6.8: 复制体

The Replisome
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Molecular Biology
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03:01 min
November 23, 2020

Overview

DNA 复制是由大量蛋白质复合物进行的,这些复合物作用于协调物质以实现高保真 DNA 复制。这个复合物一起被称为 DNA 复制机制或复制体。

先导链和滞后链的合成是一个高度协调的过程。为了解释这一点,布鲁斯·阿尔伯茨 (Bruce Alberts) 于 1980 年提出了”长号模型”。当引物在母体滞后链上合成时,DNA 环形成开始。该环随着冈崎片段的合成而增长,并最终在片段合成结束时溶解。然后 DNA 聚合酶附着在另一个引物上,重复从环形成到崩溃的整个循环。复制体允许将所有活动协调为复制机械复合物。

Replisome 组分

解旋酶解旋并分离双链 DNA。这些酶在原核生物中以单六聚体环的形式存在,在真核生物中以双六聚体环的形式存在。真核解离酶依赖于额外的蛋白质 Cdc45 和 GINS 来发挥作用。单链 DNA 结合 (SSB) 蛋白阻止 DNA 链重新退火。在原核生物中,SSB 由单个亚基组成,而在真核生物中,它们是一种称为复制蛋白 A (RPA) 的异源三聚体蛋白。

引物酶在 DNA 合成的起点处添加了 RNA 引物。在原核生物中,引物酶以称为 DnaG 的单个亚基酶存在,它合成约 12 个核苷酸的 RNA 引物。在真核生物中,一种多亚基酶 DNA 聚合酶-α 引物酶合成约 25 个核苷酸的 RNA-DNA 杂交引物。除了聚合酶α外,复制聚合酶还会延伸新合成的 DNA。虽然原核生物中存在单一类型的复制聚合酶 DNA 聚合酶 III,但真核生物中存在两种不同类型的复制聚合酶 Pol ε 和 Pol δ,分别用于前导链和滞后链合成。

滑动夹蛋白使聚合酶保持附着在 DNA 模板上。β-clamp 是一种同型二聚体蛋白,在原核生物中充当夹子。在真核生物中,通过增殖细胞核抗原 (PCNA) 来完成相同的任务,PCNA 是一种同源三聚体蛋白。滑动夹的中心孔带正电,这使其能够与 DNA 带负电的磷酸骨架发生静电相互作用。夹具通过 Clamp Loader 连接到 DNA。这些五聚体蛋白属于 ATP 酶的 AAA+ 类。真核生物夹式加载器称为复制因子 C,而原核大肠杆菌夹式加载器称为 γ 复合物;然而,与复制体的许多其他组分不同,夹蛋白和夹装蛋白被认为是进化同源物。

Transcript

DNA 复制是通过高度协调的多蛋白质组装进行的,称为 DNA 复制机制或复制体,这提高了 DNA 复制的效率。

该机制的核心成分是解旋酶、单链 DNA 结合蛋白、DNA 引物酶、滑动夹、夹式装载机和多种 DNA 聚合酶,它们都在复制叉附近相互关联。

复制 DNA 聚合酶具有大约 10 个核苷酸的持续合成能力,这是它在与模板链解离之前可以添加到子链中的核苷酸数。

这对于在合理的时间范围内复制整个基因组来说效率太低,这个问题可以在滑动夹蛋白的帮助下解决。

当 ATP 与钳式加载蛋白结合时,它们会结合并打开滑动夹,使其环状结构可以包围引物-模板 DNA 复合物。一旦结合,钳式加载体将 ATP 水解为 ADP,导致钳式加载体解离,夹钳在 DNA 周围闭合。

然后,DNA 聚合酶与夹蛋白结合,它们一起沿着模板 DNA 滑动,将 DNA 聚合酶拴在链上,并将其持续合成能力提高到 1000 个核苷酸。

这种增加的持续合成能力使 DNA 聚合酶能够在前导链上进行连续的 DNA 复制。

然而,在滞后链模板上,另一种 DNA 聚合酶以允许 DNA 聚合酶分子同时合成前导链和滞后链的方式进行不连续的 DNA 复制。这个过程有时被描述为 “长号模型”。

当 DNA 聚合酶从 RNA 引物开始 Okazaki 片段合成时,滞后链及其模板链形成一个环。

当解旋酶解开 DNA 并合成滞后链时,DNA 环从两个方向生长。

当 DNA 聚合酶遇到下一个 RNA 引物时,它会从模板链上分离。同时,引物酶向滞后链添加另一个引物,并释放生长的 DNA 环。

夹和夹装蛋白允许 DNA 聚合酶快速与引物 DNA 模板重新结合。

DNA 环的形成和亚序列崩溃随着每个新冈崎片段的合成而重复。

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