analysis-mrna-nuclear-export-kinetics-mammalian-cells

Analysis of mRNA Nuclear Export Kinetics in Mammalian Cells by Microinjection

In eukaryotes, messenger RNA (mRNA) is transcribed in the nucleus and must be exported into the cytoplasm to access the translation machinery. Although ...

University of Toronto

&#x5728;&#x9AD8;&#x7B49;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#xFF0C;&#x4FE1;&#x4F7F; Rna &#xFF08;mRNAs&#xFF09; &#x8FDC;&#x9500;&#x4ECE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x901A;&#x8FC7;&#x62FC;&#x63A5;&#x671F;&#x95F4;&#x9644;&#x8FD1; 5&#39; &#x7AEF;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5185;&#x5BB9;&#x5B58;&#x653E;&#x7684;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5E8F;&#x5217;&#x7F16;&#x7801;&#x533A; (&#x8C31;) &#x53EF;&#x4EE5;&#x652F;&#x6301;&#x4E0D;&#x9700;&#x8981;&#x62FC;&#x63A5;&#x4EA4;&#x66FF; mRNA (ALREX) &#x51FA;&#x53E3;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x8C31;&#x542B;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E5F;&#x6709;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#xFF0C;&#x6240;&#x4EE5;&#x4E24;&#x8005;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5BFC;&#x51FA;&#x673A;&#x5236;&#x5C1A;&#x4E0D;&#x660E;&#x786E;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x652F;&#x6301;&#x7684;&#x6700;&#x8FDC;&#x7684;&#x4E0A;&#x6E38;&#x5143;&#x7D20;&#x5728;&#x7ED9;&#x5B9A;&#x7684;&#x8A8A;&#x672C;&#xFF0C;&#x65E0;&#x8BBA;&#x662F;&#x6A21;&#x578B;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x6216; ALREX &#x4FC3;&#x8FDB;&#x8C31;&#xFF0C;&#x53D1;&#x53F7;&#x65BD;&#x4EE4;&#x7684; mRNA &#x51FA;&#x53E3;&#x9014;&#x5F84;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x901A;&#x8FC7;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x660E;&#x6838;&#x7F16;&#x7801;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4F7F;&#x7528; ALREX &#x901A;&#x8DEF;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;ALREX &#x8FD8;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5F97;&#x5230;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5185;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x9776;&#x5411;&#x5E8F;&#x5217;&#x7F16;&#x7801;&#x533A; (MSCRs)&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;&#x5E76;&#x901A;&#x8FC7;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x5173;&#x8054; ALREX &#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x56FE;&#x6848;&#x7531; SSCRs &#x548C; MSCRs &#x5171;&#x4EAB;&#x7684;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x5F88;&#x5F3A;&#x7684;&#x76F8;&#x5173;&#x6027; 5&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x533A; (5&#39;UTR) &#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;/&#x4E0D;&#x5B58;&#x5728;&#x548C;&#x5E8F;&#x5217;&#x7279;&#x5F81;&#x7F16;&#x7801;&#x533A;&#x57DF;&#x7684;&#x5F00;&#x5934;&#x3002;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x86CB;&#x767D;&#x5206;&#x6CCC;&#x548C;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x5171;&#x4EAB;&#x7EA7;&#x522B;&#x7684; mRNA &#x51FA;&#x53E3;&#x5171;&#x540C;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86; 5&#39;UTR &#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x4E0E;&#x6838; mRNA &#x51FA;&#x53E3;&#x5206;&#x6CCC;&#x53CA;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

In higher eukaryotes, messenger RNAs (mRNAs) are exported from the nucleus to the cytoplasm via factors deposited near the 5' end of the transcript during splicing. The signal sequence coding region (SSCR) can support an alternative mRNA export (ALREX) pathway that does not require splicing. However, most SSCR-containing genes also have introns, so the interplay between these export mechanisms remains unclear. Here we support a model in which the furthest upstream element in a given transcript, be it an intron or an ALREX-promoting SSCR, dictates the mRNA export pathway used. We also experimentally demonstrate that nuclear-encoded mitochondrial genes can use the ALREX pathway. Thus, ALREX can also be supported by nucleotide signals within mitochondrial-targeting sequence coding regions (MSCRs). Finally, we identified and experimentally verified novel motifs associated with the ALREX pathway that are shared by both SSCRs and MSCRs. Our results show strong correlation between 5' untranslated region (5'UTR) intron presence/absence and sequence features at the beginning of the coding region. They also suggest that genes encoding secretory and mitochondrial proteins share a common regulatory mechanism at the level of mRNA export.

Genome analysis reveals interplay between 5'UTR introns and nuclear mRNA export for secretory and mitochondrial genes.

Chez les eucaryotes sup&#xE9;rieurs, les ARN messagers (ARNm) sont export&#xE9;s &#xE0; partir du noyau vers le cytoplasme par l&#x26;#39;interm&#xE9;diaire des facteurs d&#xE9;pos&#xE9;s pr&#xE8;s de l&#x26;#39;extr&#xE9;mit&#xE9; 5 &#x26;#39;de la transcription au cours de l&#x26;#39;&#xE9;pissage. La r&#xE9;gion de s&#xE9;quence de codage de signal (SSCR) peut supporter une exportation de remplacement ARNm (ALREX) voie qui ne n&#xE9;cessite pas d&#x26;#39;&#xE9;pissage. Cependant, la plupart des SSCR contenant les g&#xE8;nes ont &#xE9;galement introns, alors l&#x26;#39;interaction entre ces m&#xE9;canismes d&#x26;#39;exportation reste incertaine. Ici nous soutenons un mod&#xE8;le dans lequel l&#x26;#39;&#xE9;l&#xE9;ment le plus en amont dans une transcription, qu&#x26;#39;il s&#x26;#39;agisse d&#x26;#39;un intron ou un SSCR ALREX-promotion, dicte la voie &#xE0; l&#x26;#39;exportation ARNm utilis&#xE9;. Nous avons &#xE9;galement d&#xE9;montrer exp&#xE9;rimentalement que l&#x26;#39;&#xE9;nergie nucl&#xE9;aire-encod&#xE9;es g&#xE8;nes mitochondriaux pouvez utiliser la voie ALREX. Ainsi, ALREX peuvent &#xE9;galement &#xEA;tre pris en charge par des signaux de nucl&#xE9;otides au sein des r&#xE9;gions de s&#xE9;quences mitochondriales de ciblage de codage (MSCRs). Enfin, nous avons identifi&#xE9; et v&#xE9;rifi&#xE9; exp&#xE9;rimentalement motifs de nouveaux associ&#xE9;s &#xE0; la fili&#xE8;re ALREX qui sont partag&#xE9;s par les deux SSCRs et MSCRs. Nos r&#xE9;sultats montrent une forte corr&#xE9;lation entre la r&#xE9;gion 5 &#x26;#39;non traduite (5&#x26;#39;UTR) les fonctions de pr&#xE9;sence / absence et la s&#xE9;quence des introns au d&#xE9;but de la r&#xE9;gion codante. Ils sugg&#xE8;rent &#xE9;galement que s&#xE9;cr&#xE9;toire g&#xE8;nes codant pour des prot&#xE9;ines mitochondriales et partagent un m&#xE9;canisme commun de r&#xE9;glementation au niveau de l&#x26;#39;exportation d&#x26;#39;ARNm.

D&#x26;#39;analyse du g&#xE9;nome r&#xE9;v&#xE8;le l&#x26;#39;interaction entre la introns 5&#x26;#39;UTR et l&#x26;#39;exportation d&#x26;#39;ARNm nucl&#xE9;aire pour s&#xE9;cr&#xE9;toire et les g&#xE8;nes mitochondriaux

In den h&ouml;heren Eukaryotes werden Zytoplasma &uuml;ber Faktoren, die am 5&#39;-Ende der Niederschrift w&auml;hrend Splei&szlig;en hinterlegt Messenger-RNAs (mRNAs) vom Kern exportiert. Die Signal-Sequenz, die Kodierung der Region (SSCR) kann ein alternatives mRNA Export (ALREX) Weg unterst&uuml;tzen, die keine Splei&szlig;en erfordert. Allerdings haben die meisten SSCR-haltigen Gene auch Introns, also das Zusammenspiel zwischen diesen export Mechanismen bleibt unklar. Hier unterst&uuml;tzen wir ein Modell, in dem das am weitesten upstream-Element in einer bestimmten Abschrift, sei es, ein Intron oder eine F&ouml;rderung von ALREX SSCR, Diktat der mRNA-Export-Pfad verwendet. Wir zeigen auch experimentell, dass nukleare-codierte mitochondriale Gene der ALREX-Stoffwechselweg verwenden k&ouml;nnen. ALREX kann somit auch von Nukleotid-Signale innerhalb mitochondrische Zielversionen Sequenz Codierung Regionen (MSCRs) unterst&uuml;tzt werden. Schlie&szlig;lich haben wir erkannt und experimentell &uuml;berpr&uuml;ft Roman Motive, verbunden mit der ALREX-Weg, die von SSCRs und MSCRs geteilt werden. Unsere Ergebnisse zeigen starke Korrelation zwischen 5&#39; Untranslatierter Bereich (5&#39;UTR) Intron Anwesenheit/Abwesenheit und Sequenz Features zu Beginn die kodierende Region. Sie suggerieren, dass Gene Kodierung sekretorischen und mitochondriale Proteine einen gemeinsamen regulatorischen Mechanismus auf der Ebene der mRNA Export freigeben.

Genomanalyse zeigt Zusammenspiel von 5&#39;UTR Introns und nukleare mRNA Export f&uuml;r sekretorische und mitochondriale Gene.

Negli eucarioti superiori, RNA messaggero (mRNA) sono esportato dal nucleo al citoplasma tramite fattori depositati vicino l&#39;estremit&agrave; 5&#39; della trascrizione durante lo splicing. La sequenza segnale codifica regione (SSCR) &egrave; in grado di supportare un percorso di esportazione (ALREX) mRNA alternativi che non richiedono lo splicing. Tuttavia, la maggior parte dei geni contenenti SSCR hanno anche introni, quindi l&#39;interazione tra queste esportazioni meccanismi rimane poco chiari. Qui sosteniamo un modello in cui l&#39;elemento pi&ugrave; lontano a monte in una trascrizione di data, sia esso un introne o una promozione ALREX SSCR, dettami utilizzato il percorso di esportazione del mRNA. Abbiamo anche sperimentalmente dimostrare che geni mitocondriali codificati nucleari possono utilizzare il percorso ALREX. Cos&igrave;, ALREX pu&ograve; essere sostenuta anche da segnali di nucleotidi all&#39;interno della sequenza targeting mitocondriale codifica regioni (MSCRs). Infine, abbiamo individuato e verificato sperimentalmente romanzo motivi associati con il sentiero ALREX che sono condivisi da entrambi SSCRs e MSCRs. I nostri risultati mostrano forte correlazione tra regione 5&#39; non tradotta (5&#39;UTR) introne presenza e sequenza caratteristiche all&#39;inizio della regione codificante. Essi suggeriscono anche che i geni che codificano proteine secretorie e mitocondriale condividono un meccanismo di regolamentazione comune a livello dell&#39;esportazione del mRNA.

Analisi del genoma rivelano interazione tra 5&#39; introni UTR e l&#39;esportazione di mRNA nucleare per geni mitocondriali e secretive.

&#x9AD8;&#x7B49;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30E1;&#x30C3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B8;&#x30E3;&#x30FC;RNA&#xFF08;mRNA&#xFF09;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6642;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x306E;5 &#x26;#39;&#x672B;&#x7AEF;&#x4ED8;&#x8FD1;&#x306B;&#x5806;&#x7A4D;&#x56E0;&#x5B50;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6838;&#x304B;&#x3089;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x3078;&#x8F38;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x9818;&#x57DF;&#xFF08;SSCR&#xFF09;&#x306F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3057;&#x306A;&#x3044;&#x4EE3;&#x308F;&#x308A;&#x306B;mRNA&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#xFF08;ALREX&#xFF09;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;SSCR&#x542B;&#x6709;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3082;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#xB7;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x4E0D;&#x660E;&#x306A;&#x307E;&#x307E;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x4E0E;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x5185;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x9060;&#x3044;&#x4E0A;&#x6D41;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x307E;&#x305F;&#x306F;ALREX&#x4FC3;&#x9032;SSCR&#x305D;&#x308C;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3057;&#x3001;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x51FA;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x5B9F;&#x9A13;&#x6838;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;ALREX&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;ALREX&#x3082;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x9818;&#x57DF;&#xFF08;MSCRs&#xFF09;&#x5185;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x4FE1;&#x53F7;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x306B;S&#x200B;&#x200B;SCRs&#x3068;MSCRs&#x4E21;&#x65B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5171;&#x6709;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;ALREX&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x306E;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x3092;&#x691C;&#x8A3C;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x9818;&#x57DF;&#x306E;&#x5148;&#x982D;&#x306E;5 &#x26;#39;&#x975E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x9818;&#x57DF;&#xFF08;5&#x26;#39;UTR&#xFF09;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;/&#x4E0D;&#x5728;&#x3068;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x5F37;&#x3044;&#x76F8;&#x95A2;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x5206;&#x6CCC;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x51FA;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;

&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5206;&#x6CCC;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;5&#x26;#39;UTR&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3068;&#x6838;&#x5185;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x51FA;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;

&#xB192;&#xC740; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBA54;&#xC2E0;&#xC800; RNAs (mRNAs) &#xC811;&#xD569; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC785;&#xAE08; &#xC99D;&#xBA85;&#xC11C; 5&#39; &#xB05D; &#xAC00;&#xAE4C;&#xC774; &#xC694;&#xC778; &#xD1B5;&#xD574; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xD575;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB0B4;&#xBCF4;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC9C0;&#xC5ED; (SSCR) &#xCF54;&#xB529; &#xC2E0;&#xD638; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC811;&#xD569;&#xC744; &#xC694;&#xAD6C; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; mRNA &#xC218;&#xCD9C; (ALREX) &#xD1B5;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC6D0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; SSCR &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC04;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xB0B4;&#xBCF4;&#xB0B4;&#xAE30; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xB0A8;&#xC544; &#xBD88;&#xBD84;&#xBA85; &#xD558;&#xBBC0;&#xB85C; introns&#xC744; &#xB610;&#xD55C; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; intron &#xB610;&#xB294; ALREX &#xD64D;&#xBCF4; SSCR, mRNA &#xC218;&#xCD9C; &#xD1B5;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC9C0;&#xC2DC;&#xB294; &#xC8FC;&#xC5B4;&#xC9C4;&#xB41C; &#xB300; &#xBCF8; &#xB9E8; &#xC5C5;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC694;&#xC18C;&#xAC00; &#xB420; &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xBAA8;&#xB378; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC;&#xB9AC; &#xC544; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD575; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xB41C; ALREX &#xACBD;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, ALREX &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xC2E0;&#xD638; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC; &#xB9AC;&#xC544; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xCF54;&#xB529; &#xC601;&#xC5ED; (MSCRs) &#xC5D0;&#xC11C;&#xB3C4; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xD655;&#xC778; &#xD558; &#xACE0; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801; &#xC18C;&#xC124; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C; ALREX &#xD1B5;&#xB85C;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; Sscrs&#xC640; Mscrs&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACF5;&#xC720; &#xB418;&#xB294; &#xD655;&#xC778;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; (5&#39;UTR) intron &#xC874;&#xC7AC;/&#xBD80;&#xC7AC; &#xBC0F; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAE30;&#xB2A5; &#xCF54;&#xB529; &#xC601;&#xC5ED;&#xC758; &#xC2DC;&#xC791; &#xBD80;&#xBD84;&#xC5D0;&#xC11C; 5&#39; &#xB9DE;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xC0AC;&#xC774; &#xAC15;&#xD55C; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xB610;&#xD55C; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xBD84; &#xBC0F; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC;&#xB9AC; &#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; mRNA &#xC218;&#xCD9C; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xADDC;&#xC81C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xACF5;&#xC720; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAC8C;&#xB188; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; 5&#39;UTR introns &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xBD84; &#xBC0F; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC;&#xB9AC; &#xC544; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD575; mRNA &#xC218;&#xCD9C; &#xC0AC;&#xC774; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;.

En eucariotas superiores, los ARN mensajeros (ARNm) se exportan desde el n&#xFA;cleo hasta el citoplasma a trav&#xE9;s de factores depositados cerca del extremo 5 &#x26;#39;de la transcripci&#xF3;n durante el empalme. La regi&#xF3;n de la secuencia de codificaci&#xF3;n de se&#xF1;ales (SSCR) pueden apoyar una alternativa a la exportaci&#xF3;n del ARNm (ALREX) y la v&#xED;a que no requiere de empalme. Sin embargo, la mayor&#xED;a de SSCR que contienen los genes tambi&#xE9;n tienen intrones, por lo que la interacci&#xF3;n entre estos mecanismos de exportaci&#xF3;n sigue siendo poco clara. Aqu&#xED; apoyamos un modelo en el que el elemento que est&#xE1; m&#xE1;s arriba en una transcripci&#xF3;n dada, ya sea un intr&#xF3;n o un SSCR ALREX-promoci&#xF3;n, dicta la v&#xED;a de la exportaci&#xF3;n del ARNm utiliza. Tambi&#xE9;n demostrar experimentalmente que la energ&#xED;a nuclear-encoded genes mitocondriales pueden utilizar la v&#xED;a de ALREX. Por lo tanto, ALREX tambi&#xE9;n puede ser apoyado por las se&#xF1;ales de nucle&#xF3;tidos en las regiones de la secuencia mitocondrial orientaci&#xF3;n de codificaci&#xF3;n (MSCRs). Por &#xFA;ltimo, hemos identificado y verificado experimentalmente nuevos motivos relacionados con la v&#xED;a ALREX que son compartidos por ambos SSCRs y MSCRs. Nuestros resultados muestran una fuerte correlaci&#xF3;n entre (5&#x26;#39;UTR) caracter&#xED;sticas de la regi&#xF3;n no traducida 5 &#x26;#39;intr&#xF3;n presencia / ausencia y la secuencia en el comienzo de la regi&#xF3;n codificante. Tambi&#xE9;n sugieren que los genes que codifican secretora y las prote&#xED;nas mitocondriales comparten un mecanismo com&#xFA;n de regulaci&#xF3;n en el &#xE1;mbito de la exportaci&#xF3;n del ARNm.

El an&#xE1;lisis del genoma revela interacci&#xF3;n entre los intrones 5&#x26;#39;UTR y exportaci&#xF3;n del mRNA nuclear para secretora y los genes mitocondriales

Stefan P. Tarnawsky

Biography

JoVE Journal Publications

Other Publications