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Agarose Gel Electrophoresis for the Separation of DNA Fragments

Agarose gel electrophoresis is the most effective way of separating DNA fragments of varying sizes ranging from 100 bp to 25 kb1. Agarose is isolated from ...

University of California Los Angeles 

&#x30DC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30FC; &#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5236;&#x5FA1;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A6;&#x30CB;&#x80DA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4E2D;&#x80DA;&#x8449;&#x3068;&#x5185;&#x80DA;&#x8449;&#x306E;&#x4ED5;&#x69D8;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3053;&#x3053;&#x306B;&#x8981;&#x7D04;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x6442;&#x52D5;&#x89E3;&#x6790;&#x8A08;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x8AD6;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3001;&#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x3001;&#x5206;&#x5B50;&#x767A;&#x751F;&#x5B66;&#x3068;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066;&#x304B;&#x3089;&#x6D3E;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x73FE;&#x6642;&#x70B9;&#x3067;&#x306F;&#x3001;40 &#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;&#x5404;&#x30CE;&#x30FC;&#x30C9;&#x306F; cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x308B; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x76F4;&#x63A5;&#x691C;&#x8A3C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30C6;&#x30AF;&#x30C1;&#x30E3;&#x958B;&#x767A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x304B;&#x3064;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x5074;&#x9762;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x4E0E;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x305D;&#x306E;&#x5B9A;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x904B;&#x547D;&#x3067;&#x80DA;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3057;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x304C;&#x5BB9;&#x8D66;&#x306A;&#x304F;&#x79FB;&#x52D5;&#x306A;&#x305C;&#x767A;&#x9054;&#x306E;&#x6642;&#x9593;&#x3067;&#x8EE2;&#x9001;&#x3002;

&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x958B;&#x767A;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3002;

Sviluppo del piano di corpo &egrave; controllato da grandi network di geni regolatori. Una rete regolamentare del gene che controlla la specificazione dell&#39;endoderma e mesoderma nell&#39;embrione di riccio di mare &egrave; riassunta qui. La rete &egrave; stata derivata dall&#39;analisi di perturbazione su larga scala, in combinazione con metodologie di calcolo, dati genomici, analisi cis-regolatori ed embriologia molecolare. La rete contiene oltre 40 geni in questo momento, e ogni nodo pu&ograve; essere verificata direttamente a livello di sequenza del DNA da analisi cis-regolatori. La sua architettura rivela aspetti specifici e generali di sviluppo, ad esempio come dato cellule generano i loro destini ordinati nell&#39;embrione e perch&eacute; il processo si muove inesorabilmente in avanti nel tempo dello sviluppo.

Una rete genomic normativa per lo sviluppo.

&#x8BE5;&#x673A;&#x6784;&#x8BA1;&#x5212;&#x53D1;&#x5C55;&#x88AB;&#x53D7;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5927;&#x578B;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6C47;&#x603B;&#x63A7;&#x5236;&#x7684;&#x89C4;&#x8303;&#x7684;&#x5185;&#x80DA;&#x5C42;&#x3001; &#x4E2D;&#x80DA;&#x5C42;&#x4E2D;&#x7684;&#x6D77;&#x80C6;&#x80DA;&#x80CE;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x88AB;&#x6765;&#x81EA;&#x5927;&#x578B;&#x7684;&#x6444;&#x52A8;&#x5206;&#x6790;&#x3001; &#x8BA1;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3001; &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x3001; &#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x5206;&#x5B50;&#x80DA;&#x80CE;&#x5B66;&#x7684;&#x7ED3;&#x5408;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x8BE5;&#x7F51;&#x7EDC;&#x5305;&#x542B;&#x8D85;&#x8FC7; 40 &#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x8282;&#x70B9;&#x53EF;&#x4EE5;&#x76F4;&#x63A5;&#x9A8C;&#x8BC1; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x4E00;&#x7EA7;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x89C4;&#x5236;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x5B83;&#x7684;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7ED3;&#x6784;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86;&#x5177;&#x4F53;&#x548C;&#x4E00;&#x822C;&#x53D1;&#x5C55;&#x65B9;&#x9762;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#x5982;&#x4F55;&#x9274;&#x4E8E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5728;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x751F;&#x6210;&#x5176;&#x53D7;&#x6212;&#x7684;&#x547D;&#x8FD0;&#x548C;&#x4E3A;&#x4EC0;&#x4E48;&#x8FDB;&#x7A0B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x963B;&#x6321;&#x5730;&#x79FB;&#x52A8;&#x5411;&#x524D;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x3002;

&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;

Development of the body plan is controlled by large networks of regulatory genes. A gene regulatory network that controls the specification of endoderm and mesoderm in the sea urchin embryo is summarized here. The network was derived from large-scale perturbation analyses, in combination with computational methodologies, genomic data, cis-regulatory analysis, and molecular embryology. The network contains over 40 genes at present, and each node can be directly verified at the DNA sequence level by cis-regulatory analysis. Its architecture reveals specific and general aspects of development, such as how given cells generate their ordained fates in the embryo and why the process moves inexorably forward in developmental time.

A genomic regulatory network for development.

&Eacute;laboration du plan de corps est contr&ocirc;l&eacute;e par les grands r&eacute;seaux de g&egrave;nes r&eacute;gulateurs. Un r&eacute;seau de r&eacute;gulation de g&egrave;ne qui contr&ocirc;le la sp&eacute;cification de l&#39;endoderme et le m&eacute;soderme chez l&#39;embryon d&#39;oursin est r&eacute;sum&eacute; ici. Le r&eacute;seau a &eacute;t&eacute; d&eacute;riv&eacute; d&#39;analyses des perturbations &agrave; grande &eacute;chelle, en combinaison avec les m&eacute;thodologies de calculs, les donn&eacute;es g&eacute;nomiques, cis-regulatory analysis et embryologie mol&eacute;culaire. Le r&eacute;seau contient plus de 40 g&egrave;nes &agrave; l&#39;heure actuelle, et chaque n&oelig;ud peut &ecirc;tre directement v&eacute;rifi&eacute;e au niveau de s&eacute;quence de l&#39;ADN par cis-regulatory analysis. Son architecture r&eacute;v&egrave;le des aspects sp&eacute;cifiques et g&eacute;n&eacute;rales de d&eacute;veloppement, par exemple, comment les cellules g&eacute;n&egrave;rent leurs destins ordonn&eacute;s dans l&#39;embryon et pourquoi le processus se d&eacute;place inexorablement en avant dans le temps du d&eacute;veloppement.

Un r&eacute;seau de r&eacute;gulation g&eacute;nomique pour le d&eacute;veloppement.

Eine genomische regulatorisches Netzwerk f&#xFC;r die Entwicklung.

&#xBC14;&#xB514; &#xACC4;&#xD68D;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xADDC;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB300;&#xADDC;&#xBAA8; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC81C;&#xC5B4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. Endoderm / &#xC131; &#xAC8C; &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; mesoderm &#xC0AC;&#xC591; &#xC81C;&#xC5B4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xADDC;&#xC81C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xB294; &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC694;&#xC57D; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xCEF4;&#xD4E8;&#xD305; &#xBC29;&#xBC95;&#xB860;, &#xAC8C;&#xB188; &#xB370;&#xC774;&#xD130;, cis &#xADDC;&#xC815; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xBD84;&#xC790; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD559; &#xD568;&#xAED8; &#xB300;&#xADDC;&#xBAA8; &#xC12D; &#xB3D9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xB798; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;, 40 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBC0F; &#xAC01; &#xB178;&#xB4DC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC9C1;&#xC811; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB808;&#xBCA8;&#xC5D0;&#xC11C; cis &#xADDC;&#xC815; &#xBD84;&#xC11D;. &#xC544;&#xD0A4;&#xD14D;&#xCC98; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xBC29;&#xBC95; &#xB4F1;&#xC758; &#xAD6C;&#xCCB4;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC591;&#xC0C1;&#xC744; &#xACC4;&#xC2DC; &#xD55C;&#xB2E4; &#xC140; &#xC8FC;&#xC5B4;&#xC9C4; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC548; &#xC218; &#xC6B4;&#xBA85;&#xC744; &#xBC30;&#xC544; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558; &#xACE0; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4; &#xC774;&#xB3D9; inexorably &#xC65C; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xC2DC;&#xAC04;&#xC5D0; &#xC55E;&#xC73C;&#xB85C;.

&#xAC1C;&#xBC1C;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xAC8C;&#xB188; &#xADDC;&#xC81C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Desarrollo plan del cuerpo es controlado por las grandes redes de genes reguladores. Una red de gene regulador que controla la especificaci&oacute;n del endodermo y mesodermo en el embri&oacute;n de erizo de mar se resume aqu&iacute;. La red se deriva del an&aacute;lisis de perturbaci&oacute;n a gran escala, en combinaci&oacute;n con m&eacute;todos computacionales, datos gen&oacute;micos, an&aacute;lisis cis-reguladores y Embriolog&iacute;a molecular. La red contiene m&aacute;s de 40 genes en la actualidad, y cada nodo puede ser verificado directamente en el nivel de la secuencia de ADN por an&aacute;lisis cis-regulaci&oacute;n. Su arquitectura revela aspectos espec&iacute;ficos y generales de desarrollo, tales como c&eacute;lulas generan sus destinos ordenados en el embri&oacute;n y por ello el proceso avanza inexorablemente hacia adelante en el tiempo de desarrollo.

Una red de Regulaci&oacute;n Gen&oacute;mica para el desarrollo.

&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x5728;&#x5927;&#x7EB2;&#x4E2D;&#x89E3;&#x91CA;&#x4E86;&#x5982;&#x4F55;&#x63A7;&#x5236; endomesodermal &#x89C4;&#x8303;&#x4E2D;&#x7684;&#x6D77;&#x80C6;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E34;&#x65F6; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x57FA;&#x4E8E;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F51;&#x7EDC;&#x7684;&#x5F53;&#x524D;&#x7A97;&#x4F53;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x6A21;&#x578B;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x8FDE;&#x7EED;&#x4FEE;&#x8BA2;&#x548C;&#x589E;&#x957F;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x6DFB;&#x52A0;&#x65B0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x65B0;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7ED3;&#x679C;&#x53D8;&#x4E3A;&#x53EF;&#x7528; &#xFF1B;&#x8BF7;&#x53C2;&#x9605;&#x6700;&#x65B0;&#x7248;&#x672C; http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm &#xFF08;&#x7ED3;&#x675F; mes &#x57FA;&#x56E0;&#x7F51;&#x7EDC;&#x66F4;&#x65B0;&#xFF09;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x8BB8;&#x591A;&#x65B0;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E86;&#x8FD9;&#x4E00;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x548C;&#x6700;&#x7F16;&#x7801; dna &#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x5305;&#x542B;&#x8D85;&#x8FC7; 40 &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x7684;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7ED3;&#x6784;&#x662F;&#x6700;&#x521D;&#x63A5;&#x89E6;&#x96C6;&#x6210;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x636E;&#xFF0C;&#x73B0;&#x5728;&#x53EF;&#x5BF9; endomesoderm &#x89C4;&#x8303;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684;&#x903B;&#x8F91;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x6784;&#x5EFA;&#x3002;&#x5C31;&#x529F;&#x80FD;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x5DF2;&#x901A;&#x8FC7;&#x76D1;&#x7BA1;&#x6270;&#x52A8;&#x5BF9;&#x7F51;&#x7EDC;&#x4E2D;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x76F8;&#x5173;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x6D4B;&#x91CF;&#x786E;&#x5B9A;&#x7F51;&#x7EDC;&#x4E2D;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5185;&#x90E8;&#x8054;&#x7CFB;&#x3002;&#x5DF2;&#x5E94;&#x7528;&#x7684;&#x6444;&#x52A8;&#x7684;&#x4E94;&#x79CD;&#xFF1A; (1) &#x4F7F;&#x7528; morpholino &#x53CD;&#x4E49;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684;&#x5BF9;&#x8BB8;&#x591A;&#x5173;&#x952E;&#x8C03;&#x8282;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7F51;&#x7EDC; &#xFF1B;(2) &#x5176;&#x4ED6;&#x76D1;&#x7BA1;&#x56E0;&#x7D20;&#x8F6C;&#x5316;&#x4E3A;&#x4E3B;&#x5BFC;&#x7684;&#x952F;&#x9F7F;&#x963B;&#x904F;&#x7269;&#x57DF;&#x878D;&#x5408; &#xFF1B; &#x5EFA;&#x8BBE; repressors(3) &#x5F02;&#x4F4D;&#x8868;&#x8FBE;&#x9274;&#x4E8E;&#x76D1;&#x7BA1;&#x56E0;&#x7D20;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x9057;&#x4F20;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6784;&#x9020;&#x548C;&#x6CE8;&#x5165;&#x5206;&#x6CCC; &#xFF1B;(4) &#x5BF9; &beta;-&#x8FDE;&#x73AF;&#x7D20;/Tcf &#x901A;&#x8DEF;&#x901A;&#x8FC7; mRNA &#x7F16;&#x7801;&#x80DE;&#x5185;&#x57DF;&#x7684;&#x9499; &#xFF1B; &#x5B9E;&#x884C;&#x5C01;&#x9501;&#x548C; (5) &#x5C01;&#x9501;&#x7684;&#x69FD;&#x53E3;&#x7684; mRNA &#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x69FD;&#x53E3;&#x53D7;&#x4F53;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x4FE1;&#x53F7;&#x901A;&#x8DEF;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x6A21;&#x578B;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x94FE;&#x63A5;&#x5230;&#x7F51;&#x7EDC;&#x4E2D;&#x7684;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x6295;&#x5165;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x5176;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7ED3;&#x6784;&#x662F;&#x7531;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x89C4;&#x5236;&#x5206;&#x6790;&#x53EF;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x3002;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x53CA;&#x91CD;&#x7EC4; Lytechinus &#x9CBD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; BAC &#x5B50;&#x7F51;&#x7EDC;&#x4E2D;&#x5305;&#x542B;&#x5927;&#x91CF;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x53CA;&#x6CE8;&#x91CA;&#x3002;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x9884;&#x6D4B;&#x6781;&#x5927;&#x5730;&#x4FBF;&#x5229;&#x79CD;&#x95F4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5E8F;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x8981;&#x70B9;&#x4E4B;&#x524D;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5FEB;&#x901F;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;&#x7F51;&#x7EDC;&#x6307;&#x5B9A; genomically &#x7F16;&#x7801;&#x76D1;&#x7BA1;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x65E9;&#x671F;&#x5375;&#x548C;&#x539F;&#x80A0;&#x9636;&#x6BB5;&#x4E4B;&#x95F4;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x63A7;&#x5236;&#x7684;&#x89C4;&#x8303; micromere &#x6CBF;&#x88AD;&#x548C;&#x521D;&#x59CB; veg(2) endomesodermal &#x57DF; &#xFF1B;blastula &#x7EA7;&#x95F4;&#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x4E2D;&#x592E; veg(2) &#x4E2D;&#x80DA;&#x53F6;&#x57DF; &#xFF08;&#x5373;&#xFF0C;&#x8F85;&#x52A9;&#x95F4;&#x5145;&#x8D28;&#x7956;&#x57DF;&#xFF09; &#x4ECE;&#x5916;&#x56F4; veg(2) &#x80DA;&#x57DF; &#xFF1B;&#x7A33;&#x5B9A;&#x7684;&#x89C4;&#x8303;&#x56FD;&#x5BB6;&#x5185;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57DF; &#xFF1B;&#x548C;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E0B;&#x6E38;&#x5206;&#x5316;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x3002;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x89C4;&#x683C;&#x7684;&#x65F6;&#x7A7A;&#x9636;&#x6BB5;&#x53C2;&#x52A0;&#x7684;&#x7F51;&#x7EDC;&#x6A21;&#x578B;&#xFF0C;&#x5728;&#x7279;&#x5B9A;&#x9636;&#x6BB5;&#x5BF9;&#x5F85;&#x76D1;&#x7BA1;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x6709;&#x5173;&#x80DA;&#x80CE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x5185;&#x7684;&#x5B50;&#x5143;&#x7D20;&#x3002;

&#x89C4;&#x683C; endomesoderm &#x6D77;&#x80C6;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x4E34;&#x65F6;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;

We present the current form of a provisional DNA sequence-based regulatory gene network that explains in outline how endomesodermal specification in the sea urchin embryo is controlled. The model of the network is in a continuous process of revision and growth as new genes are added and new experimental results become available; see http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (End-mes Gene Network Update) for the latest version. The network contains over 40 genes at present, many newly uncovered in the course of this work, and most encoding DNA-binding transcriptional regulatory factors. The architecture of the network was approached initially by construction of a logic model that integrated the extensive experimental evidence now available on endomesoderm specification. The internal linkages between genes in the network have been determined functionally, by measurement of the effects of regulatory perturbations on the expression of all relevant genes in the network. Five kinds of perturbation have been applied: (1) use of morpholino antisense oligonucleotides targeted to many of the key regulatory genes in the network; (2) transformation of other regulatory factors into dominant repressors by construction of Engrailed repressor domain fusions; (3) ectopic expression of given regulatory factors, from genetic expression constructs and from injected mRNAs; (4) blockade of the beta-catenin/Tcf pathway by introduction of mRNA encoding the intracellular domain of cadherin; and (5) blockade of the Notch signaling pathway by introduction of mRNA encoding the extracellular domain of the Notch receptor. The network model predicts the cis-regulatory inputs that link each gene into the network. Therefore, its architecture is testable by cis-regulatory analysis. Strongylocentrotus purpuratus and Lytechinus variegatus genomic BAC recombinants that include a large number of the genes in the network have been sequenced and annotated. Tests of the cis-regulatory predictions of the model are greatly facilitated by interspecific computational sequence comparison, which affords a rapid identification of likely cis-regulatory elements in advance of experimental analysis. The network specifies genomically encoded regulatory processes between early cleavage and gastrula stages. These control the specification of the micromere lineage and of the initial veg(2) endomesodermal domain; the blastula-stage separation of the central veg(2) mesodermal domain (i.e., the secondary mesenchyme progenitor field) from the peripheral veg(2) endodermal domain; the stabilization of specification state within these domains; and activation of some downstream differentiation genes. Each of the temporal-spatial phases of specification is represented in a subelement of the network model, that treats regulatory events within the relevant embryonic nuclei at particular stages.

A provisional regulatory gene network for specification of endomesoderm in the sea urchin embryo.

Nous pr&eacute;sentons la forme actuelle d&#39;un r&eacute;seau de g&egrave;ne de r&eacute;gulation ax&eacute;e sur la s&eacute;quence ADN provisoire qui explique dans les grandes lignes Comment contr&ocirc;le-t-on l&#39;endom&eacute;soderme sp&eacute;cification dans l&#39;embryon d&#39;oursin. Le mod&egrave;le du r&eacute;seau est dans un processus continu de r&eacute;vision et de la croissance comme les nouveaux g&egrave;nes sont ajout&eacute;es et de nouveaux r&eacute;sultats exp&eacute;rimentaux seront disponibles ; Voir http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (fin-mes g&egrave;nes Network Update) pour obtenir la derni&egrave;re version. Le r&eacute;seau contient plus de 40 g&egrave;nes &agrave; l&#39;heure actuelle, beaucoup nouvellement d&eacute;couvert dans le cadre de ce travail et les facteurs de r&eacute;gulation transcriptionnelles de codage plus liant &agrave; l&#39;ADN. L&#39;architecture du r&eacute;seau a &eacute;t&eacute; approch&eacute; au d&eacute;part par la construction d&#39;un mod&egrave;le logique qui a int&eacute;gr&eacute; l&#39;abondante preuve exp&eacute;rimentale maintenant disponible sur endomesoderm cahier des charges. Les liens internes entre les g&egrave;nes du r&eacute;seau ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es sur le plan fonctionnel, en mesurant les effets des perturbations r&eacute;glementaires sur l&#39;expression de tous les g&egrave;nes concern&eacute;s dans le r&eacute;seau. Cinq types de perturbations ont &eacute;t&eacute; appliqu&eacute;es: (1) utilisation des oligonucl&eacute;otides antisens morpholino, destin&eacute;s &agrave; de nombreux les g&egrave;nes r&eacute;gulateurs cl&eacute;s du r&eacute;seau ; (2) transformation d&#39;autres facteurs de r&eacute;gulation en dominants r&eacute;presseurs de construction des fusions de r&eacute;presseur engr&ecirc;l&eacute;e de domaine ; (3) l&#39;expression ectopique de compte tenu de facteurs de r&eacute;gulation, de constructions de l&#39;expression g&eacute;n&eacute;tique et de l&#39;ARNm inject&eacute;e ; (4) le blocage de la voie de la beta-cat&eacute;nine/Tcf par introduction d&#39;ARNm codant pour le domaine intracellulaire de cadh&eacute;rine ; et la voie de signalisation de blocage (5) de l&#39;encoche par introduction d&#39;ARNm codant pour le domaine extracellulaire du r&eacute;cepteur de l&#39;encoche. Le mod&egrave;le de r&eacute;seau pr&eacute;voit les cis-r&eacute;glementation intrants qui relient chaque g&egrave;ne dans le r&eacute;seau. Donc, son architecture est testable par analyse r&eacute;glementaire-cis. Strongylocentrotus purpuratus et Lytechinus variegatus g&eacute;nomiques BAC recombinants qui incluent un grand nombre de g&egrave;nes dans le r&eacute;seau ont &eacute;t&eacute; s&eacute;quenc&eacute;s et annot&eacute;s. Essais des pr&eacute;dictions du mod&egrave;le r&eacute;glementaires cis sont grandement facilit&eacute;es par la comparaison des s&eacute;quences de calcul intersp&eacute;cifiques, qui permet une identification rapide des &eacute;l&eacute;ments cis-r&eacute;gulateurs probables avant analyse exp&eacute;rimentale. Le r&eacute;seau sp&eacute;cifie g&eacute;nomiquement encod&eacute;s les processus r&eacute;glementaires entre les &eacute;tapes de la gastrula et clivage au d&eacute;but. Ceux-ci contr&ocirc;lent la sp&eacute;cification de la lign&eacute;e de micromere et du domaine initial veg(2) endom&eacute;soderme ; la s&eacute;paration du stade blastula du domaine m&eacute;sodermiques veg(2) central (c.-&agrave;-d., le champ de prog&eacute;niteurs m&eacute;senchyme secondaire) du domaine endodermique veg(2) p&eacute;riph&eacute;riques ; la stabilisation de l&#39;&eacute;tat de la sp&eacute;cification dans ces domaines ; et l&#39;activation de certains g&egrave;nes de diff&eacute;renciation en aval. Chacune des phases temporelles et spatiales de la sp&eacute;cification est repr&eacute;sent&eacute; dans un sous-&eacute;l&eacute;ment du mod&egrave;le de r&eacute;seau, qui traite des &eacute;v&eacute;nements r&eacute;glementaires dans les noyaux embryonnaires pertinentes &agrave; certaines &eacute;tapes.

Un r&eacute;seau provisoire de g&egrave;ne r&eacute;gulateur pour la sp&eacute;cification d&#39;endomesoderm dans l&#39;embryon d&#39;oursin.

Eine vorl&#xE4;ufige regulatorische Gen-Netzwerk f&#xFC;r Spezifikation von endomesoderm im Seeigel Embryo.

Vi presentiamo la forma attuale di una provvisoria rete DNA basato su sequenze geniche regolatorie che spiega a grandi linee come endomesodermal specifica nell&#39;embrione di riccio di mare &egrave; controllato. Il modello della rete &egrave; in un continuo processo di revisione e di crescita come vengono aggiunti nuovi geni e di nuovi risultati sperimentali sono disponibili; vedi http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (aggiornamento di rete Gene fine-mes) per la versione pi&ugrave; recente. La rete contiene oltre 40 geni attualmente, molti appena scoperto nel corso di questo lavoro e pi&ugrave; codifica DNA-binding transcriptional fattori normativi. L&#39;architettura della rete &egrave; stato avvicinato inizialmente dalla costruzione di un modello di logica che hanno integrato la vasta prova sperimentale ora disponibile su endomesoderm specifica. I collegamenti interni tra geni in rete sono stati determinati funzionalmente, tramite la misura degli effetti di perturbazioni regolamentazione sull&#39;espressione dei geni rilevanti nella rete. Cinque tipi di perturbazione sono stati applicati: (1) utilizzo di oligonucleotidi antisense oligonucleotides mirati a molti dei geni regolatori chiavi della rete; (2) trasformazione di altri fattori normativi in repressori dominante dalla costruzione delle fusioni di dominio repressor Engrailed; (3) ectopica espressione del dato fattori normativi, da costrutti di espressione genetica e da mRNAs iniettato; (4) blocco della beta-catenina/Tcf via dall&#39;introduzione di mRNA che codifica il dominio intracellulare di cadherin; e (5) blocco della tacca signaling pathway dall&#39;introduzione di mRNA che codifica il dominio extracellulare del recettore Notch. Il modello di rete prevede i cis-regolatori ingressi che collegano ogni gene in rete. Pertanto, la sua architettura &egrave; verificabile dall&#39;analisi cis-regolatori. Strongylocentrotus purpuratus e Lytechinus variegatus genomic ricombinanti del BAC che includono un gran numero di geni in rete sono stati sequenziati e annotate. Test delle previsioni del modello cis-regolatori sono notevolmente facilitata dal confronto interspecifici sequenza computazionale, che offre una rapida individuazione di probabili elementi cis-regolatori in anticipo analisi sperimentale. La rete specifica genomically codificati processi normativi tra scissione precoce e fasi di gastrula. Questi controllano la specifica del lignaggio micromere e del dominio iniziale veg(2) endomesodermal; la separazione di blastula fase del veg(2) centrale mesodermica dominio (cio&egrave;, il campo del progenitore mesenchima secondario) dal dominio endodermico veg(2) periferici; la stabilizzazione dello stato specifica all&#39;interno di questi domini; e l&#39;attivazione di alcuni geni di differenziazione a valle. Ciascuna delle fasi temporali-spaziali della specifica &egrave; rappresentato in un sottoelemento del modello di rete che tratta eventi normativi all&#39;interno di nuclei embrionali pertinenti alle fasi particolari.

Una rete di gene regolatore provvisorio per la specifica di endomesoderm nell&#39;embrione di riccio di mare.

&#x30A6;&#x30CB;&#x80DA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; endomesodermal &#x4ED5;&#x69D8;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306E;&#x6982;&#x8981;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x4EEE; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x898F;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB; &#x30EA;&#x30D3;&#x30B8;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x7D99;&#x7D9A;&#x7684;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x7D50;&#x679C;&#x304C;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x3068;&#x3067;&#x3059;;http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9; mes &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF; &#x30A2;&#x30C3;&#x30D7; &#x30C7;&#x30FC;&#x30C8;&#xFF09; &#x306E;&#x6700;&#x65B0;&#x30D0;&#x30FC;&#x30B8;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x53C2;&#x7167;&#x3057;&#x3066;&#x304F;&#x3060;&#x3055;&#x3044;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x304F;&#x3053;&#x306E;&#x4ED5;&#x4E8B;&#x3068;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x7B26;&#x53F7;&#x5316;&#x306E; DNA &#x7D50;&#x5408;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x3067;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x306A;&#x3063;&#x305F;&#x4EE5;&#x4E0A; 40 &#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x542B;&#x3093;&#x3067;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x5EFA;&#x7BC9;&#x306F;&#x3001;&#x5F53;&#x521D;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x8A3C;&#x62E0; endomesoderm &#x4ED5;&#x69D8;&#x3067;&#x4ECA;&#x3059;&#x3050;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3092;&#x7D71;&#x5408;&#x30ED;&#x30B8;&#x30C3;&#x30AF; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x69CB;&#x7BC9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8FD1;&#x3065;&#x304B;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3067;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x5185;&#x90E8;&#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B8;&#x306F;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x5185;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x6442;&#x52D5;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;5 &#x7A2E;&#x985E;&#x306E;&#x6442;&#x52D5;&#x304C;&#x9069;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;: (1) &#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x306B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30AD;&#x30FC;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;; &#x3067;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; morpholino &#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B9; &#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;(2) &#x4ED6;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x306E;&#x5EFA;&#x8A2D;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B0;&#x30EC;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30EA;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x878D;&#x5408;&#x306E;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x30EA;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306B;&#x5909;&#x63DB;;3&#xFF09; &#x7570;&#x6240;&#x7684;&#x767A;&#x73FE;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56E0;&#x5B50;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x3068;&#x6CE8;&#x5165;&#x3055;&#x308C;&#x305F; Mrna &#x304B;&#x3089;&#x4E0E;&#x3048;;4&#xFF09; &#x30AB;&#x30C9;&#x30D8;&#x30EA;&#x30F3;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9; mRNA &#x306E;&#x5C0E;&#x5165;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; &beta;-&#x30AB;&#x30C6;&#x30CB;&#x30F3;/Tcf &#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x5C01;&#x9396;;&#xFF08;5&#xFF09; &#x306E;&#x5C01;&#x9396;&#x30CE;&#x30C3;&#x30C1;&#x306E; Notch &#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9; mRNA &#x306E;&#x5C0E;&#x5165;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3002;&#x5404;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF; &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF; cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x5165;&#x529B;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30C6;&#x30AF;&#x30C1;&#x30E3;&#x306F; cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x3068;&#x3001;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306B;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x542B;&#x3080; Lytechinus &#x8FBC;&#x307F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; BAC recombinants &#x304C;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3001;&#x6CE8;&#x91C8;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x4E88;&#x6E2C;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x5927;&#x5E45;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C; cis &#x898F;&#x5236;&#x8981;&#x7D20;&#x5B9F;&#x9A13;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x5148;&#x7ACB;&#x3063;&#x3066;&#x306E;&#x8FC5;&#x901F;&#x306A;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092; affords &#x7A2E;&#x9593;&#x8A08;&#x7B97;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4FC3;&#x9032;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF; genomically &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x898F;&#x5236;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x521D;&#x671F;&#x5375;&#x5272;&#x3068;&#x539F;&#x8178;&#x80DA;&#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B8;&#x9593;&#x3092;&#x6307;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x4ED5;&#x69D8;&#x3068;&#x521D;&#x671F; veg(2) endomesodermal &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x5C0F;&#x5272;&#x7403;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;;&#x4E2D;&#x592E; veg(2) &#x4E2D;&#x80DA;&#x8449;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; (&#x3059;&#x306A;&#x308F;&#x3061;&#x3001;&#x4E8C;&#x6B21;&#x9593;&#x5145;&#x7E54;&#x306E;&#x524D;&#x99C6;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30EB;&#x30C9;) &#x672B;&#x68A2; veg(2) &#x5185;&#x80DA;&#x8449;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x80DE;&#x80DA;&#x6BB5;&#x968E;&#x5206;&#x96E2;;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x5185;&#x306E;&#x4ED5;&#x69D8;&#x72B6;&#x614B;&#x306E;&#x5B89;&#x5B9A;&#x5316;;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x4E0B;&#x6D41;&#x5206;&#x5316;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3002;&#x5404;&#x4ED5;&#x69D8;&#x306E;&#x6642;&#x7A7A;&#x7684;&#x6BB5;&#x968E;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x95A2;&#x9023;&#x306E;&#x80DA;&#x6838;&#x5185;&#x3067;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x6271;&#x3046;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x8981;&#x7D20;&#x3067;&#x8868;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A6;&#x30CB;&#x80DA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; endomesoderm &#x306E;&#x4ED5;&#x69D8;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x66AB;&#x5B9A;&#x898F;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3002;

&#xC131; &#xAC8C; &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; endomesodermal &#xC0AC;&#xC591; &#xC81C;&#xC5B4; &#xBC29;&#xBC95; &#xAC1C;&#xC694;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xB294; &#xC784;&#xC2DC; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAE30;&#xBC18; &#xADDC;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC758; &#xD604;&#xC7AC; &#xD615;&#xD0DC;&#xB294; &#xC120;&#xBB3C;&#xC774;. &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xAC00; &#xCD94;&#xAC00; &#xB418; &#xACE0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xACB0;&#xACFC; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD574;; &#xC218;&#xC815; &#xBC0F; &#xC131;&#xC7A5;&#xC758; &#xC5F0;&#xC18D; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378;&#xC740; &#xCD5C;&#xC2E0; &#xBC84;&#xC804;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (&#xCD5C;&#xC885;-mes &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC5C5;&#xB370;&#xC774;&#xD2B8;)&#xB97C; &#xCC38;&#xC870; &#xD558;&#xC2ED;&#xC2DC;&#xC624;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC774; &#xC791;&#xC5C5;&#xACFC; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; transcriptional &#xADDC;&#xC81C; &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1D;&#xD600; &#xB0B8; &#xB9CE;&#xC740; &#xD604;&#xC7AC; 40 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xAC00; &#xD3EC;&#xD568; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC544;&#xD0A4;&#xD14D;&#xCC98;&#xB294; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC9C0;&#xAE08; endomesoderm &#xC0AC;&#xC591;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xD1B5;&#xD569; &#xB17C;&#xB9AC; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; &#xAC74;&#xC124;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xCC98;&#xC74C; &#xC811;&#xADFC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xB0B4;&#xBD80; &#xC5F0;&#xACC4; &#xAE30;&#xB2A5;, &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0; &#xADDC;&#xC81C; &#xBB3C;&#xACB0; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC758; &#xCE21;&#xC815;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xC12F; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xC12D; &#xB3D9; &#xC801;&#xC6A9;: morpholino &#xC13C;&#xC2A4; oligonucleotides; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD575;&#xC2EC; &#xADDC;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB9CE;&#xC740; &#xB300;&#xC0C1;&#xC758; (1) &#xC0AC;&#xC6A9; (2) Engrailed &#xC9C4;&#xC555; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; fusions;&#xC758; &#xAC74;&#xC124;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; repressors&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xADDC;&#xC81C; &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654; (3) &#xC18C;&#xC131; &#xD45C;&#xD604;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C; &#xC694;&#xC778;, &#xC8FC;&#xC5B4;&#xC9C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xD604; &#xAD6C;&#xBB38; &#xBC0F; &#xC8FC;&#xC785;&#xB41C; mRNAs; (4) mRNA &#xC778;&#xCF54;&#xB529; cadherin;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC;&#xB0B4; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xB3C4;&#xC785;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBCA0;&#xD0C0;-catenin/Tcf &#xD1B5;&#xB85C; &#xBD09;&#xC1C4; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB178;&#xCE58;&#xC758; (5) &#xBD09;&#xC1C4; &#xB178;&#xCE58; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; Mrna&#xC758; &#xB3C4;&#xC785; &#xD558; &#xC5EC; &#xD1B5;&#xB85C; &#xC2E0;&#xD638;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBAA8;&#xB378; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0; &#xAC01; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558;&#xB294; cis &#xADDC;&#xC815; &#xC785;&#xB825;&#xC744; &#xC608;&#xCE21; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC790;&#xC0AC;&#xC758; &#xC544;&#xD0A4;&#xD14D;&#xCC98;&#xB294; cis &#xADDC;&#xC815; &#xBD84;&#xC11D;&#xC73C;&#xB85C; &#xC4F8;&#xB9CC;&#xD55C;. Strongylocentrotus purpuratus &#xBC0F; Lytechinus variegatus &#xAC8C;&#xB188; BAC recombinants &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0; &#xB2E4; &#xC218;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC21C;&#xC11C;&#xAC00; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xACE0; &#xC8FC;&#xC11D;. &#xD06C;&#xAC8C; &#xC694; &#xADF9;&#xC744; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; cis &#xADDC;&#xC815; &#xC694;&#xC18C; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC55E;&#xC11C; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB294; interspecific &#xC5F0;&#xC0B0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBE44;&#xAD50; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; cis &#xADDC;&#xC815; &#xC608;&#xCE21; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB97C; &#xC6A9;&#xC774; &#xD558; &#xAC8C;. &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xCD08;&#xAE30; &#xBD84;&#xC5F4; &#xBC0F; gastrula &#xB2E8;&#xACC4; &#xC0AC;&#xC774; genomically &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xB41C; &#xADDC;&#xC81C; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC9C0;&#xC815;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC81C;&#xC5B4;&#xC640; &#xCD08;&#xAE30; veg(2) endomesodermal &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;; micromere &#xD608;&#xD1B5;&#xC758; &#xC0AC;&#xC591; &#xC8FC;&#xBCC0; veg(2) endodermal &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;; &#xC911;&#xC559; veg(2) mesodermal &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; (&#xC989;, 2 &#xCC28; mesenchyme &#xC870;&#xC0C1; &#xD544;&#xB4DC;) blastula &#xB2E8;&#xACC4; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;; &#xB0B4; &#xC0AC;&#xC591; &#xC0C1;&#xD0DC; &#xC548;&#xC815;&#xD654; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC77C;&#xBD80; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xBD84;&#xD654; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC01; &#xADDC;&#xACA9;&#xC758; &#xC2DC;&#xAC04;&#xC801; &#xACF5;&#xAC04;&#xC801; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC30;&#xC544; &#xAD00;&#xB828; &#xD575; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xB97C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; &#xD558;&#xC704; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC131; &#xAC8C; &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; endomesoderm&#xC758; &#xC0AC;&#xC591;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A0;&#xC815; &#xADDC;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;.

Presentamos la forma actual de una red de gene de regulaci&oacute;n basadas en la secuencia de ADN provisional que explica en el esquema de c&oacute;mo se controla la especificaci&oacute;n de endomesodermal en el embri&oacute;n de erizo de mar. El modelo de la red est&aacute; en un proceso continuo de revisi&oacute;n y crecimiento como se agregan nuevos genes y disponga de nuevos resultados experimentales; Ver http://www.its.caltech.edu/~mirsky/endomeso.htm (actualizaci&oacute;n de red End-mes Gene) para la versi&oacute;n m&aacute;s reciente. La red contiene m&aacute;s de 40 genes en la actualidad, muchos reci&eacute;n descubierto en el curso de este trabajo y factores reguladores transcripcionales de codificaci&oacute;n m&aacute;s ADN. La arquitectura de la red fue abordada inicialmente por la construcci&oacute;n de un modelo de l&oacute;gica que integran la amplia evidencia experimental ya est&aacute; disponible en la especificaci&oacute;n de endomesoderm. Los v&iacute;nculos internos entre genes en la red han sido determinados funcionalmente, medici&oacute;n de los efectos de perturbaciones reglamentarios en la expresi&oacute;n de los genes relevantes en la red. Se han aplicado cinco clases de perturbaci&oacute;n: (1) el uso de oligonucle&oacute;tidos antisentido Morfolino dirigido a muchos de los genes reguladores claves en la red; (2) transformaci&oacute;n de otros factores reguladores en dominantes represores por construcci&oacute;n de fusiones de dominio angrelado represor; (3) expresi&oacute;n ect&oacute;pica de dado factores reguladores, de construcciones de la expresi&oacute;n g&eacute;nica y de mRNAs inyectado; (4) el bloqueo de la v&iacute;a de la beta-catenina/Tcf por introducci&oacute;n de mRNA codificaci&oacute;n del dominio intracelular de cadherin; y la v&iacute;a de se&ntilde;alizaci&oacute;n de bloqueo (5) de la ranura de introducci&oacute;n del mRNA codificaci&oacute;n el dominio extracelular del receptor Notch. El modelo predice las entradas reglamentarias cis que unen cada gen en la red. Por lo tanto, su arquitectura es comprobable por an&aacute;lisis cis-regulaci&oacute;n. Strongylocentrotus purpuratus y Lytechinus variegatus recombinantes de BAC gen&oacute;micas que incluyen un gran n&uacute;mero de los genes en la red han sido secuenciados y anotado. Pruebas de las cis-reguladoras predicciones del modelo se facilitan enormemente por comparaci&oacute;n de la secuencia computacional interespec&iacute;fica, que permite una r&aacute;pida identificaci&oacute;n de elementos cis-reguladores probables antes de an&aacute;lisis experimental. La red especifica procesos regulatorios gen&oacute;micamente codificados entre escote principio y etapas de la g&aacute;strula. Estos controlan la especificaci&oacute;n del linaje micromere y el dominio de endomesodermal de veg(2) inicial; la separaci&oacute;n de la bl&aacute;stula-etapa del dominio mesod&eacute;rmico veg(2) central (es decir, el campo de la progenitora mes&eacute;nquima secundario) del dominio endodermal veg(2) perif&eacute;rica; la estabilizaci&oacute;n del estado de especificaci&oacute;n dentro de estos dominios; y la activaci&oacute;n de algunos genes de diferenciaci&oacute;n aguas abajo. Cada una de las fases temporales-espaciales de especificaci&oacute;n est&aacute; representada en un subelemento del modelo de la red, que trata de eventos reglamentarios dentro de los n&uacute;cleos embrionarios pertinentes en etapas.

Una red provisional gene regulador para la especificaci&oacute;n de endomesoderm en el embri&oacute;n de erizo de mar.

The analysis of cell fate patterning during the vulval development of Caenorhabditis elegans has relied mostly on the direct observation of cell divisions and cell movements (cell lineage analysis). However, reconstruction of the developing vulva from EM serial sections has suggested seven different cell types (vulA, vulB1, vulB2, vulC, vulD, vulE, and vulF), many of which cannot be distinguished based on such observations. Here we report the vulval expression of seven genes, egl-17, cdh-3, ceh-2, zmp-1, B0034.1, T04B2.6 and F47B8.6 based on gfp, cfp and yfp (green fluorescent protein and color variants) reporter fusions. Each gene expresses in a specific subset of vulval cells, and is therefore useful as a marker for vulval cell fates. Together, expressions of markers distinguish six cell types, and reveal a strict temporal control of gene expression in the developing vulva.

Gene expression markers for Caenorhabditis elegans vulval cells.

&#x79C0;&#x4E3D;&#x9690;&#x6746;&#x7EBF;&#x866B;&#x5916;&#x9634;&#x53D1;&#x80B2;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x547D;&#x8FD0;&#x9635;&#x5217;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x5927;&#x591A;&#x4F9D;&#x8D56;&#x76F4;&#x63A5;&#x89C2;&#x5BDF;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8FD0;&#x52A8; &#xFF08;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8C31;&#x7CFB;&#x5206;&#x6790;&#xFF09;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x4ECE; EM &#x4E32;&#x884C;&#x8282;&#x5916;&#x9634;&#x91CD;&#x5EFA;&#x5DF2;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x4E03;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B; &#xFF08;vulA&#x3001; vulB1&#x3001; vulB2&#x3001; vulC&#x3001; vulD&#x3001; vulE &#x548C; vulF&#xFF09;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x8BB8;&#x591A;&#x4E0D;&#x80FD;&#x533A;&#x5206;&#x57FA;&#x4E8E;&#x8FD9;&#x79CD;&#x610F;&#x89C1;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x62A5;&#x544A;&#x5916;&#x9634;&#x4E03;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E; gfp&#x3001; cfp &#x548C; yfp (&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x989C;&#x8272;&#x6B3E;&#x5F0F;) &#x8BB0;&#x8005;&#x878D;&#x5408; egl 17&#x3001; &#x9F0E;&#x6656; 3&#x3001; &#x96BD; 2&#x3001; zmp-1&#x3001; B0034.1&#x3001; T04B2.6 &#x548C; F47B8.6&#x3002;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x793A;&#x5728;&#x5916;&#x9634;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5B50;&#x96C6;&#xFF0C;&#x56E0;&#x6B64;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x5916;&#x9634;&#x7EC6;&#x80DE;&#x547D;&#x8FD0;&#x7684;&#x6807;&#x8BB0;&#x5F88;&#x6709;&#x7528;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#xFF0C;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x6807;&#x8BB0;&#x533A;&#x5206;&#x516D;&#x79CD;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#xFF0C;&#x548C;&#x63ED;&#x793A;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x7684;&#x5916;&#x9634;&#x4E25;&#x683C;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x63A7;&#x5236;&#x3002;

&#x79C0;&#x4E3D;&#x9690;&#x6746;&#x7EBF;&#x866B;&#x5916;&#x9634;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6807;&#x5FD7;&#x3002;

L&#39;analyse de la structuration de destin cellulaire durant le d&eacute;veloppement vulvaire de Caenorhabditis elegans repose principalement sur l&#39;observation directe des divisions cellulaires et mouvements de la cellule (analyse de lign&eacute;e cellulaire). Cependant, la reconstruction de la vulve en d&eacute;veloppement de coupes s&eacute;ri&eacute;es EM a sugg&eacute;r&eacute; sept diff&eacute;rents types de cellules (vulA, vulB1, vulB2, vulC vulD, vulE et vulF), dont beaucoup ne peuvent &ecirc;tre distingu&eacute;es sur la base des observations. Ici, nous rapportons l&#39;expression vulvaire de sept g&egrave;nes, egl-17, 3-cdh, ceh-2, 1-zmp, B0034.1, T04B2.6 et F47B8.6 fondent gfp, PDC, yfp fusions de journaliste (vert fluorescent prot&eacute;ine et couleur variantes). Chaque g&egrave;ne exprime dans un sous-ensemble sp&eacute;cifique des cellules vulvaires et est donc utile comme marqueur des destins cellulaires vulvaire. Ensemble, les expressions des marqueurs distinguent six types de cellules et r&eacute;v&egrave;lent un contr&ocirc;le temporel strict de l&#39;expression g&eacute;nique dans la vulve en d&eacute;veloppement.

Marqueurs d&#39;expression de g&egrave;nes pour cellules vulvaires de Caenorhabditis elegans.

Die Genexpression Marker f&#xFC;r Caenorhabditis elegans Vulva-Zellen.

L&#39;analisi di patterning destino delle cellule durante lo sviluppo vulvare di Caenorhabditis elegans ha si basava principalmente sull&#39;osservazione diretta delle divisioni delle cellule e dei movimenti delle cellule (analisi di lineage delle cellule). Tuttavia, la ricostruzione della vulva in via di sviluppo da sezioni seriale EM ha suggerito sette diversi tipi di cellule (vulA, vulB1, vulB2, vulC, vulD, vulE e vulF), molti dei quali non possono essere distinti sulla base di tali osservazioni. Qui riportiamo l&#39;espressione dei Sette geni vulvare, egl-17, cdh-3, ceh-2, zmp-1, B0034.1, T04B2.6 e F47B8.6 basato su gfp, cfp e yfp fusioni reporter (verde fluorescente proteina e colori varianti). Ogni gene esprime in un sottoinsieme specifico delle cellule vulvare e pertanto &egrave; utile come marker per destini cella vulvare. Insieme, le espressioni dei marcatori distinguono sei tipi di cellule e rivelano un rigoroso controllo temporale dell&#39;espressione genica nella vulva in via di sviluppo.

Marcatori di espressione genica per celle vulvare Caenorhabditis elegans.

&#x7D30;&#x80DE;&#x904B;&#x547D;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x7DDA;&#x866B;&#x306E;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x306E;&#x767A;&#x9054;&#x6BB5;&#x968E;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x7D30;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x904B;&#x52D5; (&#x7D30;&#x80DE;&#x7CFB;&#x8B5C;&#x89E3;&#x6790;) &#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x306E;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3092;&#x4E3B;&#x306B;&#x983C;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x5FA9;&#x8208;&#x9014;&#x4E0A;&#x306E;&#x5916;&#x9670;&#x90E8; EM &#x9023;&#x7D9A;&#x5207;&#x7247;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x89B3;&#x6E2C;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x591A;&#x6570;&#x304C;&#x533A;&#x5225;&#x3067;&#x304D;&#x306A;&#x3044; 7 &#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7A2E;&#x985E;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE; (vulA&#x3001;vulB1&#x3001;vulB2&#x3001;&#x30D0;&#x30EB;&#x30AB;&#x3001;vulD&#x3001;vulE&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; vulF&#xFF09; &#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067; 7 &#x3064;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3001;egl 17, &#x5148;&#x5929;&#x6027;&#x6A2A;&#x9694;&#x819C;&#x30D8;&#x30EB;&#x30CB;&#x30A2; 3&#x3001;ceh 2, zmp-1&#x3001;B0034.1&#x3001;T04B2.6&#x3001;F47B8.6 gfp&#x3001;cfp&#x3001;yfp &#xFF08;&#x7DD1;&#x8272;&#x86CD;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3068;&#x8272;&#x306E;&#x4E9C;&#x7A2E;) &#x306E;&#x8A18;&#x8005;&#x878D;&#x5408;&#x3092;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5404;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x3092;&#x8868;&#x73FE;&#x3057;&#x3001;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x7D30;&#x80DE;&#x904B;&#x547D;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6709;&#x7528;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x3001;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x5F0F;&#x306F; 6 &#x7A2E;&#x985E;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x533A;&#x5225;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x767A;&#x5C55;&#x9014;&#x4E0A;&#x306E;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x53B3;&#x683C;&#x306A;&#x6642;&#x9593;&#x5236;&#x5FA1;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7DDA;&#x866B;&#x7DDA;&#x866B;&#x5916;&#x9670;&#x90E8;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8868;&#x73FE;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;

&#xC138;&#xD3EC; &#xC6B4;&#xBA85; &#xD328;&#xD134;&#xD654; Caenorhabditis elegans&#xC758; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xBD84;&#xC11D; &#xC138;&#xD3EC; &#xBD84;&#xC5F4;&#xACFC; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC6C0;&#xC9C1;&#xC784; (&#xC138;&#xD3EC; &#xACC4;&#xBCF4; &#xBD84;&#xC11D;)&#xC758; &#xC9C1;&#xC811; &#xAD00;&#xCC30;&#xC5D0; &#xC8FC;&#xB85C; &#xC758;&#xC874; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, EM &#xC9C1;&#xB82C; &#xC139;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80;&#xC758; &#xC7AC;&#xAD6C;&#xC131; 7 &#xAC1C;&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xD615; (vulA, vulB1, vulB2, vulC, vulD, vulE, &#xBC0F; vulF)&#xC744; &#xAD6C;&#xBCC4;&#xD560; &#xC218; &#xC5C6;&#xB294; &#xADF8;&#xB7F0; &#xAD00;&#xCE21;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xC81C;&#xC548; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xBCF4;&#xACE0; 7 &#xAC1C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80; &#xD45C;&#xD604;, egl 17, cdh 3, ceh 2, zmp-1, B0034.1, T04B2.6 &#xBC0F; F47B8.6 gfp, c f p, yfp (&#xB179;&#xC0C9; &#xD615;&#xAD11; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; &#xC0C9;&#xC0C1; &#xBCC0;&#xC885;) &#xAE30;&#xC790; fusions &#xAE30;&#xBC18;. &#xAC01; &#xC9C4; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80; &#xC140;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xD604; &#xD558; &#xACE0; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80; &#xC140; &#xC6B4;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD45C;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xC720;&#xC6A9;. &#xD568;&#xAED8;, &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; &#xC2DD; 6 &#xC140; &#xC885;&#xB958;&#xB97C; &#xAD6C;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xC678; &#xC74C;&#xBD80;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC5C4;&#xACA9;&#xD55C; &#xC2DC;&#xAC04; &#xAD00;&#xB9AC; &#xACF5;&#xAC1C;.

&#xC9C4; &#xC2DD; &#xB9C8;&#xCEE4; Caenorhabditis elegans &#xC678; &#xC74C;&#xBD80; &#xC140;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

El an&aacute;lisis de patrones de destino celular durante el desarrollo vulvar de Caenorhabditis elegans ha dependido principalmente de la observaci&oacute;n directa de las divisiones de c&eacute;lula y movimientos celulares (an&aacute;lisis de linaje de la c&eacute;lula). Sin embargo, la reconstrucci&oacute;n de la vulva en desarrollo de secciones seriadas EM ha sugerido siete diferentes tipos de c&eacute;lulas (vulA, vulB1, vulB2, vulC, vulD, Vuleos y vulF), muchos de los cuales no se pueden distinguir en base a estas observaciones. Aqu&iacute; divulgamos la expresi&oacute;n vulvar de siete genes, egl-17, cdh-3, 2-ceh, zmp-1, B0034.1, T04B2.6 y F47B8.6 basan en fusiones de reportero gfp, cfp y yfp (verde fluorescente prote&iacute;nas y color variantes). Cada gen se expresa en un subconjunto espec&iacute;fico de c&eacute;lulas vulvares y por lo tanto es &uacute;til como un marcador para los sinos vulvar de la c&eacute;lula. Juntos, expresiones de marcadores distinguen seis tipos de c&eacute;lulas y revelan un estricto control temporal de la expresi&oacute;n g&eacute;nica en la vulva en desarrollo.

Marcadores de expresi&oacute;n g&eacute;nica Caenorhabditis elegans c&eacute;lulas vulvares.

L&#39;analyse de structuration destin cellulaire durant le d&eacute;veloppement vulvaire de Caenorhabditis elegans a compt&eacute; principalement sur l&#39;observation directe des divisions cellulaires et les mouvements de la cellule (analyse de la lign&eacute;e cellulaire). Cependant, la reconstruction de la vulve en d&eacute;veloppement de coupes s&eacute;ri&eacute;es EM a sugg&eacute;r&eacute; sept diff&eacute;rents types de cellules (vulA, vulB1, vulB2, vulC, vulD, vulE et vulF), dont beaucoup ne peuvent pas &ecirc;tre distingu&eacute;es bas&eacute;s sur ces observations. Ici, nous rapportons l&#39;expression vulvaire de sept g&egrave;nes, egl-17, cdh-3, 2-ceh, zmp-1, B0034.1, T04B2.6 et F47B8.6 issu de la gfp, cfp et yfp fusions de journaliste (vert fluorescent prot&eacute;ine et couleur variantes). Chaque g&egrave;ne exprime dans un sous-ensemble sp&eacute;cifique des cellules vulvaires et est donc utile comme marqueur des destins cellulaires vulvaire. Ensemble, les expressions des marqueurs distinguent six types de cellules et r&eacute;v&egrave;lent un strict contr&ocirc;le temporel d&#39;expression de g&egrave;ne dans la vulve en d&eacute;veloppement.

Spgatae &#x662F;&#x6D77;&#x80C6; ortholog gata4/5/6 &#x7684;&#x810A;&#x690E;&#x52A8;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x5206;&#x6790;&#x6240;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x62A5;&#x544A; Spgatae &#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x80B2;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x79EF;&#x7D2F;&#x548C;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x7A7A;&#x95F4;&#x683C;&#x5C40;&#x3002;15 H blastula &#x9996;&#x5148;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E86;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;Spgatae RNA &#x5206;&#x5B50;&#x6570;&#x76EE;&#x4E0E;&#x8868;&#x8FBE;&#x9AD8;&#x5CF0;&#x671F;&#x95F4; gastrulation blastula &#x9636;&#x6BB5;&#x90FD;&#x5728;&#x7A33;&#x6B65;&#x589E;&#x52A0;&#x3002;Gastrulation &#x5B8C;&#x6210;&#x540E;&#xFF0C;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x4E0B;&#x964D;&#x76F4;&#x81F3;&#x7ED3;&#x675F;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;&#x6574;&#x4E2A;&#x88C5;&#x8F7D;&#x539F;&#x4F4D;&#x6742;&#x4EA4;&#x663E;&#x793A; Spgatae &#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x4E2D;&#x73AF;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x677F;&#x4E2D;&#x51C6;&#x4E2D;&#x80DA;&#x5C42;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9996;&#x6B21;&#x53D1;&#x73B0;&#x3002;&#x7136;&#x540E; Spgatae &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x53EF;&#x5C55;&#x5F00;&#x4EE5;&#x5305;&#x62EC;&#x6574;&#x4E2A;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x677F;&#x95F4;&#x8D28; blastula &#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x671F;&#x95F4; gastrulation Spgatae &#x662F;&#x80DA;&#x5B54;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x5F3A;&#x70C8;&#x7684;&#x5E72;&#x8349;&#x548C;&#x80A0;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x524D;&#x5185;&#x810F;&#x53EB;&#x548C;&#x4E5F;&#x5728;&#x9876;&#x7AEF;&#x5373;&#x539F;&#x80A0;&#x7684;&#x4E2D;&#x80DA;&#x5C42;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x68F1;&#x955C;&#x9636;&#x6BB5;&#x8868;&#x793A;&#x3002;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#x5E74;&#x5E95;&#xFF0C;&#x5728;&#x80A0;&#x9053;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;&#x7EC8;&#x7AEF;&#x6A21;&#x5F0F;&#x662F;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x7684;&#x5728;&#x4E2D;&#x80A0;&#x52A0;&#x4F53;&#x8154;&#x90AE;&#x888B;&#x3002;

Spgatae&#xFF0C;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus ortholog &#x810A;&#x690E;&#x52A8;&#x7269; GATA4/5/6 &#x56E0;&#x7D20;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x3002;

Spgatae is the sea urchin ortholog of the vertebrate gata4/5/6 genes, as confirmed by phylogenetic analysis. The accumulation of Spgatae transcripts during embryonic development and the spatial pattern of expression are reported here. Expression was first detected in the 15 h blastula. The number of Spgatae RNA molecules increases steadily during blastula stages, with expression peaking during gastrulation. After gastrulation is complete, the level of expression decreases until the end of embryogenesis. Whole mount in situ hybridization showed that Spgatae transcripts were first detected in a ring of prospective mesoderm cells in the vegetal plate. Spgatae expression then expands to include the entire vegetal plate at the mesenchyme blastula stage. During gastrulation Spgatae is expressed at the blastopore, and at prism stage strongly in the hindgut and midgut but not foregut, and also in mesoderm cells at the tip of the archenteron. Towards the end of embryogenesis, expression in the hindgut decreases. The terminal pattern of expression is in midgut plus coelomic pouches.

Expression of Spgatae, the Strongylocentrotus purpuratus ortholog of vertebrate GATA4/5/6 factors.

Spgatae est l&#39;orthologue oursin des g&egrave;nes des vert&eacute;br&eacute;s gata4/5/6, tel que confirm&eacute; par l&#39;analyse phylog&eacute;n&eacute;tique. L&#39;accumulation des transcrits de Spgatae durant le d&eacute;veloppement embryonnaire et la r&eacute;partition spatiale d&#39;expression sont rapport&eacute;s ici. Expression premi&egrave;re d&eacute;tection de la blastula 15 h. Le nombre de mol&eacute;cules d&#39;ARN de Spgatae augmente progressivement durant les stades blastula, avec l&#39;expression avec un pic au cours de la gastrulation. Fin de gastrulation, le niveau d&#39;expression diminue jusqu&#39;&agrave; la fin de l&#39;embryogen&egrave;se. Montage hybridation in situ ont montr&eacute; que les transcriptions de Spgatae ont &eacute;t&eacute; d&eacute;tect&eacute;es tout d&#39;abord dans un anneau de cellules du m&eacute;soderme prospective dans la plaque de v&eacute;g&eacute;tale. Expression de Spgatae puis s&#39;&eacute;largit toute la plaque v&eacute;g&eacute;tale au stade blastula m&eacute;senchyme. Au cours de la gastrulation Spgatae s&#39;exprime dans le blastopore et au stade de prisme fortement dans le gros intestin et l&#39;intestin moyen mais pas de tube digestif ant&eacute;rieur et aussi dans les cellules du m&eacute;soderme &agrave; la pointe de l&#39;archenteron. Vers la fin de l&#39;embryogen&egrave;se, l&#39;expression dans l&#39;intestin post&eacute;rieur diminue. Le mod&egrave;le de terminal d&#39;expression est dans l&#39;intestin moyen plus petits sacs coelomiques.

Expression de Spgatae, le Strongylocentrotus purpuratus orthologue de vert&eacute;br&eacute;s facteurs GATA4/5/6.

Die Expression von Spgatae, die Strongylocentrotus purpuratus Ortholog von Wirbeltieren GATA4/5/6 Faktoren.

Spgatae &egrave; il riccio di mare ortholog dei vertebrati gata4/5/6 geni, come confermato da analisi filogenetica. L&#39;accumulo di Spgatae trascrizioni durante lo sviluppo embrionale e il pattern spazio dell&#39;espressione sono segnalati qui. Espressione in primo luogo &egrave; stato rilevato nella blastula h 15. Il numero di molecole di RNA Spgatae aumenta costantemente durante le fasi di blastula, con espressione picco durante la gastrulazione. Al termine della gastrulazione, il livello di espressione diminuisce fino alla fine dell&#39;embriogenesi. Monte tutta l&#39;ibridazione in situ ha mostrato che le trascrizioni Spgatae in primo luogo sono state rilevate in un anello di cellule del mesoderma prospettico nella piastra di vegetale. Spgatae espressione allora si espande per includere tutta la piastra vegetale allo stadio di blastula mesenchima. Durante la gastrulazione Spgatae &egrave; espressa presso il Blastoporo e in fase di prisma fortemente nel hindgut e intestino ma non apparentemente e anche nelle cellule del mesoderma presso la punta dell&#39;archenteron. Verso la fine dell&#39;embriogenesi, espressione del hindgut diminuisce. Il terminale pattern di espressione &egrave; nell&#39;intestino pi&ugrave; sacche celomatiche.

Espressione di Spgatae, il Strongylocentrotus purpuratus ortholog dei vertebrati GATA4/5/6 fattori.

Spgatae &#x30A6;&#x30CB; &#x30AA;&#x30EB;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0;&#x810A;&#x690E;&#x52D5;&#x7269; gata4/5/6 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x305F;&#x306E;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x80DA;&#x767A;&#x80B2;&#x306E; Spgatae &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x306E;&#x84C4;&#x7A4D;&#x3068;&#x8868;&#x73FE;&#x306E;&#x7A7A;&#x9593;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5F0F;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x521D; 15 h &#x80DE;&#x3067;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Spgatae RNA &#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x6570;&#x306F;&#x7740;&#x5B9F;&#x306B;&#x539F;&#x8178;&#x9665;&#x5165;&#x6642;&#x306B;&#x5F0F;&#x3092;&#x30D4;&#x30FC;&#x30AF;&#x306B;&#x3001;&#x80DE;&#x80DA;&#x6BB5;&#x968E;&#x4E2D;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x539F;&#x8178;&#x9665;&#x5165;&#x304C;&#x5B8C;&#x4E86;&#x3057;&#x305F;&#x3089;&#x3001;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x5F0F;&#x306E;&#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x306E;&#x7D42;&#x308F;&#x308A;&#x307E;&#x3067;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Spgatae &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x306E;&#x30D7;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x5C06;&#x6765;&#x4E2D;&#x80DA;&#x8449;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6307;&#x8F2A;&#x3067;&#x6700;&#x521D;&#x306B;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5168;&#x53F0;&#x7D19;&#x306E;&#x307E;&#x307E;&#x306E;&#x4EA4;&#x914D;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Spgatae &#x5F0F; [&#x9593;&#x5145;&#x7E54;&#x80DE;&#x80DA;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x30D7;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x5168;&#x4F53;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x62E1;&#x5F35;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x539F;&#x8178;&#x9665;&#x5165;&#x6642;&#x306B; Spgatae&#x3001;blastopore &#x3068;&#x30D7;&#x30EA;&#x30BA;&#x30E0; &#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B8;&#x5F8C;&#x8178;&#x3068;&#x4E2D;&#x8178;&#x304C;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x524D;&#x8178;&#x3067;&#x5F37;&#x304F;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x4E2D;&#x80DA;&#x8449;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5148;&#x7AEF;&#x3001;&#x30A6;&#x30CB;&#x306E;&#x3067;&#x8868;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x306E;&#x7D42;&#x308F;&#x308A;&#x306B;&#x5411;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x5F8C;&#x8178;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x767A;&#x73FE;&#x304C;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30FC;&#x30DF;&#x30CA;&#x30EB;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x4E2D;&#x8178;&#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x4F53;&#x8154;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C1;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

Spgatae&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x30AA;&#x30EB;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0;&#x306E;&#x810A;&#x690E;&#x52D5;&#x7269;&#x306E; GATA4/5/6 &#x8981;&#x56E0;&#x306E;&#x5F0F;&#x3002;

Spgatae &#xCC99;&#xCD94; gata4/5/6 &#xC720;&#xC804;&#xC790; phylogenetic &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD655;&#xC778;&#xC758; &#xC131; &#xAC8C; ortholog&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC30;&#xC544; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; Spgatae &#xC131;&#xC801;&#xD45C;&#xC758; &#xCD95;&#xC801; &#xBC0F; &#xD45C;&#xD604;&#xC758; &#xACF5;&#xAC04;&#xC801; &#xD328;&#xD134; &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC2DD; 15 h blastula&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC98;&#xC74C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Spgatae RNA &#xBD84;&#xC790; &#xC218; blastula &#xB2E8;&#xACC4; &#xC2DD; gastrulation &#xC911; &#xC815;&#xC810;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC18D;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Gastrulation &#xC644;&#xB8CC; &#xB418; &#xBA74; embryogenesis &#xB9D0;&#xAE4C;&#xC9C0; &#xD45C;&#xD604;&#xC758; &#xC218;&#xC900;&#xC744; &#xAC10;&#xC18C;. &#xC81C;&#xC790;&#xB9AC; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xCCB4; &#xB9C8;&#xC6B4;&#xD2B8; Spgatae &#xC131;&#xC801;&#xD45C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC131; &#xC811;&#xC2DC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC7A0;&#xC7AC; mesoderm &#xC140; &#xB9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC98;&#xC74C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. Spgatae &#xC2DD; &#xB2E4;&#xC74C; mesenchyme blastula &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xCCB4; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC131; &#xC811;&#xC2DC;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB3C4;&#xB85D; &#xD655;&#xC7A5; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. Gastrulation &#xC911; Spgatae, blastopore &#xBC0F; &#xD504;&#xB9AC;&#xC998; &#xB2E8;&#xACC4; hindgut midgut &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; foregut&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; &#xD558; &#xACE0; &#xB610;&#xD55C; mesoderm &#xC138;&#xD3EC;&#xB294; archenteron&#xC758; &#xB05D;&#xC5D0; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. Embryogenesis&#xC758; &#xB05D;&#xC740; hindgut&#xC5D0; &#xC2DD; &#xAC10;&#xC18C;. &#xC2DD;&#xC758; &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xD328;&#xD134;&#xC740; midgut &#xD50C;&#xB7EC;&#xC2A4; coelomic &#xD30C;&#xC6B0;&#xCE58;.

Spgatae, Strongylocentrotus purpuratus ortholog &#xCC99;&#xCD94; GATA4/5/6 &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;.

Spgatae es el ort&oacute;logo de erizo de mar de los vertebrados genes gata4/5/6, seg&uacute;n lo confirmado por an&aacute;lisis filogen&eacute;tico. La acumulaci&oacute;n de transcritos de Spgatae durante el desarrollo embrionario y el patr&oacute;n espacial de expresi&oacute;n se divulgan aqu&iacute;. Expresi&oacute;n se detect&oacute; primero en la bl&aacute;stula h 15. El n&uacute;mero de mol&eacute;culas de ARN Spgatae aumenta constantemente durante las etapas de la bl&aacute;stula, con un pico de expresi&oacute;n durante la gastrulaci&oacute;n. Despu&eacute;s de gastrulaci&oacute;n es completa, el nivel de expresi&oacute;n disminuye hasta el final de la embriog&eacute;nesis. Todo Monte hibridaci&oacute;n in situ demostraron que las transcripciones de Spgatae primero fueron detectadas en un anillo de c&eacute;lulas del mesodermo prospectivo en la placa de vegetal. Spgatae expresi&oacute;n entonces se expande para incluir toda la placa vegetal en la etapa de bl&aacute;stula del mes&eacute;nquima. Durante la gastrulaci&oacute;n Spgatae se expresa en el blastoporo y en etapa de prisma fuertemente en el intestino grueso y del midgut pero no del foregut y tambi&eacute;n en las c&eacute;lulas del mesodermo en la punta de la archenteron. Hacia el final de la embriog&eacute;nesis, disminuye la expresi&oacute;n en el intestino grueso. El terminal patr&oacute;n de expresi&oacute;n es en el intestino medio m&aacute;s bolsas cel&oacute;micas.

Expresi&oacute;n de Spgatae, el Strongylocentrotus purpuratus ort&oacute;logo de vertebrados GATA4/5/6 factores.

&#x79BB;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x7279;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684; spec2a &#x671F;&#x95F4;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#xFF0C;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x4E0A;&#x6E38;&#x7684;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x5242;&#xFF0C;&#x8D4B;&#x4E88;&#x5176;&#x5F88;&#x5927;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x901A;&#x8FC7;&#x9547;&#x538B;&#x7684;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x76EE;&#x7684;&#x662F;&#x786E;&#x5B9A;&#x5982;&#x4F55; spec2a &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x538B;&#x6291;&#x7684;&#x5185;&#x80DA;&#x5C42;&#x548C;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x53E3;&#x8154;&#x754C;&#x3002;78 &#x78B1;&#x57FA;&#x5BF9; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x540C;&#x6E90;&#x5185;&#x5305;&#x542B;&#x4E94;&#x4E2A;&#x95F4;&#x8DDD;&#x7D27;&#x5BC6;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x5143;&#x7D20;&#x5305;&#x62EC;&#x8FD1;&#x7AEF; (TAATCT) &#x548C;&#x8FDC;&#x7AEF; (TAATCC) &#x5143;&#x7D20;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230; SpOtx&#x3001; &#x5E7F;&#x6CDB;&#x5206;&#x53D1;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x56E0;&#x5B50;&#xFF0C;SpGoosecoid &#xFF08;SpGsc&#xFF09;&#xFF0C;&#x963B;&#x904F;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x9650;&#x5236;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7269;&#x7684;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x5C55;&#x793A;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x770B;&#x4F3C;&#x591A;&#x4F59;&#x5916; Otx/&#x79D1;&#x5B66;&#x56E2;&#x5143;&#x7D20;&#x6709;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x804C;&#x80FD;&#x3002;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x7684;&#x5143;&#x7D20;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230; SpGATA-E&#xFF0C;&#x7279;&#x5B9A;&#x4E8E; endomesoderm &#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x3002;SpGATA-E &#x548C; SpGsc morpholino &#x53CD;&#x4E49;&#x5BE1; (MASOs) &#x6CBB;&#x7597;&#x5BFC;&#x81F4;&#x589E;&#x5F3A;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6D3B;&#x52A8;&#x4ECE;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x7684;&#x5143;&#x7D20;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x56E0;&#x7D20;&#x5145;&#x5F53;&#x6B64;&#x7AD9;&#x70B9;&#x4E0A;&#x7684; repressors&#x3002;SpGATA-E MASO &#x6CBB;&#x7597;&#x80DA;&#x80CE;&#x672A;&#x80FD;&#x8868;&#x8FBE;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x6307;&#x793A; SpGATA e &#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x5206;&#x5316;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;Spec2a &#x8FD1;&#x7AEF;&#x5143;&#x7D20;&#x662F;&#x6709;&#x522B;&#x4E8E;&#x76F8;&#x5173;&#x7684; spec1 &#x5242;&#xFF0C;&#x5728;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x5143;&#x7D20;&#x548C; spec1 &#x548C; spec2a &#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x5143;&#x7D20;&#x4E4B;&#x95F4;&#x4E92;&#x6362;&#x6307;&#x51FA;&#xFF0C;&#x6700;&#x4F18;&#x7684;&#x9547;&#x538B;&#xFF0C;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x5143;&#x7D20;&#x4E0E;&#x9644;&#x8FD1;&#x7684; CCAAT &#x7ED1;&#x5B9A;&#x56E0;&#x5B50;&#x5143;&#x7D20;&#x8FDB;&#x884C;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x6700;&#x8FD1;&#x8FDB;&#x5316;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x5143;&#x7D20;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E; spec2a endomesoderm &#x548C;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x754C;&#x7684;&#x9547;&#x538B;&#x3002;

&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF; E &#x5C06;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230;&#x548C;&#x538B;&#x6291;&#x5728;&#x5916; Otx Goosecoid &#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x5143;&#x7D20;&#x5185;&#x624E;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x7279;&#x5B9A; spec2a &#x589E;&#x5F3A;&#x5B50;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x3002;

During Strongylocentrotus purpuratus embryogenesis, aboral ectoderm-specific expression of spec2a relies on an upstream enhancer that confers its spatial specificity largely through repression. The purpose of this study was to determine how spec2a expression is repressed in endoderm and oral ectoderm territories. A 78-base pair DNA sequence within the enhancer contains five tightly spaced cis-regulatory elements including proximal (TAATCT) and distal (TAATCC) elements that bind to both SpOtx, a broadly distributed transcriptional activator, and SpGoosecoid (SpGsc), an oral ectoderm-restricted transcriptional repressor. We show here that these two seemingly redundant Otx/Gsc elements have distinct functions. The proximal element bound to SpGATA-E, an endomesoderm-specific transcription factor. Treatment with SpGATA-E and SpGsc morpholino antisense oligonucleotides (MASOs) resulted in enhanced transcriptional activity from the proximal element, suggesting that both factors functioned as repressors at this site. SpGATA-E MASO-treated embryos failed to express ectoderm markers, indicating a role for SpGATA-E in ectoderm differentiation. The spec2a proximal element was distinct from the corresponding element in the related spec1 enhancer, and swaps between spec1 and spec2a cis-regulatory elements indicated, that for optimal repression, the proximal element had to interact with a nearby CCAAT-binding factor element. Our results show that the recently evolved proximal element contributes to the repression of spec2a in endomesoderm and oral ectoderm territories.

Strongylocentrotus purpuratus transcription factor GATA-E binds to and represses transcription at an Otx-Goosecoid cis-regulatory element within the aboral ectoderm-specific spec2a enhancer.

Au cours de l&#39;embryogen&egrave;se de Strongylocentrotus purpuratus, aborale expression ectoderme sp&eacute;cifique de spec2a s&#39;appuie sur un enrichisseur en amont qui conf&egrave;re sa sp&eacute;cificit&eacute; spatiale en grande partie par le biais de la r&eacute;pression. Le but de cette &eacute;tude &eacute;tait de d&eacute;terminer comment les spec2a expression est r&eacute;prim&eacute;e dans l&#39;endoderme et territoires de l&#39;ectoderme oral. Une paire de 78-base de s&eacute;quence d&#39;ADN au sein de l&#39;amplificateur contient cinq &eacute;l&eacute;ments cis-r&eacute;glementation &eacute;troitement espac&eacute;s dont proximal (TAATCT) et distaux &eacute;l&eacute;ments (TAATCC) qui se lient aux deux SpOtx, un activateur de la transcription largement distribu&eacute; et SpGoosecoid (SpGsc), un oral r&eacute;presseur transcriptionnel ectoderme restreints. Nous montrons ici que ces deux &eacute;l&eacute;ments apparemment redondants de Otx/CGC ont des fonctions distinctes. L&#39;&eacute;l&eacute;ment proximal li&eacute; &agrave; SpGATA-E, un facteur de transcription endomesoderm sp&eacute;cifique. Traitement avec SpGATA-E et SpGsc morpholino antisens (MASOs) conduit &agrave; l&#39;augmentation de l&#39;activit&eacute; transcriptionnelle de l&#39;&eacute;l&eacute;ment proximal, sugg&eacute;rant que les deux facteurs servaient de r&eacute;presseurs sur ce site. Les embryons trait&eacute;s MASO SpGATA-E n&#39;a pas &agrave; exprimer des marqueurs de l&#39;ectoderme, indiquant un r&ocirc;le pour SpGATA-E dans la diff&eacute;renciation de l&#39;ectoderme. L&#39;&eacute;l&eacute;ment proximal spec2a &eacute;tait distinct de l&#39;&eacute;l&eacute;ment correspondant dans le renforceur spec1 connexes et Echanges entre des &eacute;l&eacute;ments cis-r&eacute;gulateurs spec1 et spec2a indiqu&eacute;, que de la r&eacute;pression optimale, l&#39;&eacute;l&eacute;ment proximal devait interagir avec un &eacute;l&eacute;ment de facteur de fef-liaison &agrave; proximit&eacute;. Nos r&eacute;sultats montrent que l&#39;&eacute;l&eacute;ment proximal r&eacute;cemment &eacute;volu&eacute; contribue &agrave; la r&eacute;pression des spec2a dans les territoires de l&#39;ectoderme endomesoderm et oral.

Strongylocentrotus purpuratus facteur de transcription GATA-E lie &agrave; et r&eacute;prime la transcription &agrave; un &eacute;l&eacute;ment cis-r&eacute;gulation Otx-Goosecoid au sein de l&#39;enrichisseur aboral ectoderme sp&eacute;cifique spec2a.

Strongylocentrotus purpuratus Transkriptionsfaktor GATA-E bindet und die Transkription zu einem OTX-goosecoid cis-regulatorische Element innerhalb der aboralen Ektoderms-spezifische spec2a Enhancer.

Durante l&#39;embriogenesi di Strongylocentrotus purpuratus, placche ectoderma specifica espressione di spec2a si basa su un potenziatore a monte che conferisce la sua specificit&agrave; territoriali in gran parte attraverso la repressione. Lo scopo di questo studio era di determinare come spec2a espressione &egrave; repressa in endoderma ed ectoderma orale nei territori. Una coppia di 78-base sequenza del DNA all&#39;interno del rinforzatore contiene cinque elementi cis-regolatori strettamente spaziati tra cui distali elementi (TAATCC) che si legano a SpOtx, un attivatore trascrizionale largamente distribuito e SpGoosecoid (SpGsc), un orale repressore trascrizionale limitato da ectoderma e prossimale (TAATCT). Mostriamo qui che questi due elementi apparentemente ridondanti Otx/Gsc hanno funzioni distinte. L&#39;elemento prossimale associata a SpGATA-E, un fattore di trascrizione endomesoderm specifici. Trattamento con SpGATA-E e SpGsc oligonucleotides oligonucleotidi antisenso (MASOs) ha portato una maggiore attivit&agrave; transcriptional dall&#39;elemento prossimale, suggerendo che entrambi i fattori hanno funzionato come repressori in questo sito. Embrioni di MASO-trattati di SpGATA-E non &egrave; riuscito a esprimere marcatori ectoderma, che indica un ruolo per SpGATA-E nella differenziazione di ectoderma. L&#39;elemento prossimale spec2a era distinto dall&#39;elemento corrispondente nel rinforzatore spec1 correlati, e swap tra elementi cis-regolatori spec1 e spec2a indicato, che per la repressione ottima, l&#39;elemento prossimale dovuto interagire con un elemento di fattore sequenza-associazione vicino. I nostri risultati mostrano che l&#39;elemento prossimale recentemente evoluto contribuisce alla repressione di spec2a nei territori di ectoderma endomesoderm e orale.

Strongylocentrotus purpuratus fattore di trascrizione GATA-E si lega a e reprime la trascrizione presso un elemento cis-regolatori Otx-Goosecoid entro il rinforzatore aboral ectoderma-specifiche spec2a.

&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x6642;&#x305D;&#x306E;&#x7A7A;&#x9593;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x306E;&#x6291;&#x5727;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4E3B;&#x3092;&#x6388;&#x3051;&#x308B;&#x4E0A;&#x6D41;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x4E09;&#x30FB;&#x56DB;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x56FA;&#x6709;&#x8868;&#x73FE; spec2a &#x306E;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x76EE;&#x7684;&#x306F;&#x3001;&#x5185;&#x80DA;&#x8449;&#x3068;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306E;&#x9818;&#x571F;&#x3067;&#x306E; spec2a &#x5F0F;&#x306E;&#x6291;&#x5727;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;78-&#x57FA;&#x790E;&#x30DA;&#x30A2; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3001;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x5185;&#x8FD1;&#x4F4D; &#xFF08;TAATCT&#xFF09; &#x3068; SpOtx&#x3001;&#x5E83;&#x304F;&#x5206;&#x6563;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3068; SpGoosecoid (SpGsc), &#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x5236;&#x9650;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EA;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x9060;&#x4F4D;&#x306E; (TAATCC) &#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x3092;&#x542B;&#x3080; 5 &#x3064;&#x306E;&#x5BC6;&#x306A;&#x9593;&#x9694; cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089; 2 &#x3064;&#x306E;&#x4E00;&#x898B;&#x5197;&#x9577; Otx/Gsc &#x8981;&#x7D20;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x6A5F;&#x80FD;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x306E;&#x8981;&#x7D20; endomesoderm &#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; SpGATA E &#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;SpGATA E &#x3068; SpGsc morpholino &#x306E;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B9; &#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9; (MASOs) &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x6CBB;&#x7642;&#x5F37;&#x5316;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x30EA;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x3053;&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3059;&#x308B;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x8981;&#x7D20;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3002;SpGATA E &#x30DE;&#x30BE;&#x6271;&#x308F;&#x308C;&#x305F;&#x80DA;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3001;&#x5F79;&#x5272; SpGATA-E &#x306E;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x3078;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3092;&#x8868;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5931;&#x6557;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Spec2a &#x8FD1;&#x4F4D;&#x8981;&#x7D20;&#x304C;&#x95A2;&#x9023; spec1 &#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306E;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x8981;&#x7D20;&#x3068;&#x306F;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x3055;&#x308C;&#x3001;spec1 &#x3068; spec2a &#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x8981;&#x7D20;&#x9593;&#x306E;&#x30B9;&#x30EF;&#x30C3;&#x30D7;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6700;&#x9069;&#x306A;&#x5F3E;&#x5727;&#x306E;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x8FD1;&#x304F;&#x306E; CCAAT &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x8981;&#x7D20;&#x7D20;&#x5B50;&#x3068;&#x306E;&#x5BFE;&#x8A71;&#x3092;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x306E;&#x8981;&#x7D20; spec2a &#x306E; endomesoderm &#x3068;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306E;&#x9818;&#x571F;&#x306E;&#x6291;&#x5236;&#x306B;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; GATA E &#x306F;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3057;&#x3001;Otx Goosecoid &#x30B7;&#x30B9;&#x8981;&#x7D20;&#x4E09;&#x30FB;&#x56DB;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x56FA;&#x6709; spec2a &#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x5185;&#x3067;&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Strongylocentrotus purpuratus embryogenesis &#xC911; spec2a&#xC758; aboral ectoderm &#xD2B9;&#xC815; &#xC2DD; &#xC5B5;&#xC555;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xC8FC;&#xB85C; &#xC790;&#xC0AC;&#xC758; &#xACF5;&#xAC04; &#xD2B9;&#xC774;&#xC131;&#xC744; &#xC218; &#xC5EC; &#xD558;&#xB294; &#xC5C5;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC99D;&#xAC15;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xBAA9;&#xC801;&#xC740; spec2a &#xC2DD; endoderm &#xBC0F; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5B5;&#xC555;&#xC740; &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;.&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. 78-&#xAE30;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xC30D; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC99D;&#xAC15; &#xB0B4; &#xADFC; (TAATCT)&#xC640; SpOtx, &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xBD84;&#xC0B0;&#xB41C; transcriptional &#xD65C;&#xC131;&#xAE30;&#xC640; SpGoosecoid (SpGsc) &#xAD6C;&#xB450; ectoderm &#xC81C;&#xD55C; transcriptional &#xC9C4;&#xC555; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; &#xC6D0;&#xC2EC; (TAATCC) &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; 5 &#xAC1C;&#xC758; &#xBC00;&#xC811; &#xD558; &#xAC8C; &#xAC04;&#xACA9; &#xB454;&#xB41C; cis &#xADDC;&#xC815; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC774; &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xAC89;&#xBCF4;&#xAE30; &#xC911;&#xBCF5; Otx/Gsc &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xAE30;&#xB2A5; &#xD45C;&#xC2DC;. &#xC778;&#xC811; &#xC694;&#xC18C; SpGATA-E, endomesoderm &#xAD00;&#xB828; &#xC804;&#xC1A1; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xB41C;. Spgata&#xC640; SpGsc morpholino &#xC13C;&#xC2A4; oligonucleotides (MASOs)&#xC640; &#xCE58;&#xB8CC; &#xB450; &#xC694;&#xC778;&#xC774;&#xC774; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; repressors&#xB85C; &#xC791;&#xC6A9; &#xD558;&#xC790; &#xC778;&#xC811; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB41C; transcriptional &#xD65C;&#xB3D9; &#xADC0;&#xCC29;&#xB418; &#xC5C8; &#xB2E4;. SpGATA-E &#xB9C8; &#xCE58;&#xB8CC; &#xBC30;&#xC544; ectoderm &#xB9C8;&#xCEE4;, ectoderm &#xBD84;&#xD654;&#xC5D0; SpGATA-E&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xC9C0; &#xBABB;&#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Spec2a &#xC778;&#xC811; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xD574;&#xB2F9; &#xC694;&#xC18C; &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; spec1 &#xC99D;&#xAC15;&#xC5D0; &#xB2E4;&#xB97C; &#xD558; &#xACE0; spec1 &#xBC0F; spec2a cis &#xADDC;&#xC81C; &#xC694;&#xC18C; &#xAC04;&#xC758; &#xC2A4;&#xC651; &#xD45C;&#xC2DC;&#xB294; &#xCD5C;&#xC801;&#xC758; &#xC5B5;&#xC555;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC778;&#xC811; &#xC694;&#xC18C; &#xADFC;&#xCC98; CCAAT &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC694;&#xC18C; &#xC694;&#xC18C;&#xC640; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xD45C;&#xC2DC; &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0; &#xC9C4;&#xD654; &#xC778;&#xC811; &#xC694;&#xC18C; endomesoderm &#xBC0F; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm &#xC601;&#xD1A0;&#xC5D0;&#xC11C; spec2a&#xC758; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC; &#xD55C;&#xB2E4;.

Strongylocentrotus purpuratus &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; GATA E&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD558;&#xACE0; &#xB204;&#xB974;&#xB294; aboral ectoderm &#xD2B9;&#xC815; spec2a &#xC99D;&#xAC15; &#xB0B4; Otx Goosecoid cis &#xADDC;&#xC815; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xC0AC;.

Durante la embriog&eacute;nesis de Strongylocentrotus purpuratus, aboral expresi&oacute;n de ectodermo-espec&iacute;fica de spec2a se basa en un potenciador ascendente que confiere su especificidad espacial en gran parte a trav&eacute;s de la represi&oacute;n. El prop&oacute;sito de este estudio fue determinar c&oacute;mo se reprime la expresi&oacute;n de spec2a en endodermo y ectodermo oral territorios. Un par de 78-bajo la secuencia de la DNA en el reforzador contiene cinco elementos cis-reguladores estrechamente espaciados como proximal (TAATCT) y distales elementos (TAATCC) que se unen a ambos SpOtx, un activador transcripcional ampliamente distribuido y SpGoosecoid (SpGsc), un represor transcripcional restringida ectodermo oral. Aqu&iacute; mostramos que estos dos elementos aparentemente redundantes de Otx/Gsc tienen distintas funciones. El pr&oacute;ximo elemento enlazado a SpGATA-E, un factor de transcripci&oacute;n endomesoderm espec&iacute;ficas. Tratamiento con SpGATA-E y SpGsc Morfolino oligonucle&oacute;tidos antisentidos (MASOs) dio lugar a mayor actividad transcripcional del elemento proximal, sugiriendo que ambos factores funcionaron como represores en este sitio. SpGATA-E tratados MASO embriones no expresan marcadores de ectodermo, indicando un papel para SpGATA-E en la diferenciaci&oacute;n del ectodermo. El elemento proximal de spec2a fue distinto al elemento correspondiente en el reforzador spec1 relacionados, y permutas entre elementos cis-reguladores spec1 y spec2a indica, que para represi&oacute;n &oacute;ptima, el elemento proximal deb&iacute;a interactuar con un elemento de factor de uni&oacute;n a CCAAT cercano. Nuestros resultados muestran que el elemento proximal recientemente evolucionado contribuye a la represi&oacute;n de spec2a en los territorios de ectodermo endomesoderm y oral.

Strongylocentrotus purpuratus factor de transcripci&oacute;n GATA-E se une a y reprime la transcripci&oacute;n en un elemento cis-regulador de Otx-Goosecoid dentro el reforzador aboral ectodermo espec&iacute;ficos spec2a.

Riportiamo la sequenza e l&#39;analisi del genoma 814-megabase di riccio di mare Strongylocentrotus purpuratus, un modello per lo sviluppo e la biologia dei sistemi. La strategia di sequenziamento combinato whole genome shotgun e sequenze di cromosomi artificiali batterici (BAC). Questo uso di cloni BAC, aiutato da una strategia di pooling, superato Difficolt&agrave; associate con elevata eterozigosi del genoma. Il genoma codifica circa 23.300 geni, tra cui molti pensava di essere vertebrate innovazioni o noto solo di fuori i deuterostomi. Questo genoma echinodermi fornisce un evolutivo outgroup per i cordati e rendimenti intuizioni l&#39;evoluzione dei deuterostomi.

Il genoma del riccio di mare Strongylocentrotus purpuratus.

We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes.

The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus.

Nous rapportons la s&eacute;quence et l&#39;analyse du g&eacute;nome de l&#39;oursin Strongylocentrotus purpuratus, un mod&egrave;le pour 814-megabase d&eacute;veloppementale et biologie des syst&egrave;mes. La strat&eacute;gie de s&eacute;quen&ccedil;age combin&eacute; whole-genome shotgun et des s&eacute;quences des chromosomes artificiels bact&eacute;riens (BAC). Cette utilisation des clones BAC, aid&eacute; par une strat&eacute;gie de mise en commun, a surmont&eacute; les difficult&eacute;s associ&eacute;es &agrave; l&#39;h&eacute;t&eacute;rozygotie &eacute;lev&eacute; du g&eacute;nome. Le g&eacute;nome encode environ 23 300 g&egrave;nes, dont un grand nombre qu&#39;on croyait &ecirc;tre des innovations vert&eacute;br&eacute;es ou connu seulement en dehors des deut&eacute;rostomiens. Ce g&eacute;nome &eacute;chinoderme fournit un &eacute;volutionniste exogroupe pour les id&eacute;es chord&eacute;s et les rendements dans l&#39;&eacute;volution des deut&eacute;rostomiens.

Le g&eacute;nome de l&#39;oursin Strongylocentrotus purpuratus.

Wir berichten die Abfolge und die Analyse des Genoms 814-Megabase Seeigel Strongylocentrotus Purpuratus, ein Modell f&uuml;r Entwicklungsbiologie und Systembiologie. Die Sequenzierung-Strategie kombiniert ganz-Genoms Schrotflinte und bacterial artificial Chromosome (BAC) Sequenzen. Diese Verwendung von BAC Klone, unterst&uuml;tzt durch ein pooling-Strategie, &uuml;berwand die Schwierigkeiten im Zusammenhang mit hohen Heterozygosit&auml;t des Genoms. Das Genom kodiert rund 23.300 Gene, darunter viele, die vorher als Wirbeltiere Innovationen werden oder nur au&szlig;erhalb der Deuterostomiern bekannt. Diese Stachelh&auml;uter-Genom enth&auml;lt einen evolution&auml;ren Fremdgruppe f&uuml;r die Chordatiere und Renditen Einblicke in die Entwicklung der Deuterostomiern.

Das Genom der Seeigel Strongylocentrotus Purpuratus.

&#x6211;&#x4EEC;&#x62A5;&#x544A;&#x7684;&#x987A;&#x5E8F;&#x548C;&#x6D77;&#x80C6;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus&#xFF0C;&#x4E00;&#x79CD;&#x6A21;&#x578B;&#x7B2C; 814 &#x7ECF;&#x8FC7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x6790;&#x53D1;&#x5C55;&#x548C;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3002;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6218;&#x7565;&#x8054;&#x5408;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x9E1F;&#x67AA;&#x548C;&#x7EC6;&#x83CC;&#x4EBA;&#x5DE5;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; (BAC) &#x5E8F;&#x5217;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5229;&#x7528;&#x6240;&#x6C47;&#x96C6;&#x7684;&#x7B56;&#x7565;&#xFF0C;&#x8F85;&#x52A9;&#x7684; BAC &#x514B;&#x9686;&#x514B;&#x670D;&#x4E86;&#x56F0;&#x96BE;&#x4E0E;&#x9AD8;&#x6742;&#x5408;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7F16;&#x7801;&#x7EA6; 23,300 &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x8BB8;&#x591A;&#x4EE5;&#x524D;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x662F;&#x810A;&#x690E;&#x52A8;&#x7269;&#x521B;&#x65B0;&#x6216; deuterostomes &#x4EE5;&#x5916;&#x53EA;&#x77E5;&#x9053;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x68D8;&#x76AE;&#x52A8;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x8FDB;&#x5316; outgroup &#x5230; deuterostomes &#x7684;&#x6F14;&#x53D8;&#x810A;&#x7D22;&#x52A8;&#x7269;&#x548C;&#x6536;&#x76CA;&#x7387;&#x7684;&#x6DF1;&#x523B;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;

&#x6D77;&#x80C6;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x3002;

&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x30A6;&#x30CB; &#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E; 814 &#x7D50;&#x679C;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x5831;&#x544A;&#x767A;&#x9054;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3002;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x6226;&#x7565;&#x306F;&#x3001;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x6563;&#x5F3E;&#x9283;&#x3068;&#x7D30;&#x83CC;&#x4EBA;&#x5DE5;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; &#xFF08;BAC &#x306E;&#xFF09; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x7D50;&#x5408;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x30D7;&#x30FC;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x6226;&#x7565;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x652F;&#x63F4;&#x3001;BAC &#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x63A5;&#x5408;&#x6027;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x96E3;&#x3057;&#x3055;&#x3092;&#x514B;&#x670D;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x4EE5;&#x524D;&#x810A;&#x690E;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x9769;&#x65B0;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x8003;&#x3048;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x306E;&#x307F;&#x3001;&#x5F8C;&#x53E3;&#x52D5;&#x7269;&#x5916;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x591A;&#x304F;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;&#x7D04; 23,300 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x68D8;&#x76AE;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x9032;&#x5316;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5F8C;&#x53E3;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x810A;&#x7D22;&#x52D5;&#x7269;&#x3068;&#x5229;&#x56DE;&#x308A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x91CD;&#x8981;&#x3002;

&#x30A6;&#x30CB; &#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3002;

&#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xC131; Strongylocentrotus purpuratus&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; 814 megabase &#xAC8C;&#xB188; &#xBD84;&#xC11D; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xBC0F; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;. &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xC804;&#xB7B5; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC0F7;&#xAC74; &#xD558; &#xACE0; &#xC138;&#xADE0; &#xC778;&#xACF5; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; (BAC) &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xACB0;&#xD569;. BAC &#xD074;&#xB860;, &#xD480;&#xB9C1; &#xC804;&#xB7B5;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC6D0;&#xC870;&#xC758;&#xC774; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xC774; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xB192;&#xC740; heterozygosity&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC5B4;&#xB824;&#xC6C0;&#xC744; &#xADF9;&#xBCF5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0;&#xB294; &#xC57D; 23,300 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C; &#xB9CE;&#xC740; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xCC99;&#xCD94; &#xD601;&#xC2E0; &#xC0DD;&#xAC01; &#xB098;&#xB294; deuterostomes &#xBC16;&#xC5D0; &#xC11C;&#xB9CC; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF9;&#xD53C;&#xB3D9;&#xBB3C; &#xAC8C;&#xB188;&#xC774; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xC9C4;&#xD654; outgroup chordates &#xBC0F; &#xC218;&#xC728; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825; deuterostomes&#xC758; &#xC9C4;&#xD654;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C;.

&#xBC14;&#xB2E4; &#xC131; &#xAC8C; Strongylocentrotus purpuratus&#xC758; &#xAC8C;&#xB188;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Divulgamos la secuencia y el an&aacute;lisis del genoma 814-megabase del erizo de mar Strongylocentrotus purpuratus, un modelo de desarrollo y Biolog&iacute;a de sistemas. La estrategia de secuenciaci&oacute;n hab&iacute;a combinado escopeta todo el genoma y secuencias del cromosoma artificial bacteriano (BAC). Este uso de clones BAC, ayudado por una estrategia de agrupaci&oacute;n super&oacute; dificultades asociadas con el alto heterocigoto del genoma. El genoma codifica unos 23.300 genes, incluyendo muchos pensaba ser vertebradas innovaciones o conocida s&oacute;lo fuera los deuterostomes. Este genoma de equinodermos proporciona un evolutivo de grupos para las penetraciones de cordados y rendimientos en la evoluci&oacute;n de deuterostomes.

El genoma del erizo de mar Strongylocentrotus purpuratus.

&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5C06;&#x542F;&#x52A8;&#x786E;&#x5B9A;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x89C4;&#x8303;&#x4E86;&#x6D77;&#x80C6;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801; TGFbeta &#x914D;&#x4F53;&#x548C;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x5728;&#x5176;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x4E2D;&#x63A8;&#x5B9A;&#x7684;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x5728; 30-&#x7EC6;&#x80DE;&#x9636;&#x6BB5;&#x6709;&#x5173;&#x3002;&#x6B64;&#x540E;&#x8282;&#x70B9;&#x4FE1;&#x53F7;&#x53D1;&#x751F;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x7684;&#x9886;&#x571F;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x548C;&#x8282;&#x70B9;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x662F;&#x9700;&#x8981;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x8282;&#x70B9;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4F20;&#x611F;&#x5668;&#x533A;&#x5206;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x80B2;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x7684;&#x672A;&#x6765;&#x53E3;&#x5934;&#x548C;&#x79BB;&#x57DF;&#x7684;&#x5404;&#x5411;&#x5F02;&#x6027;&#x5206;&#x5E03;&#x5F0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x63D0;&#x793A;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x548C;&#x7EF4;&#x62A4;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;&#x529F;&#x80FD;&#x6027;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x63A7;&#x5236;&#x6A21;&#x5757;&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x79CD;&#x95F4;&#x5E8F;&#x5217;&#x517B;&#x62A4;&#x3002;5&#39; &#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x6A21;&#x5757;&#x51FD;&#x6570;&#x542F;&#x52A8;&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4FDD;&#x6301;&#x5176;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x901A;&#x8FC7;&#x4ECE;&#x8282;&#x70B9;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x53CD;&#x9988;&#x610F;&#x89C1;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x51FD;&#x6570;&#x662F;&#x5728;&#x76EE;&#x6807;&#x7AD9;&#x70B9; bZIP &#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#xFF0C;&#x800C;&#x7531; SMAD &#x76EE;&#x6807;&#x7AD9;&#x70B9;&#x5206;&#x522B;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x3002;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E00;&#x4E2A; SMAD &#x7F51;&#x7AD9;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x9700;&#x8981;&#x542F;&#x52A8;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x3002;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x6A21;&#x5757;&#x8FD8;&#x5305;&#x542B;&#x8282;&#x70B9;&#x7684;&#x53CD;&#x9988;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x51FA;&#x56DE;&#x5E94;&#x7684; SMAD &#x7AD9;&#x70B9;&#x548C;&#x53E6;&#x5916;&#x884C;&#x4E3A;&#x6765;&#x538B;&#x5236;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x7684;&#x8A00;&#x8BBA;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x610F;&#x89C1;&#x89E3;&#x91CA;&#x8282;&#x70B9;&#x8868;&#x8FBE;&#x5728;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x7279;&#x70B9;&#xFF1A; &#x7531;&#x4E8E; bZIP &#x56E0;&#x7D20;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x662F;&#x6C27;&#x5316;&#x8FD8;&#x539F;&#x654F;&#x611F;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E14;&#x79BB;&#x547D;&#x8FD0;&#x4E0E;&#x53E3;&#x8154;&#x7684;&#x521D;&#x59CB;&#x4E24;&#x6781;&#x5206;&#x5316;&#x8868;&#x73B0;&#x5728;&#x6C27;&#x5316;&#x8FD8;&#x539F;&#x5DEE;&#x5F02;&#xFF0C;bZIP &#x7F51;&#x7AD9;&#x5E10;&#x6237;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x8282;&#x70B9;&#x7684;&#x53E3;&#x8154;&#x4E00;&#x4FA7; &#xFF1B;&#x800C;&#x7531;&#x4E8E;&#x7ACB;&#x5373;&#x65E9;&#x671F;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x54CD;&#x5E94;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684; Nodal SMAD &#x56E0;&#x7D20;&#xFF0C;SMAD &#x7F51;&#x7AD9;&#x5360;&#x53CD;&#x9988;&#x7EF4;&#x62A4;&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

&#x8282;&#x70B9;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x542F;&#x52A8;&#x5668;&#x7684;&#x6D77;&#x80C6;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x5C42;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F51;&#x7EDC;&#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;

Expression of the nodal gene initiates the gene regulatory network which establishes the transcriptional specification of the oral ectoderm in the sea urchin embryo. This gene encodes a TGFbeta ligand, and in Strongylocentrotus purpuratus its transcription is activated in the presumptive oral ectoderm at about the 30-cell stage. Thereafter Nodal signaling occurs among all cells of the oral ectoderm territory, and nodal expression is required for expression of oral ectoderm regulatory genes. The cis-regulatory system of the nodal gene transduces anisotropically distributed cytoplasmic cues that distinguish the future oral and aboral domains of the early embryo. Here we establish the genomic basis for the initiation and maintenance of nodal gene expression in the oral ectoderm. Functional cis-regulatory control modules of the nodal gene were identified by interspecific sequence conservation. A 5' cis-regulatory module functions both to initiate expression of the nodal gene and to maintain its expression by means of feedback input from the Nodal signal transduction system. These functions are mediated respectively by target sites for bZIP transcription factors, and by SMAD target sites. At least one SMAD site is also needed for the initiation of expression. An intron module also contains SMAD sites which respond to Nodal feedback, and in addition acts to repress vegetal expression. These observations explain the main features of nodal expression in the oral ectoderm: since the activity of bZIP factors is redox sensitive, and the initial polarization of oral vs. aboral fate is manifested in a redox differential, the bZIP sites account for the activation of nodal on the oral side; and since the immediate early signal transduction response factors for Nodal are SMAD factors, the SMAD sites account for the feedback maintenance of nodal gene expression.

Cis-regulatory control of the nodal gene, initiator of the sea urchin oral ectoderm gene network.

L&#39;expression du g&egrave;ne nodal lance le r&eacute;seau de r&eacute;gulation de g&egrave;ne qui &eacute;tablit les sp&eacute;cifications transcriptionnelle de l&#39;ectoderme oral dans l&#39;embryon d&#39;oursin. Ce g&egrave;ne code pour un ligand TGF et Strongylocentrotus purpuratus sa transcription est activ&eacute;e dans l&#39;ectoderme oral pr&eacute;somptif &agrave; sur le stade de 30 cellules. Par la suite Nodal de signalisation se produit parmi toutes les cellules du territoire ectoderme oral et expression nodale est n&eacute;cessaire pour l&#39;expression des g&egrave;nes r&eacute;gulateurs ectoderme oral. Le syst&egrave;me cis-r&eacute;gulation du g&egrave;ne nodal transduit anisotrope distribu&eacute;s signaux cytoplasmiques qui permettent de distinguer les domaines orales et aboral futures de l&#39;embryon pr&eacute;coce. Ici, nous &eacute;tablissons la base g&eacute;nomique pour l&#39;initiation et le maintien de l&#39;expression g&eacute;nique nodal dans l&#39;ectoderme oral. Modules cis-r&eacute;gulation fonctionnelle du g&egrave;ne nodal ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s par la conservation de la s&eacute;quence intersp&eacute;cifique. Un 5&#39; fonctions de module cis-r&eacute;gulateur pour initier l&#39;expression du g&egrave;ne nodal tant pour maintenir son expression au moyen de l&#39;entr&eacute;e de feedback provenant du syst&egrave;me de transduction de signal Nodal. Ces fonctions sont respectivement m&eacute;di&eacute;es par les sites cibles pour les facteurs de transcription bZIP et sites cibles SMAD. Au moins un site SMAD est &eacute;galement n&eacute;cessaire pour justifier l&#39;ouverture d&#39;expression. Un module d&#39;intron contient &eacute;galement des sites SMAD qui r&eacute;pondent aux commentaires Nodal et agit en outre pour r&eacute;primer l&#39;expression v&eacute;g&eacute;tale. Ces observations expliquent les principaux &eacute;l&eacute;ments d&#39;expression nodale dans l&#39;ectoderme oral : &eacute;tant donn&eacute; que l&#39;activit&eacute; des facteurs bZIP est oxydo-r&eacute;duction sensible, et la polarisation initiale oral vs aboral sort se manifeste par une oxydo-r&eacute;duction diff&eacute;rentielle, les sites bZIP repr&eacute;sentent l&#39;activation de nodal du c&ocirc;t&eacute; orale ; et les facteurs imm&eacute;diats de r&eacute;ponse transduction d&eacute;but de signal pour Nodal &eacute;tant facteurs SMAD, les sites SMAD compte pour le maintien de la r&eacute;troaction de l&#39;expression g&eacute;nique nodal.

CIS-r&eacute;gulation du g&egrave;ne nodal, initiateur du r&eacute;seau g&egrave;ne oursin ectoderme oral.

Ausdruck des Gens nodal initiiert das regulatorische gen-Netzwerk, das die transkriptionelle Spezifikation der m&uuml;ndlichen Ektoderm Seeigel Embryos festlegt. Dieses Gen kodiert ein TGFbeta-Ligand, und in Strongylocentrotus Purpuratus ihrer Transkription in den mutma&szlig;lichen m&uuml;ndliche Ektoderm an &uuml;ber die 30-Zelle-B&uuml;hne aktiviert ist. Unter allen Zellen des m&uuml;ndlichen Ektoderm-Territoriums tritt danach Nodal Signalisierung und nodal Ausdruck ist erforderlich f&uuml;r Expression orale Ektoderm regulatorische Gene. Das Cis-Regulierungssystem nodal gen transduces anisotropically verteilte zytoplasmatischen Hinweise, die die zuk&uuml;nftigen oralen und aboraler Dom&auml;nen des fr&uuml;hen Embryos zu unterscheiden. Hier schaffen wir den genomischen Basis f&uuml;r die Initiierung und Pflege von nodal Genexpression in der m&uuml;ndlichen Ektoderm. Funktionale Cis-regulatorische Steuermodule nodal gen wurden durch Interspezifische Sequenz Erhaltung identifiziert. Eine 5&#39;-Cis-regulatorische Modul-Funktionen, sowohl Ausdruck des Gens nodal einzuleiten und seinen Ausdruck durch R&uuml;ckmeldungen Eingaben vom Nodal Signaltransduktion System zu pflegen. Diese Funktionen werden durch Ziel-Sites f&uuml;r bZIP Transkriptionsfaktoren und durch SMAD-Ziel-Sites bzw. vermittelt. Mindestens eine SMAD-Website ist auch f&uuml;r die Einleitung des Ausdrucks erforderlich. Ein Intron-Modul enth&auml;lt auch die SMAD-Sites, die auf Nodal Feedback reagieren und dar&uuml;ber hinaus fungiert um pflanzliche Ausdruck zu unterdr&uuml;cken. Diese Beobachtungen erkl&auml;ren die wichtigsten Merkmale der nodal Ausdruck in der m&uuml;ndlichen Ektoderm: da die Aktivit&auml;t der bZIP Faktoren Redox empfindlich, und die anf&auml;ngliche Polarisierung der Oral vs. aborale Schicksal sich in einer differenziellen Redox manifestiert, ber&uuml;cksichtigen die bZIP-Sites f&uuml;r die Aktivierung der nodal auf der oralen Seite; und da die sofortige fr&uuml;he Signaltransduktion Response-Faktoren f&uuml;r Nodal SMAD Faktoren sind, entfallen die SMAD-Sites die R&uuml;ckmeldungen-Wartung von nodal Genexpression.

CIS-regulatorischen Kontrolle des nodal Gens, Initiator des Netzwerks Seeigel m&uuml;ndliche Ektoderm gen.

Espressione del gene nodale avvia la rete regolamentare di gene che stabilisce la specifica transcriptional dell&#39;ectoderma orale nell&#39;embrione di riccio di mare. Questo gene codifica per un ligando TGFbeta, e nel Strongylocentrotus purpuratus la trascrizione &egrave; attivata in ectoderma orale presuntiva presso sulla fase 30-cell. Segnalazione successivamente nodale si verifica tra tutte le celle del territorio ectoderma orale ed espressione nodale &egrave; necessaria per l&#39;espressione dei geni regolatori ectoderma orale. Il sistema cis-regolatori del gene nodale transduces anisotropically distribuiti spunti citoplasmatici che contraddistinguono i futuri domini orali e placche dell&#39;embrione precoce. Qui si stabilisce la base per l&#39;iniziazione e la manutenzione di espressione genica nodale in ectoderma orale genomic. Moduli di controllo funzionale cis-regolatori del gene nodale sono stati identificati dalla conservazione di sequenza interspecifici. Un 5&#39; cis-regolatori modulo funzioni di espressione del gene nodale di avviare e a mantenere la sua espressione mediante ingresso di feedback dal sistema di trasduzione del segnale nodale. Queste funzioni sono mediate rispettivamente dai siti di destinazione per fattori di trascrizione del bZIP e da siti di destinazione SMAD. Almeno un sito SMAD &egrave; necessario anche per l&#39;inizio dell&#39;espressione. Un modulo introne contiene anche siti SMAD che rispondono al feedback nodale e inoltre agisce per reprimere l&#39;espressione vegetale. Queste osservazioni spiegano le caratteristiche principali di espressione nodale in ectoderma orale: poich&eacute; l&#39;attivit&agrave; dei fattori bZIP &egrave; redox sensibili, e la polarizzazione iniziale di orale vs aboral destino si manifesta in una redox differenziale, i siti bZIP conto per l&#39;attivazione di nodale sul lato orale; e poich&eacute; i fattori della risposta del trasduzione di segnale precoce immediata per Nodal sono fattori SMAD, i siti SMAD conto per la manutenzione di feedback dell&#39;espressione del gene nodale.

Controllo CIS-regolatori del gene nodale, iniziatore della rete gene ectoderma orale riccio di mare.

&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x7BC0;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x4ED5;&#x69D8;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30A6;&#x30CB;&#x80DA;&#x3092;&#x78BA;&#x7ACB;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F; tgf &beta; &#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x30EA;&#x30AC;&#x30F3;&#x30C9; &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x3067;&#x305D;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199; 30 &#x30BB;&#x30EB;&#x6BB5;&#x968E;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x4E88;&#x5B9A;&#x306E;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x3067;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x7BC0;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306E;&#x9818;&#x571F;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x3001;&#x7BC0;&#x70B9;&#x5F0F;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x7BC0;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x80DA;&#x306E;&#x5C06;&#x6765;&#x306E;&#x53E3;&#x8154;&#x3068;&#x4E09;&#x30FB;&#x56DB;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x533A;&#x5225;&#x7570;&#x5206;&#x6563;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x624B;&#x304C;&#x304B;&#x308A; p75 &#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306E;&#x958B;&#x59CB;&#x3068;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30CA;&#x30F3;&#x30B9;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7BC0;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x57FA;&#x76E4;&#x3092;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x30B7;&#x30B9;&#x5236;&#x5FA1;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x7BC0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x7A2E;&#x9593;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x4FDD;&#x5168;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;5&#39; Cis &#x898F;&#x5236;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x95A2;&#x6570;&#x7BC0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3057;&#x3066;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x7BC0;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7CFB;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30C9;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x5165;&#x529B;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x305D;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x95A2;&#x6570;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C; SMAD &#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30FB; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x306F; bzip &#x578B;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;SMAD &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082; 1 &#x3064;&#x306E;&#x5F0F;&#x306E;&#x958B;&#x59CB;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3; &#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x3082;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x7BC0;&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30C9;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC; SMAD &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x690D;&#x7269;&#x6027;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x89B3;&#x5BDF;&#x7BC0;&#x5F0F;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x3067;&#x306E;&#x4E3B;&#x306A;&#x7279;&#x5FB4;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3059;&#x308B;: bZIP &#x8981;&#x56E0;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x30EC;&#x30C9;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x654F;&#x611F;&#x3001;&#x7D4C;&#x53E3;&#x4E09;&#x30FB;&#x56DB;&#x904B;&#x547D;&#x5BFE;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x504F;&#x6CE2;&#x3067;&#x9178;&#x5316;&#x9084;&#x5143;&#x5DEE;&#x52D5;&#x660E;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x30A2;&#x30AB;&#x30A6;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E; bZIP &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x7BC0;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x7D4C;&#x53E3;&#x306E;&#x5074;&#x306B;&#x306F;;&#x5373;&#x6642;&#x65E9;&#x671F;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4F1D;&#x9054;&#x5FDC;&#x7B54;&#x8981;&#x7D20;&#x7BC0;&#x70B9;&#x306E; SMAD &#x8981;&#x56E0;&#x306A;&#x306E;&#x3067;&#x3001;SMAD &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8; &#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x30C9;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x7DAD;&#x6301;&#x7BC0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A2;&#x30AB;&#x30A6;&#x30F3;&#x30C8;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7BC0;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x30A4;&#x30CB;&#x30B7;&#x30A8;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30A6;&#x30CB;&#x53E3;&#x8154;&#x5916;&#x80DA;&#x8449;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x5236;&#x5FA1;&#x3002;

&#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC2DD; &#xC131; &#xAC8C; &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm transcriptional &#xADDC;&#xACA9;&#xC744; &#xC124;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xADDC;&#xC81C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC2DC;&#xC791; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790; TGFbeta &#xB9AC;&#xAC04;&#xB4DC; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xD558;&#xACE0; Strongylocentrotus purpuratus&#xC758; &#xC804;&#xC0AC; 30 &#xC140; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C;&#xC5D0; &#xCD94;&#xC815; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm&#xC5D0;&#xC11C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm &#xC601;&#xD1A0;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC140; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xADF8; &#xD6C4; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC2E0;&#xD638; &#xACE0; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC2DD; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm &#xADDC;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; cis &#xADDC;&#xC81C; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; transduces anisotropically &#xBD84;&#xC0B0;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8; &#xC2E0;&#xD638; &#xCD08;&#xAE30; &#xBC30;&#xC544;&#xC758; &#xBBF8;&#xB798;&#xC758; &#xAD6C;&#xB450; &#xBC0F; aboral &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC744; &#xAD6C;&#xBD84; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAC1C;&#xC2DC;&#xC640; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm&#xC5D0;&#xC11C; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC8C;&#xB188;&#xC73C;&#xB85C; &#xC124;&#xC815;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; cis &#xADDC;&#xC815; &#xC81C;&#xC5B4; &#xBAA8;&#xB4C8; interspecific &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC874;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. 5&#39; Cis &#xADDC;&#xC815; &#xBAA8;&#xB4C8; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC2DD;&#xC744; &#xC2DC;&#xC791; &#xD558; &#xACE0; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC2E0;&#xD638; &#xBCC0;&#xD658; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD53C;&#xB4DC;&#xBC31; &#xC785;&#xB825;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574;&#xC758; &#xC2DD;&#xC744; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD568;&#xC218;&#xB294; SMAD &#xB300;&#xC0C1; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC640; bZIP &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB300;&#xC0C1; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC01;&#xAC01; &#xC911;&#xC7AC;. &#xD558;&#xB098; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; SMAD &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xB610;&#xD55C; &#xC2DD;&#xC758; &#xAC1C;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Intron &#xBAA8;&#xB4C8; &#xB610;&#xD55C; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30;&#xC758; &#xC758;&#xACAC;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5; &#xD558;&#xB294; SMAD &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xACE0; &#xB610;&#xD55C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC131; &#xC2DD; &#xC8FC;&#xCCB4; &#xD560; &#xD589;&#xC704;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAD00;&#xCE21; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm&#xC5D0;&#xC11C; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC2DD;&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xC124;&#xBA85;: bZIP &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xAD6C;&#xAC15; &#xCABD;; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xB97C; &#xC704;&#xD574; &#xACC4;&#xC815; bZIP &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xD65C;&#xB3D9; redox &#xBBFC;&#xAC10;&#xD55C;, &#xC774;&#xD6C4; aboral &#xC6B4;&#xBA85; &#xB300; &#xAD6C;&#xAC15;&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xC591;&#xADF9; &#xD654; redox &#xCC28;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xB098;&#xD0C0;&#xB098; &#xC2E0;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; Nodal&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC989;&#xAC01;&#xC801;&#xC778; &#xCD08;&#xAE30; &#xC2E0;&#xD638; &#xC804;&#xB2EC; &#xBC18;&#xC751; &#xC694;&#xC778; SMAD &#xC694;&#xC778; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0;, SMAD &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC758;&#xACAC; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218;&#xB97C; &#xB2F4;&#xB2F9;.

&#xAFB8;&#xBC85;&#xAFB8;&#xBC85; &#xC878; &#xAE30; &#xC9C4; &#xC131; &#xAC8C; &#xAD6C;&#xAC15; ectoderm &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC758; &#xCC3D;&#xC2DC;&#xC790;&#xC758; Cis &#xADDC;&#xC815; &#xC81C;&#xC5B4;.

Expresi&oacute;n del gen nodal inicia la red de gene regulador que establece la especificaci&oacute;n transcripcional del ectodermo oral en el embri&oacute;n de erizo de mar. Este gen codifica un ligando de TGFbeta, y en Strongylocentrotus purpuratus su transcripci&oacute;n se activa en el presunto ectodermo oral en sobre la etapa de 30 c&eacute;lulas. Despu&eacute;s de eso Nodal se&ntilde;alizaci&oacute;n ocurre entre todas las c&eacute;lulas del territorio ectodermo oral y expresi&oacute;n nodal es necesaria para la expresi&oacute;n de genes reguladores de ectodermo oral. El sistema regulatorio-cis del gen nodal transmite anis&oacute;tropa distribuidos citopl&aacute;smicos se&ntilde;ales que distinguen a los futuros dominios orales y aboral del embri&oacute;n temprano. Aqu&iacute; establecemos la base gen&oacute;mica para la iniciaci&oacute;n y mantenimiento de expresi&oacute;n g&eacute;nica nodal en el ectodermo oral. M&oacute;dulos de control de cis-regulador funcional del gen nodal fueron identificados por conservaci&oacute;n de secuencia interespec&iacute;fica. Un 5&#39; cis-regulatorios funciones del m&oacute;dulo para iniciar la expresi&oacute;n del gen nodal y mantener su expresi&oacute;n por medio de la entrada de la retroalimentaci&oacute;n del sistema de transducci&oacute;n de se&ntilde;al Nodal. Estas funciones est&aacute;n mediadas respectivamente por sitios de destino para factores de transcripci&oacute;n bZIP y sitios de destino SMAD. Al menos un sitio SMAD tambi&eacute;n es necesario para la iniciaci&oacute;n de la expresi&oacute;n. Un m&oacute;dulo del intr&oacute;n tambi&eacute;n contiene sitios SMAD que responden a la regeneraci&oacute;n Nodal y adem&aacute;s act&uacute;a para reprimir la expresi&oacute;n vegetal. Estas observaciones explican las principales caracter&iacute;sticas de expresi&oacute;n nodal en el ectodermo oral: ya que la actividad de factores bZIP redox sensible y la polarizaci&oacute;n inicial de oral vs destino aboral se manifiesta en un diferencial de redox, los sitios bZIP son responsables de la activaci&oacute;n de nodal del lado oral; y puesto que el inmediato factores de respuesta de transducci&oacute;n de la se&ntilde;al temprana para Nodal son factores SMAD, los sitios SMAD cuenta para el mantenimiento de la retroalimentaci&oacute;n de la expresi&oacute;n g&eacute;nica nodal.

Control CIS-regulador del gen nodal, iniciador de la red de gene de ectodermo oral de erizo de mar.

Gatae &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6D77;&#x80C6; purpuratus &#x662F;&#x810A;&#x690E;&#x52A8;&#x7269;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF; 4,5,6 &#x57FA;&#x56E0; orthologous&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x662F;&#x8868;&#x793A;&#x5728; blastula &#x53CA;&#x66F4;&#x9AD8;&#x7248;&#x672C;&#x7684; endomesoderm &#x7684;&#x80DA;&#x80CE;&#xFF0C;&#x80A0;&#x548C;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x9700;&#x8981;&#x3002;Gatae &#x542B;&#x6709;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x57FA;&#x56E0;&#x8BB0;&#x8005;&#x649E;&#x5230;&#x5916;&#x663E;&#x5B50;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x4E00;&#x7684; BAC &#x5F97;&#x4EE5;&#x91CD;&#x73B0;&#x5728;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x7684;&#x5185;&#x6E90;&#x6027; gatae &#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x65B9;&#x9762;&#x3002;&#x8981;&#x786E;&#x5B9A;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C; Lytechinus &#x9CBD; gatae BAC&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x663E;&#x793A; 25 &#x79CD;&#x95F4;&#x5E8F;&#x5217;&#x517B;&#x62A4;&#x5206;&#x6790;&#x5047;&#x5B9A; gatae &#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x6A21;&#x5757;&#x5B88;&#x6052;&#x975E;&#x7F16;&#x7801;&#x5E8F;&#x5217;&#x4FEE;&#x8865;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x88AB;&#x5355;&#x72EC;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x5728;&#x57FA;&#x56E0;&#x8F6C;&#x79FB;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5E76;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6A21;&#x5757;&#x80FD;&#x591F;&#x5728;&#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x7684;&#x9A7E;&#x9A76;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x7684;&#x8BB0;&#x8005;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E86;&#x3002;&#x6A21;&#x5757; 10 &#x751F;&#x6210;&#x65E9;&#x671F;&#x5230;&#x539F;&#x80A0;&#x65E9;&#x671F;&#x7684;&#x4E2D;&#x80DA;&#x5C42;&#x548C;&#x5185;&#x80DA;&#x5C42;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x6A21;&#x5757; 24 &#x751F;&#x6210;&#x539F;&#x80A0;&#x548C; pluteus &#x9636;&#x6BB5;&#x7684;&#x665A;&#x671F;&#x80DA;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x6A21;&#x5757; 10 &#x7136;&#x540E;&#x662F;&#x4E92;&#x60E0;&#x7684;&#x91CD;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x9020;&#x6210;&#x603B;&#x635F;&#x5931;&#x7684;&#x8BB0;&#x8005;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x5373;&#x4E00;&#x822C;&#x5904;&#x4E8E;&#x6D3B;&#x52A8;&#x72B6;&#x6001;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x5185;&#x4ECE; gatae BAC &#x5220;&#x9664;&#x3002;&#x6A21;&#x5757; 24 &#x7C7B;&#x4F3C;&#x5220;&#x9664;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7684;&#x539F;&#x80A0;&#x548C; pluteus &#x4E2D;&#x65E0;&#x5904;&#x4E0D;&#x5728;&#x7684;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x6A21;&#x5757; 10 &#x662F;&#x552F;&#x4E00;&#x5FC5;&#x8981;&#x5E76;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x8BF4;&#x660E; gatae endomesoderm &#x89C4;&#x8303;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5B83;&#x4EEC;&#x610F;&#x5473;&#x7740;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x529F;&#x80FD;&#x6A21;&#x5757;&#x6392;&#x65A5;&#xFF0C;&#x5373;&#x53EA;&#x6709;&#x5355;&#x4E2A;&#x6A21;&#x5757;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x57FA;&#x672C;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x548C;&#x9A71;&#x52A8;&#x5668;&#x5728;&#x4EFB;&#x4F55;&#x7ED9;&#x5B9A;&#x65F6;&#x95F4;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

Gatae Strongylocentrorus purpuratus &#x80DA;&#x80CE;&#x4E2D;&#x7684;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x76D1;&#x7BA1;&#x6A21;&#x5757;&#x7684;&#x72EC;&#x5360;&#x53D1;&#x5C55;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;

The gatae gene of Strongylocentrotus purpuratus is orthologous to vertebrate gata-4,5,6 genes. This gene is expressed in the endomesoderm in the blastula and later the gut of the embryo, and is required for normal development. A gatae BAC containing a GFP reporter knocked into exon one of the gene was able to reproduce all aspects of endogenous gatae expression in the embryo. To identify putative gatae cis-regulatory modules we carried out an interspecific sequence conservation analysis with respect to a Lytechinus variegatus gatae BAC, which revealed 25 conserved non-coding sequence patches. These were individually tested in gene transfer experiments, and two modules capable of driving localized reporter expression in the embryo were identified. Module 10 produces early expression in mesoderm and endoderm cells up to the early gastrula stage, while module 24 generates late endodermal expression at gastrula and pluteus stages. Module 10 was then deleted from the gatae BAC by reciprocal recombination, resulting in total loss of reporter expression in the time frame in which it is normally active. Similar deletion of module 24 led to ubiquitous GFP expression in the gastrula and pluteus. These results show that Module 10 is uniquely necessary and sufficient to account for the early phase of gatae expression during endomesoderm specification. In addition, they imply a functional cis-regulatory module exclusion, whereby only a single module can associate with the basal promoter and drive gene expression at any given time.

Exclusive developmental functions of gatae cis-regulatory modules in the Strongylocentrorus purpuratus embryo.

Le g&egrave;ne gatae de Strongylocentrotus purpuratus est orthologues de g&egrave;nes gata-4,5,6 de vert&eacute;br&eacute;s. Ce g&egrave;ne est exprim&eacute; dans l&#39;endomesoderm de la blastula et plus tard l&#39;intestin de l&#39;embryon et est n&eacute;cessaire au d&eacute;veloppement normal. Un BAC contenant un reporter GFP dans l&#39;exon du g&egrave;ne de l&#39;un de gatae &eacute;tait capable de reproduire tous les aspects de l&#39;expression gatae endog&egrave;ne chez l&#39;embryon. Pour identifier les modules cis-r&eacute;glementation gatae putatif, que nous avons effectu&eacute; une analyse s&eacute;quence intersp&eacute;cifique de conservation en ce qui concerne un Lytechinus variegatus gatae BAC, qui a r&eacute;v&eacute;l&eacute; le 25 conserv&eacute; patches de s&eacute;quences non codantes. Ceux-ci ont &eacute;t&eacute; test&eacute;s individuellement dans les exp&eacute;riences de transfert de g&egrave;ne, et deux modules capables d&#39;expression motrice de journaliste localis&eacute;e dans l&#39;embryon ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s. Module 10 module 24 g&eacute;n&egrave;re l&#39;expression endodermique tardive au stade gastrula et pluteus g&eacute;n&egrave;re l&#39;expression pr&eacute;coce dans les cellules jusqu&#39;au stade pr&eacute;coce de la gastrula, m&eacute;soderme et endoderme. Module 10 a &eacute;t&eacute; ensuite supprim&eacute; de la gatae BAC par recombinaison r&eacute;ciproque, ce qui entra&icirc;ne une perte totale de l&#39;expression du Rapporteur dans le laps de temps o&ugrave; il est normalement actif. Semblable suppression du module 24 a conduit &agrave; l&#39;expression de la GFP omnipr&eacute;sente dans la gastrula et pluteus. Ces r&eacute;sultats montrent que le Module 10 est uniquement n&eacute;cessaire et suffisante pour tenir compte de la phase initiale d&#39;expression gatae au cours de la sp&eacute;cification endomesoderm. En outre, elles impliquent une exclusion module cis-r&eacute;gulation fonctionnelle, selon laquelle seulement un seul module peut &ecirc;tre associ&eacute; le promoteur basal et l&#39;expression g&eacute;nique en voiture &agrave; tout moment.

Fonctions du d&eacute;veloppement exclusives gatae modules cis-r&eacute;gulation chez l&#39;embryon de purpuratus Strongylocentrorus.

Das Gatae gen von Strongylocentrotus Purpuratus ist Orthologous vertebrate Gata-4,5,6-Genen. Dieses Gen wird ausgedr&uuml;ckt in der Endomesoderm in der Blastula und sp&auml;ter den Darm des Embryos und ist f&uuml;r die normale Entwicklung erforderlich. Ein Gatae BAC mit GFP Reporter klopfte in Exon eines Gens war in der Lage, alle Aspekte des endogenen Gatae Ausdruck im Embryo zu reproduzieren. Vermeintliche Gatae Cis-regulatorische Module zu identifizieren, wie, die wir eine Interspezifische Sequenzanalyse der Erhaltung in Bezug auf eine Lytechinus Variegatus Gatae BAC, erledigt die 25 offenbart, konserviert nicht-kodierenden Sequenz Flecken. Diese wurden einzeln in gen-Transfer-Experimenten getestet, und der treibende lokalisierte Reporter Ausdruck im Embryo zwei Module wurden identifiziert. Modul 10 erzeugt fr&uuml;hen Ausdruck im Mesoderm und Entoderm Zellen bis zu den fr&uuml;hen Gastrula-Stadium, w&auml;hrend Modul 24 sp&auml;ten endodermalen Ausdruck in Phasen Gastrula und Rehbrauner generiert. Modul 10 wurde dann aus der Gatae BAC gel&ouml;scht, durch wechselseitige Rekombination, total Verlust Reporter Ausdruck in dem Zeitrahmen, in dem es normalerweise aktiv ist. &Auml;hnliche L&ouml;schung des Moduls 24 f&uuml;hrte zur allgegenw&auml;rtigen GFP-Expression in der Gastrula und Rehbrauner. Diese Ergebnisse zeigen, dass Modul 10 eindeutig notwendig und ausreichend, um der fr&uuml;hen Phase der Gatae Ausdruck w&auml;hrend der Endomesoderm-Spezifikation zu ber&uuml;cksichtigen ist. Dar&uuml;ber hinaus wollen sie eine funktionierendes Cis-regulatorische Modul Ausgrenzung, wobei nur ein Modul der basalen Projekttr&auml;ger und Laufwerk-Genexpression zu einem bestimmten Zeitpunkt zugeordnet werden kann.

Exklusive Entwicklungsst&ouml;rungen Funktionen Gatae Cis-regulatorische Module im Strongylocentrorus Purpuratus Embryo.

Il gene gatae di Strongylocentrotus purpuratus &egrave; orthologous ai vertebrati geni gata-4,5,6. Questo gene &egrave; espresso in endomesoderm della blastula e pi&ugrave; tardi l&#39;intestino dell&#39;embrione ed &egrave; necessaria per lo sviluppo normale. Un gatae BAC contenente un reporter GFP bussato in esone uno del gene &egrave; stata in grado di riprodurre tutti gli aspetti dell&#39;espressione gatae endogeni nell&#39;embrione. Per identificare i moduli cis-regolatori gatae putativo, che abbiamo effettuato un&#39;analisi di conservazione interspecifici sequenza rispetto a un Lytechinus variegatus gatae BAC, che ha rivelato 25 conservato patch sequenza non codificante. Questi sono stati testati singolarmente in esperimenti di trasferimento del gene, e sono stati identificati due moduli capaci di guida espressione reporter localizzata nell&#39;embrione. Modulo 10 produce precoce espressione in cellule mesoderma ed endoderma fino allo stadio di gastrula precoce, mentre il modulo 24 genera tardo endodermico espressione nelle fasi di gastrula e pluteus. Modulo 10 &egrave; stato poi cancellato da gatae BAC di ricombinazione reciproca, con conseguente perdita totale dell&#39;espressione reporter nel lasso di tempo in cui &egrave; normalmente attivo. Simile omissione del modulo 24 led all&#39;onnipresente espressione di GFP nella gastrula e pluteus. Questi risultati mostrano che il modulo 10 &egrave; unicamente necessario e sufficiente a rendere conto per la prima fase dell&#39;espressione gatae durante endomesoderm specifica. Inoltre, essi implicano un&#39;esclusione funzionale modulo cis-regolatori, per cui solo un singolo modulo pu&ograve; essere associato il promotore basale ed espressione genica in auto in un determinato momento.

Esclusive funzioni dello sviluppo di moduli cis-regolatori gatae nell&#39;embrione purpuratus Strongylocentrorus.

&#x30C8;&#x30E9;&#x30B6;&#x30E1; purpuratus &#x306E; gatae &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x810A;&#x690E;&#x52D5;&#x7269;&#x30AC;&#x30FC;&#x30BF; 4,5,6 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x8178;&#x80DA;&#x306E;&#x80DE;&#x80DA;&#x3068;&#x5F8C;&#x3067; endomesoderm &#x3067;&#x8868;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x767A;&#x9054;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;Gatae &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306B;&#x30CE;&#x30C3;&#x30AF; GFP &#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x542B;&#x3080; BAC &#x80DA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5185;&#x5728;&#x6027; gatae &#x5F0F;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x5074;&#x9762;&#x3092;&#x518D;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x3002;Lytechinus &#x8FBC;&#x307F; gatae 25 &#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B; BAC &#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x7A2E;&#x9593;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x4FDD;&#x5168;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x5B9F;&#x65BD;&#x3057;&#x305F;&#x63A8;&#x5B9A; gatae &#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; &#x30D1;&#x30C3;&#x30C1;&#x3092;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306F;&#x500B;&#x5225;&#x306B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x4F1D;&#x9054;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x904B;&#x8EE2;&#x306E;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x8A18;&#x8005;&#x5F0F;&#x4E2D;&#x306E;&#x80DA;&#x306E;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B; 2 &#x3064;&#x306E;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x304C;&#x7279;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; 24 &#x539F;&#x8178;&#x80DA;&#x3068;&#x30D7;&#x30EB;&#x30C6;&#x30A6;&#x30B9;&#x671F;&#x5F8C;&#x534A;&#x306E;&#x5185;&#x80DA;&#x8449;&#x5F0F;&#x751F;&#x6210;&#x4E2D;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; 10 &#x4E2D;&#x80DA;&#x8449;&#x3068;&#x5185;&#x80DA;&#x8449;&#x7D30;&#x80DE;&#x539F;&#x8178;&#x80DA;&#x521D;&#x671F;&#x307E;&#x3067;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x8868;&#x73FE;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; 10 &#x306F;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x5F0F;&#x3067;&#x901A;&#x5E38;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x5834;&#x5408;&#x306E;&#x6642;&#x9593;&#x67A0;&#x3067;&#x306E;&#x7DCF;&#x640D;&#x5931;&#x3067;&#x751F;&#x3058;&#x308B;&#x76F8;&#x4E92;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x63DB;&#x3048;&#x306B;&#x3088;&#x308B; BAC gatae &#x304B;&#x3089;&#x524A;&#x9664;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x539F;&#x8178;&#x80DA;&#x3068;&#x30D7;&#x30EB;&#x30C6;&#x30A6;&#x30B9; &#x30E6;&#x30D3;&#x30AD;&#x30BF;&#x30B9; GFP &#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x3063;&#x305F;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; 24 &#x306E;&#x985E;&#x4F3C;&#x306E;&#x524A;&#x9664;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; 10 &#x304C;&#x4E00;&#x610F;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304B;&#x3064;&#x5341;&#x5206;&#x306A; gatae &#x5F0F; endomesoderm &#x4ED5;&#x69D8;&#x4E2D;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x4F4D;&#x76F8;&#x3092;&#x8003;&#x616E;&#x3057;&#x3066;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F; cis &#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x9664;&#x5916;&#x306F;&#x3001;whereby &#x57FA;&#x5E95;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x4EFB;&#x610F;&#x306E;&#x6642;&#x70B9;&#x3067;&#x30C9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x8868;&#x73FE;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x306E;&#x307F; 1 &#x3064;&#x306E;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x3092;&#x610F;&#x5473;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Gatae &#x30B7;&#x30B9;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB; Strongylocentrorus purpuratus &#x80DA;&#x306E;&#x6392;&#x4ED6;&#x7684;&#x306A;&#x767A;&#x9054;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3002;

Strongylocentrotus purpuratus&#xC758; gatae &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xAC00; &#xCC99;&#xCD94; gata 4,5,6 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; orthologous. &#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xBC30;&#xC544;, &#xC6A9;&#xAE30; endomesoderm&#xB294; blastula &#xBC0F; &#xB098;&#xC911;&#xC5D0; &#xD45C;&#xD604; &#xD558; &#xACE0; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xBC1C;&#xC804;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Gatae BAC GFP &#xAE30;&#xC790; &#xD558;&#xB098; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; exon&#xC73C;&#xB85C; &#xAE30; &#xC808;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xD0DC;&#xC544;&#xC758; &#xC0DD; gatae &#xC2DD;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xCE21;&#xBA74;&#xC744; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0C1; gatae cis &#xADDC;&#xC815; &#xBAA8;&#xB4C8; Lytechinus variegatus gatae 25 &#xBC1D;&#xD600; &#xD608; &#xC911; &#xC54C;&#xCF54;&#xC62C; &#xB18D;&#xB3C4; &#xAD00;&#xD558;&#xC5EC; interspecific &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC874; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xC2DC;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; &#xC21C;&#xC11C; &#xD328;&#xCE58;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC874;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC804;&#xC1A1; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBCC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD558; &#xACE0; &#xB450; &#xBAA8;&#xB4C8; &#xD0DC;&#xC544;&#xC5D0; &#xC6B4;&#xC804; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xB41C; &#xAE30;&#xC790; &#xC2DD; &#xC218; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4C8; 10 &#xBAA8;&#xB4C8; 24 gastrula &#xBC0F; pluteus &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2A6;&#xC740; endodermal &#xC2DD;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xCD08;&#xAE30; gastrula &#xBB34;&#xB300; mesoderm &#xBC0F; endoderm &#xC140; &#xCD08;&#xAE30; &#xC2DD;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4C8; 10 &#xB2E4;&#xC74C; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB418;&#xB294; &#xC2DC;&#xAC04; &#xD504;&#xB808;&#xC784;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC790; &#xC2DD;&#xC758; &#xCD1D; &#xC190;&#xC2E4;&#xC744; &#xC0C1;&#xD638; &#xC7AC;&#xACB0;&#xD569; &#xD558; &#xC5EC; &#xD608; &#xC911; &#xC54C;&#xCF54;&#xC62C; &#xB18D;&#xB3C4;&#xAC00; gatae&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC720;&#xBE44; &#xCFFC;&#xD130; &#xC2A4; GFP &#xC2DD; gastrula &#xBC0F; pluteus&#xC5D0; led &#xBAA8;&#xB4C8; 24&#xC758; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xC0AD;&#xC81C;. &#xC774; &#xACB0;&#xACFC; &#xBAA8;&#xB4C8; 10 &#xC720;&#xC77C; &#xD558; &#xAC8C; &#xD544;&#xC694; &#xD558; &#xACE0; endomesoderm &#xC0AC;&#xC591; &#xC911; gatae &#xC2DD;&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xACC4;&#xC815;&#xC5D0; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD55C; &#xAC83;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xAE30;&#xC800; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC0F; &#xC5B8;&#xC81C; &#xB4E0; &#xC9C0; &#xB4DC;&#xB77C;&#xC774;&#xBE0C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xB2E8;&#xC77C; &#xBAA8;&#xB4C8;&#xC744; &#xC5F0;&#xACB0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xADF8;&#xAC83;&#xC5D0; &#xC758;&#xD558;&#xC5EC; &#xAE30;&#xB2A5; cis &#xADDC;&#xC815; &#xBAA8;&#xB4C8; &#xC81C;&#xC678;&#xB97C; &#xC758;&#xBBF8;.

Gatae Strongylocentrorus purpuratus &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; cis &#xADDC;&#xC815; &#xBAA8;&#xB4C8;&#xC758; &#xB3C5;&#xC810; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xAE30;&#xB2A5;.

El gen gatae de Strongylocentrotus purpuratus es orthologous genes de gata-4,5,6 vertebrados. Este gen es expresada en el endomesoderm en la bl&aacute;stula y m&aacute;s adelante el intestino del embri&oacute;n y se requiere para el desarrollo normal. Un gatae BAC que contiene un reportero GFP en ex&oacute;n uno del gen fue capaz de reproducir todos los aspectos de la expresi&oacute;n gatae end&oacute;geno en el embri&oacute;n. Para identificar la supuesta gatae m&oacute;dulos cis-regulador se llev&oacute; a cabo un an&aacute;lisis de la conservaci&oacute;n de secuencia interespec&iacute;fica con respecto a un Lytechinus variegatus gatae BAC, que revel&oacute; 25 conserva parches de secuencia no codificante. &Eacute;stos fueron probados individualmente en experimentos de transferencia de genes, y se identificaron dos m&oacute;dulos capaces de conducir expresi&oacute;n localizada de reportero en el embri&oacute;n. M&oacute;dulo 10 produce temprana expresi&oacute;n en las c&eacute;lulas del mesodermo y endodermo hasta la etapa de g&aacute;strula temprana, mientras que el m&oacute;dulo 24 genera final expresi&oacute;n endod&eacute;rmico en fases de g&aacute;strula y pluteus. M&oacute;dulo 10 entonces fue eliminada de la gatae BAC por recombinaci&oacute;n rec&iacute;proca, dando por resultado la p&eacute;rdida total de expresi&oacute;n de reportero en el marco de tiempo en el cual es normalmente activo. Supresi&oacute;n similar de m&oacute;dulo 24 conducido a la expresi&oacute;n de GFP omnipresente en la g&aacute;strula y pluteus. Estos resultados muestran que el m&oacute;dulo 10 es &uacute;nicamente necesaria y suficiente para tomar en cuenta la fase temprana de expresi&oacute;n gatae durante la especificaci&oacute;n endomesoderm. Adem&aacute;s, implican una exclusi&oacute;n de m&oacute;dulo de cis-regulador funcional, por el que s&oacute;lo un m&oacute;dulo se puede asociar con el promotor basal y la expresi&oacute;n g&eacute;nica de unidad en un momento dado.

Funciones exclusivas de desarrollo de m&oacute;dulos cis-regulador gatae en el embri&oacute;n de purpuratus Strongylocentrorus.

&#x4E3A;&#x9AD8;&#x6280;&#x672F;&#x5DE5;&#x4E1A;&#x5E9F;&#x6C34;&#x819C;&#x751F;&#x7269;&#x53CD;&#x5E94;&#x5668; (MBR) &#x4E2D;&#x6DFB;&#x52A0;&#x8865;&#x5145;&#x78B3;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;MBR &#x88AB;&#x7ECF;&#x8425;&#x7684; 302days &#x4E0B;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684; C/N (BOD(L)/NH(4)(+)-N) &#x6BD4;&#x7387;&#xFF0C;&#x5373; 0.9-1 &#x5230; 20days&#xFF0C;1.6 21 &#x81F3; 42days&#x3001; 82days&#x3001; 3.6-83 &#x5230; 141days&#x3001; 4.8-165 &#x5230; 233days 2.9-43 &#x548C; 9.3-240 &#x5230; 302days&#x3002;C/N &#x6BD4;&#x4F8B;&#x8C03;&#x67E5;&#xFF0C;SS &#x548C; BOD(5) &#x7684;&#x53BB;&#x9664;&#x6548;&#x7387;&#x662F; 95%&#x4EE5;&#x4E0A;&#x548C; COD &#x53BB;&#x9664;&#x88AB;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684; 80%&#x4EE5;&#x4E0A;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5728;&#x6574;&#x4E2A;&#x8C03;&#x67E5;&#x6307;&#x51FA;&#x5B8C;&#x6210;&#x785D;&#x5316;&#x3002;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x53CD;&#x785D;&#x5316;&#x8131;&#x6C2E;&#x53CA;&#x603B;&#x6C2E;&#x53BB;&#x9664;&#x7387;&#x8FBE;&#x5230;&#x5176;&#x6700;&#x9AD8;&#x503C;&#x5728;&#x6700;&#x9AD8;&#x7684; C/N &#x6BD4; &#xFF08;9.3&#xFF09; &#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x5B9E;&#x65F6; PCR &#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E; 10times &#x9AD8;&#x6C28;&#x6C27;&#x5316;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x603B;&#x6570;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x6700;&#x9AD8; C/N &#x6BD4;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B; &#xFF08;9.3&#xFF09; &#x76F8;&#x6BD4;&#x4F4E; C/N &#x6BD4;&#x4F8B;&#x6761;&#x4EF6; &#xFF08;1.6&#xFF09;&#x3002;

C/N &#x4F4E;&#x9AD8;&#x6280;&#x672F;&#x5DE5;&#x4E1A;&#x5E9F;&#x6C34;&#x7684; MBR &#x6CBB;&#x7597;&#x6DFB;&#x52A0;&#x8865;&#x5145;&#x78B3;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

The effect of supplementary carbon addition for the treatment of high-technology industrial wastewater in a membrane bioreactor (MBR) was investigated. The MBR was operated for 302days under different C/N (BOD(L)/NH(4)(+)-N) ratios, i.e. 0.9-1 to 20days, 1.6-21 to 42days, 2.9-43 to 82days, 3.6-83 to 141days, 4.8-165 to 233days and 9.3-240 to 302days. Irrespective of the C/N ratios investigated, SS and BOD(5) removal efficiencies were above 95% and above 80% COD removal efficiency was observed. In addition, complete nitrification was observed throughout the investigation. However, denitrification and total nitrogen removal efficiencies reached their maximum values at the highest C/N ratio (9.3) investigated. Real-time PCR analysis revealed 10times higher ammonia oxidizing bacteria to total bacteria ratio under the highest C/N ratio condition (9.3) compared to the low C/N ratio condition (1.6).

Effect of supplementary carbon addition in the treatment of low C/N high-technology industrial wastewater by MBR.

A &eacute;tudi&eacute; l&#39;effet de l&#39;addition de carbone suppl&eacute;mentaire pour le traitement des eaux us&eacute;es industrielles de haute technologie dans un bior&eacute;acteur &agrave; membrane (MBR). Le MBR a &eacute;t&eacute; op&eacute;r&eacute; pour 302days sous diff&eacute;rentes C/N (ratios de BOD(L)/NH(4)(+)-N), soit 0,9-1 &agrave; 20 jours, 1.6-21 &agrave; 42days, 2,9-43 82days, 3.6-1983 &agrave; 141days, 4,8-165 &agrave; 233days et 9,3-240 &agrave; 302days. Quelles que soient les rapports c/n &eacute;tudi&eacute;s, les rendements d&#39;&eacute;limination de SS et BOD(5) ont &eacute;t&eacute; au-dessus de 95 % et 80 % efficacit&eacute; d&#39;&eacute;limination de COD a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e. En outre, la nitrification compl&egrave;te a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e tout au long de l&#39;enqu&ecirc;te. Toutefois, la d&eacute;nitrification et les rendements d&#39;&eacute;limination de l&#39;azote total atteints leur valeur maximale dans le rapport de c/n plus &eacute;lev&eacute; (9,3) ont &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;s. Analyse PCR en temps r&eacute;el a r&eacute;v&eacute;l&eacute; 10times sup&eacute;rieur ammoniaque oxydation bact&eacute;ries ratio bact&eacute;ries totales sous la condition de ratio C/N plus &eacute;lev&eacute;e (9,3), par rapport &agrave; l&#39;&eacute;tat bas du ratio C/N (1.6).

Effet de l&#39;addition de carbone suppl&eacute;mentaire dans le traitement des eaux basses C/N haute technologie us&eacute;es industrielles par MBR.

Die Wirkung einer zus&auml;tzlichen CO2-Zuschlag der High-Tech-Industrie Abwasserbehandlung in einem Membran-Bioreaktor (MBR) wurde untersucht. Der MBR wurde f&uuml;r 302days unter verschiedenen C/N (BOD(L)/NH(4)(+)-N)-Verh&auml;ltnisse, d.h. 0,9-1 bis 20Tagen, 1.6-21 bis 42days, 2.9-43 82days, 3.6-83, 141days, 4.8-165, 233days und 9.3-240, 302days. betrieben. Unabh&auml;ngig von der C/N-Verh&auml;ltnisse untersucht waren SS und BOD(5) Entfernung Effizienz &uuml;ber 95 % und &uuml;ber 80 %, die Effizienz der COD-Entfernung beobachtet wurde. Au&szlig;erdem wurde w&auml;hrend der Untersuchung vollst&auml;ndige Nitrifikation beobachtet. Jedoch untersuchte Denitrifikation und Gesamtstickstoff Entfernung Effizienz erreicht ihre maximale Werte mit der h&ouml;chsten C/N-Verh&auml;ltnis (9.3). Echtzeit-PCR-Analyse ergab 10times h&ouml;here Ammoniak oxidierende Bakterien insgesamt Bakterien-Verh&auml;ltnis unter den h&ouml;chsten C/N Verh&auml;ltnis Bedingung (9.3) im Vergleich zu den niedrigen C/N Verh&auml;ltnis Zustand (1.6).

Effekt der zus&auml;tzlichen CO2-Zusatz in der niedrigen C/N High-Tech-industrielle Abwasserbehandlung von MBR.

&Egrave; stato studiato l&#39;effetto dell&#39;aggiunta di carbonio supplementare per il trattamento di acque reflue industriali ad alta tecnologia in un bioreattore a membrana (MBR). il MBR &egrave; stato operato per 302days sotto diverse C/N (rapporti di BOD(L)/NH(4)(+)-N), cio&egrave; 0.9-1 a 20days, 1.6-21 per 42days, 2,9-43 a 82days, 3.6-83 a 141days, 4,8-165 per 233days e 9.3-240 a 302days. Qualunque sia i rapporti C/N indagati, efficienze di rimozione SS e BOD(5) erano sopra il 95% e 80% l&#39;efficienza di rimozione di COD &egrave; stata osservata. Inoltre, nitrificazione completa &egrave; stata osservata in tutta l&#39;inchiesta. Tuttavia, denitrificazione e le efficienze di rimozione di azoto totale ha raggiunge i valori massimi presso il pi&ugrave; alto rapporto c/n (9.3) indagato. Analisi PCR in tempo reale ha rivelato 10times ammoniaca superiore ossidanti batteri rapporto totale batteri sotto il pi&ugrave; alta C/N rapporto condizione (9.3) rispetto alla condizione di rapporto C/N basso (1.6).

Effetto dell&#39;aggiunta di carbonio supplementare nel trattamento di acque basse C/N alta tecnologia reflue industriali di MBR.

&#x819C;&#x578B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30EA;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BF;&#x30FC; (MBR) &#x306E;&#x9AD8;&#x6280;&#x8853;&#x7523;&#x696D;&#x5EC3;&#x6C34;&#x306E;&#x51E6;&#x7406;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x88DC;&#x8DB3;&#x70AD;&#x7D20;&#x6DFB;&#x52A0;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;MBR &#x306F;&#x3001;302days &#x7570;&#x306A;&#x308B; C/N (BOD(L)/NH(4)(+)-N) &#x6BD4;&#x3001;&#x3059;&#x306A;&#x308F;&#x3061;&#x306E; 0.9-1 20 days, 1.6-21 42days&#x3001;2.9-43 82days&#x3001;3.6-83 141days &#x306B;&#x3001;4.8-165 233days &#x3057;&#x3066; 9.3-240 302days &#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3002; &#x4E0B;&#x306E;&#x624B;&#x8853;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x305F;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F; C/N &#x6BD4;&#x306B;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306A;&#x304F;&#x3001;SS &#x306F;&#x3001;BOD(5) &#x9664;&#x53BB;&#x52B9;&#x7387; 95% &#x4EE5;&#x4E0A;&#x3068; COD &#x9664;&#x53BB;&#x52B9;&#x7387;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F; 80% &#x4EE5;&#x4E0A;.&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x785D;&#x5316;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3092;&#x901A;&#x3058;&#x3066;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x8131;&#x7A92;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x6700;&#x9AD8;&#x306E; C/N &#x6BD4; (9.3) &#x3067;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x306B;&#x9054;&#x3057;&#x305F;&#x5408;&#x8A08;&#x7A92;&#x7D20;&#x9664;&#x53BB;&#x52B9;&#x7387;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3002;&#x30EA;&#x30A2;&#x30EB;&#x30BF;&#x30A4;&#x30E0; PCR &#x89E3;&#x6790;&#x30EA;&#x30D5;&#x30ED;&#x30FC; 10 &#x56DE;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x3044;&#x30A2;&#x30F3;&#x30E2;&#x30CB;&#x30A2;&#x9178;&#x5316;&#x7D30;&#x83CC;&#x5408;&#x8A08;&#x7D30;&#x83CC;&#x6BD4;&#x4F4E; C/N &#x6BD4;&#x6761;&#x4EF6; (1.6) &#x306B;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3066;&#x9AD8;&#x3044; C/N &#x6BD4;&#x6761;&#x4EF6; (9.3) &#x306E;&#x4E0B;&#x306B;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

MBR &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4F4E; C/N &#x9AD8;&#x6280;&#x8853;&#x7523;&#x696D;&#x5EC3;&#x6C34;&#x306E;&#x9644;&#x5247;&#x70AD;&#x7D20;&#x6DFB;&#x52A0;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;

&#xB9C9; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xBC18;&#xC751; &#xAE30; (MBR)&#xC5D0;&#xC11C; &#xCCA8;&#xB2E8; &#xAE30;&#xC220; &#xC0B0;&#xC5C5; &#xD3D0;&#xC218;&#xC758; &#xCC98;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBCF4;&#xCDA9; &#xD0C4;&#xC18C; &#xCD94;&#xAC00;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;. MBR&#xC740; &#xB2E4;&#xB978; c/N (BOD(L)/NH(4)(+)-N) &#xBE44;&#xC728;, &#xC989; 0.9-1 20days, 42days, 2.9-43, 82days, 141days 3.6-83, 233days 4.8-165&#xC640; 302days 9.3-240&#xC744; 1.6-21 &#xC544;&#xB798;&#xB294; 302days&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6B4;&#xC601; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC870;&#xC0AC; c/N &#xBE44;&#xC728;&#xC5D0; &#xAD00;&#xACC4; &#xC5C6;&#xC774; SS &#xBC0F; BOD(5) &#xC81C;&#xAC70; &#xD6A8;&#xC728; 95% &#xC774;&#xC0C1; &#xBC0F; COD &#xC81C;&#xAC70; &#xD6A8;&#xC728;&#xC744; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; 80% &#xC774;&#xC0C1; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC644;&#xC804; &#xD55C; nitrification &#xC870;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xAD00;&#xCC30; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, denitrification &#xBC0F; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; c/N &#xBE44;&#xC728; (9.3)&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; &#xAC12;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xB2EC; &#xD558;&#xB294; &#xCD1D; &#xC9C8;&#xC18C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD6A8;&#xC728;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC;. &#xC2E4;&#xC2DC;&#xAC04; PCR &#xBD84;&#xC11D; &#xACF5;&#xAC1C; 10times &#xB192;&#xC740; &#xC554;&#xBAA8;&#xB2C8;&#xC544; &#xC0B0;&#xD654; &#xC138;&#xADE0; &#xCD1D; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xBE44;&#xC728;&#xC774; &#xB0AE;&#xC740; c/N &#xBE44;&#xC728; &#xC870;&#xAC74; (1.6)&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; c/N &#xBE44;&#xC728; &#xC870;&#xAC74; (9.3).

MBR&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB0AE;&#xC740; c/N &#xCCA8;&#xB2E8; &#xAE30;&#xC220; &#xC0B0;&#xC5C5; &#xD3D0;&#xC218;&#xC758; &#xCC98;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xBCF4;&#xCDA9; &#xD0C4;&#xC18C; &#xCD94;&#xAC00;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC;.

Se investig&oacute; el efecto de la adici&oacute;n de carbono suplementario para el tratamiento de aguas residuales industriales de alta tecnolog&iacute;a en un biorreactor de la membrana (MBR). El MBR funcionaron para 302days bajo diferentes C/N (relaciones BOD(L)/NH(4)(+)-N), es decir, 0.9-1 a 20 d&iacute;as, 1.6-21 a 42days, 2.9-43 82days, 3.6-83 a 141days, 4.8-165 a 233days y 9.3-240 a 302days. Independientemente de los valores de C/N investigados, eficiencia de remoci&oacute;n de SS y BOD(5) fueron superiores al 95% y superiores al 80% la eficiencia de remoci&oacute;n de bacalao se observ&oacute;. Adem&aacute;s, se observ&oacute; la nitrificaci&oacute;n completa a lo largo de la investigaci&oacute;n. Sin embargo, investig&oacute; la desnitrificaci&oacute;n y la eficiencia de eliminaci&oacute;n de nitr&oacute;geno total alcanzado sus valores m&aacute;ximos en la m&aacute;s alta relaci&oacute;n C/N (9.3). An&aacute;lisis PCR en tiempo real revelaron 10 veces m&aacute;s amon&iacute;aco oxidante las bacterias a la proporci&oacute;n de bacterias totales bajo la m&aacute;s alta condici&oacute;n de relaci&oacute;n C/N (9,3) en comparaci&oacute;n con la condici&oacute;n de relaci&oacute;n C/N baja (1.6).

Article	Year
A genomic regulatory network for development. Science (New York, N.Y.)\| PubMed ID: 11872831	2002
A provisional regulatory gene network for specification of endomesoderm in the sea urchin embryo. Developmental biology\| PubMed ID: 12027441	2002
Gene expression markers for Caenorhabditis elegans vulval cells. Gene expression patterns : GEP\| PubMed ID: 12617807	2002
Gene expression markers for Caenorhabditis elegans vulval cells. Mechanisms of development\| PubMed ID: 14516686	2002
Expression of Spgatae, the Strongylocentrotus purpuratus ortholog of vertebrate GATA4/5/6 factors. Gene expression patterns : GEP\| PubMed ID: 15567710	2004
Strongylocentrotus purpuratus transcription factor GATA-E binds to and represses transcription at an Otx-Goosecoid cis-regulatory element within the aboral ectoderm-specific spec2a enhancer. Developmental biology\| PubMed ID: 15882584	2005
The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus. Science (New York, N.Y.)\| PubMed ID: 17095691	2006
Cis-regulatory control of the nodal gene, initiator of the sea urchin oral ectoderm gene network. Developmental biology\| PubMed ID: 17451671	2007
Exclusive developmental functions of gatae cis-regulatory modules in the Strongylocentrorus purpuratus embryo. Developmental biology\| PubMed ID: 17570356	2007
Effect of supplementary carbon addition in the treatment of low C/N high-technology industrial wastewater by MBR. Bioresource technology\| PubMed ID: 22300636	2011

Pei Yun Lee

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