 مل من تعليق الخلية (لقارورة T75).
ملاحظة: بالنسبة لقارورة T25 ، يتم استخدام 0.7 × 106 خلايا في 5 مل من تعليق الخلية بشكل عام للبذر.
- انقل معلق الخلية سعة 15 مل إلى قارورة T75 واحتضانه طوال الليل عند 37 درجة مئوية ، 5٪ ثاني أكسيد الكربون2.
- في صباح اليوم التالي ، تبادل وسائل الإعلام مع BLEAM-I الجديد. بعد ذلك ، تبادل الوسائط مع BLEAM-I جديد كل يومين. بمجرد أن تصل الخلايا إلى حوالي 80٪ -90٪ ، تصبح جاهزة للتربسين لزراعة ALI.
- ضع 5 مل من التربسين EDTA (T75) على طبقة أحادية الخلية.
ملاحظة: تذكر استخدام التربسين الطازج. تجنب استخدام التربسين الذي تم تسخينه عدة مرات.
- احتضان القارورة عند 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق في الحاضنة. ثم اضغط على جانب القارورة 8x-10x لإخراج الخلايا. تحقق تحت المجهر للتأكد من أن الخلايا قد تم إزاحتها بعد التربسين. إذا بقيت >50٪ من الخلايا على القارورة ، اغسلها باستخدام PBS 2x وكرر خطوة التربسين مع تقليل وقت الحضانة من 2-3 دقائق.
- أوقف التفاعل باستخدام 15 مل من HEPES-FBS والماصة لأعلى ولأسفل 4x-5x. انقل الخلايا إلى أنبوب معقم بحجم مناسب وجهاز طرد مركزي عند 250 × جم لمدة 5 دقائق لتكسير الخلايا.
- بعد الطرد المركزي ، استنشق بعناية المادة الطافية. قم بإذابة حبيبات الخلية في 1 مل من BLEAM-I عن طريق سحب العينة برفق لأعلى ولأسفل 5x-10x.
- عد الخلايا لتحديد إجمالي عدد الخلايا الحية. قم بتخفيف معلق الخلية بحجم مناسب من BLEAM-I ، بحيث يكون التركيز النهائي 1 × 105 خلايا حية لكل 100 ميكرولتر من تعليق الخلية.
3. ثقافة ALI ل nTAECs
ملاحظة: يجب طلاء إدخالات زراعة الخلايا بوسائط مكيفة ب 804G واحتضانها لمدة 4 ساعات على الأقل عند 37 درجة مئوية ، 5٪ ثاني أكسيد الكربون2 قبل الخطوة التالية (انظر الخطوة 1.2).
- قم بإزالة لوحة (صفائح) زراعة الخلايا المكونة من 24 بئرا التي تحتوي على إدخالات زراعة الخلايا من الحاضنة وتخلص من الوسائط المكيفة ب 804G.
- أضف 1 مل من BLEAM-I إلى الغرفة القاعدية الجانبية (السفلية) لكل بئر ALI. أضف 100 ميكرولتر من تعليق الخلية (1 × 105 خلايا) إلى الغرفة القمية لإدخالات ثقافة خلايا ALI واحتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية ، 5٪ ثاني أكسيدالكربون 2. تعرف هذه المرحلة بأنها يوم ALI -2.
- في اليوم التالي ، قم بتغيير الوسائط في الغرف القاعدية الجانبية (1 مل) والقمي (100 ميكرولتر) باستخدام BLEAM-I الطازج. عند تغيير الوسائط في الغرفة القمية ، احرص على عدم إزعاج الطبقة الأحادية للخلية. تعرف هذه المرحلة بأنها يوم ALI -1.
- في اليوم التالي ، قم بإزالة الوسائط من كل من الغرف القاعدية والقمي.
ملاحظة: يستغرق الأمر يومين حتى تصبح الخلايا الموجودة على غشاء زراعة الخلية ملتقية في ظل الظروف المغمورة. في هذه المرحلة ، يمكن إنشاء ALI.
- أضف 1 مل من وسائط HBTEC-I إلى الغرفة القاعدية الجانبية ولكن اترك وسائط الغرفة القمية خالية ومعرضة للهواء. تعرف هذه المرحلة بأنها يوم ALI 0.
- استمر في تبادل وسائط HBTEC-I (1 مل) في الغرفة القاعدية كل 48 ساعة من اليوم 0 إلى 6 ALI. قم بالتبديل إلى وسائط HBTEC العادية (بدون مثبطات) في اليوم 7 من ALI حتى النقطة الزمنية المطلوبة للحصاد.
ملاحظة: خلال الأيام السبعة الأولى من ثقافة ALI ، قد تتسرب الوسائط من الغرفة القاعدية إلى الغرفة القمية. يجب استنشاق هذه الوسائط بعناية كل يوم للحفاظ على صحة طبقة الخلية والسماح لها بالتمايز.
- حصاد الخلايا وإدخالات زراعة الخلايا والوسائط القاعدية في نقاط زمنية مختلفة للتقنيات الجزيئية والمقايسات والتحليل.
- بالنسبة لهذا البروتوكول ، في أيام ALI 0 و 7 و 28 ، حصاد الخلايا لتحليل التعبير الجيني qPCR (بروتوكول الشركة المصنعة القياسي) لعلامات التمايز الظهارية. في أيام ALI 0 و 7 و 14 و 28 ، يتم حصاد إدخالات زراعة الخلايا لاختبار وظيفة الحاجز (الطرق الموضحة أدناه).
- في اليومين 0 و 28 من ALI ، استخدم إدخالات مزرعة الخلايا الثابتة بالفورمالين لتلوين الفلورسنت المناعي باستخدام علامات التمايز الظهارية (باستخدام البروتوكول المنشور سابقا)49. في اليوم 14 من ALI ، حصاد الوسائط القاعدية الجانبية لإطلاق نازعة هيدروجين اللاكتات (LDH) (بروتوكول الشركة المصنعة القياسي) ، ومحللات الخلايا ل qPCR لعلامات الإجهاد التأكسدي ، واللطخة المناعية مع الأجسام المضادة الكاسباز 3 والأجسام المضادة الكاسباز 3 المشقوقة (بروتوكول الشركة المصنعة القياسي) ، وإدراج ثقافة الخلايا لمقايسة الإجهاد التأكسدي (الطريقة الموضحة أدناه).
4. اختبار وظيفة الحاجز أثناء تمايز ALI
- قياس المقاومة الكهربائية عبر الظهارية (TEER)
ملاحظة: قم بقياس TEER باستخدام مقياس الفولت الظهاري / أوم (EVOM) أثناء تمايز ALI لتقييم سلامة طبقة الخلية50.
- قبل قياس قيم مقاومة مرشح الاختبار ، استخدم ثقافة خلية مطلية بالوسائط مكيفة ب 804G (خالية من أي خلايا) لقياس قيمة مقاومة الخلفية بالأوم (Ω)
- اطرح قيمة مقاومة الخلفية من قيم مقاومة مرشح الاختبار واضرب الفرق في مساحة سطح نمو الخلية للحصول على قيمة TEER لكل مرشح اختبار.
TEER = (ΩT - ΩB) × C
TEER = المقاومة الكهربائية عبر الظهارة (Ω.cm2)
ΩT = اختبار قيمة مقاومة المرشح (Ω)
ΩB = قيمة مقاومة الخلفية (Ω)
C = مساحة سطح نمو الخلية (سم2)
ملاحظة: يتم تثبيت إدخالات زراعة الخلايا المستخدمة في قياسات TEER لاحقا بالفورمالين المخزن بنسبة 10٪ وتستخدم على الفور في تلطيخ الفلورسنت المناعي والفحص المجهري الفلوري (الطريقة الموضحة أدناه) أو تخزينها عند 4 درجات مئوية للتلطيخ لاحقا.
- مقايسة النفاذية الظهارية للفلوريسين إيزيثيونات ديكستران (FITC-dextran)
ملاحظة: تم إجراء مقايسة نفاذية الظهارة باستخدام وزنين جزيئيين مختلفين من FITC-dexterrn (10 كيلو دالتون و 20 كيلو دال) أثناء تمايز ALI.
- تحضير محلول عمل FITC-dextran (1 مجم / مل): قم بقياس 5 مجم من FITC واخلطه في 1 مل من DMSO (5 مجم / مل). أعد تعليق مخزون 5 مجم / مل في وسائط HBTEC الدافئة إلى 37 درجة مئوية إلى تركيز 1 مجم / مل. حماية المحلول من الضوء.
- نقل مرشحات الاختبار (المحتوية على الخلايا) إلى صفيحة جديدة مكونة من 12 بئرا وإضافة 1 مل من وسائط HBTEC في الحجرة القاعدية الجانبية.
- قم بشفط وسائط الحجرة القمية (إن وجدت) واستبدلها ب 250 ميكرولتر من محلول عمل FITC-dextran. احتضن في درجة حرارة الغرفة محمية من الضوء لمدة 60 دقيقة.
- قم بإنهاء اختبار FITC-dextern عن طريق إزالة مرشحات الاختبار (التي تحتوي على محلول عمل FITC-dextran) من اللوحة المكونة من 12 بئرا.
- اجمع الوسائط القاعدية الجانبية من الصفيحة المكونة من 12 بئرا في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة سعة 1.5 مل والدوامة.
- انقل 100 ميكرولتر من كل أنبوب إلى صفيحة دقيقة من البوليسترين الأسود ذات القاع الشفاف 96 جيدا في ثلاث نسخ. نقل 100 ميكرولتر من وسائط HBTEC إلى آبار إضافية في الصفيحة المكونة من 96 بئرا كعنصر تحكم سلبي لقياس مضان الخلفية.
- قم بقياس شدة التألق باستخدام مقياس الطيف الضوئي باستخدام إثارة 490 نانومتر والحد الأقصى للانبعاث 520 نانومتر.
- اطرح متوسط قيمة مضان الخلفية من قيم مضان مرشح الاختبار للحصول على مضان مصحح والتعبير عن القيم كنسبة مئوية مقابل قيم التألق المصححة في اليوم 0 ل FITC 10 كيلو دالتون و 20 كيلو دالتون.
5. التعرض لفرط التأكسج باستخدام حاضنة TriGas
- في اليوم السابع من ALI ، حدد عدد إدخالات زراعة الخلايا التي سيتم وضعها في فرط التأكسج بناء على الاحتياجات التجريبية واحتياجات الحصاد.
- اضبط مستوى O2 في حاضنة TriGas على 60٪ O2. يستغرق الأمر بشكل عام ~ 30-45 دقيقة حتى يصل مستوى O2 إلى 60٪.
- بمجرد أن يستقر مستوى O2 عند 60٪ ، ضع لوحة زراعة الخلايا المكونة من 24 بئرا مع إدخالات زراعة الخلايا المخصصة لمجموعة فرط التأكسج داخل الحاضنة وأغلق باب الحاضنة.
ملاحظة: يجب تنفيذ هذه الخطوة بأكبر قدر ممكن من الكفاءة لمنع حدوث انخفاض كبير في مستوى O2 داخل الحاضنة.
- قم بتغيير الوسائط في إدخالات ثقافة الخلايا المعرضة لفرط التأكسج باتباع نفس الجدول الزمني مثل آبار التحكم (21٪ O2 مكشوفة). افحص إدخالات مزرعة الخلايا كل يوم بحثا عن تسرب الوسائط واستنشق أي تسرب برفق إلى غرفة زراعة الخلايا.
- استمر في التعرض لفرط التأكسج لمدة 7 أيام (أيام ALI من 7 إلى 14). بمجرد اكتمال التعرض لفرط التأكسج ، قم بحصاد الخلايا أو إجراء فحوصات باستخدام إدخالات زراعة الخلايا في اليوم 14 من ALI.
6. مقايسة الإجهاد التأكسدي لتقييم آثار فرط التأكسج
ملاحظة: استخدمنا مجموعة فحص CM-H2DCFDA وقمنا بقياس شدة التألق في اليوم 14 من ALI كعلامة على الإجهاد التأكسدي في إدخالات ثقافة الخلايا بعد التعرض ل O2 . H2DCFDA هو شكل مختزل كيميائيا وأسيتيل من 2 ′ ، 7 ′ ثنائي كلورو فلورسين (DCF) وهو مؤشر دائم للخلية الحية لأنواع الأكسجين التفاعلية (ROS). CM-H2DCFDA هو مشتق الكلورو ميثيل تفاعل الثيول ل H2DCFDA ، والذي يعزز المزيد من الارتباط التساهمي بالمكونات داخل الخلايا ، مما يسمح بالاحتفاظ بالصبغة داخل الخلية لفترة أطول. هذه الجزيئات غير فلورية حتى تتم إزالة مجموعات الأسيتات بعمل الاستيرازات داخل الخلايا ، وتحدث الأكسدة في الخلية51. بعد الأكسدة داخل الخلايا ، يمكن قياس الزيادة الناتجة في التألق باستخدام مجهر الفلورسنت كمقياس بديل للإجهاد التأكسدي الخلوي52. الكاشف خفيف وحساس للهواء وبالتالي يحتاج إلى الحماية من الضوء وإبقائه محكم الإغلاق قدر الإمكان.
- تحضير محلول الفحص CM-H2DCFDA: تحتوي كل قارورة على 50 ميكروغرام من صبغة الكاشف في شكل مسحوق. لعمل محلول مخزون 1 ملي مولار ، أضف 80 ميكرولتر من DMSO المعقم إلى القارورة ، واخلطها جيدا باستخدام ماصة ، ودوامة برفق. للحصول على تركيز نهائي 1 ميكرومتر من الصبغة في إدخالات زراعة الخلايا ، أضف 0.1 ميكرولتر من مخزون 1 ملي مولار لكل 100 ميكرولتر من PBS (على سبيل المثال ، أضف محلول مخزون 0.6 ميكرولتر إلى 600 ميكرولتر PBS ل 6 إدخالات لزراعة الخلايا).
ملاحظة: يمكن أن يتراوح التركيز النهائي للصبغة بين 1-5 ميكرومتر. يجب تحسين الجرعة لكل حالة مزرعة.
- أضف 100 ميكرولتر من محلول الصبغة 1 ميكرومتر في كل مزرعة خلوية لكل من المجموعة المعرضة لفرط التأكسج أو المجموعة المعرضة للنورموكسيا. استخدم ما لا يقل عن 1 مزرعة خلية كعنصر تحكم سلبي من كل مجموعة معالجة (100 ميكرولتر من PBS بدون صبغة). احتضن عند 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة ، محمية من الضوء. اغسل 1x مع PBS.
- تحضير الشريحة: استنزاف أي PBS زائد. أمسك إدخالات ثقافة الخلايا بعناية واستخدم شفرة لقطع غشاء زراعة الخلايا ببطء. صب 1-2 قطرات من السائل الصاعد على الشريحة. باستخدام ملقط مسطح الرأس ، أمسك زاوية الغشاء بعناية ، وضعه على جانب الخلية لأسفل على الحامل ، وقم بتغطيته بقلة غطاء. قم بإزالة السائل الزائد واتركه ليجف في الهواء لمدة 15 دقيقة في درجة حرارة الغرفة محمية من الضوء. الشرائح جاهزة الآن للتصوير.
ملاحظة: يجب إجراء تحضير الفحص المجهري للشريحة والفلورسنت في أسرع وقت ممكن حيث تتلاشى شدة الفلورسنت بشكل ملحوظ خلال 2-3 ساعات.
- المجهر الفلوري: التقط الصور باستخدام مجهر الفلورسنت باستخدام قناة Cy2 (السيانين-2). التقط صورا من ثلاث مناطق منفصلة وغير متداخلة لكل مزرعة خلية.
- الكشف عن الفلورسنت للإجهاد التأكسدي
ملاحظة: استخدم الصور من الفحص المجهري الفلوري لقياس التألق الكلي للخلية المصححة (CTCF) باستخدام برنامج ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/) وسير العمل الموضح أدناه. يعمل CTCF كعلامة للإجهاد التأكسدي في إدخالات ثقافة الخلية بعد التعرض لفرط التأكسج ويتم قياسه عن طريق القضاء على مضان الخلفية بمساعدة برنامج ImageJ.
- افتح صورة الفحص المجهري في ImageJ وحدد منطقة الاهتمام باستخدام أداة المستطيل. احفظ منطقة التحديد (α) بالنقر بزر الماوس الأيمن وحدد إضافة إلى مدير ROI (منطقة الاهتمام). استخدم منطقة التحديد هذه عبر الصور.
- حدد معلمات القياس ضمن تحليل > تعيين القياسات وحدد المنطقة والكثافة المتكاملة ومتوسط القيمة الرمادية ضمن علامة تبويب الإعدادات.
- لكل صورة، استخدم نفس منطقة التحديد من مدير عائد الاستثمار وحدد تحليل > القياس. تمثل قيمة الكثافة المتكاملة التألق الكلي (Ft) للمنطقة المحددة. قم بتدوين قيم القياس من النافذة المنبثقة.
- لتصحيح مضان الخلفية (Fb) في كل صورة، حدد مساحة صغيرة من المنطقة غير الفلورية باستخدام أداة المستطيل. حدد تحليل > قياس لهذه المنطقة. تمثل قيمة الشدة المتوسطة Fb. قم بتدوين قيم القياس من النافذة المنبثقة.
- احسب CTCF بضرب متوسط شدة التألق لقراءات الخلفية في المساحة الإجمالية لعائد الاستثمار وطرح هذا الرقم من قيمة الكثافة المتكاملة لعائد الاستثمار. كرر سير العمل هذا لجميع الصور لكلتا المجموعتين العلاجيتين (Control و Hyperoxia).
CTCF = Ft - (Fb x α)
CTCF = التألق الكلي المصحح للخلية (A.U.)
Ft = التألق الكلي
Fb = مضان الخلفية
α = منطقة الاختيار