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Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) to Assay Dynamic Histone Modification in Activated Gene Expression in Human Cells

In response to a variety of extracellular ligands, the STAT (signal transducer and activator of transcription) transcription factors are rapidly recruited ...

University of Virginia

&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x5B50;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x5B50; (STAT) &#x6FC0;&#x6D3B;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x662F;&#x5FEB;&#x901F;&#x548C;&#x77AC;&#x6001;&#xFF0C;&#x548C;&#x65F6;&#x6B63;&#x786E;&#x6267;&#x884C;&#x5B83;&#x5F71;&#x54CD;&#x751F;&#x957F;&#x3001; &#x5206;&#x5316;&#x3001; &#x7A33;&#x6001;&#x548C;&#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5E94;&#xFF0C;&#x4F46;&#x5F53;&#x6C34;&#x5E73;&#x53CA;&#x5B83;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x53D7;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x6A21;&#x677F;&#x7684;&#x6539;&#x5EFA;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5728;&#x88AB;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x4E3A;&#x54CD;&#x5E94; STAT &#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4F4D;&#x70B9;&#x7684;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4FEE;&#x9970;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x88AB;&#x5B9A;&#x4E49;&#x4E0D;&#x6E05;&#x3002;

&#x978D;&#x9694;&#x8111;&#x819C;&#x548C; RNF20 &#x7684;&#x62DB;&#x8058;&#x662F;&#x5173;&#x8054;&#x52A8;&#x6001;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4FEE;&#x9970;&#x7684;&#x8C03;&#x8282;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x5B50; 1 (STAT1)-&#x6FC0;&#x6D3B;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5E72;&#x6270;&#x7D20;&#x8C03;&#x8282;&#x56E0;&#x5B50; 1 &#x57FA;&#x56E0; (IRF1)&#x3002;

Signal transducer and activator of transcription (STAT) activation of gene expression is both rapid and transient, and when properly executed it affects growth, differentiation, homeostasis and the immune response, but when dysregulated it contributes to human disease. Transcriptional activation is regulated by alterations to the chromatin template. However, the role of histone modification at gene loci that are activated for transcription in response to STAT signaling is poorly defined.

Menin and RNF20 recruitment is associated with dynamic histone modifications that regulate signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1)-activated transcription of the interferon regulatory factor 1 gene (IRF1).

Transducteur de signal et activateur de la transcription (STAT) d&#x26;#39;activation de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique est &#xE0; la fois rapide et transitoire, et lorsqu&#x26;#39;ils sont correctement ex&#xE9;cut&#xE9;e, elle affecte la croissance, la diff&#xE9;renciation, l&#x26;#39;hom&#xE9;ostasie et la r&#xE9;ponse immunitaire, mais quand elle contribue &#xE0; une dysr&#xE9;gulation des maladies humaines. Activation de la transcription est r&#xE9;gul&#xE9;e par des modifications apport&#xE9;es au mod&#xE8;le chromatine. Cependant, le r&#xF4;le de la modification des histones au locus qui sont activ&#xE9;s pour la transcription en r&#xE9;ponse &#xE0; STAT est mal d&#xE9;finie.

Recrutement de Menin et RNF20 est associ&#xE9;e &#xE0; des modifications des histones dynamiques qui r&#xE9;gulent de transduction de signal et activateur de la transcription 1 (STAT1) activ&#xE9; par transcription de l&#x26;#39;interf&#xE9;ron Facteur 1 g&#xE8;ne r&#xE9;gulateur (IRF1)

Signal Wandler und Aktivator der Transkription (STAT) Aktivierung der Genexpression ist sowohl schnelle als auch vor&uuml;bergehend, und bei richtig wirkt sich auf Wachstum, Differenzierung, Hom&ouml;ostase und die Immunantwort, Ausf&uuml;hrung aber bei defekten, die es tr&auml;gt, zur menschlichen Erkrankungen. Transkriptionelle Aktivierung wird durch &Auml;nderungen an der Vorlage Chromatin geregelt. Allerdings ist die Rolle der Histon-&Auml;nderung bei gen-Loci, die f&uuml;r die Transkription als Reaktion auf die STAT Signalisierung aktiviert werden schlecht definiert.

Menin und RNF20 Einstellung ist verbunden mit dynamischen Histon-Modifikationen, die Signal-Wandler und Aktivator der Transkription 1 (STAT1) regulieren-Transkription des Gens ordnungspolitischen Faktor 1 Interferon (IRF1) aktiviert.

Segnale trasduttore e attivatore di trascrizione (STAT) attivazione dell&#39;espressione genica &egrave; rapida e transitoria e quando eseguito correttamente influisce sulla crescita, differenziazione, l&#39;omeostasi e la risposta immunitaria, ma quando contribuisce alla malattia umana. Attivazione trascrizionale &egrave; regolata da alterazioni al modello della cromatina. Tuttavia, il ruolo delle modifiche dell&#39;istone in loci del gene che vengono attivati per la trascrizione in risposta alla segnalazione STAT &egrave; scarsamente definito.

Reclutamento di Menin e RNF20 &egrave; associato con le modifiche dell&#39;istone dinamici che regolano il trasduttore di segnale e attivatore di trascrizione 1 (STAT1)-attiva la trascrizione del gene interferon regulatory factor 1 (IRF1).

&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C7;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B5;&#x30FC;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C1;&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#xFF08;STAT&#xFF09;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x8FC5;&#x901F;&#x304B;&#x3064;&#x4E00;&#x904E;&#x6027;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3068;&#x540C;&#x6642;&#x306B;&#x3001;&#x9069;&#x5207;&#x306B;&#x5B9F;&#x884C;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x304D;&#x306B;&#x305D;&#x308C;&#x304C;&#x5897;&#x6B96;&#x3001;&#x5206;&#x5316;&#x3001;&#x6052;&#x5E38;&#x6027;&#x3068;&#x514D;&#x75AB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x3068;&#x304D;&#x306B;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x4E0D;&#x5168;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x75BE;&#x60A3;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x3078;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x898F;&#x5236;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;STAT&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x306F;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Menin&#x3068;RNF20&#x30EA;&#x30AF;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x306F;&#x8EE2;&#x5199;1&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x3068;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#xFF08;STAT1&#xFF09;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30F3;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56E0;&#x5B50;1&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#xFF08;IRF1&#xFF09;&#x3092;&#x898F;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x30C0;&#x30A4;&#x30CA;&#x30DF;&#x30C3;&#x30AF;&#xB7;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306B;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;

&#xC2E0;&#xD638; &#xBCC0;&#xD658;&#xAE30; &#xBC0F; &#xD65C;&#xC131; &#xC81C; &#xC804;&#xC0AC; (STAT)&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xB294; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xACE0; &#xC77C;&#xC2DC;&#xC801;&#xC778;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC131;&#xC7A5;, &#xBD84;&#xD654;, &#xD56D;&#xC0C1;&#xC131; &#xBC0F; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751;&#xC5D0; &#xC81C;&#xB300;&#xB85C; &#xC2E4;&#xD589; &#xD558;&#xB294; &#xACBD;&#xC6B0; &#xBC0F; &#xB54C; &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC; dysregulated &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC;. Transcriptional &#xD65C;&#xC131;&#xD654; chromatin &#xC11C;&#xC2DD; &#xD30C;&#xC77C; &#xBCC0;&#xACBD;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xADDC;&#xC81C; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC804;&#xC0AC; &#xD569;&#xACC4; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; loci&#xC5D0;&#xC11C; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815; &#xC5ED;&#xD560;&#xC740; &#xC81C;&#xB300;&#xB85C; &#xC815;&#xC758; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Menin &#xBC0F; RNF20 &#xBAA8;&#xC9D1;&#xC740; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C; &#xC2E0;&#xD638; &#xBCC0;&#xD658;&#xAE30; &#xBC0F; &#xC804;&#xC0AC; 1 (STAT1)&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xC744; &#xC870;&#xC808; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC801; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815;-&#xC778;&#xD130;&#xD398;&#xB860; &#xADDC;&#xC81C; &#xC694;&#xC18C; 1 &#xC720;&#xC804;&#xC790; (IRF1)&#xC758; &#xC804;&#xC0AC;&#xB97C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Transductor de se&#xF1;al y activador de la transcripci&#xF3;n (STAT) la activaci&#xF3;n de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica es a la vez r&#xE1;pida y transitoria, y cuando se ejecuta, afecta el crecimiento, la diferenciaci&#xF3;n, la homeostasis y la respuesta inmune, pero cuando desregulada contribuye a la enfermedad humana. Activaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n est&#xE1; regulada por las modificaciones de la plantilla de la cromatina. Sin embargo, el papel de la modificaci&#xF3;n de las histonas en los loci de genes que se activan para la transcripci&#xF3;n en respuesta a STAT de se&#xF1;alizaci&#xF3;n no est&#xE1; bien definido.

Contrataci&#xF3;n Menin y RNF20 se asocia con la din&#xE1;mica modificaciones de las histonas que regulan la se&#xF1;al de transductor y activador de la transcripci&#xF3;n 1 (STAT1) activado por la transcripci&#xF3;n del factor regulador de interfer&#xF3;n 1 gen (IRF1)

Lauren J. Buro

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