यहां, हम विवो आरएनए: आरएनए इंटरैक्शन के अध्ययन में उपयोग किए जाने वाले काइमेरिक आरएनए अनुक्रमण डेटा का विश्लेषण करने के लिए जैव सूचना विज्ञान पाइपलाइन की स्थापना और उपयोग का प्रदर्शन करने वाला एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं।