3.8: 核酸

Nucleic acids
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March 11, 2019

核酸是维持生命延续的最重要大分子。它们携带着细胞的遗传蓝图,并携带着细胞功能的指令。

DNA 和 RNA

核酸

的两种主要类型是脱氧核糖核酸 (DNA) 和核糖核酸 (RNA)。DNA 是所有生物体的遗传物质,从单细胞细菌到多细胞哺乳动物。它位于真核生物的细胞核以及细胞器、叶绿体和线粒体中。在原核生物中,DNA 没有被包裹在膜包膜中。

细胞的整个遗传内容就是它的基因组,而基因组的研究就是基因组学。在真核细胞中而不是在原核生物中,DNA 与组蛋白形成复合物,形成染色质,这是真核染色体的物质。一条染色体可以包含数以万计的基因。许多基因包含制造蛋白质的信息。其他基因编码 RNA 产物。DNA 通过”打开”或”关闭”基因来控制所有细胞活动。

另一种类型的核酸 RNA 主要参与蛋白质合成。DNA 分子永远不会离开细胞核,而是使用中介与细胞的其他部分进行交流。这个中介是信使 RNA (mRNA)。其他类型的 RNA(如 rRNA、tRNA 和 microRNA)参与蛋白质合成及其调节。

DNA 和 RNA 由称为核苷酸的单体组成。每个核苷酸由三个组分组成:含氮碱基、戊糖(五碳)糖和磷酸基团。核苷酸中的每个含氮碱基都连接到一个糖分子上,该糖分子连接到一个或多个磷酸基团。含氮碱基是核苷酸的重要组成部分,是有机分子,之所以如此命名,是因为它们含有碳和氮。它们是碱,因为它们包含一个氨基,该氨基有可能结合额外的氢,从而降低其环境中的氢离子浓度,使其更碱性。DNA 中的每个核苷酸都包含四种可能的含氮碱基之一:腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤 (G)、胞嘧啶 (C) 和胸腺嘧啶 (T)。腺嘌呤和鸟嘌呤被归类为嘌呤。嘌呤的主要结构是两个碳氮环。胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶被归类为嘧啶,其主要结构为单个碳氮环。这些碱性碳氮环中的每一个都连接着不同的官能团。在分子生物学速记中,我们通过它们的符号 A、T、G、C 和 U 来了解含氮碱基。DNA 包含 A、T、G 和 C;而 RNA 包含 A、U、G 和 C。

DNA 中的戊糖是脱氧核糖,而 RNA 中的糖是核糖。糖之间的区别在于核糖的第二个碳上存在羟基,脱氧核糖的第二个碳上存在氢。磷酸盐残基连接到一种糖的 5′ 碳的羟基和下一个核苷酸的糖的 3′ 碳的羟基上,形成 5’–3′ 磷酸二酯键。

DNA 双螺旋结构

DNA 具有双螺旋结构。糖和磷酸盐位于螺旋的外侧,形成 DNA 的骨架。含氮碱基堆积在内部,就像一对楼梯台阶一样。氢键将对物相互结合。双螺旋中的每个碱基对与下一个碱基对相距 0.34 nm。螺旋线的两条链沿相反的方向运行,这意味着一根链的 5′ 碳端将面向其匹配链的 3′ 碳端。只允许某些类型的碱基配对 – A 可以与 T 配对,G 可以与 C 配对。这是互补基本规则。换句话说,DNA 链是互补的。

核糖核酸

核糖核酸或 RNA 主要参与 DNA 指导下的蛋白质合成过程。RNA 通常是单链的,由通过磷酸二酯键连接的核糖核苷酸组成。

RNA 有四种主要类型:信使 RNA (mRNA)、核糖体 RNA (rRNA)、转移 RNA (tRNA) 和 microRNA (miRNA)。第一种是 mRNA,它携带来自 DNA 的信息,DNA 控制着细胞中的所有细胞活动。如果一个细胞需要某种蛋白质,它的基因就会”打开”,信使 RNA 就会在细胞核中合成。RNA 碱基序列与复制它的 DNA 编码序列互补。在细胞质中,mRNA 与核糖体和其他细胞机制相互作用。

mRNA 以三个碱基为一组读取,称为密码子。每个密码子编码一个氨基酸。通过这种方式,读取 mRNA 并制造蛋白质产物。核糖体 RNA (rRNA) 是 mRNA 结合的核糖体的主要成分。rRNA 确保 mRNA 和核糖体的正确对齐。核糖体的 rRNA 还具有酶活性(肽基转移酶)并催化两个对齐氨基酸之间形成肽键。转移 RNA (tRNA) 是四种 RNA 中最小的一种,通常长达 70-90 个核苷酸。它将正确的氨基酸携带到蛋白质合成位点。正是 tRNA 和 mRNA 之间的碱基配对允许正确的氨基酸将自身插入多肽链中。MicroRNA 是最小的 RNA 分子,它们的作用包括通过干扰某些 mRNA 信息的表达来调节基因表达。

尽管 RNA 是单链的,但大多数 RNA 类型在互补序列之间显示出广泛的分子内碱基配对,从而形成了对其功能至关重要的可预测的三维结构。

本文改编自 Openstax,生物学 2e,第 3.5 章:核酸

Transcript

核酸是核苷酸的聚合物——由戊糖、含氮碱基和磷酸基团组成的分子。

核酸有两种类型:脱氧核糖核酸 (DNA) 和核糖核酸 (RNA)。

它们的化学结构根据它们所含的戊糖和含氮碱基而有所不同。

RNA 中的戊糖是核糖,它有一个羟基连接到碳 2。DNA 中的糖是脱氧核糖,它只有一个氢原子,但在碳 2 处没有氧。

含氮碱基与碳 1 键合,磷酸盐在碳 5 处键合。RNA 和 DNA 都含有腺嘌呤、胞嘧啶和鸟嘌呤碱基;但 DNA 含有胸腺嘧啶,而 RNA 含有尿嘧啶。

在 DNA 和 RNA 中,鸟嘌呤和胞嘧啶形成互补碱基对,由三个氢键连接。腺嘌呤和胸腺嘧啶在 DNA 中形成碱基对,而腺嘌呤和尿嘧啶在 RNA 中形成碱基对,两者都通过两个氢键连接在一起。

各种 DNA 或 RNA 聚合酶催化核苷酸的聚合。

磷酸

二酯键在连接到碳 3 的羟基和连接到下一个核苷酸的碳 5 的磷酸基之间形成。该反应留下一个带有游离磷酸基的未连接的 5′ 末端和一个带有游离羟基的未连接的 3′ 末端。

当与互补链配对时,两个分子是反平行的,这意味着一条链的 5′ 端与另一条链的 3′ 端配对。

这些链通过分子间作用力结合在一起,包括疏水效应、范德华相互作用以及在含氮碱基之间形成的特定氢键。

DNA 是由两条相互缠绕的多核苷酸链组成的双螺旋。相比之下,RNA 通常以单链分子的形式出现。

然而,RNA 可以与互补的 RNA 或 DNA 结合。它还可以表现出链内互补碱基配对,导致不同类型的 RNA 二级结构,这些结构在细胞内具有不同的功能。