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Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets

Recruitment of transcriptional and epigenetic factors to their targets is a key step in their regulation. Prominently featured in recruitment are the ...

University of Illinois Chicago - UIC

&#x50CF;&#x5DEE;&#x5728;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5982;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x5BFC;&#x81F4;&#x764C;&#x75C7;&#x3002;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; 2 (RBP2 &#xFF1B; &#x4E5F;&#x79F0;&#x4E3A; JARID1A &#x6216; KDM5A&#xFF09; &#x53EF;&#x4EE5; demethylate &#x4E09;&#x548C; dimethylated &#x6C28;&#x9178; 4 &#x5728;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; H3&#xFF0C;&#x54EA;&#x4E9B;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x6D3B;&#x6027;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x7684;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x800C;&#x591A;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x817A;&#x7624;&#x952E;&#x5165; 1 (MEN1) &#x80BF;&#x7624;&#x6291;&#x5236;&#x56E0;&#x5B50;&#x4FC3;&#x8FDB; H3K4 &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E; RBP2 &#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x86CB;&#x767D; (pRB)&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x7684;&#x9057;&#x4F20; Rbp2 &#x6D88;&#x878D;&#x51CF;&#x5C11;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x5F62;&#x6210;&#x548C;&#x5EF6;&#x957F; Rb1(+/-) &#x5C0F;&#x9F20;&#x548C; Men1 &#x7F3A;&#x9677;&#x5C0F;&#x9F20;&#x751F;&#x5B58;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76; RBP2 &#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x8131;&#x6D3B;&#x52A8;&#x94FE;&#x63A5;&#x5230;&#x80BF;&#x7624;&#xFF0C;&#x764C;&#x75C7;&#x6CBB;&#x7597;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6F5C;&#x5728;&#x76EE;&#x6807;&#x63D0;&#x540D; RBP2&#x3002;

&#x635F;&#x5931;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; 2 (RBP2) &#x7684;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x8131;&#x6291;&#x5236;&#x7F3A;&#x4E4F; Rb1 &#x6216; Men1 &#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;

Aberrations in epigenetic processes, such as histone methylation, can cause cancer. Retinoblastoma binding protein 2 (RBP2; also called JARID1A or KDM5A) can demethylate tri- and dimethylated lysine 4 in histone H3, which are epigenetic marks for transcriptionally active chromatin, whereas the multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) tumor suppressor promotes H3K4 methylation. Previous studies suggested that inhibition of RBP2 contributed to tumor suppression by the retinoblastoma protein (pRB). Here, we show that genetic ablation of Rbp2 decreases tumor formation and prolongs survival in Rb1(+/-) mice and Men1-defective mice. These studies link RBP2 histone demethylase activity to tumorigenesis and nominate RBP2 as a potential target for cancer therapy.

Loss of the retinoblastoma binding protein 2 (RBP2) histone demethylase suppresses tumorigenesis in mice lacking Rb1 or Men1.

Aberrations dans les processus &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques, tels que la m&#xE9;thylation des histones, peuvent causer le cancer. Prot&#xE9;ine du r&#xE9;tinoblastome liaison 2 (RBP2, aussi appel&#xE9; JARID1A ou KDM5A) peut d&#xE9;m&#xE9;thyler tri-et dim&#xE9;thyl&#xE9;e la lysine 4 de l&#x26;#39;histone H3, qui sont des marques &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques pour la chromatine transcriptionnellement actif, alors que le type n&#xE9;oplasie endocrinienne multiple 1 (NEM1) suppresseur de tumeur favorise la m&#xE9;thylation H3K4. Des &#xE9;tudes ant&#xE9;rieures ont sugg&#xE9;r&#xE9; que l&#x26;#39;inhibition de RBP2 contribu&#xE9; &#xE0; la suppression des tumeurs par la prot&#xE9;ine du r&#xE9;tinoblastome (pRB). Ici, nous montrons que l&#x26;#39;ablation g&#xE9;n&#xE9;tique de Rbp2 diminue la formation de la tumeur et prolonge la survie des Rb1 (+ / -) des souris et des Men1 d&#xE9;fectueux souris. Ces &#xE9;tudes &#xE9;tablissent un lien RBP2 activit&#xE9; histone d&#xE9;m&#xE9;thylase &#xE0; la tumorigen&#xE8;se et de nommer RBP2 comme une cible potentielle pour le traitement du cancer.

Perte de la r&#xE9;tinoblastome Protein 2 (RBP2) D&#xE9;m&#xE9;thylase fixation sur les histones Supprime tumorigen&#xE8;se chez les souris d&#xE9;pourvues Rb1 ou Men1

Aberrationen in epigenetische Prozesse wie Histon-Methylierung, k&ouml;nnen Krebs verursachen. Retinoblastom verbindliches Protein 2 (RBP2; auch genannt JARID1A oder KDM5A) k&ouml;nnen demethylate Tri- und Dimethylated Lysin 4 in Histon H3, die epigenetischen Markierungen f&uuml;r transcriptionally aktiv Chromatin sind, w&auml;hrend die multiple endokrine Neoplasie Typ 1 (MEN1)-Tumorsuppressor f&ouml;rdert H3K4 Methylierung. Fr&uuml;here Studien vorgeschlagen, dass die Hemmung der RBP2 Tumor Unterdr&uuml;ckung durch das Retinoblastom-Protein (pRB) beigetragen. Hier zeigen wir, dass genetische Ablation des Rbp2 verringert die Tumorbildung und verl&auml;ngert das &Uuml;berleben bei Rb1(+/-) M&auml;usen und Men1-Genen M&auml;usen. Diese Studien link RBP2 Histon Demethylase Aktivit&auml;t zu Tumorentstehung und RBP2 als m&ouml;gliches Angriffsziel f&uuml;r Krebstherapie benennen.

Verlust des Retinoblastom verbindliches Protein 2 (RBP2) unterdr&uuml;ckt Histon Demethylase Tumorentstehung in M&auml;usen fehlt Rb1 oder Men1.

Aberrazioni nei processi epigenetici, come ad esempio la metilazione dell&#39;istone, possono provocare il cancro. Retinoblastoma binding protein 2 (RBP2; anche chiamato JARID1A o KDM5A) possono demethylate tri - e dimetilata lisina 4 in istone H3, che sono marchi epigenetici per cromatina transcriptionally active, considerando che la neoplasia endocrina multipla tipo 1 (MEN1) tumor suppressor promuove la metilazione H3K4. Precedenti studi ha suggerito che l&#39;inibizione della RBP2 hanno contribuito alla soppressione del tumore dalla proteina retinoblastoma (pRB). Qui, vi mostriamo quello genetici ablazione di Rbp2 riduce la formazione di tumori e prolunga la sopravvivenza in topi Rb1(+/-) e topi Men1-difettoso. Questi studi linkare RBP2 attivit&agrave; di istone demethylase tumorigenesi e nominano RBP2 come un potenziale bersaglio per la terapia del cancro.

Perdita della proteina del retinoblastoma 2 (RBP2) dell&#39;istone demethylase sopprime la tumorigenesi in topi privi di Rb1 o Men1.

&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3059;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;2&#xFF08;RBP2&#x3001;&#x307E;&#x305F;JARID1A&#x307E;&#x305F;&#x306F;KDM5A&#x3068;&#x3082;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;&#xFF09;&#x591A;&#x767A;&#x6027;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x816B;&#x760D;1&#x578B;&#xFF08;MEN1&#xFF09;&#x816B;&#x760D;&#x30B5;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306F;H3K4&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x4E00;&#x65B9;&#x3001;&#x30C8;&#x30EA; - &#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;H3&#x306E;4&#x3001;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x307E;&#x3067;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;RBP2&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x304C;&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#xFF08;PRB&#xFF09;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x816B;&#x760D;&#x6291;&#x5236;&#x306B;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x305F;&#x3002; &#xFF08;+ /  - &#xFF09;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3068;MEN1&#x6B20;&#x640D;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;Rbp2&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x30A2;&#x30D6;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x3092;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x3068;RB1&#x306B;&#x751F;&#x5B58;&#x671F;&#x9593;&#x3092;&#x5EF6;&#x9577;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;RBP2&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3057;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x6CBB;&#x7642;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;RBP2&#x3092;&#x6307;&#x540D;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;2&#xFF08;RBP2&#xFF09;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x306F;&#x3001;Rb1&#x306E;&#x304B;&#x3001;MEN1&#x306E;&#x6B20;&#x640D;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3067;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;

&#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xB4F1;&#xC758; epigenetic &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xCC29;&#xC624;&#xB294; &#xC554;&#xC744; &#xC77C;&#xC73C;&#xD0AC; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Retinoblastoma &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; 2 (RBP2; &#xB610;&#xD55C; &#xB77C;&#xB294; JARID1A &#xB610;&#xB294; KDM5A)&#xC744; &#xBB36;&#xB294; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; demethylate transcriptionally &#xD65C;&#xC131; chromatin epigenetic &#xB9C8;&#xD06C;&#xB294; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; H3&#xC5D0;&#xC11C; dimethylated &#xBC0F; &#xD2B8;&#xB77C;&#xC774;-lysine 4, &#xC5EC;&#xB7EC; &#xB0B4; &#xBD84; &#xBE44; &#xC2E0; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xC785;&#xB825; 1 (MEN1) &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC555; &#xD558;&#xB294; &#xBC18;&#xBA74; H3K4 &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xB97C; &#xCD09;&#xC9C4;. &#xC774;&#xC804; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; rbp2&#xC758; &#xC800;&#xD574; retinoblastoma &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (pRB)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xB97C; &#xC81C;&#xC548; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC790;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xADF8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; rbp2&#xC758; &#xC808;&#xC81C; &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC744; &#xAC10;&#xC18C; &#xD558; &#xACE0; Rb1(+/-) &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xBC0F; Men1 &#xACB0;&#xD568; &#xC950;&#xC758; &#xC0DD;&#xC874;&#xC744; &#xC5F0;&#xC7A5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; RBP2 &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; demethylase &#xD65C;&#xB3D9; tumorigenesis&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558; &#xACE0; &#xC554; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; rbp2&#xB97C; &#xC9C0;&#xBA85;.

&#xC190;&#xC2E4; retinoblastoma &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (RBP2) 2&#xC758; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; demethylase Rb1 &#xB610;&#xB294; Men1 &#xBD80;&#xC871; &#xD55C; &#xC950;&#xC5D0;&#xC11C; tumorigenesis&#xB97C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Aberraciones en los procesos epigen&#xE9;ticos, como la metilaci&#xF3;n de las histonas, pueden causar c&#xE1;ncer. La prote&#xED;na retinoblastoma vinculante 2 (RBP2, tambi&#xE9;n llamado JARID1A o KDM5A) puede demethylate tri-y dimetilado lisina 4 de la histona H3, que son las marcas epigen&#xE9;ticas de la cromatina para transcripcionalmente activo, mientras que el tipo de neoplasia endocrina m&#xFA;ltiple 1 (MEN1) supresor tumoral promueve H3K4 metilaci&#xF3;n. Estudios previos han sugerido que la inhibici&#xF3;n de RBP2 contribuido a la supresi&#xF3;n de tumores por la prote&#xED;na retinoblastoma (pRB). En este sentido, muestran que la ablaci&#xF3;n gen&#xE9;tica de Rbp2 disminuye la formaci&#xF3;n de tumores y prolonga la supervivencia en el Rb1 (+ / -) ratones y ratones hombres1 defectuosos. Estos estudios relacionan la actividad RBP2 desmetilasa histona a la tumorig&#xE9;nesis y nominar RBP2 como un objetivo potencial para la terapia del c&#xE1;ncer.

La p&#xE9;rdida de la desmetilasa Retinoblastoma prote&#xED;na de uni&#xF3;n 2 (RBP2) Histona Suprime la tumorig&#xE9;nesis en ratones que carecen Rb1 o hombres1

Michael L. Beshiri

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