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Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

Max-Planck-Institute for terrestrial Microbiology

&#x5728;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x4E2D;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x54AF;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B65;&#xFF0C;&#x915E; tRNA &#x8FD8;&#x539F;&#x9176; &#xFF08;GluTR&#xFF0C;&#x7F16;&#x7801;&#x7531;&#x8D6B;) &#x50AC;&#x5316;&#x915E; tRNA &#x7684;&#x8C37;&#x6C28;&#x9178;-1-&#x534A; NADPH &#x4F9D;&#x8D56;&#x7684;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;&#x4F5C;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027; homodimeric GluTR &#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x5DE5;&#x7A0B;&#x83CC; hemA &#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x4F34;&#x4FA3;&#x57FA;&#x56E0; dnaJK &#x548C; grpE&#x3002;Mg(2+) &#x523A;&#x6FC0;&#x7684;&#x50AC;&#x5316;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x5728; Cys 50 &#x4E2D;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x5DEF;&#x57FA;&#x96C6;&#x56E2;&#x653B;&#x51FB; tRNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x8C37;&#x6C28;&#x9178; &alpha;-&#x7FB0;&#x57FA;&#x96C6;&#x56E2;&#x3002;&#x7531;&#x6B64;&#x4EA7;&#x751F;&#x7684;&#x786B;&#x916F;&#x4E2D;&#x95F4;&#x4F53;&#x88AB;&#x56F0;&#x548C;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x7684;&#x653E;&#x5C04;&#x81EA;&#x663E;&#x5F71;&#x3002;&#x5F53;&#x7740; NADPH&#xFF0C;&#x6700;&#x7EC8;&#x4EA7;&#x54C1;&#x3001; &#x8C37;&#x6C28;&#x9178;-1-&#x534A;&#xFF0C;&#x88AB;&#x5F62;&#x6210;&#x3002;&#x5728;&#x7F3A;&#x4E4F; NADPH&#xFF0C;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; GluTR &#x5C55;&#x51FA;&#x57FA;&#x677F;&#x916F;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x4F53;&#x5916;&#x5408;&#x6210;&#x4E2D;&#x672A;&#x88AB;&#x4FEE;&#x6539;&#x7684;&#x915E; tRNA &#x662F;&#x53EF;&#x4EE5;&#x63A5;&#x53D7;&#x7684;&#x57FA;&#x677F;&#x7684;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; GluTR&#x3002;&#x516B; 5-&#x6C28;&#x57FA;&#x916E;&#x620A;&#x9178;&#x8425;&#x517B;&#x7F3A;&#x9677;&#x578B;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x8D6B;&#x9A6C;&#x7A81;&#x53D8;&#x57FA;&#x56E0;&#x88AB;&#x9009;&#x62E9;&#xFF0C;&#x5E76;&#x786E;&#x5B9A;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x3002;&#x6700;&#x7EAF;&#x51C0;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53; GluTR &#x7684;&#x91CD;&#x7EC4;&#x9176;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x53EF;&#x63A2;&#x6D4B;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x4EA4;&#x6D41;&#x7684;&#x7ACB;&#x573A;&#x57FA;&#x4E8E; Methanopyrus kandleri GluTR &#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x5373;&#x5C06;&#x5728;&#x50AC;&#x5316;&#x9886;&#x57DF; (G7D&#x3001; E114K&#x3001; R314C&#x3001; S22L/S164F&#x3001; G44C/S105N/A326T&#x3001; G106N&#x3001; S145F)&#x3002;&#x53EA;&#x6709; GluTR G191D &#xFF08;NADPH &#x7ED1;&#x5B9A;&#x4E2D;&#x53D7;&#x5F71;&#x54CD;&#xFF09; &#x900F;&#x9732;&#x916F;&#x9176;&#xFF0C;&#x4F46;&#x6CA1;&#x6709;&#x8FD8;&#x539F;&#x9176;&#x7684;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;

&#x5927;&#x80A0;&#x57C3;&#x5E0C;&#x6C0F;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x915E; tRNA &#x8FD8;&#x539F;&#x9176;&#x3002;&#x9677;&#x5370;&#x786B;&#x916F;&#x4E2D;&#x95F4;&#x3002;

In the first step of tetrapyrrole biosynthesis in Escherichia coli, glutamyl-tRNA reductase (GluTR, encoded by hemA) catalyzes the NADPH-dependent reduction of glutamyl-tRNA to glutamate-1-semialdehyde. Soluble homodimeric E. coli GluTR was made by co-expressing the hemA gene and the chaperone genes dnaJK and grpE. During Mg(2+)-stimulated catalysis, the reactive sulfhydryl group of Cys-50 in the E. coli enzyme attacks the alpha-carbonyl group of the tRNA-bound glutamate. The resulting thioester intermediate was trapped and detected by autoradiography. In the presence of NADPH, the end product, glutamate-1-semialdehyde, is formed. In the absence of NADPH, E. coli GluTR exhibited substrate esterase activity. The in vitro synthesized unmodified glutamyl-tRNA was an acceptable substrate for E. coli GluTR. Eight 5-aminolevulinic acid auxotrophic E. coli hemA mutants were genetically selected, and the corresponding mutations were determined. Most of the recombinant purified mutant GluTR enzymes lacked detectable activity. Based on the Methanopyrus kandleri GluTR structure, the positions of the amino acid exchanges are close to the catalytic domain (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). Only GluTR G191D (affected in NADPH binding) revealed esterase but no reductase activity.

Escherichia coli glutamyl-tRNA reductase. Trapping the thioester intermediate.

Dans la premi&egrave;re &eacute;tape de la biosynth&egrave;se de t&eacute;trapyrroles chez Escherichia coli, r&eacute;ductase glutamyl-ARNt (GluTR, cod&eacute;e par hemA) catalyse la r&eacute;duction NADPH-d&eacute;pendante de la glutamyl-tRNA de glutamate-1-semiald&eacute;hyde. Soluble flavoprotein GluTR d&#39;e. coli a &eacute;t&eacute; faite par co-expressing du g&egrave;ne de hemA et le chaperon g&egrave;nes dnaJK et grpE. Au cours de la Mg(2+) stimul&eacute;e par catalyse, le groupe r&eacute;actif sulfhydryle de Cys-50 l&#39;enzyme d&#39;e. coli attaque alpha-carbonyle du glutamate ARNt li&eacute;. L&#39;interm&eacute;diaire thioester qui en r&eacute;sulte a &eacute;t&eacute; pris au pi&egrave;ge et d&eacute;tect&eacute; par autoradiographie. En pr&eacute;sence de NADPH, le produit final, le glutamate-1-semiald&eacute;hyde, est form&eacute;. En l&#39;absence de NADPH, e. coli GluTR expose l&#39;activit&eacute; est&eacute;rasique substrat. L&#39;in vitro synth&egrave;se non modifi&eacute; glutamyl-tRNA est un substrat acceptable pour e. coli GluTR. Huit mutants de hemA d&#39;Escherichia coli auxotrophes acide 5-aminol&eacute;vulinique &eacute;taient g&eacute;n&eacute;tiquement s&eacute;lectionn&eacute;es, et les mutations correspondantes ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es. La plupart des enzymes GluTR mutantes purifi&eacute;es recombinantes manquait activit&eacute; d&eacute;tectable. Bas&eacute; sur le Methanopyrus kandleri GluTR structure, les positions des &eacute;changes acides amin&eacute;s sont &agrave; proximit&eacute; du domaine catalytique (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). Seulement GluTR G191D (affect&eacute; dans la liaison de NADPH) a r&eacute;v&eacute;l&eacute; est&eacute;rase, mais aucune activit&eacute; de la r&eacute;ductase.

R&eacute;ductase de glutamyl-tRNA Escherichia coli. Pi&eacute;geage thioester interm&eacute;diaire.

Im ersten Schritt der Tetrapyrrole Biosynthese in Escherichia coli katalysiert Glutamyl-tRNA-Reduktase (GluTR, HemA codiert) die NADPH-abh&auml;ngigen Reduktion der Glutamyl-tRNA zu Glutamat-1-Semialdehyd. L&ouml;sliche Homodimeric E. Coli GluTR wurde durch co-expressing die HemA-gen und die Anstandsdame Gene DnaJK und GrpE. W&auml;hrend Mg(2+)-stimuliert Katalyse greift die reaktive Sulfhydryl-Gruppe der Cys-50 in der E.-Coli-Enzym die Alpha-Carbonyl-Gruppe von der tRNA gebundene Glutamat. Die resultierende Thioester-Mittelstufe war gefangen und durch Autoradiographie erkannt. In Anwesenheit von NADPH, das Endprodukt, die Glutamat-1-Semialdehyd, wird gebildet. Das Fehlen von NADPH stellte E. Coli GluTR Substrat-Esterase-Aktivit&auml;t. Die in-vitro synthetisierten unver&auml;nderten Glutamyl-tRNA war eine akzeptable Substrat f&uuml;r E. Coli GluTR. Acht 5-Aminolevulinic S&auml;ure auxotrophe E. Coli HemA Mutanten gentechnisch ausgew&auml;hlt wurden, und die entsprechenden Mutationen waren entschlossen. Die meisten der rekombinanten gereinigten mutant GluTR Enzyme fehlte Aktivit&auml;t nachweisbar. Auf der Grundlage der Methanopyrus-Kandleri GluTR-Struktur, sind die Positionen der Aminos&auml;ure-B&ouml;rsen in der N&auml;he der katalytischen Dom&auml;ne (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). Nur GluTR G191D (betroffen in NADPH Bindung) offenbarte Esterase keine Reduktase-Aktivit&auml;t.

Escherichia-coli-Glutamyl-tRNA-Reduktase. &Uuml;berf&uuml;llung der Thioester Mittelstufe.

Nel primo passaggio della biosintesi di tetrapyrrole in Escherichia coli, reduttasi glutammil-tRNA (GluTR, codificata da hemA) catalizza la riduzione NADPH-dipendente di glutammil-tRNA al glutammato-1-semialdeide. Solubile ereditaria GluTR di e. coli &egrave; stata fatta da co-expressing del gene di hemA e il chaperone geni dnaJK e grpE. Durante la catalisi Mg(2+)-stimolata, del gruppo reattivi sulfidrilici Cys-50 in e. coli enzima attacca il gruppo carbonilico alfa del glutammato del tRNA-bound. Il risultante tioestere intermedio &egrave; stato intrappolato e individuato da autoradiografia. In presenza di NADPH, il prodotto finale, glutammato-1-semialdeide, &egrave; formata. In assenza di NADPH, e. coli GluTR esposte attivit&agrave; esterasi substrato. La glutammil-tRNA non modificata sintetizzata in vitro era un substrato accettabile per e. coli GluTR. Otto 5-aminolevulinico acido e. coli auxotrofi hemA mutanti sono stati geneticamente selezionati, e le mutazioni corrispondenti sono state determinate. La maggior parte degli enzimi GluTR mutante purificati ricombinante mancava attivit&agrave; rilevabile. Basato sul Methanopyrus kandleri GluTR struttura, le posizioni degli scambi dell&#39;amminoacido sono vicino il dominio catalitico (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). Solo GluTR G191D (colpiti in associazione NADPH) ha rivelato esterasi ma nessuna attivit&agrave; reduttasi.

Reduttasi glutammil-tRNA di Escherichia coli. Intrappolando il tioestere intermedio.

&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30D4; &#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x5408;&#x6210;&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x624B;&#x9806;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x30EC;&#x30C0;&#x30AF;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BC; (GluTR, hemA &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;) &#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x306B;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x9178; 1-&#x30BB;&#x30DF;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C7;&#x30D2;&#x30C9;&#x306E; NADPH &#x4F9D;&#x5B58;&#x6027;&#x4F4E;&#x6E1B;&#x89E6;&#x5A92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x53CA;&#x307C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F; (fig3) &#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR hemA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x30B7;&#x30E3;&#x30DA;&#x30ED;&#x30F3;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; dnaJK &#x3068; grpE co-expressing &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x306A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Mg(2+) &#x523A;&#x6FC0;&#x89E6;&#x5A92;&#x4E2D; Cys 50 &#x306E;&#x53CD;&#x5FDC;&#x6027; sh &#x57FA;&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x306E; tRNA &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9; &#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x9178;&#x306E;&#x30A2;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1; &#x30AB;&#x30EB;&#x30DC;&#x30CB;&#x30EB; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3092;&#x653B;&#x6483;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7D50;&#x679C;&#x306E;&#x30C1;&#x30AA;&#x30A8;&#x30B9;&#x30C6;&#x30EB;&#x4E2D;&#x9593;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x9589;&#x3058;&#x8FBC;&#x3081;&#x3057;&#x3001;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B8;&#x30AA;&#x30B0;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;NADPH &#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x6700;&#x7D42;&#x88FD;&#x54C1;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x9178; 1-&#x9178;&#x30BB;&#x30DF;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C7;&#x30D2;&#x30C9;&#x3001;&#x5F62;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;NADPH &#x306E;&#x4E0D;&#x5728;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR &#x57FA;&#x677F;&#x30A8;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;In vitro &#x5408;&#x6210;&#x672A;&#x5909;&#x66F4;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR &#x306E;&#x8A31;&#x5BB9;&#x306E;&#x57FA;&#x677F;&#x306F;&#x3001;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;8 5-&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30EC;&#x30D6;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x306E;&#x6804;&#x990A;&#x8981;&#x6C42;&#x6027;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; hemA &#x5909;&#x7570;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x306B;&#x9078;&#x3070;&#x308C;&#x305F;&#x3068;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3002;&#x7D44;&#x63DB;&#x3048;&#x306E;&#x6D44;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5909;&#x7570; GluTR &#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D3;&#x30C6;&#x30A3;&#x306B;&#x6B20;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x30E1;&#x30BF;&#x30CE;&#x30D1;&#x30A4;&#x30E9;&#x30B9;&#x5C5E; kandleri GluTR &#x69CB;&#x9020;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x3001;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x4EA4;&#x6D41;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x306F;&#x3001;&#x89E6;&#x5A92;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; (G7D&#x3001;E114K&#x3001;R314C&#x3001;S22L/S164F&#x3001;G44C&#x3001;S105N&#x3001;A326T&#x3001;G106N&#x3001;S145F&#xFF09; &#x306B;&#x8FD1;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x306E;&#x307F; GluTR G191D &#xFF08;NADPH &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x308B;) &#x30A8;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x304C;&#x306A;&#x3044;&#x9084;&#x5143;&#x9175;&#x7D20;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x9084;&#x5143;&#x9175;&#x7D20;&#x3002;&#x30C1;&#x30AA;&#x30A8;&#x30B9;&#x30C6;&#x30EB;&#x4E2D;&#x9593;&#x4F53;&#x3092;&#x30C8;&#x30E9;&#x30C3;&#x30D7;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xB300;&#xC7A5;&#xADE0;&#xC5D0;&#xC11C; tetrapyrrole &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC758; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; glutamyl tRNA reductase (GluTR, hemA &#xC778;&#xCF54;&#xB529;) &#xC870;&#xBBF8;&#xB8CC;-1-semialdehyde&#xC5D0; glutamyl-Trna&#xC758; NADPH &#xC885;&#xC18D; &#xAC10;&#xC18C; catalyzes. &#xC218;&#xC6A9; &#xC131; homodimeric &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; GluTR hemA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xBCF4;&#xD638;&#xC790; &#xC720;&#xC804;&#xC790; dnaJK &#xBC0F; grpE co-expressing&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB9CC;&#xB4E4;&#xC5B4;&#xC84C;&#xB2E4;. &#xCD09;&#xB9E4; mg(2+)&#xC744; &#xC790;&#xADF9; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC5D0; Cys-50&#xC758; &#xC0AC;&#xD6C4; sulfhydryl &#xADF8;&#xB8F9; tRNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xB41C; &#xC870;&#xBBF8;&#xB8CC;&#xC758; &#xC54C;&#xD30C; &#xCE74; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC744; &#xACF5;&#xACA9; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xACB0;&#xACFC; thioester &#xC911;&#xAE09; &#xAC07;&#xD600; &#xC788;&#xC5C8;&#xACE0; autoradiography &#xD558; &#xC5EC; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. NADPH, &#xCD5C;&#xC885; &#xC81C;&#xD488;, &#xC870;&#xBBF8;&#xB8CC;-1-semialdehyde&#xC758; &#xC874;&#xC7AC; &#xD615;&#xC131; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. NADPH &#xBD80;&#xC7AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; GluTR &#xAE30;&#xD310; esterase &#xD65C;&#xB3D9; &#xC804;&#xC2DC;. &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC678;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD569;&#xC131; &#xB41C; &#xC218;&#xC815; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; glutamyl-Trna&#xB294; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; Glutr&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xAE30;&#xD310;. 8 5-Aminolevulinic &#xC0B0; auxotrophic &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; hemA &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC120;&#xD0DD; &#xB41C; &#xBC0F; &#xD574;&#xB2F9; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC7AC;&#xC870;&#xD569; &#xC21C;&#xD654; &#xB41C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; GluTR &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xBD80;&#xC871; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD65C;&#xB3D9;. Methanopyrus kandleri GluTR &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xBC14;&#xD0D5;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xAD50;&#xB958;&#xC758; &#xC704;&#xCE58;&#xB294; &#xCD09;&#xB9E4; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). (NADPH &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744;) GluTR g191d&#xB9CC; &#xBC1D;&#xD600; esterase &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; reductase &#xD65C;&#xB3D9;&#xC774; &#xC5C6;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xBCD1;&#xC6D0; &#xC131; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; glutamyl tRNA reductase&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. Thioester &#xC911;&#xAC04; &#xD2B8;&#xB798;&#xD551;.

En el primer paso de la bios&iacute;ntesis de Tetrapirrol en Escherichia coli, reductasa glutamil-tRNA (GluTR, codificada por hemA) cataliza la reducci&oacute;n de la NADPH-dependiente de glutamil-tRNA al glutamato-1-semialdehyde. Homodim&eacute;ricas solubles GluTR de e. coli fue hecha por co-expressing en el gen de hemA y el acompa&ntilde;ante genes dnaJK y grpE. Durante cat&aacute;lisis Mg(2+)-estimulado, el grupo de reactivos sulfidrilo de Cys-50 en la enzima de e. coli ataca el Grupo Alfa-carbonilo el glutamato tRNA-limite. El intermediario tio&eacute;ster resultante fue atrapado y detectado por autorradiograf&iacute;a. En presencia de NADPH, el producto final, glutamato-1-semialdehyde, est&aacute; formado. En la ausencia de NADPH, e. coli GluTR exhibi&oacute; actividad esterasa de sustrato. El glutamil-tRNA sin modificar sintetizado in vitro fue un substrato aceptable para e. coli GluTR. Ocho mutantes de hemA de Escherichia coli auxotr&oacute;fica &aacute;cido 5-aminolevul&iacute;nico fueron seleccionados gen&eacute;ticamente, y se determinaron las mutaciones correspondientes. La mayor&iacute;a de las enzimas de GluTR mutantes purificadas recombinantes carec&iacute;a de actividad perceptible. Partiendo de la Methanopyrus Methanopyrus GluTR estructura, las posiciones de los intercambios del amino&aacute;cido est&aacute;n cerca el dominio catal&iacute;tico (G7D, E114K, R314C, S22L/S164F, G44C/S105N/A326T, G106N, S145F). S&oacute;lo GluTR G191D (afectado en el enlace de NADPH) revel&oacute; esterasa pero ninguna actividad de la reductasa.

Reductasa de Escherichia coli glutamil-tRNA. Atrapando el tio&eacute;ster intermedio.

Durante el primer paso de la bios&iacute;ntesis de porfirinas en la mayor&iacute;a de las bacterias, Archaea y en cloroplastos glutamil-tRNA reductasa (GluTR) cataliza la reducci&oacute;n de la NADPH-dependiente de glutamil-tRNA al glutamato-1-semialdehyde. Elementos importantes para la utilizaci&oacute;n por Escherichia coli GluTR tRNA(Glu) se determinaron mediante an&aacute;lisis cin&eacute;tico de 51 transcripciones variantes de e. coli Glu-tRNA(Glu). Base U8, el U13 * G22 ** A46 base triple, el terciario Watson-Crick base par 19 * 56 y la falta de residuo 47 son necesarios para el reconocimiento de GluTR. Todas estas bases contribuyen a la formaci&oacute;n del n&uacute;cleo &uacute;nico terciario de e. coli tRNA-(Glu). Dos mol&eacute;culas de tRNA(Glu) falta el anticodon todo lazo del v&aacute;stago/pero conservando la estructura terciaria permaneci&oacute; sustratos para GluTR, mientras que adem&aacute;s disminuir tama&ntilde;o de tRNA hacia un minihelix hab&iacute;a suprimido GluTR actividad. RNA huella experimentos revelaron la interacci&oacute;n f&iacute;sica de GluTR con la base del terciaria de Glu-tRNA(Glu). GluTR de e. coli mostraron selectividad claro contra Glu-tRNA(Gln) mischarged. Llegamos a la conclusi&oacute;n que la estructura de la &uacute;nica base terciaria de e. coli tRNA(Glu) era suficiente para e. coli GluTR distinguir espec&iacute;ficamente su sustrato glutamil-tRNA.

reconocimiento de tRNA por reductasa glutamil-tRNA.

&#x671F;&#x95F4;&#x5728;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7EC6;&#x83CC;&#x3001; &#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#x548C;&#x53F6;&#x7EFF;&#x4F53;&#x915E; tRNA &#x7684;&#x535F;&#x5549;&#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B65;&#x8FD8;&#x539F;&#x9176; (GluTR) &#x50AC;&#x5316;&#x915E; tRNA &#x7684;&#x8C37;&#x6C28;&#x9178;-1-&#x534A; NADPH &#x4F9D;&#x8D56;&#x7684;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#x5229;&#x7528;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; GluTR tRNA(Glu) &#x4E2D;&#x7684;&#x5143;&#x7D20;&#x5B9A;&#x7684;&#x52A8;&#x529B;&#x5B66;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; Glu-tRNA(Glu) 51 &#x53D8;&#x578B;&#x8A8A;&#x672C;&#x3002;&#x57FA;&#x5730; U8&#x3001; U13 * G22 * * A46 &#x57FA;&#x5730;&#x4E09;&#x3001; &#x9AD8;&#x7B49;&#x6559;&#x80B2;&#x7684;&#x6C83;&#x68EE;-&#x514B;&#x91CC;&#x514B;&#x78B1;&#x57FA;&#x5BF9; 19 * 56 &#x548C; 47 &#x6B8B;&#x7559;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x6240;&#x9700;&#x7684; GluTR &#x8BC6;&#x522B;&#x3002;&#x6240;&#x6709;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x5730;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x5F62;&#x6210;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x9AD8;&#x7B49;&#x6559;&#x80B2;&#x6838;&#x5FC3;&#x7684;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; tRNA-(Glu)&#x3002;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x6574;&#x4E2A;&#x53CD;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A; tRNA(Glu) &#x5206;&#x5B50;&#x5E72;/&#x5FAA;&#x73AF;&#x4F46;&#x4FDD;&#x7559;&#x9AD8;&#x7B49;&#x6559;&#x80B2;&#x7684;&#x6838;&#x5FC3;&#x7ED3;&#x6784;&#x4ECD;&#x7136;&#x886C;&#x5E95;&#x4E3A; GluTR&#xFF0C;&#x800C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x964D;&#x4F4E; tRNA &#x5927;&#x5C0F; minihelix &#x671D;&#x5E9F;&#x9664; GluTR &#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;RNA &#x8DB3;&#x8FF9;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x63ED;&#x793A; GluTR &#x4E0E; Glu-tRNA(Glu) &#x7684;&#x4E09;&#x7EA7;&#x6838;&#x5FC3;&#x7269;&#x7406;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; GluTR &#x663E;&#x793A; mischarged Glu-tRNA(Gln) &#x9488;&#x5BF9;&#x660E;&#x786E;&#x7684;&#x9009;&#x62E9;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F97;&#x51FA;&#x7ED3;&#x8BBA;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; tRNA(Glu) &#x7684;&#x552F;&#x4E00;&#x7684;&#x4E09;&#x7EA7;&#x6838;&#x5FC3;&#x7ED3;&#x6784;&#x8DB3;&#x591F;&#x7684;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; GluTR &#x6765;&#x533A;&#x5206;&#x660E;&#x786E;&#x5176;&#x915E; tRNA &#x886C;&#x5E95;&#x3002;

&#x901A;&#x8FC7;&#x8FD8;&#x539F;&#x9176;&#x915E; tRNA tRNA &#x8BC6;&#x522B;&#x3002;

During the first step of porphyrin biosynthesis in Archaea, most bacteria, and in chloroplasts glutamyl-tRNA reductase (GluTR) catalyzes the NADPH-dependent reduction of glutamyl-tRNA to glutamate-1-semialdehyde. Elements in tRNA(Glu) important for utilization by Escherichia coli GluTR were determined by kinetic analysis of 51 variant transcripts of E. coli Glu-tRNA(Glu). Base U8, the U13*G22**A46 base triple, the tertiary Watson-Crick base pair 19*56, and the lack of residue 47 are required for GluTR recognition. All of these bases contribute to the formation of the unique tertiary core of E. coli tRNA-(Glu). Two tRNA(Glu) molecules lacking the entire anticodon stem/loop but retaining the tertiary core structure remained substrates for GluTR, while further decreasing tRNA size toward a minihelix abolished GluTR activity. RNA footprinting experiments revealed the physical interaction of GluTR with the tertiary core of Glu-tRNA(Glu). E. coli GluTR showed clear selectivity against mischarged Glu-tRNA(Gln). We concluded that the unique tertiary core structure of E. coli tRNA(Glu) was sufficient for E. coli GluTR to distinguish specifically its glutamyl-tRNA substrate.

tRNA recognition by glutamyl-tRNA reductase.

Au cours de la premi&egrave;re &eacute;tape de la biosynth&egrave;se de la porphyrine chez les Archaea, la plupart des bact&eacute;ries et dans les chloroplastes glutamyl-tRNA r&eacute;ductase (GluTR) catalyse la r&eacute;duction NADPH-d&eacute;pendante de la glutamyl-tRNA de glutamate-1-semiald&eacute;hyde. &Eacute;l&eacute;ments importants pour l&#39;utilisation par Escherichia coli GluTR tRNA(Glu) ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es par l&#39;analyse cin&eacute;tique de 51 transcriptions variantes d&#39;e. coli Glu-tRNA(Glu). U8, les U13 de base * G22 ** A46 triple base, la paire de base tertiaire Watson-Crick 19 * 56 et l&#39;absence de r&eacute;sidu 47 sont requis pour la reconnaissance de la GluTR. Toutes ces bases contribuent &agrave; la formation du noyau tertiaire unique d&#39;e. coli tRNA-(Glu). Deux mol&eacute;cules de tRNA(Glu) manque l&#39;anticodon ensemble tige/boucle mais conservant la structure de base tertiaire resta substrats GluTR, bien que diminuant plus taille de tRNA vers un minihelix abolit l&#39;activit&eacute; GluTR. RNA d&#39;empreinte des exp&eacute;riences r&eacute;v&egrave;le l&#39;interaction physique de GluTR avec le noyau sup&eacute;rieur de Glu-tRNA(Glu). GluTR d&#39;e. coli a montr&eacute; clairement s&eacute;lectivit&eacute; contre Glu-tRNA(Gln) mischarged. Nous avons conclu que la structure de base tertiaire unique de tRNA(Glu) d&#39;e. coli ne suffisait pas pour e. coli GluTR de distinguer plus pr&eacute;cis&eacute;ment son substrat glutamyl-ARNt.

reconnaissance de tRNA de r&eacute;ductase de la glutamyl-ARNt.

W&auml;hrend der erste Schritt der Porphyrin-Biosynthese in Archaeen, den meisten Bakterien und in Chloroplasten Glutamyl-tRNA katalysiert Reduktase (GluTR) die NADPH-abh&auml;ngigen Reduktion der Glutamyl-tRNA zu Glutamat-1-Semialdehyd. Elemente in tRNA(Glu) wichtig f&uuml;r die Nutzung durch Escherichia coli GluTR wurden durch kinetische Analyse von 51 variant Mitschriften E. Coli Glu-tRNA(Glu) bestimmt. Basis-U8, die U13 * G22 ** A46 base dreifach, die terti&auml;re Watson-Crick-Basenpaar 19 * 56 und das Fehlen des R&uuml;ckstands 47 GluTR Anerkennung erforderlich sind. Alle diese Basen tr&auml;gt zur Entstehung der einzigartigen terti&auml;ren Kern von E. Coli tRNA-(Glu). Zwei tRNA(Glu)-Molek&uuml;len fehlt der gesamte Anticodon Vorbau/Schleife Beibehaltung der terti&auml;ren Kernstruktur blieb aber Substrate f&uuml;r GluTR, w&auml;hrend weitere tRNA Gr&ouml;&szlig;e in Richtung eines Minihelix zu verringern GluTR Aktivit&auml;t abgeschafft. RNA Fu&szlig;abdruck Experimente offenbart die physische Interaktion von GluTR mit dem terti&auml;ren Kern des Glu-tRNA(Glu). E. Coli GluTR zeigte klar Selektivit&auml;t gegen mischarged Glu-tRNA(Gln). Wir festgestellt, dass die einzigartige terti&auml;ren Kernstruktur des E. Coli tRNA(Glu) ausreichend f&uuml;r E. Coli GluTR, speziell seine Glutamyl-tRNA-Substrat zu unterscheiden war.

tRNA-Anerkennung durch Glutamyl-tRNA-Reduktase.

Durante il primo passaggio della biosintesi di porfirina in Archaea, la maggior parte dei batteri e in cloroplasti glutammil-tRNA riduttasi (GluTR) catalizza la riduzione NADPH-dipendente di glutammil-tRNA al glutammato-1-semialdeide. Elementi importanti per l&#39;utilizzo di Escherichia coli GluTR tRNA(Glu) sono stati determinati mediante analisi cinetica di 51 trascrizioni variante di e. coli Glu-tRNA(Glu). U8, l&#39;U13 di base * G22 ** A46 triple base, la coppia di basi di Watson-Crick terziaria 19 * 56 e la mancanza di residui 47 sono necessari per il riconoscimento di GluTR. Tutte queste basi contribuiscono alla formazione del nucleo unico terziaria di e. coli tRNA-(Glu). Due molecole di tRNA(Glu) manca l&#39;anticodone intero gambo/ciclo ma mantenendo la struttura terziaria nucleo rimase substrati per GluTR, mentre diminuire ulteriormente le dimensioni del tRNA verso un minihelix abolita GluTR attivit&agrave;. RNA dell&#39;impronta esperimenti hanno rivelato l&#39;interazione fisica di GluTR con il nucleo di terziario di Glu-tRNA(Glu). GluTR e. coli ha mostrato chiari selettivit&agrave; contro Glu-tRNA(Gln) mischarged. Abbiamo concluso che la struttura unico nucleo terziaria di e. coli tRNA(Glu) era sufficiente per GluTR di e. coli distinguere in particolare suo substrato glutammil-tRNA.

riconoscimento del tRNA da reduttasi glutammil-tRNA.

&#x30DD;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30F3;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x8449;&#x7DD1;&#x4F53;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x4E2D;&#x306B; NADPH &#x4F9D;&#x5B58;&#x6027;&#x4F4E;&#x6E1B;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x9178;&#x30BB;&#x30DF;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C7;&#x30D2;&#x30C9; &#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x9178; 1 &#x3078;&#x306E;&#x9084;&#x5143;&#x9175;&#x7D20; (GluTR) &#x89E6;&#x5A92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x53CA;&#x307C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;TRNA(Glu) &#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x5229;&#x7528;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; Glu-tRNA(Glu) &#x306E; 51 &#x30D0;&#x30EA;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C8;&#x8B04;&#x672C;&#x306E;&#x901F;&#x5EA6;&#x8AD6;&#x7684;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;U8&#x3001;U13 &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9; &#x203B; G22 &#x5E74; A46 &#x57FA;&#x672C;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30EB;&#x3001;&#x4E09;&#x6B21;&#x30EF;&#x30C8;&#x30BD;&#x30F3;-&#x30AF;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x5869;&#x57FA;&#x5BFE; 19 &#x203B; 56 &#x3068;&#x6B8B;&#x6E23; 47 &#x306E;&#x6B20;&#x5982;&#x304C; GluTR &#x8A8D;&#x8B58;&#x306E;&#x5FC5;&#x8981;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x57FA;&#x5730;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x4E00;&#x610F;&#x306E;&#x7B2C;&#x4E09;&#x7D00;&#x30B3;&#x30A2;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; tRNA-(Glu) &#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;2 TRNA(Glu) &#x5206;&#x5B50;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30B3;&#x30C9;&#x30F3;&#x6B20;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5E79;/&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x304C;&#x3055;&#x3089;&#x306B; tRNA &#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x306F; minihelix &#x306B;&#x5411;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x3066;&#x5EC3;&#x6B62; GluTR &#x6D3B;&#x52D5;&#x4E2D;&#x6B8B;&#x3063;&#x305F;&#x7B2C;&#x4E09;&#x7D00;&#x306E;&#x30B3;&#x30A2;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x4FDD;&#x6301;&#x57FA;&#x677F; GluTR &#x306E;&#x3002;RNA &#x30D5;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3067;&#x306F; Glu-tRNA(Glu) &#x306E;&#x7B2C;&#x4E09;&#x7D00;&#x306E;&#x30B3;&#x30A2;&#x3068; GluTR &#x306E;&#x7269;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR mischarged Glu-tRNA(Gln) &#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3066;&#x660E;&#x78BA;&#x306A;&#x9078;&#x629E;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x5927;&#x8178;&#x83CC; tRNA(Glu) &#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x4E09;&#x6B21;&#x30B3;&#x30A2;&#x69CB;&#x9020;&#x304C;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; GluTR &#x306E;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x306A;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x306E;&#x57FA;&#x677F;&#x3092;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5341;&#x5206;&#x306A;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x7D50;&#x8AD6;&#x306B;&#x9054;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30EB; tRNA &#x9084;&#x5143;&#x9175;&#x7D20;&#x306B;&#x3088;&#x308B; tRNA &#x306E;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3002;

&#xD3EC; &#xB974; &#xD53C; &#xB9B0;&#xC758; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131; &#xACE0;&#xC138;&#xADE0;, &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC640; chloroplasts glutamyl Trna&#xC758; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; reductase (GluTR) &#xC870;&#xBBF8;&#xB8CC;-1-semialdehyde&#xC5D0; glutamyl-Trna&#xC758; NADPH &#xC885;&#xC18D; &#xAC10;&#xC18C; catalyzes. TRNA(Glu) &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; GluTR &#xC0AC;&#xC6A9;&#xB960;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; Glu-trna(glu)&#xC758; 51 &#xBCC0;&#xD615; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D;&#xC758; &#xC6B4;&#xB3D9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. U8&#xB294; U13 &#xAE30;&#xBCF8; * G22 * * A46 &#xAE30;&#xBCF8; &#xD2B8;&#xB9AC;&#xD50C;, 3 &#xCC28; &#xC653;&#xC2A8; &#xD06C;&#xB9AD; &#xC790;&#xB8CC; &#xC30D; 19 * 56, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xCC0C; &#xAEBC; &#xAE30; 47 &#xBD80;&#xC871;&#xC740; GluTR &#xC778;&#xC2DD; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xAE30;&#xC9C0;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; Trna-(glu)&#xC758; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; 3 &#xCC28; &#xCF54;&#xC5B4;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;. &#xC804;&#xCCB4; anticodon &#xBD80;&#xC871; &#xB450; tRNA(Glu) &#xBD84;&#xC790; &#xC904;&#xAE30;/&#xB8E8;&#xD504; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB354;&#xC6B1; &#xAC10;&#xC18C; &#xD558;&#xB294; Trna&#xC758; &#xD06C;&#xAE30;&#xB294; minihelix&#xB85C; GluTR &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xD3D0;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; GluTR, &#xAE30;&#xD310; &#xB0A8;&#xC544; 3 &#xCC28; &#xCF54;&#xC5B4; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC720;&#xC9C0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. RNA &#xD504;&#xB9B0;&#xD305; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xACF5;&#xAC1C; Glu-trna(glu)&#xC758; 3 &#xCC28; &#xCF54;&#xC5B4;&#xC640; Glutr&#xC758; &#xBB3C;&#xB9AC;&#xC801; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;. &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; GluTR mischarged Glu-trna(gln)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBA85;&#xD655;&#xD55C; &#xC120;&#xD0DD;&#xB3C4; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; Trna(glu)&#xC758; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; 3 &#xCC28; &#xCF54;&#xC5B4; &#xAD6C;&#xC870;&#xB294; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; GluTR glutamyl tRNA &#xAE30;&#xD310;&#xC758; &#xBA85;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xAD6C;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30;&#xC5D0; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD55C; &#xACB0;&#xB860;&#xC744; &#xB0B4;&#xB838;&#xB2E4;.

tRNA glutamyl tRNA reductase&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC778;&#xC2DD;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Nanoarchaeum equitans &#x5C0F;&#x55DC;&#x70ED;&#x53E4;&#x83CC;&#x5BC4;&#x751F;&#x866B;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x540E;&#xFF0C;&#x5E76;&#x672A;&#x53D1;&#x73B0;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x8C37;&#x6C28;&#x9178;&#x3001; &#x7EC4;&#x6C28;&#x9178;&#x3001; &#x8272;&#x6C28;&#x9178;&#x548C;&#x542F;&#x52A8;&#x5668;&#x86CB;&#x6C28;&#x9178;&#x8F6C;&#x79FB; RNA &#x7269;&#x79CD;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x5C55;&#x5230;&#x641C;&#x7D22;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x5730;&#x5206;&#x6563;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801; tRNA &#x4E24;&#x534A;&#xFF0C;&#x6839;&#x636E;&#x7ED3;&#x6784;&#x9884;&#x6D4B;&#xFF0C;&#x53EF;&#x6784;&#x6210;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684; tRNA &#x5206;&#x5B50;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;N.equitans &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x641C;&#x7D22;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86; 9 &#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801; tRNA &#x4E24;&#x534A; &#xFF1B;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x52A0;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#x5360;&#x7F3A;&#x5C11; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x3002;TRNA &#x5E8F;&#x5217;&#x88AB;&#x62C6;&#x5206;&#x540E;&#x7684;&#x53CD;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x76F8;&#x90BB;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E; 37&#xFF0C;tRNA &#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x6B63;&#x5E38;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3002;&#x7EC8;&#x7AEF;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5B89;&#x7F6E;&#x5728;&#x5E72;&#x9884;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5305;&#x62EC; 12-14-&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684; 5&#39; &#x7AEF;&#x7684;&#x5BCC;&#x542B; GC &#x7684; RNA &#x53CC;&#x5DE5; tRNA &#x4E00;&#x534A;&#x5E76;&#x5F00;&#x59CB; 3&#39; tRNA &#x4E00;&#x534A;&#x3002;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x548C; N.equitans aminoacylation &#x5B9E;&#x9A8C; tRNA &#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x6210;&#x719F;&#x5230;&#x5168;&#x5C3A;&#x5BF8; tRNA &#x548C;&#x627F;&#x5151;&#x4EBA;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7684;&#x9884;&#x6D4B;&#x5728;&#x7845;&#x4E2D;&#x7684; tRNA(His) &#x548C; tRNA(Glu) &#x7684;&#x7269;&#x79CD;&#x3002;&#x7531;&#x4E8E;&#x52A0;&#x5165;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x53EF;&#x80FD;&#x6D89;&#x53CA; tRNA &#x53CD;&#x5F0F;&#x526A;&#x63A5;&#xFF0C;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x65E9;&#x671F; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x6240;&#x9700;&#x3002;

Nanoarchaeum equitans &#x521B;&#x5EFA;&#x529F;&#x80FD; chin &#x5982;&#x4ECE;&#x5355;&#x72EC;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5176; 5&#39;-&#x548C; 3&#39;-&#x4E24;&#x534A;&#x3002;

Analysis of the genome sequence of the small hyperthermophilic archaeal parasite Nanoarchaeum equitans has not revealed genes encoding the glutamate, histidine, tryptophan and initiator methionine transfer RNA species. Here we develop a computational approach to genome analysis that searches for widely separated genes encoding tRNA halves that, on the basis of structural prediction, could form intact tRNA molecules. A search of the N. equitans genome reveals nine genes that encode tRNA halves; together they account for the missing tRNA genes. The tRNA sequences are split after the anticodon-adjacent position 37, the normal location of tRNA introns. The terminal sequences can be accommodated in an intervening sequence that includes a 12-14-nucleotide GC-rich RNA duplex between the end of the 5' tRNA half and the beginning of the 3' tRNA half. Reverse transcriptase polymerase chain reaction and aminoacylation experiments of N. equitans tRNA demonstrated maturation to full-size tRNA and acceptor activity of the tRNA(His) and tRNA(Glu) species predicted in silico. As the joining mechanism possibly involves tRNA trans-splicing, the presence of an intron might have been required for early tRNA synthesis.

Nanoarchaeum equitans creates functional tRNAs from separate genes for their 5'- and 3'-halves.

Analyse de la s&eacute;quence du g&eacute;nome du parasite arch&eacute;es hyperthermophiles petit Nanoarchaeum equitans n&#39;a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que des g&egrave;nes codant le glutamate, histidine, esp&egrave;ces d&#39;ARN de transfert de m&eacute;thionine tryptophane et initiateur. Ici, nous d&eacute;veloppons une approche computationnelle &agrave; l&#39;analyse du g&eacute;nome que cherche tr&egrave;s &eacute;loign&eacute;s des g&egrave;nes codant les moiti&eacute;s d&#39;ARNt qui, sur la base de la structure prediction, pourraient constituer des mol&eacute;cules intactes de tRNA. Une recherche du g&eacute;nome N. equitans r&eacute;v&egrave;le neuf g&egrave;nes qui codent les moiti&eacute;s de l&#39;ARNt ; ensemble, ils repr&eacute;sentent pour les g&egrave;nes d&#39;ARNt manquant. Les s&eacute;quences de l&#39;ARNt sont divis&eacute;es apr&egrave;s la position adjacente anticodon 37, l&#39;emplacement normal des introns de l&#39;ARNt. Les ordres terminaux peuvent &ecirc;tre log&eacute;s dans une s&eacute;quence d&#39;intervention comprenant un duplex de RNA riche en GC 12-14-nucl&eacute;otides entre la fin de la 5&#39; ARNt la moiti&eacute; et le d&eacute;but de la 3&#39; tRNA moiti&eacute;. Reverse transcriptase PCR et exp&eacute;riences d&#39;aminoacylation de N. equitans tRNA d&eacute;montr&eacute; maturation &agrave; pleine grande activit&eacute; ARNt et l&#39;accepteur des esp&egrave;ces tRNA(His) et tRNA(Glu) pr&eacute;vues in silico. Comme le m&eacute;canisme d&#39;adh&eacute;sion implique &eacute;ventuellement ARNt trans-&eacute;pissage, la pr&eacute;sence d&#39;un intron aurait pu &ecirc;tre requise pour la synth&egrave;se de tRNA pr&eacute;coce.

Nanoarchaeum equitans cr&eacute;e des ARNt fonctionnelle de g&egrave;nes distincts pour leurs 5&#39;-3&#39;-moiti&eacute;s et.

Analyse der Genom-Sequenz des kleinen hyperthermophilen Archaea Parasiten Nanoarchaeum Equitans ergab nicht Gene Kodierung der Glutamat, Histidin, Tryptophan und Initiator Methionin-Transfer-RNA-Arten. Hier entwickeln wir einen computational Ansatz zur Genomanalyse, dass sucht weit voneinander Genen tRNA-H&auml;lften, die aufgrund struktureller Vorhersage, intakt tRNA-Molek&uuml;le bilden k&ouml;nnten. Eine Suche des Genoms N. Equitans zeigt neun Gene, die H&auml;lften der tRNA kodieren; zusammen machen sie die fehlenden tRNA-Gene. Die tRNA-Sequenzen werden nach der Anticodon benachbarte Position 37, die normale Lage der tRNA Introns aufgeteilt. Die terminal-Sequenzen k&ouml;nnen in einer eingreifenden Sequenz mit einen 12-14-Nukleotid-GC-reiche RNA-Duplex zwischen dem Ende des 5&#39; untergebracht werden tRNA H&auml;lfte und der Beginn der 3&#39; tRNA H&auml;lfte. Reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion und Aminoacylation Experimente von N. Equitans demonstriert tRNA Reifung zu voller Gr&ouml;&szlig;e tRNA und Akzeptor-Aktivit&auml;t der tRNA(His) und tRNA(Glu) Arten in Silico vorhergesagt. Da der beitretende Mechanismus m&ouml;glicherweise tRNA Trans-Splei&szlig;en beinhaltet, h&auml;tte das Vorhandensein eines Intron f&uuml;r fr&uuml;he tRNA Synthese ben&ouml;tigt.

Nanoarchaeum Equitans erstellt funktionale tRNAs aus separaten Gene f&uuml;r ihre 5&#39;-und 3&#39;-H&auml;lften.

Analisi della sequenza del genoma del parassita archaeal lentamente piccole Nanoarchaeum equitans non ha rivelato i geni che codificano il glutammato, istidina, triptofano e iniziatore specie di RNA di trasferimento di metionina. Qui possiamo sviluppare un approccio computazionale di analisi del genoma che cerca ampiamente separati i geni che codificano tRNA met&agrave;, sulla base di previsione strutturale, potrebbe formare molecole di tRNA intatto. Una ricerca del genoma del N. equitans rivela nove geni che codificano le met&agrave; tRNA; insieme rappresentano i geni tRNA mancante. Le sequenze di tRNA sono divisi dopo l&#39;anticodone adiacente posizione 37, quella normale degli introni tRNA. Le sequenze terminali possono essere accomodate in una sequenza di stacchi che include un duplex di GC-ricco RNA 12-14-nucleotide tra la fine del 5&#39; tRNA met&agrave; e l&#39;inizio del 3&#39; tRNA met&agrave;. Reazione a catena della polimerasi trascrittasi inversa e aminoacylation esperimenti di equitans N. tRNA dimostrata maturazione per attivit&agrave; full-size di tRNA e accettore della specie tRNA(His) e tRNA(Glu) predetto in silico. Come il meccanismo di giunzione comporta forse tRNA trans-splicing, la presenza di un introne potrebbe essere stato richiesta per la sintesi di tRNA presto.

Nanoarchaeum equitans crea tRNA funzionale da geni distinti per la loro met&agrave; 5&#39;-e 3&#39;.

&#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x8D85;&#x597D;&#x71B1;&#x6027;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x7531;&#x6765;&#x5BC4;&#x751F;&#x866B;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x9178;, &#x30D2;&#x30B9;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3;&#x3001;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A1;&#x30F3;&#x3068;&#x30A4;&#x30CB;&#x30B7;&#x30A8;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30AA;&#x30CB;&#x30F3; &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC; RNA &#x7A2E;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3092;&#x691C;&#x7D22;&#x304C;&#x5E83;&#x304F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x69CB;&#x9020;&#x4E88;&#x6E2C;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x307E;&#x307E; tRNA &#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x3001;tRNA &#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3068;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x8A08;&#x7B97;&#x624B;&#x6CD5;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;(&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x691C;&#x7D22;&#x3067;&#x306F; tRNA &#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B; 9 &#x3064;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x884C;&#x65B9;&#x4E0D;&#x660E;&#x306E; tRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x30A2;&#x30AB;&#x30A6;&#x30F3;&#x30C8;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;TRNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; &#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30B3;&#x30C9;&#x30F3;&#x96A3;&#x63A5;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x306E;&#x5F8C; 37&#x3001;tRNA &#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x5834;&#x6240;&#x306B;&#x5206;&#x5272;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30FC;&#x30DF;&#x30CA;&#x30EB; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F; 12-14-&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E; GC &#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A; RNA &#x4E8C;&#x91CD;&#x306E; 5&#39; &#x7AEF;&#x306E;&#x9593;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x4ECB;&#x5728;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3067;&#x53CE;&#x5BB9;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059; tRNA &#x534A;&#x5206;&#x306E; 3&#39; &#x59CB;&#x307E;&#x308A; tRNA &#x534A;&#x5206;&#x3002;&#x9006;&#x8EE2;&#x5199;&#x9175;&#x7D20;&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x9023;&#x9396;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3068;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB;&#x5B9F;&#x9A13; (&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E; tRNA silico &#x4E88;&#x6E2C; tRNA(His) &#x3068; tRNA(Glu) &#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x30D5;&#x30EB;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E; tRNA &#x3068;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30D7;&#x30BF;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306B;&#x6210;&#x719F;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x304A;&#x305D;&#x3089;&#x304F; tRNA &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x63A5;&#x5408;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306F;&#x521D;&#x671F;&#x306E; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3002;

&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684; Trna &#x304B;&#x3089;&#x5225;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E; 5&#39;-&#x3068; 3&#39;-&#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3092;&#x4F5C;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Nanoarchaeum equitans&#xC758; &#xC791;&#xC740; hyperthermophilic archaeal &#xAE30;&#xC0DD;&#xCDA9; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558;&#xC9C0; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC870;&#xBBF8;&#xB8CC;, &#xD788;&#xC2A4;&#xD2F0;&#xB518;, &#xD2B8;&#xB9BD;&#xD1A0;&#xD310; &#xCD08;&#xAE30;&#xC790; &#xBA54;&#xD2F0;&#xC624;&#xB2CC; &#xC804;&#xC1A1; RNA &#xC885; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xB4DC;&#xB7EC;&#xB0AC;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188; &#xBD84;&#xC11D; &#xAC80;&#xC0C9; &#xB110;&#xB9AC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAD6C;&#xC870; &#xC608;&#xCE21;&#xC5D0; &#xADFC;&#xAC70; &#xD558; &#xC5EC; &#xADF8;&#xB300;&#xB85C; tRNA &#xBD84;&#xC790;&#xB97C; &#xD615;&#xC131;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; tRNA &#xBC18;&#xCABD; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xAD6C;&#xBD84; &#xC804;&#xC0B0; &#xC811;&#xADFC; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C;. &#xBA85;. equitans &#xAC8C;&#xB188; &#xAC80;&#xC0C9; tRNA &#xBC18;&#xCABD;; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; 9 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1D;&#xD600; &#xD568;&#xAED8; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xB204;&#xB77D; &#xB41C; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xACC4;&#xC815;. TRNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; anticodon &#xC778;&#xC811; &#xC704;&#xCE58; 37, tRNA introns&#xC758; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC704;&#xCE58; &#xD6C4; &#xBD84;&#xD560; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; 12-14-&#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; GC &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; RNA &#xC774;&#xC911; 5&#39; &#xB05D; &#xC0AC;&#xC774; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC911;&#xAC04; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC218;&#xC6A9; &#xC218; &#xC788;&#xB294; tRNA &#xC808;&#xBC18;&#xC758; 3&#39; &#xC2DC;&#xC791; tRNA &#xC808;&#xBC18;. &#xC5ED;&#xC804;&#xC0AC; &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC5F0;&#xC1C4; &#xBC18;&#xC751; &#xBC0F; &#xBD81; &#xC544; &#xC77C; equitans&#xC758; aminoacylation &#xC2E4;&#xD5D8; tRNA &#xC2DC;&#xC5F0; tRNA(His) tRNA(Glu) &#xC885; silico &#xC608;&#xCE21;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xD06C;&#xAE30; Trna&#xC640; &#xC218;&#xB77D;&#xC790; &#xD65C;&#xB3D9; &#xD558; &#xC644;&#xC131;. &#xC870;&#xC778; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC740; &#xC544;&#xB9C8;&#xB3C4; tRNA &#xD2B8;&#xB79C;&#xC2A4;-&#xC811;&#xD569; &#xD3EC;&#xD568;&#xB294; intron&#xC758; &#xC874;&#xC7AC; &#xCD08;&#xAE30; tRNA &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Nanoarchaeum equitans &#xC790;&#xC2E0;&#xC758; 5&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBCC4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC778; tRNAs &#xB9CC;&#xB4ED;&#xB2C8;&#xB2E4; &#39;-3&#39;-&#xBC18; &#xD558; &#xACE0;.

An&aacute;lisis de la secuencia del genoma del par&aacute;sito peque&ntilde;o hyperthermophilic archaeal Nanoarchaeum equitans no ha revelado los genes que codifican el glutamato, histidina, tript&oacute;fano e iniciador especies de ARN de transferencia de metionina. Aqu&iacute; desarrollamos un enfoque computacional para el an&aacute;lisis del genoma que busca ampliamente separados genes que codifican las mitades del tRNA que, sobre la base de la predicci&oacute;n estructural, podr&iacute;an formar mol&eacute;culas de tRNA intacto. Una b&uacute;squeda del genoma Nanoarchaeum N. revela nueve genes que codifican las mitades del tRNA; juntos representan los genes de tRNA que falta. Las secuencias de tRNA se dividen despu&eacute;s de la posici&oacute;n anticod&oacute;n adyacente 37, la situaci&oacute;n normal de intrones tRNA. Las secuencias terminales pueden ser acomodadas en una secuencia de intervenci&oacute;n que incluye un d&uacute;plex de RNA ricas en GC 12-14-nucle&oacute;tido entre el final de los 5&#39; tRNA mitad y principio de los 3&#39; tRNA la mitad. Reacci&oacute;n en cadena de polimerasa de transcriptasa reversa y experimentos de aminoacilaci&oacute;n de Nanoarchaeum N. tRNA demostr&oacute; maduraci&oacute;n a tama&ntilde;o completo tRNA y aceptador de la actividad de las especies tRNA(His) y tRNA(Glu) previstas in silico. Como el mecanismo de Uni&oacute;n implica posiblemente tRNA trans-empalme, la presencia de un intr&oacute;n pudo haber sido requerida para la s&iacute;ntesis de tRNA temprano.

Nanoarchaeum equitans crea tRNAs funcional de genes separados para sus 5&#39;-y 3&#39;-mitades.

&#x53E4;&#x83CC;&#x5BC4;&#x751F; Nanoarchaeum equitans &#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E00;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x9700;&#x8981;&#x5355;&#x72EC;&#x7684;&#x5927;&#x4F1A;&#x7684; 5&#39; &#x548C; 3&#39; tRNA &#x4E24;&#x534A;&#x7684;&#x4E94;&#x4E2A; tRNA &#x7269;&#x79CD;&#x4EA7;&#x751F; [Randau&#xFF0C;L.&#xFF0C;&#x8292;&#x5947;&#xFF0C;R.&#x3001; &#x8611;&#x3001; &#x65B0;&#x4F5C; Jahn&#xFF0C;D.&#x548C;&#x897F;&#x4E4C;&#x73E0;&#x7A46;&#x6C81;&#xFF0C;D.(2005 &#x5E74;) Nanoarchaeum equitans &#x521B;&#x5EFA;&#x529F;&#x80FD; chin &#x5982;&#x4ECE;&#x5355;&#x72EC;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5176; 5&#39;-&#x548C; 3&#39;-&#x4E24;&#x534A;&#x3002;&#x6027;&#x8D28; 433&#xFF0C;537 541]&#x3002;&#x7F3A;&#x5C11;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6307;&#x5B9A;&#x4E3A; tRNA(Trp) &#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x9884;&#x6D4B;&#x3001; &#x8054;&#x63A5; chin &#x5982;&#x751F;&#x5316;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;-&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x548C;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7ED3;&#x679C;&#x786E;&#x5B9A;&#x6B64; tRNA &#x4F5C;&#x4E3A; tRNA(Lys) (&#x4E5D;&#x9F99;) &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x66FF;&#x4EE3;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x52A0;&#x5165;&#x57FA;&#x5730; 30 &#x548C; 31&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x542B;&#x6709;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684; tRNA(Trp) &#x51AC;&#x5019;&#x9E1F;&#x5728;&#x521D;&#x59CB;&#x7684; Nanoarchaeum equitans &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6CE8;&#x91CA; [E.&#x6C34;&#x57DF;&#x4E2D;&#x5357;&#x5DE5;&#x4E1A;&#x5927;&#x5B66; &#xFF08;2003 &#x5E74;&#xFF09; &#x7684; Nanoarchaeum equitans &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF1A; &#x6DF1;&#x5165;&#x4E86;&#x89E3;&#x65E9;&#x671F;&#x53E4;&#x83CC;&#x6F14;&#x5316;&#x548C;&#x6D3E;&#x751F;&#x7684;&#x5BC4;&#x751F;&#x3002;&#x5904;&#x7406;&#x5668;&#x56FD;&#x6C11;&#x5B66;&#x4F1A;&#x8D28;&#x63A7;&#x7F8E;&#x56FD; 100&#xFF0C;12984 12988]&#x3002;&#x548C;&#x4EE5;&#x524D;&#x672A;&#x77E5;&#x7684;&#x8054;&#x63A5; tRNA(Gln) (UUG)&#xFF0C;Nanoarchaeum equitans &#x5C55;&#x54C1; 44 chin &#x5982;&#x548C;&#x542F;&#x7528;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x8BFB;&#x53D6;&#x6240;&#x6709; 61 &#x611F;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x3002;&#x8FD9;&#x5957; tRNA &#x5206;&#x5B50;&#x6240;&#x7279;&#x6709;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x8FDB;&#x884C;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x3002;

&#x5957;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684; Nanoarchaeum equitans tRNA &#x6811;&#x79CD;&#x3002;

The archaeal parasite Nanoarchaeum equitans was found to generate five tRNA species via a unique process requiring the assembly of seperate 5' and 3' tRNA halves [Randau, L., Munch, R., Hohn, M.J., Jahn, D. and Soll, D. (2005) Nanoarchaeum equitans creates functional tRNAs from separate genes for their 5'- and 3'-halves. Nature 433, 537-541]. Biochemical evidence was missing for one of the computationally-predicted, joined tRNAs designated as tRNA(Trp). Our RT-PCR and sequencing results identify this tRNA as tRNA(Lys) (CUU) joined at the alternative position between bases 30 and 31. We show that the intron-containing tRNA(Trp) was misidentified in the initial Nanoarchaeum equitans genome annotation [E. Waters et al. (2003) The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 12984-12988]. Along with a previously unidentified joined tRNA(Gln) (UUG), Nanoarchaeum equitans exhibits 44 tRNAs and is enabled to read all 61 sense codons. Features unique to this set of tRNA molecules are discussed.

The complete set of tRNA species in Nanoarchaeum equitans.

Le parasite des arch&eacute;obact&eacute;ries Nanoarchaeum equitans a &eacute;t&eacute; trouv&eacute; pour g&eacute;n&eacute;rer des cinq esp&egrave;ces de tRNA gr&acirc;ce &agrave; un proc&eacute;d&eacute; unique qui exige de l&#39;Assembl&eacute;e de s&eacute;parer les moiti&eacute;s de tRNA 5&#39; et 3&#39; [Randau, L., Munch, R., Hohn, M.J., Jahn, D. et Soll, d. (2005) Nanoarchaeum equitans cr&eacute;e des ARNt fonctionnelle de s&eacute;pareront les g&egrave;nes pour leurs 5&#39;-3&#39;-moiti&eacute;s et. Nature 433, 537-541]. Il manquait des indices biochimiques pour l&#39;un des ARNt pr&eacute;dite par le calcul, jointes d&eacute;sign&eacute;s comme tRNA(Trp). Notre RT-PCR et s&eacute;quen&ccedil;age identifier cet ARNt tRNA(Lys) (CUU) s&#39;est joint &agrave; la position alternative entre les bases des 30 et 31. Nous montrons que le tRNA(Trp) contenant de l&#39;intron a &eacute;t&eacute; mal identifi&eacute; dans l&#39;annotation de g&eacute;nome initiale Nanoarchaeum equitans [E. Waters et al., (2003) du g&eacute;nome de Nanoarchaeum equitans : aper&ccedil;us de d&eacute;but de l&#39;&eacute;volution des arch&eacute;obact&eacute;ries et d&eacute;riv&eacute; de parasitisme. Proc Natl. Acad. Sci. USA 100, 12984-12988]. Avec un tRNA(Gln) jointes inconnus (UUG), Nanoarchaeum equitans pi&egrave;ces 44 ARNt et est activ&eacute; pour lire tous les codons sens 61. Les auteurs discutent les caract&eacute;ristiques uniques &agrave; cet ensemble de mol&eacute;cules de l&#39;ARNt.

L&#39;ensemble des esp&egrave;ces de tRNA dans Nanoarchaeum equitans.

Der reitenden Parasiten Nanoarchaeum Equitans wurde festgestellt, dass um f&uuml;nf tRNA-Arten &uuml;ber einen einzigartigen Prozess erfordert die Montage der separate 5&#39; und 3&#39; tRNA-H&auml;lften zu generieren [Randau, L., Munch, R., Hohn, m.j., Jahn, D. und S&ouml;ll, D. (2005) Nanoarchaeum Equitans schafft funktionale tRNAs aus trennen Sie Gene f&uuml;r ihre 5&#39;-und 3&#39;-H&auml;lften. Natur 433, 537-541]. Biochemischen Nachweis fehlte zum einen die tRNAs rechnerisch vorhergesagt, trat als tRNA(Trp) bezeichnet. Unsere RT-PCR und Sequenzierung Ergebnisse identifizieren diese tRNA, die tRNA(Lys) (CUU) trat der alternative Position zwischen 30 und 31 Basen. Wir zeigen, dass die Intron-haltige tRNA(Trp) in der anf&auml;nglichen Nanoarchaeum Equitans Genom Anmerkung f&auml;lschlicherweise wurde [E. Waters Et Al. (2003) das Genom von Nanoarchaeum Equitans: Einblicke in die fr&uuml;he Evolution der reitenden und abgeleiteten Parasitismus. Proc National Amauta Sci USA 100, 12984-12988]. Zusammen mit einem identifizierten verbundene tRNA(Gln) (UUG) Nanoarchaeum Equitans Exponate 44 tRNAs und alle 61 Sinn Codons Lesen aktiviert ist. Merkmale eindeutig zu diesem Satz von tRNA-Molek&uuml;le werden diskutiert.

Der vollst&auml;ndige Satz von tRNA-Arten in Nanoarchaeum Equitans.

Il parassita di archaeal Nanoarchaeum equitans &egrave; stato trovato per generare cinque specie di tRNA tramite un processo unico che richiedono l&#39;assemblaggio di met&agrave; di tRNA 5&#39; e 3&#39; separata [Randau, L., Munch, R., Hohn, M.J., Jahn, D. e Soll, d. (2005) Nanoarchaeum equitans crea funzionale tRNA da separare met&agrave; geni per loro 5&#39; e 3&#39;-. Natura 433, 537-541]. Prove biochimiche mancavano per uno del tRNA informaticamente predetto, riunite designato come tRNA(Trp). La RT-PCR e sequenziamento risultati identificano questo tRNA come basi di tRNA(Lys) (CUU) si un&igrave; alla posizione alternativa tra il 30 e 31. Mostriamo che la tRNA(Trp) dell&#39;introne-contenenti &egrave; stato erroneamente identificato nell&#39;iniziale annotazione Nanoarchaeum equitans genome [E. Waters et al (2003) del genoma di equitans di Nanoarchaeum: intuizioni early evolution archaeal e parassitismo derivata. Proc Natl. Acad Sci USA 100, 12984-12988]. Insieme ad un tRNA(Gln) si &egrave; iscritto a precedentemente non identificato (UUG), Nanoarchaeum equitans esibisce 44 tRNA ed &egrave; in grado di leggere tutti i codoni senso 61. Caratteristiche uniche di questo insieme di molecole di tRNA sono discussi.

Il set completo delle specie di tRNA in Nanoarchaeum equitans.

&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x5BC4;&#x751F;&#x866B;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; seperate 5&#39; &#x3068; 3&#39; tRNA &#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066; 5 tRNA &#x7A2E;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x305F; [Randau&#x3001;l.&#x3001;&#x30E0;&#x30F3;&#x30AF;&#x3001;r.&#x3001;Hohn&#x3001;M.J.&#x3001;&#x30E4;&#x30FC;&#x30F3;&#x3001;D. &#x3068;&#x3088;&#x308A;&#x3001;D. (2005) &#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30EB;&#x30AB;&#x30A8;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x4F5C;&#x6210;&#x304B;&#x3089;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A; Trna &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E; 5&#39;-&#x3068; 3&#39;-&#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x81EA;&#x7136; 433, 537-541]&#x3002;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066; tRNA(Trp) &#x3092;&#x6307;&#x5B9A;&#x8A08;&#x7B97;&#x7684;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3001;&#x5165;&#x793E;&#x306E; Trna &#x306E; 1 &#x3064;&#x884C;&#x65B9;&#x4E0D;&#x660E;&#x306B;&#x306A;&#x3063;&#x305F;&#x3002;30 &#x3068; 31 &#x65E5;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x4EE3;&#x66FF;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x306B;&#x53C2;&#x52A0; tRNA(Lys) (&#x30AF;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;) &#x3092;&#x62E0;&#x70B9;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E; RT-PCR &#x3068;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x914D;&#x5217;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x306E; tRNA &#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x9054;&#x306F;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3080; tRNA(Trp) &#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30EB;&#x30AB;&#x30A8;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30A2;&#x30CE;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306B;&#x8AA4;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059; [E. &#x30A6;&#x30A9;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BA; et al. (2003) &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;: &#x521D;&#x671F;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x3084;&#x6D3E;&#x751F;&#x5BC4;&#x751F;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3002;&#x8AD6;&#x6587;&#x96C6;&#x56FD;&#x7ACB;&#x4FDD;&#x990A;&#x9632;&#x885B;&#x5927;&#x7406;&#x5DE5;&#x7C73;&#x56FD; 100&#x3001;12984 12988]&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x672A;&#x78BA;&#x8A8D;&#x5165;&#x793E; tRNA(Gln) (UUG&#xFF09;&#x3001;&#x3068;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; 44 Trna &#x3092;&#x5C55;&#x793A;&#x3057;&#x3001;61 &#x30CA;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B3;&#x30C9;&#x30F3;&#x3092;&#x8AAD;&#x3080;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x6709;&#x52B9;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E; tRNA &#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; tRNA &#x7A2E;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3002;

Archaeal &#xAE30;&#xC0DD;&#xCDA9; Nanoarchaeum equitans&#xC758; &#xC5B4;&#xC148;&#xBE14;&#xB9AC; &#xBD84;&#xB9AC; 5&#39;&#xACFC; 3&#39; tRNA &#xBC18;&#xCABD;&#xC744; &#xD544;&#xC694;&#xB85C; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xACFC;&#xC815;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; 5 tRNA &#xC885; &#xC0DD;&#xC131;&#xC744; &#xCC3E;&#xC558;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; [Randau, L., &#xBB49;&#xD06C;, R., Hohn, &#xC5E0; &#xC81C;, Jahn, &#xB514;&#xC640; Soll, &#xB514; (2005) Nanoarchaeum equitans &#xB9CC;&#xB4ED;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE30;&#xB2A5; tRNAs &#xBCC4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; 5 &#39;-3&#39;-&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558; &#xACE0;. &#xC790;&#xC5F0; 433, 537-541]&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0DD; &#xD654; &#xD559;&#xC801; &#xC99D;&#xAC70; &#xD558;&#xB098; Trna(trp)&#xB85C; &#xC608;&#xCE21; &#xACC4;&#xC0B0;, &#xC870;&#xC778; &#xB41C; Trnas&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E4;&#xC885; &#xB410;&#xB2E4;. RT-PCR &#xBC0F; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xACB0;&#xACFC; tRNA(Lys) (CUU) &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xB300;&#xCCB4; &#xC704;&#xCE58;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE30;&#xC9C0; 30, 31&#xC774;&#xC774; Trna&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xCD08;&#xAE30; Nanoarchaeum equitans &#xAC8C;&#xB188; &#xC8FC;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; intron &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; tRNA(Trp) &#xC624;&#xC778; &#xD588;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC; [E. &#xC6CC;&#xD130;&#xC2A4; &#xC678;. (2003) Nanoarchaeum equitans&#xC758; &#xAC8C;&#xB188;: &#xCD08;&#xAE30; archaeal &#xC9C4;&#xD654; &#xBC0F; &#xD30C;&#xC0DD;&#xB41C; &#xAE30;&#xC0DD;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;. &#xB300;&#xD68C; &#xD559;&#xC220; &#xBC1C;&#xD45C; &#xB17C;&#xBB38;&#xC9D1; Natl. Acad. &#xACFC;&#xD559; &#xBBF8;&#xAD6D; 100, 12984 12988]. &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC815;&#xCCB4; &#xBD88;&#xBA85;&#xB41C; &#xC870;&#xC778;&#xB41C; tRNA(Gln) (UUG) &#xD568;&#xAED8; Nanoarchaeum equitans 44 Trnas&#xB97C; &#xC804;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xBAA8;&#xB4E0; 61 &#xAC10;&#xAC01; codons &#xC77D;&#xC744; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. TRNA &#xBD84;&#xC790;&#xC758; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Nanoarchaeum equitans&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; Trna&#xC758; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xC138;&#xD2B8;.

El par&aacute;sito de archaeal Nanoarchaeum equitans encontraron a cinco especies de tRNA mediante un proceso &uacute;nico que requiere el montaje de separa las mitades de tRNA 5&#39; y 3&#39; [Randau, L., Munch, Hohn, M.J., R., Jahn, D. y Soll, D. de (2005) de Nanoarchaeum equitans crea tRNAs funcional de separan genes para sus 5&#39;-y 3&#39;-mitades. Naturaleza 433, 537-541]. Faltaba evidencia bioqu&iacute;mica para uno de los tRNAs computacionalmente la prevista, se uni&oacute; a se&ntilde;alado como tRNA(Trp). Nuestra RT-PCR y los resultados de secuenciaci&oacute;n identifican este ARNT como bases de tRNA (Lys) (CUU) se ha unido a la posici&oacute;n alternativa entre 30 y 31. Mostramos que el tRNA(Trp) que contienen intr&oacute;n fue identificado err&oacute;neamente en la anotaci&oacute;n de genoma de Nanoarchaeum equitans inicial [E. aguas et al (2003) el genoma de Nanoarchaeum equitans: penetraciones en la evoluci&oacute;n temprana de archaeal y parasitismo derivado. Proc. nacional Acad. sci. USA 100, 12984-12988]. Junto con un tRNA(Gln) se unieron previamente no identificado (UUG), Nanoarchaeum equitans exhibe 44 tRNAs y est&aacute; habilitado para leer todos los codones de sentido 61. Caracter&iacute;sticas &uacute;nicas de este conjunto de mol&eacute;culas de tRNA se discuten.

El conjunto completo de especies del tRNA en Nanoarchaeum equitans.

&#x5176;&#x4E2D; tRNA &#x53E4;&#x83CC; Nanoarchaeum equitans &#x662F;&#x4ECE;&#x5355;&#x72EC;&#x7684; 5&#39; &#x548C; 3&#39; tRNA &#x534A;&#x548C;&#x56DB;&#x79CD;&#x7EC4;&#x88C5;&#x7684;&#x4E94;&#x79CD;&#x5BC4;&#x751F;&#x866B;&#x7684;&#x4EBA;&#x53E3;&#x4ECE;&#x542B;&#x6709;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684; tRNA &#x524D;&#x4F53;&#x6D3E;&#x751F;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x5FC5;&#x987B; tRNA &#x53D1;&#x80B2;&#x671F;&#x95F4;&#x5220;&#x9664;&#x4E2D;&#x95F4;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x5143;&#x7D20;&#x3002;&#x80C0;&#x87BA;&#x65CB;&#x80C0; (&#x725B;&#x8840;&#x7EA2;&#x86CB;&#x767D;) &#x6BCD;&#x9898;&#x662F;&#x62FC;&#x63A5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7684;&#x8BC6;&#x522B;&#x548C;&#x6240;&#x6709;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x5207;&#x9664;&#x7684;&#x53E4;&#x83CC;&#x6240;&#x8981;&#x6C42;&#x7684;&#x6807;&#x5FD7;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;&#x725B;&#x8840;&#x7EA2;&#x86CB;&#x767D;&#x56FE;&#x6848;&#x662F;&#x53EF;&#x8BC6;&#x522B;&#x52A0;&#x5165;&#x5730;&#x70B9;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x4E94;&#x4E2A;&#x8282;&#x6BB5; tRNA &#x7269;&#x79CD;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x504F;&#x79BB;&#x89C4;&#x8303;&#x642A;&#x5B54;&#x6BCD;&#x9898;&#x4E2D;&#x7684;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6E05;&#x695A;&#x5730;&#x5448;&#x73B0;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x62FC;&#x63A5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7684; N.equitans &#x88C2; tRNA &#x524D;&#x4F53;&#x5305;&#x542B;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x4E94;&#x4E2A;&#x975E;&#x8FDE;&#x7EED;&#x7684;&#x524D;&#x4F53; chin &#x5982;&#xFF0C;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x63A5;&#x5934;&#x5730;&#x70B9;&#x3001; &#x6307;&#x793A;&#x9176;&#x7684;&#x53CC;&#x91CD;&#x89D2;&#x8272;&#xFF0C;&#x6D88;&#x9664;&#x7684; tRNA &#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x548C; tRNA &#x4E24;&#x534A;&#x7684;&#x5904;&#x7406;&#x5C06;&#x8DE8;&#x7ED3;&#x5408;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#x3002;&#x4E0A;&#x4E00;&#x5957;&#x5408;&#x6210;&#x89C4;&#x8303;&#x548C;&#x975E;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x642A;&#x5B54;&#x6784;&#x9020;&#x7684;&#x5288;&#x88C2;&#x6D3B;&#x52A8;&#x8868;&#x660E;&#x62FC;&#x63A5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7684; N.equitans &#x63A5;&#x53D7;&#x66F4;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x886C;&#x5E95;&#x6BD4; homodimeric Archaeoglobus fulgidus &#x9176;&#x3002;A.fulgidus &#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x62FC;&#x63A5;&#x9176; N.equitans &#x62E5;&#x6709;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x4E9A;&#x57FA;&#x3002;N.equitans&#xFF0C;&#x5728;&#x6240;&#x6709;&#x7684; Crenarchaeota&#xFF0C;&#x53D1;&#x73B0;&#x6B64;&#x7F1D;&#x9699;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7684;&#x7C7B;&#x578B;&#xFF0C;&#x548C;&#x5728; Methanopyrus kandleri&#xFF0C;&#x662F;&#x80FD;&#x591F;&#x884C;&#x4E8B;&#x53EF;&#x89C6;&#x70B9;&#x7684; tRNA &#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x4EC5;&#x5B58;&#x5728;&#x4E8E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x751F;&#x7269;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x9176;&#x548C;&#x5E95;&#x7269;&#x7684;&#x8FDB;&#x5316;&#x3002;

&#x62FC;&#x63A5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7684;&#x7F1D;&#x9699; Nanoarchaeum equitans &#x88C2;&#x8054;&#x63A5; tRNA &#x4E24;&#x534A;&#x7684;&#x975E;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x80C0;&#x80C0;-&#x87BA;&#x65CB;&#x56FE;&#x6848;&#x3002;

Among the tRNA population of the archaeal parasite Nanoarchaeum equitans are five species assembled from separate 5' and 3' tRNA halves and four species derived from tRNA precursors containing introns. In both groups an intervening sequence element must be removed during tRNA maturation. A bulge-helix-bulge (BHB) motif is the hallmark structure required by the archaeal splicing endonuclease for recognition and excision of all introns. BHB motifs are recognizable at the joining sites of all five noncontinuous tRNA species, although deviations from the canonical BHB motif are clearly present in at least two of them. Here, we show that the N. equitans splicing endonuclease cleaves tRNA precursors containing normal introns, as well as all five noncontinuous precursor tRNAs, at the predicted splice sites, indicating the enzyme's dual role in the removal of tRNA introns and processing of tRNA halves to be joined in trans. The cleavage activity on a set of synthetic canonical and noncanonical BHB constructs showed that the N. equitans splicing endonuclease accepts a broader range of substrates than the homodimeric Archaeoglobus fulgidus enzyme. In contrast to the A. fulgidus endonuclease, the N. equitans splicing enzyme possesses two different subunits. This heteromeric endonuclease type, found in N. equitans, in all Crenarchaeota, and in Methanopyrus kandleri, is able to act on the noncanonical tRNA introns present only in these organisms, which suggests coevolution of enzyme and substrate.

The heteromeric Nanoarchaeum equitans splicing endonuclease cleaves noncanonical bulge-helix-bulge motifs of joined tRNA halves.

Parmi les ARNt population du parasite archaeal Nanoarchaeum equitans sont cinq esp&egrave;ces assembl&eacute;s &agrave; partir de 5&#39; et 3&#39; tRNA moiti&eacute;s et quatre esp&egrave;ces d&eacute;riv&eacute;es de pr&eacute;curseurs de tRNA contenant des introns. Dans les deux groupes, un &eacute;l&eacute;ment de la s&eacute;quence intervenant doit &ecirc;tre enlev&eacute; durant la maturation de l&#39;ARNt. Un motif de renflement-helix-bulge (BHB) est la structure caract&eacute;ristique requise par l&#39;archaeal &eacute;pissage endonucl&eacute;ase pour la reconnaissance et l&#39;excision des introns tous. Motifs BHB sont reconnaissables sur les sites &agrave; joindre tous les cinq esp&egrave;ces tRNA discontinue, bien que le motif BHB canonique des d&eacute;viations sont clairement pr&eacute;sentes dans au moins deux d&#39;entre eux. Ici, nous montrons que le N. equitans &eacute;pissage endonucl&eacute;ase fend pr&eacute;curseurs de tRNA contenant des introns normales, ainsi que tous les cinq pr&eacute;curseurs discontinue ARNt, sur les sites d&#39;&eacute;pissage pr&eacute;dite, indiquant le r&ocirc;le double de l&#39;enzyme dans l&#39;&eacute;limination des introns de l&#39;ARNt et le traitement des moiti&eacute;s de l&#39;ARNt se joindre en trans. L&#39;activit&eacute; de clivage sur un ensemble de synth&eacute;tique canonique et non canonique BHB construit a montr&eacute; que le N. equitans &eacute;pissage endonucl&eacute;ase accepte un large &eacute;ventail de substrats que l&#39;homodim&egrave;re Archaeoglobus fulgidus enzyme. Contrairement &agrave; l&#39;endonucl&eacute;ase fulgidus a., le N. equitans &eacute;pissage enzyme poss&egrave;de deux sous-unit&eacute;s diff&eacute;rentes. Ce type d&#39;endonucl&eacute;ase h&eacute;t&eacute;rom&eacute;rique, trouv&eacute; dans le N. equitans, dans tous les Crenarchaeota, et dans Methanopyrus kandleri, est capable d&#39;agir sur les introns tRNA non canonique pr&eacute;sents uniquement chez ces organismes, ce qui sugg&egrave;re la co-&eacute;volution de l&#39;enzyme et le substrat.

Le h&eacute;t&eacute;rom&eacute;rique Nanoarchaeum equitans &eacute;pissage endonucl&eacute;ase fend des motifs h&eacute;lice-Ardennes-Ardennes non canonique des moiti&eacute;s de tRNA jointes.

Zwischen tRNA Bev&ouml;lkerung des reitenden Parasiten Nanoarchaeum Equitans f&uuml;nf Arten zusammengesetzt aus separaten 5&#39; und 3&#39;-tRNA-H&auml;lften und vier Arten sind von tRNA-Vorl&auml;ufer, die Introns enth&auml;lt abgeleitet. In beiden Gruppen muss w&auml;hrend der Reifung der tRNA eine eingreifende Sequence-Element entfernt werden. Eine Ausbuchtung-Helix-Ausbuchtung (BHB) Motiv ist die Kennzeichen-Struktur von der reitenden Splei&szlig;en Endonuklease f&uuml;r Anerkennung und Exzision der alle Introns ben&ouml;tigt. BHB-Motive sind erkennbar an den Beitritt aller f&uuml;nf nichtzusammenh&auml;ngende tRNA-Arten, obwohl Abweichungen von der kanonischen BHB-Motiv in mindestens zwei von ihnen eindeutig vorhanden sind. Hier zeigen wir, dass die N. Equitans Splei&szlig;en Endonuklease Splei&szlig;ungen tRNA-Vorl&auml;ufer, normale Introns, sowie alle f&uuml;nf tRNAs nichtzusammenh&auml;ngende Vorl&auml;ufer, die an den Standorten der vorhergesagten Splei&szlig;, angibt, das Enzym Doppelrolle in der Entfernung der tRNA Introns und Verarbeitung der tRNA-H&auml;lften in Trans verkn&uuml;pft werden. Die Schneidefunktion auf eine Reihe von synthetischen kanonischen und Mitgliedattribut BHB Konstrukte zeigten, dass die N. Equitans Splei&szlig;en Endonuklease eine umfassendere Substrate als das Homodimeric Archaeoglobus Fulgidus Enzym akzeptiert. Im Gegensatz zu den A. Fulgidus Endonuklease besitzt die N. Equitans Splei&szlig;en Enzym zwei verschiedene Untereinheiten. Dieser heteromeren Endonuklease Art, im N. Equitans in allen Crenarchaeota, und in Methanopyrus Kandleri, noch auf der Mitgliedattribut tRNA-Introns, die nur in diesen Organismen reagieren was darauf hindeutet, Koevolution von Enzym und Substrat.

Die heteromeren Nanoarchaeum Equitans Splei&szlig;en Endonuklease Splei&szlig;ungen Mitgliedattribut Ausbuchtung-Helix-Ausbuchtung Motive verkn&uuml;pfte tRNA-H&auml;lften.

Tra il tRNA popolazione del parassita archaeal Nanoarchaeum equitans cinque specie assemblati da met&agrave; di tRNA 5&#39; e 3&#39; separate e quattro specie sono derivati da precursori tRNA contenente introni. In entrambi i gruppi un elemento frapposizione di sequenza dovr&agrave; essere rimosse durante la maturazione del tRNA. Un motivo di rigonfiamento-elica-rigonfiamento (BHB) &egrave; la struttura caratteristica necessaria di archaeal splicing endonucleasi per il riconoscimento e l&#39;asportazione di tutti gli introni. BHB motivi sono riconoscibili nei siti di giunzione di tutte le cinque specie tRNA non continuo, anche se le deviazioni dal motivo canonico BHB sono chiaramente presenti in almeno due di loro. Qui, ci mostra che il N. equitans splicing endonucleasi fende precursori tRNA contenente introni normali, come pure tutti i cinque tRNA precursore non continuo, presso i siti di giunzione previsto, indicando il duplice ruolo di enzima nella rimozione degli introni tRNA ed elaborazione delle met&agrave; di tRNA per essere riunite in trans. L&#39;attivit&agrave; di scissione su un set di sintetico canonica e canonica che BHB costruisce ha mostrato che il N. equitans splicing endonucleasi accetta una gamma pi&ugrave; vasta di substrati dell&#39;enzima ereditaria Archaeoglobus fulgidus. In contrasto con le endonucleasi fulgidus a., il N. equitans splicing enzima possiede due subunit&agrave; diverse. Questo tipo di endonucleasi eteromerico, trovato in equitans N., in tutti i Crenarchaeota, e Methanopyrus kandleri, &egrave; in grado di agire sul canonica introni tRNA presenti solo in questi organismi, che suggerisce di coevoluzione di enzima e substrato.

Il equitans di Nanoarchaeum eteromerico splicing endonucleasi fende canonica rigonfiamento-elica-rigonfiamento motivi di Unite met&agrave; del tRNA.

TRNA &#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x4EBA;&#x53E3;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2;&#x5BC4;&#x751F;&#x866B;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30EB;&#x30AB;&#x30A8;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; 5 &#x7A2E;&#x306E;&#x5225;&#x306E; 5&#39; &#x3068; 3&#39; &#x306E; tRNA &#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3068; 4 &#x7A2E;&#x304B;&#x3089;&#x7D44;&#x307F;&#x7ACB;&#x3066;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3080; tRNA &#x524D;&#x99C6;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3067;&#x306F;&#x3001;tRNA &#x6210;&#x719F;&#x904E;&#x7A0B;&#x4ECB;&#x5728;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x8981;&#x7D20;&#x524A;&#x9664;&#x3057;&#x306A;&#x3051;&#x308C;&#x3070;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x30D0;&#x30EB;&#x30B8; &#x30D8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x81A8;&#x3089;&#x307F; (BHB) &#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5; &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3068;&#x5207;&#x9664;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x8A8D;&#x523B;&#x6975;&#x5370;&#x69CB;&#x9020;&#x3067;&#x3059;&#x3002;BHB &#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306F;&#x504F;&#x5DEE;&#x6B63;&#x898F; BHB &#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x304B;&#x3089;&#x660E;&#x78BA;&#x306B;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082; 2 &#x3064;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; 5 &#x5B9F;&#x7DDA;&#x4EE5;&#x5916; tRNA &#x7A2E;&#x306E;&#x53C2;&#x52A0;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x8A8D;&#x8B58;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; (&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x3067;&#x7D50;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; 5 &#x3064;&#x5B9F;&#x7DDA;&#x4EE5;&#x5916;&#x306E;&#x524D;&#x99C6;&#x4F53; Trna &#x4E88;&#x6E2C;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;&#x9175;&#x7D20;&#x306E; tRNA &#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x9664;&#x53BB;&#x306E;&#x4E8C;&#x91CD;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;tRNA &#x306E;&#x534A;&#x5206;&#x3092;&#x51E6;&#x7406;&#x306E; tRNA &#x524D;&#x99C6;&#x3092;&#x5207;&#x65AD;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x958B;&#x88C2;&#x6D3B;&#x6027; BHB &#x69CB;&#x7BC9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x5408;&#x6210;&#x6A19;&#x6E96;&#x3068;&#x30AB;&#x30CE;&#x30CB;&#x30AB;&#x30EB;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; (&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F; (fig3) &#x30A2;&#x30EB;&#x30AB;&#x30A8;&#x30AA;&#x30B0;&#x30ED;&#x30D6;&#x30B9;&#x5C5E; fulgidus &#x9175;&#x7D20;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x5E45;&#x5E83;&#x3044;&#x57FA;&#x677F;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x5165;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;A. fulgidus &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x3068;&#x306F;&#x5BFE;&#x7167;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x9175;&#x7D20; (&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; 2 &#x3064;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x6240;&#x6709;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E; heteromeric &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC; &#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30AF;&#x30EC;&#x30F3;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x3067;&#x306E; (&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x30E1;&#x30BF;&#x30CE;&#x30D1;&#x30A4;&#x30E9;&#x30B9;&#x5C5E;&#x306E; kandleri&#x3001;&#x30AB;&#x30CE;&#x30CB;&#x30AB;&#x30EB;&#x306E; tRNA &#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x307F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x884C;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x306F;&#x9175;&#x7D20;&#x3068;&#x57FA;&#x8CEA;&#x306E;&#x5171;&#x9032;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; heteromeric &#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x5165;&#x793E; tRNA &#x534A;&#x5206;&#x306E;&#x30AB;&#x30CE;&#x30CB;&#x30AB;&#x30EB;&#x81A8;&#x3089;&#x307F;&#x30D8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x81A8;&#x3089;&#x307F;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x88C2;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

TRNA &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; archaeal &#xAE30;&#xC0DD;&#xCDA9; Nanoarchaeum equitans&#xB294; 5 &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC4;&#xB3C4; 5&#39;&#xACFC; 3&#39; tRNA &#xBC18;&#xCABD;&#xACFC; 4 &#xC885;&#xC758; &#xC870;&#xB9BD;&#xC758; &#xC778;&#xAD6C; introns &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; tRNA &#xC720;&#xB3C4;&#xCCB4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C;. &#xB450; &#xADF8;&#xB8F9; &#xBAA8;&#xB450;&#xC5D0;&#xC11C; tRNA &#xC131;&#xC219; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC911;&#xAC04; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC19F;&#xC544;&#xC624;&#xB978; &#xB098;&#xC120; &#xB3CC;&#xCD9C; (BHB) &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C; archaeal endonuclease &#xC778;&#xC2DD; &#xBC0F; &#xBAA8;&#xB4E0; introns &#xC808;&#xB2E8; &#xC811;&#xD569;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xAC01; &#xC778; &#xAD6C;&#xC870;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. BHB &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C; &#xC815;&#xC2DD; BHB &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD3B8;&#xCC28;&#xB294; &#xBA85;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC801;&#xC5B4;&#xB3C4; 2&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xBAA8;&#xB4E0; 5 &#xBE44;&#xC5F0;&#xC18D; tRNA &#xC885;, &#xAC00;&#xC785; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC778;&#xC2DD;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; endonuclease &#xC811;&#xD569; &#xBA85;. equitans &#xD2B8;&#xB79C;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xD3EC;&#xD568; &#xC2DC;&#xD0AC; tRNA &#xC120;&#xAD6C;&#xC790; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; introns &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xC2A4;&#xD50C;&#xB77C;&#xC774;&#xC2A4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xBAA8;&#xB450; 5 &#xAC1C;&#xC758; &#xBE44;&#xC5F0;&#xC18D; &#xC804;&#xC870; tRNAs &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C;, tRNA introns &#xC81C;&#xAC70;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xC774;&#xC911; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294;, tRNA &#xBC18;&#xCABD;&#xC758; &#xCC98;&#xB9AC; &#xACE0;&#xB300;&#xC758; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD569;&#xC131; &#xC815;&#xADDC; &#xBC0F; &#xBE44;&#xC815;&#xADDC; BHB &#xAD6C;&#xC131; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xBD84;&#xC5F4; &#xD65C;&#xB3D9; endonuclease &#xC811;&#xD569; &#xBA85;. equitans homodimeric Archaeoglobus fulgidus &#xD6A8;&#xC18C; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xAE30;&#xD310;&#xC758; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC94;&#xC704;&#xB97C; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. A. fulgidus endonuclease &#xB2EC;&#xB9AC; &#xD6A8;&#xC18C;&#xB97C; &#xC811;&#xD569; &#xD558;&#xB294; &#xBD81; &#xC544; &#xC77C; equitans &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xD558;&#xC704; &#xB2E8;&#xC704;&#xB97C;&#xAC00;&#xC9C0;&#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;. Heteromeric endonuclease &#xC774;&#xC640; &#xBAA8;&#xB4E0; Crenarchaeota&#xC5D0; &#xBD81; &#xC544; &#xC77C; equitans&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; Methanopyrus&#xC5D0;&#xC11C; kandleri, &#xBE44;&#xC815;&#xADDC; tRNA introns&#xC774; &#xC720;&#xAE30;&#xC774; &#xCCB4;&#xC5D0;&#xB9CC;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xD589;&#xB3D9; &#xC218;&#xB294; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC640; &#xAE30;&#xC9C8; coevolution &#xB098;&#xC654;&#xB2E4;.

Heteromeric Nanoarchaeum equitans endonuclease &#xC811;&#xD569; &#xC55E; &#xC870;&#xC778; &#xB41C; tRNA &#xBC18;&#xCABD;&#xC758; &#xBE44;&#xC815;&#xADDC; &#xC19F;&#xC544;&#xC624;&#xB978; &#xB098;&#xC120; &#xC19F;&#xC544;&#xC624;&#xB978; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C;.

Entre el tRNA poblaci&oacute;n del par&aacute;sito archaeal Nanoarchaeum equitans son cinco especies de mitades separadas de tRNA de 5&#39; y 3&#39; y cuatro especies deriva de precursores de tRNA contiene intrones. En ambos grupos un elemento intermedio de secuencia debe eliminarse durante la maduraci&oacute;n del tRNA. Un motivo de bombeo-h&eacute;lice-bulge (BHB) es la estructura de sello exija la archaeal empalme endonucleasa para el reconocimiento y la supresi&oacute;n de los intrones. Motivos BHB son reconocibles en los sitios de uni&oacute;n de todas las especies de tRNA si cinco, aunque las desviaciones de la can&oacute;nica motivo BHB son claramente presentes en al menos dos de ellos. Aqu&iacute;, demostramos que el Nanoarchaeum N. empalme endonucleasa hiende precursores del tRNA contiene intrones normales, as&iacute; como los tRNAs precursor si cinco, en los sitios de empalme prevista, indicando la doble funci&oacute;n de la enzima en la eliminaci&oacute;n de intrones de tRNA y procesamiento de mitades del tRNA que se ensamblar&aacute;n en trans. La actividad de escote en un conjunto de sint&eacute;tico can&oacute;nica y noncanonical que BHB construye mostr&oacute; que el Nanoarchaeum N. empalme endonucleasa acepta una amplia gama de sustratos de la enzima de fulgidus de Archaeoglobus homodim&eacute;ricas. En contraste con la endonucleasa fulgidus a., el Nanoarchaeum N. empalme enzima posee dos subunidades diferentes. Este tipo de endonucleasa heterom&eacute;ricos, encontrado en Nanoarchaeum N., en Crenarchaeota todos, y en Methanopyrus Methanopyrus, es capaz de actuar en los intrones de tRNA noncanonical presentes solamente en estos organismos, que sugiere la coevoluci&oacute;n de la enzima y el substrato.

El heterom&eacute;ricos Nanoarchaeum equitans empalme endonucleasa hiende noncanonical motivos de bombeo-h&eacute;lice-bombeo de se uni&oacute; a mitades del tRNA.

&#x6C28;&#x57FA;&#x9170;-chin &#x5982; (aa-chin &#x5982;) &#x662F;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x3001; &#x91CD;&#x8981;&#x57FA;&#x8D28;&#x548C;&#x4E00;&#x822C;&#x5408;&#x6210;&#x6C28;&#x57FA;&#x9170; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9176; &#xFF08;aaRSs&#xFF09;&#x3002;&#x8F83;&#x65E9;&#x524D;&#x9884;&#x671F;&#x6BCF;&#x4E00;&#x4E2A;&#x751F;&#x7269;&#x5C06;&#x5305;&#x542B;&#x4E00;&#x5957;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684;&#x4E8C;&#x5341; aaRSs&#xFF0C;&#x53E6;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7528;&#x4E8E;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x89C4;&#x8303;&#x7684;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x8BB8;&#x591A;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x751F;&#x5316;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x663E;&#x793A;&#x5230;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x751F;&#x7269;&#x4F53; asparaginyl &#x548C; glutaminyl tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9176;&#x7F3A;&#x4E4F;&#xFF0C;&#x56E0;&#x6B64;&#x65E0;&#x6CD5;&#x9644;&#x52A0;&#x5929;&#x51AC;&#x9170;&#x80FA;&#x548C;&#x8C37;&#x6C28;&#x9170;&#x80FA;&#x76F4;&#x63A5;&#x5230;&#x5176;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684; tRNA &#x4E0A;&#x3002;&#x76F8;&#x53CD;&#xFF0C;&#x8981;&#x6C42; pretranslational &#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x5C06;&#x8F6C;&#x6362; Asp-tRNA(Asn) &#x548C; Glu-tRNA(Gln) &#x5206;&#x522B;&#x4E3A;&#x6B63;&#x786E;&#x5E26;&#x7535;&#x7684; Asn-tRNA(Asn) &#x548C; Gln-tRNA(Gln)&#x3002;&#x5728;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7EC6;&#x83CC;&#x548C;&#x53E4;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5171;&#x540C;&#x9170;&#x80FA; aa tRNA &#x5408;&#x6210;&#x8FD9; transamidation &#x901A;&#x8DEF;&#x3002;&#x610F;&#x5916;&#x4ECE;&#x751F;&#x5316;&#x3001; &#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x5927;&#x91CF;&#x4F9D;&#x9760; tRNA &#x4F9D;&#x8D56; transamidation &#x7684;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x5929;&#x95E8;&#x51AC;&#x9170;&#x80FA;&#x5F62;&#x6210;&#x5404;&#x79CD;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x3002;Pretranslational &#x4FEE;&#x6539;&#x5E76;&#x4E0D;&#x4EC5;&#x9650;&#x4E8E;&#x5929;&#x51AC;&#x9170;&#x80FA;&#x548C;&#x8C37;&#x6C28;&#x9170;&#x80FA;&#xFF0C;&#x4F46;&#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x7684; chin &#x4E00;&#x4E9B;&#x5176;&#x4ED6; aa-&#x5982;&#xFF0C;&#x5982;&#x542F;&#x52A8;&#x5668; tRNA fmet-tRNA(Met)(i) &#x4E2D;&#x4E5F;&#x53EF;&#x4EE5;&#x627E;&#x5230;&#x4E0E;&#x6307;&#x5B9A; selenocysteine &#x7684; Sec-tRNA(Sec)&#xFF0C;21(st) cotranslationally &#x63D2;&#x5165;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x3002;&#x5728;&#x751F;&#x6210;&#x4E2D;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x524D;&#x4F53;&#x535F;&#x5549;&#x5408;&#x6210;&#x8BB8;&#x591A;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x6C28;&#x57FA;&#x4E59;&#x9170;&#x4E19;&#x9178;&#x8FD8;&#x53C2;&#x4E0E;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178; tRNA &#x4F9D;&#x8D56;&#x4FEE;&#x6539;&#x3002;

Pre-translational &#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x6539;&#x6027;&#x6C28;&#x57FA;&#x9170; tRNA &#x7684;&#x5408;&#x6210;&#x3002;

Aminoacyl-tRNAs (aa-tRNAs) are essential substrates for ribosomal translation, and are generally synthesized by aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs). It was expected earlier that every organism would contain a complete set of twenty aaRSs, one for each canonical amino acid. However, analysis of the many known genome sequences and biochemical studies revealed that most organisms lack asparaginyl- and glutaminyl-tRNA synthetases, and thus are unable to attach asparagine and glutamine directly onto their corresponding tRNA. Instead, a pretranslational amino acid modification is required to convert Asp-tRNA(Asn) and Glu-tRNA(Gln) to the correctly charged Asn-tRNA(Asn) and Gln-tRNA(Gln), respectively. This transamidation pathway of amide aa-tRNA synthesis is common in most bacteria and archaea. Unexpected results from biochemical, genetic and genomic studies showed that a large variety of different bacteria rely on tRNA-dependent transamidation for the formation of the amino acid asparagine. Pretranslational modifications are not restricted to asparagine and glutamine but are also found in the biosynthesis of some other aa-tRNAs, such as the initiator tRNA fmet-tRNA(Met)(i) and Sec-tRNA(Sec) specifying selenocysteine, the 21(st) cotranslationally inserted amino acid. tRNA-dependent amino acid modification is also involved in the generation of aminolevulinic acid, the first precursor for porphyrin biosynthesis in many organisms.

Aminoacyl-tRNA synthesis by pre-translational amino acid modification.

Aminoacyl-ARNt (aa-ARNt) est des substrats essentiels pour la traduction ribosomique et est g&eacute;n&eacute;ralement synth&eacute;tis&eacute;s par aminoacyl-tRNA synth&eacute;tases (aaRSs). Auparavant, il &eacute;tait pr&eacute;vu que chaque organisme contiendrait un ensemble complet de vingt aaRSs, un pour chaque acide amin&eacute; canonique. Cependant, analyse des s&eacute;quences g&eacute;nomiques connues et les &eacute;tudes biochimiques ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; que la plupart des organismes n&#39;ont pas asparaginyl - et glutaminyl-tRNA synth&eacute;tases et sont donc impossible de joindre l&#39;asparagine et glutamine directement sur leur ARNt correspondant. Au lieu de cela, une modification de l&#39;&eacute;quilibre des acides amin&eacute;s est n&eacute;cessaire pour convertir des Asp-tRNA(Asn) et des Glu-tRNA(Gln) aux Asn-tRNA(Asn) et Gln-tRNA(Gln), correctement charg&eacute;es respectivement. Cette voie physico-organiques de synth&egrave;se aa-ARNt amide est commune dans la plupart des bact&eacute;ries et des arch&eacute;es. Des r&eacute;sultats inattendus des &eacute;tudes biochimiques, g&eacute;n&eacute;tiques et g&eacute;nomiques qui a montr&eacute; une grande vari&eacute;t&eacute; de bact&eacute;ries diff&eacute;rentes d&eacute;pendent de tRNA d&eacute;pendant physico-organiques pour la formation de l&#39;asparagine de l&#39;acide amin&eacute;. Pr&eacute;-traduction modifications ne se limitent pas &agrave; l&#39;asparagine et de la glutamine, mais sont &eacute;galement pr&eacute;sents dans la biosynth&egrave;se de certains autres aa-ARNt, tels que le fmet-tRNA(Met)(i) d&#39;ARNt initiateur et Sec-tRNA(Sec) sp&eacute;cifiant la s&eacute;l&eacute;nocyst&eacute;ine, le 21(st) cotranslationally ins&eacute;r&eacute; d&#39;acides amin&eacute;s. modification de tRNA d&eacute;pendant d&#39;acides amin&eacute;s participe &eacute;galement &agrave; la g&eacute;n&eacute;ration d&#39;acide aminol&eacute;vulinique, le premier pr&eacute;curseur de la biosynth&egrave;se de la porphyrine dans de nombreux organismes.

Synth&egrave;se d&#39;aminoacyl-tRNA par modification des acides amin&eacute;s pre-translational.

AMINOACYL-tRNAs (aa-tRNAs) sind wesentliche Substrate f&uuml;r ribosomal &Uuml;bersetzung und werden im Allgemeinen von Aminoacyl-tRNA-Synthetases (AaRSs) synthetisiert. Fr&uuml;her wurde erwartet, dass jeder Organismus einen vollst&auml;ndigen Satz von zwanzig AaRSs, eine f&uuml;r jede kanonische Aminos&auml;ure enthalten w&uuml;rde. Analyse der vielen bekannten Genomsequenzen und biochemische Untersuchungen ergab jedoch, dass den meisten Organismen NARS2 und Glutaminyl-tRNA Synthetases fehlt, und somit nicht in der Lage, Asparagin und Glutamin direkt auf ihre entsprechende tRNA anzuf&uuml;gen. Stattdessen ist eine pretranslational Aminos&auml;ure-&Auml;nderung erforderlich, um Asp-tRNA(Asn) und Glu-tRNA(Gln) in der ordnungsgem&auml;&szlig; geladene Asn-tRNA(Asn) und Gln-tRNA(Gln), bzw. zu konvertieren. Diese Option Transamidation Amid aa-tRNA Synthese ist in den meisten Bakterien und Archaeen. Unerwartete Ergebnisse aus genomischer, biochemische und genetische Studien zeigten, dass eine gro&szlig;e Vielzahl von verschiedenen Bakterien setzen auf tRNA-abh&auml;ngige Transamidation f&uuml;r die Bildung der Aminos&auml;ure Asparagin. Pretranslational &Auml;nderungen beschr&auml;nken sich nicht auf Asparagin und Glutamin aber finden sich auch in der Biosynthese von einigen anderen aa-tRNAs, z. B. die Initiator-tRNA-fmet-tRNA(Met)(i) und Sec-tRNA(Sec) Angabe Selenocystein, die 21(st) cotranslationally eingef&uuml;gt Aminos&auml;ure. tRNA-abh&auml;ngige Aminos&auml;ure-&Auml;nderung ist auch in der Generation der Aminolevulinic S&auml;ure, der erste Vorl&auml;ufer f&uuml;r Porphyrin-Biosynthese in vielen Organismen beteiligt.

AMINOACYL-tRNA Synthese und Modifizierung der pre-translational Aminos&auml;ure.

Amminoacil-tRNA (aa-tRNA) &egrave; substrati essenziali per traduzione ribosomiale e generalmente vengono sintetizzati da sintetasi amminoacil-tRNA (aaRSs). All&#39;inizio &egrave; stato previsto che ogni organismo contiene un set completo di venti aaRSs, uno per ogni amminoacido canonica. Tuttavia, analisi di molte sequenze di genoma noto e studi biochimici hanno rivelato che la maggior parte dei organismi sintetasi del tRNA di asparaginyl e di Glutamminil la mancanza e cos&igrave; sono in grado di fissare l&#39;asparagina e glutamina direttamente sul loro tRNA corrispondenti. Invece, una modificazione dell&#39;amminoacido pretranslational &egrave; necessaria per convertire Asp-tRNA(Asn) e Glu-tRNA(Gln) per la corretta carica Asn-tRNA(Asn) e Gln-tRNA(Gln), rispettivamente. Questo pathway transamidation di sintesi aa-tRNA ammide &egrave; comune nella maggior parte dei batteri e archaea. Risultati inaspettati da studi di genomici, biochimici e genetici hanno mostrato che una grande variet&agrave; di diversi batteri si basano su transamidation tRNA-dipendente per la formazione di amminoacidi asparagina. Pretranslational le modifiche non sono limitate a asparagina e glutammina ma si trovano anche nella biosintesi di alcuni altri aa-tRNA, come l&#39;iniziatore tRNA fmet-tRNA(Met)(i) e Sec-tRNA(Sec) specificando la selenocisteina, il 21(st) cotranslationally inserito dell&#39;amminoacido. modifica di aminoacido tRNA-dipendente &egrave; anche coinvolto nella generazione di acido aminolevulinico, il primo precursore per la biosintesi di porfirina in molti organismi.

Sintesi di aminoacidi pre-translational modifica amminoacil-tRNA.

&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB; Trna &#xFF08;aa Trna&#xFF09; &#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x7FFB;&#x8A33;&#x306E;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x306A;&#x57FA;&#x677F;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20; (aaRSs) &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x5408;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x4EE5;&#x524D;&#x3042;&#x3089;&#x3086;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x304C; 20 aaRSs&#x3001;&#x5404;&#x6B63;&#x898F;&#x306E;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x306E; 1 &#x3064;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x542B;&#x307E;&#x306A;&#x3044;&#x3060;&#x308D;&#x3046;&#x3068;&#x4E88;&#x60F3;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x65E2;&#x77E5;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x5869;&#x57FA;&#x914D;&#x5217;&#x3068;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x306F; asparaginyl &#x3068;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30CB;&#x30EB; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x3046;&#x3057;&#x3066;&#x30A2;&#x30B9;&#x30D1;&#x30E9;&#x30AE;&#x30F3;&#x53CA;&#x3073;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B; tRNA &#x306B;&#x76F4;&#x63A5;&#x6DFB;&#x4ED8;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4EE3;&#x308F;&#x308A;&#x306B;&#x3001;Asp-tRNA(Asn) &#x3068; Glu-tRNA(Gln) &#x306F;&#x6B63;&#x3057;&#x304F;&#x5145;&#x96FB;&#x306E; Asn-tRNA(Asn) &#x3068; Gln-tRNA(Gln) &#x306B;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x5909;&#x63DB;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E; transamidation &#x7D4C;&#x8DEF;&#x30A2;&#x30DF;&#x30C9; aa tRNA &#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x7814;&#x7A76;&#x304B;&#x3089;&#x4E88;&#x671F;&#x3057;&#x306A;&#x3044;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A; tRNA &#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x305F; transamidation &#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x30A2;&#x30B9;&#x30D1;&#x30E9;&#x30AE;&#x30F3;&#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x69D8;&#x3005; &#x306A;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC;&#x3002;&#x5909;&#x66F4;&#x30A2;&#x30B9;&#x30D1;&#x30E9;&#x30AE;&#x30F3;&#x53CA;&#x3073;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30DF;&#x30F3;&#x306B;&#x5236;&#x9650;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x304C;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x305D;&#x306E;&#x4ED6; aa Trna&#x3001;&#x30A4;&#x30CB;&#x30B7;&#x30A8;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; tRNA fmet-tRNA(Met)(i) &#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x3082;&#x898B;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x30BB;&#x30EC;&#x30CE;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x6307;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x3001;Sec-tRNA(Sec)&#x3001;21(st) cotranslationally &#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x3092;&#x633F;&#x5165;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;tRNA &#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x305F;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x6539;&#x5909;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30EC;&#x30D6;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30DD;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30F3;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x524D;&#x99C6;&#x4F53;&#x306E;&#x751F;&#x6210;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB; &#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x3002;

Aminoacyl-tRNAs (&#xAE08;&#xC8FC; &#xBAA8;&#xC784;-tRNAs) ribosomal &#xBC88;&#xC5ED;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xAE30;&#xD310; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD569;&#xC131; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xC774;&#xC804; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; 20 aaRSs &#xC815;&#xC2DD; &#xAC01; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xC608;&#xC0C1; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xB9CE;&#xC740; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xD654;&#xD559; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xBD84;&#xC11D; &#xACF5;&#xAC1C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; asparaginyl &#xBC0F; glutaminyl tRNA synthetases &#xBD80;&#xC871; &#xD558; &#xACE0; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xC544;&#xC2A4;&#xD30C;&#xB77C;&#xAE34;&#xACFC; &#xAE00;&#xB8E8;&#xD0C0;&#xBBFC;&#xC758; &#xD574;&#xB2F9; Trna&#xC5D0; &#xC9C1;&#xC811; &#xC5F0;&#xACB0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB300;&#xC2E0;, pretranslational &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xC218;&#xC815; &#xAC01;&#xAC01; &#xC62C;&#xBC14;&#xB974;&#xAC8C; &#xCCAD;&#xAD6C; Asn-trna(asn)&#xC640; Gln-tRNA(Gln), Asp-tRNA(Asn) &#xBC0F; Glu-trna(gln)&#xB97C; &#xBCC0;&#xD658; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC544; &#xBBF8;&#xB4DC; aa-tRNA &#xD569;&#xC131;&#xC758; transamidation &#xD1B5;&#xB85C;&#xC774; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC640; &#xACE0;&#xC138;&#xADE0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0DD;&#xD654;&#xD559;, &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xAC8C;&#xB188; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC608;&#xAE30;&#xCE58; &#xC54A;&#xC740; &#xACB0;&#xACFC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; &#xD070; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xC544;&#xC2A4;&#xD30C;&#xB77C;&#xAE34;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; tRNA &#xC885;&#xC18D; transamidation&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD558;&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. Pretranslational &#xC140;&#xB808;&#xB178;&#xC2DC;&#xC2A4;&#xD14C;&#xC778;&#xC744; &#xC9C0;&#xC815; &#xD558;&#xB294; Sec-trna(sec)&#xB294; 21(st) cotranslationally &#xC0BD;&#xC785; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xBC0F; &#xC218;&#xC815; &#xC81C;&#xD55C; &#xC544;&#xC2A4;&#xD30C;&#xB77C;&#xAE34;&#xACFC; &#xAE00;&#xB8E8;&#xD0C0;&#xBBFC; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB610;&#xD55C; &#xC77C;&#xBD80; &#xB2E4;&#xB978; aa-tRNAs, &#xCD08;&#xAE30;&#xC790; tRNA fmet-tRNA(Met)(i) &#xB4F1;&#xC758; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC3E;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Trna&#xC5D0; &#xC885;&#xC18D;&#xC801;&#xC778; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xC218;&#xC815;&#xB3C4; &#xB9CE;&#xC740; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD3EC; &#xB974; &#xD53C; &#xB9B0;&#xC758; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xC804;&#xC870; aminolevulinic &#xC0B0;&#xC758; &#xC0DD;&#xC131;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;.

Pre-translational &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xAC1C;&#xC870;&#xB098; Aminoacyl-tRNA &#xD569;&#xC131;.

Aminoacil-tRNAs (aa-ARNt) son sustratos esenciales para la traducci&oacute;n ribosomal y generalmente son sintetizados por aminoacil-tRNA sintetasas (aaRSs). Se esperaba antes de que cada organismo contendr&iacute;a un conjunto completo de veinte aaRSs, uno para cada amino&aacute;cido can&oacute;nica. Sin embargo, an&aacute;lisis de las secuencias del genoma conocido muchas y estudios bioqu&iacute;micos revelaron que la mayor&iacute;a de los organismos carece de asparaginyl - y glutaminil-tRNA sintetasas y as&iacute; es incapaces de fijar la asparagina y glutamina directamente su tRNA correspondiente. En cambio, una modificaci&oacute;n de la pretranslational del amino&aacute;cido es necesaria para convertir Asp-tRNA(Asn) y Glu-tRNA(Gln) a la correctamente cargado Asn-tRNA(Asn) y Gln-tRNA(Gln), respectivamente. Esta v&iacute;a de transamidation de s&iacute;ntesis de aa-tRNA amida es com&uacute;n en la mayor&iacute;a de las bacterias y arqueas. Resultados inesperados de los estudios bioqu&iacute;micos, gen&eacute;ticos y gen&oacute;micos que demostraron una gran variedad de diferentes bacterias dependen de tRNA-dependiente transamidation para la formaci&oacute;n del amino&aacute;cido asparragina. Pretranslational modificaciones no est&aacute;n restringidos a la asparragina y la glutamina, pero tambi&eacute;n se encuentran en la bios&iacute;ntesis de algunos otros aa-ARNt, tales como el fmet-tRNA(Met)(i) de ARNt iniciador y Sec-tRNA(Sec) especificando selenociste&iacute;na, el 21(st) cotranslationally insertado del amino&aacute;cido. modificaci&oacute;n de tRNA-dependiente del amino&aacute;cido tambi&eacute;n participa en la generaci&oacute;n de &aacute;cido aminolevul&iacute;nico, el primer precursor de la bios&iacute;ntesis de porfirinas en muchos organismos.

S&iacute;ntesis del aminoacil-tRNA por modificaci&oacute;n de amino&aacute;cidos pre-translational.

&#x666E;&#x904D;&#x6027;&#x7684;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x9178;&#x9176; P (&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x9178;&#x9176; P)&#xFF0C;&#x8F6C;&#x79FB; RNA (tRNA) 5&#39; &#x6210;&#x719F;&#x7684;&#x5FC5;&#x8981;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x5728; Nanoarchaeum equitans archaeon &#x63D0;&#x51FA;&#x4E86;&#x8D28;&#x7591;&#x3002;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x65E2;&#x7EC6;&#x80DE;&#x63D0;&#x53D6;&#x6DB2;&#x4E2D;&#x7684;&#x751F;&#x5316;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x79CD;&#x9176;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C55;&#x793A;&#x5176; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x7684;&#x5B88;&#x6052;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x5141;&#x8BB8;&#x7FA4;&#x9F99;&#x65E0;&#x9996; chin &#x5982;&#xFF0C;&#x5176;&#x5B58;&#x5728;&#x7531; 5&#39; triphosphorylated &#x6210;&#x719F; tRNA &#x7269;&#x79CD;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#x6838;&#x5B9E;&#x7684;&#x5408;&#x6210;&#x3002;TRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x9700;&#x8981;&#x560C;&#x5464;&#xFF0C;chin &#x5982;&#x5728;&#x4F4D;&#x7F6E; 1 &#x80DE;&#x5627;&#x5576;&#x4E0E;&#x663E;&#x793A;&#x5F02;&#x5E38;&#x5EF6;&#x957F; 5&#39; &#x603B;&#x7AD9;&#x4E0E;&#x989D;&#x5916;&#x560C;&#x5464;&#x6B8B;&#x7559;&#x7684;&#x7ED3;&#x8BBA;&#x76F8;&#x543B;&#x5408;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B; chin &#x5982;&#x88AB;&#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x4E3A;&#x5176;&#x540C;&#x6E90;&#x6C28;&#x57FA;&#x9170; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9176;&#x7684;&#x886C;&#x5E95;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x81EA;&#x7136;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5982;&#x4F55;&#x5E94;&#x4ED8;&#x666E;&#x904D;&#x548C;&#x6240;&#x8C13;&#x53E4;&#x4EE3;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x9178;&#x9176; P &#x901A;&#x8FC7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x91CD;&#x6392;&#x5728; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x51B7;&#x51DD;&#x538B;&#x529B;&#x4E0B;&#x7684;&#x635F;&#x5931;&#x3002;

&#x65E0;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x9178;&#x4F53;&#x80B2;&#x751F;&#x6D3B;

The universality of ribonuclease P (RNase P), the ribonucleoprotein essential for transfer RNA (tRNA) 5' maturation, is challenged in the archaeon Nanoarchaeum equitans. Neither extensive computational analysis of the genome nor biochemical tests in cell extracts revealed the existence of this enzyme. Here we show that the conserved placement of its tRNA gene promoters allows the synthesis of leaderless tRNAs, whose presence was verified by the observation of 5' triphosphorylated mature tRNA species. Initiation of tRNA gene transcription requires a purine, which coincides with the finding that tRNAs with a cytosine in position 1 display unusually extended 5' termini with an extra purine residue. These tRNAs were shown to be substrates for their cognate aminoacyl-tRNA synthetases. These findings demonstrate how nature can cope with the loss of the universal and supposedly ancient RNase P through genomic rearrangement at tRNA genes under the pressure of genome condensation.

Life without RNase P.

L&#39;universalit&eacute; de la ribonucl&eacute;ase P (RNase P), la ribonucl&eacute;oprot&eacute;ine essentielle pour la maturation des ARN de transfert (ARNt) 5&#39;, est contest&eacute;e dans l&#39;Arch&eacute;en Nanoarchaeum equitans. Une vaste analyse computationnelle du g&eacute;nome ni des tests biochimiques dans les extraits cellulaires ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; l&#39;existence de cette enzyme. Ici, nous montrons que le placement conserv&eacute; de ses promoteurs de g&egrave;nes d&#39;ARNt permet la synth&egrave;se des ARNt non hi&eacute;rarchis&eacute;, dont la pr&eacute;sence a &eacute;t&eacute; v&eacute;rifi&eacute;e par l&#39;observation de 5&#39; triphosphorylated mature tRNA esp&egrave;ces. Initiation de la transcription de g&egrave;nes d&#39;ARNt n&eacute;cessite une purine, qui co&iuml;ncide avec la conclusion selon laquelle ARNt avec une cytosine en position 1 affichage prolong&eacute; exceptionnellement 5&#39; termini avec un r&eacute;sidu suppl&eacute;mentaire de purine. Ces ARNt s&#39;est av&eacute;r&eacute;s &ecirc;tre des substrats pour leurs apparent&eacute;s aminoacyl-tRNA synth&eacute;tases. Ces r&eacute;sultats d&eacute;montrent comment la nature peut faire face &agrave; la perte de l&#39;universel et soi-disant antique RNase P par r&eacute;arrangement g&eacute;nomique &agrave; des g&egrave;nes d&#39;ARNt sous la pression de condensation du g&eacute;nome.

Vie sans RNase P.

Die Universalit&auml;t der Ribonuklease P (RNase P), das Ribonucleoprotein notwendig f&uuml;r Transfer-RNA (tRNA) 5&#39; Reifung, in dem Archaeon Nanoarchaeum Equitans herausgefordert. Weder umfangreiche computational Analyse des Genoms biochemische Tests in Zelle Extrakten offenbart die Existenz dieses Enzyms. Hier zeigen wir, dass die konservierte Platzierung ihrer tRNA-gen-Promotoren die Synthese von f&uuml;hrungslos tRNAs, erm&ouml;glicht durch die Beobachtung von 5&#39; Triphosphorylated Reife tRNA Arten, deren Anwesenheit bekannt wurde. Einleitung der tRNA-gen-Transkription erfordert ein Purin, die zusammenf&auml;llt mit der Feststellung, die tRNAs mit einem Cytosin in Stellung 1 anzeigen ungew&ouml;hnlich verl&auml;ngert 5&#39; Termini mit einer zus&auml;tzlichen Purin-R&uuml;ckstand. Diese tRNAs wurden gezeigt, um Substrate f&uuml;r ihre Verwandten Aminoacyl-tRNA-Synthetases sein. Diese Ergebnisse zeigen, wie die Natur mit dem Verlust der universellen und angeblich alte RNase P durch genomische Umlagerung in tRNA-Gene unter dem Druck der Genom-Kondensation bew&auml;ltigen kann.

Leben ohne RNase P.

L&#39;universalit&agrave; della P la ribonucleasi (RNasi P), la ribonucleoproteina essenziale per RNA transfer (tRNA) 5&#39; maturazione, viene sfidato in ipertermofilo Nanoarchaeum equitans. Ampia analisi computazionale del genoma n&eacute; test biochimici in estratti cellulari ha rivelato l&#39;esistenza di questo enzima. Qui vi mostriamo che il posizionamento conservato dei suoi promotori del gene tRNA permette la sintesi di tRNA leaderless, la cui presenza &egrave; stata verificata tramite l&#39;osservazione di 5&#39; triphosphorylated specie matura tRNA. Iniziazione della trascrizione del gene tRNA richiede una Purina, che coincide con la constatazione che visualizzano i tRNA con una citosina in posizione 1 insolitamente esteso 5&#39; termini con un residuo di Purina extra. Questi tRNA hanno dimostrato di essere substrati per loro sintetasi cognate amminoacil-tRNA. Questi risultati dimostrano come la natura pu&ograve; far fronte con la perdita della RNasi P presumibilmente antica e universale attraverso riarrangiamento genomico a geni tRNA sotto la pressione di condensazione del genoma.

Vita senza RNasi P.

&#x30EA;&#x30DC;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC; P &#x306E; (RNase P) &#x8EE2;&#x79FB; RNA &#xFF08;tRNA&#xFF09; 5&#39; &#x6210;&#x719F;&#x306E;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x306E;&#x30EA;&#x30DC;&#x666E;&#x904D;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; &#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2;&#x306E;&#x6311;&#x6226;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x89E3;&#x6790;&#x3082;&#x7D30;&#x80DE;&#x62BD;&#x51FA;&#x6DB2;&#x306E;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x691C;&#x67FB;&#x3082;&#x3053;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x305D;&#x306E; tRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x914D;&#x7F6E;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092; 5&#39; triphosphorylated &#x306E;&#x6210;&#x719F; tRNA &#x7A2E;&#x306E;&#x89B3;&#x5BDF;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x691C;&#x8A3C;&#x3057;&#x305F;&#x6307;&#x63EE;&#x8005;&#x306E; Trna &#x5408;&#x6210;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;TRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x901A;&#x5E38; 5&#39; &#x4F59;&#x5206;&#x306A;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x6B8B;&#x6E23;&#x3068;&#x30C6;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CB;&#x62E1;&#x5F35;&#x4F4D;&#x7F6E; 1 &#x30B7;&#x30C8;&#x30B7;&#x30F3;&#x3068; Trna &#x3092;&#x8868;&#x793A;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089; Trna &#x305D;&#x306E;&#x540C;&#x65CF;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x30A2;&#x30B7;&#x30EB; tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x57FA;&#x677F;&#x3092;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306F;&#x3001;&#x666E;&#x904D;&#x7684;&#x306A;&#x304A;&#x305D;&#x3089;&#x304F;&#x53E4;&#x4EE3;&#x306E; RNase P tRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x51DD;&#x7E2E;&#x5727;&#x529B;&#x4E0B;&#x3067;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x8EE2;&#x4F4D;&#x3092;&#x901A;&#x3058;&#x3066;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x3068;&#x81EA;&#x7136;&#x304C;&#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

RNase P. &#x306A;&#x3057;&#x306E;&#x751F;&#x6D3B;

&#xBCF4;&#xD3B8;&#xC131; ribonuclease P (RNase P) &#xC774;&#xB3D9; RNA (tRNA) 5&#39; &#xC644;&#xC131;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD544;&#xC218; ribonucleoprotein archaeon Nanoarchaeum equitans&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB3C4;&#xC804; &#xC774;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC804;&#xC0B0; &#xBD84;&#xC11D; &#xC5C6;&#xC73C;&#xBA70; &#xC140; &#xCD94;&#xCD9C; &#xBB3C;&#xC5D0; &#xC0DD; &#xD654; &#xD655; &#xC801;&#xC778; &#xC2DC;&#xD5D8;&#xC774;&#xC774; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xACF5;&#xAC1C;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130;&#xC758; &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xBC30;&#xCE58; &#xC9C0;&#xD718;&#xAD00; tRNAs, &#xADF8;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB294; 5&#39; triphosphorylated &#xC131;&#xC219; tRNA &#xC885; &#xAD00;&#xCC30;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAC80;&#xC99D; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xD569;&#xC131; &#xC218; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC1C;&#xC2DC; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC804;&#xC0AC;&#xC758; purine &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC7A5; &#xB41C; 5&#39; &#xD14C;&#xB974;&#xBBF8;&#xB2C8; &#xC5D1;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB77C; purine &#xC794;&#xB958;&#xBB3C;&#xACFC; &#xCC3E;&#xB294; &#xC704;&#xCE58; 1&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DC;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; Trnas&#xB97C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294;&#xC640; &#xC77C;&#xCE58; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; tRNAs &#xC790;&#xC2E0;&#xC758; &#xB3D9;&#xC871; aminoacyl tRNA synthetases &#xAE30;&#xD310; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC790;&#xC5F0; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC8C;&#xB188; &#xC751;&#xCD95; &#xC555;&#xB825; &#xC544;&#xB798;&#xC5D0;&#xC11C; genomic &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xBCF4;&#xD3B8;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xC544;&#xB9C8; &#xACE0; &#xB300; RNase P&#xC758; &#xC190;&#xC2E4;&#xC744; &#xB300;&#xCC98;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

RNase &#xD53C; &#xC5C6;&#xB294; &#xC0DD;&#xD65C;

La universalidad de la Ribonucleasa P (Rnasa P), la Ribonucleoprote&iacute;na esencial para ARN de transferencia (tRNA) 5&#39; maduraci&oacute;n, est&aacute; cuestionada en el archaeon Nanoarchaeum equitans. Extenso an&aacute;lisis computacional del genoma ni pruebas bioqu&iacute;micas en extractos celulares revelaron la existencia de esta enzima. Aqu&iacute; mostramos que la colocaci&oacute;n conservada de sus promotores de genes de tRNA permite la s&iacute;ntesis de tRNAs sin gu&iacute;a, cuya presencia fue verificada por la observaci&oacute;n de 5&#39; triphosphorylated maduro tRNA especies. Iniciaci&oacute;n de la transcripci&oacute;n de genes de tRNA requiere una purina, que coincide con el hallazgo que tRNAs con una citosina en la posici&oacute;n 1 muestran inusualmente extendido 5&#39; termini con un residuo adicional de purina. Estos tRNAs mostraron ser sustratos para sus cognado aminoacil-tRNA sintetasas. Estos resultados demuestran c&oacute;mo la naturaleza puede hacer frente a la p&eacute;rdida de la universal y supuestamente antigua Rnasa P a trav&eacute;s de cambio gen&oacute;mico en genes de tRNA bajo la presi&oacute;n de condensaci&oacute;n del genoma.

Vida sin RNasa P.

&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x53F8; Korarchaeota &#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x672A;&#x5F00;&#x57A6;&#x7684;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#xFF0C;&#x7531;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x5C0F;&#x4E9A;&#x57FA; rRNA &#x4EB2;&#x7F18;&#x5173;&#x7CFB;&#xFF0C;&#x53EF;&#x80FD;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x504F;&#x79BB;&#x65E9;&#x671F;&#x4E3B;&#x8981;&#x53E4;&#x83CC;&#x95E8; Crenarchaeota &#x548C; Euryarchaeota&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#x6240;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x7684;&#x540D;&#x79F0;&#xFF0C;&quot;&#x79CD;&#x7C7B; Korarchaeum cryptofilum&#xFF0C;&quot;&#x5C55;&#x54C1;&#x8D85;&#x8584;&#x4E1D;&#x72B6;&#x5F62;&#x6001;&#x4E0E; Korarchaeota &#x7684;&#x6210;&#x5458;&#x7684;&#x521D;&#x6B65;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;&#x8C03;&#x67E5;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x7956;&#x5148;&#x5173;&#x7CFB;&#x4E4B;&#x95F4;&#x6DF1;&#x5206;&#x652F;&#x7684; Korarchaeota &#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x95E8;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7528;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x9E1F;&#x67AA;&#x6CD5;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6765;&#x6784;&#x5EFA;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684;&#x590D;&#x5408; korarchaeal &#x4ECE;&#x6D53;&#x7F29;&#x7EC6;&#x80DE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x3002;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x88AB;&#x7EC4;&#x88C5;&#x6210;&#x5355;&#x4E2A; contig 1.59 Mb &#x7684;&#x957F;&#x5EA6;&#x4E0E; G + C &#x542B;&#x91CF;&#x7684; 49%&#x3002;1,617 &#x9884;&#x6D4B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684; 1,382 &#xFF08;85%&#xFF09; &#x53EF;&#x4EE5;&#x6307;&#x6D3E;&#x7ED9;&#x4E00;&#x5957;&#x8BA2;&#x6B63;&#x7684;&#x53E4;&#x83CC;&#x540C;&#x6E90;&#x96C6;&#x7FA4; (COGs)&#x3002;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x529F;&#x80FD;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x673A;&#x4F53;&#x4F9D;&#x8D56;&#x80BD;&#x53D1;&#x9175;&#x7684;&#x78B3;&#x548C;&#x80FD;&#x6E90;&#x7684;&#x7B80;&#x5355;&#x6A21;&#x5F0F;&#x548C;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x7EFC;&#x5408; de novo &#x560C;&#x5464;&#x3001; CoA &#x548C;&#x51E0;&#x4E2A;&#x5176;&#x4ED6;&#x8F85;&#x52A9;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x57FA;&#x4E8E;&#x4FDD;&#x5B88;&#x7684;&#x5355;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x4E32;&#x8054;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5E8F;&#x5217;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x4E3A;&#x5177;&#x6709;&#x660E;&#x663E;&#x5173;&#x8054;&#x5230; Crenarchaeota &#x6DF1;&#x53E4;&#x6CBF;&#x88AD;&#x7684; korarchaeote&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5185;&#x5BB9;&#x900F;&#x9732;&#x51E0;&#x4E2A;&#x5B88;&#x6052;&#x7684;&#x79FB;&#x52A8;&#x7535;&#x8BDD;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x5982;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3001; DNA &#x590D;&#x5236;&#x548C; tRNA &#x6210;&#x719F;&#xFF0C;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E; Euryarchaeota &#x7684;&#x5BF9;&#x5E94;&#x5355;&#x4F4D;&#x3002;&#x6839;&#x636E;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x53E4;&#x83CC;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7EC4;&#x6210;&#xFF0C;Korarchaeota &#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x4FDD;&#x7559;&#x4E00;&#x7EC4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7279;&#x5F81;&#x8868;&#x793A;&#x7684;&#x7956;&#x4F20;&#x53E4;&#x83CC;&#x5F62;&#x5F0F;&#x3002;

Korarchaeal &#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x63ED;&#x793A;&#x7684;&#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#x6F14;&#x53D8;&#x7684;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;

The candidate division Korarchaeota comprises a group of uncultivated microorganisms that, by their small subunit rRNA phylogeny, may have diverged early from the major archaeal phyla Crenarchaeota and Euryarchaeota. Here, we report the initial characterization of a member of the Korarchaeota with the proposed name, "Candidatus Korarchaeum cryptofilum," which exhibits an ultrathin filamentous morphology. To investigate possible ancestral relationships between deep-branching Korarchaeota and other phyla, we used whole-genome shotgun sequencing to construct a complete composite korarchaeal genome from enriched cells. The genome was assembled into a single contig 1.59 Mb in length with a G + C content of 49%. Of the 1,617 predicted protein-coding genes, 1,382 (85%) could be assigned to a revised set of archaeal Clusters of Orthologous Groups (COGs). The predicted gene functions suggest that the organism relies on a simple mode of peptide fermentation for carbon and energy and lacks the ability to synthesize de novo purines, CoA, and several other cofactors. Phylogenetic analyses based on conserved single genes and concatenated protein sequences positioned the korarchaeote as a deep archaeal lineage with an apparent affinity to the Crenarchaeota. However, the predicted gene content revealed that several conserved cellular systems, such as cell division, DNA replication, and tRNA maturation, resemble the counterparts in the Euryarchaeota. In light of the known composition of archaeal genomes, the Korarchaeota might have retained a set of cellular features that represents the ancestral archaeal form.

A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea.

La division de candidat Korarchaeota comprend un groupe de micro-organismes incultes qui, par leur phylog&eacute;nie des ARNr petite sous-unit&eacute;, peut avoir diverg&eacute; au d&eacute;but de la phylum archaeal majeur Crenarchaeota et Euryarchaeota. Ici, nous rapportons la caract&eacute;risation initiale d&#39;un membre de la Korarchaeota avec la d&eacute;nomination propos&eacute;e, &laquo; Candidatus Korarchaeum cryptofilum &raquo;, qui pr&eacute;sente une morphologie filamenteuse ultramince. Afin d&#39;&eacute;tudier la possibilit&eacute; de relations ancestrales entre profonde ramification Korarchaeota et autres phylums, nous avons utilis&eacute; le s&eacute;quen&ccedil;age du g&eacute;nome entier fusil pour construire un g&eacute;nome complet korarchaeal composite de cellules enrichies. Le g&eacute;nome a &eacute;t&eacute; assembl&eacute; en un seul contig 1.59 Mb en longueur avec un G + C contenu de 49 %. Des 1 617 g&egrave;nes codant pour des prot&eacute;ines pr&eacute;dites, 1 382 (85 %) pourrait &ecirc;tre assign&eacute; &agrave; un ensemble r&eacute;vis&eacute; d&#39;archaeal grappes de groupes orthologues (CMV). Les fonctions des g&egrave;nes pr&eacute;dits sugg&egrave;rent que l&#39;organisme s&#39;appuie sur un mode simple de la fermentation de peptide de carbone et d&#39;&eacute;nergie et qu&#39;il n&#39;a pas la capacit&eacute; de faire la synth&egrave;se de purines de Novo, CoA et plusieurs autres cofacteurs. Les analyses phylog&eacute;n&eacute;tiques basent sur des g&egrave;nes conserv&eacute;s unique et s&eacute;quences prot&eacute;iques concat&eacute;n&eacute;e positionne le korarchaeote comme une lign&eacute;e archaeal profonde avec une affinit&eacute; apparente de le Crenarchaeota. Toutefois, le contenu de g&egrave;nes pr&eacute;dits ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; que plusieurs syst&egrave;mes cellulaires conserv&eacute;es, telles que la division cellulaire, la r&eacute;plication de l&#39;ADN et la maturation de l&#39;ARNt, ressemblent &agrave; des homologues dans le Euryarchaeota. Compte tenu de la composition connue des g&eacute;nomes archaeal, le Korarchaeota pourrait avoir conserv&eacute; un ensemble de fonctions cellulaires qui repr&eacute;sente la forme ancestrale d&#39;archaea.

Un g&eacute;nome de korarchaeal r&eacute;v&egrave;le sur l&#39;&eacute;volution de l&#39;Archaea.

Die Kandidaten-Abteilung Korarchaeota umfasst eine Gruppe von Wildpflanze Mikroorganismen, die durch ihre kleine Untereinheit rRNA Phylogenie, fr&uuml;h von den gro&szlig;en Archaea-St&auml;mme Crenarchaeota und Euryarchaeota abweichen kann. Hier berichten wir &uuml;ber die erste Charakterisierung eines Mitglieds der Korarchaeota mit dem vorgeschlagenen Namen &quot;Candidatus Korarchaeum Cryptofilum,&quot; die eine ultrad&uuml;nne filament&ouml;sen Morphologie ausstellt. Um m&ouml;gliche Vorfahren Beziehungen zwischen tief-Verzweigung Korarchaeota und andere St&auml;mme zu untersuchen, haben wir Sequenzierung des gesamten Genoms Schrotflinte verwendet, um ein vollst&auml;ndige zusammengesetzten Korarchaeal Genom aus angereicherten Zellen zu konstruieren. Das Genom wurde montiert in einer einzigen Contig 1.59 Mb L&auml;nge mit einem G + C Inhalt der 49 %. 1.382 (85 %) Konnte der 1.617 vorhergesagten Protein-kodierenden Gene eine &uuml;berarbeitete Reihe von reitenden Orthologous-Gruppen-Clustern (COGs) zugewiesen werden. Die vorhergesagte Genfunktionen zufolge der Organismus beruht auf einem einfachen Modus der Peptid-G&auml;rung f&uuml;r kohlenstoffarme und und fehlt die F&auml;higkeit, de Novo Purine, CoA und mehrere andere Cofaktoren zu synthetisieren. Phylogenetische Analysen auf der Grundlage von konservierten einzelne Gene und verkettete Proteinsequenzen positioniert die Korarchaeote als eine Tiefe Archaea-Linie mit einer scheinbaren Affinit&auml;t zu der Crenarchaeota. Der vorhergesagte gen Inhalt ergab jedoch, dass mehrere konservierte zellul&auml;re Systeme wie Zellteilung, DNA-Replikation und Reifung der tRNA, die Kollegen in der Euryarchaeota &auml;hneln. Angesichts der bekannten Zusammensetzung der reitenden Genome k&ouml;nnte die Korarchaeota eine Reihe von zellul&auml;ren Funktionen beibehalten haben, die die Vorfahren Archaea Form darstellt.

Ein Korarchaeal-Genom zeigt Einblicke in die Entwicklung der Archaeen.

La divisione candidato Korarchaeota comprende un gruppo di microrganismi incolti che, da loro phylogeny di rRNA piccole subunit&agrave;, potrebbe hanno discostato presto dal phyla principali archaeal Crenarchaeota ed Euryarchaeota. Riportiamo la caratterizzazione iniziale di un membro di Korarchaeota con il nome proposto, &quot;Candidatus Korarchaeum cryptofilum&quot;, che presenta una morfologia filamentosa ultrasottile. Per indagare su possibili relazioni ancestrali tra deep-ramificazione Korarchaeota e altri phyla, abbiamo usato il sequenziamento del genoma intero fucile per costruire un genoma completo korarchaeal composito da cellule arricchite. Il genoma &egrave; stato assemblato in un singolo contig 1,59 Mb in lunghezza con G + C contenuto del 49%. Il predetto geni codificanti proteine 1.617, 1.382 (85%) potrebbe essere assegnato un set riveduto di archaeal Clusters of Orthologous Groups (COGs). Le funzioni del gene predetto suggeriscono che l&#39;organismo si basa su una semplice modalit&agrave; di fermentazione del peptide di carbonio ed energia e manca la capacit&agrave; di sintetizzare de novo purine, CoA e diversi altri cofattori. Analisi filogenetiche basato sui geni unico conservati e sequenze proteiche concatenato posizionato il korarchaeote come un lineage archaeal profondo con un&#39;evidente affinit&agrave; con i Crenarchaeota. Tuttavia, il contenuto del predetto gene ha rivelato che diversi sistemi cellulari conservati, come la divisione cellulare, la replicazione del DNA e maturazione del tRNA, ricordano le controparti in Euryarchaeota. Alla luce della composizione conosciuta di genomes archaeal, i Korarchaeota potrebbe hanno mantenuto un insieme di funzionalit&agrave; cellulare che rappresenta la forma di archaeal ancestrale.

Un genoma korarchaeal rivela insights into the evolution of Archaea.

&#x5019;&#x88DC;&#x8005;&#x90E8;&#x9580;&#x30B3;&#x30EB;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x306E;&#x5C0F;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8; rRNA &#x7CFB;&#x7D71;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x306F;&#x65E9;&#x671F;&#x30AF;&#x30EC;&#x30F3;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x3068;&#x30E6;&#x30EA;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2;&#x9580;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x5C90;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x672A;&#x8015;&#x4F5C;&#x306E;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x63D0;&#x6848;&#x306E;&#x540D;&#x524D;&quot;&#x6975;&#x8584;&#x306E;&#x7CF8;&#x72B6;&#x5F62;&#x614B;&#x3092;&#x5C55;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x30AB;&#x30F3;&#x30AD;&#x30C4;&#x30B0;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0; Korarchaeum cryptofilum&#x3001;&quot;&#x30B3;&#x30EB;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30B3;&#x30EB;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x3068;&#x4ED6;&#x306E;&#x9580;&#x306E;&#x6DF1;&#x3044;&#x5206;&#x5C90;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x5148;&#x7956;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x6FC3;&#x7E2E;&#x7D30;&#x80DE;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x8907;&#x5408; korarchaeal &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x69CB;&#x7BC9;&#x306B;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30B7;&#x30E7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30AC;&#x30F3; &#x30FB; &#x30B7;&#x30FC;&#x30AF;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6CD5;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5358;&#x4E00; contig &#x306B;&#x7D44;&#x307F;&#x7ACB;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x305F; 1.59 Mb G + C &#x3068;&#x9577;&#x3055;&#x3067; 49 &#xFF05; &#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30F3;&#x30C4;&#x3002;1,617 &#x4E88;&#x6E2C;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;1,382 (85%) &#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2; &#x30AA;&#x30FC;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC; (COGs) &#x306E;&#x6539;&#x8A02;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3001;&#x751F;&#x7269;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x767A;&#x9175;&#x70AD;&#x7D20;&#x3068;&#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30FC;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7C21;&#x5358;&#x306A;&#x30E2;&#x30FC;&#x30C9;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066; de novo &#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x3001;CoA &#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x4ED6;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x88DC;&#x56E0;&#x5B50;&#x3092;&#x5408;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5358;&#x4E00;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x9023;&#x7D50;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3001;korarchaeote&#x3001;&#x30AF;&#x30EC;&#x30F3;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x3078;&#x898B;&#x304B;&#x3051;&#x306E;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x3068;&#x6DF1;&#x3044;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x7CFB;&#x7D71;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x4ED8;&#x3051;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x4E88;&#x6E2C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30F3;&#x30C4;&#x3001;&#x30E6;&#x30EA;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x3067;&#x306E;&#x30AB;&#x30A6;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC; &#x30D1;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x4FDD;&#x5B58;&#x7D30;&#x80DE;&#x7CFB;&#x7D30;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3001;DNA &#x8907;&#x88FD;&#x3001;tRNA &#x6210;&#x719F;&#x306A;&#x3069;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x69CB;&#x6210;&#x306B;&#x7167;&#x3089;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30B3;&#x30EB;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BF;&#x9580;&#x5148;&#x7956;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2; &#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x4E00;&#x9023;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x6A5F;&#x80FD;&#x4FDD;&#x6301;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Korarchaeal &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; &#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xD6C4;&#xBCF4; &#xBD80;&#xBB38; Korarchaeota &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC791;&#xC740; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; rRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC218; &#xAC08;&#xB77C; &#xC788;&#xB2E4; &#xC77C;&#xCC0D; &#xC8FC;&#xC694; archaeal phyla Crenarchaeota &#xBC0F; Euryarchaeota&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD558;&#xB294; &#xBBF8; &#xAC1C; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC744; &#xAD6C;&#xC131; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; ultrathin filamentous &#xD615;&#xD0DC;&#xD559;&#xC744; &#xC804;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; &quot;Candidatus Korarchaeum cryptofilum&quot; &#xC81C;&#xC548;&#xB41C; &#xB41C; &#xC774;&#xB984; &#xAC00;&#xC9C4; Korarchaeota&#xC758; &#xAD6C;&#xC131;&#xC6D0;&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xACE0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Korarchaeota &#xBC0F; &#xB2E4;&#xB978; phyla &#xAE4A;&#xC740; &#xBD84;&#xAE30; &#xAC04;&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC870;&#xC0C1; &#xAD00;&#xACC4; &#xC870;&#xC0AC;, &#xB18D;&#xCD95;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xD569;&#xC131; korarchaeal &#xAC8C;&#xB188;&#xC744; &#xAD6C;&#xC131; &#xD558; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC0F7;&#xAC74; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188;&#xC740; &#xB2E8;&#xC77C; contig &#xC870;&#xB9BD; G + C &#xAE38;&#xC774; 1.59 m b 49%&#xC758; &#xCF58;&#xD150;&#xCE20;. 1617 &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCF54;&#xB529; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; 1382 (85%) archaeal &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; Orthologous &#xADF8;&#xB8F9; (&#xD1B1;&#xB2C8;)&#xC758; &#xC218;&#xC815; &#xB41C; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xD560;&#xB2F9; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; &#xD0C4;&#xC18C; &#xBC0F; &#xC5D0;&#xB108;&#xC9C0;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBC1C;&#xD6A8;&#xC758; &#xAC04;&#xB2E8; &#xBAA8;&#xB4DC;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD558; &#xACE0; &#xD569;&#xC131; &#xB4DC; &#xB178; &#xBCF4; purines, Coa&#xC758;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2E4;&#xB978; &#xC5EC;&#xB7EC; cofactors &#xB2A5;&#xB825; &#xC5C6;&#xB2E4;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Phylogenetic &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xACE0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; Crenarchaeota&#xC5D0; &#xBA85;&#xBC31;&#xD55C; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4; &#xAE4A;&#xC740; archaeal &#xD608;&#xD1B5;&#xC73C;&#xB85C;&#xB294; korarchaeote&#xC5D0; &#xC704;&#xCE58;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xCF58;&#xD150;&#xCE20; &#xC138;&#xD3EC; &#xBD84;&#xC5F4;, DNA &#xBCF5;&#xC81C;, tRNA &#xC131;&#xC219; &#xB4F1; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC740; Euryarchaeota&#xC5D0; &#xB300;&#xC751; &#xC720;&#xC0AC; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; archaeal &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAD6C;&#xC131;&#xC5D0; &#xBE44;&#xCD94;&#xC5B4;&#xB294; Korarchaeota &#xC870;&#xC0C1; archaeal &#xD3FC;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC720;&#xC9C0; &#xC218;&#xB3C4; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Korarchaeal &#xAC8C;&#xB188;&#xC740; Archaea&#xC758; &#xC9C4;&#xD654;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900;&#xB2E4;.

La divisi&oacute;n de candidato Korarchaeota comprende un grupo de microorganismos no cultivados que, por su filogenia de rRNA de la subunidad peque&ntilde;a, puede haber divergido temprano de los filos principales archaeal Crenarchaeota y Euryarchaeota. Aqu&iacute;, divulgamos la caracterizaci&oacute;n inicial de un miembro de la Korarchaeota con el nombre propuesto, &quot;Candidatus Korarchaeum cryptofilum,&quot; que exhibe una morfolog&iacute;a filamentosa ultrafina. Para investigar posibles relaciones ancestrales entre profundo-ramificaci&oacute;n Korarchaeota y otro phyla, utilizamos la secuenciaci&oacute;n del genoma completo de escopeta para construir un genoma completo korarchaeal compuesto de c&eacute;lulas enriquecidos. El genoma fue montado en una sola contig 1.59 Mb en longitud con un G + C contenido del 49%. De los 1.617 predijo genes prote&iacute;na-codificaci&oacute;n, 1.382 (85%) podr&iacute;a asignarse a un conjunto revisado de archaeal racimos de Orthologous grupos (CV). Las funciones del gen predicha sugieren que el organismo se basa en un simple modo de fermentaci&oacute;n de p&eacute;ptido de carbono y energ&iacute;a y carece de la capacidad de s&iacute;ntesis de purinas de novo, CoA y varios otros cofactores. An&aacute;lisis filogen&eacute;ticos basan en genes individuales conservados y las secuencias de prote&iacute;nas concatenados coloca el korarchaeote como un linaje de archaeal profundo con una aparente afinidad con el Crenarchaeota. Sin embargo, el contenido del gen prevista revel&oacute; que varios sistemas celulares conservados, como divisi&oacute;n celular, replicaci&oacute;n del DNA y maduraci&oacute;n del tRNA, se asemejan a las contrapartes en el Euryarchaeota. A la luz de la conocida composici&oacute;n de archaeal genomas, el Korarchaeota podr&iacute;a han conservado un conjunto de caracter&iacute;sticas celulares que representa la forma de archaeal ancestral.

Un genoma de korarchaeal revela informaci&oacute;n sobre la evoluci&oacute;n del Archaea.

&#x77ED;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x8F6C;&#x79FB; RNA (tRNA) &#x5206;&#x5B50;&#x662F;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x4FDD;&#x5B88;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x53CD;&#x6620; tRNA &#x5728;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5408;&#x6210;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x9891;&#x7E41;&#x53D1;&#x751F;&#x7684;&#x96F6;&#x788E; chin &#x542B;&#x6709;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x5982;&#x9700;&#x8981;&#x5904;&#x7406;&#x7A97;&#x4F53;&#x8FDE;&#x7EED;&#x5206;&#x5B50;&#x56E0;&#x6B64;&#x662F;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x60CA;&#x8BB6;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684; permuted &#x548C;&#x62C6;&#x5206;&#x7684; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x5DF2;&#x6DFB;&#x52A0;&#x5230;&#x5173;&#x4E8E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x96F6;&#x788E;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6027;&#x8D28;&#x7684;&#x660E;&#x663E;&#x7684;&#x521B;&#x9020;&#x529B;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684;&#x5404;&#x79CD;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x96F6;&#x788E; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6982;&#x8FF0;&#x548C;&#x5BA1;&#x67E5;&#x5047;&#x8BF4;&#xFF0C;&#x96C6;&#x6210;&#x7684;&#x79FB;&#x52A8;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x8981;&#x7D20; &mdash; &mdash; &#x5305;&#x62EC;&#x75C5;&#x6BD2;&#x548C;&#x8D28;&#x7C92; &mdash; &mdash; &#x5EFA;&#x7ACB;&#x8FD9;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x5728;&#x7247;&#x4E2D;&#x3002;

&#x5728;&#x7247;&#x4E2D;&#x7684;&#x8F6C;&#x79FB; RNA &#x57FA;&#x56E0;&#x3002;

The short genes encoding transfer RNA (tRNA) molecules are highly conserved in both sequence and structure, reflecting the central role of tRNA in protein biosynthesis. The frequent occurrence of fragmented intron-containing tRNAs that require processing to form contiguous molecules is therefore surprising. Recent discoveries of permuted and split tRNA genes have added to the apparent creativity of nature regarding the organization of these fragmented genes. Here, we provide an overview of the various types of fragmented tRNA genes and examine the hypothesis that the integration of mobile genetic elements--including viruses and plasmids--established such genes in pieces.

Transfer RNA genes in pieces.

Quelques g&egrave;nes codant des mol&eacute;cules d&#39;ARN de transfert (ARNt) sont tr&egrave;s conserv&eacute;s en s&eacute;quence et en structure, refl&eacute;tant le r&ocirc;le central de l&#39;ARNt dans la biosynth&egrave;se des prot&eacute;ines. L&#39;apparition fr&eacute;quente de fragment&eacute; ARNt contenant de l&#39;intron n&eacute;cessitant une transformation pour former des mol&eacute;cules contigu&euml;s est donc surprenante. Des d&eacute;couvertes r&eacute;centes de permut&eacute; et fractionner les tRNA g&egrave;nes ont ajout&eacute; &agrave; la cr&eacute;ativit&eacute; apparente de la nature en ce qui concerne l&#39;organisation de ces g&egrave;nes fragment&eacute;s. Ici, nous offrons un aper&ccedil;u des diff&eacute;rents types de g&egrave;nes d&#39;ARNt fragment&eacute; et examiner l&#39;hypoth&egrave;se que l&#39;int&eacute;gration d&#39;&eacute;l&eacute;ments g&eacute;n&eacute;tiques mobiles--y compris virus et &agrave; plasmides--cr&eacute;&eacute; ces g&egrave;nes en morceaux.

G&egrave;nes d&#39;ARN de transfert en morceaux.

Die kurze Gene Transfer-RNA (tRNA) Molek&uuml;le sind in Reihenfolge und Struktur, reflektieren die zentrale Rolle der tRNA in Proteinbiosynthese stark konserviert. Das h&auml;ufige Auftreten von fragmentierten Intron-haltigen tRNAs, die erfordern, Verarbeitung, Form zusammenh&auml;ngender Molek&uuml;le ist daher &uuml;berraschend. J&uuml;ngste Entdeckungen der permutierte und mehrere tRNA, die Gene der scheinbare Kreativit&auml;t der Natur hinsichtlich der Organisation dieser fragmentierten Gene hinzugef&uuml;gt haben. Hier bieten wir einen &Uuml;berblick &uuml;ber die verschiedenen Arten von fragmentierten tRNA-Gene und untersuchen die Hypothese, die die Integration von mobilen genetischen Elementen--einschlie&szlig;lich Viren und Plasmide--Sitz solcher Gene in St&uuml;cke.

Transfer-RNA-Gene in St&uuml;cke.

I brevi geni che codificano per molecole di RNA transfer (tRNA) sono altamente conservati in sequenza e struttura, che riflettono il ruolo centrale del tRNA nella biosintesi della proteina. La frequente occorrenza di frammentato tRNA contenente introne che richiedono elaborazione di molecole contigue forma quindi &egrave; sorprendente. Recenti scoperte di permutati e dividere tRNA geni hanno aggiunto alla creativit&agrave; apparente della natura per quanto riguarda l&#39;organizzazione di questi geni frammentati. Qui, forniamo una panoramica dei diversi tipi di geni tRNA frammentati ed esaminare l&#39;ipotesi che l&#39;integrazione di elementi genetici mobili - tra cui virus e plasmidi - stabilito tali geni in pezzi.

RNA di trasferimento di geni in pezzi.

&#x8EE2;&#x79FB; RNA &#xFF08;tRNA&#xFF09; &#x5206;&#x5B50;&#x77ED;&#x3044;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; tRNA &#x306E;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x7684;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3057;&#x305F;&#x69CB;&#x9020;&#x3067;&#x4FDD;&#x5B58;&#x6027;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x51E6;&#x7406;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x9023;&#x7D9A;&#x3057;&#x305F;&#x5206;&#x5B50;&#x306B;&#x305D;&#x308C;&#x3086;&#x3048;&#x306B;&#x9A5A;&#x304D;&#x3067;&#x3059;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3080; Trna &#x306E;&#x591A;&#x767A;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x306E; permuted &#x3057;&#x3001;&#x5206;&#x5272; tRNA &#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x81EA;&#x7136;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306E;&#x660E;&#x767D;&#x306A;&#x5275;&#x9020;&#x6027;&#x3092;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F; tRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x69D8;&#x3005; &#x306A;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306E;&#x6982;&#x8981;&#x3068;&#x4EEE;&#x8AAC;&#x3092;&#x691C;&#x67FB;&#x306F;&#x30E2;&#x30D0;&#x30A4;&#x30EB;&#x907A;&#x4F1D;&#x8981;&#x7D20;--&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x30DF;&#x30C9;--&#x8A2D;&#x7ACB;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4F5C;&#x54C1;&#x3002;

&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC; RNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x65AD;&#x7247;&#x3067;&#x3002;

&#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC804;&#xC1A1; RNA (tRNA) &#xBD84;&#xC790; &#xC9E7;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC640; &#xAD6C;&#xC870;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; Trna&#xC758; &#xC911;&#xC2EC; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xBC18;&#xC601;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xC874; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC591;&#xC2DD; &#xC5F0;&#xC18D; &#xBD84;&#xC790; &#xCC98;&#xB9AC;&#xAC00; &#xB180;&#xB77C;&#xC6B4; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xD544;&#xC694;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; &#xC870;&#xAC01;&#xB09C;&#xB41C; intron &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; tRNAs &#xC790;&#xC8FC; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC;&#xC758; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC758; &#xBC30;&#xCE58; &#xBC0F; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xAC00; &#xC870;&#xAC01;&#xB09C;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xAD00;&#xD55C; &#xC790;&#xC5F0;&#xC758; &#xBA85;&#xBC31;&#xD55C; &#xCC3D;&#xC758;&#xB825;&#xC5D0; &#xCD94;&#xAC00;&#xD55C; &#xBD84;&#xD560;. &#xC870;&#xAC01;&#xB09C;&#xB41C; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xAC1C;&#xC694;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;, &#xAC00;&#xC124;&#xC744; &#xAC80;&#xD1A0; &#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xB294; &#xB4F1; &#xBAA8;&#xBC14;&#xC77C; &#xC720;&#xC804;&#xC801; &#xC694;&#xC18C;-&#xD1B5;&#xD569; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC640; &#xD50C;&#xB77C;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xB4DC;-&#xC870;&#xAC01; &#xAC19;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC124;&#xB9BD;.

&#xC804;&#xC1A1; RNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xAC01;&#xC5D0;.

Los pocos genes que codifican mol&eacute;culas de ARN de transferencia (tRNA) est&aacute;n muy conservados en secuencia y estructura, lo que refleja el papel central del tRNA en bios&iacute;ntesis de la prote&iacute;na. La ocurrencia frecuente de tRNAs que contienen intr&oacute;n fragmentada que requieren tratamiento para formar mol&eacute;culas contiguas, por tanto, es sorprendente. Recientes descubrimientos de permutada y dividir tRNA genes han a&ntilde;adido a la creatividad aparente de la naturaleza con respecto a la organizaci&oacute;n de estos genes fragmentados. Presentamos un Resumen de los distintos tipos de genes de tRNA fragmentada y examinar la hip&oacute;tesis de que la integraci&oacute;n de elementos gen&eacute;ticos m&oacute;viles--incluyendo virus y pl&aacute;smidos--establecido dichos genes en pedazos.

ARN de transferencia de genes en pedazos.

Tutti canonica RNA di trasferimento (tRNA) hanno un uridina in posizione 8, coinvolti nel mantenimento della struttura terziaria di tRNA. Tuttavia, lentamente ipertermofilo Methanopyrus kandleri porti 30 (su 34) tRNA geni con citidina alla posizione 8. Qui, noi dimostrare C-U editing in questa posizione nel nucleo di terziario di tRNA e presentano la struttura cristallina di una deaminasi della citidina specifici tRNA, CDAT8, che ha il dominio di citidina deaminasi collegato a un dominio THUMP tRNA-associazione. CDAT8 &egrave; specifico per deaminazione C alla posizione 8, richiede solo il tornante stelo accettore per attivit&agrave; e appartiene a una famiglia unica all&#39;interno della superfamiglia &quot;citidina deaminasi-like&quot;. La presenza di questo enzima modifica di C-a-U garantisce la corretta pieghevole e funzionalit&agrave; di tutti i M. kandleri tRNA.

Una deaminasi della citidina modifica C a U in trasferimento RNAs in Archaea.

&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x6B63;&#x898F;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC; Rna (Trna) &#x306F;&#x30A6;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x4F4D;&#x7F6E; 8&#x3001;tRNA &#x306E;&#x4E09;&#x6B21;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x7DAD;&#x6301;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x8D85;&#x597D;&#x71B1;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x30E1;&#x30BF;&#x30CE;&#x30D1;&#x30A4;&#x30E9;&#x30B9;&#x5C5E; kandleri &#x6E2F;&#x6E7E; 30 (34 &#x304B;&#x3089;) tRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x30B7;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3;&#x3068; 8 &#x3092;&#x914D;&#x7F6E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x306B;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061; C U &#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3053;&#x306E;&#x5834;&#x6240; tRNA &#x306E;&#x7B2C;&#x4E09;&#x7D00;&#x306E;&#x30B3;&#x30A2;&#x306B;&#x7DE8;&#x96C6;&#x3084;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E; tRNA aid tRNA &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0; &#x30B4;&#x30C4;&#x30F3; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306B;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3; &#x30A2;&#x30C7;&#x30CE;&#x30B7;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x304C; CDAT8 &#x306E;&#x7D50;&#x6676;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;CDAT8 &#x306F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30D7;&#x30BF;&#x30FC;&#x5E79;&#x30D8;&#x30A2;&#x30D4;&#x30F3; &#x30AB;&#x30FC;&#x30D6;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3068;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x5BB6;&#x65CF;&#x5185;&#x300C;&#x30B7;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3; &#x30A2;&#x30C7;&#x30CE;&#x30B7;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x300D;&#x30B9;&#x30FC;&#x30D1;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306B;&#x5C5E;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x7F6E; 8 C &#x8131;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x306E;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E; C U &#x7DE8;&#x96C6;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x9069;&#x5207;&#x306A;&#x6298;&#x308A;&#x305F;&#x305F;&#x307F;&#x305D;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3059;&#x3079;&#x3066; M. kandleri &#x306E;&#x4FDD;&#x8A3C; Trna&#x3002;

&#x30B7;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3; &#x30A2;&#x30C7;&#x30CE;&#x30B7;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC; C U &#x306B;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; Rna &#x3092;&#x8EE2;&#x9001;&#x3067;&#x7DE8;&#x96C6;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x6240;&#x6709;&#x89C4;&#x8303;&#x8F6C;&#x79FB; Rna (chin &#x5982;&#xFF09; 8&#xFF0C;&#x53C2;&#x4E0E;&#x7EF4;&#x6301; tRNA &#x7684;&#x4E09;&#x7EA7;&#x7ED3;&#x6784;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x6709;&#x5C3F;&#x82F7;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x5728;&#x80DE;&#x82F7;&#x7684;&#x55DC;&#x70ED; archaeon Methanopyrus kandleri (34) &#x540D;&#x6E2F;&#x53E3; 30 tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E; 8&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E; C-U &#x5728; tRNA &#x7684;&#x4E09;&#x7EA7;&#x6838;&#x5FC3;&#x4E2D;&#x7684;&#x6B64;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x7F16;&#x8F91;&#x548C; tRNA &#x7279;&#x5B9A;&#x80DE;&#x82F7;&#x8131;&#x6C28;&#x9176;&#xFF0C;CDAT8&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5DF2;&#x94FE;&#x63A5;&#x7684; tRNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x5654;&#x57DF;&#x80DE;&#x82F7;&#x8131;&#x6C28;&#x9176;&#x57DF;&#x7684;&#x6676;&#x4F53;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;CDAT8 &#x662F;&#x7279;&#x5B9A;&#x4E8E; C &#x6C28;&#x4F4D;&#x7F6E; 8&#x3001; &#x9700;&#x8981;&#x53EA;&#x6709;&#x627F;&#x5151;&#x4EBA;&#x5E72;&#x53D1;&#x5939;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4E14;&#x5C5E;&#x4E8E;&#x5185;&quot;&#x80DE;&#x82F7;&#x8131;&#x6C28;&#x9176;&#x6837;&quot;&#x5BB6;&#x65CF;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x5BB6;&#x65CF;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E2A; C-U &#x7F16;&#x8F91;&#x9176;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x4FDD;&#x8BC1;&#x6B63;&#x786E;&#x6298;&#x53E0;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x6240;&#x6709; M.kandleri chin &#x5982;&#x3002;

&#x80DE;&#x82F7;&#x8131;&#x6C28;&#x9176;&#x5728;&#x8F6C;&#x8BA9; RNAs &#x5728;&#x53E4;&#x7F16;&#x8F91;&#x5230; U C&#x3002;

All canonical transfer RNAs (tRNAs) have a uridine at position 8, involved in maintaining tRNA tertiary structure. However, the hyperthermophilic archaeon Methanopyrus kandleri harbors 30 (out of 34) tRNA genes with cytidine at position 8. Here, we demonstrate C-to-U editing at this location in the tRNA's tertiary core, and present the crystal structure of a tRNA-specific cytidine deaminase, CDAT8, which has the cytidine deaminase domain linked to a tRNA-binding THUMP domain. CDAT8 is specific for C deamination at position 8, requires only the acceptor stem hairpin for activity, and belongs to a unique family within the "cytidine deaminase-like" superfamily. The presence of this C-to-U editing enzyme guarantees the proper folding and functionality of all M. kandleri tRNAs.

A cytidine deaminase edits C to U in transfer RNAs in Archaea.

Tous les ARN canonique de transfert (ARNt) ont une uridine &agrave; la position 8, impliqu&eacute;s dans le maintien de la structure tertiaire ARNt. Cependant, les hyperthermophile arch&eacute;en Methanopyrus kandleri ports 30 (sur 34) g&egrave;nes d&#39;ARNt avec cytidine &agrave; position 8. Nous d&eacute;montrons ici, C-&agrave;-U modification &agrave; cet endroit en base tertiaire de l&#39;ARNt et pr&eacute;senter la structure cristalline d&#39;un d&eacute;aminase cytidine ARNt sp&eacute;cifiques, CDAT8, qui poss&egrave;de la cytidine d&eacute;saminase domaine li&eacute; &agrave; un domaine de liaison &agrave; tRNA THUMP. CDAT8 est sp&eacute;cifique pour la d&eacute;samination C &agrave; la position 8, exige seulement l&#39;&eacute;pingle de la tige accepteur pour activit&eacute; et appartient &agrave; une famille unique au sein de la superfamille &laquo; cytidine d&eacute;saminase-like &raquo;. La pr&eacute;sence de cette enzyme &eacute;dition C-&agrave;-U garantit le pliage ad&eacute;quat et la fonctionnalit&eacute; de tous M. kandleri ARNt.

Un d&eacute;aminase cytidine modifie C de U dans l&#39;ARN de transfert chez les Archaea.

Alle kanonischen Transfer-RNAs (tRNAs) haben ein Uridin an Position 8, Aufrechterhaltung der tRNA Terti&auml;rstruktur beteiligt. Jedoch Positionieren der hyperthermophilen Archaeon Methanopyrus Kandleri H&auml;fen 30 (von 34) tRNA-Gene mit Cytidin am 8. Hier demonstrieren wir C-U-an dieser Stelle in der tRNA terti&auml;ren Kern bearbeiten und pr&auml;sentieren die Kristallstruktur von eine tRNA-spezifische Cytidin-Deaminase, CDAT8, die die Cytidin-Desaminase-Dom&auml;ne zu einer tRNA-Bindung THUMP Dom&auml;ne verkn&uuml;pft hat. CDAT8 ist spezifisch f&uuml;r C Deamination an Position 8 und erfordert nur die Akzeptor-Vorbau-Haarnadel f&uuml;r Aktivit&auml;t geh&ouml;rt zu einer einzigartigen Familie innerhalb der &Uuml;berfamilie &quot;Cytidin Desaminase-wie&quot;. Das Vorhandensein dieses C-U-Bearbeitung Enzyms garantiert die korrekte Faltung und Funktionalit&auml;t der alle M. Kandleri tRNAs.

Ein Cytidin-Deaminase: C u im Transfer-RNAs in Archaeen aus.

&#xBAA8;&#xB4E0; &#xC815;&#xC2DD; &#xC804;&#xC1A1; RNAs &#xB4E4; (tRNAs) &#xC704;&#xCE58; 8, Trna&#xC758; 3 &#xCC28; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC720;&#xC9C0; &#xAD00;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xD55C; uridine&#xAC00; &#xC788;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;,&#xC5D0;&#xC11C; cytidine&#xC640; hyperthermophilic archaeon Methanopyrus kandleri (34) &#xC911; 30 &#xD56D;&#xAD6C; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC704;&#xCE58; 8. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC11C;, C U &#xC2DC;&#xC5F0; Trna&#xC758; 3 &#xCC28; &#xCF54;&#xC5B4;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xC704;&#xCE58;&#xB97C; &#xD3B8;&#xC9D1; &#xD558; &#xACE0; tRNA &#xD2B9;&#xC815; cytidine deaminase, cytidine deaminase &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC774; tRNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xCFF5; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; cdat8&#xC758; &#xACB0;&#xC815; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC81C;&#xC2DC;. CDAT8 &#xC704;&#xCE58;&#xC758; 8 C &#xD0C8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD2B9;&#xC815; &#xD65C;&#xB3D9;, &#xC218;&#xB77D;&#xC790; &#xC904;&#xAE30; &#xBA38;&#xB9AC; &#xD540;&#xB9CC; &#xD544;&#xC694;&#xB85C; &#xD558; &#xACE0; &quot;cytidine deaminase &#xAC19;&#xC740;&quot; superfamily &#xB0B4; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xAC00;&#xC871;&#xC5D0; &#xC18D;&#xD55C;&#xB2E4;. &#xC774; C U &#xD3B8;&#xC9D1; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC7A5; &#xC801;&#xC808; &#xD55C; &#xD3F4;&#xB529; &#xBC0F; &#xBAA8;&#xB4E0; M. kandleri&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; tRNAs.

Cytidine deaminase &#xACE0;&#xC138;&#xADE0;&#xC5D0; &#xC804;&#xC1A1; Rnas&#xC5D0; C U &#xD3B8;&#xC9D1;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Todos can&oacute;nicas RNAs de transferencia (ARNt) tienen un Uridina en posici&oacute;n 8, implicados en el mantenimiento de la estructura terciaria de tRNA. Sin embargo, los hyperthermophilic archaeon Methanopyrus Methanopyrus puertos 30 (de 34) tRNA genes con citidina en posici&oacute;n 8. Aqu&iacute;, demostramos C-a-U edici&oacute;n en este lugar en centro terciario del tRNA y presentar la estructura cristalina de una deaminasa citidina tRNA espec&iacute;fica, CDAT8, que tiene el dominio de citidina desaminasa ligado a un dominio de golpe tRNA-obligatorio. CDAT8 es espec&iacute;fico para la desaminaci&oacute;n de la C en la posici&oacute;n 8, requiere solamente la horquilla de la madre del aceptador de actividad y pertenece a una familia &uacute;nica dentro de la Superfamilia &quot;citidina desaminasa-como&quot;. La presencia de esta enzima edici&oacute;n C-a-U garantiza la correcta plegable y funcionalidad de todos Methanopyrus M. tRNAs.

Una deaminasa citidina edita C a U en RNAs de transferencia en Archaea.

&#x5C5E;&#x4E8E;&#x6700;&#x8FD1;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x62FC;&#x63A5;&#x548C;&#x52A0;&#x5DE5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x7684;&#x5207;&#x9176; Nanoarchaeum equitans (&#x4F01;&#x4E1A;) &#x7684; RNA &#xFF08;alphabeta)(2) &#x5BB6;&#x65CF;&#x7684;&#x62FC;&#x63A5;&#x62FC;&#x63A5;&#x6D3B;&#x52A8;&#x9700;&#x8981;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x4E9A;&#x57FA;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x3002;N.equitans &#x62FC;&#x63A5;&#x6838;&#x9178;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x7531;&#x50AC;&#x5316;&#x4E9A;&#x5355;&#x4F4D; (NEQ205) &#x548C;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x4E9A;&#x57FA; (NEQ261) &#x7EC4;&#x6210;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x7B2C; 2.1 A &#x62A5;&#x544A;&#x529F;&#x80FD;&#x4F01;&#x4E1A;&#x9176;&#x7684;&#x6676;&#x4F53;&#x7ED3;&#x6784;&#x5305;&#x542B;&#x4E24;&#x4E9A;&#x57FA;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#xFF0C;&#x72EC;&#x81EA;&#x5728; 2.2 A.NEQ261 &#x4E9A;&#x57FA;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x9176;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x5148;&#x524D;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684; alpha(2) &#x548C; alpha(4) &#x7684;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#xFF0C;&#x4F46;&#x7A97;&#x4F53; heterotetramer: &#x4E8C;&#x805A;&#x4F53;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A; heterodimers &#x7684;&#x50AC;&#x5316;&#x4E9A;&#x57FA; (NEQ205) &#x548C;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x4E9A;&#x57FA; (NEQ261)&#x3002;&#x5947;&#x602A;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;NEQ261 &#x5355;&#x5F62;&#x5F0F; homodimer&#xFF0C;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x4EE5;&#x524D;&#x5DF2;&#x77E5; homodimer &#x50AC;&#x5316;&#x4E9A;&#x5355;&#x4F4D;&#x3002;&#x5B64;&#x7ACB;&#x4E9A;&#x57FA; homodimers &#x662F;&#x6291;&#x5236;&#x5230; heterodimerization &#x5DF2;&#x7ECF;&#x6CA1;&#x6709; RNA &#x5288;&#x88C2;&#x6D3B;&#x52A8;&#x540E;&#x6DF7;&#x5408;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x4E9A;&#x57FA;&#x7684;&#x5171;&#x4EF7;&#x952E;&#x8FDE;&#x50AC;&#x5316; homodimer &#x6240;&#x793A;&#x3002;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7ED3;&#x6784;&#x6BD4;&#x8F83;&#x663E;&#x793A;&#x66F4;&#x6709;&#x5229;&#x5F02;&#x8D28;-&#x6BD4; homodimerization &#x63A5;&#x53E3;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x8868;&#x660E;&#x901A;&#x8FC7;&#x53EF;&#x7528;&#x4E9A;&#x57FA;&#x9176;&#x5927;&#x4F1A;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x7075;&#x6D3B;&#x7684;&#x4F01;&#x4E1A;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7F51;&#x7AD9;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x4E00;&#x4E2A;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x89E3;&#x91CA;&#xFF0C;&#x4E3A;&#x5176;&#x66F4;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x5E95;&#x7269;&#x4E13;&#x4E00;&#x6027;&#x3002;

&#x6676;&#x4F53;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x7684; Nanoarchaeum equitans tRNA &#x62FC;&#x63A5;&#x5207;&#x7684;&#x5927;&#x4F1A;&#x3002;

The RNA splicing and processing endonuclease from Nanoarchaeum equitans (NEQ) belongs to the recently identified (alphabeta)(2) family of splicing endonucleases that require two different subunits for splicing activity. N. equitans splicing endonuclease comprises the catalytic subunit (NEQ205) and the structural subunit (NEQ261). Here, we report the crystal structure of the functional NEQ enzyme at 2.1 A containing both subunits, as well as that of the NEQ261 subunit alone at 2.2 A. The functional enzyme resembles previously known alpha(2) and alpha(4) endonucleases but forms a heterotetramer: a dimer of two heterodimers of the catalytic subunit (NEQ205) and the structural subunit (NEQ261). Surprisingly, NEQ261 alone forms a homodimer, similar to the previously known homodimer of the catalytic subunit. The homodimers of isolated subunits are inhibitory to heterodimerization as illustrated by a covalently linked catalytic homodimer that had no RNA cleavage activity upon mixing with the structural subunit. Detailed structural comparison reveals a more favorable hetero- than homodimerization interface, thereby suggesting a possible regulation mechanism of enzyme assembly through available subunits. Finally, the uniquely flexible active site of the NEQ endonuclease provides a possible explanation for its broader substrate specificity.

Crystal structure and assembly of the functional Nanoarchaeum equitans tRNA splicing endonuclease.

L&#39;ARN d&#39;&eacute;pissage et traitement endonucl&eacute;ase de Nanoarchaeum equitans (NEQ) appartient &agrave; la r&eacute;cemment identifi&eacute; (famille des alphabeta)(2) de l&#39;&eacute;pissage des endonucl&eacute;ases qui n&eacute;cessitent deux sous-unit&eacute;s diff&eacute;rentes pour l&#39;&eacute;pissage de l&#39;activit&eacute;. N. equitans &eacute;pissage endonucl&eacute;ase comprend la sous-unit&eacute; catalytique (NEQ205) et la sous-unit&eacute; structurale (NEQ261). Nous rapportons ici la structure cristalline de l&#39;enzyme fonctionnelle de QNE &agrave; 2.1 A contenant les sous-unit&eacute;s, ainsi que celui de la sous-unit&eacute; NEQ261 seule &agrave; 2.2 A. L&#39;enzyme fonctionnelle ressemble d&eacute;j&agrave; connues des endonucl&eacute;ases de alpha(2) et alpha(4), mais forme un h&eacute;t&eacute;rot&eacute;tram&egrave;re : un dim&egrave;re de deux h&eacute;t&eacute;rodim&egrave;res de la sous-unit&eacute; catalytique (NEQ205) et la sous-unit&eacute; structurale (NEQ261). &Eacute;tonnamment, NEQ261 seule forme un homodim&egrave;re, semblable &agrave; l&#39;homodim&egrave;re d&eacute;j&agrave; connue de la sous-unit&eacute; catalytique. Les homodim&egrave;res de sous-unit&eacute;s isol&eacute;es sont inhibitrices pour h&eacute;t&eacute;rodim&eacute;risation, comme en t&eacute;moigne un homodim&egrave;re catalytique par covalence li&eacute; qui n&#39;avait aucune activit&eacute; de clivage RNA apr&egrave;s m&eacute;lange avec la sous-unit&eacute; structurale. Comparaison structurale d&eacute;taill&eacute;e r&eacute;v&egrave;le un plus favorable h&eacute;t&eacute;ro-que homodim&eacute;risation interface, ce qui sugg&egrave;re un m&eacute;canisme de r&eacute;glementation possible d&#39;Assembl&eacute;e d&#39;enzyme par l&#39;interm&eacute;diaire de sous-unit&eacute;s disponibles. Enfin, flexible unique site actif de l&#39;endonucl&eacute;ase de QNE fournit une explication possible pour sa plus large sp&eacute;cificit&eacute; de substrat.

Structure cristalline et assemblage de l&#39;endonucl&eacute;ase &eacute;pissage fonctionnelle Nanoarchaeum equitans ARNt.

Die RNA-Splei&szlig;en und Verarbeitung Endonuklease von Nanoarchaeum Equitans (NEQ) geh&ouml;rt zu den k&uuml;rzlich identifizierten (alphabeta)(2) Familie von Splei&szlig;en Endonucleases, die zwei verschiedene Untereinheiten f&uuml;r Splei&szlig;en T&auml;tigkeit ben&ouml;tigen. N. Equitans Splei&szlig;en Endonuklease umfasst die katalytische Untereinheit (NEQ205) und der strukturellen Untereinheit (NEQ261). Hier berichten wir die Kristallstruktur des Enzyms funktionale NEQ auf 2.1 A, enth&auml;lt sowohl Untereinheiten, als auch von der NEQ261-Untereinheit, die allein auf 2,2 A. Das funktionale Enzym &auml;hnelt dem bisher bekannten alpha(2) und alpha(4) Endonucleases aber bildet ein Heterotetramer: ein Dimer zwei Heterodimere die katalytische Untereinheit (NEQ205) und der strukturellen Untereinheit (NEQ261). &Uuml;berraschenderweise bildet NEQ261 allein ein Homodimer, &auml;hnlich wie die bisher bekannten Homodimer die katalytische Untereinheit. Die Homodimers isoliert-Untereinheiten sind hemmende zu Heterodimerization wie ein kovalent verkn&uuml;pfte katalytische Homodimer dargestellt, die keine RNA Schneidefunktion nach Vermischung mit der strukturellen Untereinheit hatte. Detaillierte Strukturvergleich zeigt eine g&uuml;nstigere Hetero-als Homodimerization-Schnittstelle, damit schl&auml;gt eine m&ouml;gliche Regulierungsmechanismus Enzym Assembly nicht auf verf&uuml;gbare Untereinheiten. Schlie&szlig;lich bietet die einzigartig flexible aktiv-Seite des NEQ-Endonuklease eine m&ouml;gliche Erkl&auml;rung f&uuml;r seine breitere Substratspezifit&auml;t.

Kristallstruktur und Montage von der funktionalen Nanoarchaeum Equitans tRNA Splei&szlig;en Endonuklease.

il RNA splicing ed elaborazione endonucleasi da Nanoarchaeum equitans (NEQ) appartiene al recentemente identificato (alphabeta)(2) famiglia di splicing endonucleases che richiedono due subunit&agrave; diverse per attivit&agrave; di splicing. N. equitans splicing endonucleasi comprende la subunit&agrave; catalitica (NEQ205) e la subunit&agrave; strutturale (NEQ261). Qui riportiamo la struttura cristallina dell&#39;enzima funzionale NEQ a 2.1 un contenente sia le subunit&agrave;, nonch&eacute; quella della subunit&agrave; NEQ261 alone at 2.2 A. L&#39;enzima funzionale assomiglia endonucleases precedentemente noto alpha(2) e alpha(4) ma forma un heterotetramer: un dimero di due eterodimeri la subunit&agrave; catalitica (NEQ205) e la subunit&agrave; strutturale (NEQ261). Sorprendentemente, solo NEQ261 forma un omodimero, simile all&#39;omodimero precedentemente conosciuto della subunit&agrave; catalitica. Omodimeri di subunit&agrave; isolata sono inibitorie di heterodimerization come illustrato da un omodimero catalitico covalentemente legato che non aveva nessuna attivit&agrave; di fenditura RNA dopo la miscelazione con la subunit&agrave; strutturale. Confronto strutturale dettagliato rivela una pi&ugrave; favorevole etero-interfaccia homodimerization, suggerendo cos&igrave; un meccanismo di regolazione dell&#39;Assemblea enzima attraverso la subunit&agrave; disponibile. Infine, il sito attivo in modo univoco flessibile del endonucleasi NEQ fornisce una possibile spiegazione per la sua pi&ugrave; ampia specificit&agrave; di substrato.

Struttura di cristallo e assemblaggio del funzionale Nanoarchaeum equitans tRNA splicing endonucleasi.

RNA &#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC; &#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; (NEQ&#xFF09; &#x304B;&#x3089;&#x51E6;&#x7406;&#x304C;&#x6700;&#x8FD1;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x306B;&#x5C5E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B; (&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D3;&#x30C6;&#x30A3;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E; 2 &#x3064;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E; alphabeta)(2) &#x5BB6;&#x65CF;&#x3002;(&#x540D;) &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x89E6;&#x5A92;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8; (NEQ205) &#x3068;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8; (NEQ261) &#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x306F; 2.1 A &#x3067;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684; NEQ &#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x7D50;&#x6676;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x4E21;&#x65B9;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306E; 2.2 A. &#x3067;&#x5358;&#x72EC;&#x3067;&#x306E; NEQ261 &#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x6A5F;&#x80FD;&#x6027;&#x9175;&#x7D20;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x672A;&#x77E5;&#x306E; alpha(2) &#x3068; alpha(4) &#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306B;&#x4F3C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;heterotetramer &#x3092;&#x5F62;&#x6210;&#x3059;&#x308B;: &#x306E;&#x89E6;&#x5A92;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8; (NEQ205) &#x3068;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8; (NEQ261) &#x306E; 2 &#x3064;&#x306E;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x4E8C;&#x91CF;&#x4F53;&#x3002;&#x9A5A;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;NEQ261 &#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x3001;2 &#x91CF;&#x4F53;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x89E6;&#x5A92;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x672A;&#x77E5;&#x306E;&#x30DB;&#x30E2;&#x4E8C;&#x91CF;&#x4F53;&#x3092;&#x5F62;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5B64;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x304B;&#x3089;&#x6210;&#x308B;&#x30DB;&#x30E2; RNA &#x5207;&#x65AD;&#x6D3B;&#x6027;&#x3068;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x30DF;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6642;&#x306B;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x5171;&#x6709;&#x7D50;&#x5408;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x89E6;&#x5A92; 2 &#x91CF;&#x4F53;&#x3067;&#x793A;&#x3059;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;heterodimerization &#x306E;&#x6291;&#x5236;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306F;&#x3088;&#x308A;&#x6709;&#x5229;&#x306A;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x9175;&#x7D20;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x3092;&#x901A;&#x3058;&#x3066;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x898F;&#x5236;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x793A;&#x5506; - &#x30C0;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x5316;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A7;&#x30A4;&#x30B9;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x72EC;&#x81EA;&#x306E;&#x67D4;&#x8EDF;&#x6027;&#x306E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8; NEQ &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x57FA;&#x8CEA;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3088;&#x308A;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x8AAC;&#x660E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7D50;&#x6676;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30CA;&#x30CE;&#x30A2;&#x30FC;&#x30B1;&#x30A6;&#x30E0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30AF;&#x30A4;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9; tRNA &#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0; &#x30FB; &#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x3002;

RNA &#xC811;&#xD569; &#xBC0F; &#xCC98;&#xB9AC; endonuclease Nanoarchaeum equitans (NEQ)&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD5C;&#xADFC; &#xD655;&#xC778; &#xB41C;&#xC5D0; &#xC18D;&#xD55C;&#xB2E4; (endonucleases &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC811;&#xD569; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xD558;&#xC704; &#xB2E8;&#xC704;&#xB97C; &#xD544;&#xC694;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; &#xC811;&#xD569;&#xC758; alphabeta)(2) &#xC81C;&#xD488;&#xAD70;. &#xBA85;. equitans endonuclease &#xC811;&#xD569; (NEQ205) &#xCD09;&#xB9E4; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; &#xAD6C;&#xC870; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; (NEQ261) &#xAD6C;&#xC131; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. 2.1 A&#xC5D0; &#xAE30;&#xB2A5; NEQ &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xACB0;&#xC815; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xBCF4;&#xACE0; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC5EC;&#xAE30;, &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xBAA8;&#xB450; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704;, NEQ261 &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; 2.2 &#xB300;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xD63C;&#xC790;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC131; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; alpha(2) &#xBC0F; alpha(4) endonucleases&#xC640; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD615;&#xC131; &#xD558;&#xB294; heterotetramer: &#xCD09;&#xB9E4; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; (NEQ205) &#xBC0F; &#xAD6C;&#xC870; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; (NEQ261)&#xC758; &#xB450; heterodimers&#xC758; dimer. &#xB180;&#xB78D;&#xAC8C;&#xB3C4;, NEQ261 &#xD63C;&#xC790; homodimer &#xCD09;&#xB9E4; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; homodimer&#xC640; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xD615;&#xD0DC;. &#xACA9;&#xB9AC; &#xB41C; &#xD558;&#xC704; &#xB2E8;&#xC704; homodimers&#xB294; heterodimerization &#xAD6C;&#xC870; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704;&#xC640; &#xD63C;&#xD569;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; RNA &#xBD84;&#xC5F4; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131; &#x70AD; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xCD09;&#xB9E4; homodimer&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBCFC; &#xC218; &#xC788;&#xB4EF;&#xC774; &#xAE08;&#xC9C0;. &#xC0C1;&#xC138;&#xD55C; &#xAD6C;&#xC870; &#xBE44;&#xAD50; &#xACC4;&#xC2DC;&#xB97C; &#xBCA0;&#xD478;&#xB294; hetero-homodimerization &#xC778;&#xD130;&#xD398;&#xC774;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xD558;&#xC704; &#xB2E8;&#xC704;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC5B4;&#xC148;&#xBE14;&#xB9AC;&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, NEQ endonuclease&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xD65C;&#xC131; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC758; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xAE30;&#xC9C8; &#xD2B9;&#xC774;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC124;&#xBA85;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xACB0;&#xC815; &#xAD6C;&#xC870; &#xBC0F; &#xAE30;&#xB2A5; Nanoarchaeum equitans tRNA &#xC811;&#xD569; endonuclease&#xC758; &#xC870;&#xB9BD;.

El RNA de empalme y procesamiento endonucleasa de Nanoarchaeum equitans (NEQ) pertenece a la recientemente identificada (alphabeta)(2) familia de empalme Endonucleasas que requieren dos subunidades diferentes para empalmar la actividad. N. Nanoarchaeum empalme endonucleasa comprende la subunidad catal&iacute;tica (NEQ205) y la subunidad estructural (NEQ261). Aqu&iacute;, divulgamos la estructura cristalina de la enzima NEQ funcional en 2.1 A que contiene tanto subunidades, como la de la subunidad NEQ261 solamente en 2.2 A. La enzima funcional se asemeja al conocido endonucleases de alpha(2) y alpha(4) pero forma un heterotetramer: un d&iacute;mero de dos heterod&iacute;meros de la subunidad catal&iacute;tica (NEQ205) y la subunidad estructural (NEQ261). Sorprendentemente, NEQ261 solo forma un homod&iacute;mero, similar a la homod&iacute;mero conocido de la subunidad catal&iacute;tica. Los homod&iacute;meros de las subunidades aisladas son inhibitorios para heterodimerization como un homod&iacute;mero catal&iacute;tico covalentemente enlazado que hab&iacute;a tenido actividad RNA escote en mezcla con la subunidad estructural. Comparaci&oacute;n estructural detallada revela un m&aacute;s favorable hetero-que interfaz de T329N, as&iacute;, lo que sugiere un mecanismo posible regulaci&oacute;n de Asamblea de la enzima a trav&eacute;s de subunidades disponibles. Finalmente, el sitio activo &uacute;nicamente flexible de la endonucleasa NEQ proporciona una posible explicaci&oacute;n para su m&aacute;s amplia especificidad de sustrato.

Estructura cristalina y montaje de la funcional endonucleasa que empalma Nanoarchaeum equitans tRNA.

Molecole di RNA transfer (tRNA) sono altamente conservati in lunghezza, la sequenza e la struttura per poter essere funzionali nel ribosoma. Tuttavia, soprattutto in archaea, dei pochi geni che codificano tRNA possono essere trovati interrotto, frammentato, con permutazioni o con mutazioni non-funzionale di nucleotidi conservati. Qui, noi diamo una panoramica dei tRNA recentemente scoperto percorsi di maturazione che richiedono elaborazione intricati passaggi per generare infine il tRNA standard da questi geni tRNA insolito.

Trasferimento RNA processing in archaea: percorsi insoliti ed enzimi.

&#x8F6C;&#x79FB; RNA (tRNA) &#x5206;&#x5B50;&#x662F;&#x9AD8;&#x957F;&#x5EA6;&#x3001; &#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FDD;&#x5B88;&#x624D;&#x80FD;&#xFF0C;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5927;&#x591A;&#x662F;&#x5728;&#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#x77ED;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801; chin &#x5982;&#x53EF;&#x4EE5;&#x627E;&#x5230;&#x4E2D;&#x65AD;&#xFF0C;&#x652F;&#x79BB;&#x7834;&#x788E;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x6392;&#x5217;&#x6216;&#x975E;&#x529F;&#x80FD;&#x6027;&#x7684;&#x5B88;&#x6052;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x7A81;&#x53D8;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7ED9;&#x7684;&#x6700;&#x8FD1;&#x53D1;&#x73B0; tRNA &#x6982;&#x8FF0;&#x9700;&#x8981;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x5904;&#x7406;&#x6B65;&#x9AA4;&#xFF0C;&#x6700;&#x540E;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4E0D;&#x5BFB;&#x5E38;&#x7684; tRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x751F;&#x6210;&#x6807;&#x51C6;&#x7684; tRNA &#x7684;&#x6210;&#x719F;&#x4E4B;&#x8DEF;&#x3002;

&#x8F6C;&#x79FB; RNA &#x5728;&#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#x52A0;&#x5DE5;&#xFF1A; &#x4E0D;&#x5BFB;&#x5E38;&#x7684;&#x9014;&#x5F84;&#x548C;&#x9176;&#x3002;

Transfer RNA (tRNA) molecules are highly conserved in length, sequence and structure in order to be functional in the ribosome. However, mostly in archaea, the short genes encoding tRNAs can be found disrupted, fragmented, with permutations or with non-functional mutations of conserved nucleotides. Here, we give an overview of recently discovered tRNA maturation pathways that require intricate processing steps to finally generate the standard tRNA from these unusual tRNA genes.

Transfer RNA processing in archaea: unusual pathways and enzymes.

Mol&eacute;cules d&#39;ARN de transfert (ARNt) sont fortement conserv&eacute;s dans la s&eacute;quence, la longueur et la structure afin d&#39;&ecirc;tre fonctionnel dans le ribosome. Cependant, surtout chez les archaea, quelques g&egrave;nes qui codent les ARNt trouvera perturb&eacute;e, fragment&eacute;, avec permutations ou pr&eacute;sentant des mutations non fonctionnelles de nucl&eacute;otides conserv&eacute;s. Nous donnons ici, un aper&ccedil;u de l&#39;ARNt r&eacute;cemment d&eacute;couverte des voies de maturation qui requi&egrave;rent des &eacute;tapes de traitement complexe pour enfin g&eacute;n&eacute;rer le tRNA standard de ces g&egrave;nes d&#39;ARNt inhabituelle.

Les ARN de transfert de traitement chez les archaea : voies inhabituelles et des enzymes.

Transfer-RNA (tRNA) Molek&uuml;le sind stark in die L&auml;nge, Reihenfolge und Struktur konserviert, um in das Ribosom funktionsf&auml;hig zu sein. Jedoch meist in Archaeen, die kurzen Genen tRNAs finden gest&ouml;rt, fragmentiert, mit Permutationen oder nicht funktionierende Mutationen der konservierten Nukleotide. Hier geben wir einen &Uuml;berblick der k&uuml;rzlich entdeckten tRNA Reifung Bahnen, die erfordern komplizierte Verarbeitungsschritte, Norm tRNA schlie&szlig;lich aus dieser ungew&ouml;hnlichen tRNA-Gene zu generieren.

Transfer-RNA, die Verarbeitung in Archaea: ungew&ouml;hnliche Wege und Enzyme.

&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x9577;&#x3055;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x69CB;&#x9020;&#x3067;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x8EE2;&#x79FB; RNA &#xFF08;tRNA&#xFF09; &#x5206;&#x5B50;&#x3092;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x5927;&#x62B5;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30A2;&#x306E; Trna &#x77ED;&#x3044;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x4E2D;&#x65AD;&#x3001;&#x9806;&#x5217;&#x3068;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x975E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x3068;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x306A; tRNA &#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304B;&#x3089;&#x6A19;&#x6E96;&#x306E; tRNA &#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x51E6;&#x7406;&#x624B;&#x9806;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x6210;&#x719F;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306F;&#x6700;&#x8FD1;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x305F; tRNA &#x306E;&#x6982;&#x8981;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8EE2;&#x9001;&#x51E6;&#x7406;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC; RNA: &#x7570;&#x5E38;&#x306A;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3068;&#x9175;&#x7D20;&#x3002;

&#xC804;&#xC1A1; RNA (tRNA) &#xBD84;&#xC790;&#xB294; &#xACE0;&#xB3C4;&#xB85C; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC791;&#xB3D9; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xAE38;&#xC774;, &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xAD6C;&#xC870;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xC874; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xACE0;&#xC138;&#xADE0;, &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; tRNAs &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC9E7;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC911;&#xB2E8;, &#xC870;&#xAC01;&#xD654;, &#xC21C;&#xC5F4; &#xB610;&#xB294; &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC;&#xC758; &#xC678;&#xC801;&#xC778; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;&#xC774; &#xD2B9;&#xC774; &#xD55C; tRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xC900; Trna&#xB97C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xB2E8;&#xACC4;&#xAC00; &#xC131;&#xC219; &#xACBD;&#xB85C; &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB41C; Trna&#xC758; &#xAC1C;&#xC694;&#xB97C; &#xC900;&#xB2E4;.

&#xACE0;&#xC138;&#xADE0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xC804;&#xC1A1; RNA: &#xBE44;&#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xD1B5;&#xB85C; &#xD6A8;&#xC18C;.

Las mol&eacute;culas de ARN de transferencia (tRNA) est&aacute;n muy conservadas en longitud, secuencia y estructura para ser funcional en el ribosoma. Sin embargo, en su mayor&iacute;a en archaea, los pocos genes que codifican tRNAs pueden encontrarse interrumpido, fragmentada, con permutaciones o con mutaciones no funcionales de nucle&oacute;tidos conservados. Aqu&iacute;, le damos una visi&oacute;n general del tRNA recientemente descubierto caminos de maduraci&oacute;n que requieren procesamiento intrincados pasos para finalmente generar el tRNA est&aacute;ndar de estos genes de tRNA inusual.

ARN de transferencia, procesamiento en archaea: caminos inusuales y enzimas.

tRNA(His) guanylyltransferase (Thg1) post-transcriptionally &#x6DFB;&#x52A0; 5&#39;-&#x603B;&#x7AD9;&#x7684; tRNA(His) G &#xFF08;&#x4F4D;&#x7F6E;-1&#xFF09;&#x3002;&#x7403;&#x83CC; acetivorans Thg1 (MaThg1) &#x57FA;&#x56E0;&#x5305;&#x542B;&#x5728;&#x6846;&#x67B6;&#x6807;&#x8BB0; &#xFF08;&#x7425;&#x73C0;&#x8272;&#xFF09; &#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x3002;&#x867D;&#x7136; UAG &#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x901A;&#x5E38;&#x6307;&#x793A;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x7EC8;&#x6B62;&#xFF0C;&#x5176;&#x5728;&#x7403;&#x83CC; mRNA &#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x5BFC;&#x81F4; Pyl-tRNA(Pyl)&#xFF0C;pyrrolysyl-tRNA &#x5408;&#x6210;&#x9176;&#x7684;&#x4EA7;&#x54C1;&#x6240;&#x53D6;&#x5F97;&#x7684; pyrrolysine (Pyl) &#x7EB3;&#x5165;&#x3002;MaThg1 &#x6D4B;&#x5E8F;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x8C08;&#x8BDD;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x7425;&#x73C0;&#x8272;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x3002;MaThg1 mRNA &#x7FFB;&#x8BD1;&#x5BFC;&#x81F4;&#x5168;&#x957F;&#x3001; Pyl &#x542B;&#x3001; &#x6D3B;&#x8DC3;&#x7684;&#x9176;&#x514D;&#x75AB;&#x5370;&#x8FF9;&#x6CD5;&#x3001; &#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5;&#x548C;&#x751F;&#x5316;&#x5206;&#x6790;&#x6240;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x3002;UAG &#x6240;&#x6307;&#x5B9A;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x63D2;&#x5165;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x7684;&#x6027;&#x8D28;&#x4E0D;&#x662F;&#x5173;&#x952E;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A; Pyl &#x6216;&#x8DE8;&#x56FD;&#x6FC0;&#x8FDB;&#x515A;&#x63D2;&#x5165;&#x751F;&#x6210;&#x6D3B;&#x52A8; MaThg1 M.acetivorans &#x548C;&#x540C;&#x7B49;&#x6570;&#x91CF;&#x7684;&#x5168;&#x957F;&#x86CB;&#x767D;&#x53D8;&#x5F02;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x8868;&#x660E; Pyl &#x63D2;&#x5165;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x5929;&#x7136;&#x6291;&#x5236;&#x548C;&#x4E0E;&#x6D3B;&#x52A8;&#x505C;&#x6B62;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x91CD;&#x65B0;&#x5206;&#x914D;&#x6240;&#x9700;&#x7684; selenocysteine &#x63D2;&#x5165;&#x4E0D;&#x540C;&#x3002;&#x53EA;&#x6709;&#x4E09;&#x4E2A; Pyl &#x542B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x8FC7;&#x4EE5;&#x524D;&#xFF0C;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#x4E00;&#x5957;&#x7532;&#x80FA;&#x7532;&#x57FA;&#x8F6C;&#x79FB;&#x9176; Pyl &#x5047;&#x5B9A;&#x4EE5;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x8FDB;&#x5316;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7F51;&#x7AD9;&#x6784;&#x6210;&#x3002;&#x76F8;&#x6BD4;&#x4E4B;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x5728; MaThg1 Pyl &#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x53EF;&#x6709;&#x53EF;&#x65E0;&#x7684;&#x6B8B;&#x7559;&#x7269;&#xFF0C;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x8D4B;&#x4E88;&#x6CA1;&#x6709;&#x9009;&#x62E9;&#x6027;&#x7684;&#x4F18;&#x52BF;&#x3002;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E; Thg1 &#x6210;&#x4E3A;&#x53EF;&#x6709;&#x53EF;&#x65E0;&#x7684;&#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#xFF0C;&#x6B64;&#x5916;&#x652F;&#x6301;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x5047;&#x8BBE;&#xFF0C;Pyl &#x51FA;&#x73B0;&#x5728; MaThg1&#xFF0C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E2D;&#x6027;&#x8FDB;&#x5316;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x3002;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x5373;&#x4F7F;&#x662F;&#x6700;&#x4E0D;&#x5BFB;&#x5E38;&#x7684;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x53EF;&#x4EE5;&#x53D1;&#x6325;&#x666E;&#x901A;&#x4F5C;&#x7528;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;

Pyrrolysine tRNAHis guanylyltransferase &#x7531;&#x4E2D;&#x6027;&#x8FDB;&#x5316;&#x4E2D;&#x7684;&#x5916;&#x89C2;&#x3002;

tRNA(His) guanylyltransferase (Thg1) post-transcriptionally adds a G (position -1) to the 5'-terminus of tRNA(His). The Methanosarcina acetivorans Thg1 (MaThg1) gene contains an in-frame TAG (amber) codon. Although a UAG codon typically directs translation termination, its presence in Methanosarcina mRNA may lead to pyrrolysine (Pyl) incorporation achieved by Pyl-tRNA(Pyl), the product of pyrrolysyl-tRNA synthetase. Sequencing of the MaThg1 gene and transcript confirmed the amber codon. Translation of MaThg1 mRNA led to a full-length, Pyl-containing, active enzyme as determined by immunoblotting, mass spectrometry, and biochemical analysis. The nature of the inserted amino acid at the position specified by UAG is not critical, as Pyl or Trp insertion yields active MaThg1 variants in M. acetivorans and equal amounts of full-length protein. These data suggest that Pyl insertion is akin to natural suppression and unlike the active stop codon reassignment that is required for selenocysteine insertion. Only three Pyl-containing proteins have been characterized previously, a set of methylamine methyltransferases in which Pyl is assumed to have specifically evolved to be a key active-site constituent. In contrast, Pyl in MaThg1 is a dispensable residue that appears to confer no selective advantage. Phylogenetic analysis suggests that Thg1 is becoming dispensable in the archaea, and furthermore supports the hypothesis that Pyl appeared in MaThg1 as the result of neutral evolution. This indicates that even the most unusual amino acid can play an ordinary role in proteins.

The appearance of pyrrolysine in tRNAHis guanylyltransferase by neutral evolution.

tRNA(His) guanylyltransf&eacute;rase (Thg1) ajoute post-traductionnelle un G (position -1) &agrave; l&#39;extr&eacute;mit&eacute; 5&#39; de tRNA(His). Le Methanosarcina acetivorans Thg1 g&egrave;ne (MaThg1) contient un codon de TAG (orange) dans le cadre. Bien que g&eacute;n&eacute;ralement un codon UAG ordonne &agrave; terminaison de la traduction, sa pr&eacute;sence dans l&#39;ARNm de Methanosarcina peut-&ecirc;tre perturber incorporation pyrrolysine (Pyl) r&eacute;alis&eacute;e par Pyl-tRNA(Pyl), le produit de la pyrrolysyl-tRNA synth&eacute;tase. Le s&eacute;quen&ccedil;age de la MaThg1 g&egrave;ne et transcription a confirm&eacute; le codon d&#39;ambre. Traduction de l&#39;ARNm de MaThg1 a conduit &agrave; une enzyme pleine longueur, contenant Pyl, active, tel que d&eacute;termin&eacute; par immunoblotting, spectrom&eacute;trie de masse et analyse biochimique. La nature de l&#39;acide amin&eacute; ins&eacute;r&eacute; &agrave; la position sp&eacute;cifi&eacute;e par UAG n&#39;est pas critique, comme insertion Pyl ou Trp g&eacute;n&egrave;re des variantes MaThg1 actives dans acetivorans M. et une quantit&eacute; &eacute;gale de la prot&eacute;ine pleine longueur. Ces donn&eacute;es sugg&egrave;rent que l&#39;insertion Pyl est semblable &agrave; l&#39;&eacute;limination naturelle et contrairement &agrave; la r&eacute;affectation de codon stop actif qui est n&eacute;cessaire pour l&#39;insertion de la s&eacute;l&eacute;nocyst&eacute;ine. Seulement trois prot&eacute;ines Pyl ont &eacute;t&eacute; caract&eacute;ris&eacute;s auparavant, un ensemble de m&eacute;thylamine m&eacute;thyltransf&eacute;rases selon lequel Pyl est suppos&eacute; avoir &eacute;volu&eacute; sp&eacute;cifiquement pour &ecirc;tre un composant cl&eacute; de site actif. En revanche, Pyl dans MaThg1 est un r&eacute;sidu dispensable qui semble ne conf&eacute;rer aucun avantage s&eacute;lectif. L&#39;analyse phylog&eacute;n&eacute;tique sugg&egrave;re que Thg1 devient dispensable dans l&#39;archaea et en outre appuie l&#39;hypoth&egrave;se Pyl paru dans MaThg1 comme le r&eacute;sultat d&#39;une &eacute;volution neutre. Cela signifie que m&ecirc;me l&#39;acide amin&eacute; le plus inhabituel peut jouer un r&ocirc;le ordinaire en prot&eacute;ines.

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Lennart Randau

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