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Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer (<em>Agrilus planipennis</em>) Using Quantitative Real Time-PCR

Emerald ash borer (EAB, Agrilus planipennis) is an exotic invasive pest, which has killed millions of ash trees (Fraxinus spp) in North America. EAB ...

The Ohio State University

&#x7070; (&#x767D;&#x8721;&#x866B;&#xFF09; &#x662F;&#x4F18;&#x52BF;&#x6811;&#x79CD;&#x5728;&#x57CE;&#x5E02;&#x548C;&#x68EE;&#x6797;&#x666F;&#x89C2;&#x6574;&#x4E2A;&#x5317;&#x7F8E; (NA)&#x3002;NA &#x7684;&#x767D;&#x8721;&#x866B; (&#x82B1;)&#x3001; &#x6728;&#x6750;&#x94BB;&#x5B54;&#x7532;&#x866B;&#x7279;&#x6709;&#x4E1C;&#x4E9A;&#xFF0C;&#x8FC5;&#x901F;&#x5165;&#x4FB5;&#x9020;&#x6210;&#x6570;&#x4EE5;&#x767E;&#x4E07;&#x8BA1;&#x7684;&#x7070;&#x6811;&#x7684;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x548C;&#x66F4;&#x5A01;&#x80C1;&#x5230;&#x6570;&#x5341;&#x4EBF;&#x3002;&#x5E7C;&#x866B;&#x9972;&#x6599;&#x4E3B;&#x8981;&#x5728;&#x97E7;&#x76AE;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x73AF;&#x7ED5;&#xFF0C;&#x6740;&#x4E86;&#x6811;&#x4E0A;&#x3002;&#x867D;&#x7136; NA &#x7070;&#x7269;&#x79CD;&#x5305;&#x62EC;&#x9ED1;&#x8272; (F.&#x9ED1;&#x8D28;)&#x3001; &#x7EFF;&#x8272; (F.pennsylvannica)&#x3001; &#x767D; (F.&#x7F8E;&#x6D32;) &#x975E;&#x5E38;&#x5BB9;&#x6613;&#xFF0C;&#x4E9A;&#x6D32;&#x7269;&#x79CD;&#x6C34;&#x66F2;&#x67F3; (F.&#x6C34;&#x66F2;&#x67F3;) &#x662F;&#x6297; A.&#x82B1;&#x4E5F;&#x8BB8;&#x662F;&#x56E0;&#x4E3A;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x5171;&#x540C;&#x8FDB;&#x5316;&#x7684;&#x5386;&#x53F2;&#x3002;&#x5206;&#x5B50;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x7070;&#x4E86;&#x89E3;&#x751A;&#x5C11;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x8BC6;&#x522B;&#x6C47;&#x8F91; &#x300B; &#x7070;&#x97E7;&#x76AE;&#x90E8;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x529F;&#x80FD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;

&#x5BBF;&#x4E3B;&#x7684;&#x7070; (&#x767D;&#x8721;&#x866B;) &#x97E7;&#x76AE;&#x90E8;&#x7684;&#x7B7E;&#x540D;&#x3002;

Ash (Fraxinus spp.) is a dominant tree species throughout urban and forested landscapes of North America (NA). The rapid invasion of NA by emerald ash borer (Agrilus planipennis), a wood-boring beetle endemic to Eastern Asia, has resulted in the death of millions of ash trees and threatens billions more. Larvae feed primarily on phloem tissue, which girdles and kills the tree. While NA ash species including black (F. nigra), green (F. pennsylvannica) and white (F. americana) are highly susceptible, the Asian species Manchurian ash (F. mandshurica) is resistant to A. planipennis perhaps due to their co-evolutionary history. Little is known about the molecular genetics of ash. Hence, we undertook a functional genomics approach to identify the repertoire of genes expressed in ash phloem.

Transcriptomic signatures of ash (Fraxinus spp.) phloem.

Fr&#xEA;ne (Fraxinus spp.) Est une esp&#xE8;ce d&#x26;#39;arbres dominante tout au long de paysages urbaines et bois&#xE9;es de l&#x26;#39;Am&#xE9;rique du Nord (NA). L&#x26;#39;invasion rapide de NA par l&#x26;#39;agrile du fr&#xEA;ne (Agrilus planipennis), un col&#xE9;opt&#xE8;re xylophage end&#xE9;mique &#xE0; l&#x26;#39;Asie orientale, a entra&#xEE;n&#xE9; la mort de millions de fr&#xEA;nes et menace des milliards de plus. Les larves se nourrissent principalement sur les tissus du phlo&#xE8;me, qui ceinture et tue l&#x26;#39;arbre. Alors que NA esp&#xE8;ces de fr&#xEA;ne dont le noir (F. nigra), vert (F. pennsylvannica) et blanc (F. americana) sont tr&#xE8;s sensibles, la Banque asiatique de fr&#xEA;ne de Mandchourie esp&#xE8;ces (F. mandshurica) est r&#xE9;sistant &#xE0; A. planipennis peut-&#xEA;tre en raison de leur coop&#xE9;ration -&#xE9;volution historique. On conna&#xEE;t peu la g&#xE9;n&#xE9;tique mol&#xE9;culaire des cendres. Par cons&#xE9;quent, nous avons entrepris une approche de g&#xE9;nomique fonctionnelle pour identifier le r&#xE9;pertoire des g&#xE8;nes exprim&#xE9;s dans les cendres du phlo&#xE8;me.

Signatures transcriptomique de fr&#xEA;ne (Fraxinus spp.) Liber

Esche (Fraxinus spp.) ist eine dominierende Baumarten im gesamten Stadt- und bewaldeten Landschaften von Nordamerika (NA). Die schnelle Invasion NA von Emerald Ash Borer (Agrilus Planipennis), eine Holz-Bohren K&auml;fer endemisch in Ostasien, f&uuml;hrte zu den Tod von Millionen von Eschen und Milliarden mehr droht. Larven ern&auml;hren sich haupts&auml;chlich von Phloem Gewebe, das H&uuml;ftg&uuml;rtel und t&ouml;tet den Baum. W&auml;hrend NA Esche Arten einschlie&szlig;lich schwarz (F. Nigra), gr&uuml;n (F. Pennsylvannica) und wei&szlig; (F. Americana) sind sehr anf&auml;llig, die asiatischen Arten Mandschurische Esche (F. Mandshurica) ist resistent gegen A. Planipennis vielleicht aufgrund ihrer co-evolution&auml;ren Geschichte. &Uuml;ber die molekulare Genetik Asche ist wenig bekannt. Daher unternahmen wir einen funktionelle Genomik-Ansatz, um das Repertoire von Genen, die in Asche Phloem ausgedr&uuml;ckt zu identifizieren.

Transcriptomic Unterschriften der Esche (Fraxinus spp.) Phloem.

Frassino (Fraxinus spp.) &egrave; una specie di albero dominante in tutta paesaggi urbani e boscose del Nord America (NA). La rapida invasione di NA da piralide cenere smeraldo (Agrilus planipennis), un legno-noioso coleottero endemico dell&#39;Asia orientale, ha provocato la morte di milioni di alberi di frassino e minaccia miliardi in pi&ugrave;. Le larve si nutrono principalmente il tessuto del floema, che PANCIERE e uccide l&#39;albero. Mentre NA cenere specie tra cui nero (F. nigra), verde (F. pennsylvannica) e bianco (F. americana) sono altamente sensibili, le specie asiatiche cenere Manchurian (F. mandshurica) sono resistente a. planipennis forse a causa della loro storia co-evolutivo. Poco si sa circa la genetica molecolare di cenere. Quindi, abbiamo intrapreso un approccio di genomica funzionale per identificare il repertorio di geni espressi in floema di cenere.

Trascrittomica firme del floema di frassino (Fraxinus spp.).

&#x7070;&#x306F;&#xFF08;&#x30C8;&#x30CD;&#x30EA;&#x30B3;&#x5C5E;&#xFF09;&#x5317;&#x7C73;&#xFF08;NA&#xFF09;&#x306E;&#x90FD;&#x5E02;&#x90E8;&#x3068;&#x68EE;&#x6797;&#x666F;&#x89B3;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x6A39;&#x7A2E;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30A8;&#x30E1;&#x30E9;&#x30EB;&#x30C9;&#x7070;&#x30DC;&#x30FC;&#x30E9;&#x30FC;&#xFF08;Agrilus planipennis&#xFF09;&#x306B;&#x3088;&#x308B;NA&#x306E;&#x6025;&#x901F;&#x306A;&#x4FB5;&#x5165;&#x3001;&#x6771;&#x30A2;&#x30B8;&#x30A2;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6728;&#x6750;&#x9000;&#x5C48;&#x306A;&#x7532;&#x866B;&#x306F;&#x3001;&#x7070;&#x306E;&#x6728;&#x6570;&#x767E;&#x4E07;&#x306E;&#x6B7B;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x3001;&#x3088;&#x308A;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5341;&#x5104;&#x3092;&#x8105;&#x304B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5E7C;&#x866B;&#x306F;&#x6728;&#x3092;&#x30AC;&#x30FC;&#x30C9;&#x30EB;&#x3068;&#x6BBA;&#x3059;&#x7BE9;&#x90E8;&#x7D44;&#x7E54;&#x306B;&#x4E3B;&#x306B;&#x98DF;&#x3079;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x9ED2;&#xFF08;F.&#x9ED2;&#xFF09;&#x3001;&#x7DD1;&#xFF08;F. pennsylvannica&#xFF09;&#x3068;&#x767D;&#xFF08;F.&#x30A2;&#x30E1;&#x30EA;&#x30AB;&#x30FC;&#x30CA;&#xFF09;&#x3092;&#x542B;&#x3080;NA&#x7070;&#x7A2E;&#x306F;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x654F;&#x611F;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x4E00;&#x65B9;&#x3067;&#x3001;&#x30A2;&#x30B8;&#x30A2;&#x306E;&#x7A2E;&#x6E80;&#x5DDE;&#x7070;&#xFF08;F. mandshurica&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x304A;&#x305D;&#x3089;&#x304F;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5171;&#x540C;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;A. planipennis&#x306B;&#x8010;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B; - &#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x6B74;&#x53F2;&#x3002;&#x30EA;&#x30C8;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x7070;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306F;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x7070;&#x7BE9;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30EC;&#x30D1;&#x30FC;&#x30C8;&#x30EA;&#x30FC;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30B2;&#x30CE;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;

&#x30A2;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E5;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CD;&#x30C1;&#x30E3;&#xFF08;&#x30C8;&#x30CD;&#x30EA;&#x30B3;&#x5C5E;&#xFF09;&#x7BE9;

&#xD654;&#xC0B0;&#xC7AC; (Fraxinus &#xC885;)&#xB294; &#xBD81;&#xBBF8; (&#xC5C6;&#xC74C;)&#xC758; &#xB3C4;&#xC2DC;&#xC640; &#xC232;&#xC774; &#xC6B0;&#xAC70;&#xC9C4; &#xD48D;&#xACBD;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; &#xB098;&#xBB34; &#xC885;. &#xAD6C;&#xBA4D; &#xB6AB;&#xB294; &#xC5D0;&#xBA54;&#xB784;&#xB4DC; &#xBB3C; &#xD478; &#xB808; (Agrilus planipennis)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB098; &#xC0C1; &#xC6B1;, &#xB3D9;&#xBD80; &#xC544;&#xC2DC;&#xC544; &#xB098;&#xBB34; &#xC9C0;&#xB8E8;&#xD55C; &#xBC8C;&#xB808; &#xBC1C;&#xBCD1;&#xC758; &#xAE09;&#xC18D; &#xD55C; &#xCE68;&#xACF5; &#xBB3C; &#xD478; &#xB808; &#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xC218;&#xBC31;&#xB9CC;&#xC758; &#xC8FD;&#xC74C; &#xADC0;&#xCC29;&#xB418; &#xC5C8; &#xACE0; &#xC218;&#xC2ED;&#xC5B5; &#xB2EC;&#xB7EC;&#xB97C; &#xC704;&#xD611; &#xD558;&#xB294; &#xB354;. &#xC560;&#xBC8C;&#xB808;&#xB294; &#xC8FC;&#xB85C; girdles &#xD558; &#xACE0; &#xB098;&#xBB34;&#xB97C; &#xC8FD;&#xC774;&#xACE0; &#xCCB4; &#xAD00; &#xBD80; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xD53C;&#xB4DC;. NA &#xC7AC; &#xC885; &#xB4F1; &#xBE14;&#xB799; (F. nigra), &#xB179;&#xC0C9; (F. pennsylvannica)&#xC640; &#xD654;&#xC774;&#xD2B8; (F. americana) &#xC544;&#xC2DC;&#xC544; &#xC885;&#xB9CC; &#xC8FC; &#xC560;&#xC26C; (F. mandshurica) &#xC5B4;&#xCA4C;&#xBA74; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC9C4;&#xD654; &#xC5ED;&#xC0AC; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; A. planipennis&#xB294; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xCDE8;&#xC57D; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC791;&#xC740; &#xD654;&#xC0B0;&#xC7AC;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xC720;&#xC804;&#xD559;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC7AC; &#xCCB4; &#xAD00; &#xBD80;&#xB85C; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB808; &#xD37C; &#xD1A0;&#xB9AC;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB294; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC720;&#xC804;&#xCCB4;&#xD559; &#xC811;&#xADFC;&#xC744; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Transcriptomic &#xD654;&#xC0B0;&#xC7AC; (Fraxinus &#xC885;) &#xCCB4; &#xAD00; &#xBD80;&#xC758; &#xC11C;&#xBA85;.

Fresno (Fraxinus spp.) Es una especie arb&#xF3;rea dominante en todo los paisajes urbanos y forestales de Am&#xE9;rica del Norte (NA). La r&#xE1;pida invasi&#xF3;n de NA por el barrenador esmeralda del fresno (Agrilus planipennis), un escarabajo que barrena la madera end&#xE9;mica de Asia Oriental, ha dado como resultado la muerte de millones de fresnos y pone en peligro miles de millones m&#xE1;s. Las larvas se alimentan principalmente de tejido de floema, que ci&#xF1;e y mata al &#xE1;rbol. Mientras que las especies de ceniza NA incluyendo el negro (F. nigra), verde (F. pennsylvannica) y blanco (F. americana) son muy susceptibles, el Banco Asi&#xE1;tico especies de fresno de Manchuria (F. mandshurica) es resistente a A. planipennis tal vez debido a su cooperaci&#xF3;n -evolutivo de la historia. Poco se sabe sobre la gen&#xE9;tica molecular de la ceniza. Por lo tanto, llevamos a cabo un enfoque de gen&#xF3;mica funcional para identificar el repertorio de genes expresados &#x200B;&#x200B;en las cenizas del floema.

Firmas transcriptomic de fresno (Fraxinus spp.) Floema

RNA Seq &#x548C;&#x5206;&#x5B50;&#x5BF9;&#x63A5;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86;&#x591A;&#x7EA7;&#x6297;&#x836F;&#x6027;&#x5728;&#x5E8A; bug &#x4E2D;&#x3002;

RNA-Seq and molecular docking reveal multi-level pesticide resistance in the bed bug.

ARN-Seq et docking mol&#xE9;culaire r&#xE9;v&#xE8;lent que la r&#xE9;sistance aux pesticides multi-niveau dans la punaise de lit

RNA-Seq und Molekulare Andocken offenbaren mehrstufige Pestizid-Resistenz bei der Bed Bug.

RNA-Seq e docking molecolare rivelano resistenza ai pesticidi multilivello nel bed bug.

RNA-Seq&#x306F;&#x3001;&#x5206;&#x5B50;&#x30C9;&#x30C3;&#x30AD;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x30C8;&#x30B3;&#x30B8;&#x30E9;&#x30DF;&#x306B;&#x30DE;&#x30EB;&#x30C1;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x8FB2;&#x85AC;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;

RNA-Seq&#xC640; &#xBD84;&#xC790; &#xB3C4;&#xD0B9; &#xCE68;&#xB300; &#xBC84;&#xADF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB2E8;&#xACC4; &#xB18D;&#xC57D; &#xC800;&#xD56D;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;.

Article	Year
Transcriptomic signatures of ash (Fraxinus spp.) phloem. PloS one\| PubMed ID: 21283712	2011
RNA-Seq and molecular docking reveal multi-level pesticide resistance in the bed bug. BMC genomics\| PubMed ID: 22226239	2012

Loren Rivera-Vega

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