组蛋白具有从核小体伸出的柔性 N 末端尾巴。这些组蛋白尾部经常受到翻译后修饰,例如乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化。这些修饰的特定组合形成影响染色质折叠和组织特异性基因表达的”组蛋白密码”。
乙酰化作用
组蛋白乙酰转移酶将乙酰基添加到组蛋白上。另一种酶,组蛋白脱乙酰酶,从乙酰化组蛋白中去除乙酰基。N 末端组蛋白尾部第 4 位和第 9 位的赖氨酸氨基酸通常被乙酰化和脱乙酰化。乙酰化增加了组蛋白的负电荷。这会削弱 DNA-组蛋白相互作用,导致染色质松动并增加对 DNA 的访问。例如,在红细胞中,β-珠蛋白基因与乙酰化组蛋白相关,从而增加其表达。在该基因失活的非红细胞中,发现它与非乙酰化组蛋白相关。
甲基化
组蛋白 H3 赖氨酸 9 位点的组蛋白尾部可被组蛋白甲基转移酶二甲基化或三甲基化。这种甲基化可以启动非组蛋白的结合并增加染色质的压缩。甲基化增加了组蛋白上的正电荷,导致带负电荷的 DNA 和组蛋白之间的亲和力增加,染色质压缩增加。被抑制的染色质,也称为异染色质,是高度甲基化的。
组蛋白修饰及其对基因表达影响的汇总表
组蛋白密码或修饰是表观遗传的,这意味着这些修饰不是遗传编码的。因此,在每次细胞分裂期间,这些修饰会作为表观遗传记忆忠实地传递给下一个细胞。
核小体包含一个蛋白质核心,该核心由四种组蛋白核心蛋白组成:H2A、H2B、H3 和 H4。
除了这四种标准核心组蛋白外,真核生物还具有每种组蛋白的一些变体,H4 除外。
核心标准和变体核心组蛋白的氨基末端尾部从核小体中突出,并且是高度非结构化和可移动的。
这些尾部由大约 30 个氨基酸组成,受到多种形式的共价修饰,例如赖氨酸的乙酰化、丝氨酸的磷酸化以及赖氨酸的单甲基化、二甲基化或三甲基化。
导致这些修饰的反应是由不同的酶催化的,例如甲基转移酶、乙酰化酶、激酶。这些酶组统称为”写入者”。
催化去除这些化学基团的反应由脱甲基酶、脱乙酰酶和磷酸酶等酶催化。这些酶统称为”橡皮擦”。
在不同组蛋白变体和氨基末端修饰的众多可能组合中,已知只有某些协调集发生。其中一些组合的修饰集编码细胞的特定信号。
例如,一组修饰标志着 DNA 损伤和需要修复。另一个信号表示基因表达,而其他信号则表示基因沉默或染色质修饰,如异染色质的建立和传播。
这种编码系统被称为”组蛋白码”。
这些修饰中编码的信号由称为”读取器”的特定调节蛋白解码。这些蛋白质和多蛋白复合物包含各种小结构域,每个结构域都识别一个特定的组蛋白标记。
它们与包含几种不同组蛋白标记物的染色质区域紧密结合,并吸引具有催化活性的其他蛋白质复合物。这导致特定的生物学功能,例如染色质修饰、基因表达和基因沉默。
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