表观遗传学是研究细胞表型的遗传变化而不改变 DNA 序列的学科。它为差异基因表达模式提供了一种记忆形式,以维持细胞谱系、位置效应杂色、剂量补偿和维持染色质结构,如端粒和着丝粒。例如,染色体上着丝粒的结构和位置是表观遗传的。它的功能不是由潜在的 DNA 序列决定或确保的,而是由染色质组织和组蛋白变体决定的。一旦建立,着丝粒组织和功能通过几次细胞分裂保持稳定遗传。
组蛋白是表观遗传的核心
在核小体中,DNA 和组蛋白都经过化学修饰。DNA 在胞嘧啶残基处被甲基化,组蛋白被甲基化、乙酰化或磷酸化。这些修饰中的每一种都构成了一个称为组蛋白密码的信号。最近的进展强调甲基化是一个真正的表观遗传标记,而染色质复杂性是表观遗传标记的主要载体。组蛋白变体在特定位置和时间的存在增加了染色质组织的复杂性。例如,组蛋白 H3 变体 CENP-A 以 DNA 合成非依赖性方式掺入核小体中,从而产生异常稳定的核小体。
组蛋白的遗传
DNA 甲基化、组蛋白在 DNA 链上的沉积以及组蛋白或组蛋白密码的翻译后修饰都与复制机制有关。PCNA 是一种 DNA 持续合成能力因子,是将 DNA 复制与表观遗传标记遗传联系起来的重要蛋白质。在复制叉处,核小体被移位,使得 H2A-H2B 二聚体从复制叉中完全去除。然后将亲本 H3-H4 四聚体分布到子链上,然后将新合成的组蛋白亚基放置在亲本组蛋白上以完成核小体。
尽管所有体细胞都包含相同的遗传信息,但肝脏细胞分裂形成仅肝细胞,皮肤细胞分裂成新的皮肤细胞。
每种组织类型都有特定的染色质包装和组蛋白修饰,这导致不同的基因表达模式。
染色质的这些结构特征(如着丝粒、异染色质和常染色质区域)是表观遗传的,这意味着它们的特性除了遗传物质外,还会从母细胞传递到子细胞。
这意味着肝脏或皮肤或其他特殊细胞的组织特异性表型在每一轮细胞分裂过程中都会传递,而无需改变遗传物质。
新合成的 DNA 上的从头着丝粒形成始于组蛋白 H3 变体 CENP-A 与富含 AT 的卫星 DNA 结合,形成着丝粒特异性核小体。一旦启动,该结构就会以合作的方式选择性地将更多的 CENP-A 组蛋白募集到其附近。
在 DNA 复制过程中,复制叉之前的组蛋白八聚体被分解成两个 H2A-H2B 二聚体和 H3-H4 四聚体。
两个 H2A-H2B 二聚体从八聚体中完全去除,而 H3-H4 四聚体松散地附着在 DNA 上并随机分布到子链上。
然后将新合成的 H3-H4 四聚体添加到两条链中以填充空间。接下来添加两个 H2A-H2B 二聚体 – 一半是原始分子,另一半是新的分子 – 以完成八聚体。
在酵母中,DNA 复制后,新合成链中组蛋白 H3 的乙酰化标志着常染色质,而 H3 组蛋白的脱乙酰化建立了紧密染色质结构域或异染色质的位置。
组蛋白 H3 甲基化导致染色质缩合。DNA 复制后,甲基化组蛋白随机分布在子链上,然后与组蛋白甲基转移酶结合,在新合成的八聚体上甲基化组蛋白 H3。
X 染色体失活是染色质结构遗传的另一个例子。雌性哺乳动物获得两条 X 染色体,而雄性只获得一条。在女性中,其中一条 X 染色体失活,这种现象称为剂量补偿。
在这里,一个长的非编码 RNA XIST 通过在胚胎阶段与一条 X 染色体的整个长度结合来启动 X 失活。随后,染色体在所有体细胞的连续细胞分裂中保持这种非活性模式。
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