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Sequencing of Plant Wall Heteroxylans Using Enzymic, Chemical (Methylation) and Physical (Mass Spectrometry, Nuclear Magnetic Resonance) Techniques

This protocol describes the specific techniques used for the characterization of reducing end (RE) and internal region glycosyl sequence(s) of ...

University of Melbourne

&#x9AD8;&#x5EA6;&#x786E;&#x5B9A;&#x79EF;&#x5206;&#x548C;&#x5916;&#x56F4;&#x7B49;&#x79BB;&#x5B50;&#x819C; &#xFF08;PM&#xFF09; &#x86CB;&#x767D;&#x4ECE;&#x7A3B; &#xFF08;&#x7C73;&#xFF09;&#xFF0C;&#x4E30;&#x5BCC;&#x4E86;&#x4E0B;&#x5348;&#x998F;&#x5206;&#x6C34;&#x7A3B;&#x60AC;&#x6D6E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8FDB;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E24;&#x79CD;&#x4E92;&#x8865;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x4E0B;&#x5348;&#x4E30;&#x5BCC;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x6C34;&#x4E24;&#x76F8;&#x5206;&#x533A;&#x548C;&#x9AD8; ph &#x503C;&#x78B3;&#x9178;&#x76D0;&#x6C34;&#x6D17;&#x9664;&#x53BB;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x3001; &#x6C61;&#x67D3;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x548C;&#x4F7F;&#x7528;&#x9176;&#x548C;&#x514D;&#x75AB;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x4ECE;&#x78B3;&#x9178;&#x6D17;&#x4E0B;&#x5348; (&#x8FD0;&#x52A8;) &#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x8DDF;&#x80F0;&#x9176;&#x6C34;&#x89E3;&#x6216;&#x8DDF;&#x5F3A;&#x9633;&#x79BB;&#x5B50;&#x4EA4;&#x6362;&#x9AD8;&#x6548;&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;&#x6CD5; (LC) &#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x964D;&#x89E3;&#x6216;&#x8005;&#x4E00;&#x7EF4;&#x51DD;&#x80F6;&#x7535;&#x6CF3; (1 D SDS&#xFF09; &#x968F;&#x540E;&#x7531; LC-MS/MS (&#x5206;&#x522B;&#x79F0;&#x4E3A;&#x51DD;&#x80F6;-&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;-&#x8D28;&#x8C31;/&#x8D28;&#x8C31;&#x548C; 2D-LC-MS/MS) &#x7684;&#x80F0;&#x9176;&#x80BD;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x4E0E;&#x3002;&#x7ED3;&#x5408;&#x8FD9;&#x4E24;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#xFF0C;&#x6839;&#x636E;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6216;&#x591A;&#x4E2A;&#x5339;&#x914D;&#x7684;&#x591A;&#x80BD;&#xFF0C;&#x5E76;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x53D1;&#x73B0; 438 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28; 367 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x6839;&#x636E;&#x5355;&#x4E2A;&#x80BD;&#x5339;&#x914D;&#x6570;&#x636E;&#x5206;&#x6790;&#x540E;&#x4E0E;&#x4E24;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684;&#x641C;&#x7D22;&#x7B97;&#x6CD5;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B; 805 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;350 &#x9884;&#x8A00;&#x662F;&#x4E0B;&#x5348;&#x6216;&#x665A;&#x4E0A;&#x76F8;&#x5173;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x767E; 25 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28; (53%) &#x9884;&#x8BA1;&#x8981;&#x6574;&#x4F53;&#x5173;&#x8054;&#x819C;&#xFF0C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6216;&#x5F88;&#x591A; &#xFF08;&#x6700;&#x591A; 16 &#x4E2A;&#xFF09; &#x8DE8;&#x819C;&#x57DF;&#x3001; GPI-&#x951A;&#x6216;&#x8DE8;&#x819C; beta &#x6876;&#x3002;&#x5927;&#x7EA6; 80%&#x7684; 805 &#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x88AB;&#x5206;&#x914D;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E;&#x76F8;&#x4F3C;&#x7684;&#x5DF2;&#x77E5;&#x529F;&#x80FD;&#x86CB;&#x767D;&#x6216;&#x529F;&#x80FD;&#x57DF;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x53C2;&#x4E0E;&#x4E0B;&#x5348;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#xFF0C;&#x6BD4;&#x5982;&#x4FE1;&#x53F7; &#xFF08;805 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28; 21%&#xFF09;&#xFF0C;&#x8F6C;&#x8FD0;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E09; &#xFF08;14%&#xFF09;&#xFF0C;&#x548C;&#x8702;&#x7A9D;&#x8D29;&#x5356;&#x4EBA;&#x53E3; &#xFF08;8%&#xFF09;&#xFF0C;&#x5982;&#x901A;&#x8FC7;&#x56CA;&#x6CE1;&#x53C2;&#x4E0E;&#x8FDC;&#x85E4;&#x548C;&#x80DE;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x3002;&#x6240;&#x6D89;&#x53CA;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E5F;&#x5DF2;&#x786E;&#x5B9A; (5%)&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x4E09;&#x79CD;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x5408;&#x6210;&#x9176; &#xFF08;&#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x7279;&#x5F02;) &#x86CB;&#x767D;&#x3001; &#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x5408;&#x6210;&#x9176;&#x7C7B;&#x4F3C; D (CSLD) &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3001; &#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x548C;&#x51E0;&#x4E2A;&#x80DD;&#x5408;&#x3002;&#x5927;&#x7EA6; 20%&#x7684;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x672A;&#x88AB;&#x529F;&#x80FD;&#x5206;&#x7C7B;&#x5C3D;&#x7BA1;&#x88AB;&#x9884;&#x8A00;&#x662F;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;

&#x6C34;&#x7A3B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x4E1D;&#x4E1D;&#x7F15;&#x7F15;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7ED3;&#x5408;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x548C;&#x80BD;&#x5206;&#x998F;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7ED3;&#x5408;&#x4F7F;&#x7528;&#x548C;&#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

To identify integral and peripheral plasma membrane (PM) proteins from Oryza sativa (rice), highly enriched PM fractions from rice suspension cultured cells were analyzed using two complementary approaches. The PM was enriched using aqueous two-phase partitioning and high pH carbonate washing to remove soluble, contaminating proteins and characterized using enzymatic and immunological analyses. Proteins from the carbonate-washed PM (WPM) were analyzed by either one-dimensional gel electrophoresis (1D-SDS-PAGE) followed by tryptic proteolysis or proteolysis followed by strong cation exchange liquid chromatography (LC) with subsequent analysis of the tryptic peptides by LC-MS/MS (termed Gel-LC-MS/MS and 2D-LC-MS/MS, respectively). Combining the results of these two approaches, 438 proteins were identified on the basis of two or more matching peptides, and a further 367 proteins were identified on the basis of single peptide matches after data analysis with two independent search algorithms. Of these 805 proteins, 350 were predicted to be PM or PM-associated proteins. Four hundred and twenty-five proteins (53%) were predicted to be integrally associated with a membrane, via either one or many (up to 16) transmembrane domains, a GPI-anchor, or membrane-spanning beta-barrels. Approximately 80% of the 805 identified proteins were assigned a predicted function, based on similarity to proteins of known function or the presence of functional domains. Proteins involved in PM-related activities such as signaling (21% of the 805 proteins), transporters and ATPases (14%), and cellular trafficking (8%), such as via vesicles involved in endo- and exocytosis, were identified. Proteins that are involved in cell wall biosynthesis were also identified (5%) and included three cellulose synthase (CESA) proteins, a cellulose synthase-like D (CSLD) protein, cellulases, and several callose synthases. Approximately 20% of the proteins identified in this study remained functionally unclassified despite being predicted to be membrane proteins.

Analysis of the Oryza sativa plasma membrane proteome using combined protein and peptide fractionation approaches in conjunction with mass spectrometry.

Pour identifier les prot&eacute;ines de la membrane de plasma int&eacute;grante et p&eacute;riph&eacute;riques (PM) de Oryza sativa (riz), hautement enrichi PM les fractions de suspension de riz des cellules ont &eacute;t&eacute; analys&eacute;es &agrave; l&#39;aide de deux approches compl&eacute;mentaires. Le PM s&#39;est enrichi en utilisant un partitionnement en deux phases aqueuse et pH &eacute;lev&eacute; de carbonate de lavage pour &eacute;liminer les prot&eacute;ines solubles, contaminants et caract&eacute;ris&eacute;es &agrave; l&#39;aide d&#39;analyses enzymatiques et immunologiques. Prot&eacute;ines de la PM de carbonate de chaux (WPM) ont &eacute;t&eacute; analys&eacute;s par soit &eacute;lectrophor&egrave;se unidimensionnelle (1D-SDS-PAGE) suivie de la prot&eacute;olyse tryptique ou prot&eacute;olyse suivi par &eacute;change de cations forts de chromatographie liquide (LC) avec analyse subs&eacute;quente des peptides tryptiques par LC-MS/MS (appel&eacute;e Gel-LC-MS/MS et 2D-LC-MS/MS, respectivement). Combinant les r&eacute;sultats de ces deux approches, 438 prot&eacute;ines ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;es sur la base de deux ou plusieurs peptides correspondants et une autre 367 prot&eacute;ines ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;es sur la base du seul peptide matches apr&egrave;s analyse des donn&eacute;es avec deux algorithmes de recherche ind&eacute;pendante. Ces prot&eacute;ines 805, 350 ont &eacute;t&eacute; pr&eacute;dites pour PM ou prot&eacute;ines associ&eacute;es &agrave; la PM. Quatre cent vingt - cinq prot&eacute;ines (53 %) ont &eacute;t&eacute; pr&eacute;vus pour &ecirc;tre int&eacute;gralement associ&eacute;e &agrave; une membrane, via un ou plusieurs domaines transmembranaires (jusqu&#39;&agrave; 16), une ancre GPI- ou b&ecirc;ta-barils transmembranaire. Environ 80 % des prot&eacute;ines identifi&eacute;es 805 ont &eacute;t&eacute; assign&eacute;s &agrave; une fonction estim&eacute;e, bas&eacute;e sur la similitude aux prot&eacute;ines de fonction connue ou la pr&eacute;sence de domaines fonctionnels. Prot&eacute;ines impliqu&eacute;es dans des activit&eacute;s li&eacute;es au PM comme signalisation (21 % des 805 prot&eacute;ines), transporteurs et ATPases (14 %), et le trafic cellulaire (8 %), tels que par l&#39;interm&eacute;diaire de v&eacute;sicules impliqu&eacute;es dans les endo - et exocytose, ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s. Les prot&eacute;ines qui sont impliqu&eacute;es dans la biosynth&egrave;se de la paroi cellulaire ont &eacute;galement &eacute;taient identifi&eacute;s (5 %) et comprenaient trois prot&eacute;ines de cellulose synthase (CESA), une prot&eacute;ine D (CSLD) cellulose synthase, cellulases et plusieurs synthases de callose. Environ 20 % des prot&eacute;ines identifi&eacute;es dans cette &eacute;tude reste fonctionnellement non classifi&eacute; malgr&eacute; &eacute;tant pr&eacute;vus pour &ecirc;tre des prot&eacute;ines membranaires.

Analyse du prot&eacute;ome membrane plasmique Oryza sativa en utilisant des approches combin&eacute;es de fractionnement des prot&eacute;ines et de peptides en conjonction avec la spectrom&eacute;trie de masse.

Ermittlung integralen und peripheren Plasmamembran (PM)-Proteine von Oryza Sativa (Reis), sehr bereichert PM Br&uuml;che vom Reis-Federung, die kultivierte Zellen mit zwei komplement&auml;re Konzepte analysiert wurden. Die PM wurde bereichert mit w&auml;ssrigen zwei-Phasen-Partitionierung und hohen pH-Wert Carbonat waschen um wasserl&ouml;slich, kontaminierende Proteine zu entfernen und gekennzeichnet mit enzymatische und immunologische Analysen. Proteine von der Karbonat-gewaschen-PM (WPM) wurden durch entweder eindimensionaler Gelelektrophorese (1D-SDS-PAGE) gefolgt von tryptic Proteolyse oder Proteolyse gefolgt von starken kation Exchange Fl&uuml;ssigchromatographie (LC) mit nachfolgenden Analyse der tryptic Peptide von LC-MS/MS (genannt Gel-LC-MS/MS und 2D-LC-MS/MS,) analysiert. Kombiniert man die Ergebnisse dieser beiden Ans&auml;tze, 438 Proteine identifiziert wurden, auf der Grundlage von zwei oder mehr &uuml;bereinstimmende Peptide und weitere 367 Proteine wurden auf der Grundlage der einzelnen Peptid Treffern nach Datenanalyse mit zwei unabh&auml;ngigen Suchalgorithmen identifiziert. Dieser 805 Proteine, 350 waren vorhergesagt, PM oder PM-assoziierte Proteine. Vier hundert und f&uuml;nfundzwanzig Proteine (53 %) wurden vorhergesagt Integral von einer Membran, &uuml;ber eine oder mehrere zugeordnet werden (bis zu 16) Transmembran-Dom&auml;nen, eine GPI-Anker oder Membran-spanning Beta-Barrel. Etwa 80 % der 805 identifizierte Proteine wurden eine vorhergesagte Funktion, basierend auf &Auml;hnlichkeit mit Proteinen bekannte Funktion oder das Vorhandensein von funktionellen Dom&auml;nen zugeordnet. Proteine beteiligt PM-Aktivit&auml;ten wie z. B. die Signalisierung (21 % der 805-Proteine), Transporter und ATPasen (14 %) und zellul&auml;re Menschenhandel (8 %), wie z. B. &uuml;ber Vesikel beteiligt Endo- und Exozytose, wurden identifiziert. Proteine, die an der Zellwand-Biosynthese beteiligt sind waren auch identifizierten (5 %) und drei Zellulose-Synthase (CESA) Proteine ein Zellulose-Synthase-wie D (CSLD)-Protein, Cellulasen und mehrere Callose-Synthasen. Etwa 20 % der Proteine, die in dieser Studie identifizierten blieb trotz wird voraussichtlich Membranproteine funktionell nicht klassifizierte.

Analyse des Oryza Sativa Plasmamembran Proteome mit kombinierten Protein- und Fraktionierung Ans&auml;tze in Verbindung mit Massenspektrometrie.

Per identificare le proteine integrali e periferiche plasma membrana (PM) da Oryza sativa (riso), altamente arricchito le frazioni di PM da sospensione riso cellule in coltura sono state analizzate utilizzando due approcci complementari. Il PM &egrave; stato arricchito con partizionamento a due fasi acquose e pH elevato carbonato di lavaggio per rimuovere le proteine solubili, contaminanti e caratterizzati mediante analisi enzimatiche e immunologiche. Proteine da PM carbonato-lavato (WPM) sono state analizzate da entrambi elettroforesi monodimensionale (1 D-SDS-PAGE) seguita da proteolisi triptico o proteolisi seguita da forte scambio cationico cromatografia liquida (LC) con successiva analisi dei peptidi trittica di LC-MS/MS (chiamato Gel-LC-MS/MS e 2D-LC-MS/MS, rispettivamente). Combinando i risultati di questi due approcci, 438 proteine sono state identificate sulla base di due o pi&ugrave; peptidi corrispondenti e un ulteriore 367 proteine sono state identificate sulla base del peptide unico partite dopo analisi dei dati con due algoritmi di ricerca indipendente. Di queste 805 proteine, 350 erano previsto per PM o PM-associated proteins. Quattro-venti - cinque proteine (53%) erano previsti essere integralmente associato con una membrana, tramite uno o molti domini transmembrana (fino a 16), un ancoraggio di GPI o membrana-spanning beta-botti. Circa l&#39;80% delle proteine identificate 805 furono assegnate una funzione prevista, basata sulla somiglianza con proteine di funzione nota o la presenza di domini funzionali. Proteine coinvolte in attivit&agrave; legate al PM come segnalazione (21% delle 805 proteine), trasportatori e ATPasi (14%), e cellulari traffico (8%), come tramite vescicole coinvolte in endo - ed esocitosi, sono stati identificati. Le proteine che sono coinvolte nella biosintesi della parete cellulare sono state anche identificate (5%) e comprendevano tre proteine di cellulosa sintasi (CESA), una proteina di cellulosa sintasi-simile D (CSLD), cellulasi e parecchi synthases callosio. Circa il 20% delle proteine identificate in questo studio &egrave; rimasto funzionalmente non classificati pur essendo previsto per le proteine di membrana.

Analisi del proteoma Oryza sativa membrana plasmatica utilizzando approcci di frazionamento proteine e peptidi combinati in congiunzione con spettrometria di massa.

&#x30A4;&#x30CD; (&#x7C73;) &#x304B;&#x3089;&#x7A4D;&#x5206;&#x3068;&#x5468;&#x8FBA;&#x30D7;&#x30E9;&#x30BA;&#x30DE;&#x819C; (PM) &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F; 2 &#x3064;&#x306E;&#x76F8;&#x88DC;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x30A4;&#x30CD;&#x306E;&#x61F8;&#x6FC1;&#x6DB2;&#x304B;&#x3089;&#x5348;&#x5F8C;&#x5206;&#x6570;&#x3092;&#x8C4A;&#x304B;&#x306B;&#x3002;PM &#x6C34;&#x6027;&#x4E8C;&#x76F8;&#x5206;&#x914D;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x8C4A;&#x304B;&#x306B;&#x306A;&#x3063;&#x305F;&#x3068;&#x9AD8; pH &#x3068;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3068;&#x6C5A;&#x67D3;&#x3092;&#x524A;&#x9664;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x6D17;&#x6FEF;&#x3092;&#x70AD;&#x9178;&#x9175;&#x7D20;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x514D;&#x75AB;&#x5B66;&#x7684;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x7279;&#x5FB4;&#x3065;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3001;&#x70AD;&#x9178;&#x3092;&#x6D17;&#x3063;&#x305F; PM (WPM) &#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x5206;&#x89E3;&#x3084;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5206;&#x89E3;&#x5F37;&#x30AB;&#x30C1;&#x30AA;&#x30F3;&#x4EA4;&#x63DB;&#x6DB2;&#x4F53;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C8;&#x30B0;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC; (LC) &#x7D9A;&#x3044;&#x3066;&#x7D9A;&#x3044;&#x3066;&#x3069;&#x3061;&#x3089;&#x304B; 1 &#x6B21;&#x5143;&#x30B2;&#x30EB;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5; (1 D-SDS-PAGE) LC-MS/MS (&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x306E;&#x30B2;&#x30EB;-&#x6DB2;&#x6676;-MS/MS &#x3068; 2D LC MS/MS &#x3068;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;) &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3; &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x5F8C;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#x3068;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089; 2 &#x3064;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3001;438 &#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3068;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B; 2 &#x3064;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x4E00;&#x81F4;&#x3059;&#x308B;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x305F; 367 &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5358;&#x4E00;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x4E00;&#x81F4;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x5206;&#x6790;&#x5F8C; 2 &#x3064;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x691C;&#x7D22;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B4;&#x30EA;&#x30BA;&#x30E0;&#x3068;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089; 805 &#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x306E; 350 &#x6642;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x307E;&#x305F;&#x306F; PM &#x95A2;&#x9023;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3002;4 100 &#x3068; 20-5 &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; (53%) &#x3044;&#x305F;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066; 1 &#x3064;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x819C;&#x3068;&#x4E00;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B; (&#x6700;&#x5927; 16) &#x819C;&#x8CAB;&#x901A;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3001;GPI &#x30A2;&#x30F3;&#x30AB;&#x30FC;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x819C;&#x306B;&#x307E;&#x305F;&#x304C;&#x308B; &beta; &#x30D0;&#x30EC;&#x30EB;&#x3002;805 &#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x7D04; 80% &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x6A5F;&#x80FD;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3078;&#x306E;&#x985E;&#x4F3C;&#x6027;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x4E88;&#x6E2C;&#x95A2;&#x6570;&#x304C;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068; Atpase (14%), (21%) &#x306E; 805 &#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x306A;&#x3069;&#x5348;&#x5F8C;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7; &#xFF08;8 &#xFF05; &#xFF08;&#xFF09;&#x3001;&#x9060;&#x85E4; - &#x3068;&#x30A8;&#x30AD;&#x30BD;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x306B;&#x5C0F;&#x80DE;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x305F; (5%) &#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3057;&#x3001;3 &#x3064;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x306E; &#xFF08;CESA&#xFF09; &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A; D (CSLD) &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30AB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x7D04; 20% &#x306F;&#x819C;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306B;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x672A;&#x5206;&#x985E;&#x6B8B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;

&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C3;&#x30C9;&#x5206;&#x5225;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3068;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B6; &#x30B5;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D0;&#x539F;&#x5F62;&#x8CEA;&#x819C;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x3002;

&#xB192;&#xC740; Oryza sativa&#xB85C; &#xAD6C;&#xB098; (&#xC300;)&#xC5D0;&#xC11C; &#xC815;&#xC218; &#xBC0F; &#xC8FC;&#xBCC0; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; (&#xC624;&#xD6C4;) &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBC30;&#xC591;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xB294; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xBCF4;&#xC644;&#xC801;&#xC778; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4; &#xBC25; &#xC11C; &#xC2A4; &#xD39C; &#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC624;&#xD6C4; &#xBD84;&#xC218; &#xB18D;&#xCD95;. &#xC624;&#xD6C4;&#xB294; &#xC218;&#xC131; 2 &#xB2E8;&#xACC4; &#xBD84;&#xD560;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C; &#xD558; &#xACE0; &#xB192;&#xC740; pH &#xD0C4;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xC218;&#xC6A9; &#xC131; &#xC624;&#xC5FC; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC81C;&#xAC70; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xCC99; &#xBC0F; &#xD6A8;&#xC18C; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xC774; &#xD2B9;&#xC9D5;. &#xD0C4;&#xC0B0; &#xC53B;&#xC5B4; &#xC624;&#xD6C4; (WPM)&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; LC-MS/MS (&#xBD88;&#xB9AC; &#xC824;-LC-MS/MS&#xC640; 2D-LC-MS/MS, &#xAC01;&#xAC01;), tryptic &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xC758; &#xD6C4;&#xC18D; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xB450; 1 &#xCC28;&#xC6D0; &#xC824; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95; (1 D SDS &#xD398;&#xC774;&#xC9C0;), tryptic &#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4; &#xB610;&#xB294; &#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4; &#xB4A4;&#xC5D0; &#xAC15;&#xD55C; &#xC591;&#xC774;&#xC628; &#xAD50;&#xD658; &#xC561;&#xCCB4; &#xD06C;&#xB85C;&#xB9C8;&#xD1A0;&#xADF8;&#xB798;&#xD53C; (LC) &#xB2E4;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xBC29;&#xBC95;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xACB0;&#xD569;, 438 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB458; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xC77C;&#xCE58; &#xD558;&#xB294; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;, &#xCD94;&#xAC00; &#xAE30;&#xC900; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; 367 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; &#xAC80;&#xC0C9; &#xC54C;&#xACE0;&#xB9AC;&#xC998;&#xC73C;&#xB85C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBD84;&#xC11D; &#xD6C4; &#xB2E8;&#xC77C; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; &#xC77C;&#xCE58;&#xC5D0; &#xADFC;&#xAC70; &#xD558; &#xC5EC; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. 805&#xC774; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; 350 &#xC624;&#xD6C4; &#xB420; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xC608;&#xC0C1; &#xD588;&#xB2E4; &#xB610;&#xB294; &#xC624;&#xD6C4; &#xAD00;&#xB828; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. 4 &#xBC31; 25 &#xAC1C;&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (53%), &#xD558;&#xB098; &#xB610;&#xB294; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xD1B5;&#xD574; &#xB9C9; integrally &#xC5F0;&#xACB0; &#xB418;&#xB3C4;&#xB85D; &#xC608;&#xCE21; &#xD588;&#xB2E4; (&#xCD5C;&#xB300; 16) &#xB9C9; &#xD6A1;&#xB2E8; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;, GPI &#xC575;&#xCEE4; &#xB610;&#xB294; &#xB9C9;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCE5C; &#xBCA0;&#xD0C0; &#xBC30;&#xB7F4;. 805 &#xD655;&#xC778; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC57D; 80%&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xAE30;&#xB2A5; &#xB610;&#xB294; &#xAE30;&#xB2A5; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xC720;&#xC0AC;&#xC131;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xD568;&#xC218;&#xB97C; &#xD560;&#xB2F9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC804;&#xC1A1;&#xAE30;&#xC640; ATPases (14%), &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (805 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; 21%), &#xC2E0;&#xD638; &#xB4F1;&#xC758; &#xC624;&#xD6C4; &#xAD00;&#xB828; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xD558; &#xACE0; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC778;&#xC2E0; &#xB9E4;&#xB9E4; (8%), &#xC18C;&#xD3EC;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC5D4;&#xB3C4;-&#xBC0F; exocytosis, &#xCC38;&#xC5EC;&#xC640; &#xAC19;&#xC740; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD558;&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xB3C4; &#xD655;&#xC778;&#xB41C; (5%) &#xC774;&#xC5C8;&#xACE0;, 3 &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4; synthase (CESA) &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4; synthase &#xAC19;&#xC740; D (CSLD) &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, cellulases, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC5EC;&#xB7EC; callose synthases &#xD3EC;&#xD568;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC57D; 20% &#xC815;&#xB3C4; &#xB0A8;&#xC544; &#xB9C9; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC608;&#xC0C1; &#xB418;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD84;&#xB958; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740;.

&#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC640; &#xD568;&#xAED8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACB0;&#xD569; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBD84;&#xB958; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; Oryza sativa &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634;&#xC758; &#xBD84;&#xC11D;.

Para identificar las prote&iacute;nas integrales y perif&eacute;ricas membrana plasm&aacute;tica (PM) de Oryza sativa (arroz), altamente enriquecido PM fracciones de suspensi&oacute;n de arroz c&eacute;lulas cultivadas se analizaron dos enfoques complementarios. La PM se enriqueci&oacute; con la partici&oacute;n de dos fases acuosas y pH alto carbonato de lavado para eliminar las prote&iacute;nas solubles, contaminantes y caracterizado usando an&aacute;lisis enzim&aacute;ticos e inmunol&oacute;gicos. Prote&iacute;nas de la PM de lavado con carbonato (WPM) se analizaron por cualquiera electroforesis unidimensional (1D-SDS-PAGE) seguida de prote&oacute;lisis tr&iacute;ptica o prote&oacute;lisis seguido del fuerte intercambio cati&oacute;nico de la cromatograf&iacute;a l&iacute;quida (LC) con posterior an&aacute;lisis de los p&eacute;ptidos tr&iacute;pticos por LC-MS/MS (denominado Gel-LC-MS/MS y 2D-LC-MS/MS, respectivamente). La combinaci&oacute;n de los resultados de estos dos enfoques, 438 prote&iacute;nas fueron identificadas sobre la base de dos o m&aacute;s p&eacute;ptidos que empareja y otros 367 prote&iacute;nas fueron identificadas sobre la base de p&eacute;ptido solo partidos despu&eacute;s de an&aacute;lisis de datos con dos algoritmos de b&uacute;squeda independiente. De estas 805 prote&iacute;nas, 350 se predijo que PM o prote&iacute;nas asociadas a PM. Cuatrocientos y veinte y cinco prote&iacute;nas (53%) fueron predichas para ser integralmente asociado a una membrana, mediante uno o muchos dominios transmembrana (hasta 16), un anclaje GPI o barriles de beta que atraviesan la membrana. Aproximadamente el 80% de las prote&iacute;nas identificadas 805 asignaron una funci&oacute;n prevista, basada en la similitud con las prote&iacute;nas de funci&oacute;n conocida o la presencia de dominios funcionales. Prote&iacute;nas implicadas en actividades relacionadas con la PM como se&ntilde;alizaci&oacute;n (21% de las 805 prote&iacute;nas), transportadores y ATPasas (14%), y celular tr&aacute;fico (8%), como mediante ves&iacute;culas implicado en endo y exocitosis, fueron identificado. Prote&iacute;nas que participan en la bios&iacute;ntesis de la pared celular se tambi&eacute;n identificado (5%) e incluyeron tres prote&iacute;nas de celulosa sintasa (CESA), una prote&iacute;na de celulosa sintasa-como D (CSLD), celulasas y varios Sintasas de Callosa. Aproximadamente el 20% de las prote&iacute;nas identificadas en este estudio permaneci&oacute; funcionalmente sin clasificar a pesar de ser predijo que las prote&iacute;nas de la membrana.

An&aacute;lisis del proteoma Oryza sativa membrana plasm&aacute;tica mediante acercamientos de fraccionamiento de prote&iacute;nas y p&eacute;ptidos combinados junto con espectrometr&iacute;a de masas.

Rice (Oryza sativa cv Taipei 309) suspension culture cells (SCCs) were used as a simple, single cell model system to gain insights into the complex abscisic acid (ABA) signaling response pathways in plants. Following system establishment involving morphological observations and transcript profiling of genes known to be ABA responsive in planta, a comprehensive proteomic and metabolomic study was performed. A total of 759 buffer-soluble proteins that included 3284 peptides categorized into 656 protein families are reported. Using iTRAQ, only 36 of these proteins showed statistically significant changes in abundance in response to ABA. In addition, a GC-MS based metabolite profiling study allowed the identification of 148 metabolites that included 25 amino acids (AAs), 45 organic acids (OAs), 35 sugars, 19 fatty acids, 2 polyamines, 4 sterols, 5 sugar acids, 4 sugar alcohols, and 9 miscellaneous compounds. Of these, only 11 (8.8%) changed in a statistically significant manner in response to ABA treatment. These studies provide important insights into plant responses to ABA at the protein and metabolite level.

Proteomic and metabolic profiling of rice suspension culture cells as a model to study abscisic acid signaling response pathways in plants.

&#x6C34;&#x7A3B; (&#x7A3B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x4E1D;&#x4E1D;&#x7F15;&#x7F15; cv &#x53F0;&#x5317; 309) &#x60AC;&#x6D6E;&#x57F9;&#x517B;&#x7EC6;&#x80DE; (Scc) &#x88AB;&#x7528;&#x4F5C;&#x4E00;&#x79CD;&#x7B80;&#x5355;&#x3001; &#x5355;&#x4E00;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6A21;&#x578B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x6DF1;&#x5165;&#x4E86;&#x89E3;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x8131;&#x843D;&#x9178; (ABA) &#x4FE1;&#x53F7;&#x53CD;&#x5E94;&#x9014;&#x5F84;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x4E2D;&#x3002;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x6D89;&#x53CA;&#x5F62;&#x6001;&#x89C2;&#x6D4B;&#x548C;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5185;&#x5BB9;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5DF2;&#x77E5;&#x662F;&#x963F;&#x575D;&#x654F;&#x611F;&#x690D;&#x7269;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x540E;, &#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x5168;&#x9762;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x603B;&#x5171;&#x6709;&#x5305;&#x62EC; 3284 &#x80BD;&#x5206;&#x4E3A; 656 &#x86CB;&#x767D;&#x5BB6;&#x65CF;&#x7684; 759 &#x7F13;&#x51B2;&#x533A;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53EA;&#x6709; 36 &#x4F7F;&#x7528; iTRAQ&#xFF0C;&#x5728;&#x56DE;&#x5E94;&#x963F;&#x575D;&#x4E30;&#x5EA6;&#x8868;&#x660E;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x4E0A;&#x7684;&#x663E;&#x8457;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x6C14;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;-&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5;&#x57FA;&#x4E8E;&#x4EE3;&#x8C22;&#x4EA7;&#x7269;&#x5206;&#x6790;&#x5141;&#x8BB8; 148 &#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x4EA7;&#x7269;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5305;&#x62EC; 25 &#x4E2A;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178; (AAs)&#x3001; 45 &#x6709;&#x673A;&#x9178; &#xFF08;&#x7F8E;&#x6D32;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF09;&#x3001; 35 &#x7CD6;&#x3001; 19 &#x8102;&#x80AA;&#x9178;&#x3001; 2 &#x591A;&#x80FA;&#x3001; 4 &#x753E;&#x9187;&#x3001; 5 &#x7CD6;&#x9178;&#x3001; 4 &#x7CD6;&#x9187;&#x548C; 9 &#x6742;&#x9879;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x5176;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x53EA;&#x6709; 11 (8.8%) &#x5728;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x4E0A;&#x7684;&#x663E;&#x8457;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x5BF9;&#x963F;&#x575D;&#x6CBB;&#x7597;&#x7684;&#x53CD;&#x5E94;&#x4E2D;&#x66F4;&#x6539;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x89C1;&#x89E3;&#x690D;&#x7269;&#x5BF9;&#x963F;&#x575D;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x7269;&#x4E00;&#x7EA7;&#x54CD;&#x5E94;&#x3002;

&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x6C34;&#x7A3B;&#x60AC;&#x6D6E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x57F9;&#x517B;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6A21;&#x578B;&#x6765;&#x7814;&#x7A76;&#x8131;&#x843D;&#x9178;&#x4FE1;&#x53F7;&#x53CD;&#x5E94;&#x9014;&#x5F84;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x4E2D;&#x3002;

Cellules de culture de riz (Oryza sativa cv Taipei 309) suspension (SCC) ont &eacute;t&eacute; utilis&eacute;s comme syst&egrave;me mod&egrave;le simple, une seule cellule afin de mieux comprendre dans le complexe acide abscissique (ABA) signalisation des voies de r&eacute;ponse chez les plantes. Apr&egrave;s la mise en place de syst&egrave;me impliquant des observations morphologiques et profilage de transcription des g&egrave;nes connus pour &ecirc;tre des ABA responsive in planta, une &eacute;tude approfondie de la prot&eacute;omique et m&eacute;tabolomique a &eacute;t&eacute; r&eacute;alis&eacute;e. Un total de 759 prot&eacute;ines solubles dans le tampons qui comprenait des 3284 peptides class&eacute;es en 656 familles de prot&eacute;ines sont signal&eacute;s. Utilisez iTRAQ, seulement 36 de ces prot&eacute;ines ont montr&eacute; des changements statistiquement significatifs en abondance en r&eacute;ponse &agrave; l&#39;ABA. En outre, une GC-MS base metabolite profiling &eacute;tude a permis d&#39;identifier des 148 m&eacute;tabolites qui comprenait 25 acides amin&eacute;s (AA), 45 acides organiques (OEA), 35 sucres, 19 sortes d&#39;acides gras, 2 polyamines, 4 st&eacute;rols, 5 sucre acides, alcools de sucre 4 et 9 compos&eacute;s divers. De ce nombre, seulement 11 (8,8 %) a chang&eacute; de mani&egrave;re statistiquement significative dans la r&eacute;ponse au traitement ABA. Ces &eacute;tudes fournissent des renseignements importants sur les r&eacute;actions des plantes &agrave; ABA au niveau prot&eacute;ique et m&eacute;tabolite.

Prot&eacute;omiques et profils m&eacute;taboliques des cellules de culture de suspension de riz comme mod&egrave;le pour &eacute;tudier l&#39;acide abscissique signalisation des voies de r&eacute;ponse chez les plantes.

Reis (Oryza Sativa cv Taipei 309)-Federung-Kultur-Zellen (SCCs) dienten als einfache, einzelne Zelle Modellsystem, tiefere Einblicke in die komplexen Abscisic S&auml;ure (ABA) Signalisierung Antwort Wege in Pflanzen. Nach System Einrichtung mit morphologischen Beobachtungen und Transkript Profilerstellung von Genen, die bekannterma&szlig;en ABA in Planta reagieren wurde eine umfassende Proteomic und metabolische Studie durchgef&uuml;hrt. Insgesamt 759 Puffer-l&ouml;sliche Proteine, die enthalten 3284 Peptide in 656 Proteinfamilien kategorisiert werden gemeldet. Mit iTRAQ, zeigte nur 36 dieser Proteine statistisch signifikante &Auml;nderungen in H&uuml;lle und F&uuml;lle in Reaktion auf ABA. Dar&uuml;ber hinaus basiert ein GC-MS Metabolit Profilerstellung Studie erlaubt die Identifizierung von 148 Metaboliten, die 25 Aminos&auml;uren (AAs), 45 organische S&auml;uren (OAs), 35 Zucker 19 Fetts&auml;uren, 2 Polyamine, 4 Sterole, 5 Zucker S&auml;uren, 4 Zuckeralkoholen und 9 verschiedene Verbindungen enthalten. Von diesen ver&auml;ndert nur 11 (8,8 %) in statistisch signifikanter Weise in Reaktion auf die Behandlung von ABA. Diese Studien liefern wichtige Erkenntnisse der Pflanze Antworten zu ABA auf der Ebene von Proteinen und Metaboliten.

Proteomic und metabolic profiling von Reis Aussetzung Kultur-Zellen als Modell Abscisic S&auml;ure Signalisierung Antwort Wege in Anlagen zu studieren.

Cellule di coltura di riso (Oryza sativa cv Taipei 309) sospensione (SCCs) sono state utilizzate come sistema di modello semplice, singola cella per acquisire conoscenze nel complesso acido abscissico (ABA), vie di risposta negli impianti di segnalazione. Istituzione del sistema che coinvolgono le osservazioni morfologiche e profilatura di trascrizione dei geni noti per essere reattivo in planta ABA, a seguito di uno studio completo di proteomica e metabolomica &egrave; stato eseguito. Un totale di 759 proteine solubili in tampone che comprendeva 3284 peptidi categorizzati in 656 famiglie proteiche vengono segnalati. Utilizzando iTRAQ, solo 36 di queste proteine hanno mostrato variazioni statisticamente significative in abbondanza in risposta all&#39;ABA. Inoltre, un GC-MS basato metabolita profilatura studio ha permesso l&#39;identificazione di 148 metaboliti che comprendeva 25 aminoacidi (AAs), 45 acidi organici (OAs), 35 zuccheri, acidi grassi 19, 2 poliammine, 4 steroli, 5 zucchero acidi, 4 alditoli e 9 composti varie. Di questi, solo 11 (8,8%) cambiato in modo statisticamente significativo in risposta al trattamento con ABA. Questi studi forniscono importanti intuizioni risposte pianta ABA a livello di proteine e metaboliti.

Proteomic e profilo metabolico di riso cellule di coltura di sospensione come un modello per studiare l&#39;acido abscissico vie risposta negli impianti di segnalazione.

&#x30A4;&#x30CD; (Oryza sativa cv &#x53F0;&#x5317; 309) &#x61F8;&#x6FC1;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE; (Scc) &#x306F;&#x3001;&#x5358;&#x7D14;&#x306A;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB; &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30A2;&#x30D6;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x9178; (ABA) &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3067;&#x690D;&#x7269;&#x306B;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x529B;&#x3092;&#x5F97;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5F62;&#x614B;&#x5B66;&#x7684;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3068; ABA planta &#x3067;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3059;&#x308B;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x78BA;&#x7ACB;&#x5F8C;&#x306F;&#x3001;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30E1;&#x30BF;&#x30DC;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;656 &#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x306B;&#x5206;&#x985E;&#x3055;&#x308C;&#x305F; 3284 &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066; 759 &#x306E;&#x30D0;&#x30C3;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5408;&#x8A08;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;ITRAQ &#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x552F;&#x4E00;&#x306E; 36 &#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066; ABA &#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;GC MS &#x4EE3;&#x8B1D;&#x7269;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x7814;&#x7A76; 25 &#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178; &#xFF08;AAs&#xFF09;&#x3001;45 &#x6709;&#x6A5F;&#x9178; (OAs), 35 &#x7CD6;&#x3001;19 &#x8102;&#x80AA;&#x9178;&#x3001;2 &#x30DD;&#x30EA;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x3001;4 &#x30B9;&#x30C6;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;, 5 &#x7CD6;&#x9178;&#x3001;4 &#x7CD6;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30EB;&#x3001;9 &#x305D;&#x306E;&#x4ED6;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066; 148 &#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7269;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x304F;&#x3060;&#x3055;&#x3044;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066; ABA &#x51E6;&#x7406;&#x3067;&#x552F;&#x4E00; 11 &#xFF08;8.8 &#xFF05;&#xFF09; &#x3092;&#x5909;&#x66F4;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3068;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7269;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E; ABA &#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x3068;&#x30E1;&#x30BF;&#x30DC;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF; &#x30FB; &#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x61F8;&#x6FC1;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x30A2;&#x30D6;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x9178;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x5FDC;&#x7B54;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3067;&#x690D;&#x7269;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x7C73;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xC300; (Oryza sativa &#xC774;&#xB825;&#xC11C; &#xD0C0;&#xC774;&#xD398;&#xC774; 309) &#xC11C; &#xC2A4; &#xD39C; &#xC158; &#xBB38;&#xD654; &#xC140; (Scc) &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5; &#xACBD;&#xB85C; &#xC2E0;&#xD638; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; abscisic &#xC0B0; (ABA)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC5BB;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xAC04;&#xB2E8; &#xD558; &#xACE0;, &#xB2E8;&#xC77C; &#xC140; &#xBAA8;&#xB378; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xAD6C;&#xCD95; &#xD615;&#xD0DC; &#xAD00;&#xCC30; &#xBC0F; &#xC0AC;&#xBCF8; ABA planta&#xC5D0;&#xC11C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC131;&#xC774; &#xB6F0;&#xC5B4;&#xB09C; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568;, &#xB2E4;&#xC74C;&#xACFC; &#xAC19;&#xC740; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; metabolomic &#xBC0F; proteomic &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC218;&#xD589; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD1D; 656 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAC00;&#xC871;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD84;&#xB958; 3284 &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; 759 &#xBC84;&#xD37C; &#xC218;&#xC6A9; &#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. Itraq&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC720;&#xC77C;&#xD55C; 36 ABA&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC758; &#xD55C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, GC MS &#xAE30;&#xBC18; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xC5F0;&#xAD6C; 25 &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; (AAs), 45 &#xC720;&#xAE30; &#xC0B0; (OAs), 35 &#xC124;&#xD0D5;, 19 &#xC9C0;&#xBC29;&#xC0B0;, 2 polyamines, 4 &#xC2A4; &#xD14C; &#xB864;, 5 &#xC124;&#xD0D5; &#xC0B0;, &#xC54C;&#xCF5C;, &#xC124;&#xD0D5; 4 9 &#xAE30;&#xD0C0; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xD3EC;&#xD568; 148 &#xB300;&#xC0AC; &#xC0B0;&#xBB3C;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC744; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xC0AC; &#xC0B0;&#xBB3C;. &#xC774;&#xB4E4; &#xC911;,&#xB9CC; 11 (8.8%) ABA &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC758; &#xD55C; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCC0;&#xACBD;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; &#xB300;&#xC0AC; &#xC0B0;&#xBB3C; &#xC218;&#xC900; ABA&#xC5D0; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB300;&#xC0AC; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xBC0F; Proteomic abscisic &#xC0B0; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5; &#xACBD;&#xB85C; &#xC2E0;&#xD638; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xBAA8;&#xB378;&#xB85C; &#xC11C; &#xC2A4; &#xD39C; &#xC158; &#xBB38;&#xD654; &#xC140; &#xC300;.

C&eacute;lulas en cultivo arroz (Oryza sativa cv Taipei 309) suspensi&oacute;n (SCCs) fueron utilizadas como un sistema de c&eacute;lula simple, un solo modelo para ganar penetraciones en el complejo de &aacute;cido absc&iacute;sico (ABA) v&iacute;as de respuesta en las plantas de se&ntilde;alizaci&oacute;n. Tras el establecimiento del sistema que implica observaciones morfol&oacute;gicas y perfiles de la transcripci&oacute;n de genes conocidos que respondan en la planta de ABA, se realiz&oacute; un estudio exhaustivo de la prote&oacute;mica y metabol&oacute;mica. Se reportan un total de 759 prote&iacute;nas solubles en b&uacute;fer que inclu&iacute;a 3284 p&eacute;ptidos clasificados en 656 familias de prote&iacute;nas. Usando iTRAQ, s&oacute;lo 36 de estas prote&iacute;nas mostraron cambios estad&iacute;sticamente significativos en abundancia en respuesta a ABA. Adem&aacute;s, un GC-MS base metabolito perfiles estudio permitida la identificaci&oacute;n de 148 metabolitos que inclu&iacute;a 25 amino&aacute;cidos (AAs), 45 &aacute;cidos org&aacute;nicos (OEA), 35 az&uacute;cares, 19 &aacute;cidos grasos, 2 poliaminas, 4 esteroles, 5 &aacute;cidos de az&uacute;car, 4 alcoholes de az&uacute;car y 9 diversos compuestos. De &eacute;stos, s&oacute;lo 11 (8,8%) cambi&oacute; de manera estad&iacute;sticamente significativa en la respuesta al tratamiento de ABA. Estos estudios proporcionan conocimientos profundos e importantes en las respuestas de la planta a ABA en el nivel de prote&iacute;na y metabolitos.

Prote&oacute;micos y perfiles metab&oacute;licos de c&eacute;lulas en cultivo suspensi&oacute;n de arroz como un modelo para el estudio de &aacute;cido absc&iacute;sico v&iacute;as de respuesta en las plantas de se&ntilde;alizaci&oacute;n.

Alveolates (&#x7EA4;&#x6BDB;&#x866B;&#x3001; apicomplexans &#x548C;&#x6DA1;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;) &#x7684;&#x836F;&#x819C;&#x5171;&#x4EAB;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5171;&#x540C;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x4F46;&#x6267;&#x884C;&#x975E;&#x5E38;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x52A8;&#x529B;&#x3001; &#x4FB5;&#x5165;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x76D4;&#x7532;&#x3002;&#x95ED;&#x5B54;&#x8702;&#x7A9D;&#x72B6;&#x7684;&#x8584;&#x819C;&#x7EC4;&#x6210;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x6241;&#x5E73;&#x7684;&#x819C;&#x56CA; &#xFF08;&#x817A;&#x6CE1;&#xFF0C;&#x662F;&#x96C6;&#x56E2;&#x7684;&#x7279;&#x8272;&#xFF09; &#x4F4E;&#x4E8E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x819C;&#x6240;&#x652F;&#x6301;&#x7684;&#x819C;&#x9AA8;&#x67B6;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x7F51;&#x7EDC;&#x7684;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x548C;&#x4E1D;&#x72B6;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x5143;&#x7D20;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x6700;&#x8FD1;&#x8868;&#x660E;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;alveolins&#xFF0C;&#x5171;&#x540C;&#x548C;&#x72EC;&#x6709;&#x7684; alveolates &#x6B64;&#x8584;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x6807;&#x8BC6;&#x6B64;&#x7ED3;&#x6784;&#x4F5C;&#x51FA;&#x8D21;&#x732E;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x8584;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x8FDB;&#x884C;&#x7EA4;&#x6BDB;&#x866B;&#x55DC;&#x70ED;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0; 1,173 &#x76F8;&#x5173;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x7684; 45%(529 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;) &#x4EE3;&#x8868;&#x5230;&#x5176;&#x4ED6;&#x65B0;&#x578B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E0D;&#x5339;&#x914D;&#x7684;&#x60C5;&#x51B5;&#x4E0B;&#x529F;&#x80FD;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x878D;&#x5408;&#x6784;&#x5EFA;&#x56DB;&#x4E2A;&#x65B0;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x55DC;&#x70ED; T.&#x8584;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x8584;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x548C;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4F4D;&#x4E8E;&#x53E3;&#x8154;&#x7684;&#x5668;&#x5177;&#x3002;&#x751F;&#x7269;&#x4FE1;&#x606F;&#x5B66;&#x5206;&#x6790;&#x540E;&#x53D1;&#x73B0; 21%&#x7684;&#x5047;&#x5B9A;&#x7684;&#x8584;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x4E3A;&#x4E3B;&#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x5185;&#x8F7D;&#x6709;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x6B8B;&#x7559;&#x7269; (K&#x3001; E&#x3001; Q&#x3001; L&#x3001; &#x6211;&#xFF0C;&#x548C; V&#xFF09; &#x5F3A;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x504F;&#x89C1;&#x7684;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x91CD;&#x590D;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;T.&#x55DC;&#x70ED;&#x65B0;&#x578B;&#x86CB;&#x767D;&#x662F;&#x4E0E; apicomplexan &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x76F8;&#x6BD4;&#xFF0C;278 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E0E;&#x9AD8;&#x5E8F;&#x5217;&#x76F8;&#x4F3C;&#x6027;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x8BB8;&#x591A;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5047;&#x5B9A;&#x7684;&#x8584;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x5728; alveolates &#x4E4B;&#x95F4;&#x5171;&#x4EAB;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5171;&#x4EAB;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;126 &#x6240;&#x8F7D;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x91CD;&#x590D;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;&#x4E24;&#x4E2A;&#x8FD9;&#x79CD;&#x86CB;&#x767D;&#x5728;&#x5F13;&#x5F62;&#x866B;&#x7684;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x5176;&#x4F5C;&#x7528;&#x5728;&#x8584;&#x819C;&#x548C;&#x505A;&#x5982;&#x6B64;&#x786E;&#x5B9A; apicomplexan &#x521B;&#x7ED3;&#x6784;--&#x5C16;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A;&#x65B0;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7B5B;&#x67E5;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x4E2D;&#x7684;&#x91CD;&#x590D;&#x57DF;&#x663E;&#x793A;&#x5927;&#x548C;&#x79EF;&#x6781;&#x53D1;&#x5C55;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x7684;&#x8FD9;&#x79CD;&#x86CB;&#x767D;&#x7684; alveolates&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x5DE9;&#x56FA;&#x7684;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x548C;&#x5176;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x8584;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x5B9E;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;

&#x7EA4;&#x6BDB;&#x866B;&#x8584;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x6807;&#x8BC6;&#x7279;&#x6027;&#x7684;&#x91CD;&#x590D;&#x56FE;&#x6848;&#x6240;&#x5171;&#x6709;&#x7684; alveolates &#x65B0;&#x578B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x3002;

The pellicles of alveolates (ciliates, apicomplexans, and dinoflagellates) share a common organization, yet perform very divergent functions, including motility, host cell invasion, and armor. The alveolate pellicle consists of a system of flattened membrane sacs (alveoli, which are the defining feature of the group) below the plasma membrane that is supported by a membrane skeleton as well as a network of microtubules and other filamentous elements. We recently showed that a family of proteins, alveolins, are common and unique to this pellicular structure in alveolates. To identify additional proteins that contribute to this structure, a pellicle proteome study was conducted for the ciliate Tetrahymena thermophila. We found 1,173 proteins associated with this structure, 45% (529 proteins) of which represented novel proteins without matches to other functionally characterized proteins. Expression of four newly identified T. thermophila pellicular proteins as green fluorescent protein-fusion constructs confirmed pellicular location, and one new protein located in the oral apparatus. Bioinformatic analysis revealed that 21% of the putative pellicular proteins, predominantly the novel proteins, contained highly repetitive regions with strong amino acid biases for particular residues (K, E, Q, L, I, and V). When the T. thermophila novel proteins were compared with apicomplexan genomic data, 278 proteins with high sequence similarity were identified, suggesting that many of these putative pellicular components are shared between the alveolates. Of these shared proteins, 126 contained the distinctive repeat regions. Localization of two such proteins in Toxoplasma gondii confirmed their role in the pellicle and in doing so identified two new proteins of the apicomplexan invasive structure--the apical complex. Screening broadly for these repetitive domains in genomic data revealed large and actively evolving families of such proteins in alveolates, suggesting that these proteins might underpin the diversity and utility of their unique pellicular structure.

Ciliate pellicular proteome identifies novel protein families with characteristic repeat motifs that are common to alveolates.

Les pellicules de d (cili&eacute;s, apicomplexans et dinoflagell&eacute;s) partagent une organisation commune, encore accomplir des missions tr&egrave;s divergentes, notamment la motilit&eacute;, invasion des cellules h&ocirc;tes et armure. La pellicule alv&eacute;ol&eacute;e se compose d&#39;un syst&egrave;me de sacs aplatis de membrane (alv&eacute;oles, qui sont la caract&eacute;ristique d&eacute;terminante du groupe) au-dessous de la membrane plasmique qui est soutenue par un squelette de membrane, mais aussi un r&eacute;seau de microtubules et autres &eacute;l&eacute;ments filamenteuses. R&eacute;cemment, nous avons montr&eacute; qu&#39;une famille de prot&eacute;ines, alveolins, sont communs et uniques &agrave; cette structure pelliculaires dans d. Pour identifier les prot&eacute;ines compl&eacute;mentaires qui contribuent &agrave; cette structure, le cili&eacute; Tetrahymena thermophila a effectu&eacute; une &eacute;tude de proteome pellicule. Nous avons trouv&eacute; 1 173 prot&eacute;ines associ&eacute;es &agrave; cette structure, 45 % (529 prot&eacute;ines) dont repr&eacute;sent&eacute; des prot&eacute;ines nouvelles sans allumettes autres fonctionnellement caract&eacute;risent les prot&eacute;ines. Expression de quatre nouvellement identifi&eacute;s T. thermophila pelliculaires prot&eacute;ines fusion prot&eacute;ine fluorescente verte construit confirm&eacute;es pelliculaires emplacement et une nouvelle prot&eacute;ine situ&eacute; dans l&#39;appareil par voie orale. L&#39;analyse bioinformatique a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que 21 % des prot&eacute;ines pelliculaires putatifs, principalement les prot&eacute;ines nouvelles, contenaient des r&eacute;gions hautement r&eacute;p&eacute;titifs avec acide amin&eacute; fort biais pour les r&eacute;sidus de particuliers (K, E, Q, L, I et V). Lorsque les prot&eacute;ines nouvelles de T. thermophila ont &eacute;t&eacute; compar&eacute;s avec les donn&eacute;es g&eacute;nomiques APICOMPLEXES, 278 prot&eacute;ines avec similarit&eacute; de s&eacute;quence tr&egrave;s ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s, ce qui laisse supposer que plusieurs de ces composants pelliculaires putatifs sont partag&eacute;s entre le d. Ces prot&eacute;ines partag&eacute;es, 126 contenaient les r&eacute;gions de r&eacute;p&eacute;tition distinctives. Localisation de deux de ces prot&eacute;ines &agrave; Toxoplasma gondii ont confirm&eacute; que leur r&ocirc;le dans la pellicule et faisant ainsi identifi&eacute; deux nouvelles prot&eacute;ines de la structure invasive APICOMPLEXES--le complexe apical. Criblage large pour ces domaines r&eacute;p&eacute;titives de donn&eacute;es g&eacute;nomiques a r&eacute;v&eacute;l&eacute; des familles nombreuses et activement en &eacute;volution de telles prot&eacute;ines dans d, ce qui sugg&egrave;re que ces prot&eacute;ines pourraient sous-tendre la diversit&eacute; et l&#39;utilit&eacute; de leur structure unique pelliculaires.

Cili&eacute; proteome pelliculaires identifie les familles de la nouvelle prot&eacute;ine avec des motifs de r&eacute;p&eacute;tition caract&eacute;ristiques communes &agrave; d.

Die Pellicles von Alveolates (Wimpertierchen, Apicomplexans und Dinoflagellaten) teilen eine gemeinsame Marktorganisation, dennoch sehr unterschiedlichen Aufgaben, einschlie&szlig;lich der Motilit&auml;t, Host Invasion und R&uuml;stung. Der Alveolata Kahmhaut besteht aus einem System von abgeflachten Membran T&uuml;ten (Alveolen, die das bestimmende Merkmal der Gruppe sind) unterhalb der Plasmamembran, die durch eine Membran-Skelett sowie ein Netzwerk von Mikrotubuli und anderen faserigen Elementen unterst&uuml;tzt wird. Wir haben k&uuml;rzlich gezeigt, dass eine Familie von Proteinen, Alveolins, sind h&auml;ufig und einzigartig f&uuml;r diese einzigartige Struktur in Alveolates. Um zus&auml;tzliche Proteine zu identifizieren, die zu dieser Struktur beitragen, wurde eine Kahmhaut Proteom-Studie f&uuml;r die Wimpertierchen Tetrahymena Thermophila durchgef&uuml;hrt. Wir fanden, dass 1.173 Proteine verbunden mit dieser Struktur, von denen 45 % (529 Proteine) neuartige Proteine ohne Treffern auf andere funktionell vertreten Proteine charakterisiert. Ausdruck der vier neu identifizierte T. Thermophila einzigartige Proteine best&auml;tigt wie gr&uuml;n fluoreszierendes Protein-Fusion erstellt einzigartige Lage und ein neues Protein befindet sich in der m&uuml;ndlichen Apparat. Bioinformatische Analyse ergab, dass 21 % der vermeintlichen einzigartige Proteine, vor allem die neuartige Proteine, stark repetitive Regionen mit starken Aminos&auml;ure Verzerrungen f&uuml;r bestimmte R&uuml;ckst&auml;nde (K, E, Q, L, I und V) enthalten. Wenn T. Thermophila neuartige Proteine mit Apicomplexan genomischen Daten verglichen wurden, wurden 278 Proteine mit hoher Sequenz &Auml;hnlichkeit identifiziert, was darauf hindeutet, dass viele dieser vermeintlichen einzigartige Komponenten, zwischen den Alveolates geteilt werden. Dieser freigegebenen Proteine enthalten 126 die unverwechselbare Wiederholbereiche. Lokalisierung von zwei solche Proteine in Toxoplasma Gondii best&auml;tigt, dass ihre Rolle in der Kahmhaut und dabei zwei neue Proteine der Apicomplexan invasive Struktur--der apikalen Komplex so identifizieren. Screening im gro&szlig;en und ganzen f&uuml;r diese repetitiven Dom&auml;nen in genomischen Daten ergab gro&szlig;e und aktiv sich entwickelnden Familien solcher Proteine in Alveolates, was darauf hindeutet, dass diese Proteine die Vielfalt und den Nutzen von ihrer einzigartigen einzigartige Struktur st&uuml;tzen k&ouml;nnte.

Wimpertierchen einzigartige Proteom bezeichnet Roman Proteinfamilien mit charakteristischen wiederholen Motive, die Alveolates gemeinsam sind.

Il pellicles di alveolates (ciliati, apicomplexans e dinoflagellati) condividono un&#39;organizzazione comune, ancora svolgere funzioni molto divergenti, compreso armatura motilit&agrave; e invasione delle cellule ospite. La pellicola alveolata &egrave; costituito da un sistema di sacche di membrana appiattita (alveoli, che sono la caratteristica distintiva del gruppo) di sotto della membrana plasmatica che &egrave; sostenuta da uno scheletro di membrana, nonch&eacute; una rete di microtubuli e altri elementi filamentosi. Abbiamo recentemente dimostrato che una famiglia di proteine, alveolins, sono comuni e unico di questa struttura pellicolare in alveolates. Per identificare le proteine supplementari che contribuiscono a questa struttura, &egrave; stato condotto uno studio del proteoma di pellicola per i ciliati Tetrahymena thermophila. Abbiamo trovato 1.173 proteine associate con questa struttura, 45% (529 proteine) di cui rappresentato romanzo proteine senza partite agli altri funzionalmente caratterizzato le proteine. Espressione di quattro recentemente identificate T. thermophila pellicolare proteine come fusion proteina fluorescente verde costruisce confermato pellicolare posizione e una nuova proteina che si trova nell&#39;apparato orale. L&#39;analisi bioinformatica ha rivelato che 21% delle proteine pellicolare putative, principalmente proteine del romanzo, contenuti altamente ripetitive regioni con forte dell&#39;amminoacido pregiudizi per particolari residui (K, E, Q, L, I e V). Quando le proteine romanzo di T. thermophila sono state confrontate con dati genomici Apicomplexa, 278 proteine con somiglianza di sequenza alta sono state identificate, suggerendo che molti di questi componenti pellicolare putativi sono condivisi tra i alveolates. Di queste proteine condivise, 126 contenute le regioni di ripetizione distintive. Localizzazione delle due tali proteine di Toxoplasma gondii ha confermato il che loro ruolo nella pellicola e facendo cos&igrave; identificati due nuove proteine della struttura invasiva Apicomplexa - il complesso apicale. Screening ampiamente per questi domini ripetitivi di dati genomici rivelato attivamente in continua evoluzione e grandi famiglie di tali proteine in alveolates, suggerendo che queste proteine potrebbero sostenere la diversit&agrave; e l&#39;utilit&agrave; della loro unica struttura pellicolare.

Ciliato proteome pellicolare identifica famiglie proteiche romanzo con caratteristici motivi ripetere che sono comuni a alveolates.

&#x30DA;&#x30EA;&#x30AF;&#x30EB; alveolates (&#x7E4A;&#x6BDB;&#x866B;&#x3001;apicomplexans&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;) &#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;&#x904B;&#x52D5;&#x3001;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x7D30;&#x80DE;&#x6D78;&#x6F64;&#x3084;&#x93A7;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x767A;&#x6563;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x5B9F;&#x884C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CF;&#x30C1;&#x306E;&#x5DE3;&#x72B6;&#x306E;&#x30DA;&#x30EA;&#x30AF;&#x30EB;&#x819C;&#x9AA8;&#x683C;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x3068;&#x7CF8;&#x72B6;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x306E;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x304C;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x539F;&#x5F62;&#x8CEA;&#x819C;&#x4E0B;&#x5E73;&#x5766;&#x819C;&#x6C17;&#x56A2; &#xFF08;&#x80BA;&#x80DE;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x306E;&#x7279;&#x5FB4;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#xFF09; &#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x3067;&#x69CB;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;alveolins&#x3001;&#x5BB6;&#x65CF;&#x304C;&#x5171;&#x901A;&#x3068;&#x3053;&#x306E; pellicular &#x69CB;&#x9020;&#x306E; alveolates &#x306B;&#x56FA;&#x6709;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x4F53;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x3059;&#x308B;&#x8FFD;&#x52A0;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x7E4A;&#x6BDB;&#x866B;&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30D2;&#x30E1;&#x30CA;&#x306E;&#x30DA;&#x30EA;&#x30AF;&#x30EB; &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F; 45% (529 &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#xFF09; &#x306F;&#x65B0;&#x898F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C1;&#x306A;&#x3057;&#x4ED6;&#x306B;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x8868;&#x3055;&#x3053;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x305F; 1,173 &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x304C;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7DD1;&#x8272;&#x86CD;&#x5149;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x878D;&#x5408;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3057;&#x307E;&#x3059; 4 &#x3064;&#x65B0;&#x305F;&#x306B;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F; t. &#x6E29;&#x5EA6;&#x306E; pellicular &#x86CB;&#x767D;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x3001;pellicular &#x306E;&#x5834;&#x6240;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x53E3;&#x8154;&#x88C5;&#x7F6E;&#x5185;&#x306B;&#x3042;&#x308B; 1 &#x3064;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3002;Bioinformatic &#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;21 &#xFF05; &#x306E;&#x63A8;&#x5B9A; pellicular &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x4E3B;&#x306B;&#x65B0;&#x898F;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;&#x53CD;&#x5FA9;&#x6027;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x5730;&#x57DF;&#x7279;&#x5B9A;&#x6B8B;&#x57FA; (K, E&#x3001;Q&#x3001;L&#x3001;I&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; V) &#x306E;&#x5F37;&#x3044;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x30D0;&#x30A4;&#x30A2;&#x30B9;&#x3068;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;T. &#x6E29;&#x5EA6;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; apicomplexan &#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x304D;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x63A8;&#x5B9A; pellicular &#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x9593; alveolates &#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066; 278 &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x9AD8;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x985E;&#x4F3C;&#x6027;&#x3068;&#x304C;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x5171;&#x6709;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E; 126 &#x72EC;&#x7279;&#x306E;&#x30EA;&#x30D4;&#x30FC;&#x30C8;&#x9818;&#x57DF;&#x306B;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30C8;&#x30AD;&#x30BD; &#x30D7;&#x30E9;&#x30BA;&#x30DE;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x306E; 2 &#x3064;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3001;&#x30DA;&#x30EA;&#x30AF;&#x30EB;&#x3001;&#x4F55;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x306F;&#x305D;&#x3046;&#x4FB5;&#x8972;&#x69CB;&#x9020;&#x306E; apicomplexan--&#x9802;&#x306E;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E; 2 &#x3064;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5E83;&#x304F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x53CD;&#x5FA9;&#x7684;&#x306A;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; genomic &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3067;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x3068;&#x72EC;&#x81EA;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306E; pellicular &#x306E;&#x30E6;&#x30FC;&#x30C6;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C6;&#x30A3;&#x3092;&#x652F;&#x3048;&#x308B;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506; alveolates &#x305D;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x5927;&#x3068;&#x7A4D;&#x6975;&#x7684;&#x306B;&#x9032;&#x5316;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5BB6;&#x65CF;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x7E4A;&#x6BDB;&#x866B; pellicular &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x65B0;&#x898F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5BB6;&#x65CF; alveolates &#x306B;&#x5171;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x7279;&#x6027;&#x306E;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057;&#x306E;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Alveolates (ciliates, apicomplexans, &#xBC0F; dinoflagellates) pellicles &#xACF5;&#xC720; &#xD558;&#xB294; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC870;&#xC9C1; &#xC544;&#xC9C1; &#xC6B4;&#xB3D9; &#xC131;, &#xAC11;&#xC637;, &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC140; &#xCE68;&#xACF5; &#xB4F1; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xC218;&#xD589; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Alveolate &#xBC15;&#xB9C9; &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; &#xD574;&#xACE8; microtubules &#xBC0F; &#xAE30;&#xD0C0; filamentous &#xC694;&#xC18C;&#xC758; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xB418;&#xB294; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; &#xC544;&#xB798; &#xD3C9;&#xD3C9;&#xD55C; &#xB9C9; &#xB0AD; (&#xD3D0;, &#xADF8;&#xB8F9;&#xC758; &#xC815;&#xC758; &#xD2B9;&#xC9D5;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;) &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xAD6C;&#xC131;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xCD5C;&#xADFC; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, alveolins, &#xAC00;&#xC871;&#xC740; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; alveolates&#xC5D0;&#xC11C; pellicular &#xAD6C;&#xC870;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xC774; &#xAD6C;&#xC870;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC; &#xD558;&#xB294; &#xCD94;&#xAC00; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBC15;&#xB9C9; &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; ciliate Tetrahymena thermophila&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E4;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; 1173 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; 45% (529 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;)&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC77C;&#xCE58; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xB294; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294;&#xC774; &#xAD6C;&#xC870;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC1C;&#xACAC;. 4 &#xC0C8;&#xB85C; &#xD655;&#xC778;&#xB41C; &#xB41C; T. thermophila pellicular &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC73C;&#xB85C; &#xB179;&#xC0C9; &#xD615;&#xAD11; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;-&#xD4E8;&#xC804; &#xC0DD;&#xC131; pellicular &#xC704;&#xCE58; &#xBC0F; &#xAD6C;&#xAC15; &#xC7A5;&#xCE58;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD588;&#xB2E4;. Bioinformatic &#xBD84;&#xC11D; &#xC0C1; pellicular &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC8FC;&#xB85C; &#xC18C;&#xC124; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; 21% &#xD3EC;&#xD568; &#xD2B9;&#xC815; &#xC794;&#xB958;&#xBB3C; (K, E, Q, L, I, &#xBC0F; V)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC15;&#xD55C; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xBC14;&#xC774;&#xC5B4;&#xC2A4;&#xC640; &#xB192;&#xC740; &#xBC18;&#xBCF5; &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. T. thermophila &#xC18C;&#xC124; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; apicomplexan &#xAC8C;&#xB188; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBE44;&#xAD50; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xB54C; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C1; pellicular &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; alveolates &#xC0AC;&#xC774; &#xACF5;&#xC720; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; 278 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB192;&#xC740; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC720;&#xC0AC;&#xC131;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACF5;&#xC720; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; 126 &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xBC18;&#xBCF5; &#xC601;&#xC5ED;&#xC774; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C;. &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; Toxoplasma gondii&#xC5D0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC740; &#xC798; &#xACE0; &#xD558; &#xACE0; &#xADF8;&#xB798;&#xC11C; apicomplexan &#xCE68;&#xB7B5; &#xC801; &#xAD6C;&#xC870;-&#xD600;&#xB05D; &#xBCF5;&#xC7A1;&#xC758; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD655;&#xC778; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC18;&#xBCF5;&#xC801;&#xC778; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xAC8C;&#xB188; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xC0C1;&#xC601; alveolates, &#xB2E4;&#xC591;&#xC131; &#xBC0F; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; pellicular &#xAD6C;&#xC870; &#xC720;&#xD2F8;&#xB9AC;&#xD2F0;&#xAC00;&#xC774; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBCF4;&#xAC15; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC81C;&#xC548;&#xC5D0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD06C;&#xACE0; &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9C4;&#xD654; &#xAC00;&#xC871;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;.

Ciliate pellicular &#xD504;&#xB85C;&#xD14C;&#xC634; alveolates&#xC5D0; &#xACF5;&#xD1B5; &#xB41C; &#xD2B9;&#xC131; &#xBC18;&#xBCF5; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xB85C; &#xC18C;&#xC124; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAC00;&#xC871;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los pellicles de alveolados (ciliados, Apicomplexa y dinoflagelados) compartan una organizaci&oacute;n com&uacute;n, pero realizan funciones muy divergentes, motilidad, invasi&oacute;n de la c&eacute;lula hu&eacute;sped, y armadura. La pel&iacute;cula Alveolata consiste en un sistema de sacos de membrana aplanada (alv&eacute;olos, que son la caracter&iacute;stica definitoria del grupo) por debajo de la membrana plasm&aacute;tica que es apoyada por un esqueleto de membrana, as&iacute; como una red de microt&uacute;bulos y otros elementos filamentosos. Recientemente hemos mostrado que una familia de prote&iacute;nas, alveolins, son comunes y &uacute;nicas a esta estructura pelicular en alveolados. Para identificar prote&iacute;nas adicionales que contribuyen a esta estructura, se realiz&oacute; un estudio de proteoma de pel&iacute;cula para el ciliado Tetrahymena thermophila. Encontramos 1.173 prote&iacute;nas relacionadas con esta estructura, 45% (529 prote&iacute;nas) de los cuales representan nuevas prote&iacute;nas sin partidos s&iacute; funcionalmente caracterizan prote&iacute;nas. Expresi&oacute;n de cuatro nuevamente identificadas T. thermophila pelicular prote&iacute;nas como prote&iacute;na fluorescente verde fusi&oacute;n construye confirm&oacute; ubicaci&oacute;n pelicular y una nueva prote&iacute;na localizada en el aparato bucal. An&aacute;lisis bioinform&aacute;tico revelaron que 21% de las prote&iacute;nas pelicular putativos, predominante en las nuevas prote&iacute;nas, contiene regiones altamente repetitivas con sesgos de fuerte amino&aacute;cido particular residuos (K, E, Q, L, I y V). Cuando las T. thermophila nuevas prote&iacute;nas se compararon con datos gen&oacute;micos apicomplejo, se identificaron 278 prote&iacute;nas con similitud de secuencia alta, lo que sugiere que muchos de estos supuestos componentes pelicular son compartidos entre los alveolados. De estas prote&iacute;nas compartidas, 126 contiene las distintivas regiones de repetici&oacute;n. Localizaci&oacute;n de estas dos prote&iacute;nas en Toxoplasma gondii confirm&oacute; que su papel en la pel&iacute;cula y en hacer tan identificado dos nuevas prote&iacute;nas de la estructura invasiva apicomplejo--el complejo apical. La investigaci&oacute;n ampliamente para estos dominios repetitivas de datos gen&oacute;micos revel&oacute; familias grandes y activamente evoluci&oacute;n de dichas prote&iacute;nas en alveolados, sugiriendo que estas prote&iacute;nas podr&iacute;an apuntalar la diversidad y la utilidad de su estructura &uacute;nica pelicular.

Ciliados proteoma pelicular identifica las familias nueva prote&iacute;na con motivos de repetici&oacute;n caracter&iacute;sticas que son comunes a alveolados.

High cytosolic concentrations of Na+ inhibit plant growth and development. To maintain low cytosolic concentrations of Na+ , higher plants use membrane-bound transporters that drive the efflux of Na+ or partition Na+ ions from the cytosol, either to the extracellular compartment or into the vacuole. Bryophytes also use an energy-dependent Na+ pumping ATPase, not found in higher plants, to efflux Na+ . To investigate whether this transporter can increase the salt tolerance of crop plants, Oryza sativa has been transformed with the Physcomitrella patens Na+ pumping ATPase (PpENA1). When grown in solutions containing 50 mm NaCl, plants constitutively expressing the PpENA1 gene are more salt tolerant and produce greater biomass than controls. Transgenics and controls accumulate similar amounts of Na+ in leaf and root tissues under stress, which indicates that the observed tolerance is not because of Na+ exclusion. Moreover, inductively coupled plasma analysis reveals that the concentration of other ions in the transformants and the controls is similar. The transgenic lines are developmentally normal and fertile, and the transgene expression levels remain stable in subsequent generations. GFP reporter fusions, which do not alter the ability of PpENA1 to complement a salt-sensitive yeast mutant, indicate that when it is expressed in plant tissues, the PpENA1 protein is located in the plasma membrane. PpENA1 peptides are found in plasma membrane fractions supporting the plasma membrane targeting. The results of this study demonstrate the utility of PpENA1 as a potential tool for engineering salinity tolerance in important crop species.

Rice plants expressing the moss sodium pumping ATPase PpENA1 maintain greater biomass production under salt stress.

&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E00;&#x7CFB;&#x5217;&#x7684;&#x591A;&#x8DEF;&#x590D;&#x7528;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7814;&#x7A76;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x5E72;&#x65F1;&#x80C1;&#x8FEB;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#xFF0C;&#x4E09;&#x4E2A;&#x6FB3;&#x5927;&#x5229;&#x4E9A;&#x9762;&#x5305;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x54C1;&#x79CD; (&#x5C0F;&#x9EA6; L.&#xFF09; &#x6570;&#x91CF;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x5728;&#x6A21;&#x4EFF;&#x4E2D;&#x8BE5;&#x5B57;&#x6BB5;&#x7684;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x5FAA;&#x73AF;&#x5E72;&#x65F1;&#x6CBB;&#x7597;&#x6E29;&#x5BA4;&#x79CD;&#x690D;&#x4E0D;&#x540C;&#x671F;&#x95F4;&#x5E72;&#x65F1;&#x3001; &#x5E93;&#x514B;&#x91CC; &#xFF08;&#x504F;&#x6267;&#xFF09;&#x3001; &#x795E;&#x5251; &#xFF08;&#x5BB9;&#x9519;&#xFF09;&#xFF0C;RAC875 &#xFF08;&#x5BB9;&#x9519;&#xFF09;&#xFF0C;&#x4FDD;&#x6301;&#x7CAE;&#x98DF;&#x4EA7;&#x91CF;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x54C1;&#x79CD;&#x3002;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x88AB;&#x9694;&#x7EDD;&#x7684;&#x6210;&#x719F;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x53F6;&#x5B50;&#x548C;&#x540C;&#x4F4D;&#x7D20;&#x6807;&#x8BB0;&#x7528;&#x4E8E;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x66F4;&#x6539;&#x76F8;&#x5BF9;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684; 159 &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x8FD9;&#x662F;&#x9996;&#x4E2A;&#x730E;&#x67AA;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x5C0F;&#x9EA6;&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x89C1;&#x89E3;&#x5BF9;&#x5E72;&#x65F1;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53CD;&#x5E94;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x786E;&#x5B9A;&#x6570;&#x76EE;&#x6700;&#x5927;&#x7684;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x86CB;&#x767D; (1,299) &#x5728;&#x5355;&#x4E00;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x62A5;&#x544A;&#x3002;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x65F6;&#x95F4;&#x70B9;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x54C1;&#x79CD;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x53CD;&#x6620;&#x4E86;&#x5176;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x751F;&#x7406;&#x53CD;&#x5E94;&#xFF0C;&#x5E72;&#x65F1;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5E72;&#x65F1;&#x8010;&#x54C1;&#x79CD; &#xFF08;&#x795E;&#x5251;&#x548C; RAC875&#xFF09; &#x5728;&#x5176;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53CD;&#x5E94;&#x4E0D;&#x540C;&#x3002;&#x795E;&#x5251;&#x5728;&#x9996;&#x6B21;&#x53D1;&#x4F5C;&#x4E86;&#x4E00;&#x5927;&#x6279;&#x91CD;&#x5927;&#x53D8;&#x5316;&#x7684; RAC875 &#x4E0E;&#x6C34;&#x5206;&#x4E8F;&#x7F3A;&#x7684;&#x671F;&#x95F4;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53D1;&#x751F;&#x91CD;&#x5927;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x6240;&#x6709;&#x4E09;&#x4E2A;&#x54C1;&#x79CD;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x7B26;&#x5408;&#x589E;&#x52A0;&#x6C27;&#x5316;&#x5E94;&#x6FC0;&#x4EE3;&#x8C22;&#x53CA;&#x65E0;&#x529F; O(2) &#x7269;&#x79CD; (ROS) &#x6E05;&#x7406;&#x80FD;&#x529B;&#x901A;&#x8FC7;&#x589E;&#x52A0;&#x8D85;&#x6C27;&#x5316;&#x7269;&#x6B67;&#x5316;&#x9176;&#x548C;&#x8FC7;&#x6C27;&#x5316;&#x6C22;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x901A;&#x8FC7;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53C2;&#x4E0E;&#x5149;&#x5408;&#x4F5C;&#x7528;&#x548C;&#x5361;&#x5C14;&#x6587;&#x5FAA;&#x73AF;&#x7684;&#x8DCC;&#x5E45; ROS &#x907F;&#x514D;&#x770B;&#x5230;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;

&#x4E0D;&#x540C;&#x5E72;&#x65F1;&#x80C1;&#x8FEB;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x54C1;&#x79CD;&#x7684;&#x5B9A;&#x91CF;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Using a series of multiplexed experiments we studied the quantitative changes in protein abundance of three Australian bread wheat cultivars (Triticum aestivum L.) in response to a drought stress. Three cultivars differing in their ability to maintain grain yield during drought, Kukri (intolerant), Excalibur (tolerant), and RAC875 (tolerant), were grown in the glasshouse with cyclic drought treatment that mimicked conditions in the field. Proteins were isolated from leaves of mature plants and isobaric tags were used to follow changes in the relative protein abundance of 159 proteins. This is the first shotgun proteomics study in wheat, providing important insights into protein responses to drought as well as identifying the largest number of wheat proteins (1,299) in a single study. The changes in the three cultivars at the different time points reflected their differing physiological responses to drought, with the two drought tolerant varieties (Excalibur and RAC875) differing in their protein responses. Excalibur lacked significant changes in proteins during the initial onset of the water deficit in contrast to RAC875 that had a large number of significant changes. All three cultivars had changes consistent with an increase in oxidative stress metabolism and reactive O(2) species (ROS) scavenging capacity seen through increases in superoxide dismutases and catalases as well as ROS avoidance through the decreases in proteins involved in photosynthesis and the Calvin cycle.

Quantitative proteomic analysis of wheat cultivars with differing drought stress tolerance.

&Agrave; l&#39;aide d&#39;une s&eacute;rie d&#39;exp&eacute;riences multiplex&eacute;s, nous avons &eacute;tudi&eacute; les changements quantitatifs dans l&#39;abondance de la prot&eacute;ine de trois cultivars de bl&eacute; australien pain (Triticum aestivum L.) en r&eacute;ponse &agrave; un stress hydrique. Trois cultivars diff&egrave;rent dans leur capacit&eacute; &agrave; maintenir le rendement en grain pendant la s&eacute;cheresse, Kukri (intol&eacute;rant), Excalibur (tol&eacute;rance) et RAC875 (tol&eacute;rance), ont &eacute;t&eacute; cultiv&eacute;es en serre avec le traitement de la s&eacute;cheresse cyclique qui miment les conditions sur le terrain. Les prot&eacute;ines ont &eacute;t&eacute; isol&eacute;s des feuilles des plantes matures et isobares tags ont &eacute;t&eacute; utilis&eacute;s pour suivre les changements dans l&#39;abondance relative de prot&eacute;ine des 159 prot&eacute;ines. Il s&#39;agit de la premi&egrave;re &eacute;tude prot&eacute;omique de fusil de chasse dans le bl&eacute;, fournissant des renseignements importants sur les r&eacute;ponses de prot&eacute;ine &agrave; la s&eacute;cheresse mais aussi &agrave; identifier le plus grand nombre de prot&eacute;ines de bl&eacute; (1 299) dans une seule &eacute;tude. Les changements dans les trois cultivars aux points diff&eacute;rents temps refl&egrave;tent leurs diff&eacute;rentes r&eacute;ponses physiologiques &agrave; la s&eacute;cheresse, avec les vari&eacute;t&eacute;s tol&eacute;rantes &agrave; la deux s&eacute;cheresse (Excalibur et RAC875) diff&eacute;rant par leurs r&eacute;ponses de prot&eacute;ine. Excalibur ne disposait pas des changements importants en prot&eacute;ines pendant l&#39;apparition initiale du d&eacute;ficit eau contrairement &agrave; RAC875 qui avait un grand nombre de changements importants. Tous les trois cultivars ont des changements compatibles avec une augmentation du m&eacute;tabolisme de stress oxydatif et esp&egrave;ces d&#39;o (2) r&eacute;actives (ROS) nettoyage capacit&eacute; vue &agrave; travers l&#39;augmentation des catalases et superoxyde dismutases ainsi qu&#39;&eacute;vitement de ROS par la diminution des prot&eacute;ines impliqu&eacute;es dans la photosynth&egrave;se et le cycle de Calvin.

Analyse prot&eacute;omique quantitative des cultivars de bl&eacute; avec la tol&eacute;rance au stress s&eacute;cheresse divergentes.

Mit einer Reihe von Multiplex Experimente studierte wir die quantitativen &Auml;nderungen Protein einen &Uuml;berfluss an drei australische Brot-Weizen-Sorten (Triticum Aestivum L.) als Reaktion auf eine Trockenstress. Drei Sorten unterscheiden in ihrer F&auml;higkeit zur Korn-Ausbeute w&auml;hrend der D&uuml;rre, Kukri (Intoleranz), Excalibur (tolerant) und RAC875 (tolerant), wurden im Gew&auml;chshaus mit zyklischen D&uuml;rre Behandlung angebaut, die Bedingungen im Bereich nachahmten. Proteine wurden aus Bl&auml;ttern der Reifen Pflanzen isoliert und Isobare Tags wurden verwendet, um &Auml;nderungen in der relativen Protein-F&uuml;lle von 159 Proteine zu folgen. Dies ist die erste Schrotflinte Proteomics-Studie in Weizen, die wichtige Einblicke in Protein Antworten zu D&uuml;rre sowie die gr&ouml;&szlig;te Zahl, die Weizen Proteine (1.299) in einer einzelnen Studie. Die &Auml;nderungen in die drei Sorten zu unterschiedlichen Zeitpunkten ihre unterschiedlichen physiologischen Reaktionen auf Trockenheit, mit den zwei D&uuml;rre-tolerante Sorten (Excalibur und RAC875) unterschiedliche Protein Antworten. Excalibur fehlten wesentliche &Auml;nderungen in Proteinen w&auml;hrend der anf&auml;nglichen Ausbruch des Defizits Wasser im Gegensatz zu RAC875, die eine gro&szlig;e Anzahl signifikanter &Auml;nderungen hatte. Alle drei Sorten hatte &Auml;nderungen, die mit einer Zunahme von oxidativem Stress-Stoffwechsel und reaktive O(2) Spezies (ROS) Aufr&auml;umen Kapazit&auml;t gesehen durch Erh&ouml;hungen der Superoxid-Dismutase und Catalases sowie ROS Kostenvermeidung durch die R&uuml;ckg&auml;nge in Proteine Photosynthese und der Calvin-Zyklus beteiligt.

Proteomic quantitative Analyse der Weizen-Sorten mit unterschiedlichen D&uuml;rre Stresstoleranz.

Utilizzando una serie di esperimenti multiplexati abbiamo studiato i cambiamenti quantitativi in abbondanza di proteine delle tre cultivar australiano pane grano (Triticum aestivum L.) in risposta ad uno stress di siccit&agrave;. Tre cultivar differiscono nella loro capacit&agrave; di mantenere la resa del grano durante la siccit&agrave;, Kukri (intollerante), Excalibur (tollerante) e RAC875 (tollerante), sono stati coltivati in serra con trattamento ciclico siccit&agrave; che imitava le condizioni nel campo. Le proteine sono state isolate dalle foglie delle piante mature e tag isobarico sono stati utilizzati per seguire i cambiamenti nell&#39;abbondanza relativa proteina di 159 proteine. Questo &egrave; il primo studio di shotgun proteomics in grano, fornendo importanti intuizioni in risposte di proteina a siccit&agrave;, nonch&eacute; identificare il maggior numero di proteine del grano (1.299) in un singolo studio. Le modifiche nelle tre cultivar ai punti differenti di tempo riflettono le differenti risposte fisiologiche alla siccit&agrave;, con le variet&agrave; tolleranti alla due siccit&agrave; (Excalibur e RAC875) differiscono nelle loro risposte di proteine. Excalibur mancava significativi cambiamenti nelle proteine durante l&#39;insorgenza iniziale del deficit di acqua in contrasto con RAC875 che aveva un gran numero di cambiamenti significativi. Tutte le tre cultivar ha avuto modifiche coerenti con un aumento del metabolismo dello stress ossidativo e apparato specie reattive (ROS) lo scavenging capacit&agrave; visto attraverso aumenti dismutasi superossido e catalasi, nonch&eacute; evitare ROS attraverso le diminuzioni in proteine coinvolte nella fotosintesi e il ciclo di Calvin.

Analisi proteomic quantitativa delle cultivar di frumento con differenti tolleranza allo stress di siccit&agrave;.

&#x4E00;&#x9023;&#x306E;&#x591A;&#x91CD;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x79C1;&#x305F;&#x3061; 3 &#x30AA;&#x30FC;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30EA;&#x30A2; &#x30D1;&#x30F3;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x54C1;&#x7A2E; (Triticum aestivum l.) &#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x306E;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x3067;&#x91CF;&#x7684;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5B50;&#x5B9F;&#x53CE;&#x91CF;&#x306F;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x3001;&#x30AF;&#x30C3;&#x30AF;&#x30EA;&#x5200; &#xFF08;&#x504F;&#x72ED;&#x306A;)&#x3001;&#x30A8;&#x30AF;&#x30B9;&#x30AB;&#x30EA;&#x30D0;&#x30FC; (&#x30C8;&#x30EC;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C8;)&#x3001;RAC875 &#x4E2D;&#x306B; (&#x30C8;&#x30EC;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C8;) &#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B; 3 &#x54C1;&#x7A2E;&#x30B0;&#x30E9;&#x30B9;&#x30CF;&#x30A6;&#x30B9; &#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30EB;&#x30C9;&#x3067;&#x6761;&#x4EF6;&#x3092;&#x771F;&#x4F3C;&#x305F;&#x7E70;&#x8FD4;&#x3057;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x6CBB;&#x7642;&#x3092;&#x683D;&#x57F9;&#x3057;&#x305F;.&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x719F;&#x3057;&#x305F;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x8449;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x5B9A;&#x5727;&#x30BF;&#x30B0; 159 &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306B;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x8FFD;&#x8DE1;&#x3059;&#x308B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x6563;&#x5F3E;&#x9283;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x7814;&#x7A76;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30EC;&#x30B9;&#x30DD;&#x30F3;&#x30B9;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; &#xFF08;1,299)&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x6570;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x5C0F;&#x9EA6;&#x3067;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x3001;2 &#x3064;&#x306E;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x54C1;&#x7A2E; &#xFF08;&#x30A8;&#x30AF;&#x30B9;&#x30AB;&#x30EA;&#x30D0;&#x30FC; &#x30FB; RAC875&#xFF09; &#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x751F;&#x7406;&#x7684;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x6642;&#x70B9;&#x3067; 3 &#x54C1;&#x7A2E;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3067;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x53CD;&#x5FDC;&#x304C;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A8;&#x30AF;&#x30B9;&#x30AB;&#x30EA;&#x30D0;&#x30FC;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5909;&#x66F4;&#x304C;&#x3042;&#x3063;&#x305F; RAC875 &#x3068;&#x306F;&#x5BFE;&#x7167;&#x7684;&#x6C34;&#x8D64;&#x5B57;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x767A;&#x75C7;&#x4E2D;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5909;&#x5316;&#x306B;&#x6B20;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; 3 &#x54C1;&#x7A2E;&#x5909;&#x66F4;&#x306E;&#x9178;&#x5316;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3068;&#x5BB9;&#x91CF;&#x5897;&#x52A0;&#x30FB; &#x30C7;&#x30A3;&#x30B9;&#x30E0;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BC;&#x304A;&#x3088;&#x3073; catalases &#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5149;&#x5408;&#x6210;&#x3068;&#x30AB;&#x30EB;&#x30D0;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3092;&#x901A;&#x3058;&#x3066;&#x3001;ROS &#x56DE;&#x907F;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x898B;&#x6E05;&#x6383;&#x53CD;&#x5FDC;&#x6027; O(2) &#x7A2E; (ROS) &#x5897;&#x52A0;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;

&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x30B3;&#x30E0;&#x30AE;&#x54C1;&#x7A2E;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x3002;

&#xC6B0;&#xB9AC; &#xC138; &#xD638;&#xC8FC; &#xBE75; &#xBC00; &#xC7AC;&#xBC30; (Triticum aestivum L.) &#xAC00;&#xBB44; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD48D;&#xBD80; &#xC591;&#xC801; &#xBCC0;&#xD654;&#xB294; &#xACF5;&#xBD80; &#xB2E4;&#xC911;&#xD654; &#xB41C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC758; &#xC2DC;&#xB9AC;&#xC988;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;. 3 Cultivars (&#xAD00;&#xC6A9;), &#xAC00;&#xBB44;, Kukri (&#xC720;&#xC81C;&#xD488;), &#xC5D1;&#xC2A4; &#xCE7C;&#xB9AC;&#xBC84; (&#xAD00;&#xC6A9;), &#xBC0F; RAC875 &#xC911; &#xACE1;&#xBB3C; &#xC218;&#xD655;&#xB7C9;&#xC744; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xB2A5;&#xB825;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xD544;&#xB4DC;&#xC5D0; &#xC870;&#xAC74;&#xC744; &#xC720;&#xC0AC; &#xC8FC;&#xAE30;&#xC801; &#xAC00;&#xBB44; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC640; &#xC720;&#xB9AC; &#xACF5;&#xC7A5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC131;&#xC7A5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC131;&#xC219;&#xD55C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC78E; &#xC73C;&#xB85C;&#xBD80;&#xD130; &#xACA9;&#xB9AC; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0; &#xB4F1; &#xD0DC;&#xADF8; 159 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC0C1;&#xB300;&#xC801; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xC218;&#xD589; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C;. &#xC774;&#xAC83;&#xC740; &#xBC00;, &#xBC00; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (1,299) &#xB2E8;&#xC77C; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD070; &#xBC88;&#xD638; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC751;&#xB2F5; &#xAC00;&#xBB44;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xB294; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xC0F7;&#xAC74; proteomics &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC774;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xB978; &#xC2DC;&#xAC04; &#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138; cultivars &#xBCC0;&#xD654; &#xBC18;&#xC601; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xC751;&#xB2F5; &#xB450; &#xAC00;&#xBB44; &#xAD00;&#xB300; &#xD488;&#xC885; (&#xC5D1;&#xC2A4; &#xCE7C;&#xB9AC;&#xBC84;&#xC640; RAC875)&#xC640; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978;. &#xC5D1;&#xC2A4; &#xCE7C;&#xB9AC;&#xBC84; &#xB9CE;&#xC740; &#xC911;&#xB300; &#xD55C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xAC00;&#xC9C4; rac875&#xB294; &#xB2EC;&#xB9AC; &#xBB3C; &#xC801;&#xC790;&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xBC1C;&#xBCD1; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xBD80;&#xC871; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4E0; 3 &#xAC1C;&#xC758; cultivars &#xBCC0;&#xACBD; &#xC0B0;&#xD654; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBB3C;&#xC9C8; &#xB300;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xC6A9;&#xB7C9; &#xCD08;&#xACFC; dismutases catalases &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xAD11;&#xD569;&#xC131;&#xACFC; &#xCE98;&#xBE48; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xAC10;&#xC18C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC120;&#xC0DD;&#xB2D8; &#xD68C;&#xD53C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD1B5;&#xD574; &#xBCF8; &#xCCAD;&#xC18C; &#xBC18;&#xC751; O(2) &#xC885; (&#xC120;&#xC0DD;&#xB2D8;)&#xC758; &#xC99D;&#xAC00;&#xC640; &#xC77C;&#xCE58; &#xD588;&#xB2E4;.

&#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xAC00;&#xBB44; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xB0B4;&#xC131; &#xAC00;&#xC9C4; &#xBC00; &#xC7AC;&#xBC30;&#xC758; &#xC815;&#xB7C9;&#xC801; proteomic &#xBD84;&#xC11D;.

Utilizando una serie de experimentos multiplexados estudiamos los cambios cuantitativos en abundancia de prote&iacute;na de tres cultivares de trigo australiano pan (Triticum aestivum L.) en respuesta a una sequ&iacute;a. Tres variedades difieren en su capacidad para mantener el rendimiento de grano durante la sequ&iacute;a, Kukri (intolerante), Excalibur (tolerante) y RAC875 (tolerante), fueron cultivadas en invernadero con tratamiento de sequ&iacute;a c&iacute;clica que m&iacute;mico las condiciones en el campo. Las prote&iacute;nas fueron aisladas de hojas de plantas maduras y etiquetas isob&aacute;ricos se utilizaron para seguir los cambios en la abundancia relativa de la prote&iacute;na de 159 prote&iacute;nas. Este es el primer estudio de prote&oacute;mica de escopeta en trigo, proporcionar penetraciones importantes en las respuestas de la prote&iacute;na a la sequ&iacute;a as&iacute; como identificar la mayor cantidad de prote&iacute;nas del trigo (1.299) en un &uacute;nico estudio. Los cambios en los tres cultivares en los diferentes puntos temporales reflejan sus diferentes respuestas fisiol&oacute;gicas a la sequ&iacute;a, con las variedades tolerantes a dos sequ&iacute;a (Excalibur y RAC875) difieren en sus respuestas de la prote&iacute;na. Excalibur carec&iacute;a de cambios significativos en las prote&iacute;nas durante la aparici&oacute;n inicial de los d&eacute;ficit de agua en contraste con la RAC875 que hab&iacute;a un gran n&uacute;mero de cambios significativos. Todos los tres cultivares tuvieron cambios constantes con un aumento en el metabolismo oxidativo y especies reactivas de O(2) (ROS) borrado de capacidad a trav&eacute;s de aumentos de dismutasas super&oacute;xido y Catalasas as&iacute; como evitaci&oacute;n de ROS a trav&eacute;s de la disminuci&oacute;n en las prote&iacute;nas implicadas en la fotos&iacute;ntesis y el ciclo de Calvin.

An&aacute;lisis de la prote&oacute;mica cuantitativa de cultivares de trigo con diferente tolerancia a estr&eacute;s la sequ&iacute;a.

&#x80CC;&#x666F;&#xFF1A; &#x5305;&#x88C5;&#x3001; &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x548C;&#x7EF4;&#x62A4;&#x4F7F;&#x7528;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x6838;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5C1A;&#x65E0;&#x5904;&#x4E0D;&#x5728;&#x7684;&#x548C;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x771F;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x52A8;&#x7269;&#x95E8;&#x6210;&#x5206;&#x663E;&#x7136;&#x653E;&#x5F03;&#x4E86;&#x6B64;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x6838;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;&#x5176;&#x539F;&#x5B50;&#x6838;&#x5305;&#x542B;&#x6C38;&#x4E45;&#x51DD;&#x805A;&#x3001; &#x6DB2;&#x4F53;&#x7ED3;&#x6676;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#xFF0C;&#x770B;&#x4F3C;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E14;&#x5305;&#x542B;&#x975E;&#x5E38;&#x5927;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x3002;&#x8FD9;&#x6B21;&#x91CD;&#x7EC4;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x7840;&#x662F;&#x751A;&#x5C11;&#xFF0C;&#x662F;&#x5BFC;&#x81F4;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6FC0;&#x8FDB;&#x7684;&#x6539;&#x53D8;&#x7684;&#x8FDB;&#x5316;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x7684;&#x987A;&#x5E8F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x67E5;&#x4E86;&#x6838;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x6700;&#x63A5;&#x8FD1;&#x6DA1;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x3001; Perkinsus marinus &#x548C;&#x65E9;&#x671F;&#x5206;&#x652F;&#x85FB;&#xFF0C;Hematodinium sp.&#xFF09;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#x85FB;&#x6838;&#x6F14;&#x5316;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x51FA;&#x73B0;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x7ED3;&#x679C;&#xFF1A; &#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x8BE5;&#x4F53;&#x80B2; marinus &#x90FD;&#x6709;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5178;&#x578B;&#x7684;&#x6838;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E;&#x56DB;&#x4E2A;&#x6838;&#x5FC3;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;Hematodinium sp&#x3002; &#x65E9;&#x671F;&#x51FA;&#x73B0;&#x5DEE;&#x5F02;&#xFF0C;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x85FB;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x89C4;&#x6A21;&#x6025;&#x5267;&#x6269;&#x5927;&#x3001; &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x6C38;&#x4E45;&#x51DD;&#x805A;&#xFF0C;&#x548C;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x662F;&#x51E0;&#x4E4E;&#x65E0;&#x6CD5;&#x68C0;&#x6D4B;&#x3002;&#x800C;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x627E;&#x51FA;&#x65B0;&#x9896;&#x3001; &#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x4F18;&#x52BF;&#x53EA;&#x53D1;&#x73B0;&#x6DA1;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x548C;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x60CA;&#x8BB6;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x7684;&#x5927;&#x578B;&#x85FB;&#x7C7B;&#x75C5;&#x6BD2;&#xFF0C;Phycodnaviridae &#x7684;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65B0;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x7528; DVNPs (&#x85FB;/&#x75C5;&#x6BD2;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#xFF09;&#xFF0C;&#x662F;&#x975E;&#x5E38;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x3001; &#x7ED1;&#x5B9A; DNA &#x5177;&#x6709;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x548C;&#x53D1;&#x751F;&#x5728;&#x591A;&#x4E2A; posttranslationally &#x4FEE;&#x6539;&#x7A97;&#x4F53;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x6574;&#x4E2A;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x6DA1;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x65E9;&#x671F;&#x548C;&#x665A;&#x671F;-&#x5206;&#x652F;&#x7684;&#x5206;&#x7C7B;&#x7FA4;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x80FD;&#x5728;&#x4F53;&#x80B2; marinus &#x8FD9;&#x4E9B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x7ED3;&#x8BBA;&#xFF1A; &#x589E;&#x76CA;&#x7684;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x663E;&#x7136;&#x662F;&#x4ECE;&#x85FB;&#x7C7B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4E3B;&#x8981;&#x65B0;&#x578B;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x53D1;&#x751F;&#x5728;&#x85FB;&#x6F14;&#x5316;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#xFF0C;&#x6B63;&#x503C;&#x6025;&#x5267;&#x91CD;&#x7EC4;&#x85FB;&#x6838;&#x3002;

&#x6838;&#x5C0F;&#x4F53; DNA &#x51DD;&#x805A;&#x7684;&#x635F;&#x5931;&#x6070;&#x9022;&#x7532;&#x85FB;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x7684;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x5916;&#x89C2;&#x3002;

BACKGROUND: The packaging, expression, and maintenance of nuclear genomes using histone proteins is a ubiquitous and fundamental feature of eukaryotic cells, yet the phylum Dinoflagellata has apparently abandoned this model of nuclear organization. Their nuclei contain permanently condensed, liquid crystalline chromosomes that seemingly lack histone proteins, and contain remarkably large genomes. The molecular basis for this reorganization is poorly understood, as is the sequence of evolutionary events that led to such radical change. We have investigated nuclear organization in the closest relative to dinoflagellates, Perkinsus marinus, and an early-branching dinoflagellate, Hematodinium sp., to identify early changes that occurred during dinoflagellate nuclear evolution. RESULTS: We show that P.Â marinus has a typical nuclear organization that is based on the four core histones. By the early divergence of Hematodinium sp., however, dinoflagellate genome size is dramatically enlarged, chromosomes are permanently condensed, and histones are scarcely detectable. In place of histones, we identify a novel, dominant family of nuclear proteins that is only found in dinoflagellates and, surprisingly, in a family of large algal viruses, the Phycodnaviridae. These new proteins, which we call DVNPs (dinoflagellate/viral nucleoproteins), are highly basic, bind DNA with similar affinity to histones, and occur in multiple posttranslationally modified forms. We find these proteins throughout all dinoflagellates, including early- and late-branching taxa, but not in P.Â marinus. CONCLUSIONS: Gain of a major novel family of nucleoproteins, apparently from an algal virus, occurred early in dinoflagellate evolution and coincides with rapid and dramatic reorganization of the dinoflagellate nucleus.

Loss of Nucleosomal DNA Condensation Coincides with Appearance of a Novel Nuclear Protein in Dinoflagellates.

Pr&eacute;requis : Emballage, d&#39;expression et entretien des g&eacute;nomes nucl&eacute;aires utilisant des histones est une fonctionnalit&eacute; universels et fondamentale des cellules eucaryotes, et pourtant le phylum des dinoflagell&eacute;s a apparemment abandonn&eacute; ce mod&egrave;le de l&#39;organisation nucl&eacute;aire. Leur noyau contient les chromosomes cristallines en permanence condens&eacute;es, liquides qui n&#39;ont apparemment pas histones et contenir remarquablement grands g&eacute;nomes. La base mol&eacute;culaire de cette r&eacute;organisation est mal comprise, comme c&#39;est la s&eacute;quence des &eacute;v&eacute;nements &eacute;volutifs qui ont conduit &agrave; ce changement radical. Nous avons &eacute;tudi&eacute; organisation nucl&eacute;aire la plus proche de vous par rapport &agrave; des dinoflagell&eacute;s, Perkinsus marinus et une ramification pr&eacute;coce dinoflagell&eacute;s, Hematodinium SP., d&#39;identifier les premiers changements survenus durant l&#39;&eacute;volution nucl&eacute;aire des dinoflagell&eacute;s. R&Eacute;SULTATS : Nous montrons que P. marinus a une organisation nucl&eacute;aire typique qui repose sur les quatre core-histones. Par la divergence pr&eacute;coce de Hematodinium SP., cependant, la taille du g&eacute;nome dinoflagell&eacute; est consid&eacute;rablement &eacute;largie, chromosomes sont condensent en permanence et histones sont difficilement d&eacute;tectables. En lieu et place des histones, nous identifions un roman, la famille dominante des prot&eacute;ines nucl&eacute;aires que l&#39;on trouve uniquement dans les dinoflagell&eacute;s et, &eacute;tonnamment, dans une famille de grands virus algues, le Phycodnaviridae. Ces nouvelles prot&eacute;ines, qu&#39;on appelle DVNPs (nucl&eacute;oprot&eacute;ines virale des dinoflagell&eacute;s), sont tr&egrave;s basiques, lient l&#39;ADN avec une affinit&eacute; semblable aux histones et se pr&eacute;sentent sous des formes modifi&eacute;es apr&egrave;s multiples. Nous trouvons ces prot&eacute;ines tout au long de toutes les dinoflagell&eacute;s, y compris les taxons ramification pr&eacute;coce et tardive, mais pas de P. marinus. CONCLUSIONS : Gain d&#39;une nouvelle famille majeure des nucl&eacute;oprot&eacute;ines, apparemment d&#39;un virus d&#39;algues, a eu lieu au d&eacute;but de l&#39;&eacute;volution des dinoflagell&eacute;s et co&iuml;ncide avec une r&eacute;organisation rapide et spectaculaire du noyau dinoflagell&eacute;.

Perte de Condensation de l&#39;ADN nucl&eacute;osomique co&iuml;ncide avec l&#39;apparition d&#39;une nouvelle prot&eacute;ine nucl&eacute;aire dans les dinoflagell&eacute;s.

Hintergrund: Die Verpackung, Ausdruck und Wartung der nuklearen Genome mit Histon-Proteine ist eine allgegenw&auml;rtige und grundlegende Funktion von eukaryotischen Zellen, aber der Stamm Dinoflagellata dieses Modell der nuklearen Organisation offenbar aufgegeben hat. Ihre Kerne enthalten dauerhaft verk&uuml;rzte, fl&uuml;ssige kristalline Chromosomen, die scheinbar Histon-Proteine fehlen und bemerkenswert gro&szlig;e Genomen. Die molekulare Grundlage f&uuml;r diese Neuordnung wird schlecht verstanden, wie die Abfolge der evolution&auml;ren Ereignisse, die zu solchen radikalen Wandel gef&uuml;hrt. Wir haben untersucht, nukleare Organisation in das n&auml;chstgelegene relativ Dinoflagellaten, Perkinsus Marinus und eine fr&uuml;he Verzweigung Dinoflagellaten, Hematodinium SP., fr&uuml;he Ver&auml;nderungen zu identifizieren, die bei Dinoflagellaten nukleare Entwicklung aufgetreten sind. Ergebnisse: Wir zeigen, dass p. Marinus hat eine typische Atombeh&ouml;rde &uuml;bernehmen, die auf die vier Kernhistone basiert. Durch die fr&uuml;hen Divergenz der Hematodinium SP. jedoch Dinoflagellaten Genom-Gr&ouml;&szlig;e wird dramatisch vergr&ouml;&szlig;ert, Chromosomen verdichten sich dauerhaft und Histone sind kaum nachweisbar. Anstelle der Histone identifizieren wir ein Roman, der dominierende Familie von nuklearen Proteine, die nur in Dinoflagellaten und, &uuml;berraschenderweise, in einer Familie von gro&szlig;e Algen Viren, die Phycodnaviridae gefunden wird. Diese neue Proteine, die wir DVNPs (Dinoflagellaten/virale Nukleoproteinen) nennen, sind sehr einfach, DNA mit &auml;hnlicher Affinit&auml;t zu Histone binden und in mehreren posttranslational modifizierte Formen auftreten. Wir finden diese Proteine in allen Dinoflagellaten, fr&uuml;h - und sp&auml;t-Verzweigung Taxa, einschlie&szlig;lich, aber nicht in p. Marinus. Schlussfolgerungen: Gewinn einer gro&szlig;en Roman Familie von Nukleoproteinen, offenbar aus einem Algen-Virus, trat fr&uuml;h in der Evolution der Dinoflagellaten und deckt sich mit schnellen und dramatische Reorganisation des Zellkerns Dinoflagellaten.

Verlust der Nucleosomal DNA-Kondensation f&auml;llt mit Darstellung eines neuartigen nukleare Proteins bei Dinoflagellaten.

SFONDO: Il packaging, espressione e la manutenzione del genoma nucleare utilizzando le proteine dell&#39;istone &egrave; una caratteristica fondamentale e onnipresente delle cellule eucariotiche, eppure il phylum dinoflagellate apparentemente ha abbandonato questo modello di organizzazione nucleare. Loro nuclei contengono permanentemente condensate, liquidi cristallini cromosomi che apparentemente mancano le proteine dell&#39;istone e contengono notevolmente grandi genomi. La base molecolare di questa riorganizzazione &egrave; poco conosciuta, come &egrave; la sequenza di eventi evolutivi che hanno portato a tale cambiamento radicale. Abbiamo studiato organizzazione nucleare nel pi&ugrave; vicino rispetto ai dinoflagellati, Perkinsus marinus e un dinoflagellato precoce ramificazione, Hematodinium SP., per identificare i primi cambiamenti che si sono verificati durante l&#39;evoluzione nucleare dinoflagellati. RISULTATI: Vi mostriamo che p. marinus ha una tipica organizzazione nucleare che si basa su istoni quattro core. Dai prima divergenza di Hematodinium SP., tuttavia, grandezza del genoma Dinoflagellata &egrave; notevolmente allargata, cromosomi sono permanentemente condensate, e gli istoni sono a malapena rilevabili. Al posto di istoni, identifichiamo un romanzo, la famiglia dominante di proteine nucleari che si trova solo in dinoflagellati e, sorprendentemente, in una famiglia di grandi virus algali, i Phycodnaviridae. Queste nuove proteine, che noi chiamiamo DVNPs (nucleoproteine virali/Dinoflagellata), sono molto spartane, legare il DNA con simile affinit&agrave; con gli istoni e si verificano in molteplici forme posttranslationally modificate. Troviamo queste proteine durante tutti i dinoflagellati, compresi i primi - e tardo-ramificazione taxa, ma non in p. marinus. CONCLUSIONI: Guadagno di una famiglia importante romanzo di nucleoproteine, apparentemente da un virus algali, avvenuta all&#39;inizio della evoluzione di dinoflagellati e coincide con rapida e drammatica riorganizzazione del nucleo dinoflagellati.

Perdita di condensazione del DNA Nucleosomal coincide con l&#39;apparenza di un romanzo di proteina nucleare in dinoflagellati.

&#x80CC;&#x666F;&#xFF1A; &#x5305;&#x88C5;&#x3001;&#x5F0F;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30CA;&#x30F3;&#x30B9; &#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x6838;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30E6;&#x30D3;&#x30AD;&#x30BF;&#x30B9;&#x304B;&#x3064;&#x57FA;&#x790E;&#x7684;&#x306A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x771F;&#x6838;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x9580; Dinoflagellata &#x3069;&#x3046;&#x3084;&#x3089;&#x3053;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x6838;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3092;&#x65AD;&#x5FF5;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x307E;&#x3060;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x6838;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x898B;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x6C38;&#x4E45;&#x306B;&#x51DD;&#x7E2E;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x6DB2;&#x4F53;&#x306E;&#x7D50;&#x6676;&#x6027;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x3092;&#x542B;&#x307F;&#x3001;&#x8457;&#x3057;&#x304F;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3092;&#x542B;&#x307F;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x518D;&#x7DE8;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x76E4;&#x306F;&#x3088;&#x304F;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x6839;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x5909;&#x5316;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x3063;&#x305F;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6838;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3067;&#x6700;&#x3082;&#x8FD1;&#x3044;&#x76F8;&#x5BFE;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x3001;&#x30D1;&#x30FC;&#x30AD;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9; &#x30DE;&#x30EA;&#x30CC;&#x30B9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x6838;&#x9032;&#x5316;&#x4E2D;&#x306B;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x305F;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x3001;Hematodinium sp. &#x3092;&#x521D;&#x671F;&#x5206;&#x5C90;&#x97AD;&#x6BDB;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3002;&#x7D50;&#x679C;: &#x305D;&#x306E; P. &#x30DE;&#x30EA;&#x30CC;&#x30B9; 4 &#x30B3;&#x30A2;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x5178;&#x578B;&#x7684;&#x306A;&#x6838;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;.&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x767A;&#x6563; Hematodinium sp. &#x306E;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; &#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x3092;&#x5287;&#x7684;&#x306B;&#x62E1;&#x5927;&#x3001;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306F;&#x6C38;&#x4E45;&#x306B;&#x51DD;&#x7E2E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306F;&#x3084;&#x3063;&#x3068;&#x306E;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306E;&#x4EE3;&#x308F;&#x308A;&#x306B;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x3001;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x3068;&#x3001;&#x9A5A;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x5927;&#x578B;&#x85FB;&#x985E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x3001;Phycodnaviridae &#x306E;&#x5BB6;&#x65CF;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x306E;&#x307F;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x5BB6;&#x65CF;&#x306E;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;DVNPs &#xFF08;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C8;/&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x86CB;&#x767D;) &#x3092;&#x547C;&#x3073;&#x51FA;&#x3059;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306F;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3001;DNA &#x3068;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306B;&#x4F3C;&#x305F;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x7D50;&#x5408;&#x3001;&#x8907;&#x6570;&#x306E; posttranslationally &#x5909;&#x66F4;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;P. &#x30DE;&#x30EA;&#x30CC;&#x30B9;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x521D;&#x671F;&#x3068;&#x5F8C;&#x671F;-&#x5206;&#x5C90;&#x7FA4;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7D50;&#x8AD6;: &#x5229;&#x5F97;&#x86CB;&#x767D;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x85FB;&#x985E;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x5BB6;&#x65CF;&#x306E;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x3001;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x6838;&#x306E;&#x6025;&#x901F;&#x306A;&#x5287;&#x7684;&#x306A;&#x518D;&#x7DE8;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x640D;&#x5931;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0; DNA &#x306E;&#x51DD;&#x7E2E;&#x306E;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB;&#x306E;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x306E;&#x51FA;&#x73FE;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xBC30;&#xACBD;: &#xD3EC;&#xC7A5; &#xD45C;&#xD604;&#xACFC; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD575; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218; &#xBB38; Dinoflagellata&#xC774;&#xC774; &#xBAA8;&#xB378; &#xD575; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xD3EC;&#xAE30; &#xBD84;&#xBA85;&#xD788; &#xD588;&#xB2E4; &#xC544;&#xC9C1; &#xC9C4; &#xD575; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xD3B8; &#xC7AC; &#xD558; &#xACE0; &#xAE30;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD575; &#xC601;&#xAD6C;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC751;&#xCD95;, &#xC561;&#xCCB4; &#xACB0;&#xC815; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xAC89;&#xBCF4;&#xAE30; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBD80;&#xC871;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xACE0; &#xD604;&#xC800; &#xD558; &#xAC8C; &#xD070; &#xAC8C;&#xB188;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568;. &#xC774; &#xC870;&#xC9C1; &#xAC1C;&#xD3B8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBD84;&#xC790; &#xB2E8;&#xC704;&#xB85C; &#xC11C; &#xD22C;&#xB974; &#xAC8C; &#xC774;&#xD574; &#xAC19;&#xC740; &#xAE09;&#xC9C4;&#xC801;&#xC778; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xC8FC;&#xB3C4;&#xD558;&#xB294; &#xC9C4;&#xD654; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xC21C;&#xC11C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC5D0; dinoflagellates, Perkinsus marinus &#xBC0F; &#xCD08;&#xAE30; &#xBD84;&#xAE30; dinoflagellate, Hematodinium sp. dinoflagellate &#xD575; &#xBC1C;&#xC804; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD55C; &#xCD08;&#xAE30; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB0B4;&#xC6A9;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xAC00;&#xC7A5; &#xAC00;&#xAE4C;&#xC6B4; &#xD575; &#xC870;&#xC9C1;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xACB0;&#xACFC;: &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; P. marinus&#xB294; 4 &#xAC1C;&#xC758; &#xCF54;&#xC5B4; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xD575; &#xC870;&#xC9C1; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; Hematodinium sp.&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xD655;&#xC0B0;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; dinoflagellate &#xAC8C;&#xB188; &#xD06C;&#xAE30; &#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xB300;, &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC751;&#xCD95; &#xC601;&#xAD6C;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558; &#xACE0; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xAC70;&#xC758; &#xAC10;&#xC9C0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4;. &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;, &#xB300;&#xC2E0; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC18C;&#xC124;, dinoflagellates &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0;, &#xB180;&#xB78D;&#xAC8C;&#xB3C4;, &#xB300;&#xD615; &#xC870;&#xB958; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xB294; Phycodnaviridae &#xC81C;&#xD488;&#xAD70;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xC788;&#xB294; &#xD575; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; &#xAC00;&#xC871; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. DVNPs (dinoflagellate/&#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; nucleoproteins)&#xB97C; &#xD638;&#xCD9C; &#xD558; &#xACE0;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC740; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xAE30;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;, &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4;&#xC640; DNA&#xC744; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD558;&#xACE0; &#xC5EC;&#xB7EC; posttranslationally &#xC218;&#xC815;&#xB41C; &#xD3FC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; taxa &#xCD08;&#xBC18;&#xACFC; &#xD6C4;&#xBC18;&#xC744; &#xBD84;&#xAE30;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xBAA8;&#xB4E0; dinoflagellates &#xAC78;&#xCCD0; &#xC544;&#xB2C8;&#xC9C0;&#xB9CC; P. marinus &#xCC3E;&#xC73C;&#xC2ED;&#xC2DC;&#xC624;. &#xACB0;&#xB860;: &#xC870;&#xB958; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xBA85;&#xD788; nucleoproteins&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xC18C;&#xC124; &#xAC00;&#xC871;&#xC758; &#xC774;&#xB4DD; dinoflagellate &#xC9C4;&#xD654; &#xCD08;&#xAE30;&#xC5D0; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558; &#xACE0; dinoflagellate &#xD575;&#xC758; &#xAE09;&#xC18D; &#xD558; &#xACE0; &#xADF9;&#xC801;&#xC778; &#xAC1C;&#xD3B8; &#xC77C;&#xCE58; &#xD55C;&#xB2E4;.

Nucleosomal DNA &#xC751;&#xCD95;&#xC758; &#xC190;&#xC2E4;&#xC5D0; Dinoflagellates &#xC18C;&#xC124; &#xD575; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xBAA8;&#xC591;&#xC744; &#xC77C;&#xCE58; &#xD55C;&#xB2E4;.

FONDO: El embalaje, expresi&oacute;n y mantenimiento de los genomas nucleares utilizando prote&iacute;nas histonas es una caracter&iacute;stica omnipresente y fundamental de las c&eacute;lulas eucariotas, sin embargo el filum Dinoflagellata aparentemente ha abandonado este modelo de organizaci&oacute;n nuclear. Sus n&uacute;cleos contienen cromosomas cristalinos permanentemente condensados, l&iacute;quidos que aparentemente carecen de prote&iacute;nas histonas y contienen genomas notable grandes. La base molecular de esta reorganizaci&oacute;n es mal entendida, como es la secuencia de eventos evolutivas que condujo a un cambio tan radical. Hemos investigado la organizaci&oacute;n nuclear en el m&aacute;s cercano en relaci&oacute;n con una ramificaci&oacute;n temprana dinoflagelados, Hematodinium SP., para identificar cambios tempranos que ocurrieron durante la evoluci&oacute;n nuclear dinoflagelados, dinoflagelados y Perkinsus marinus. Resultados: Demostramos que p. marinus tiene una organizaci&oacute;n nuclear t&iacute;pica que se basa en las histonas de la base de cuatro. Por la divergencia temprana de Hematodinium SP., sin embargo, dram&aacute;ticamente se agranda el tama&ntilde;o del genoma de dinoflagelados, permanentemente se condensan los cromosomas y las histonas son apenas perceptibles. En lugar de las histonas, identificamos una novela, la familia dominante de las prote&iacute;nas nucleares que s&oacute;lo se encuentra en dinoflagelados y, sorprendentemente, en una familia de virus de algas grandes, el Phycodnaviridae. Estas nuevas prote&iacute;nas, que llamamos DVNPs (dinoflagelados viral nucleoprote&iacute;nas), son muy b&aacute;sicas, unen ADN con afinidad similar a las histonas y ocurren en m&uacute;ltiples formas posttranslationally modificadas. Encontramos estas prote&iacute;nas a lo largo de los dinoflagelados, incluyendo temprano - y &uacute;ltimo-ramificaci&oacute;n taxones, pero no en p. marinus. CONCLUSIONES: Ganancia de una importante familia novela de nucleoprote&iacute;nas, aparentemente de un virus de algas, ocurri&oacute; temprano en la evoluci&oacute;n de dinoflagelados y coincide con la reorganizaci&oacute;n r&aacute;pida y dram&aacute;tica del n&uacute;cleo dinoflagelados.

P&eacute;rdida de condensaci&oacute;n de DNA Nucleosomal coincide con la aparici&oacute;n de una nueva prote&iacute;na Nuclear en dinoflagelados.

Salinity is one of the major abiotic stresses affecting plant productivity but surprisingly, a thorough understanding of the salt-responsive networks responsible for sustaining growth and maintaining crop yield remains a significant challenge. Rice suspension culture cells (SCCs), a single cell type, were evaluated as a model system as they provide a ready source of a homogenous cell type and avoid the complications of multicellular tissue types in planta. A combination of growth performance, and transcriptional analyses using known salt-induced genes was performed on control and 100 mM NaCl cultured cells to validate the biological system. Protein profiling was conducted using both DIGE- and iTRAQ-based proteomics approaches. In total, 106 proteins were identified in DIGE experiments and 521 proteins in iTRAQ experiments with 58 proteins common to both approaches. Metabolomic analysis provided insights into both developmental changes and salt-induced changes of rice SCCs at the metabolite level; 134 known metabolites were identified, including 30 amines and amides, 40 organic acids, 40 sugars, sugar acids and sugar alcohols, 21 fatty acids and sterols, and 3 miscellaneous compounds. Our results from proteomic and metabolomic studies indicate that the salt-responsive networks of rice SCCs are extremely complex and share some similarities with thee cellular responses observed in planta. For instance, carbohydrate and energy metabolism pathways, redox signaling pathways, auxin/indole-3-acetic acid pathways and biosynthesis pathways for osmoprotectants are all salt responsive in SCCs enabling cells to maintain cellular function under stress condition. These data are discussed in the context of our understanding of in planta salt-responses.

Rice suspension cultured cells are evaluated as a model system to study salt responsive networks in plants using a combined proteomic and metabolomic profiling approach.

The analysis of post-translational modifications (PTMs) by proteomics is regarded as a technically challenging undertaking. While in recent years approaches to examine and quantify protein phosphorylation have greatly improved, the analysis of many protein modifications, such as glycosylation, are still regarded as problematic. Limitations in the standard proteomics workflow, such as use of suboptimal peptide fragmentation methods, can significantly prevent the identification of glycopeptides. The current generation of tandem mass spectrometers has made available a variety of fragmentation options, many of which are becoming standard features on these instruments. We have used three common fragmentation techniques, namely CID, HCD, and ETD, to analyze a glycopeptide and highlight how an integrated fragmentation approach can be used to identify the modified residue and characterize the N-glycan on a peptide.

Article	Year
Analysis of the Oryza sativa plasma membrane proteome using combined protein and peptide fractionation approaches in conjunction with mass spectrometry. Journal of proteome research\| PubMed ID: 18260611	2008
Proteomic and metabolic profiling of rice suspension culture cells as a model to study abscisic acid signaling response pathways in plants. Journal of proteome research\| PubMed ID: 20961066	2010
Ciliate pellicular proteome identifies novel protein families with characteristic repeat motifs that are common to alveolates. Molecular biology and evolution\| PubMed ID: 21127172	2011
Rice plants expressing the moss sodium pumping ATPase PpENA1 maintain greater biomass production under salt stress. Plant biotechnology journal\| PubMed ID: 21338466	2011
Quantitative proteomic analysis of wheat cultivars with differing drought stress tolerance. Frontiers in plant science\| PubMed ID: 22639595	2011
Loss of Nucleosomal DNA Condensation Coincides with Appearance of a Novel Nuclear Protein in Dinoflagellates. Current biology : CB\| PubMed ID: 23159597	2012
Rice suspension cultured cells are evaluated as a model system to study salt responsive networks in plants using a combined proteomic and metabolomic profiling approach. Proteomics\| PubMed ID: 23661342	2013
Characterization of protein N-glycosylation by tandem mass spectrometry using complementary fragmentation techniques. Frontiers in plant science\| PubMed ID: 26379696	2015

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