5.13: 染色质修饰的传播

Spreading of Chromatin Modifications
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Molecular Biology
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Spreading of Chromatin Modifications
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02:25 min
November 23, 2020

核小体中的组蛋白经过翻译后修饰 (PTM) 以增加或减少对 DNA 的访问。常见观察到的 PTM 是组蛋白 H3 尾部区域中赖氨酸氨基酸的甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化。这些组蛋白修饰对细胞具有特定的意义。因此,它们被称为”组蛋白密码”。参与组蛋白修饰的蛋白质复合物称为”读取器-写入器”复合物。

作家

写入器是一种可引起特定组蛋白修饰的酶。常见的写入酶是组蛋白甲基转移酶 (HMT) 和组蛋白乙酰转移酶 (HAT)。HMT 在组蛋白尾部添加一个甲基,这增加了染色质的压缩,抑制了转录,并有助于在 DNA 复制过程中区分新合成的链和亲本链。HAT 在组蛋白尾部添加乙酰基,从而减少染色质压缩并允许访问 DNA。

橡皮

组蛋白的 PTM 是可逆的,可以被另一组称为”擦除”的酶去除。常见的擦除是组蛋白脱乙酰酶和组蛋白脱甲基酶。它们从组蛋白中去除乙酰基或甲基并改变染色质压缩。

屏障蛋白

读写器复合物标记染色质上的常染色质和异染色质区域。组蛋白尾赖氨酸的乙酰化标记常染色质,而甲基化标记异染色质区域。将富含基因的常染色质与基因贫乏的异染色质分开,以实现基因表达的最佳调节,这一点很重要。在长染色质链上,一系列常染色质和异染色质被屏障序列分离。这些序列通过多种方式阻止组蛋白修饰的传播。例如,屏障蛋白可以将染色质拴在核孔上并防止异染色质扩散。

写入擦除酶的异常活性与多种人类疾病有关,包括阿尔茨海默氏症、脆性 X 综合征和癌症。在脆性 X 综合征中,正常认知发育所需的基因 FRM1 被高甲基化,这导致基因的转录沉默。

Transcript

Reader 酶与 writer 或 eraser 酶协同作用,产生染色质修饰,并将染色质变化沿染色体传播相当长的距离。

该过程的功能与 writer 和 eraser 酶类似,这里以 reader 和 writer 的组合为例进行描述。

当转录调节蛋白与特定 DNA 序列结合时,该过程开始。结合后,调节蛋白将写入酶募集到染色体上的特定位点。

然后写入酶开始向核心组蛋白添加标记。

一旦标记被添加到一个或多个相邻的核小体上,包含识别这些标记的”读取器”酶的多蛋白复合物就会与新修饰的核小体紧密结合。

这种结合激活了多蛋白复合物的”写入”酶,并将其定位在相邻的核小体附近,使其能够添加新标记。

复合物的读取酶和写入酶协同工作,催化一系列许多”读写”循环。这些循环沿染色体传播染色质修饰,例如染色质浓缩。

具有不同结构和功能的相邻染色质结构域(如常染色质和异染色质)之间的边界由称为”屏障序列”的特定 DNA 序列标记。

这些屏障序列充当各种屏障蛋白的结合位点,通过介导不同的屏障作用来阻止异染色质向常染色质的传播。

例如,一些屏障蛋白募集组蛋白修饰酶,这些酶会擦除异染色质扩散所需的组蛋白标记。

一些屏障蛋白与核小体组紧密结合,将它们覆盖起来,从而使覆盖的常染色质对异染色质扩散产生抵抗力。

然而,另一种屏障蛋白将染色质的一个区域拴在较大的固定位点,例如核孔,并形成阻止异染色质扩散的屏障。