تسلسل Amplicon باستخدام تقنيات التسلسل طويل القراءة

أبحث فيما إذا كان التسلسل المحمول طويل القراءة يمكن أن يوفر نتائج قابلية للأدوية في بيئات محدودة الموارد بدقة مماثلة لطريقة المعيار الذهبي، مما يعزز تشخيصات السل عالية الجودة وسهلة الوصول إليها. باستخدام التسلسل المستهدف من الجيل القادم كأداة تشخيصية لمرض السل المقاوم للأدوية من خلال تقديم ملف مقاومة شامل مباشرة من عينة سريرية دون خبرة في المعلوماتية الحيوية. بروتوكولنا الذي يستخدم تسلسل القراءة الطويلة لديه القدرة على توفير أوقات استجابة أسرع، وسير عمل أبسط مقارنة بالكشف عن المقاومة في الوقت الحقيقي، مما يسهل تشخيصات السل الشاملة، ويعزز تتبع التفشي في بيئة محدودة الموارد مع بنية تحتية محدودة.

للبدء، احسب 100 نانوجرام من كل عينة أمبليون بناء على التركيز وانقل الحجم المطلوب إلى أنبوب PCR نظيف. لتحديد الكتلة الكلية للمضخمات في العينة، استخدم الصيغة المعطاة. اضبط الحجم الكلي لكل عينة إلى 12.5 ميكرولتر باستخدام ماء خال من النوكليز.