Experimental Metastasis Assay

Metastasis is the leading cause of death in cancer patients.  To understand the mechanism of metastasis, an experimental metastasis assay was established ...

University of Rochester Medical Center

&#x591A;&#x7EF4;&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;-&#x8D28;&#x8C31;&#x57FA;&#x4E8E;&#x80BD;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x4F20;&#x7EDF;&#x4E0A;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x7B2C;&#x4E00;&#x7EF4;&#x5EA6;&#x548C;&#x53CD;&#x76F8;&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;&#x4E2D;&#x7684;&#x79BB;&#x5B50;&#x4EA4;&#x6362;&#x6CD5;&#x5728;&#x7B2C;&#x4E8C;&#x7684;&#x730E;&#x67AA;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#xFF0C;&#x5B83;&#x8868;&#x660E;&#x7B49;&#x7535;&#x805A;&#x7126; (IEF) &#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6709;&#x8DA3;&#x7684;&#x66FF;&#x4EE3;&#x65B9;&#x6CD5;&#x79BB;&#x5B50;&#x4EA4;&#x6362;&#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EF4;&#x5EA6;&#x4E2D;&#x7684;&#x591A;&#x80BD;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E00;&#x79CD;&#x6539;&#x8FDB;&#x7684;&#x591A;&#x80BD;&#x5206;&#x79BB;&#x534F;&#x8BAE;&#x8FDE;&#x7EED;&#x81EA;&#x7531;&#x6D41;&#x7535;&#x6CF3; (&#x5916;&#x8D44;&#x4F01;&#x4E1A;) &#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E8C;&#x7EF4;&#x80BD;&#x5206;&#x79BB;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x6D41;&#x4E2D;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EF4;&#x5EA6;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528;&#x5E73;&#x9762; pI &#x6E10;&#x53D8;&#x548C;&#x7518;&#x9732;&#x9187;&#x548C;&#x5C3F;&#x7D20;&#x6839;&#x636E;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F97;&#x4EE5;&#x6267;&#x884C;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x5206;&#x6790;&#x4E0E;&#x6539;&#x8FDB;&#x7684;&#x8854;&#x63A5;&#x4EE5;&#x7CAE;&#x548C;&#x5C5E;-&#x8D28;&#x8C31;/&#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x79BB;&#x4ECB;&#x8D28;&#x3002;&#x53D1;&#x8FBE;&#x7684;&#x534F;&#x8BAE;&#x88AB;&#x5E94;&#x7528;&#x4E8E;&#x6E38;&#x79BB;&#x7684;&#x4E00;&#x5C0F;&#x90E8;&#x5206;&#x6765;&#x81EA;&#x65BD;&#x8010;&#x5FB7; S2 &#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECE;&#x679C;&#x8747;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x8D85;&#x8FC7; 10,000 &#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x80BD;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x4E0E;&#x9AD8;&#x6982;&#x7387;&#x3002;&#x6539;&#x5584;&#x540E;&#x4EE5;&#x7CAE;&#x76DB;&#x4E8B;&#x7684;&#x80BD;&#x9274;&#x5B9A;&#x7684;&#x51C6;&#x786E;&#x6027;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x9644;&#x52A0;&#x53C2;&#x6570; pI &#x4FE1;&#x606F;&#x7EB3;&#x5165;&#x6B63;&#x786E;&#x548C;&#x4E0D;&#x6B63;&#x786E;&#x7684;&#x80BD;&#x5206;&#x914D;&#x5230; MS/MS &#x8C31;&#x4E4B;&#x95F4;&#x6B67;&#x89C6;&#x7684;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x6A21;&#x578B;&#x3002;

&#x4F18;&#x5316;&#x591A;&#x80BD;&#x5206;&#x79BB;&#x53CA;&#x8D28;&#x8C31;&#x9274;&#x5B9A;&#x57FA;&#x4E8E;&#x901A;&#x8FC7;&#x81EA;&#x7531;&#x6D41;&#x7535;&#x6CF3;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x3002;

Multidimensional LC-MS based shotgun proteomics experiments at the peptide level have traditionally been carried out by ion exchange in the first dimension and reversed-phase liquid chromatography in the second. Recently, it has been shown that isoelectric focusing (IEF) is an interesting alternative approach to ion exchange separation of peptides in the first dimension. Here we present an improved protocol for peptide separation by continuous free-flow electrophoresis (FFE) as the first dimension in a two-dimensional peptide separation work flow. By the use of a flat pI gradient and a mannitol and urea based separation media we were able to perform high-throughput proteome analysis with improved interfacing between FFE and RPLC-MS/MS. The developed protocol was applied to a cytosolic fraction from Schneider S2 cells from Drosophila melanogaster, resulting in the identification of more than 10,000 unique peptides with high probability. To improve the accuracy of the peptide identification following FFE-IEF we incorporated the pI information as an additional parameter into a statistical model for discrimination between correct and incorrect peptide assignments to MS/MS spectra.

Optimized peptide separation and identification for mass spectrometry based proteomics via free-flow electrophoresis.

Multidimensionnelle SM-bas&eacute; shotgun proteomics au niveau du peptide ont traditionnellement &eacute;t&eacute; effectu&eacute; des exp&eacute;riences par &eacute;change d&#39;ions dans la chromatographie liquide premi&egrave;re dimension et phase inverse dans la seconde. R&eacute;cemment, il a &eacute;t&eacute; d&eacute;montr&eacute; que l&#39;iso&eacute;lectrofocalisation (IEF) est une approche alternative int&eacute;ressante &agrave; &eacute;change d&#39;ions s&eacute;paration des peptides dans la premi&egrave;re dimension. Nous pr&eacute;sentons ici un protocole am&eacute;lior&eacute; pour la s&eacute;paration des peptides par &eacute;lectrophor&egrave;se continue sur la libre circulation (FFE) comme la premi&egrave;re dimension dans un flux de travail de s&eacute;paration de peptide &agrave; deux dimensions. Par l&#39;utilisation d&#39;un gradient de pI plat et mannitol et ur&eacute;e bas&eacute; des m&eacute;dias de s&eacute;paration nous avons pu effectuer une analyse prot&eacute;omique haut d&eacute;bit avec une interface am&eacute;lior&eacute;e entre la FFE et RPLC-SM/SM. Le protocole d&eacute;velopp&eacute; a &eacute;t&eacute; appliqu&eacute; &agrave; une fraction cytosolique de cellules Schneider S2 de Drosophila melanogaster, r&eacute;sultant dans l&#39;identification de plus de 10 000 peptides uniques, avec une probabilit&eacute; &eacute;lev&eacute;e. Pour am&eacute;liorer la pr&eacute;cision de l&#39;identification de peptide suite FFE-IEF, nous avons incorpor&eacute; les informations IP comme un param&egrave;tre suppl&eacute;mentaire dans un mod&egrave;le statistique pour la discrimination entre les affectations de peptide correctes et incorrectes aux spectres MS/MS.

Peptide optimis&eacute; s&eacute;paration et identification par spectrom&eacute;trie de masse pour la base prot&eacute;omique par &eacute;lectrophor&egrave;se de libre circulation.

Mehrdimensionale LC-MS basierte Schrotflinte, die Proteomics Experimente auf der Peptid-Ebene traditionell durch Ionenaustausch in der ersten Dimension und Umkehrphasen-Fl&uuml;ssigchromatographie im zweiten durchgef&uuml;hrt wurden. Vor kurzem hat sich gezeigt, dass die Isoelektrische Fokussierung (IEF) eine interessante alternative Herangehensweise Ionenaustausch Trennung von Peptiden in der ersten Dimension ist. Hier pr&auml;sentieren wir eine verbesserte Protokoll f&uuml;r Peptid-Trennung durch kontinuierliche free Flow-Elektrophorese (FFE) als die erste Dimension im Arbeitsablauf einer zweidimensionalen Peptid-Trennung. Durch die Verwendung von einem flachen pI-Farbverlauf und Mannit und Harnstoff basierte Trennung Medien konnten wir Hochdurchsatz Proteom-Analyse mit verbesserter Schnittstellen zwischen FFE und RPLC-MS/MS f&uuml;hren. Das entwickelte Protokoll wurde auf ein cytosolisches Bruchteil von Schneider S2-Zellen von Drosophila Melanogaster, wodurch die Identifizierung von mehr als 10.000 einzigartige Peptide mit hoher Wahrscheinlichkeit angewendet. Um die Genauigkeit der Peptid-Identifizierung nach FFE-IEF verbessern wir die pI-Informationen als einen zus&auml;tzlichen Parameter in ein statistisches Modell f&uuml;r Diskriminierung zwischen richtigen und falschen Peptid-Zuweisungen f&uuml;r MS/MS Spektren aufgenommen.

Optimierte Peptid-Trennung und Identifizierung f&uuml;r Massenspektrometrie basierte Proteomics &uuml;ber free Flow-Elektrophorese.

LC-MS multidimensionale basato shotgun proteomics esperimenti a livello del peptide sono tradizionalmente svolte da scambio ionico nella primo dimensione e controfase cromatografia liquida nel secondo. Recentemente, &egrave; stato dimostrato che l&#39;isoelettrofocalizzazione (IEF) &egrave; un interessante approccio alternativo a scambio ionico separazione dei peptidi nella prima dimensione. Qui di seguito presentiamo un protocollo per la separazione del peptide migliorato dal continuo flusso di-elettroforesi (FFE) come la prima dimensione in un flusso di lavoro di separazione bidimensionale del peptide. Mediante l&#39;uso di una sfumatura pI piatto e mannitolo e urea basato separazione media siamo stati in grado di effettuare analisi di alto-rendimento proteome con migliorato interfacciamento tra FFE e RPLC-MS/MS. Il protocollo sviluppato &egrave; stato applicato a una frazione citosolica da Schneider S2 cellule di Drosophila melanogaster, risultante nell&#39;identificazione di pi&ugrave; di 10.000 unici peptidi con alta probabilit&agrave;. Per migliorare la precisione dell&#39;identificazione del peptide seguito FFE-IEF abbiamo incorporato le informazioni pI come parametro aggiuntivo in un modello statistico per la discriminazione tra le assegnazioni del peptide corretto e scorretto di spettri MS/MS.

Peptide ottimizzato separazione e identificazione per spettrometria totale basato proteomica tramite elettroforesi free-flow.

&#x591A;&#x6B21;&#x5143; LC MS &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x5B9F;&#x9A13;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9; &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x4F1D;&#x7D71;&#x7684;&#x306B;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30C7;&#x30A3;&#x30E1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068;&#x9006;&#x76F8;&#x6DB2;&#x4F53;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C8;&#x30B0;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x4EA4;&#x63DB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; 2 &#x756A;&#x76EE;&#x304C;&#x5B9F;&#x65BD;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6563;&#x5F3E;&#x9283;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#xFF08;IEF&#xFF09; &#x7B49;&#x96FB;&#x96C6;&#x4E2D;&#x3001;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x6B21;&#x5143;&#x306E;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x4EA4;&#x63DB;&#x5206;&#x96E2;&#x306F;&#x8208;&#x5473;&#x6DF1;&#x3044;&#x4EE3;&#x66FF;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x5206;&#x96E2;&#x306E;&#x6539;&#x826F;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x9023;&#x7D9A;&#x30D5;&#x30EA;&#x30FC; &#x30D5;&#x30ED;&#x30FC;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5; &#xFF08;FFE&#xFF09; &#x4E8C;&#x6B21;&#x5143;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x5206;&#x96E2;&#x4F5C;&#x696D;&#x30D5;&#x30ED;&#x30FC;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30C7;&#x30A3;&#x30E1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D5;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8; pI &#x30B0;&#x30E9;&#x30C7;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DE;&#x30F3;&#x30CB;&#x30C8;&#x30FC;&#x30EB;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5C3F;&#x7D20;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x96E2;&#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A2;&#x306E; FFE &#x3068;&#x6E05;&#x6DBC;&#x98F2;&#x6599;&#x6C34;-MS/MS &#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x6539;&#x5584;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF; &#x30D5;&#x30A7;&#x30FC;&#x30B9;&#x3068;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8; &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x5B9F;&#x884C;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x3002;&#x958B;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x306F;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x753B;&#x5206;&#x306B;&#x30B7;&#x30E5;&#x30CA;&#x30A4;&#x30C0;&#x30FC; S2 &#x7D30;&#x80DE;&#x30AD;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x3001;10,000 &#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x306B;&#x9AD8;&#x3044;&#x78BA;&#x7387;&#x3067;&#x751F;&#x3058;&#x308B;&#x304B;&#x3089;&#x9069;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6B21;&#x306E; FFE IEF &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C3;&#x30C9;&#x8B58;&#x5225;&#x306E;&#x7CBE;&#x5EA6;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x6211;&#x3005; &#x5DEE;&#x5225; MS/MS &#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x6B63;&#x3057;&#x3044;&#x3068;&#x6B63;&#x3057;&#x304F;&#x306A;&#x3044;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x9593;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306B; pI &#x60C5;&#x5831;&#x8FFD;&#x52A0;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x307F;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

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&#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; LC MS &#xAE30;&#xBC18; &#xC0F7;&#xAC74; proteomics &#xC2E4;&#xD5D8; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xC804;&#xD1B5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC2E4;&#xC2DC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xCC28;&#xC6D0;&#xACFC; &#xBC18;&#xB300;&#xB85C; &#xC0C1; &#xC561;&#xCCB4; &#xD06C;&#xB85C;&#xB9C8;&#xD1A0;&#xADF8;&#xB798;&#xD53C;&#xC5D0; &#xC774;&#xC628; &#xAD50;&#xD658;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB450; &#xBC88;&#xC9F8;. &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0;, isoelectric &#xCD08;&#xC810; (IEF)&#xC740; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xCC28;&#xC6D0;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xC758; &#xC774;&#xC628; &#xAD50;&#xD658; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD765;&#xBBF8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xADFC; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC; 2 &#xCC28;&#xC6D0; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC791;&#xC5C5; &#xD750;&#xB984;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xCC28;&#xC6D0;&#xC73C;&#xB85C; &#xC5F0;&#xC18D; &#xC790;&#xC720; &#xD750;&#xB984; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95; (FFE) &#xD558; &#xC5EC; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; &#xBD84;&#xB9AC;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB41C; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C;&#xC744; &#xC81C;&#xC2DC;. &#xD50C;&#xB7AB; pI &#xADF8;&#xB77C;&#xB370;&#xC774;&#xC158;&#xACFC; &#xB9C8; &#xB2C8; &#xD1A8; &#xBC0F; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xBD84;&#xB9AC; &#xBBF8;&#xB514;&#xC5B4; FFE RPLC MS/MS &#xC0AC;&#xC774; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB41C; &#xC778;&#xD130;&#xD398;&#xC774;&#xC2A4;&#xC640; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC218;&#xD589;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C;. &#xAC1C;&#xBC1C;&#xB41C; &#xB41C; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C;&#xC740; Drosophila melanogaster, &#xB192;&#xC740; &#xD655;&#xB960;&#xC73C;&#xB85C; 10000 &#xACE0;&#xC720; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC288;&#xB098;&#xC774;&#xB354; S2 &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; cytosolic &#xBD84;&#xC218;&#xC5D0; &#xC801;&#xC6A9; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. FFE IEF &#xB2E4;&#xC74C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC758; &#xC815;&#xD655;&#xB3C4; &#xAC1C;&#xC120; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; MS/MS &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC815;&#xD655; &#xD558; &#xACE0; &#xC798;&#xBABB; &#xB41C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xD560;&#xB2F9; &#xAC04;&#xC758; &#xCC28;&#xBCC4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0; &#xCD94;&#xAC00; &#xB9E4;&#xAC1C; &#xBCC0;&#xC218; pI &#xC815;&#xBCF4; &#xD1B5;&#xD569;.

&#xCD5C;&#xC801;&#xD654; &#xB41C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBD84;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xC790;&#xC720; &#xD750;&#xB984; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18; &#xC73C;&#xB85C;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

LC-MS multidimensional basada en escopeta experimentos de la prote&oacute;mica en el nivel del p&eacute;ptido tradicionalmente se han realizado por intercambio i&oacute;nico en la primera dimensi&oacute;n y fase inversa cromatograf&iacute;a l&iacute;quida en el segundo. Recientemente, se ha demostrado que la concentraci&oacute;n isoel&eacute;ctrica (IEF) es una interesante alternativa a la separaci&oacute;n de intercambio i&oacute;nico de p&eacute;ptidos en la primera dimensi&oacute;n. Aqu&iacute; presentamos un protocolo mejorado para la separaci&oacute;n del p&eacute;ptido por electroforesis de libre flujo continua (FFE) como la primera dimensi&oacute;n en un flujo de trabajo de separaci&oacute;n de p&eacute;ptido bidimensional. Por el uso de un gradiente de pI plana manitol y urea basados en los medios de separaci&oacute;n que hemos sido capaces de realizar el an&aacute;lisis del proteoma de alto rendimiento con interfaz mejorada entre FFE y TAGATOSA-MS/MS. El protocolo desarrollado se aplic&oacute; a una fracci&oacute;n citos&oacute;lica de c&eacute;lulas Schneider S2 de Drosophila melanogaster, dando por resultado la identificaci&oacute;n de m&aacute;s de 10.000 p&eacute;ptidos &uacute;nicos con alta probabilidad. Para mejorar la exactitud de la identificaci&oacute;n de p&eacute;ptido tras FFE-IEF incorporamos la informaci&oacute;n pI como un par&aacute;metro adicional en un modelo estad&iacute;stico para la discriminaci&oacute;n entre las asignaciones correctas e incorrectas de p&eacute;ptido de espectros de MS/MS.

P&eacute;ptido optimizado separaci&oacute;n e identificaci&oacute;n por espectrometr&iacute;a de masas basada en prote&oacute;mica mediante electroforesis de flujo libre.

&#x4E86;&#x89E3;&#x5982;&#x4F55;&#x86CB;&#x767D;&#x4E0E;&#x5B83;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C;&#x4EA4;&#x4E92;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x7F51;&#x7EDC;&#x5C06;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4FE1;&#x606F;&#x8F6C;&#x6362;&#x6210;&#x4E00;&#x4E2A;&#x52A8;&#x6001;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x4F53;&#x662F;&#x751F;&#x7269;&#x79D1;&#x5B66;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x57FA;&#x672C;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7406;&#x89E3;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x514B;&#x9686;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6B65;&#x9AA4;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x901A;&#x8FC7;&#x68C0;&#x6D4B; 9,124 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4ECE;&#x5197;&#x4F59;&#x7684; 498,000 &#x548C; 72,281 &#x4E0D;&#x540C;&#x80BD;&#x9274;&#x5B9A;&#x7F16;&#x5F55;&#x9884;&#x6D4B;&#x679C;&#x8747;&#x679C;&#x8747;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7684; 63%&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7A7A;&#x524D;&#x7684;&#x9AD8;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x62A5;&#x9053;&#x4E3A;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x771F;&#x53D6;&#x5F97;&#x4E86;&#x7ED3;&#x5408;&#x793A;&#x4F8B;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x3001; &#x591A;&#x5C42;&#x9762;&#x7684;&#x751F;&#x5316;&#x5206;&#x998F;&#x548C;&#x5206;&#x6790;&#x9A71;&#x52A8;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x53CD;&#x9988;&#x56DE;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x5373;&#x6570;&#x636E;&#x6536;&#x96C6;&#x9075;&#x5FAA;&#x4E8B;&#x5148;&#x6570;&#x636E;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x9AD8;&#x8D28;&#x91CF;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x6570;&#x636E;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4FEE;&#x6539;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6CE8;&#x91CA;&#xFF0C;&#x5E76;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x5F88;&#x591A;&#x4EBA;&#x9884;&#x6D4B;&#x57FA;&#x56E0;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4E5F;&#x672C;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684; proteotypic &#x80BD;&#x5339;&#x914D; D.&#x9ED1;&#x8179;&#x679C;&#x8747;&#x57FA;&#x56E0;&#x6A21;&#x578B;&#x5927;&#x7EA6; 50%&#x3002;&#x6B64;&#x5E93;&#x7684; proteotypic &#x591A;&#x80BD;&#x5E94;&#x542F;&#x7528;&#x5FEB;&#x901F;&#x3001; &#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x548C;&#x5B9A;&#x91CF;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x6F84;&#x6E05;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6A21;&#x5F0F;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3002;

&#x679C;&#x8747;&#x679C;&#x8747;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7684;&#x9AD8;&#x8D28;&#x91CF;&#x76EE;&#x5F55;&#x3002;

Understanding how proteins and their complex interaction networks convert the genomic information into a dynamic living organism is a fundamental challenge in biological sciences. As an important step towards understanding the systems biology of a complex eukaryote, we cataloged 63% of the predicted Drosophila melanogaster proteome by detecting 9,124 proteins from 498,000 redundant and 72,281 distinct peptide identifications. This unprecedented high proteome coverage for a complex eukaryote was achieved by combining sample diversity, multidimensional biochemical fractionation and analysis-driven experimentation feedback loops, whereby data collection is guided by statistical analysis of prior data. We show that high-quality proteomics data provide crucial information to amend genome annotation and to confirm many predicted gene models. We also present experimentally identified proteotypic peptides matching approximately 50% of D. melanogaster gene models. This library of proteotypic peptides should enable fast, targeted and quantitative proteomic studies to elucidate the systems biology of this model organism.

A high-quality catalog of the Drosophila melanogaster proteome.

Comprendre comment les prot&eacute;ines et leurs r&eacute;seaux d&#39;interactions complexes convertir l&#39;information g&eacute;nomique dans un organisme vivant dynamique est un d&eacute;fi fondamental en sciences biologiques. Comme une &eacute;tape importante dans la compr&eacute;hension de la biologie des syst&egrave;mes d&#39;un eucaryote complexe, nous catalogu&eacute;s 63 % du prot&eacute;ome Drosophila melanogaster pr&eacute;dit en d&eacute;tectant les prot&eacute;ines 9 124 de 498 000 licenci&eacute;s et 72 281 identifications peptidiques distinctes. Cette couverture de proteome &eacute;lev&eacute; sans pr&eacute;c&eacute;dent pour un eucaryote complexe a &eacute;t&eacute; obtenue en combinant la diversit&eacute; de l&#39;&eacute;chantillon, le fractionnement biochimique multidimensionnel et boucles de r&eacute;troaction d&#39;exp&eacute;rimentation ax&eacute;e sur l&#39;analyse, selon laquelle la collecte de donn&eacute;es est guid&eacute;e par l&#39;analyse statistique des donn&eacute;es pr&eacute;alables. Nous montrons que prot&eacute;omique de qualit&eacute; de donn&eacute;es fournissent des informations cruciales pour modifier l&#39;annotation du g&eacute;nome et confirmer que beaucoup ont pr&eacute;dit des mod&egrave;les de g&egrave;ne. Nous avons &eacute;galement pr&eacute;sent identifi&eacute; exp&eacute;rimentalement proteotypic peptides correspondant &agrave; environ 50 % des mod&egrave;les de g&egrave;ne de d. melanogaster. Cette biblioth&egrave;que de peptides proteotypic devrait permettre des &eacute;tudes prot&eacute;omiques rapide, cibl&eacute;e et quantitatives &eacute;lucider la biologie des syst&egrave;mes de cet organisme mod&egrave;le.

Un catalogue de qualit&eacute; du prot&eacute;ome Drosophila melanogaster.

Verstehen, wie Proteine und ihre komplexe Interaktion-Netzwerke die genomische Informationen in eine dynamische Lebewesen umwandeln ist eine grunds&auml;tzliche Herausforderung in den Biowissenschaften. Als wichtigen Schritt in Richtung zum Verst&auml;ndnis der Systembiologie von einer komplexen Eukaryote katalogisiert wir 63 % des prognostizierten Drosophila Melanogaster Proteome von 9.124 Proteine von 498.000 redundant und 72.281 unterschiedliche Peptid-Identifikationen zu erkennen. Diese beispiellos hohen Proteom-Abdeckung f&uuml;r eine komplexe Eukaryote wurde erreicht durch die Kombination von Beispiel-Vielfalt, mehrdimensionale biochemische Fraktionierung und Analyse-gesteuerte Experimente-Feedback-Schleifen, wobei Datenerhebung durch statistische Analyse der vorherigen Daten gef&uuml;hrt wird. Wir zeigen, dass qualitativ hochwertige Proteomics Daten wichtige Informationen zur &Auml;nderung der Genom-Anmerkung und liefern zu best&auml;tigen, dass viele gen Modelle vorausgesagt. Wir auch anwesend experimentell ermittelten Proteotypic Peptide entsprechen etwa 50 % D. Melanogaster gen Modelle. Diese Bibliothek Proteotypic Peptide sollten schnell, gezielt und quantitative Proteomic Studien zu erhellen die Systembiologie von diesem Modellorganismus aktivieren.

Ein hochwertiger Katalog des Drosophila Melanogaster Proteome.

Capire come le proteine e le loro reti di interazione complessa convertono le informazioni genomiche in un organismo vivente dinamica &egrave; una sfida fondamentale in scienze biologiche. Come un importante passo verso la comprensione della biologia dei sistemi di un&#39;eucariote complessa, abbiamo catalogato 63% del predetto Drosophila melanogaster proteoma rilevando 9.124 proteine da 498.000 ridondanti e 72.281 identificazioni del peptide distinti. Questa copertura proteome alta senza precedenti per un&#39;eucariote complessa &egrave; stata realizzata combinando diversit&agrave; campione, frazionamento biochimica multidimensionale e sperimentazione basata su analisi feedback loop, per cui la raccolta dei dati &egrave; guidata dall&#39;analisi statistica dei dati precedenti. Mostriamo che alta qualit&agrave; proteomics dati forniscono informazioni cruciali per emendare annotazione del genoma e confermano che molti predetto modelli gene. Siamo anche presenti proteotypic sperimentalmente identificati peptidi corrispondenti a circa il 50% dei modelli del gene d. melanogaster. Questa libreria dei peptidi proteotypic dovrebbe consentire veloce, mirato e quantitativa proteomic studi chiarire la biologia dei sistemi di questo organismo di modello.

Un catalogo di alta qualit&agrave; del proteoma melanogaster della drosofila.

&#x52D5;&#x7684;&#x751F;&#x4F53;&#x3078;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x60C5;&#x5831;&#x5909;&#x63DB;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x306F;&#x3001;&#x751F;&#x7269;&#x79D1;&#x5B66;&#x306E;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x8AB2;&#x984C;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x771F;&#x6838;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x306B;&#x5411;&#x3051;&#x3066;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306F;&#x3001;&#x5197;&#x9577; 498,000 &#x304B;&#x3089; 9,124 &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x304A;&#x3088;&#x3073; 72,281 &#x306E;&#x660E;&#x78BA;&#x306A;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30AD;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E; 63 &#xFF05; &#x3092;&#x30AB;&#x30BF;&#x30ED;&#x30B0;&#x5316;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x524D;&#x4F8B;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x9AD8;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0; &#x30AB;&#x30D0;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B8;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x3001;&#x591A;&#x6B21;&#x5143;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x5206;&#x753B;&#x3001;whereby &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x53CE;&#x96C6;&#x524D;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5C0E;&#x304B;&#x308C;&#x308B;&#x5206;&#x6790;&#x99C6;&#x52D5;&#x5B9F;&#x9A13;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30C9;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF; &#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x9054;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x79C1;&#x9054;&#x306F;&#x9AD8;&#x54C1;&#x8CEA;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9; &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF; &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30A2;&#x30CE;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x6539;&#x6B63;&#x3057;&#x3066;&#x591A;&#x304F;&#x304C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x30AD;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x7D04; 50 &#xFF05; &#x30DE;&#x30C3;&#x30C1;&#x30F3;&#x30B0;&#x5B58;&#x5728;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F; proteotypic &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA; proteotypic &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x9AD8;&#x901F;&#x3001;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x7D5E;&#x3063;&#x305F;&#x3001;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x7814;&#x7A76;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3053;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x89E3;&#x660E;&#x306B;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30AD;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x9AD8;&#x54C1;&#x8CEA;&#x30AB;&#x30BF;&#x30ED;&#x30B0;&#x3002;

&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xB3D9;&#xC801; &#xC0B4;&#xC544;&#xC788;&#xB294; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4;&#xC5D0; &#xAC8C;&#xB188; &#xC815;&#xBCF4; &#xBCC0;&#xD658; &#xB418;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC774;&#xD574; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADFC;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xB3C4;&#xC804; &#xC774;&#xB2E4;. &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xC774;&#xD574;&#xB97C; &#xD5A5;&#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC; 498,000 &#xC911;&#xBCF5;&#xC5D0;&#xC11C; 9,124 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; 72,281 &#xAC00;&#xC9C0; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC744; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD558; &#xC5EC; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; Drosophila melanogaster &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634;&#xC758; 63%&#xB97C; &#xCE74;&#xD0C8;&#xB85C;&#xADF8;. &#xC0D8;&#xD50C; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;, &#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; &#xC0DD; &#xD654; &#xD559;&#xC801; &#xBD84;&#xB958; &#xBC0F; &#xBD84;&#xC11D; &#xAE30;&#xBC18; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xD53C;&#xB4DC;&#xBC31; &#xB8E8;&#xD504;, &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC218;&#xC9D1; &#xC0AC;&#xC804; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC758; &#xD1B5;&#xACC4; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC778;&#xB3C4; &#xB41C;&#xB2E4; &#xADF8;&#xAC83;&#xC5D0; &#xC758;&#xD558;&#xC5EC; &#xACB0;&#xD569; &#xD558; &#xC5EC; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC804;&#xB840; &#xC5C6;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634; &#xBC94;&#xC704;&#xAC00; &#xB2EC;&#xC131; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB192;&#xC740;-&#xD488;&#xC9C8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xAC8C;&#xB188; &#xC8FC;&#xC11D; &#xC218;&#xC815; &#xD558; &#xACE0; &#xB9CE;&#xC740; &#xC608;&#xCE21; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD3A9; &#xD2F0;&#xB3C4; &#xD604;&#xC7AC; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; proteotypic &#xB4DC; &#xB514; melanogaster &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; &#xC57D; 50% &#xC77C;&#xCE58; &#xD558;&#xB294;. &#xC774; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC; proteotypic &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xC758; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xBE60;&#xB974;&#xACE0; &#xC815;&#xB7C9;&#xC801; proteomic &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294;&#xC774; &#xBAA8;&#xB378; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC744; &#xBA85;&#xB8CC; &#xD558; &#xAC8C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Drosophila melanogaster &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634;&#xC758; &#xACE0;&#xAE09; &#xCE74;&#xD0C8;&#xB85C;&#xADF8;.

Entender c&oacute;mo las prote&iacute;nas y sus redes de interacci&oacute;n compleja convierten la informaci&oacute;n gen&oacute;mica en un organismo vivo din&aacute;mico es un reto fundamental en ciencias biol&oacute;gicas. Como un paso importante hacia la comprensi&oacute;n de la biolog&iacute;a de sistemas de un complejo eucariotas, hemos catalogado 63% del predicho Drosophila melanogaster proteoma detectando 9.124 prote&iacute;nas de 498.000 redundante y 72.281 identificaciones distintas p&eacute;ptido. Esta cobertura sin precedentes de proteoma alta para un complejo eucariotas se logr&oacute; mediante la combinaci&oacute;n de diversidad de la muestra, fraccionamiento bioqu&iacute;mico multidimensional y bucles de retroalimentaci&oacute;n de experimentaci&oacute;n basadas en el an&aacute;lisis, por el que recopilaci&oacute;n de datos es guiada por el an&aacute;lisis estad&iacute;stico de datos previas. Mostramos que datos de prote&oacute;mica de alta calidad proporcionan informaci&oacute;n crucial para modificar la anotaci&oacute;n del genoma y confirmar que muchos predijeron modelos de gene. Nosotros tambi&eacute;n presente proteotypic experimentalmente identificado p&eacute;ptidos que aproximadamente el 50% de los modelos de gene D. melanogaster. Esta biblioteca de p&eacute;ptidos proteotypic deber&iacute;a permitir estudios prote&oacute;micos r&aacute;pido, objetivo y cuantitativo dilucidar la biolog&iacute;a de sistemas de este organismo modelo.

Un cat&aacute;logo de alta calidad del Drosophila melanogaster proteoma.

&#x7EBF;&#x866B;&#x81F3;&#x5C11;&#x662F;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#xFF0C;&#x6D41;&#x884C;&#x7684;&#x6A21;&#x578B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x57FA;&#x56E0;&#x4FDD;&#x5B88;&#x4E2D;&#x7EBF;&#x866B;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x751F;&#x6210;&#x53CA;&#x5176;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7684;&#x5168;&#x9762;&#x6E05;&#x5355;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6267;&#x884C;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x730E;&#x67AA;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x548C;&#x786E;&#x5B9A;&#x6240;&#x6709;&#x9884;&#x6D4B;&#x7EBF;&#x866B;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x4E00;&#x534A;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x3002;&#x8FD9;&#x4F7F;&#x6211;&#x4EEC;&#x80FD;&#x591F;&#x786E;&#x8BA4;&#x5EF6;&#x957F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6CE8;&#x91CA;&#xFF0C;&#x7EBF;&#x866B;&#x4E2D;, operons &#x89D2;&#x8272;&#x7279;&#x5F81;&#x548C; semiquantitatively &#x63A8;&#x65AD;&#x51FA;&#x6210;&#x5343;&#x4E0A;&#x4E07;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x4E30;&#x5EA6;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B21;&#x7ED9;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x77E5;&#x8BC6;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4FBF;&#x80FD;&#x591F;&#x6BD4;&#x8F83;&#x4E24;&#x4E2A;&#x52A8;&#x7269;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4; &#xFF08;&#x7EBF;&#x866B;&#x548C;&#x679C;&#x8747;&#xFF09;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0; metazoans orthologous &#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x4E30;&#x5EA6;&#x5173;&#x8054;&#x51FA;&#x8272;&#xFF0C;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x4E0E;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5185;&#x5BB9;&#x4E30;&#x5BCC;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x751F;&#x7269;&#x4F53;&#x5185;&#x6216;&#x6709;&#x673A;&#x4F53; &#xFF1B; &#x8DE8;&#x8A8A;&#x672C;&#x4E30;&#x5EA6;&#x86CB;&#x767D;&#x4E30;&#x5EA6;&#x6BD4;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5185;&#x5BB9;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x90E8;&#x5206;&#x62B5;&#x6D88;&#x4E86;&#x5728;&#x8FDB;&#x5316;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x53CD;&#x5BF9;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;

&#x79C0;&#x4E3D;&#x9690;&#x6746;&#x7EBF;&#x866B;&#x548C;&#x679C;&#x8747;&#x679C;&#x8747;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x529F;&#x80FD;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

The nematode Caenorhabditis elegans is a popular model system in genetics, not least because a majority of human disease genes are conserved in C. elegans. To generate a comprehensive inventory of its expressed proteome, we performed extensive shotgun proteomics and identified more than half of all predicted C. elegans proteins. This allowed us to confirm and extend genome annotations, characterize the role of operons in C. elegans, and semiquantitatively infer abundance levels for thousands of proteins. Furthermore, for the first time to our knowledge, we were able to compare two animal proteomes (C. elegans and Drosophila melanogaster). We found that the abundances of orthologous proteins in metazoans correlate remarkably well, better than protein abundance versus transcript abundance within each organism or transcript abundances across organisms; this suggests that changes in transcript abundance may have been partially offset during evolution by opposing changes in protein abundance.

Comparative functional analysis of the Caenorhabditis elegans and Drosophila melanogaster proteomes.

Le n&eacute;matode Caenorhabditis elegans est un syst&egrave;me de mod&egrave;le populaire en g&eacute;n&eacute;tique, pas moins parce que la majorit&eacute; des g&egrave;nes de maladies sont conserv&eacute;es chez c. elegans. Pour g&eacute;n&eacute;rer un inventaire complet de ses proteome exprim&eacute;e, nous avons effectu&eacute; vaste shotgun proteomics et identifi&eacute; plus de la moiti&eacute; des prot&eacute;ines de c. elegans tout pr&eacute;vu. Cela nous a permis de confirmer et prolonger les annotations du g&eacute;nome, caract&eacute;riser le r&ocirc;le des op&eacute;rons chez c. elegans et d&eacute;duire selon une m&eacute;thode semi-quantitative des niveaux d&#39;abondance pour les milliers de prot&eacute;ines. En outre, pour la premi&egrave;re fois &agrave; notre connaissance, nous avons pu comparer les deux proteomes animales (c. elegans et la drosophile). Nous avons constat&eacute; que l&#39;abondance des prot&eacute;ines orthologues de m&eacute;tazoaires corr&eacute;ler remarquablement bien, mieux que l&#39;abondance de la prot&eacute;ine par rapport &agrave; l&#39;abondance de la transcription au sein de chaque organisme ou abondance de transcription &agrave; travers des organismes ; Ceci sugg&egrave;re que les changements dans l&#39;abondance de la transcription peuvent ont &eacute;t&eacute; partiellement compens&eacute;s au cours de l&#39;&eacute;volution en s&#39;opposant &agrave; des changements dans l&#39;abondance de la prot&eacute;ine.

Analyse fonctionnelle comparative du Caenorhabditis elegans et Drosophila melanogaster prot&eacute;omes.

Der Fadenwurm Caenorhabditis Elegans ist ein popul&auml;res Modell-System in der Genetik, nicht zuletzt, weil eine Mehrheit der menschlichen Krankheit Gene sind in C. Elegans konserviert. Um einen umfassenden Bestand an seine ausdr&uuml;ckliche Proteome zu generieren, haben wir umfangreiche Schrotflinte Proteomics durchgef&uuml;hrt und identifiziert mehr als die H&auml;lfte aller vorhergesagten Proteine in C. Elegans. Dies erm&ouml;glichte uns best&auml;tigen und Genom-Anmerkungen zu verl&auml;ngern, charakterisieren die Rolle der Operone in C. Elegans und semiquantitatively ableiten F&uuml;lle R&uuml;ckst&auml;nden von Tausenden Proteinen. Zum ersten Mal nach unserem wissen konnten wir dar&uuml;ber hinaus zwei tierischen Proteome (C. Elegans und Drosophila Melanogaster) zu vergleichen. Wir fanden, dass die H&auml;ufigkeiten der Orthologous Proteine in Metazoen erstaunlich gut, besser als Protein &Uuml;berfluss versus Abschrift F&uuml;lle innerhalb jeder Organismus oder Abschrift H&auml;ufigkeiten &uuml;ber Organismen korrelieren; Dies deutet darauf hin, dass &Auml;nderungen im Transkript &Uuml;berfluss w&auml;hrend Evolution teilweise wurden haben k&ouml;nnen durch gegen &Auml;nderungen im Protein-&Uuml;berfluss.

Vergleichende funktionale Analyse der Fadenwurm Caenorhabditis Elegans und Drosophila Melanogaster Proteome.

Il nematode Caenorhabditis elegans &egrave; un sistema di modello popolare in genetica, non da ultimo perch&eacute; la maggioranza dei geni malattia umana sono conservate in c. elegans. Per generare un inventario completo del relativo proteome espresso, abbiamo eseguito vasto shotgun proteomics e identificato oltre la met&agrave; delle proteine di c. elegans tutto previsto. Questo ci ha permesso di confermare ed estendere le annotazioni del genoma, caratterizzano il ruolo di operoni in c. elegans e sostanza dedurre livelli di abbondanza per le migliaia di proteine. Inoltre, per la prima volta a nostra conoscenza, siamo stati in grado di confrontare due animali ai proteomi (c. elegans e Drosophila melanogaster). Abbiamo trovato che l&#39;abbondanza di proteine orthologous nei metazoi correlazione molto bene, meglio di abbondanza di proteine versus trascrizione abbondanza all&#39;interno di ciascun organismo o abbondanza di trascrizione attraverso organismi; Questo suggerisce che cambiamenti nell&#39;abbondanza di trascrizione possono avere stato parzialmente compensate durante l&#39;evoluzione opponendosi cambiamenti nell&#39;abbondanza di proteine.

Analisi funzionale comparativa del Caenorhabditis elegans e Drosophila melanogaster ai proteomi.

&#x3072;&#x3068;&#x75BE;&#x60A3;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5927;&#x534A;&#x304C;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x306E;&#x3067;&#x7DDA;&#x866B;&#x306B;&#x7DDA;&#x866B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x306E;&#x4EBA;&#x6C17;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x30B7;&#x30E7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30AC;&#x30F3;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x5B9F;&#x884C;&#x3057;&#x3001;&#x86CB;&#x767D;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x7DDA;&#x866B;&#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x6CE8;&#x91C8;&#x3092;&#x62E1;&#x5F35;&#x3001;C. elegans &#x306E;&#x30AA;&#x30DA;&#x30ED;&#x30F3;&#x69CB;&#x6210;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x3001;&#x5316;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x4F55;&#x5343;&#x3082;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x63A8;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x77E5;&#x308B;&#x9650;&#x308A;&#x521D;&#x3081;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005; 2 &#x3064;&#x306E;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0; &#xFF08;&#x7DDA;&#x866B;&#x3068;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#xFF09; &#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x3002;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0; &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5F8C;&#x751F;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x5143;&#x7D20;&#x5B58;&#x5728;&#x5EA6;&#x306F;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x3088;&#x304F;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x5404;&#x6709;&#x6A5F;&#x4F53;&#x5185;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x5143;&#x7D20;&#x5B58;&#x5728;&#x5EA6;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x5BFE;&#x3088;&#x308A;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x3092;&#x767A;&#x898B;;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x306E;&#x8C4A;&#x304B;&#x3055;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306B;&#x9032;&#x5316;&#x4E2D;&#x306B;&#x5909;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306B;&#x53CD;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x76F8;&#x6BBA;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x304D;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7DDA;&#x866B;&#x3068;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30AD;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x89E3;&#x6790;&#x3002;

&#xC120; &#xCDA9; &#xB958; Caenorhabditis elegans &#xC778;&#xAC04; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC740; C. elegans&#xC5D0; &#xBCF4;&#xC874; &#xD558;&#xAE30; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC801;&#xC5B4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC804;&#xD559;, &#xC778;&#xAE30; &#xBAA8;&#xB378; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634;&#xC758; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; &#xC778;&#xBCA4;&#xD1A0;&#xB9AC;&#xB97C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC0F7;&#xAC74; proteomics &#xC218;&#xD589; &#xD558; &#xACE0; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; C. elegans &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC808;&#xBC18; &#xC774;&#xC0C1;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4;. &#xC774; &#xD1B5;&#xD574; &#xD655;&#xC778; &#xD558; &#xACE0; &#xAC8C;&#xB188; &#xC8FC;&#xC11D; &#xD655;&#xC7A5;, C. elegans&#xC5D0; operons&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC758; &#xD2B9;&#xC131; &#xBC0F; semiquantitatively &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC218;&#xCC9C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C; &#xB808;&#xBCA8;&#xC744; &#xC720;&#xCD94;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC9C0;&#xC2DD;&#xC5D0; &#xCC98;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB450; &#xB3D9;&#xBB3C; proteomes (C. elegans&#xC640; Drosophila melanogaster)&#xB97C; &#xBE44;&#xAD50;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xAC01; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0AC;&#xBCF8; &#xD48D;&#xBD80; &#xB610;&#xB294; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4;; &#xAC78;&#xCCD0; &#xC0AC;&#xBCF8; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xB300; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD48D;&#xBD80; &#xBCF4;&#xB2E4; metazoans&#xC5D0;&#xC11C; orthologous &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xB108;&#xBB34;&#xB098; &#xC798; &#xC0C1;&#xAD00;&#xB97C; &#xCC3E;&#xC558;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xD654; &#xC788;&#xB2E4; &#xB418;&#xC5B4; &#xBD80;&#xBD84;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC624;&#xD504;&#xC14B; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC9C4;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xBC18;&#xB300; &#xD558; &#xC5EC; &#xB098;&#xC654;&#xB2E4;.

Caenorhabditis elegans Drosophila melanogaster proteomes&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBD84;&#xC11D;.

El nematodo Caenorhabditis elegans es un sistema de modelo popular en gen&eacute;tica, no menos importante porque la mayor&iacute;a de los genes de enfermedades humanas se conservan en C. elegans. Para generar un inventario de su proteoma expresada, realizamos escopeta extensa prote&oacute;mica y hab&iacute;a identificado m&aacute;s de la mitad de todo previstas Caenorhabditis elegans prote&iacute;nas. Esto permiti&oacute; confirmar y ampliar las anotaciones del genoma, caracterizar el papel de operones en C. elegans y semiquantitatively inferir niveles de abundancia para miles de prote&iacute;nas. Adem&aacute;s, por primera vez a nuestro conocimiento, hemos sido capaces de comparar dos animales proteomas (C. elegans y Drosophila melanogaster). Encontramos que la abundancia de prote&iacute;nas orthologous en metazoos correlaciona bastante bien, mejor que la abundancia de prote&iacute;na versus abundancia de transcripci&oacute;n dentro de cada organismo o abundancia de transcripci&oacute;n a trav&eacute;s de organismos; Esto sugiere que cambios en la abundancia de transcripci&oacute;n pueden han sido parcialmente compensados durante la evoluci&oacute;n por oponerse a los cambios en la abundancia de prote&iacute;na.

An&aacute;lisis comparativo funcional del Caenorhabditis elegans y Drosophila melanogaster proteomas.

&#x81EA;&#x566C;&#x662F;&#x6EB6;&#x9176;&#x4F53;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x9000;&#x5316;&#x8FDB;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x5B58;&#x671F;&#x95F4;&#x517B;&#x5206;&#x9650;&#x5236;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x8FC7;&#x5EA6;&#x81EA;&#x566C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x3002;&#x679C;&#x8747;&#xFF0C;&#x81EA;&#x566C;&#x5219;&#x89C4;&#x7BA1;&#x8425;&#x517B;&#x3001; &#x8377;&#x5C14;&#x8499;&#x548C;&#x53D1;&#x80B2;&#x51E0;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5305;&#x62EC;&#x8102;&#x80AA;&#x4F53;&#xFF0C;&#x8425;&#x517B;&#x8D2E;&#x5B58;&#x5668;&#x5B98;&#x4E2D;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x65B9;&#x6CD5;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x9965;&#x997F;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x8102;&#x80AA;&#x679C;&#x8747;&#x4F53;&#x5185;&#x81EA;&#x566C;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528; cICAT &#x6807;&#x8BB0;&#x548C;&#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x76F8;&#x6BD4;&#x8981;&#x997F;&#x53D1;&#x673A;&#x6784;&#x6B63;&#x5E38;&#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x3002;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E;&#x81EA;&#x566C;&#x5728;&#x8102;&#x80AA;&#x673A;&#x6784;&#x5404;&#x81EA;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x6709;&#x7F3A;&#x9677;&#x57FA;&#x56E0;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;Desat1 &#x4E2D;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5BF9;&#x8102;&#x8D28;&#x53BB;&#x9971;&#x548C;&#x9176;&#x8FDB;&#x884C;&#x7F16;&#x7801;&#x3002;Desat1 &#x7A81;&#x53D8;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E0D;&#x80FD;&#x8BF1;&#x4F7F;&#x9965;&#x997F;&#x65F6;&#x81EA;&#x566C;&#x3002;Desat1 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x517B;&#x5206;&#x67AF;&#x7AED;&#x540E;&#x5BF9;&#x81EA;&#x566C;&#x7ED3;&#x6784;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x548C;&#x98DE;&#x53D1;&#x5C55;&#x9700;&#x8981;&#x3002;&#x8840;&#x8102;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A; Desat1 &#x8C03;&#x8282;&#x8840;&#x8102;&#x7684;&#x679C;&#x8747;&#x7684;&#x7EC4;&#x6210;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE; Desat1 &#x65BD;&#x52A0;&#x5176;&#x5728;&#x81EA;&#x566C;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7;&#x63A7;&#x5236;&#x8102;&#x8D28;&#x5408;&#x6210;&#x548C;/&#x6216;&#x4FE1;&#x53F7;&#x81EA;&#x566C;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x5FC5;&#x8981;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;

&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x548C;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x5206;&#x6790;&#x6807;&#x8BC6;&#x4E3A; Desat1 &#x5728;&#x679C;&#x8747;&#x4E2D;&#x9965;&#x997F;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x7684;&#x81EA;&#x566C;&#x8102;&#x53BB;&#x9971;&#x548C;&#x9176;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

Autophagy is a lysosomal-mediated degradation process that promotes cell survival during nutrient-limiting conditions. However, excessive autophagy results in cell death. In Drosophila, autophagy is regulated nutritionally, hormonally and developmentally in several tissues, including the fat body, a nutrient-storage organ. Here we use a proteomics approach to identify components of starvation-induced autophagic responses in the Drosophila fat body. Using cICAT labeling and mass spectrometry, differences in protein expression levels of normal compared to starved fat bodies were determined. Candidates were analyzed genetically for their involvement in autophagy in fat bodies deficient for the respective genes. One of these genes, Desat1, encodes a lipid desaturase. Desat1 mutant cells fail to induce autophagy upon starvation. The desat1 protein localizes to autophagic structures after nutrient depletion and is required for fly development. Lipid analyses revealed that Desat1 regulates the composition of lipids in Drosophila. We propose that Desat1 exerts its role in autophagy by controlling lipid biosynthesis and/or signaling necessary for autophagic responses.

A combined proteomic and genetic analysis identifies a role for the lipid desaturase Desat1 in starvation-induced autophagy in Drosophila.

Autophagie est un processus de d&eacute;gradation lysosomale m&eacute;diation favorisant la survie des cellules au cours de l&#39;&eacute;l&eacute;ment nutritif limitant des conditions. Cependant, autophagie excessive entra&icirc;ne la mort cellulaire. Chez la drosophile, autophagie est r&eacute;glement&eacute; sur le plan nutritionnel, hormonale et d&eacute;veloppemental dans plusieurs tissus, y compris le tissu adipeux, un organe de stockage des &eacute;l&eacute;ments nutritifs. Ici, nous utilisons une approche prot&eacute;omique pour identifier les composants des r&eacute;ponses d&#39;autophagie induite par la famine dans le corps gras de drosophile. Diff&eacute;rences dans les niveaux d&#39;expression de prot&eacute;ine de la normale par rapport aux affam&eacute;s de corps gras &agrave; l&#39;aide de cICAT &eacute;tiquetage et spectrom&eacute;trie de masse, ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es. Les candidats ont &eacute;t&eacute; analys&eacute;s g&eacute;n&eacute;tiquement pour leur implication dans l&#39;autophagie dans le corps gras d&eacute;ficients pour les g&egrave;nes respectifs. Un de ces g&egrave;nes, Desat1, encode une d&eacute;saturase lipidique. Desat1 cellules mutantes ne parviennent pas &agrave; induire l&#39;autophagie &agrave; la famine. La prot&eacute;ine desat1 localise aux structures autophagiques apr&egrave;s &eacute;puisement des nutriments et est n&eacute;cessaire pour le d&eacute;veloppement de mouche. Lipides analyses ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; que Desat1 r&eacute;glemente la composition des lipides chez la drosophile. Nous proposons que Desat1 exerce son r&ocirc;le dans l&#39;autophagie de contr&ocirc;ler la biosynth&egrave;se des lipides et/ou de signalisation n&eacute;cessaires pour autophagiques r&eacute;ponses.

Un combin&eacute; prot&eacute;omiques et analyse g&eacute;n&eacute;tique identifie un r&ocirc;le pour le lipides d&eacute;saturase Desat1 dans autophagie induite par le je&ucirc;ne chez la drosophile.

Autophagy ist eine lysosomale-vermittelte Abbauprozess, die Zelle &uuml;berleben w&auml;hrend Begrenzung der N&auml;hrstoff f&ouml;rdert Bedingungen. Autophagie f&uuml;hrt jedoch zu Zellentod. Drosophila Autophagy ern&auml;hrungsphysiologisch, hormonell und entwicklungspolitisch in verschiedenen Geweben, einschlie&szlig;lich Fett K&ouml;rpers, einen N&auml;hrstoff-Speicher-Orgel reguliert. Hier verwenden wir einen Proteomik-Ansatz Komponenten der Hunger-induzierte autophagic Reaktionen im K&ouml;rper Fett Drosophila. Mit cICAT beschriften und Massenspektrometrie, wurden Unterschiede im Protein Ausdruck Normal im Vergleich zu Fett K&ouml;rper verhungert bestimmt. Kandidaten wurden wegen ihrer Beteiligung an Autophagy in Fett K&ouml;rper mangelhaft f&uuml;r die jeweiligen Gene genetisch analysiert. Eines dieser Gene, Desat1, codiert ein Lipid-Desaturase. Desat1 mutierte Zellen nicht Autophagy auf Hunger zu induzieren. Das desat1-Protein nach N&auml;hrstoffen Ersch&ouml;pfung autophagic Strukturen lokalisiert und f&uuml;r fliegen Entwicklung erforderlich ist. Lipid-Analysen ergaben, dass Desat1 die Zusammensetzung der Lipide in Drosophila regelt. Wir schlagen vor, Desat1 seine Rolle in Autophagy &uuml;bt durch Steuerung von Lipid-Biosynthese und/oder Signalisierung f&uuml;r autophagic Antworten notwendig.

Eine kombinierte Proteomic und genetische Analyse identifiziert eine Rolle f&uuml;r die Lipid-Desaturase Desat1 in Hunger-induzierte Autophagy in Drosophila.

Autophagy &egrave; un processo di degradazione lisosomiale-mediata che promuove la sopravvivenza delle cellule durante la sostanza nutriente-limitando le condizioni. Tuttavia, un&#39;eccessiva autophagy risultati nella morte delle cellule. In Drosophila, autophagy &egrave; regolata dal punto di vista nutrizionale, ormonale e inerente allo sviluppo in diversi tessuti, compreso il corpo grasso, un organo di nutrienti-archiviazione. Qui usiamo un approccio di proteomica per identificare i componenti di risposte autophagic fame indotta nel corpo grasso della drosofila. Le differenze nei livelli di espressione della proteina di normale rispetto ai corpi grassi di fame utilizzando cICAT etichettatura e spettrometria di massa, sono state determinate. I candidati sono stati analizzati geneticamente per il loro coinvolgimento in autophagy in corpi grassi carenti per i rispettivi geni. Uno di questi geni, Desat1, codifica una desaturasi lipidico. Desat1 cellule mutanti non riescono a indurre autophagy sulla fame. La proteina desat1 si localizza alle strutture autophagic dopo esaurimento dei nutrienti ed &egrave; necessaria per lo sviluppo di volo. Analisi dei lipidi ha rivelato che Desat1 regola la composizione dei lipidi in drosofila. Proponiamo che Desat1 esercita il suo ruolo in autophagy dal controllo della biosintesi dei lipidi e/o segnalazione necessarie per risposte autophagic.

Un combinato proteomic e analisi genetica identifica un ruolo per i lipidi desaturasi Desat1 in autophagy indotta da inedia in drosofila.

&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x3067;&#x3059;&#x6804;&#x990A;&#x5236;&#x9650;&#x6642;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x751F;&#x5B58;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BD;&#x30BE;&#x30FC;&#x30E0;&#x5A92;&#x4ECB;&#x52A3;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x904E;&#x5EA6;&#x306E;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x7D30;&#x80DE;&#x6B7B;&#x3092;&#x7D50;&#x679C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x3067;&#x3001;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x3001;&#x6804;&#x990A;&#x3001;&#x30DB;&#x30EB;&#x30E2;&#x30F3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x767A;&#x9054;&#x3092;&#x6804;&#x990A;&#x8CAF;&#x8535;&#x5668;&#x5B98;&#x8102;&#x80AA;&#x4F53;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3067;&#x898F;&#x5236;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x98E2;&#x9913;&#x306B;&#x3088;&#x308B; autophagic &#x5FDC;&#x7B54;&#x3067;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x8102;&#x80AA;&#x4F53;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x624B;&#x6CD5;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;CICAT &#x30E9;&#x30D9;&#x30EB;&#x4ED8;&#x3051;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x98E2;&#x3048;&#x305F;&#x8102;&#x80AA;&#x4F53;&#x306B;&#x6BD4;&#x3079;&#x3066;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5019;&#x88DC;&#x8005;&#x3078;&#x306E;&#x95A2;&#x4E0E;&#x306E;&#x8102;&#x80AA;&#x4F53;&#x306E;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x6B20;&#x640D;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x3067;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;.&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;, Desat1 &#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x8102;&#x8CEA;&#x4E0D;&#x98FD;&#x548C;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Desat1 &#x5909;&#x7570;&#x7D30;&#x80DE;&#x98E2;&#x9913;&#x306B;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3057;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;Desat1 &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x6804;&#x990A;&#x67AF;&#x6E07;&#x5F8C;&#x306B; autophagic &#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BA;&#x3057;&#x3001;&#x30D5;&#x30E9;&#x30A4;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x8102;&#x8CEA;&#x89E3;&#x6790; Desat1 &#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8102;&#x8CEA;&#x7D44;&#x6210;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x8102;&#x8CEA;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x304A;&#x3088;&#x3073;/&#x307E;&#x305F;&#x306F; autophagic &#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0; Desat1 &#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x305D;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x767A;&#x63EE;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8907;&#x5408;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x907A;&#x4F1D;&#x89E3;&#x6790;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x306E;&#x98E2;&#x9913;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30B8;&#x30FC;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8102;&#x8CEA;&#x30C7;&#x30B5;&#x30C1;&#x30E5;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC; Desat1 &#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Autophagy&#xC740; &#xC601;&#xC591;&#xC18C;&#xB97C; &#xC81C;&#xD55C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xC874; &#xCD09;&#xC9C4; &#xC800;&#xD558; lysosomal &#xC911;&#xC7AC; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4; &#xC870;&#xAC74;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xACFC;&#xB3C4; &#xD55C; autophagy &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FD;&#xC74C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; autophagy &#xB6B1;&#xB6B1;&#xD55C; &#xBAB8;, &#xC601;&#xC591;&#xC18C; &#xC800;&#xC7A5; &#xAE30;&#xAD00; &#xB4F1; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xC601;&#xC591;, hormonally &#xBC0F; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xD1B5;&#xC81C; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; proteomics &#xC811;&#xADFC; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC; &#xC9C0;&#xBC29; &#xBCF8;&#xBB38;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC544; &#xC720;&#xB3C4; autophagic &#xC751;&#xB2F5;&#xC758; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD655;&#xC778; &#xD558;. CICAT &#xB77C;&#xBCA8; &#xBC0F; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, &#xC9C0;&#xBC29; &#xC2DC;&#xCCB4;&#xB97C; &#xAD76; &#xC5B4;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xC815;&#xC0C1;&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC2DD; &#xC218;&#xC900; &#xCC28;&#xC774; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD6C4;&#xBCF4;&#xC790;&#xB294; &#xD574;&#xB2F9; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBD80;&#xC871; &#xD55C; &#xC9C0;&#xBC29; &#xC2DC;&#xCCB4;&#xC5D0;&#xC11C; autophagy&#xC5D0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xCC38;&#xC5EC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD558;&#xB098; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; Desat1, &#xC9C0;&#xC9C8; desaturase&#xB97C; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Desat1 &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC138;&#xD3EC; &#xAE30;&#xC544;&#xB97C; &#xB530;&#xB77C; autophagy &#xC720;&#xB3C4; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Desat1 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xC601;&#xC591;&#xC18C; &#xACE0;&#xAC08; &#xD6C4; autophagic &#xAD6C;&#xC870; localizes &#xD50C;&#xB77C;&#xC774; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD544;&#xC694;. &#xC9C0;&#xC9C8; &#xBD84;&#xC11D; Desat1 &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C0;&#xC9C8; &#xC131;&#xBD84; &#xC870;&#xC808; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. Desat1 &#xC9C0;&#xC9C8; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131; &#xC81C;&#xC5B4; &#xBC0F; autophagic &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; autophagy&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC81C;&#xC548; &#xD55C;&#xB2E4;.

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D;&#xACFC; &#xACB0;&#xD569;&#xB41C; proteomic &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; autophagy &#xAE30;&#xC544; &#xC720;&#xB3C4;&#xC5D0; &#xC9C0;&#xC9C8; desaturase desat1&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Autofagia es un proceso de degradaci&oacute;n lisosomal-mediada que promueve la supervivencia de la c&eacute;lula durante la limitaci&oacute;n de nutrientes condiciones. Sin embargo, autofagia excesiva resulta en la muerte celular. En Drosophila, autofagia es regulada nutricionalmente, hormonal y desarrollo en varios tejidos, incluyendo la grasa corporal, un &oacute;rgano de almacenamiento de nutrientes. Aqu&iacute; utilizamos un enfoque de la prote&oacute;mica para identificar los componentes de las respuestas de autofagia inducida por inanici&oacute;n en el cuerpo de la grasa de Drosophila. Usando cICAT etiquetado y espectrometr&iacute;a de masas, se determinaron las diferencias en los niveles de expresi&oacute;n de la prote&iacute;na normal en comparaci&oacute;n con cuerpos grasos de hambre. Los candidatos fueron analizados gen&eacute;ticamente por su participaci&oacute;n en la autofagia en cuerpos grasos deficientes para los genes respectivos. Uno de estos genes, Desat1, codifica una desaturasa de l&iacute;pidos. Desat1 las c&eacute;lulas mutantes no inducen la autofagia al hambre. La prote&iacute;na desat1 se localiza a estructuras autofagia despu&eacute;s del agotamiento de nutriente y se requiere para el desarrollo de la mosca. L&iacute;pidos los an&aacute;lisis revelaron que Desat1 regula la composici&oacute;n de los l&iacute;pidos en Drosophila. Proponemos que el Desat1 ejerce su papel en la autofagia por controlar la bios&iacute;ntesis de l&iacute;pidos y/o se&ntilde;alizaci&oacute;n necesaria para las respuestas de la autofagia.

Un combinado de la prote&oacute;mica y an&aacute;lisis gen&eacute;tico identifica un papel para la desaturasa de l&iacute;pidos Desat1 inducida por inanici&oacute;n autofagia en Drosophila.

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&#x9274;&#x5B9A;&#x53CA;&#x5176;&#x529F;&#x80FD; N &#x8EAB;&#x60A3;&#x4E59;&#x9170;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x5728;&#x679C;&#x8747;&#x4E2D;&#x3002;

Protein modifications play a major role for most biological processes in living organisms. Amino-terminal acetylation of proteins is a common modification found throughout the tree of life: the N-terminus of a nascent polypeptide chain becomes co-translationally acetylated, often after the removal of the initiating methionine residue. While the enzymes and protein complexes involved in these processes have been extensively studied, only little is known about the biological function of such N-terminal modification events. To identify common principles of N-terminal acetylation, we analyzed the amino-terminal peptides from proteins extracted from Drosophila Kc167 cells. We detected more than 1,200 mature protein N-termini and could show that N-terminal acetylation occurs in insects with a similar frequency as in humans. As the sole true determinant for N-terminal acetylation we could extract the (X)PX rule that indicates the prevention of acetylation under all circumstances. We could show that this rule can be used to genetically engineer a protein to study the biological relevance of the presence or absence of an acetyl group, thereby generating a generic assay to probe the functional importance of N-terminal acetylation. We applied the assay by expressing mutated proteins as transgenes in cell lines and in flies. Here, we present a straightforward strategy to systematically study the functional relevance of N-terminal acetylations in cells and whole organisms. Since the (X)PX rule seems to be of general validity in lower as well as higher eukaryotes, we propose that it can be used to study the function of N-terminal acetylation in all species.

Identification and functional characterization of N-terminally acetylated proteins in Drosophila melanogaster.

Modifications prot&eacute;iques jouent un r&ocirc;le majeur pour les processus biologiques plus dans les organismes vivants. Ac&eacute;tylation d&#39;amin&eacute;-borne de prot&eacute;ines est une variante courante trouv&eacute;e tout au long de l&#39;arbre de vie: N-terminal d&#39;une cha&icirc;ne polypeptidique naissante devient prot&eacute;ines ac&eacute;tyl&eacute;, souvent apr&egrave;s l&#39;enl&egrave;vement des r&eacute;sidus m&eacute;thionine initiatrice. Alors que les enzymes et les prot&eacute;ines complexes impliqu&eacute;s dans ces processus ont &eacute;t&eacute; intensivement &eacute;tudi&eacute;s, seulement on conna&icirc;t mal la fonction biologique de tels &eacute;v&eacute;nements de modification de N-terminal. Pour identifier les principes communs d&#39;ac&eacute;tylation de N-terminal, nous avons analys&eacute; les peptides amino-terminale de prot&eacute;ines extraites des cellules Kc167 de la drosophile. Nous avons d&eacute;tect&eacute; plus de 1 200 mature prot&eacute;ine N-termini et pouvait montrer que l&#39;ac&eacute;tylation N-terminal se produit chez les insectes avec une fr&eacute;quence similaire comme chez les humains. Comme le seul vrai d&eacute;terminant pour l&#39;ac&eacute;tylation N-terminal, nous pouvions extraire le (X) r&egrave;gle PX qui indique la pr&eacute;vention de l&#39;ac&eacute;tylation en toutes circonstances. Nous avons pu montrer que cette r&egrave;gle permet &agrave; l&#39;ing&eacute;nieur g&eacute;n&eacute;tiquement une prot&eacute;ine afin d&#39;&eacute;tudier la pertinence biologique de la pr&eacute;sence ou l&#39;absence d&#39;un groupe ac&eacute;tyle, g&eacute;n&eacute;rant ainsi un test g&eacute;n&eacute;rique pour sonder l&#39;importance fonctionnelle de l&#39;ac&eacute;tylation N-terminale. Nous avons appliqu&eacute; le test en exprimant des prot&eacute;ines mut&eacute;es comme des transg&egrave;nes dans les lign&eacute;es cellulaires et chez les mouches. Nous pr&eacute;sentons ici une strat&eacute;gie simple pour &eacute;tudier syst&eacute;matiquement la pertinence fonctionnelle des investigu&eacute; N-terminale dans des cellules et des organismes entiers. Depuis le (X) PX r&egrave;gle ne semble &ecirc;tre d&#39;une validit&eacute; g&eacute;n&eacute;rale chez les eucaryotes inf&eacute;rieurs comme sup&eacute;rieurs, nous proposons qu&#39;il peut &ecirc;tre utilis&eacute; pour &eacute;tudier la fonction d&#39;ac&eacute;tylation N-terminale chez toutes les esp&egrave;ces.

Identification et caract&eacute;risation fonctionnelle des N-terminale ac&eacute;tyl&eacute; proteins in Drosophila melanogaster.

Protein-Modifikationen spielen eine wichtige Rolle f&uuml;r die biologischen Prozesse in lebenden Organismen. Amino-Terminal Acetylierung von Proteinen ist eine gemeinsame &Auml;nderung in den Baum des Lebens gefunden: der N-Terminus einer Polypeptid-Kette wird co-translationally acetylierte, oft nach dem Entfernen der initiierenden Methionin-R&uuml;ckstand. W&auml;hrend die Enzyme und Proteinkomplexe, die an diesen Prozessen beteiligt ausgiebig studiert haben, ist nur wenig bekannt &uuml;ber die biologische Funktion von solchen N-Terminal-&Auml;nderung-Veranstaltungen. Um gemeinsame Grunds&auml;tze der N-terminalen Acetylierung zu identifizieren, analysieren wir die amino-Terminal-Peptide aus Proteinen aus Drosophila Kc167 Zellen extrahiert. Wir erkannten mehr als 1.200 &auml;ltere Protein N-Termini und konnte zeigen, dass die N-terminalen Acetylierung in Insekten mit einer &auml;hnlichen Frequenz wie in den Menschen auftritt. Als die einzige wahre Determinante f&uuml;r N-terminalen Acetylierung konnten wir das (X) extrahieren PX-Regel, die angibt, die Verhinderung der Acetylierung unter allen Umst&auml;nden. Wir konnten zeigen, dass diese Regel verwendet werden kann, zu genetisch Ingenieur ein Protein, das die biologische Relevanz der Anwesenheit oder Abwesenheit einer Acetyl-Gruppe, damit einen eine generische Assay um die funktionelle Bedeutung des N-terminalen Acetylierung Pr&uuml;fpunkt zu studieren. Wir angewandt Assays zum Ausdruck bringen mutierte Proteine als transgene in Zelllinien und fliegen. Hier pr&auml;sentieren wir eine einfache Strategie, um systematisch die funktionelle Relevanz der N-terminalen Wirkstoff in Zellen und ganze Organismen zu studieren. Seit der (X) PX-Regel scheint der allgemeine G&uuml;ltigkeit bei niedriger sowie h&ouml;herer Eukaryoten, schlagen wir vor, es verwendet werden kann, um die Funktion der N-terminalen Acetylierung in allen Arten zu studieren.

Identifizierung und Funktionelle Charakterisierung von N-unheilbar acetylierte Proteine in Drosophila Melanogaster.

Modifiche di proteine svolgono un ruolo importante per i processi biologici pi&ugrave; in organismi viventi. Amino-terminale acetilazione delle proteine &egrave; una modifica comune trovata in tutto l&#39;albero della vita: il N-terminale di una catena polipeptidica nascente diventa co-translationally acetilato, spesso dopo la rimozione del residuo di metionina avvio. Mentre gli enzimi e complessi di proteine coinvolte in questi processi sono state ampiamente studiate, solo poco si sa circa la funzione biologica di tali eventi di modifica del N-terminale. Per identificare i principi comuni di acetilazione del N-terminale, abbiamo analizzato i peptidi amminico-terminale da proteine estratte da cellule Kc167 di Drosophila. Abbiamo rilevato pi&ugrave; di 1.200 maturo proteina N-termini e potrebbe mostrare che l&#39;acetilazione del N-terminale si verifica negli insetti con una frequenza simile come in esseri umani. Come l&#39;unico vero determinante per acetilazione del N-terminale noi potremmo estrarre il (X) regola PX che indica la prevenzione di acetilazione in tutte le circostanze. Noi potremmo mostrare che questa regola pu&ograve; essere utilizzata a geneticamente assistente tecnico una proteina per studiare la rilevanza biologica della presenza o assenza di un gruppo acetile, generando quindi un test generico per l&#39;importanza funzionale di acetilazione del N-terminale della sonda. Abbiamo applicato il dosaggio esprimendo proteine mutate come transgeni in linee cellulari e in mosche. Qui, vi presentiamo una semplice strategia per studiare sistematicamente la rilevanza funzionale della acetylations N-terminale in cellule e organismi interi. Poich&eacute; la (X) regola PX sembra essere di validit&agrave; generale negli eucarioti inferiori, nonch&eacute; maggiore, proponiamo che pu&ograve; essere utilizzato per studiare la funzione di acetilazione del N-terminale in tutte le specie.

Identificazione e caratterizzazione funzionale di N-terminale acetilato proteine in Drosophila melanogaster.

&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x4FEE;&#x6B63;&#x306F;&#x3001;&#x751F;&#x304D;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x6709;&#x6A5F;&#x4F53;&#x3067;&#x6700;&#x3082;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE; &#x30BF;&#x30FC;&#x30DF;&#x30CA;&#x30EB; &#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x751F;&#x547D;&#x306E;&#x6728;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x305F;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x4FEE;&#x6B63;&#x3067;&#x3059;&#xFF1A; &#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x30DD;&#x30EA;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x9396;&#x306E; N &#x672B;&#x7AEF;&#x306F; co-translationally&#x3001;&#x767A;&#x4FE1;&#x5074;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30AA;&#x30CB;&#x30F3;&#x6B8B;&#x57FA;&#x306E;&#x9664;&#x53BB;&#x5F8C;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x9175;&#x7D20;&#x3068;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x304C;&#x5E83;&#x304F;&#x7814;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x5C11;&#x3057;&#x3060;&#x3051;&#x305D;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A; N &#x30BF;&#x30FC;&#x30DF;&#x30CA;&#x30EB;&#x5909;&#x66F4;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x539F;&#x5247;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8; Kc167 &#x7D30;&#x80DE;&#x304B;&#x3089;&#x62BD;&#x51FA;&#x3057;&#x305F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x672B;&#x7AEF;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x3088;&#x308A;&#x3082; 1,200 &#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA; n-&#x672B;&#x7AEF;&#x3068;&#x4E2D;&#x9AD8;&#x5E74; N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x304C;&#x6606;&#x866B;&#x3067;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x983B;&#x5EA6;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x3002;N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x552F;&#x4E00;&#x306E;&#x771F;&#x306E;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x8981;&#x56E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066; (X) &#x3092;&#x62BD;&#x51FA;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x72B6;&#x6CC1;&#x4E0B;&#x3067;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x4E88;&#x9632;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059; PX &#x30EB;&#x30FC;&#x30EB;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x95A2;&#x9023;&#x6027;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x308A; N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x306B;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF; &#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x57FA;&#x306E;&#x4E0D;&#x5728;&#x3092;&#x52C9;&#x5F37;&#x3059;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B8;&#x30CB;&#x30A2;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x30EB;&#x30FC;&#x30EB;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; transgenes &#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x30CF;&#x30A8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5909;&#x7570;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x8868;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x9069;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x3001;N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE;&#x30FB;&#x500B;&#x4F53;&#x3067;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x95A2;&#x9023;&#x6027;&#x3092;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7684;&#x306B;&#x52C9;&#x5F37;&#x3059;&#x308B;&#x7C21;&#x5358;&#x306A;&#x6226;&#x7565;&#x3092;&#x7D39;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;(X) &#x4EE5;&#x6765; PX &#x30EB;&#x30FC;&#x30EB;&#x304C;&#x4F4E;&#x3044;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x3044;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x59A5;&#x5F53;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3088;&#x3046;, &#x305D;&#x308C;&#x306F; N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x540C;&#x5B9A;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x89E3;&#x6790;&#x306E; N &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC815; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC0DD;&#xD65C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; acetylation&#xC740; &#xC0DD;&#xBA85;&#xC758; &#xB098;&#xBB34;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xBC1C;&#xACAC; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC218;&#xC815;: &#xC2DC;&#xC791; &#xBA54;&#xD2F0;&#xC624;&#xB2CC; &#xCC0C; &#xAEBC; &#xAE30;&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD6C4; &#xC885;&#xC885; &#xCD08;&#xAE30; polypeptide &#xC0AC;&#xC2AC;&#xC758; N &#xB9D0;&#xB2E8; acetylated co-translationally &#xB41C;&#xB2E4;. &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD6A8;&#xC18C; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB2E8;&#xC9C0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xB2E8;&#xC9C0; &#xC57D;&#xAC04; N &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xC218;&#xC815; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xB4F1;&#xC758; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. N &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; acetylation&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC6D0;&#xCE59;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xCD08;&#xD30C;&#xB9AC; Kc167 &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD94;&#xCD9C;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xB97C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; 1200 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; N-&#xD14C;&#xB974;&#xBBF8;&#xB2C8; &#xC131;&#xC219; &#xD558; &#xACE0; N-&#xD130;&#xBBF8;&#xB110; acetylation &#xC778;&#xAC04; &#xCC98;&#xB7FC; &#xC720;&#xC0AC;&#xD55C; &#xC8FC;&#xD30C;&#xC218;&#xC640; &#xACE4;&#xCDA9;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC904; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. N-&#xD130;&#xBBF8;&#xB110; acetylation&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC77C;&#xD55C; &#xC9C4;&#xC815;&#xD55C; &#xACB0;&#xC815;&#xC73C;&#xB85C; (X)&#xB97C; &#xCD94;&#xCD9C;&#xD560; &#xC218; acetylation &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC0C1;&#xD669;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC608;&#xBC29;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; PX &#xADDC;&#xCE59;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xACF5;&#xBD80; &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; N &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; acetylation&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xC911;&#xC694;&#xC131;&#xC744; &#xC77C;&#xBC18; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xC544; &#xC138; &#xD2F8; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xC758; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xAD00;&#xB828;&#xC131; &#xC720;&#xBB34;&#xB97C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C;&#xC774; &#xADDC;&#xCE59;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC74C;&#xC744; &#xD45C;&#xC2DC;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC140; &#xB77C;&#xC778; &#xBC0F; &#xD30C;&#xB9AC; transgenes&#xB85C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD45C;&#xD604; &#xD558; &#xC5EC; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC801;&#xC6A9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC140; &#xBC0F; &#xC804;&#xCCB4; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4;&#xC5D0; N &#xB9E8;&#xB05D; acetylations&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xAD00;&#xB828;&#xC131;&#xC744; &#xCCB4;&#xACC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xAC04;&#xB2E8;&#xD55C; &#xC804;&#xB7B5; &#xC81C;&#xC2DC;. (X) &#xC774;&#xD6C4; PX &#xADDC;&#xCE59; &#xB0AE;&#xC740; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xB192;&#xC740; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18; &#xD0C0;&#xB2F9;&#xC131;&#xC758; &#xAC83; &#xAC19;&#xB2E4;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC218; &#xC885;&#xC5D0; N &#xB9E8;&#xB05D; acetylation &#xD568;&#xC218; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; N &#xB9D0;&#xAE30;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xD2B9;&#xC131; acetylated Drosophila melanogaster&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;.

Modificaciones de la prote&iacute;na juegan un papel importante para los procesos biol&oacute;gicos m&aacute;s en organismos vivos. Acetilaci&oacute;n de amino terminal de prote&iacute;nas es una modificaci&oacute;n com&uacute;n en todo el &aacute;rbol de la vida: el N-terminal de una cadena polipept&iacute;dica naciente se convierte co-translationally acetilado, a menudo despu&eacute;s de la eliminaci&oacute;n del residuo metionina iniciador. Mientras que las enzimas y complejos de la prote&iacute;na involucradas en estos procesos han sido ampliamente estudiados, s&oacute;lo poco se sabe sobre la funci&oacute;n biol&oacute;gica de tales acontecimientos de modificaci&oacute;n del N-terminal. Para identificar los principios comunes de la acetilaci&oacute;n N-terminal, se analizaron los p&eacute;ptidos amino-terminal de prote&iacute;nas extra&iacute;das de las c&eacute;lulas Kc167 de Drosophila. Detectamos m&aacute;s de 1.200 madurar la prote&iacute;na N-termini y podr&iacute;a demostrar que la acetilaci&oacute;n N-terminal ocurre en insectos con una frecuencia similar como en los seres humanos. Como el &uacute;nico verdadero determinante para la acetilaci&oacute;n N-terminal podr&iacute;amos extraemos la (X) regla de PX que indica la prevenci&oacute;n de acetilaci&oacute;n bajo todas las circunstancias. Podr&iacute;amos demostramos que esta regla puede utilizarse para crear gen&eacute;ticamente una prote&iacute;na para estudiar la importancia biol&oacute;gica de la presencia o ausencia de un grupo acetilo, generando un an&aacute;lisis gen&eacute;rico para probar la importancia funcional de la acetilaci&oacute;n N-terminal. Aplicamos el ensayo expresando prote&iacute;nas mutadas como transgenes en l&iacute;neas celulares y en moscas. Aqu&iacute;, presentamos una estrategia sencilla para estudiar sistem&aacute;ticamente la importancia funcional de acetylations N-terminal en c&eacute;lulas y organismos enteros. Desde el (X) regla PX parece ser de validez general en eucariotas superiores como inferiores, proponemos que puede ser utilizado para estudiar la funci&oacute;n de acetilaci&oacute;n N-terminal en todas las especies.

Identificaci&oacute;n y caracterizaci&oacute;n funcional de N-terminal acetilado prote&iacute;nas en Drosophila melanogaster.

&#x8840;&#x7BA1;&#x751F;&#x6210;&#x662F;&#x80BF;&#x7624;&#x8FDB;&#x5C55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x4E00;&#x6B65;&#x3002;VEGF &#x662F;&#x4E3B;&#x8981;&#x523A;&#x6FC0;&#x5668;&#x8840;&#x7BA1;&#x751F;&#x6210;&#x548C;&#x4E3B;&#x8981;&#x764C;&#x75C7;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5728;&#x80BF;&#x7624;&#x4E2D;&#x4F5C;&#x51FA;&#x4E86;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;VEGF &#x4FE1;&#x53F7;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x8868;&#x660E;&#x6709;&#x5E0C;&#x671B;&#x6CBB;&#x7597;&#x7684;&#x597D;&#x5904;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x764C;&#x75C7;&#x75C5;&#x4EBA;&#xFF0C;&#x4F46;&#x81EA;&#x9002;&#x5E94;&#x80BF;&#x7624;&#x53CD;&#x5E94;&#x901A;&#x5E38;&#x53EF;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x9700;&#x8981;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x4E86;&#x89E3; VEGF &#x89C4;&#x4F8B;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x62A5;&#x544A;&#x5C0F;&#x8BF4; G &#x86CB;&#x767D;&#x5076;&#x8054;&#x53D7;&#x4F53;&#xFF0C;GPR56&#xFF0C;&#x6291;&#x5236;&#x9ED1;&#x7D20;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x4ECE; VEGF &#x751F;&#x4EA7;&#x548C;&#x59A8;&#x788D;&#x4E86;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x8840;&#x7BA1;&#x751F;&#x6210;&#x548C;&#x589E;&#x957F;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7;&#x5176; N &#x603B;&#x7AD9;&#x548C;&#x6D89;&#x53CA; C&alpha; &#x86CB;&#x767D;&#x6FC0;&#x9176;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x4E1D;&#x6C28;&#x9178;&#x82CF;&#x6C28;&#x9178;&#x812F;&#x6C28;&#x9178;&#x5BCC;&#x6BB5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E86;&#x4E24;&#x4E2A;&#x7247;&#x65AD;&#x7684; GPR56&#xFF0C;&#x7531; autocatalyzed &#x88C2;&#x89E3;&#x751F;&#x6210;&#xFF0C;&#x626E;&#x6F14;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#xFF0C;&#x5728;&#x8C03;&#x8282; VEGF &#x751F;&#x4EA7;&#x548C;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x8FDB;&#x5C55;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x7B26;&#x5408;&#x5176;&#x6291;&#x5236;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x7EA7;&#x6570;&#x4E2D;&#x89D2;&#x8272;&#xFF0C;GPR56 &#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x88AB;&#x53CD;&#x6BD4;&#x7684;&#x6076;&#x6027;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x7684;&#x4EBA;&#x4F53;&#x6076;&#x6027;&#x80BF;&#x7624;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE; GPR56 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x53EF;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6297;&#x8840;&#x7BA1;&#x589E;&#x751F;&#x6CBB;&#x7597;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x7684;&#x65B0;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;

GPR56 &#x8C03;&#x8282; VEGF &#x751F;&#x4EA7;&#x548C;&#x8840;&#x7BA1;&#x751F;&#x6210;&#x671F;&#x95F4;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x8FDB;&#x5C55;&#x3002;

Angiogenesis is a critical step during cancer progression. The VEGF is a major stimulator for angiogenesis and is predominantly contributed by cancer cells in tumors. Inhibition of the VEGF signaling pathway has shown promising therapeutic benefits for cancer patients, but adaptive tumor responses are often observed, indicating the need for further understanding of VEGF regulation. We report that a novel G protein-coupled receptor, GPR56, inhibits VEGF production from the melanoma cell lines and impedes melanoma angiogenesis and growth, through the serine threonine proline-rich segment in its N-terminus and a signaling pathway involving protein kinase CÎ±. We also present evidence that the two fragments of GPR56, which are generated by autocatalyzed cleavage, played distinct roles in regulating VEGF production and melanoma progression. Finally, consistent with its suppressive roles in melanoma progression, the expression levels of GPR56 are inversely correlated with the malignancy of melanomas in human subjects. We propose that components of the GPR56-mediated signaling pathway may serve as new targets for antiangiogenic treatment of melanoma.

GPR56 Regulates VEGF production and angiogenesis during melanoma progression.

L&#x26;#39;angiogen&#xE8;se est une &#xE9;tape critique au cours de la progression du cancer. Le VEGF est un stimulateur majeur pour l&#x26;#39;angiogen&#xE8;se et est principalement contribu&#xE9; par des cellules canc&#xE9;reuses dans les tumeurs. L&#x26;#39;inhibition de la voie de signalisation du VEGF a donn&#xE9; des r&#xE9;sultats prometteurs des avantages th&#xE9;rapeutiques pour les patients canc&#xE9;reux, mais les r&#xE9;ponses tumorales d&#x26;#39;adaptation sont souvent observ&#xE9;es, indiquant la n&#xE9;cessit&#xE9; d&#x26;#39;approfondir la compr&#xE9;hension du VEGF r&#xE9;glementation. On rapport qu&#x26;#39;une nouvelle G r&#xE9;cepteur coupl&#xE9; aux prot&#xE9;ines, GPR56, inhibe la production de VEGF &#xE0; partir des lignes de cellules de m&#xE9;lanome et emp&#xEA;che l&#x26;#39;angiogen&#xE8;se et la croissance de m&#xE9;lanome, par la s&#xE9;rine thr&#xE9;onine riche en proline, segment dans son extr&#xE9;mit&#xE9; N-terminale et une voie de signalisation impliquant la prot&#xE9;ine kinase Ca. Nous avons &#xE9;galement pr&#xE9;senter des preuves que les deux fragments de GPR56, qui sont g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;s par clivage autocatalyzed, ont jou&#xE9; des r&#xF4;les distincts dans la r&#xE9;gulation de la production de VEGF et de la progression du m&#xE9;lanome. Enfin, conform&#xE9;ment &#xE0; ses r&#xF4;les r&#xE9;pressives &#xE0; la progression du m&#xE9;lanome, les niveaux d&#x26;#39;expression de GPR56 sont inversement corr&#xE9;l&#xE9;s avec la malignit&#xE9; des m&#xE9;lanomes chez les sujets humains. Nous proposons que les composants de la voie de signalisation m&#xE9;di&#xE9;e par GPR56 pourrait servir de nouvelles cibles pour le traitement anti-angiog&#xE9;nique de m&#xE9;lanome.

GPR56 r&#xE9;gule la production de VEGF et l&#x26;#39;angiogen&#xE8;se dans la progression du m&#xE9;lanome

Angiogenese ist ein wichtiger Schritt beim Fortschreiten. Die VEGF ist ein wichtiger Anreger f&uuml;r Angiogenese und wird &uuml;berwiegend von Krebszellen in Tumoren beigetragen. Hemmung der der VEGF Signalisierung Weg hat vielversprechende therapeutische Vorteile f&uuml;r Krebspatienten, aber adaptive Tumor Antworten sind oft beobachtet, erforderlich f&uuml;r das weitere Verst&auml;ndnis der VEGF-Verordnung. Wir berichten, dass ein Roman G Protein-gekoppelter Rezeptor, GPR56, hemmt die Produktion von VEGF aus der Melanom-Zelllinien und Melanom Angiogenese und Wachstum, durch Serin Threonin Prolin-Reiche im Segment der N-Terminus und ein Signalweg mit Proteinkinase C&alpha; behindert. Wir pr&auml;sentieren auch Hinweise darauf, dass die zwei Fragmente der GPR56, die von Autocatalyzed Spaltung erzeugt werden, unterschiedliche Rollen bei der Regulierung der VEGF-Produktion und Melanom Progression gespielt. Schlie&szlig;lich sind in &Uuml;bereinstimmung mit seiner unterdr&uuml;ckende Rollen in Melanom Fortschreiten, die Stufen des GPR56 umgekehrt mit der B&ouml;sartigkeit von Melanomen im menschlichen Probanden korreliert. Schlagen wir Komponenten von der GPR56-vermittelten Signalweges als neue Ziele f&uuml;r Antiangiogenetische Behandlung des Melanoms dienen k&ouml;nnen.

GPR56 regelt die VEGF-Produktion und Angiogenese beim Melanom Fortschreiten.

L&#39;angiogenesi &egrave; un passaggio fondamentale durante la progressione del cancro. Il VEGF &egrave; un importante stimolatore per l&#39;angiogenesi e principalmente &egrave; inviata da cellule tumorali nei tumori. Inibizione di VEGF signaling pathway ha mostrato promettenti benefici terapeutici per i malati di cancro, ma le risposte adattive tumore sono spesso osservate, che indica la necessit&agrave; di ulteriore comprensione del regolamento VEGF. Segnaliamo che un recettori accoppiati a proteine G romanzo, GPR56, inibisce la produzione di VEGF da linee di cellule di melanoma e impediscono l&#39;angiogenesi del melanoma e la crescita, attraverso il segmento di serina treonina proline-rich nel suo N-terminus e una via di segnalazione che coinvolge la proteina chinasi C&alpha;. Siamo presenti anche elementi di prova che i due frammenti di GPR56, che vengono generati dal clivaggio di autocatalyzed, ha svolto diversi ruoli nella regolazione della produzione di VEGF e la progressione del melanoma. Infine, coerente con i suoi ruoli soppressivi in progressione del melanoma, i livelli di espressione di GPR56 sono inversamente correlati con la malignit&agrave; di melanomi in soggetti umani. Proponiamo che componenti della via di segnalazione mediata GPR56 possono servire come nuovi obiettivi per il trattamento antiangiogenetico del melanoma.

VEGF GPR56 regola la produzione e l&#39;angiogenesi durante la progressione del melanoma.

&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x306F;&#x764C;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x4E2D;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7;&#x3067;&#x3059;&#x3002; VEGF&#x306F;&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x523A;&#x6FC0;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x4E3B;&#x306B;&#x816B;&#x760D;&#x5185;&#x306E;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5BC4;&#x8D08;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; VEGF&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x5229;&#x70B9;&#x3092;&#x7D04;&#x675F;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x9069;&#x5FDC;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;VEGF&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x7406;&#x89E3;&#x306E;&#x5FC5;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x89B3;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x898F;G&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5171;&#x5F79;&#x578B;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x3001;GPR56&#x306F;&#x3001;&#x30E1;&#x30E9;&#x30CE;&#x30FC;&#x30DE;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x304B;&#x3089;&#x306E;VEGF&#x7523;&#x751F;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x306E;N&#x672B;&#x7AEF;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;C&#x3B1;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30BB;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B9;&#x30EC;&#x30AA;&#x30CB;&#x30F3;&#x30D7;&#x30ED;&#x30EA;&#x30F3;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C1;&#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x60AA;&#x6027;&#x9ED2;&#x8272;&#x816B;&#x306E;&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5897;&#x6B96;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002; autocatalyzed&#x958B;&#x88C2;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;GPR56&#x306E;2&#x3064;&#x306E;&#x65AD;&#x7247;&#x304C;&#x3001;VEGF&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x3068;&#x30E1;&#x30E9;&#x30CE;&#x30FC;&#x30DE;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x30E1;&#x30E9;&#x30CE;&#x30FC;&#x30DE;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x3067;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x6291;&#x5236;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3001;GPR56&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x9006;&#x306B;&#x30D2;&#x30C8;&#x88AB;&#x9A13;&#x8005;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x9ED2;&#x8272;&#x816B;&#x306E;&#x60AA;&#x6027;&#x5EA6;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;GPR56&#x3092;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x304C;&#x30E1;&#x30E9;&#x30CE;&#x30FC;&#x30DE;&#x306E;&#x6297;&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x6CBB;&#x7642;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

GPR56&#x306F;&#x3001;&#x30E1;&#x30E9;&#x30CE;&#x30FC;&#x30DE;&#x9032;&#x884C;&#x4E2D;VEGF&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x3068;&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;

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GPR56 &#xADDC;&#xC81C; VEGF &#xC0DD;&#xC0B0;&#xACFC; &#xD751;&#xC0C9; &#xC885; &#xC9C4;&#xD589; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC2E0;&#xC0DD;.

La angiog&#xE9;nesis es un paso cr&#xED;tico en la progresi&#xF3;n del c&#xE1;ncer. El VEGF es un estimulador importante para la angiog&#xE9;nesis y es predominantemente presentadas por las c&#xE9;lulas cancerosas de los tumores. La inhibici&#xF3;n de la v&#xED;a de se&#xF1;alizaci&#xF3;n VEGF ha mostrado prometedores beneficios terap&#xE9;uticos para pacientes con c&#xE1;ncer, pero las respuestas de adaptaci&#xF3;n del tumor a menudo se observan, lo que indica la necesidad de una mayor comprensi&#xF3;n de la regulaci&#xF3;n de VEGF. Nos informan de que una nueva prote&#xED;na G-receptor acoplado, GPR56, inhibe la producci&#xF3;n de VEGF de las l&#xED;neas celulares de melanoma e impide la angiog&#xE9;nesis melanoma y el crecimiento, a trav&#xE9;s de la serina treonina rico en prolina segmento en su extremo N-terminal y una v&#xED;a de se&#xF1;alizaci&#xF3;n que implica la prote&#xED;na quinasa C&#x3B1;. Tambi&#xE9;n se presentan evidencias de que los dos fragmentos de GPR56, que son generados por la divisi&#xF3;n autocatalyzed, jugaron papeles distintos en la regulaci&#xF3;n de la producci&#xF3;n de VEGF y la progresi&#xF3;n del melanoma. Por &#xFA;ltimo, en consonancia con sus funciones represivas en la progresi&#xF3;n del melanoma, los niveles de expresi&#xF3;n de GPR56 est&#xE1;n inversamente correlacionados con la malignidad de los melanomas en humanos. Proponemos que los componentes de la v&#xED;a de se&#xF1;alizaci&#xF3;n mediada por GPR56 pueden servir como nuevos objetivos para el tratamiento antiangiog&#xE9;nico del melanoma.

Article	Year
Optimized peptide separation and identification for mass spectrometry based proteomics via free-flow electrophoresis. Journal of proteome research\| PubMed ID: 16944936	2006
A high-quality catalog of the Drosophila melanogaster proteome. Nature biotechnology\| PubMed ID: 17450130	2007
Comparative functional analysis of the Caenorhabditis elegans and Drosophila melanogaster proteomes. PLoS biology\| PubMed ID: 19260763	2009
A combined proteomic and genetic analysis identifies a role for the lipid desaturase Desat1 in starvation-induced autophagy in Drosophila. Autophagy\| PubMed ID: 19587536	2009
Identification and functional characterization of N-terminally acetylated proteins in Drosophila melanogaster. PLoS biology\| PubMed ID: 19885390	2009
GPR56 Regulates VEGF production and angiogenesis during melanoma progression. Cancer research\| PubMed ID: 21724588	2011

Sonali Mohanty

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